*** TF ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22051920571238457.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22051920571238457.atom to be opened.
Openam> File opened: 22051920571238457.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 263
First residue number = 1
Last residue number = 263
Number of atoms found = 2087
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -9.249961 +/- 19.628473 From: -74.817000 To: 38.134000
= 5.015372 +/- 9.891991 From: -17.842000 To: 33.769000
= 8.381758 +/- 28.443469 From: -35.704000 To: 79.568000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.5591 % Filled.
Pdbmat> 697697 non-zero elements.
Pdbmat> 76140 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 72.97 +/- 25.38
Maximum number = 135
Minimum number = 8
Pdbmat> Matrix trace = 1.522800E+06
Pdbmat> Larger element = 489.775
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
263 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22051920571238457.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22051920571238457.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22051920571238457.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2087 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 263 residues.
Blocpdb> 10 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 11
Blocpdb> 15 atoms in block 3
Block first atom: 25
Blocpdb> 12 atoms in block 4
Block first atom: 40
Blocpdb> 17 atoms in block 5
Block first atom: 52
Blocpdb> 16 atoms in block 6
Block first atom: 69
Blocpdb> 21 atoms in block 7
Block first atom: 85
Blocpdb> 15 atoms in block 8
Block first atom: 106
Blocpdb> 15 atoms in block 9
Block first atom: 121
Blocpdb> 20 atoms in block 10
Block first atom: 136
Blocpdb> 15 atoms in block 11
Block first atom: 156
Blocpdb> 17 atoms in block 12
Block first atom: 171
Blocpdb> 23 atoms in block 13
Block first atom: 188
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 211
Blocpdb> 14 atoms in block 15
Block first atom: 227
Blocpdb> 17 atoms in block 16
Block first atom: 241
Blocpdb> 19 atoms in block 17
Block first atom: 258
Blocpdb> 14 atoms in block 18
Block first atom: 277
Blocpdb> 17 atoms in block 19
Block first atom: 291
Blocpdb> 13 atoms in block 20
Block first atom: 308
Blocpdb> 15 atoms in block 21
Block first atom: 321
Blocpdb> 12 atoms in block 22
Block first atom: 336
Blocpdb> 23 atoms in block 23
Block first atom: 348
Blocpdb> 15 atoms in block 24
Block first atom: 371
Blocpdb> 17 atoms in block 25
Block first atom: 386
Blocpdb> 19 atoms in block 26
Block first atom: 403
Blocpdb> 15 atoms in block 27
Block first atom: 422
Blocpdb> 16 atoms in block 28
Block first atom: 437
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 453
Blocpdb> 15 atoms in block 30
Block first atom: 467
Blocpdb> 17 atoms in block 31
Block first atom: 482
Blocpdb> 15 atoms in block 32
Block first atom: 499
Blocpdb> 17 atoms in block 33
Block first atom: 514
Blocpdb> 16 atoms in block 34
Block first atom: 531
Blocpdb> 16 atoms in block 35
Block first atom: 547
Blocpdb> 20 atoms in block 36
Block first atom: 563
Blocpdb> 16 atoms in block 37
Block first atom: 583
Blocpdb> 18 atoms in block 38
Block first atom: 599
Blocpdb> 18 atoms in block 39
Block first atom: 617
Blocpdb> 12 atoms in block 40
Block first atom: 635
Blocpdb> 12 atoms in block 41
Block first atom: 647
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 659
Blocpdb> 13 atoms in block 43
Block first atom: 675
Blocpdb> 10 atoms in block 44
Block first atom: 688
Blocpdb> 9 atoms in block 45
Block first atom: 698
Blocpdb> 16 atoms in block 46
Block first atom: 707
Blocpdb> 20 atoms in block 47
Block first atom: 723
Blocpdb> 17 atoms in block 48
Block first atom: 743
Blocpdb> 13 atoms in block 49
Block first atom: 760
Blocpdb> 20 atoms in block 50
Block first atom: 773
Blocpdb> 14 atoms in block 51
Block first atom: 793
Blocpdb> 20 atoms in block 52
Block first atom: 807
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 827
Blocpdb> 16 atoms in block 54
Block first atom: 843
Blocpdb> 13 atoms in block 55
Block first atom: 859
