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LOGs for ID: 22052006265779525

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22052006265779525.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22052006265779525.atom to be opened. Openam> File opened: 22052006265779525.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1323 First residue number = 1 Last residue number = 117 Number of atoms found = 21313 Mean number per residue = 16.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.443741 +/- 25.318619 From: -56.004000 To: 68.161000 = -1.434736 +/- 25.209428 From: -54.863000 To: 55.693000 = 5.379897 +/- 25.649082 From: -44.287000 To: 66.708000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -14.8408 % Filled. Pdbmat> 15338509 non-zero elements. Pdbmat> 1690344 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 158.62 +/- 48.07 Maximum number = 254 Minimum number = 20 Pdbmat> Matrix trace = 3.380688E+07 Pdbmat> Larger element = 914.393 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1323 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22052006265779525.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22052006265779525.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22052006265779525.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 21313 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1323 residues. Blocpdb> 114 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 113 atoms in block 2 Block first atom: 115 Blocpdb> 114 atoms in block 3 Block first atom: 228 Blocpdb> 104 atoms in block 4 Block first atom: 342 Blocpdb> 110 atoms in block 5 Block first atom: 446 Blocpdb> 119 atoms in block 6 Block first atom: 556 Blocpdb> 125 atoms in block 7 Block first atom: 675 Blocpdb> 81 atoms in block 8 Block first atom: 800 Blocpdb> 115 atoms in block 9 Block first atom: 881 Blocpdb> 107 atoms in block 10 Block first atom: 996 Blocpdb> 115 atoms in block 11 Block first atom: 1103 Blocpdb> 105 atoms in block 12 Block first atom: 1218 Blocpdb> 108 atoms in block 13 Block first atom: 1323 Blocpdb> 126 atoms in block 14 Block first atom: 1431 Blocpdb> 111 atoms in block 15 Block first atom: 1557 Blocpdb> 103 atoms in block 16 Block first atom: 1668 Blocpdb> 107 atoms in block 17 Block first atom: 1771 Blocpdb> 107 atoms in block 18 Block first atom: 1878 Blocpdb> 119 atoms in block 19 Block first atom: 1985 Blocpdb> 102 atoms in block 20 Block first atom: 2104 Blocpdb> 128 atoms in block 21 Block first atom: 2206 Blocpdb> 125 atoms in block 22 Block first atom: 2334 Blocpdb> 112 atoms in block 23 Block first atom: 2459 Blocpdb> 113 atoms in block 24 Block first atom: 2571 Blocpdb> 104 atoms in block 25 Block first atom: 2684 Blocpdb> 93 atoms in block 26 Block first atom: 2788 Blocpdb> 118 atoms in block 27 Block first atom: 2881 Blocpdb> 112 atoms in block 28 Block first atom: 2999 Blocpdb> 117 atoms in block 29 Block first atom: 3111 Blocpdb> 108 atoms in block 30 Block first atom: 3228 Blocpdb> 111 atoms in block 31 Block first atom: 3336 Blocpdb> 127 atoms in block 32 Block first atom: 3447 Blocpdb> 116 atoms in block 33 Block first atom: 3574 Blocpdb> 111 atoms in block 34 Block first atom: 3690 Blocpdb> 92 atoms in block 35 Block first atom: 3801 Blocpdb> 128 atoms in block 36 Block first atom: 3893 Blocpdb> 99 atoms in block 37 Block first atom: 4021 Blocpdb> 101 atoms in block 38 Block first atom: 4120 Blocpdb> 85 atoms in block 39 Block first atom: 4221 Blocpdb> 94 atoms in block 40 Block first atom: 4306 Blocpdb> 109 atoms in block 41 Block first atom: 4400 Blocpdb> 109 atoms in block 42 Block first atom: 4509 Blocpdb> 111 atoms in block 43 Block first atom: 4618 Blocpdb> 126 atoms in block 44 Block first atom: 4729 Blocpdb> 125 atoms in block 45 Block first atom: 4855 Blocpdb> 106 atoms in block 46 Block first atom: 4980 Blocpdb> 127 atoms in block 47 Block first atom: 5086 Blocpdb> 118 atoms in block 48 Block first atom: 5213 Blocpdb> 117 atoms in block 49 Block first atom: 5331 Blocpdb> 97 atoms in block 50 Block first atom: 5448 Blocpdb> 111 atoms in block 51 Block first atom: 5545 Blocpdb> 144 atoms in block 52 Block first atom: 5656 Blocpdb> 133 atoms in block 53 Block first atom: 5800 Blocpdb> 113 atoms in block 54 Block first atom: 5933 Blocpdb> 107 atoms in block 55 Block first atom: 6046 Blocpdb> 120 atoms in block 56 Block first atom: 