CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  Msh26  ***

LOGs for ID: 220612095942113497

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 220612095942113497.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 220612095942113497.atom to be opened. Openam> File opened: 220612095942113497.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1828 First residue number = 1 Last residue number = 997 Number of atoms found = 14494 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -53.328227 +/- 24.511054 From: -105.113000 To: 6.767000 = 21.312029 +/- 28.050175 From: -42.129000 To: 93.927000 = 31.489777 +/- 15.143085 From: -8.494000 To: 69.585000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.5627 % Filled. Pdbmat> 5319209 non-zero elements. Pdbmat> 581455 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.23 +/- 21.43 Maximum number = 128 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 1.162910E+07 Pdbmat> Larger element = 516.108 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1828 non-zero elements, NRBL set to 10 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 220612095942113497.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 10 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 220612095942113497.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 220612095942113497.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 14494 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 10 residue(s) per block. Blocpdb> 1828 residues. Blocpdb> 78 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 71 atoms in block 2 Block first atom: 79 Blocpdb> 86 atoms in block 3 Block first atom: 150 Blocpdb> 81 atoms in block 4 Block first atom: 236 Blocpdb> 79 atoms in block 5 Block first atom: 317 Blocpdb> 80 atoms in block 6 Block first atom: 396 Blocpdb> 73 atoms in block 7 Block first atom: 476 Blocpdb> 71 atoms in block 8 Block first atom: 549 Blocpdb> 84 atoms in block 9 Block first atom: 620 Blocpdb> 89 atoms in block 10 Block first atom: 704 Blocpdb> 82 atoms in block 11 Block first atom: 793 Blocpdb> 84 atoms in block 12 Block first atom: 875 Blocpdb> 74 atoms in block 13 Block first atom: 959 Blocpdb> 83 atoms in block 14 Block first atom: 1033 Blocpdb> 62 atoms in block 15 Block first atom: 1116 Blocpdb> 76 atoms in block 16 Block first atom: 1178 Blocpdb> 72 atoms in block 17 Block first atom: 1254 Blocpdb> 81 atoms in block 18 Block first atom: 1326 Blocpdb> 80 atoms in block 19 Block first atom: 1407 Blocpdb> 75 atoms in block 20 Block first atom: 1487 Blocpdb> 64 atoms in block 21 Block first atom: 1562 Blocpdb> 81 atoms in block 22 Block first atom: 1626 Blocpdb> 78 atoms in block 23 Block first atom: 1707 Blocpdb> 86 atoms in block 24 Block first atom: 1785 Blocpdb> 78 atoms in block 25 Block first atom: 1871 Blocpdb> 76 atoms in block 26 Block first atom: 1949 Blocpdb> 73 atoms in block 27 Block first atom: 2025 Blocpdb> 79 atoms in block 28 Block first atom: 2098 Blocpdb> 80 atoms in block 29 Block first atom: 2177 Blocpdb> 87 atoms in block 30 Block first atom: 2257 Blocpdb> 74 atoms in block 31 Block first atom: 2344 Blocpdb> 77 atoms in block 32 Block first atom: 2418 Blocpdb> 66 atoms in block 33 Block first atom: 2495 Blocpdb> 79 atoms in block 34 Block first atom: 2561 Blocpdb> 87 atoms in block 35 Block first atom: 2640 Blocpdb> 89 atoms in block 36 Block first atom: 2727 Blocpdb> 77 atoms in block 37 Block first atom: 2816 Blocpdb> 86 atoms in block 38 Block first atom: 2893 Blocpdb> 91 atoms in block 39 Block first atom: 2979 Blocpdb> 81 atoms in block 40 Block first atom: 3070 Blocpdb> 87 atoms in block 41 Block first atom: 3151 Blocpdb> 77 atoms in block 42 Block first atom: 3238 Blocpdb> 86 atoms in block 43 Block first atom: 3315 Blocpdb> 76 atoms in block 44 Block first atom: 3401 Blocpdb> 85 atoms in block 45 Block first atom: 3477 Blocpdb> 81 atoms in block 46 Block first atom: 3562 Blocpdb> 86 atoms in block 47 Block first atom: 3643 Blocpdb> 79 atoms in block 48 Block first atom: 3729 Blocpdb> 86 atoms in block 49 Block first atom: 3808 Blocpdb> 71 atoms in block 50 Block first atom: 3894 Blocpdb> 76 atoms in block 51 Block first atom: 3965 Blocpdb> 74 atoms in block 52 Block first atom: 4041 Blocpdb> 93 atoms in block 53 Block first atom: 4115 Blocpdb> 85 atoms in block 54 Block first atom: 4208 Blocpdb> 76 atoms in block 55 Block first atom: 4293 Blocpdb> 78 atoms in block 56 Block first atom: 4369 Blocpdb> 91 atoms in block 57 Block first atom: 4447 Blocpdb> 78 atoms in block 58 Block first atom: 4538 Blocpdb> 75 atoms in block 59 Block first atom: 4616 Blocpdb> 75 atoms in block 60 Block first atom: 4691 Blocpdb> 76 atoms in block 61 Block first atom: 4766 Blocpdb> 70 atoms in block 62 Block first atom: 4842 Blocpdb> 74 atoms in block 63 Block first atom: 4912 Blocpdb> 81 atoms in block 64 Block first atom: 4986 Blocpdb> 79 atoms in block 65 Block first atom: 5067 Blocpdb> 87 atoms in block 66 Block first atom: 5146 Blocpdb> 81 atoms in block 67 Block first atom: 5233 Blocpdb> 77 atoms in block 68 Block first atom: 5314 Blocpdb> 72 atoms in block 69 Block first atom: 5391 Blocpdb> 69 