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***  SYT1_SMP  ***

LOGs for ID: 220623170651607

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 220623170651607.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 220623170651607.atom to be opened. Openam> File opened: 220623170651607.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 377 First residue number = 35 Last residue number = 222 Number of atoms found = 3034 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -2.577414 +/- 20.613977 From: -45.781000 To: 43.783000 = -3.932182 +/- 9.283527 From: -24.835000 To: 19.609000 = -3.348684 +/- 14.195349 From: -32.852000 To: 29.193000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.5310 % Filled. Pdbmat> 1048526 non-zero elements. Pdbmat> 114498 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 75.48 +/- 20.17 Maximum number = 116 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 2.289960E+06 Pdbmat> Larger element = 473.994 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 377 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 220623170651607.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 220623170651607.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 220623170651607.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3034 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 377 residues. Blocpdb> 19 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 18 atoms in block 2 Block first atom: 20 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 38 Blocpdb> 16 atoms in block 4 Block first atom: 60 Blocpdb> 22 atoms in block 5 Block first atom: 76 Blocpdb> 17 atoms in block 6 Block first atom: 98 Blocpdb> 20 atoms in block 7 Block first atom: 115 Blocpdb> 21 atoms in block 8 Block first atom: 135 Blocpdb> 20 atoms in block 9 Block first atom: 156 Blocpdb> 17 atoms in block 10 Block first atom: 176 Blocpdb> 13 atoms in block 11 Block first atom: 193 Blocpdb> 15 atoms in block 12 Block first atom: 206 Blocpdb> 12 atoms in block 13 Block first atom: 221 Blocpdb> 17 atoms in block 14 Block first atom: 233 Blocpdb> 13 atoms in block 15 Block first atom: 250 Blocpdb> 16 atoms in block 16 Block first atom: 263 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 279 Blocpdb> 18 atoms in block 18 Block first atom: 295 Blocpdb> 17 atoms in block 19 Block first atom: 313 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 330 Blocpdb> 21 atoms in block 21 Block first atom: 346 Blocpdb> 16 atoms in block 22 Block first atom: 367 Blocpdb> 13 atoms in block 23 Block first atom: 383 Blocpdb> 20 atoms in block 24 Block first atom: 396 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 416 Blocpdb> 15 atoms in block 26 Block first atom: 432 Blocpdb> 12 atoms in block 27 Block first atom: 447 Blocpdb> 14 atoms in block 28 Block first atom: 459 Blocpdb> 14 atoms in block 29 Block first atom: 473 Blocpdb> 18 atoms in block 30 Block first atom: 487 Blocpdb> 13 atoms in block 31 Block first atom: 505 Blocpdb> 17 atoms in block 32 Block first atom: 518 Blocpdb> 19 atoms in block 33 Block first atom: 535 Blocpdb> 15 atoms in block 34 Block first atom: 554 Blocpdb> 17 atoms in block 35 Block first atom: 569 Blocpdb> 18 atoms in block 36 Block first atom: 586 Blocpdb> 16 atoms in block 37 Block first atom: 604 Blocpdb> 17 atoms in block 38 Block first atom: 620 Blocpdb> 13 atoms in block 39 Block first atom: 637 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 650 Blocpdb> 19 atoms in block 41 Block first atom: 667 Blocpdb> 13 atoms in block 42 Block first atom: 686 Blocpdb> 15 atoms in block 43 Block first atom: 699 Blocpdb> 16 atoms in block 44 Block first atom: 714 Blocpdb> 12 atoms in block 45 Block first atom: 730 Blocpdb> 17 atoms in block 46 Block first atom: 742 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 759 Blocpdb> 12 atoms in block 48 Block first atom: 775 Blocpdb> 14 atoms in block 49 Block first atom: 787 Blocpdb> 14 atoms in block 50 Block first atom: 801 Blocpdb> 16 atoms in block 51 Block first atom: 815 Blocpdb> 15 atoms in block 52 Block first atom: 831 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 846 Blocpdb> 18 atoms in block 54 Block first atom: 863 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 881 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 895 Blocpdb> 15 atoms in block 57 Block first atom: 913 Blocpdb> 17 atoms in block 58 Block first atom: 928 Blocpdb> 15 atoms in block 59 Block first atom: 945 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 960 Blocpdb> 17 atoms in block 61 Block first atom: 974 Blocpdb> 13 atoms in block 62 Block first atom: 991 Blocpdb> 16 atoms in block 63 Block first atom: 1004 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 1020 Blocpdb> 19 atoms in block 65 Block first atom: 1036 Blocpdb> 14 atoms in block 66 Block first atom: 1055 Blocpdb> 17 atoms in block 67 Block first atom: 1069 Blocpdb> 16 atoms in block 68 Block first atom: 1086 Blocpdb> 17 atoms in block 69 Block first atom: 1102 Blocpdb> 19 atoms in block 70 Block first atom: 1119 Blocpdb> 12 atoms in block 71 Block first atom: 1138 