6153 Blocpdb> 128 atoms in block 57 Block first atom: 6273 Blocpdb> 103 atoms in block 58 Block first atom: 6401 Blocpdb> 111 atoms in block 59 Block first atom: 6504 Blocpdb> 133 atoms in block 60 Block first atom: 6615 Blocpdb> 116 atoms in block 61 Block first atom: 6748 Blocpdb> 108 atoms in block 62 Block first atom: 6864 Blocpdb> 93 atoms in block 63 Block first atom: 6972 Blocpdb> 106 atoms in block 64 Block first atom: 7065 Blocpdb> 106 atoms in block 65 Block first atom: 7171 Blocpdb> 126 atoms in block 66 Block first atom: 7277 Blocpdb> 96 atoms in block 67 Block first atom: 7403 Blocpdb> 123 atoms in block 68 Block first atom: 7499 Blocpdb> 122 atoms in block 69 Block first atom: 7622 Blocpdb> 108 atoms in block 70 Block first atom: 7744 Blocpdb> 116 atoms in block 71 Block first atom: 7852 Blocpdb> 127 atoms in block 72 Block first atom: 7968 Blocpdb> 119 atoms in block 73 Block first atom: 8095 Blocpdb> 118 atoms in block 74 Block first atom: 8214 Blocpdb> 136 atoms in block 75 Block first atom: 8332 Blocpdb> 94 atoms in block 76 Block first atom: 8468 Blocpdb> 105 atoms in block 77 Block first atom: 8562 Blocpdb> 23 atoms in block 78 Block first atom: 8667 Blocpdb> 131 atoms in block 79 Block first atom: 8690 Blocpdb> 130 atoms in block 80 Block first atom: 8821 Blocpdb> 97 atoms in block 81 Block first atom: 8951 Blocpdb> 127 atoms in block 82 Block first atom: 9048 Blocpdb> 114 atoms in block 83 Block first atom: 9175 Blocpdb> 107 atoms in block 84 Block first atom: 9289 Blocpdb> 85 atoms in block 85 Block first atom: 9396 Blocpdb> 121 atoms in block 86 Block first atom: 9481 Blocpdb> 110 atoms in block 87 Block first atom: 9602 Blocpdb> 104 atoms in block 88 Block first atom: 9712 Blocpdb> 123 atoms in block 89 Block first atom: 9816 Blocpdb> 97 atoms in block 90 Block first atom: 9939 Blocpdb> 117 atoms in block 91 Block first atom: 10036 Blocpdb> 101 atoms in block 92 Block first atom: 10153 Blocpdb> 112 atoms in block 93 Block first atom: 10254 Blocpdb> 98 atoms in block 94 Block first atom: 10366 Blocpdb> 136 atoms in block 95 Block first atom: 10464 Blocpdb> 119 atoms in block 96 Block first atom: 10600 Blocpdb> 103 atoms in block 97 Block first atom: 10719 Blocpdb> 109 atoms in block 98 Block first atom: 10822 Blocpdb> 105 atoms in block 99 Block first atom: 10931 Blocpdb> 110 atoms in block 100 Block first atom: 11036 Blocpdb> 113 atoms in block 101 Block first atom: 11146 Blocpdb> 107 atoms in block 102 Block first atom: 11259 Blocpdb> 84 atoms in block 103 Block first atom: 11366 Blocpdb> 126 atoms in block 104 Block first atom: 11450 Blocpdb> 119 atoms in block 105 Block first atom: 11576 Blocpdb> 121 atoms in block 106 Block first atom: 11695 Blocpdb> 137 atoms in block 107 Block first atom: 11816 Blocpdb> 102 atoms in block 108 Block first atom: 11953 Blocpdb> 109 atoms in block 109 Block first atom: 12055 Blocpdb> 109 atoms in block 110 Block first atom: 12164 Blocpdb> 108 atoms in block 111 Block first atom: 12273 Blocpdb> 99 atoms in block 112 Block first atom: 12381 Blocpdb> 118 atoms in block 113 Block first atom: 12480 Blocpdb> 118 atoms in block 114 Block first atom: 12598 Blocpdb> 112 atoms in block 115 Block first atom: 12716 Blocpdb> 85 atoms in block 116 Block first atom: 12828 Blocpdb> 105 atoms in block 117 Block first atom: 12913 Blocpdb> 125 atoms in block 118 Block first atom: 13018 Blocpdb> 126 atoms in block 119 Block first atom: 13143 Blocpdb> 122 atoms in block 120 Block first atom: 13269 Blocpdb> 95 atoms in block 121 Block first atom: 13391 Blocpdb> 105 atoms in block 122 Block first atom: 13486 Blocpdb> 119 atoms in block 123 Block first atom: 13591 Blocpdb> 109 atoms in block 124 Block first atom: 13710 Blocpdb> 117 atoms in block 125 Block first atom: 13819 Blocpdb> 115 atoms in block 126 Block first atom: 13936 Blocpdb> 115 atoms in block 127 Block first atom: 14051 Blocpdb> 93 atoms in block 128 Block first atom: 14166 Blocpdb> 105 atoms in block 129 Block first atom: 14259 Blocpdb> 114 atoms in block 130 Block first atom: 14364 Blocpdb> 106 atoms in block 131 Block first atom: 14478 Blocpdb> 112 atoms in block 132 Block first atom: 14584 Blocpdb> 107 atoms in block 133 Block first atom: 14696 Blocpdb> 110 atoms in block 134 Block first atom: 14803 Blocpdb> 132 atoms in block 135 Block first atom: 14913 Blocpdb> 130 atoms in block 136 Block