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 872
Blocpdb> 17 atoms in block 57
Block first atom: 886
Blocpdb> 17 atoms in block 58
Block first atom: 903
Blocpdb> 18 atoms in block 59
Block first atom: 920
Blocpdb> 11 atoms in block 60
Block first atom: 938
Blocpdb> 16 atoms in block 61
Block first atom: 949
Blocpdb> 15 atoms in block 62
Block first atom: 965
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 980
Blocpdb> 16 atoms in block 64
Block first atom: 994
Blocpdb> 17 atoms in block 65
Block first atom: 1010
Blocpdb> 18 atoms in block 66
Block first atom: 1027
Blocpdb> 15 atoms in block 67
Block first atom: 1045
Blocpdb> 22 atoms in block 68
Block first atom: 1060
Blocpdb> 16 atoms in block 69
Block first atom: 1082
Blocpdb> 18 atoms in block 70
Block first atom: 1098
Blocpdb> 14 atoms in block 71
Block first atom: 1116
Blocpdb> 19 atoms in block 72
Block first atom: 1130
Blocpdb> 15 atoms in block 73
Block first atom: 1149
Blocpdb> 15 atoms in block 74
Block first atom: 1164
Blocpdb> 17 atoms in block 75
Block first atom: 1179
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1196
Blocpdb> 19 atoms in block 77
Block first atom: 1212
Blocpdb> 20 atoms in block 78
Block first atom: 1231
Blocpdb> 26 atoms in block 79
Block first atom: 1251
Blocpdb> 15 atoms in block 80
Block first atom: 1277
Blocpdb> 12 atoms in block 81
Block first atom: 1292
Blocpdb> 10 atoms in block 82
Block first atom: 1304
Blocpdb> 18 atoms in block 83
Block first atom: 1314
Blocpdb> 12 atoms in block 84
Block first atom: 1332
Blocpdb> 16 atoms in block 85
Block first atom: 1344
Blocpdb> 15 atoms in block 86
Block first atom: 1360
Blocpdb> 17 atoms in block 87
Block first atom: 1375
Blocpdb> 19 atoms in block 88
Block first atom: 1392
Blocpdb> 16 atoms in block 89
Block first atom: 1411
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1427
Blocpdb> 13 atoms in block 91
Block first atom: 1442
Blocpdb> 17 atoms in block 92
Block first atom: 1455
Blocpdb> 18 atoms in block 93
Block first atom: 1472
Blocpdb> 17 atoms in block 94
Block first atom: 1490
Blocpdb> 16 atoms in block 95
Block first atom: 1507
Blocpdb> 12 atoms in block 96
Block first atom: 1523
Blocpdb> 15 atoms in block 97
Block first atom: 1535
Blocpdb> 17 atoms in block 98
Block first atom: 1550
Blocpdb> 14 atoms in block 99
Block first atom: 1567
Blocpdb> 19 atoms in block 100
Block first atom: 1581
Blocpdb> 15 atoms in block 101
Block first atom: 1600
Blocpdb> 15 atoms in block 102
Block first atom: 1615
Blocpdb> 13 atoms in block 103
Block first atom: 1630
Blocpdb> 16 atoms in block 104
Block first atom: 1643
Blocpdb> 14 atoms in block 105
Block first atom: 1659
Blocpdb> 13 atoms in block 106
Block first atom: 1673
Blocpdb> 18 atoms in block 107
Block first atom: 1686
Blocpdb> 13 atoms in block 108
Block first atom: 1704
Blocpdb> 22 atoms in block 109
Block first atom: 1717
Blocpdb> 17 atoms in block 110
Block first atom: 1739
Blocpdb> 23 atoms in block 111
Block first atom: 1756
Blocpdb> 16 atoms in block 112
Block first atom: 1779
Blocpdb> 9 atoms in block 113
Block first atom: 1795
Blocpdb> 14 atoms in block 114
Block first atom: 1804
Blocpdb> 18 atoms in block 115
Block first atom: 1818
Blocpdb> 15 atoms in block 116
Block first atom: 1836
Blocpdb> 16 atoms in block 117
Block first atom: 1851
Blocpdb> 15 atoms in block 118
Block first atom: 1867
Blocpdb> 16 atoms in block 119
Block first atom: 1882
Blocpdb> 13 atoms in block 120
Block first atom: 1898
Blocpdb> 14 atoms in block 121
Block first atom: 1911
Blocpdb> 19 atoms in block 122
Block first atom: 1925
Blocpdb> 17 atoms in block 123
Block first atom: 1944
Blocpdb> 14 atoms in block 124
Block first atom: 1961
Blocpdb> 11 atoms in block 125
Block first atom: 1975
Blocpdb> 13 atoms in block 126
Block first atom: 1986
Blocpdb> 20 atoms in block 127
Block first atom: 1999
Blocpdb> 18 atoms in block 128
Block first atom: 2019
Blocpdb> 14 atoms in block 129
Block first atom: 2037
Blocpdb> 15 atoms in block 130
Block first atom: 2051
Blocpdb> 15 atoms in block 131
Block first atom: 2066
Blocpdb> 7 atoms in block 132
Block first atom: 2080
Blocpdb> 132 blocks.
Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 697829 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 6261
Prepmat> Matrix trace = 1522800.0000
Prepmat> Last element read: 6261 6261 14.8429
Prepmat> 8779 lines saved.
Prepmat> 7623 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2087
RTB> Total mass = 2087.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2087
RTB> Number of blocks = 132
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 154950.6663
RTB> 39600 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 792
Diagstd> Nb of non-zero elements: 39600
Diagstd> Projected matrix trace = 154950.6663
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 792 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 154950.6663
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0027808 0.0030142 0.0146979 0.0233132
0.0971499 0.1259254 0.2341993 0.3347504 0.4813347
0.5795819 0.6134189 0.8625096 0.9292754 0.9829817
1.0185202 1.3536881 1.5359147 1.7688150 2.4787523
2.7036142 3.0569007 3.1736087 3.3988820 3.9756847
4.0795466 4.6123979 4.6926559 4.9948501 5.5673534
5.8382832 5.9757626 6.8996617 7.4376462 7.5050417
8.1672201 8.8864836 9.1165150 9.1638693 10.0434637
10.6062259 11.6628385 11.9027060 12.7345544 12.8271401
12.9680995 13.5371555 14.4335682 14.9124430 15.2114384
16.2765886 17.1081404 18.3906823 18.9206629 19.2175151
20.0168377 20.5373251 21.1934897 22.1296062 22.8304444
23.7315189 24.3355347 25.3124567 26.1480291 26.1891880
26.8590520 27.2557345 27.4734277 28.1583463 29.1639755
29.3099348 30.0701693 30.6820081 31.1943767 31.9786003
32.3620982 32.9020644 34.1764951 34.9091279 35.6134498
35.9532184 36.8425195 37.1418408 37.7388640 38.4677503
38.8457404 39.1842631 39.6121236 40.2197329 41.1012025
42.4426312 42.6195723 43.3242360 43.9971816 44.2895122
44.7180997 46.2341874 46.5205303 46.7459643 47.8198442
48.2956030
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034323 0.0034326 0.0034328 0.0034335 0.0034340
0.0034349 5.7264121 5.9618363 13.1650702 16.5804624
33.8467179 38.5346943 52.5518574 62.8283735 75.3388321
82.6709010 85.0499078 100.8503149 104.6809100 107.6633773
109.5923166 126.3439917 134.5794738 144.4230420 170.9668256
178.5532022 189.8610786 193.4514404 200.1996554 216.5216097
219.3316117 233.2161715 235.2364589 242.6925858 256.2239234
262.3843091 265.4556338 285.2391787 296.1508872 297.4896323
310.3361791 323.7130834 327.8760579 328.7265055 344.1414923
353.6516725 370.8492559 374.6434403 387.5137850 388.9199305
391.0510423 399.5388259 412.5552656 419.3432715 423.5263367
438.1037529 449.1554597 465.6870937 472.3494938 476.0404930
485.8397160 492.1156980 499.9154017 510.8367379 518.8627144
529.0028946 535.6926981 546.3392839 555.2834886 555.7203454
562.7825462 566.9231946 569.1827160 576.2339648 586.4333259
587.8989795 595.4745666 601.5021314 606.5036748 614.0800743
617.7512258 622.8835392 634.8323379 641.6006275 648.0407304
651.1246947 659.1282735 661.8003498 667.0980817 673.5094200
676.8103357 679.7529828 683.4540844 688.6758777 696.1816056
707.4511064 708.9242363 714.7608169 720.2905367 722.6794892
726.1677380 738.3748488 740.6578134 742.4502227 750.9298336
754.6560827
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2087
Rtb_to_modes> Number of blocs = 132
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9921E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9932E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.7808E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.0142E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4698E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3313E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.7150E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1259
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2342
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3348
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4813
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.30
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 792 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 1.00006 1.00001 1.00000 1.00002
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1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
1.00000 0.99996 1.00002 1.00000 0.99998
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1.00002 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999
1.00005
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 37566 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00002 0.99999 1.00001 1.00003 0.99997
1.00000 0.99995 1.00000 0.99997 1.00003
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0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 1.00002
1.00000 1.00006 1.00001 1.00000 1.00002
1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 0.99997
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1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002
0.99999 1.00000 1.00002 1.00004 1.00000
0.99998 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001
1.00002 1.00000 1.00002 1.00003 0.99999
1.00000 0.99999 0.99999 1.00003 0.99997
1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
1.00000 0.99996 1.00002 1.00000 0.99998
0.99998 0.99999 0.99998 0.99996 1.00004
0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 0.99998
1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999
1.00002 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999
1.00005
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22051920571238457.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22051920571238457.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22051920571238457.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22051920571238457.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 263
First residue number = 1
Last residue number = 263
Number of atoms found = 2087
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9906E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9921E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9932E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.7808E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.0142E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4698E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3313E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.7150E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1259
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2342
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3348
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4813
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5796
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6134
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8625
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9293
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9830
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.019
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.354
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.536
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.479
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.704
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.057
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.174
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.399
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.976
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.080
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.612
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.693
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.995
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.567
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.838
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.976
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.900
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.438
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.505
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.167
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.886
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.117
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.164
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.30
Bfactors> 106 vectors, 6261 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.002781
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.586 for 263 C-alpha atoms.
