CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  at  ***

LOGs for ID: 22062211422855121

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22062211422855121.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22062211422855121.atom to be opened. Openam> File opened: 22062211422855121.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 703 First residue number = 1 Last residue number = 703 Number of atoms found = 10924 Mean number per residue = 15.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 0.617747 +/- 29.173882 From: -57.457000 To: 76.754000 = -0.416728 +/- 12.798495 From: -47.374000 To: 36.684000 = 3.721585 +/- 23.932435 From: -44.162000 To: 57.486000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.4416 % Filled. Pdbmat> 7741661 non-zero elements. Pdbmat> 853038 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 156.18 +/- 53.01 Maximum number = 264 Minimum number = 18 Pdbmat> Matrix trace = 1.706076E+07 Pdbmat> Larger element = 911.404 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 703 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22062211422855121.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22062211422855121.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22062211422855121.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10924 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 703 residues. Blocpdb> 49 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 47 atoms in block 2 Block first atom: 50 Blocpdb> 59 atoms in block 3 Block first atom: 97 Blocpdb> 66 atoms in block 4 Block first atom: 156 Blocpdb> 56 atoms in block 5 Block first atom: 222 Blocpdb> 57 atoms in block 6 Block first atom: 278 Blocpdb> 68 atoms in block 7 Block first atom: 335 Blocpdb> 65 atoms in block 8 Block first atom: 403 Blocpdb> 77 atoms in block 9 Block first atom: 468 Blocpdb> 79 atoms in block 10 Block first atom: 545 Blocpdb> 51 atoms in block 11 Block first atom: 624 Blocpdb> 75 atoms in block 12 Block first atom: 675 Blocpdb> 70 atoms in block 13 Block first atom: 750 Blocpdb> 44 atoms in block 14 Block first atom: 820 Blocpdb> 50 atoms in block 15 Block first atom: 864 Blocpdb> 67 atoms in block 16 Block first atom: 914 Blocpdb> 65 atoms in block 17 Block first atom: 981 Blocpdb> 59 atoms in block 18 Block first atom: 1046 Blocpdb> 49 atoms in block 19 Block first atom: 1105 Blocpdb> 59 atoms in block 20 Block first atom: 1154 Blocpdb> 54 atoms in block 21 Block first atom: 1213 Blocpdb> 61 atoms in block 22 Block first atom: 1267 Blocpdb> 56 atoms in block 23 Block first atom: 1328 Blocpdb> 65 atoms in block 24 Block first atom: 1384 Blocpdb> 58 atoms in block 25 Block first atom: 1449 Blocpdb> 82 atoms in block 26 Block first atom: 1507 Blocpdb> 61 atoms in block 27 Block first atom: 1589 Blocpdb> 58 atoms in block 28 Block first atom: 1650 Blocpdb> 69 atoms in block 29 Block first atom: 1708 Blocpdb> 54 atoms in block 30 Block first atom: 1777 Blocpdb> 58 atoms in block 31 Block first atom: 1831 Blocpdb> 68 atoms in block 32 Block first atom: 1889 Blocpdb> 75 atoms in block 33 Block first atom: 1957 Blocpdb> 72 atoms in block 34 Block first atom: 2032 Blocpdb> 63 atoms in block 35 Block first atom: 2104 Blocpdb> 80 atoms in block 36 Block first atom: 2167 Blocpdb> 86 atoms in block 37 Block first atom: 2247 Blocpdb> 56 atoms in block 38 Block first atom: 2333 Blocpdb> 63 atoms in block 39 Block first atom: 2389 Blocpdb> 59 atoms in block 40 Block first atom: 2452 Blocpdb> 62 atoms in block 41 Block first atom: 2511 Blocpdb> 56 atoms in block 42 Block first atom: 2573 Blocpdb> 73 atoms in block 43 Block first atom: 2629 Blocpdb> 69 atoms in block 44 Block first atom: 2702 Blocpdb> 63 atoms in block 45 Block first atom: 2771 Blocpdb> 57 atoms in block 46 Block first atom: 2834 Blocpdb> 56 atoms in block 47 Block first atom: 2891 Blocpdb> 53 atoms in block 48 Block first atom: 2947 Blocpdb> 59 atoms in block 49 Block first atom: 3000 Blocpdb> 74 atoms in block 50 Block first atom: 3059 Blocpdb> 74 atoms in block 51 Block first atom: 3133 Blocpdb> 62 atoms in block 52 Block first atom: 3207 Blocpdb> 65 atoms in block 53 Block first atom: 3269 Blocpdb> 79 atoms in block 54 Block first atom: 3334 Blocpdb> 63 atoms in block 55 Block first atom: 3413 Blocpdb> 65 atoms in block 56 Block first atom: 3476 Blocpdb> 69 atoms in block 57 Block first atom: 3541 Blocpdb> 63 atoms in block 58 Block first atom: 3610 Blocpdb> 51 atoms in block 59 Block first atom: 3673 Blocpdb> 67 atoms in block 60 Block first atom: 3724 Blocpdb> 59 atoms in block 61 Block first atom: 3791 Blocpdb> 77 atoms in block 62 Block first atom: 3850 Blocpdb> 64 atoms in block 63 Block first atom: 3927 Blocpdb> 75 atoms in block 64 Block first atom: 