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LOGs for ID: 22052612130314259

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22052612130314259.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22052612130314259.atom to be opened. Openam> File opened: 22052612130314259.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 751 First residue number = 1 Last residue number = 239 Number of atoms found = 11653 Mean number per residue = 15.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = -3.230140 +/- 28.373792 From: -66.499000 To: 62.015000 = -0.402688 +/- 12.229858 From: -32.779000 To: 32.842000 = -0.267325 +/- 12.880551 From: -34.241000 To: 31.224000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3808 % Filled. Pdbmat> 8437762 non-zero elements. Pdbmat> 929901 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 159.60 +/- 50.01 Maximum number = 256 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 1.859802E+07 Pdbmat> Larger element = 893.688 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 751 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22052612130314259.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22052612130314259.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22052612130314259.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 11653 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 751 residues. Blocpdb> 61 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 68 atoms in block 2 Block first atom: 62 Blocpdb> 71 atoms in block 3 Block first atom: 130 Blocpdb> 50 atoms in block 4 Block first atom: 201 Blocpdb> 48 atoms in block 5 Block first atom: 251 Blocpdb> 62 atoms in block 6 Block first atom: 299 Blocpdb> 58 atoms in block 7 Block first atom: 361 Blocpdb> 58 atoms in block 8 Block first atom: 419 Blocpdb> 77 atoms in block 9 Block first atom: 477 Blocpdb> 35 atoms in block 10 Block first atom: 554 Blocpdb> 50 atoms in block 11 Block first atom: 589 Blocpdb> 55 atoms in block 12 Block first atom: 639 Blocpdb> 77 atoms in block 13 Block first atom: 694 Blocpdb> 43 atoms in block 14 Block first atom: 771 Blocpdb> 78 atoms in block 15 Block first atom: 814 Blocpdb> 54 atoms in block 16 Block first atom: 892 Blocpdb> 62 atoms in block 17 Block first atom: 946 Blocpdb> 76 atoms in block 18 Block first atom: 1008 Blocpdb> 66 atoms in block 19 Block first atom: 1084 Blocpdb> 78 atoms in block 20 Block first atom: 1150 Blocpdb> 49 atoms in block 21 Block first atom: 1228 Blocpdb> 66 atoms in block 22 Block first atom: 1277 Blocpdb> 77 atoms in block 23 Block first atom: 1343 Blocpdb> 77 atoms in block 24 Block first atom: 1420 Blocpdb> 68 atoms in block 25 Block first atom: 1497 Blocpdb> 71 atoms in block 26 Block first atom: 1565 Blocpdb> 56 atoms in block 27 Block first atom: 1636 Blocpdb> 68 atoms in block 28 Block first atom: 1692 Blocpdb> 58 atoms in block 29 Block first atom: 1760 Blocpdb> 65 atoms in block 30 Block first atom: 1818 Blocpdb> 44 atoms in block 31 Block first atom: 1883 Blocpdb> 59 atoms in block 32 Block first atom: 1927 Blocpdb> 67 atoms in block 33 Block first atom: 1986 Blocpdb> 64 atoms in block 34 Block first atom: 2053 Blocpdb> 66 atoms in block 35 Block first atom: 2117 Blocpdb> 74 atoms in block 36 Block first atom: 2183 Blocpdb> 44 atoms in block 37 Block first atom: 2257 Blocpdb> 71 atoms in block 38 Block first atom: 2301 Blocpdb> 67 atoms in block 39 Block first atom: 2372 Blocpdb> 50 atoms in block 40 Block first atom: 2439 Blocpdb> 59 atoms in block 41 Block first atom: 2489 Blocpdb> 51 atoms in block 42 Block first atom: 2548 Blocpdb> 65 atoms in block 43 Block first atom: 2599 Blocpdb> 48 atoms in block 44 Block first atom: 2664 Blocpdb> 71 atoms in block 45 Block first atom: 2712 Blocpdb> 77 atoms in block 46 Block first atom: 2783 Blocpdb> 60 atoms in block 47 Block first atom: 2860 Blocpdb> 74 atoms in block 48 Block first atom: 2920 Blocpdb> 67 atoms in block 49 Block first atom: 2994 Blocpdb> 77 atoms in block 50 Block first atom: 3061 Blocpdb> 63 atoms in block 51 Block first atom: 3138 Blocpdb> 40 atoms in block 52 Block first atom: 3201 Blocpdb> 57 atoms in block 53 Block first atom: 3241 Blocpdb> 55 atoms in