first atom: 15045 Blocpdb> 113 atoms in block 137 Block first atom: 15175 Blocpdb> 95 atoms in block 138 Block first atom: 15288 Blocpdb> 104 atoms in block 139 Block first atom: 15383 Blocpdb> 119 atoms in block 140 Block first atom: 15487 Blocpdb> 123 atoms in block 141 Block first atom: 15606 Blocpdb> 126 atoms in block 142 Block first atom: 15729 Blocpdb> 133 atoms in block 143 Block first atom: 15855 Blocpdb> 127 atoms in block 144 Block first atom: 15988 Blocpdb> 109 atoms in block 145 Block first atom: 16115 Blocpdb> 126 atoms in block 146 Block first atom: 16224 Blocpdb> 111 atoms in block 147 Block first atom: 16350 Blocpdb> 106 atoms in block 148 Block first atom: 16461 Blocpdb> 103 atoms in block 149 Block first atom: 16567 Blocpdb> 118 atoms in block 150 Block first atom: 16670 Blocpdb> 116 atoms in block 151 Block first atom: 16788 Blocpdb> 114 atoms in block 152 Block first atom: 16904 Blocpdb> 130 atoms in block 153 Block first atom: 17018 Blocpdb> 119 atoms in block 154 Block first atom: 17148 Blocpdb> 104 atoms in block 155 Block first atom: 17267 Blocpdb> 113 atoms in block 156 Block first atom: 17371 Blocpdb> 94 atoms in block 157 Block first atom: 17484 Blocpdb> 128 atoms in block 158 Block first atom: 17578 Blocpdb> 111 atoms in block 159 Block first atom: 17706 Blocpdb> 102 atoms in block 160 Block first atom: 17817 Blocpdb> 107 atoms in block 161 Block first atom: 17919 Blocpdb> 111 atoms in block 162 Block first atom: 18026 Blocpdb> 109 atoms in block 163 Block first atom: 18137 Blocpdb> 122 atoms in block 164 Block first atom: 18246 Blocpdb> 120 atoms in block 165 Block first atom: 18368 Blocpdb> 106 atoms in block 166 Block first atom: 18488 Blocpdb> 101 atoms in block 167 Block first atom: 18594 Blocpdb> 120 atoms in block 168 Block first atom: 18695 Blocpdb> 114 atoms in block 169 Block first atom: 18815 Blocpdb> 118 atoms in block 170 Block first atom: 18929 Blocpdb> 99 atoms in block 171 Block first atom: 19047 Blocpdb> 117 atoms in block 172 Block first atom: 19146 Blocpdb> 119 atoms in block 173 Block first atom: 19263 Blocpdb> 20 atoms in block 174 Block first atom: 19382 Blocpdb> 117 atoms in block 175 Block first atom: 19402 Blocpdb> 112 atoms in block 176 Block first atom: 19519 Blocpdb> 128 atoms in block 177 Block first atom: 19631 Blocpdb> 103 atoms in block 178 Block first atom: 19759 Blocpdb> 112 atoms in block 179 Block first atom: 19862 Blocpdb> 112 atoms in block 180 Block first atom: 19974 Blocpdb> 129 atoms in block 181 Block first atom: 20086 Blocpdb> 105 atoms in block 182 Block first atom: 20215 Blocpdb> 121 atoms in block 183 Block first atom: 20320 Blocpdb> 112 atoms in block 184 Block first atom: 20441 Blocpdb> 110 atoms in block 185 Block first atom: 20553 Blocpdb> 129 atoms in block 186 Block first atom: 20663 Blocpdb> 124 atoms in block 187 Block first atom: 20792 Blocpdb> 102 atoms in block 188 Block first atom: 20916 Blocpdb> 101 atoms in block 189 Block first atom: 21018 Blocpdb> 113 atoms in block 190 Block first atom: 21119 Blocpdb> 82 atoms in block 191 Block first atom: 21231 Blocpdb> 191 blocks. Blocpdb> At most, 144 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 20 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 15338700 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 63939 Prepmat> Matrix trace = 33806880.0001 Prepmat> Last element read: 63939 63939 356.0886 Prepmat> 18337 lines saved. Prepmat> 16756 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 21313 RTB> Total mass = 21313.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 21313 RTB> Number of blocks = 191 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 378672.7133 RTB> 54015 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1146 Diagstd> Nb of non-zero elements: 54015 Diagstd> Projected matrix trace = 378672.7133 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1146 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 378672.7133 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0256598 0.0472605 0.0946559 0.1342629 0.1636534 0.3018148 0.4175355 0.4734155 0.7525034 0.8546051 0.8876790 1.3434157 1.5669818 2.1789031 2.3296567 2.6725194 3.0996596 3.5676834 4.0835146 4.8705661 5.3186397 6.2124819 7.4252164 8.2705125 8.7005082 9.0480407 9.4186738 9.8871675 10.5106098 11.2697978 12.3340800 12.5961958 13.7685455 14.5635588 15.1186620 16.5574367 