atoms in block 70 Block first atom: 5463 Blocpdb> 72 atoms in block 71 Block first atom: 5532 Blocpdb> 71 atoms in block 72 Block first atom: 5604 Blocpdb> 73 atoms in block 73 Block first atom: 5675 Blocpdb> 72 atoms in block 74 Block first atom: 5748 Blocpdb> 80 atoms in block 75 Block first atom: 5820 Blocpdb> 74 atoms in block 76 Block first atom: 5900 Blocpdb> 79 atoms in block 77 Block first atom: 5974 Blocpdb> 74 atoms in block 78 Block first atom: 6053 Blocpdb> 80 atoms in block 79 Block first atom: 6127 Blocpdb> 75 atoms in block 80 Block first atom: 6207 Blocpdb> 76 atoms in block 81 Block first atom: 6282 Blocpdb> 81 atoms in block 82 Block first atom: 6358 Blocpdb> 76 atoms in block 83 Block first atom: 6439 Blocpdb> 79 atoms in block 84 Block first atom: 6515 Blocpdb> 77 atoms in block 85 Block first atom: 6594 Blocpdb> 38 atoms in block 86 Block first atom: 6671 Blocpdb> 90 atoms in block 87 Block first atom: 6709 Blocpdb> 97 atoms in block 88 Block first atom: 6799 Blocpdb> 94 atoms in block 89 Block first atom: 6896 Blocpdb> 77 atoms in block 90 Block first atom: 6990 Blocpdb> 76 atoms in block 91 Block first atom: 7067 Blocpdb> 97 atoms in block 92 Block first atom: 7143 Blocpdb> 78 atoms in block 93 Block first atom: 7240 Blocpdb> 91 atoms in block 94 Block first atom: 7318 Blocpdb> 72 atoms in block 95 Block first atom: 7409 Blocpdb> 79 atoms in block 96 Block first atom: 7481 Blocpdb> 81 atoms in block 97 Block first atom: 7560 Blocpdb> 76 atoms in block 98 Block first atom: 7641 Blocpdb> 83 atoms in block 99 Block first atom: 7717 Blocpdb> 82 atoms in block 100 Block first atom: 7800 Blocpdb> 90 atoms in block 101 Block first atom: 7882 Blocpdb> 77 atoms in block 102 Block first atom: 7972 Blocpdb> 77 atoms in block 103 Block first atom: 8049 Blocpdb> 84 atoms in block 104 Block first atom: 8126 Blocpdb> 77 atoms in block 105 Block first atom: 8210 Blocpdb> 80 atoms in block 106 Block first atom: 8287 Blocpdb> 76 atoms in block 107 Block first atom: 8367 Blocpdb> 86 atoms in block 108 Block first atom: 8443 Blocpdb> 85 atoms in block 109 Block first atom: 8529 Blocpdb> 80 atoms in block 110 Block first atom: 8614 Blocpdb> 78 atoms in block 111 Block first atom: 8694 Blocpdb> 70 atoms in block 112 Block first atom: 8772 Blocpdb> 78 atoms in block 113 Block first atom: 8842 Blocpdb> 85 atoms in block 114 Block first atom: 8920 Blocpdb> 86 atoms in block 115 Block first atom: 9005 Blocpdb> 71 atoms in block 116 Block first atom: 9091 Blocpdb> 70 atoms in block 117 Block first atom: 9162 Blocpdb> 72 atoms in block 118 Block first atom: 9232 Blocpdb> 71 atoms in block 119 Block first atom: 9304 Blocpdb> 82 atoms in block 120 Block first atom: 9375 Blocpdb> 83 atoms in block 121 Block first atom: 9457 Blocpdb> 75 atoms in block 122 Block first atom: 9540 Blocpdb> 76 atoms in block 123 Block first atom: 9615 Blocpdb> 77 atoms in block 124 Block first atom: 9691 Blocpdb> 79 atoms in block 125 Block first atom: 9768 Blocpdb> 73 atoms in block 126 Block first atom: 9847 Blocpdb> 76 atoms in block 127 Block first atom: 9920 Blocpdb> 85 atoms in block 128 Block first atom: 9996 Blocpdb> 84 atoms in block 129 Block first atom: 10081 Blocpdb> 76 atoms in block 130 Block first atom: 10165 Blocpdb> 78 atoms in block 131 Block first atom: 10241 Blocpdb> 85 atoms in block 132 Block first atom: 10319 Blocpdb> 73 atoms in block 133 Block first atom: 10404 Blocpdb> 82 atoms in block 134 Block first atom: 10477 Blocpdb> 83 atoms in block 135 Block first atom: 10559 Blocpdb> 81 atoms in block 136 Block first atom: 10642 Blocpdb> 79 atoms in block 137 Block first atom: 10723 Blocpdb> 70 atoms in block 138 Block first atom: 10802 Blocpdb> 84 atoms in block 139 Block first atom: 10872 Blocpdb> 78 atoms in block 140 Block first atom: 10956 Blocpdb> 84 atoms in block 141 Block first atom: 11034 Blocpdb> 86 atoms in block 142 Block first atom: 11118 Blocpdb> 75 atoms in block 143 Block first atom: 11204 Blocpdb> 79 atoms in block 144 Block first atom: 11279 Blocpdb> 81 atoms in block 145 Block first atom: 11358 Blocpdb> 94 atoms in block 146 Block first atom: 11439 Blocpdb> 81 atoms in block 147 Block first atom: 11533 Blocpdb> 88 atoms in block 148 Block first atom: 11614 Blocpdb> 83 atoms in block 149 Block first atom: 11702 Blocpdb> 87 atoms in block 150 Block first atom: 11785 Blocpdb> 87 atoms in block 151 Block first atom: 11872 Blocpdb> 77 atoms in block 152 Block first atom: 11959 Blocpdb> 86 atoms in block 153 Block first atom: 12036 Blocpdb> 94 atoms in block 154 Block first atom: 12122 Blocpdb> 87 atoms in block 155 Block first atom: 12216 Blocpdb> 74 atoms in block 156 Block first atom: 12303 Blocpdb> 72 atoms in block 157 Block first atom: 12377 Blocpdb> 74 atoms in block 158 Block first atom: 12449 Blocpdb> 81 atoms in block 159 Block first atom: 12523 Blocpdb> 77 atoms in block 160 Block first atom: 12604 Blocpdb> 83 atoms in block 161 Block first atom: 12681 Blocpdb> 78 atoms in block 162 Block first atom: 12764 Blocpdb> 77 atoms in block 163 Block first atom: 12842 Blocpdb> 64 atoms in block 164 Block first atom: 12919 Blocpdb> 73 atoms in block 165 