Blocpdb> 17 atoms in block 72 Block first atom: 1150 Blocpdb> 8 atoms in block 73 Block first atom: 1167 Blocpdb> 13 atoms in block 74 Block first atom: 1175 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1188 Blocpdb> 14 atoms in block 76 Block first atom: 1204 Blocpdb> 11 atoms in block 77 Block first atom: 1218 Blocpdb> 20 atoms in block 78 Block first atom: 1229 Blocpdb> 22 atoms in block 79 Block first atom: 1249 Blocpdb> 16 atoms in block 80 Block first atom: 1271 Blocpdb> 18 atoms in block 81 Block first atom: 1287 Blocpdb> 17 atoms in block 82 Block first atom: 1305 Blocpdb> 17 atoms in block 83 Block first atom: 1322 Blocpdb> 12 atoms in block 84 Block first atom: 1339 Blocpdb> 16 atoms in block 85 Block first atom: 1351 Blocpdb> 20 atoms in block 86 Block first atom: 1367 Blocpdb> 21 atoms in block 87 Block first atom: 1387 Blocpdb> 16 atoms in block 88 Block first atom: 1408 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1424 Blocpdb> 14 atoms in block 90 Block first atom: 1439 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1453 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1469 Blocpdb> 14 atoms in block 93 Block first atom: 1484 Blocpdb> 16 atoms in block 94 Block first atom: 1498 Blocpdb> 19 atoms in block 95 Block first atom: 1514 Blocpdb> 19 atoms in block 96 Block first atom: 1533 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1552 Blocpdb> 22 atoms in block 98 Block first atom: 1567 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 1589 Blocpdb> 19 atoms in block 100 Block first atom: 1608 Blocpdb> 21 atoms in block 101 Block first atom: 1627 Blocpdb> 22 atoms in block 102 Block first atom: 1648 Blocpdb> 19 atoms in block 103 Block first atom: 1670 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1689 Blocpdb> 14 atoms in block 105 Block first atom: 1705 Blocpdb> 14 atoms in block 106 Block first atom: 1719 Blocpdb> 16 atoms in block 107 Block first atom: 1733 Blocpdb> 14 atoms in block 108 Block first atom: 1749 Blocpdb> 16 atoms in block 109 Block first atom: 1763 Blocpdb> 14 atoms in block 110 Block first atom: 1779 Blocpdb> 15 atoms in block 111 Block first atom: 1793 Blocpdb> 17 atoms in block 112 Block first atom: 1808 Blocpdb> 18 atoms in block 113 Block first atom: 1825 Blocpdb> 15 atoms in block 114 Block first atom: 1843 Blocpdb> 21 atoms in block 115 Block first atom: 1858 Blocpdb> 17 atoms in block 116 Block first atom: 1879 Blocpdb> 14 atoms in block 117 Block first atom: 1896 Blocpdb> 16 atoms in block 118 Block first atom: 1910 Blocpdb> 20 atoms in block 119 Block first atom: 1926 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1946 Blocpdb> 15 atoms in block 121 Block first atom: 1961 Blocpdb> 10 atoms in block 122 Block first atom: 1976 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 1986 Blocpdb> 14 atoms in block 124 Block first atom: 2001 Blocpdb> 20 atoms in block 125 Block first atom: 2015 Blocpdb> 12 atoms in block 126 Block first atom: 2035 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 2047 Blocpdb> 20 atoms in block 128 Block first atom: 2063 Blocpdb> 15 atoms in block 129 Block first atom: 2083 Blocpdb> 18 atoms in block 130 Block first atom: 2098 Blocpdb> 17 atoms in block 131 Block first atom: 2116 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 2133 Blocpdb> 16 atoms in block 133 Block first atom: 2149 Blocpdb> 14 atoms in block 134 Block first atom: 2165 Blocpdb> 23 atoms in block 135 Block first atom: 2179 Blocpdb> 10 atoms in block 136 Block first atom: 2202 Blocpdb> 15 atoms in block 137 Block first atom: 2212 Blocpdb> 16 atoms in block 138 Block first atom: 2227 Blocpdb> 15 atoms in block 139 Block first atom: 2243 Blocpdb> 13 atoms in block 140 Block first atom: 2258 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2271 Blocpdb> 15 atoms in block 142 Block first atom: 2285 Blocpdb> 17 atoms in block 143 Block first atom: 2300 Blocpdb> 12 atoms in block 144 Block first atom: 2317 Blocpdb> 16 atoms in block 145 Block first atom: 2329 Blocpdb> 14 atoms in block 146 Block first atom: 2345 Blocpdb> 16 atoms in block 147 Block first atom: 2359 Blocpdb> 16 atoms in block 148 Block first atom: 2375 Blocpdb> 16 atoms in block 149 Block first atom: 2391 Blocpdb> 16 atoms in block 150 Block first atom: 2407 Blocpdb> 19 atoms in block 151 Block first atom: 2423 Blocpdb> 15 atoms in block 152 Block first atom: 2442 Blocpdb> 16 atoms in block 153 Block first atom: 2457 Blocpdb> 15 atoms in block 154 Block first atom: 2473 Blocpdb> 13 atoms in block 155 Block first atom: 2488 Blocpdb> 18 atoms in block 156 Block first atom: 2501 Blocpdb> 17 atoms in block 157 Block first atom: 2519 Blocpdb> 13 atoms in block 158 Block first atom: 2536 Blocpdb> 20 atoms in block 159 Block first atom: 2549 Blocpdb> 13 atoms in block 160 Block first atom: 2569 Blocpdb> 16 atoms in block 161 Block first atom: 2582 Blocpdb> 18 atoms in block 162 Block first atom: 2598 Blocpdb> 17 atoms in block 163 Block first atom: 2616 Blocpdb> 15 atoms in block 164 Block first atom: 2633 Blocpdb> 15 atoms in block 165 Block first atom: 2648 Blocpdb> 17 atoms