3991 Blocpdb> 53 atoms in block 65 Block first atom: 4066 Blocpdb> 59 atoms in block 66 Block first atom: 4119 Blocpdb> 63 atoms in block 67 Block first atom: 4178 Blocpdb> 74 atoms in block 68 Block first atom: 4241 Blocpdb> 51 atoms in block 69 Block first atom: 4315 Blocpdb> 62 atoms in block 70 Block first atom: 4366 Blocpdb> 66 atoms in block 71 Block first atom: 4428 Blocpdb> 73 atoms in block 72 Block first atom: 4494 Blocpdb> 65 atoms in block 73 Block first atom: 4567 Blocpdb> 55 atoms in block 74 Block first atom: 4632 Blocpdb> 59 atoms in block 75 Block first atom: 4687 Blocpdb> 57 atoms in block 76 Block first atom: 4746 Blocpdb> 68 atoms in block 77 Block first atom: 4803 Blocpdb> 53 atoms in block 78 Block first atom: 4871 Blocpdb> 62 atoms in block 79 Block first atom: 4924 Blocpdb> 60 atoms in block 80 Block first atom: 4986 Blocpdb> 55 atoms in block 81 Block first atom: 5046 Blocpdb> 79 atoms in block 82 Block first atom: 5101 Blocpdb> 47 atoms in block 83 Block first atom: 5180 Blocpdb> 61 atoms in block 84 Block first atom: 5227 Blocpdb> 77 atoms in block 85 Block first atom: 5288 Blocpdb> 78 atoms in block 86 Block first atom: 5365 Blocpdb> 63 atoms in block 87 Block first atom: 5443 Blocpdb> 65 atoms in block 88 Block first atom: 5506 Blocpdb> 59 atoms in block 89 Block first atom: 5571 Blocpdb> 71 atoms in block 90 Block first atom: 5630 Blocpdb> 43 atoms in block 91 Block first atom: 5701 Blocpdb> 51 atoms in block 92 Block first atom: 5744 Blocpdb> 64 atoms in block 93 Block first atom: 5795 Blocpdb> 57 atoms in block 94 Block first atom: 5859 Blocpdb> 71 atoms in block 95 Block first atom: 5916 Blocpdb> 70 atoms in block 96 Block first atom: 5987 Blocpdb> 52 atoms in block 97 Block first atom: 6057 Blocpdb> 73 atoms in block 98 Block first atom: 6109 Blocpdb> 55 atoms in block 99 Block first atom: 6182 Blocpdb> 74 atoms in block 100 Block first atom: 6237 Blocpdb> 71 atoms in block 101 Block first atom: 6311 Blocpdb> 49 atoms in block 102 Block first atom: 6382 Blocpdb> 50 atoms in block 103 Block first atom: 6431 Blocpdb> 61 atoms in block 104 Block first atom: 6481 Blocpdb> 56 atoms in block 105 Block first atom: 6542 Blocpdb> 77 atoms in block 106 Block first atom: 6598 Blocpdb> 57 atoms in block 107 Block first atom: 6675 Blocpdb> 55 atoms in block 108 Block first atom: 6732 Blocpdb> 62 atoms in block 109 Block first atom: 6787 Blocpdb> 64 atoms in block 110 Block first atom: 6849 Blocpdb> 54 atoms in block 111 Block first atom: 6913 Blocpdb> 56 atoms in block 112 Block first atom: 6967 Blocpdb> 64 atoms in block 113 Block first atom: 7023 Blocpdb> 75 atoms in block 114 Block first atom: 7087 Blocpdb> 60 atoms in block 115 Block first atom: 7162 Blocpdb> 70 atoms in block 116 Block first atom: 7222 Blocpdb> 62 atoms in block 117 Block first atom: 7292 Blocpdb> 64 atoms in block 118 Block first atom: 7354 Blocpdb> 67 atoms in block 119 Block first atom: 7418 Blocpdb> 64 atoms in block 120 Block first atom: 7485 Blocpdb> 81 atoms in block 121 Block first atom: 7549 Blocpdb> 55 atoms in block 122 Block first atom: 7630 Blocpdb> 67 atoms in block 123 Block first atom: 7685 Blocpdb> 76 atoms in block 124 Block first atom: 7752 Blocpdb> 53 atoms in block 125 Block first atom: 7828 Blocpdb> 53 atoms in block 126 Block first atom: 7881 Blocpdb> 69 atoms in block 127 Block first atom: 7934 Blocpdb> 67 atoms in block 128 Block first atom: 8003 Blocpdb> 80 atoms in block 129 Block first atom: 8070 Blocpdb> 51 atoms in block 130 Block first atom: 8150 Blocpdb> 49 atoms in block 131 Block first atom: 8201 Blocpdb> 59 atoms in block 132 Block first atom: 8250 Blocpdb> 47 atoms in block 133 Block first atom: 8309 Blocpdb> 57 atoms in block 134 Block first atom: 8356 Blocpdb> 61 atoms in block 135 Block first atom: 8413 Blocpdb> 57 atoms in block 136 Block first atom: 8474 Blocpdb> 69 atoms in block 137 Block first atom: 8531 Blocpdb> 59 atoms in block 138 Block first atom: 8600 Blocpdb> 53 atoms in block 139 Block first atom: 8659 Blocpdb> 47 atoms in block 140 Block first atom: 8712 Blocpdb> 61 atoms in block 141 Block first atom: 8759 Blocpdb> 69 atoms in block 142 Block first atom: 8820 Blocpdb> 57 atoms in block 143 Block first atom: 8889 Blocpdb> 65 atoms in block 144 Block first atom: 8946 Blocpdb> 50 atoms in block 145 Block first atom: 9011 Blocpdb> 52 atoms in block 146 Block first atom: 9061 Blocpdb> 55 atoms in block 147 Block first atom: 9113 Blocpdb> 67 atoms in block 148 Block first atom: 9168 Blocpdb> 63 atoms in block 149 Block first atom: 9235 Blocpdb> 53 atoms in block 150 Block first atom: 9298 Blocpdb> 57 atoms in block 151 Block first atom: 9351 Blocpdb> 43 atoms in block 152 Block first atom: 9408 Blocpdb> 65 atoms in