Block first atom: 12983 Blocpdb> 73 atoms in block 166 Block first atom: 13056 Blocpdb> 76 atoms in block 167 Block first atom: 13129 Blocpdb> 78 atoms in block 168 Block first atom: 13205 Blocpdb> 81 atoms in block 169 Block first atom: 13283 Blocpdb> 73 atoms in block 170 Block first atom: 13364 Blocpdb> 74 atoms in block 171 Block first atom: 13437 Blocpdb> 70 atoms in block 172 Block first atom: 13511 Blocpdb> 68 atoms in block 173 Block first atom: 13581 Blocpdb> 77 atoms in block 174 Block first atom: 13649 Blocpdb> 88 atoms in block 175 Block first atom: 13726 Blocpdb> 79 atoms in block 176 Block first atom: 13814 Blocpdb> 74 atoms in block 177 Block first atom: 13893 Blocpdb> 80 atoms in block 178 Block first atom: 13967 Blocpdb> 90 atoms in block 179 Block first atom: 14047 Blocpdb> 72 atoms in block 180 Block first atom: 14137 Blocpdb> 75 atoms in block 181 Block first atom: 14209 Blocpdb> 83 atoms in block 182 Block first atom: 14284 Blocpdb> 88 atoms in block 183 Block first atom: 14367 Blocpdb> 40 atoms in block 184 Block first atom: 14454 Blocpdb> 184 blocks. Blocpdb> At most, 97 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 38 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 5319393 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 43482 Prepmat> Matrix trace = 11629100.0000 Prepmat> Last element read: 43482 43482 81.4417 Prepmat> 17021 lines saved. Prepmat> 15603 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 14494 RTB> Total mass = 14494.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 14494 RTB> Number of blocks = 184 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 167551.9993 RTB> 48252 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1104 Diagstd> Nb of non-zero elements: 48252 Diagstd> Projected matrix trace = 167551.9993 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1104 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 167551.9993 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2010559 0.3356323 0.3972593 0.5101337 0.7523659 1.1256165 1.1597222 1.2011993 1.4753435 1.6410584 1.9829720 2.2249371 2.5148041 2.6359834 2.9060212 3.1712239 3.4339680 3.7470755 4.0764644 4.2385757 4.2925843 4.8059680 4.9158167 5.1193169 5.2542975 5.4671542 5.6048182 5.9945005 6.3033901 6.7101597 6.8335244 7.1665321 7.3277294 7.4644084 7.9554534 8.2351846 8.6712647 9.0685734 9.2369660 9.4332594 9.5558909 9.8199040 9.9005157 10.5626514 10.6772865 10.9659982 11.3344001 11.4806194 12.0529131 12.3423829 12.4244284 12.6778998 13.2708865 13.4719262 14.0115634 14.1608863 14.5720020 14.8396030 14.9672987 15.4880026 15.5430720 16.0910014 16.5512005 16.9018711 17.3654199 17.5469095 17.6460440 17.8949357 18.2947345 18.5316741 18.9372780 19.2195699 19.4271545 19.7224126 19.8678257 20.1033685 20.4683670 20.8398377 21.2708061 21.6733049 21.9382177 22.3640995 22.9949247 23.1391926 23.3314267 23.7962455 24.0059569 24.1775665 24.4044918 25.1368527 25.4608998 25.8014334 26.0673892 26.4932217 26.6815020 26.9993446 27.1013209 27.7024407 27.8976228 28.8192310 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034321 0.0034328 0.0034334 0.0034334 0.0034339 0.0034350 48.6915621 62.9110790 68.4435203 77.5599084 94.1910905 115.2100859 116.9424725 119.0153061 131.8991065 139.1096636 152.9162261 161.9772983 172.2056371 176.3058049 185.1163038 193.3787439 201.2303137 210.2042546 219.2487399 223.5657416 224.9855875 238.0596102 240.7648717 245.6978105 248.9158834 253.9077421 257.0845906 265.8714968 272.6354803 281.2948032 283.8687960 290.7031963 293.9544175 296.6832145 306.2864252 311.6247552 319.7691063 327.0128107 330.0349657 333.5232921 335.6841773 340.2897760 341.6836424 352.9244560 354.8344103 359.5997368 365.5902029 367.9407924 376.9999508 381.5002154 382.7661193 386.6508223 395.5899488 398.5750670 406.4794356 408.6396453 414.5289739 418.3178742 420.1138438 427.3591297 428.1182180 435.5989425 441.7840484 446.4395609 452.5201527 454.8786970 456.1618471 459.3675911 464.4707134 467.4687747 472.5568439 476.0659415 478.6299571 482.2534024 484.0279614 486.8887023 491.2888159 495.7268553 500.8264473 505.5427088 508.6229489 513.5361112 520.7284137 522.3593592 524.5246814 529.7238184 532.0528715 533.9512077 536.4511303 544.4408839 547.9389262 551.5910333 554.4265871 558.9367520 560.9193433 564.2504200 565.3150009 571.5500896 573.5600305 582.9569371 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 14494 Rtb_to_modes> Number of blocs = 184 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2011 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3356 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3973 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5101 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.126 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.160 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.201 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.475 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.641 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.983 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.225 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.515 