in block 166 Block first atom: 2663 Blocpdb> 12 atoms in block 167 Block first atom: 2680 Blocpdb> 9 atoms in block 168 Block first atom: 2692 Blocpdb> 16 atoms in block 169 Block first atom: 2701 Blocpdb> 14 atoms in block 170 Block first atom: 2717 Blocpdb> 15 atoms in block 171 Block first atom: 2731 Blocpdb> 12 atoms in block 172 Block first atom: 2746 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 2758 Blocpdb> 18 atoms in block 174 Block first atom: 2781 Blocpdb> 18 atoms in block 175 Block first atom: 2799 Blocpdb> 17 atoms in block 176 Block first atom: 2817 Blocpdb> 17 atoms in block 177 Block first atom: 2834 Blocpdb> 16 atoms in block 178 Block first atom: 2851 Blocpdb> 13 atoms in block 179 Block first atom: 2867 Blocpdb> 20 atoms in block 180 Block first atom: 2880 Blocpdb> 22 atoms in block 181 Block first atom: 2900 Blocpdb> 16 atoms in block 182 Block first atom: 2922 Blocpdb> 15 atoms in block 183 Block first atom: 2938 Blocpdb> 14 atoms in block 184 Block first atom: 2953 Blocpdb> 15 atoms in block 185 Block first atom: 2967 Blocpdb> 16 atoms in block 186 Block first atom: 2982 Blocpdb> 12 atoms in block 187 Block first atom: 2998 Blocpdb> 14 atoms in block 188 Block first atom: 3010 Blocpdb> 11 atoms in block 189 Block first atom: 3023 Blocpdb> 189 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1048715 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9102 Prepmat> Matrix trace = 2289960.0000 Prepmat> Last element read: 9102 9102 189.5065 Prepmat> 17956 lines saved. Prepmat> 16312 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3034 RTB> Total mass = 3034.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3034 RTB> Number of blocks = 189 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 236248.5648 RTB> 56313 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1134 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56313 Diagstd> Projected matrix trace = 236248.5648 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1134 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 236248.5648 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1992718 0.3865888 0.4338263 0.7173757 0.8018412 1.1609067 1.5967647 1.6503484 2.2505873 2.5298059 3.1739089 3.3234755 3.5798187 4.0963723 4.1928734 5.0164943 5.2773743 5.9198337 6.8309363 6.8938008 7.4989237 7.7101796 8.3187138 8.7798283 9.1406511 9.7444753 10.5170390 10.9910061 11.1957159 11.7469069 12.1195690 12.8340925 13.6520268 13.9038310 14.6092732 15.2037549 15.6209497 16.2333690 16.4337526 17.2948164 17.4506171 18.1577498 18.2800757 19.0983654 19.2742524 19.8507117 20.2271890 20.5801410 20.9760870 21.5511594 22.0299144 22.1351883 22.6029815 22.8816558 23.6741240 23.9609181 24.3765298 25.1344536 25.5116613 26.1210394 27.0140144 27.3101566 27.8724708 28.1527610 28.7078888 29.1565245 29.3902256 29.9509509 30.5726046 30.8401622 31.5133301 31.8291032 32.3162322 32.7286439 33.5676084 33.8333907 34.2657772 35.0241754 35.1422944 36.3610421 36.8135672 36.9836905 37.4411869 37.7156053 38.0156932 39.0262011 39.6604445 40.3649911 40.8636551 41.0621936 41.1977083 41.6066879 42.1100226 42.7425364 43.6134286 44.1803793 44.3581344 45.3429773 45.3819421 46.2305666 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034333 0.0034340 0.0034346 0.0034352 0.0034365 48.4750480 67.5180512 71.5242385 91.9747463 97.2387744 117.0021772 137.2194696 139.5028544 162.9083014 172.7185076 193.4605891 197.9664168 205.4592960 219.7834533 222.3571795 243.2178491 249.4619016 264.2104765 283.8150348 285.1180071 297.3683523 301.5279169 313.2011677 321.7646229 328.3097991 338.9803387 352.1616195 360.0095353 363.3466956 372.1834388 378.0409699 389.0253151 401.2304137 404.9137459 415.0587620 423.4193585 429.1894097 437.5217135 440.2137999 451.5992985 453.6288579 462.7285481 464.2845962 474.5624590 476.7426993 483.8194478 488.3858204 492.6284094 497.3447279 504.1161371 509.6848031 510.9011620 516.2714931 519.4443229 528.3628076 531.5535314 536.1437159 544.4149016 548.4848680 554.9968359 564.4036896 567.4889051 573.3014168 576.1768125 581.8297288 586.3584082 588.7036657 594.2929635 600.4287790 603.0503960 609.5964505 612.6430084 617.3133090 621.2398205 629.1518533 631.6376983 635.6610101 642.6569960 643.7397645 654.8071928 658.8692381 660.3898707 664.4619003 666.8924817 669.5403226 678.3805990 683.8708135 689.9183730 694.1668747 695.8511565 696.9984453 700.4495377 704.6736264 709.9461781 717.1423915 721.7885696 723.2391325 731.2237635 731.5378790 738.3459349 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3034 Rtb_to_modes> Number of blocs = 189 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9862E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1993 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3866 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4338 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7174 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8018 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.161 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.597 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.650 