block 153 Block first atom: 9451 Blocpdb> 57 atoms in block 154 Block first atom: 9516 Blocpdb> 51 atoms in block 155 Block first atom: 9573 Blocpdb> 66 atoms in block 156 Block first atom: 9624 Blocpdb> 67 atoms in block 157 Block first atom: 9690 Blocpdb> 74 atoms in block 158 Block first atom: 9757 Blocpdb> 62 atoms in block 159 Block first atom: 9831 Blocpdb> 60 atoms in block 160 Block first atom: 9893 Blocpdb> 61 atoms in block 161 Block first atom: 9953 Blocpdb> 57 atoms in block 162 Block first atom: 10014 Blocpdb> 55 atoms in block 163 Block first atom: 10071 Blocpdb> 64 atoms in block 164 Block first atom: 10126 Blocpdb> 75 atoms in block 165 Block first atom: 10190 Blocpdb> 61 atoms in block 166 Block first atom: 10265 Blocpdb> 67 atoms in block 167 Block first atom: 10326 Blocpdb> 56 atoms in block 168 Block first atom: 10393 Blocpdb> 67 atoms in block 169 Block first atom: 10449 Blocpdb> 60 atoms in block 170 Block first atom: 10516 Blocpdb> 59 atoms in block 171 Block first atom: 10576 Blocpdb> 68 atoms in block 172 Block first atom: 10635 Blocpdb> 51 atoms in block 173 Block first atom: 10703 Blocpdb> 70 atoms in block 174 Block first atom: 10754 Blocpdb> 52 atoms in block 175 Block first atom: 10824 Blocpdb> 49 atoms in block 176 Block first atom: 10875 Blocpdb> 176 blocks. Blocpdb> At most, 86 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 43 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 7741837 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 32772 Prepmat> Matrix trace = 17060760.0000 Prepmat> Last element read: 32772 32772 93.1410 Prepmat> 15577 lines saved. Prepmat> 13823 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10924 RTB> Total mass = 10924.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10924 RTB> Number of blocks = 176 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 403499.7026 RTB> 60468 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1056 Diagstd> Nb of non-zero elements: 60468 Diagstd> Projected matrix trace = 403499.7026 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1056 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 403499.7026 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0824208 0.1048567 0.1851832 0.2292298 0.3303321 0.3579103 0.4313707 0.5913984 1.2851261 1.6607360 1.8254606 2.4288933 2.7198309 2.9548346 3.1464852 3.3394946 3.6617445 3.7378224 4.4423071 4.8464460 5.5201922 6.6586407 7.5422005 7.6883458 8.2878241 8.7536542 9.0031956 10.1383791 10.4721617 10.8962127 12.5045862 12.7385026 13.1068868 13.7229141 15.2118659 15.8445156 16.4602690 16.5716803 17.3926304 17.9280782 19.3784991 20.3933243 20.9401697 21.6173986 22.7307020 23.2316861 24.3537812 25.4169063 25.9134555 26.0108973 27.3800975 28.1117912 28.9484533 29.3610890 30.1064058 30.9285270 31.4160301 32.0722044 33.1387659 34.7701645 35.3040557 36.4373218 36.6700201 36.9518601 37.6119293 38.0553640 39.1385445 39.9849410 40.8896791 41.1613550 43.2360669 43.9325059 44.4347935 45.4391566 45.4888641 45.8903889 46.9368064 47.4820371 48.1324059 48.4939201 49.2984513 50.6832445 51.0293518 51.7959848 53.0757866 53.7786534 54.1832522 55.5578742 55.7984859 56.3345368 57.1195493 58.1479936 58.5058569 59.2121538 60.9297135 62.4768040 63.6358232 64.4281502 64.9336457 66.1160509 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034301 0.0034312 0.0034332 0.0034336 0.0034340 0.0034344 31.1755204 35.1636039 46.7300263 51.9913140 62.4123720 64.9654376 71.3215246 83.5093946 123.1028642 139.9411961 146.7173609 169.2386280 179.0878949 186.6645600 192.6229923 198.4429411 207.7970116 209.9445538 228.8756396 239.0600298 255.1363756 280.2128657 298.2251847 301.1006793 312.6191244 321.2846472 325.8319166 345.7638176 351.4094607 358.4536997 383.9988664 387.5738525 393.1380283 402.2707483 423.5322883 432.2497620 440.5688057 442.0572865 452.8745494 459.7927818 478.0302158 490.3873891 496.9187437 504.8902634 517.7280607 523.4023231 535.8934882 547.4653342 552.7871579 553.8254987 568.2151064 575.7574142 584.2624322 588.4117814 595.8332515 603.9137238 608.6546333 614.9781498 625.1200743 640.3223380 645.2196426 655.4936733 657.5834197 660.1056239 665.9752446 669.8895768 679.3563129 686.6627844 694.3878793 696.6908582 714.0331427 719.7609296 723.8638087 731.9988711 732.3991416 735.6244394 743.9642192 748.2727882 753.3799629 756.2039243 762.4509649 773.0854231 775.7205668 781.5258142 791.1220694 796.3431373 799.3331321 809.4091142 811.1599268 815.0469831 820.7061092 828.0616037 830.6057866 835.6043834 847.6368879 858.3307725 866.2557167 871.6318905 875.0445695 882.9756620 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10924 Rtb_to_modes> Number of blocs = 176 