17.9929340 18.2405922 19.4861101 20.1070194 20.7653068 21.6822580 23.0955052 23.3284998 23.4595942 24.3979251 25.3629154 26.2270127 27.5431654 28.4577376 29.3282978 30.0636979 30.9834042 31.2315287 31.5599664 32.2016787 32.3007429 32.8953338 33.8749334 35.4796589 35.8013449 37.1322286 37.2277457 38.0664674 38.9327744 39.9138361 41.0496597 41.4009960 42.4278131 43.3575083 44.3001221 45.4943458 46.0262990 46.9905096 47.4025346 48.0902934 48.7410537 49.1715220 50.8056052 52.0751858 52.7873042 54.0982264 55.3118217 55.6513084 57.0179637 57.4703056 57.9354412 58.5671300 58.6947007 60.1790999 60.5529932 61.5532156 62.3931190 63.9909039 64.3984829 64.7517845 65.1484085 65.8209743 66.1995610 67.7929592 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034310 0.0034320 0.0034323 0.0034342 0.0034346 0.0034361 17.3949112 23.6072028 33.4094305 39.7899459 43.9296585 59.6575671 70.1684671 74.7164994 94.1996998 100.3871253 102.3112164 125.8636967 135.9337376 160.2928833 165.7453085 177.5234436 191.1843260 205.1107540 219.4382536 239.6541750 250.4353130 270.6623507 295.9033193 312.2924550 320.3078569 326.6423955 333.2653466 341.4532311 352.0539620 364.5468433 381.3718738 385.4029034 402.9390078 414.4088652 422.2327921 441.8672677 460.6236944 463.7829165 479.3556562 486.9329112 494.8396103 505.6471158 521.8660127 524.4917800 525.9634051 536.3789521 546.8835579 556.1215103 569.9046559 579.2892454 588.0831131 595.4104874 604.4492553 606.8647348 610.0473521 616.2182222 617.1653512 622.8198264 632.0253613 646.8223211 649.7479999 661.7147081 662.5652429 669.9872967 677.5681088 686.0519686 695.7449467 698.7159785 707.3275983 715.0352268 722.7660454 732.4432691 736.7129562 744.3897045 747.6460828 753.0503136 758.1283500 761.4687865 774.0180612 783.6293513 788.9691502 798.7057186 807.6147861 810.0894379 819.9759823 823.2221241 826.5467822 831.0406190 831.9452115 842.3995463 845.0124118 851.9628410 857.7557313 868.6691592 871.4311866 873.8183309 876.4904446 881.0030938 883.5331216 894.1030490 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 21313 Rtb_to_modes> Number of blocs = 191 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9828E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9885E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9905E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.5660E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.7261E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.4656E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1343 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1637 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3018 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4175 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4734 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7525 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8546 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8877 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.343 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.567 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.179 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.673 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.100 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.568 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.084 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.871 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.319 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.425 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.271 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.701 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.048 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.419 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.887 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.79 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1146 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00005 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 383634 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00005 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00003 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22052006265779525.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22052006265779525.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22052006265779525.atom Openam> file on opening on unit 11: 22052006265779525.