block 54 Block first atom: 3298 Blocpdb> 60 atoms in block 55 Block first atom: 3353 Blocpdb> 66 atoms in block 56 Block first atom: 3413 Blocpdb> 55 atoms in block 57 Block first atom: 3479 Blocpdb> 71 atoms in block 58 Block first atom: 3534 Blocpdb> 71 atoms in block 59 Block first atom: 3605 Blocpdb> 45 atoms in block 60 Block first atom: 3676 Blocpdb> 74 atoms in block 61 Block first atom: 3721 Blocpdb> 66 atoms in block 62 Block first atom: 3795 Blocpdb> 69 atoms in block 63 Block first atom: 3861 Blocpdb> 77 atoms in block 64 Block first atom: 3930 Blocpdb> 62 atoms in block 65 Block first atom: 4007 Blocpdb> 69 atoms in block 66 Block first atom: 4069 Blocpdb> 59 atoms in block 67 Block first atom: 4138 Blocpdb> 51 atoms in block 68 Block first atom: 4197 Blocpdb> 45 atoms in block 69 Block first atom: 4248 Blocpdb> 79 atoms in block 70 Block first atom: 4293 Blocpdb> 75 atoms in block 71 Block first atom: 4372 Blocpdb> 69 atoms in block 72 Block first atom: 4447 Blocpdb> 58 atoms in block 73 Block first atom: 4516 Blocpdb> 55 atoms in block 74 Block first atom: 4574 Blocpdb> 57 atoms in block 75 Block first atom: 4629 Blocpdb> 59 atoms in block 76 Block first atom: 4686 Blocpdb> 65 atoms in block 77 Block first atom: 4745 Blocpdb> 48 atoms in block 78 Block first atom: 4810 Blocpdb> 54 atoms in block 79 Block first atom: 4858 Blocpdb> 54 atoms in block 80 Block first atom: 4912 Blocpdb> 64 atoms in block 81 Block first atom: 4966 Blocpdb> 61 atoms in block 82 Block first atom: 5030 Blocpdb> 68 atoms in block 83 Block first atom: 5091 Blocpdb> 57 atoms in block 84 Block first atom: 5159 Blocpdb> 43 atoms in block 85 Block first atom: 5216 Blocpdb> 72 atoms in block 86 Block first atom: 5259 Blocpdb> 72 atoms in block 87 Block first atom: 5331 Blocpdb> 79 atoms in block 88 Block first atom: 5403 Blocpdb> 63 atoms in block 89 Block first atom: 5482 Blocpdb> 53 atoms in block 90 Block first atom: 5545 Blocpdb> 60 atoms in block 91 Block first atom: 5598 Blocpdb> 53 atoms in block 92 Block first atom: 5658 Blocpdb> 41 atoms in block 93 Block first atom: 5711 Blocpdb> 81 atoms in block 94 Block first atom: 5752 Blocpdb> 62 atoms in block 95 Block first atom: 5833 Blocpdb> 67 atoms in block 96 Block first atom: 5895 Blocpdb> 52 atoms in block 97 Block first atom: 5962 Blocpdb> 59 atoms in block 98 Block first atom: 6014 Blocpdb> 55 atoms in block 99 Block first atom: 6073 Blocpdb> 50 atoms in block 100 Block first atom: 6128 Blocpdb> 63 atoms in block 101 Block first atom: 6178 Blocpdb> 53 atoms in block 102 Block first atom: 6241 Blocpdb> 56 atoms in block 103 Block first atom: 6294 Blocpdb> 57 atoms in block 104 Block first atom: 6350 Blocpdb> 57 atoms in block 105 Block first atom: 6407 Blocpdb> 50 atoms in block 106 Block first atom: 6464 Blocpdb> 64 atoms in block 107 Block first atom: 6514 Blocpdb> 52 atoms in block 108 Block first atom: 6578 Blocpdb> 55 atoms in block 109 Block first atom: 6630 Blocpdb> 55 atoms in block 110 Block first atom: 6685 Blocpdb> 61 atoms in block 111 Block first atom: 6740 Blocpdb> 49 atoms in block 112 Block first atom: 6801 Blocpdb> 57 atoms in block 113 Block first atom: 6850 Blocpdb> 54 atoms in block 114 Block first atom: 6907 Blocpdb> 55 atoms in block 115 Block first atom: 6961 Blocpdb> 64 atoms in block 116 Block first atom: 7016 Blocpdb> 84 atoms in block 117 Block first atom: 7080 Blocpdb> 66 atoms in block 118 Block first atom: 7164 Blocpdb> 58 atoms in block 119 Block first atom: 7230 Blocpdb> 76 atoms in block 120 Block first atom: 7288 Blocpdb> 75 atoms in block 121 Block first atom: 7364 Blocpdb> 67 atoms in block 122 Block first atom: 7439 Blocpdb> 82 atoms in block 123 Block first atom: 7506 Blocpdb> 51 atoms in block 124 Block first atom: 7588 Blocpdb> 63 atoms in block 125 Block first atom: 7639 Blocpdb> 55 atoms in block 126 Block first atom: 7702 Blocpdb> 75 atoms in block 127 Block first atom: 7757 Blocpdb> 64 atoms in block 128 Block first atom: 7832 Blocpdb> 54 atoms in block 129 Block first atom: 7896 Blocpdb> 50 atoms in block 130 Block first atom: 7950 Blocpdb> 65 atoms in block 131 Block first atom: 8000 Blocpdb> 62 atoms in block 132 Block first atom: 