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9774E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9841E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9955E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.2421E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1049 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1852 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2292 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3303 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3579 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4314 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5914 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.285 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.661 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.825 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.429 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.720 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.955 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.146 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.339 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.662 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.738 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.442 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.846 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.520 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.659 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.542 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.688 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.288 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.754 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.003 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.12 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1056 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99997 1.00005 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 0.99995 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 1.00004 0.99998 1.00005 0.99997 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 0.99995 0.99998 1.00004 1.00001 1.00001 0.99995 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00005 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 196632 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 0.99997 1.00005 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 0.99995 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 1.00004 0.99998 1.00005 0.99997 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 0.99995 0.99998 1.00004 1.00001 1.00001 0.99995 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00002 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00005 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22062211422855121.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22062211422855121.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22062211422855121.atom Openam> file on opening on unit 11: 22062211422855121.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 703 First residue number = 1 Last residue number = 703 Number of atoms found = 10924 Mean number per residue = 15.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9774E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9841E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9955E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.2421E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1049 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1852 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2292 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3303 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3579 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4314 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5914 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.285 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.661 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.825 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.429 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.720 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.955 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.146 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.339 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.662 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.738 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.442 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.846 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.520 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.659 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.542 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.688 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.288 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.754 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.003 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.12 Bfactors> 106 vectors, 32772 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.082421 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.461 for 703 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.070 +/- 0.31 Bfactors> = 88.138 +/- 14.93 Bfactors> Shiftng-fct= 88.068 Bfactors> Scaling-fct= 47.511 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22062211422855121.