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.636 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.906 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.171 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.434 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.747 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.076 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.239 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.293 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.806 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.916 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.119 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.254 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.467 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.605 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.995 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.303 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.710 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.834 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.167 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.328 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.955 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.235 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.671 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.237 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.433 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.556 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.820 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.901 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.82 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1104 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00005 0.99997 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00004 1.00000 0.99998 0.99996 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 260892 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00005 0.99997 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00004 1.00000 0.99998 0.99996 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99996 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220612095942113497.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220612095942113497.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 220612095942113497.atom Openam> file on opening on unit 11: 220612095942113497.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1828 First residue number = 1 Last residue number = 997 Number of atoms found = 14494 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2011 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3356 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3973 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5101 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.126 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.160 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.201 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.475 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.641 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.983 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.225 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.515 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.636 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.906 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.171 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.434 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.747 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.076 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.239 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.293 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.806 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.916 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.119 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.254 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.467 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.605 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.995 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.303 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.710 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.834 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.167 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.328 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.955 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.235 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.671 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.237 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.433 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.556 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.820 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.901 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.82 Bfactors> 106 vectors, 43482 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.201100 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.228 for 1828 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.028 +/- 0.03 Bfactors> = 0.841 +/- 0.13 Bfactors> Shiftng-fct= 0.813 Bfactors> Scaling-fct= 4.666 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220612095942113497.