Bfactors> = 6.319 +/- 13.69
Bfactors> = 89.321 +/- 15.61
Bfactors> Shiftng-fct= 83.002
Bfactors> Scaling-fct= 1.140
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22051920571238457.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22051920571238457.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.726
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 5.962
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 16.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 107.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 126.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 144.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.6
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.7
Chkmod> 106 vectors, 6261 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2087 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 12 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 27 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 68 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 106 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9368
0.0034 0.9325
0.0034 0.7264
0.0034 0.6190
0.0034 0.9824
0.0034 0.5985
5.7261 0.5257
5.9616 0.3512
13.1645 0.3043
16.5797 0.1011
33.8453 0.1016
38.5292 0.2227
52.5497 0.2004
62.8303 0.1412
75.3329 0.5333
82.6686 0.0237
85.0449 0.1458
100.8454 0.2336
104.6778 0.0935
107.6598 0.3304
109.6134 0.2252
126.3531 0.2864
134.5774 0.2600
144.4244 0.5409
170.9680 0.2797
178.5583 0.1592
189.8560 0.1850
193.4551 0.2349
200.1945 0.1016
216.5209 0.2773
219.3344 0.5269
233.1961 0.1151
235.2350 0.2297
242.6858 0.4539
256.2048 0.4486
262.3667 0.0728
265.4495 0.4483
285.2339 0.1541
296.1452 0.1204
297.4760 0.1550
310.3187 0.1431
323.6904 0.0742
327.8707 0.5118
328.7147 0.0212
344.0674 0.2507
353.6994 0.3151
370.7882 0.3140
374.5848 0.0716
387.4279 0.4043
388.9466 0.2237
391.0629 0.3286
399.5636 0.0147
412.4866 0.1591
419.2909 0.1573
423.4881 0.4346
438.1309 0.0466
449.1606 0.2505
465.6585 0.0997
472.3209 0.2262
476.0508 0.2377
485.8572 0.1471
492.1266 0.2157
499.8528 0.1971
510.8194 0.1631
518.8354 0.3129
528.9633 0.4496
535.7188 0.1720
546.2893 0.1209
555.2806 0.2865
555.7051 0.4229
562.7683 0.4694
566.9432 0.1750
569.1228 0.2869
576.2261 0.1723
586.3682 0.1295
587.8744 0.2563
595.4473 0.3344
601.4566 0.0550
606.4351 0.3369
614.0672 0.3811
617.7047 0.3932
622.8373 0.2325
634.8376 0.2515
641.5811 0.1373
647.9815 0.0488
651.0676 0.1072
659.0774 0.2405
661.7555 0.2109
667.0795 0.3863
673.5002 0.2099
676.8184 0.3426
679.6868 0.1835
683.4064 0.2007
688.6486 0.3801
696.1415 0.2425
707.3988 0.5320
708.8974 0.2119
714.6952 0.3828
720.2827 0.4403
722.6524 0.0487
726.1520 0.3762
738.3097 0.3695
740.6218 0.1389
742.4504 0.4698
750.8988 0.4054
754.6580 0.2284
getting mode 7
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 8
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normal mode computation
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MODEL 5 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
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normal mode computation
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MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
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making small animated gif 100x100
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getting mode 10
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generate a series of perturbations for mode 10
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22051920571238457 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-60
22051920571238457.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-40
22051920571238457.eigenfacs
22051920571238457.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22051920571238457.eigenfacs
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22051920571238457.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=20
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22051920571238457.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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