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22062211422855121.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4299E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 51.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.0 Chkmod> 106 vectors, 32772 coordinates in file. Chkmod> That is: 10924 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 19 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 23 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 43 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 48 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6552 0.0034 0.6501 0.0034 0.9598 0.0034 0.8585 0.0034 0.9205 0.0034 0.5961 31.1742 0.3960 35.1694 0.0246 46.7301 0.0323 51.9857 0.2528 62.4067 0.0996 64.9617 0.0528 71.3209 0.1162 83.5059 0.5295 123.0915 0.0293 139.9463 0.1938 146.6926 0.3799 169.2351 0.3290 179.0858 0.0197 186.6618 0.0862 192.5999 0.6433 198.4197 0.0444 207.7953 0.0602 209.9405 0.0216 228.8579 0.0581 239.0388 0.0533 255.1210 0.0179 280.2084 0.0578 298.2084 0.2321 301.0810 0.1945 312.6090 0.3826 321.2772 0.0512 325.8144 0.4626 345.7766 0.0851 351.3581 0.1770 358.5006 0.1152 383.9120 0.0207 387.5800 0.2074 393.1678 0.4477 402.2108 0.0213 423.4881 0.0504 432.1696 0.2579 440.5463 0.0514 442.0159 0.2106 452.8209 0.1463 459.7977 0.3448 478.0282 0.2834 490.3264 0.1235 496.8954 0.1794 504.8990 0.1131 517.6978 0.2007 523.3609 0.2872 535.8289 0.3131 547.4751 0.2933 552.7266 0.1877 553.7922 0.2294 568.1897 0.1975 575.7144 0.2421 584.2530 0.3191 588.3756 0.2160 595.8432 0.2344 603.9022 0.0951 608.6670 0.4277 614.9306 0.3127 625.1049 0.2378 640.2933 0.3843 645.1549 0.2901 655.4896 0.4192 657.5550 0.1308 660.0607 0.0507 665.9296 0.2809 669.9016 0.3179 679.3398 0.3202 686.5909 0.2773 694.3608 0.1993 696.6495 0.4017 714.0350 0.1210 719.7095 0.1898 723.7937 0.3402 731.9742 0.4553 732.3768 0.2603 735.5897 0.1712 743.9576 0.2960 748.2246 0.1084 753.3288 0.1857 756.1409 0.1568 762.4302 0.2502 773.0275 0.2319 775.6922 0.2846 781.5226 0.2998 791.1195 0.2302 796.3189 0.3799 799.2748 0.1601 809.3899 0.2962 811.1361 0.2140 814.9792 0.2566 820.6741 0.0546 828.0403 0.0561 830.5995 0.4107 835.5533 0.3134 847.6025 0.4477 858.3159 0.4367 866.2470 0.2679 871.6070 0.4105 874.9824 0.4252 882.9641 0.3755 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22062211422855121 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom making animated gifs 11 models are in 22062211422855121.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22062211422855121.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22062211422855121.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22062211422855121 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom making animated gifs 11 models are in 22062211422855121.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22062211422855121.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22062211422855121.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22062211422855121 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom making animated gifs 11 models are in 22062211422855121.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22062211422855121.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22062211422855121.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 22062211422855121 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom making animated gifs 11 models are in 22062211422855121.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22062211422855121.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22062211422855121.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 22062211422855121 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22062211422855121.eigenfacs 22062211422855121.atom making animated gifs 11 models are in 22062211422855121.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22062211422855121.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22062211422855121.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 22062211422855121.10.pdb 22062211422855121.11.pdb 22062211422855121.7.pdb 22062211422855121.8.pdb 22062211422855121.9.pdb STDERR: real 0m46.890s user 0m46.668s sys 0m0.200s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.