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1323 First residue number = 1 Last residue number = 117 Number of atoms found = 21313 Mean number per residue = 16.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9828E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9885E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9905E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.5660E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.7261E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.4656E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1343 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1637 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3018 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4175 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4734 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7525 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8546 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8877 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.343 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.567 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.179 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.673 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.100 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.568 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.084 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.871 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.319 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.425 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.271 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.701 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.048 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.419 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.887 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.79 Bfactors> 106 vectors, 63939 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.025660 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.274 for 1323 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.075 +/- 0.11 Bfactors> = 85.204 +/- 10.50 Bfactors> Shiftng-fct= 85.129 Bfactors> Scaling-fct= 94.076 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22052006265779525.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22052006265779525.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4309E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4318E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 21313 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9783 0.0034 0.7485 0.0034 0.7604 0.0034 0.7112 0.0034 0.6462 0.0034 0.9376 17.3942 0.4107 23.6063 0.4549 33.4080 0.6311 39.7937 0.2145 43.9340 0.5002 59.6535 0.5741 70.1625 0.4411 74.7121 0.5719 94.1954 0.6386 100.3825 0.6558 102.3080 0.5447 125.8388 0.5569 135.9287 0.4493 160.2896 0.5907 165.7504 0.6709 177.5318 0.1947 191.1866 0.3933 205.1111 0.5460 219.4419 0.3494 239.6546 0.5101 250.4330 0.2818 270.6402 0.5486 295.8863 0.3830 312.2883 0.5047 320.3032 0.5313 326.6276 0.4622 333.2568 0.2534 341.4357 0.5715 352.0286 0.3655 364.5345 0.4417 381.2924 0.5772 385.4445 0.4700 402.9430 0.5691 414.3404 0.5900 422.2333 0.5781 441.8825 0.5054 460.5664 0.5172 463.7555 0.4036 479.3829 0.4210 486.9481 0.1139 494.8743 0.3555 505.5991 0.5147 521.8944 0.3658 524.4861 0.5003 525.9454 0.4656 536.3787 0.2370 546.8287 0.4565 556.1293 0.2892 569.8474 0.5115 579.2874 0.3804 588.0749 0.3969 595.3483 0.4633 604.3901 0.1645 606.8238 0.3227 610.0215 0.4244 616.1757 0.3665 617.1318 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22052006265779525.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22052006265779525.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22052006265779525 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom making animated gifs 11 models are in 22052006265779525.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22052006265779525.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22052006265779525.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22052006265779525 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22052006265779525.eigenfacs 22052006265779525.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22052006265779525.eigenfacs 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