8065 Blocpdb> 69 atoms in block 133 Block first atom: 8127 Blocpdb> 54 atoms in block 134 Block first atom: 8196 Blocpdb> 46 atoms in block 135 Block first atom: 8250 Blocpdb> 48 atoms in block 136 Block first atom: 8296 Blocpdb> 67 atoms in block 137 Block first atom: 8344 Blocpdb> 60 atoms in block 138 Block first atom: 8411 Blocpdb> 62 atoms in block 139 Block first atom: 8471 Blocpdb> 43 atoms in block 140 Block first atom: 8533 Blocpdb> 70 atoms in block 141 Block first atom: 8576 Blocpdb> 54 atoms in block 142 Block first atom: 8646 Blocpdb> 52 atoms in block 143 Block first atom: 8700 Blocpdb> 70 atoms in block 144 Block first atom: 8752 Blocpdb> 63 atoms in block 145 Block first atom: 8822 Blocpdb> 51 atoms in block 146 Block first atom: 8885 Blocpdb> 58 atoms in block 147 Block first atom: 8936 Blocpdb> 64 atoms in block 148 Block first atom: 8994 Blocpdb> 68 atoms in block 149 Block first atom: 9058 Blocpdb> 70 atoms in block 150 Block first atom: 9126 Blocpdb> 57 atoms in block 151 Block first atom: 9196 Blocpdb> 63 atoms in block 152 Block first atom: 9253 Blocpdb> 57 atoms in block 153 Block first atom: 9316 Blocpdb> 72 atoms in block 154 Block first atom: 9373 Blocpdb> 67 atoms in block 155 Block first atom: 9445 Blocpdb> 63 atoms in block 156 Block first atom: 9512 Blocpdb> 63 atoms in block 157 Block first atom: 9575 Blocpdb> 83 atoms in block 158 Block first atom: 9638 Blocpdb> 64 atoms in block 159 Block first atom: 9721 Blocpdb> 70 atoms in block 160 Block first atom: 9785 Blocpdb> 56 atoms in block 161 Block first atom: 9855 Blocpdb> 68 atoms in block 162 Block first atom: 9911 Blocpdb> 81 atoms in block 163 Block first atom: 9979 Blocpdb> 69 atoms in block 164 Block first atom: 10060 Blocpdb> 64 atoms in block 165 Block first atom: 10129 Blocpdb> 63 atoms in block 166 Block first atom: 10193 Blocpdb> 67 atoms in block 167 Block first atom: 10256 Blocpdb> 64 atoms in block 168 Block first atom: 10323 Blocpdb> 68 atoms in block 169 Block first atom: 10387 Blocpdb> 57 atoms in block 170 Block first atom: 10455 Blocpdb> 55 atoms in block 171 Block first atom: 10512 Blocpdb> 78 atoms in block 172 Block first atom: 10567 Blocpdb> 53 atoms in block 173 Block first atom: 10645 Blocpdb> 73 atoms in block 174 Block first atom: 10698 Blocpdb> 79 atoms in block 175 Block first atom: 10771 Blocpdb> 62 atoms in block 176 Block first atom: 10850 Blocpdb> 59 atoms in block 177 Block first atom: 10912 Blocpdb> 74 atoms in block 178 Block first atom: 10971 Blocpdb> 91 atoms in block 179 Block first atom: 11045 Blocpdb> 54 atoms in block 180 Block first atom: 11136 Blocpdb> 51 atoms in block 181 Block first atom: 11190 Blocpdb> 56 atoms in block 182 Block first atom: 11241 Blocpdb> 64 atoms in block 183 Block first atom: 11297 Blocpdb> 59 atoms in block 184 Block first atom: 11361 Blocpdb> 51 atoms in block 185 Block first atom: 11420 Blocpdb> 57 atoms in block 186 Block first atom: 11471 Blocpdb> 69 atoms in block 187 Block first atom: 11528 Blocpdb> 57 atoms in block 188 Block first atom: 11596 Blocpdb> 188 blocks. Blocpdb> At most, 91 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 35 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 8437950 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 34959 Prepmat> Matrix trace = 18598020.0000 Prepmat> Last element read: 34959 34959 429.4811 Prepmat> 17767 lines saved. Prepmat> 15794 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11653 RTB> Total mass = 11653.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 11653 RTB> Number of blocks = 188 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 447188.8897 RTB> 68172 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1128 Diagstd> Nb of non-zero elements: 68172 Diagstd> Projected matrix trace = 447188.8897 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1128 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 447188.8897 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0597317 0.1550854 0.2768549 0.5193612 1.2301915 1.4798256 1.8193081 2.4226788 3.0668578 4.0288649 4.8771065 6.2702097 6.6910131 8.9067326 9.1254130 9.1809505 10.7931958 11.3457830 14.0651462 14.6263764 14.8790293 15.5055157 