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220612095942113497.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.9 Chkmod> 106 vectors, 43482 coordinates in file. Chkmod> That is: 14494 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7838 0.0034 0.8579 0.0034 0.8884 0.0034 0.9867 0.0034 0.7596 0.0034 0.7299 48.6948 0.3029 62.9054 0.5251 68.4441 0.6137 77.5540 0.4864 94.1892 0.5367 115.2248 0.1898 116.9515 0.4262 119.0003 0.6820 131.8781 0.3430 139.1012 0.3939 152.9107 0.6505 161.9726 0.3668 172.2050 0.5590 176.2988 0.3009 185.1077 0.5358 193.3636 0.5593 201.2226 0.4125 210.1931 0.3212 219.2268 0.3793 223.5673 0.4883 224.9868 0.5257 238.0502 0.2011 240.7590 0.4027 245.6797 0.5908 248.8982 0.2158 253.8933 0.2910 257.0777 0.2759 265.8712 0.3726 272.6153 0.6667 281.2794 0.5435 283.8665 0.3566 290.7002 0.3630 293.9472 0.4722 296.6624 0.2916 306.2645 0.4688 311.6079 0.2410 319.7505 0.3895 327.0065 0.4549 330.0214 0.3068 333.5044 0.3031 335.6717 0.6184 340.2768 0.4665 341.6773 0.4667 352.8650 0.5885 354.8643 0.3402 359.6499 0.4755 365.5035 0.3689 367.9151 0.3983 376.9382 0.3769 381.4470 0.2860 382.6815 0.3283 386.6662 0.4484 395.5598 0.1941 398.5295 0.4782 406.4393 0.4492 408.6093 0.5805 414.4827 0.3898 418.3055 0.3882 420.1337 0.4058 427.3683 0.5042 428.0575 0.5350 435.5667 0.4483 441.7491 0.2917 446.3957 0.3769 452.5604 0.4065 454.8992 0.3496 456.1934 0.2855 459.2845 0.4027 464.3907 0.4428 467.4276 0.3759 472.5705 0.4309 476.0508 0.5116 478.6445 0.3786 482.2032 0.1631 484.0337 0.2969 486.8270 0.4332 491.2873 0.3872 495.7075 0.5203 500.7955 0.3383 505.4825 0.3687 508.6218 0.3881 513.4670 0.3526 520.6503 0.3099 522.3460 0.4531 524.4861 0.3626 529.7429 0.4127 532.0748 0.4013 533.9552 0.5723 536.3787 0.4425 544.4516 0.4179 547.9057 0.5246 551.5520 0.2756 554.4305 0.4508 558.8788 0.3936 560.8795 0.5044 564.2330 0.4940 565.2770 0.3743 571.5004 0.4053 573.5598 0.5017 582.9397 0.2843 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 220612095942113497 7 -200 200 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-200 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-160 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-140 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=120 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=140 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=160 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=180 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=200 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 220612095942113497 8 -200 200 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-200 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-160 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-140 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=120 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=140 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=160 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=180 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=200 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 220612095942113497 9 -200 200 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-200 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-160 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-140 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=120 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=140 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=160 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=180 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=200 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 220612095942113497 10 -200 200 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-200 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-160 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-140 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=120 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=140 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=160 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=180 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=200 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 220612095942113497 11 -200 200 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-200 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-160 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-140 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=120 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=140 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=160 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=180 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom calculating perturbed structure for DQ=200 220612095942113497.eigenfacs 220612095942113497.atom 220612095942113497.10.pdb 220612095942113497.11.pdb 220612095942113497.7.pdb 220612095942113497.8.pdb 220612095942113497.9.pdb STDERR: real 1m14.127s user 1m13.824s sys 0m0.212s




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.