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.251 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.530 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.174 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.323 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.580 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.096 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.193 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.016 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.277 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.920 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.831 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.894 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.499 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.710 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.319 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.780 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.141 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.744 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.23 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1134 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 54612 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220623170651607.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220623170651607.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 220623170651607.atom Openam> file on opening on unit 11: 220623170651607.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 377 First residue number = 35 Last residue number = 222 Number of atoms found = 3034 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9862E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1993 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3866 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4338 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7174 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8018 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.161 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.597 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.650 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.251 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.530 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.174 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.323 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.580 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.096 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.193 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.016 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.277 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.920 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.831 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.894 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.499 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.710 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.319 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.780 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.141 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.744 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.23 Bfactors> 106 vectors, 9102 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.199300 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.372 for 377 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.102 +/- 0.11 Bfactors> = 87.250 +/- 8.28 Bfactors> Shiftng-fct= 87.147 Bfactors> Scaling-fct= 78.492 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220623170651607.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220623170651607.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4364E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.5 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Chkmod> That is: 3034 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220623170651607.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220623170651607.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 220623170651607 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 220623170651607.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220623170651607.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220623170651607.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 220623170651607 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom making animated gifs 11 models are in 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11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220623170651607.eigenfacs 220623170651607.atom making animated gifs 11 models are in 220623170651607.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220623170651607.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220623170651607.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 220623170651607.10.pdb 220623170651607.11.pdb 220623170651607.7.pdb 220623170651607.8.pdb 220623170651607.9.pdb STDERR: real 0m17.673s user 0m17.632s sys 0m0.032s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw 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