15.7831831 16.7410608 17.2157661 19.8788086 20.0419081 20.4055378 21.8681702 23.2717178 23.9068634 24.4769347 26.4100623 27.6501141 28.0558076 30.3718459 30.9737960 33.3699735 34.3214531 34.6177540 36.2757003 36.7333425 37.6409150 38.2217752 39.5549360 40.4235508 44.0266852 44.1998617 44.8450543 45.4072449 45.6886761 47.9308564 48.4907135 48.9299424 49.5238740 49.8245197 51.0377876 53.9392766 54.4706239 54.7621080 55.2841875 56.0619298 56.9376886 57.8487156 58.6440061 59.2637136 60.2002857 60.7605512 61.0702655 62.0318559 62.2476316 63.5928595 64.6568204 64.8153672 65.9080546 68.2353388 69.1514857 69.9801335 70.6736834 71.9912422 72.5715768 72.9748426 74.6964260 75.6250769 75.9309766 76.9858163 77.0819424 77.8294601 79.2493285 80.4327189 81.1714808 81.7824396 82.4265743 83.5170444 84.7541593 85.2822449 85.9783791 87.3745998 87.9811316 88.6990847 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034321 0.0034322 0.0034327 0.0034340 0.0034341 0.0034361 26.5398059 42.7642412 57.1375202 78.2582352 120.4430195 132.0993096 146.4699075 169.0219864 190.1700422 217.9649338 239.8150301 271.9169713 280.8931969 324.0816845 328.0360279 329.0327311 356.7551963 365.7737351 407.2559190 415.3016463 418.8732057 427.6006803 431.4123543 444.3106950 450.5660421 484.1617278 486.1438699 490.5342126 507.8102972 523.8530795 530.9536125 537.2467478 558.0588415 571.0100393 575.1838290 598.4541378 604.3555252 627.2970004 636.1772191 638.9174126 654.0383030 658.1509375 666.2318127 671.3526497 682.9605579 690.4186432 720.5320022 721.9476974 727.1978018 731.7417859 734.0059273 751.8009576 756.1789217 759.5959359 764.1921727 766.5082625 775.7846823 797.5314885 801.4500401 803.5915455 807.4130155 813.0725551 819.3985606 825.9279075 831.5858585 835.9681110 842.5478146 846.4594010 848.6139848 855.2688751 856.7550959 865.9632412 873.1773305 874.2472466 881.5856794 897.0155181 903.0172320 908.4115837 912.9019686 921.3722200 925.0784413 927.6451191 938.5235863 944.3395852 946.2475609 952.7975679 953.3922236 958.0039269 966.7030212 973.8939212 978.3562293 982.0312566 985.8910082 992.3910496 999.7140379 1002.8237072 1006.9082678 1015.0510389 1018.5680564 1022.7155269 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11653 Rtb_to_modes> Number of blocs = 188 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9895E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.9732E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1551 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2769 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5194 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.230 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.480 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.819 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.423 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.067 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.029 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.877 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.270 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.691 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.907 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.125 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.181 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.70 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1128 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00004 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99995 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 0.99997 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 209754 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00004 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99995 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 0.99997 0.99998 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22052612130314259.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22052612130314259.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22052612130314259.atom Openam> file on opening on unit 11: 22052612130314259.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 751 First residue number = 1 Last residue number = 239 Number of atoms found = 11653 Mean number per residue = 15.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9893E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9895E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9929E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.9732E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1551 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2769 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5194 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.230 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.480 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.819 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.423 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.067 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.029 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.877 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.270 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.691 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.907 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.125 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.181 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.70 Bfactors> 106 vectors, 34959 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.059732 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.521 for 751 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.044 +/- 0.04 Bfactors> = 92.782 +/- 10.60 Bfactors> Shiftng-fct= 92.738 Bfactors> Scaling-fct= 235.768 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22052612130314259.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22052612130314259.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 280.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7480 0.0034 0.7071 0.0034 0.9504 0.0034 0.8081 0.0034 0.7830 0.0034 0.8094 26.5387 0.7109 42.7644 0.4810 57.1397 0.5840 78.2578 0.0390 120.4285 0.3772 132.1014 0.3390 146.4512 0.6167 169.0259 0.4202 190.1663 0.1316 217.9592 0.0222 239.8021 0.5254 271.9008 0.2819 280.8809 0.3387 324.0726 0.4337 328.0145 0.4491 329.0195 0.3334 356.6871 0.4382 365.8260 0.2747 407.3087 0.2584 415.3353 0.1724 418.8689 0.1456 427.6442 0.4340 431.3503 0.1742 444.2775 0.2281 450.6021 0.2979 484.1555 0.2374 486.0999 0.2787 490.5668 0.1333 507.8097 0.5284 523.8113 0.4559 530.9656 0.1665 537.2573 0.2968 558.0342 0.2447 570.9843 0.1642 575.2021 0.0936 598.4103 0.3373 604.2925 0.2360 627.2703 0.4872 636.1364 0.5358 638.9107 0.4625 654.0490 0.3998 658.0927 0.3594 666.1951 0.3404 671.3082 0.3812 682.8886 0.1686 690.3587 0.3692 720.5282 0.2331 721.9178 0.2393 727.2067 0.2626 731.7326 0.3574 733.9851 0.3309 751.7620 0.4558 756.1409 0.3804 759.5638 0.3992 764.1295 0.2270 766.4406 0.4252 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in 22052612130314259.7.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 8 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 8 models are in 22052612130314259.7.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 8 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22052612130314259 8 -150 150 40 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-150 22052612130314259.eigenfacs 22052612130314259.atom calculating perturbed structure for DQ=-110 22052612130314259.eigenfacs 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perturbed structure for DQ=-70 22052612130314259.eigenfacs 22052612130314259.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 22052612130314259.eigenfacs 22052612130314259.atom calculating perturbed structure for DQ=10 22052612130314259.eigenfacs 22052612130314259.atom calculating perturbed structure for DQ=50 22052612130314259.eigenfacs 22052612130314259.atom calculating perturbed structure for DQ=90 22052612130314259.eigenfacs 22052612130314259.atom calculating perturbed structure for DQ=130 22052612130314259.eigenfacs 22052612130314259.atom making animated gifs 8 models are in 22052612130314259.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 8 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 8 models are in 22052612130314259.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be 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