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***  LoTPS3_NMA  ***

LOGs for ID: 220512003914130743

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 220512003914130743.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 220512003914130743.atom to be opened. Openam> File opened: 220512003914130743.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 538 First residue number = 1 Last residue number = 538 Number of atoms found = 8835 Mean number per residue = 16.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = 1.470687 +/- 15.117053 From: -35.798000 To: 37.486000 = 0.602997 +/- 13.038874 From: -35.935000 To: 37.508000 = 0.175780 +/- 14.431404 From: -35.680000 To: 36.801000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8691 % Filled. Pdbmat> 6565728 non-zero elements. Pdbmat> 723752 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 163.84 +/- 50.46 Maximum number = 255 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 1.447504E+07 Pdbmat> Larger element = 905.456 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 538 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 220512003914130743.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 220512003914130743.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 220512003914130743.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8835 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 538 residues. Blocpdb> 47 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 61 atoms in block 2 Block first atom: 48 Blocpdb> 41 atoms in block 3 Block first atom: 109 Blocpdb> 51 atoms in block 4 Block first atom: 150 Blocpdb> 50 atoms in block 5 Block first atom: 201 Blocpdb> 53 atoms in block 6 Block first atom: 251 Blocpdb> 50 atoms in block 7 Block first atom: 304 Blocpdb> 52 atoms in block 8 Block first atom: 354 Blocpdb> 43 atoms in block 9 Block first atom: 406 Blocpdb> 33 atoms in block 10 Block first atom: 449 Blocpdb> 50 atoms in block 11 Block first atom: 482 Blocpdb> 42 atoms in block 12 Block first atom: 532 Blocpdb> 58 atoms in block 13 Block first atom: 574 Blocpdb> 47 atoms in block 14 Block first atom: 632 Blocpdb> 48 atoms in block 15 Block first atom: 679 Blocpdb> 54 atoms in block 16 Block first atom: 727 Blocpdb> 52 atoms in block 17 Block first atom: 781 Blocpdb> 38 atoms in block 18 Block first atom: 833 Blocpdb> 56 atoms in block 19 Block first atom: 871 Blocpdb> 60 atoms in block 20 Block first atom: 927 Blocpdb> 50 atoms in block 21 Block first atom: 987 Blocpdb> 55 atoms in block 22 Block first atom: 1037 Blocpdb> 51 atoms in block 23 Block first atom: 1092 Blocpdb> 52 atoms in block 24 Block first atom: 1143 Blocpdb> 59 atoms in block 25 Block first atom: 1195 Blocpdb> 46 atoms in block 26 Block first atom: 1254 Blocpdb> 46 atoms in block 27 Block first atom: 1300 Blocpdb> 52 atoms in block 28 Block first atom: 1346 Blocpdb> 53 atoms in block 29 Block first atom: 1398 Blocpdb> 40 atoms in block 30 Block first atom: 1451 Blocpdb> 51 atoms in block 31 Block first atom: 1491 Blocpdb> 34 atoms in block 32 Block first atom: 1542 Blocpdb> 42 atoms in block 33 Block first atom: 1576 Blocpdb> 53 atoms in block 34 Block first atom: 1618 Blocpdb> 49 atoms in block 35 Block first atom: 1671 Blocpdb> 61 atoms in block 36 Block first atom: 1720 Blocpdb> 62 atoms in block 37 Block first atom: 1781 Blocpdb> 48 atoms in block 38 Block first atom: 1843 Blocpdb> 54 atoms in block 39 Block first atom: 1891 Blocpdb> 40 atoms in block 40 Block first atom: 1945 Blocpdb> 58 atoms in block 41 Block first atom: 1985 Blocpdb> 63 atoms in block 42 Block first atom: 2043 Blocpdb> 49 atoms in block 43 Block first atom: 2106 Blocpdb> 51 atoms in block 44 Block first atom: 2155 Blocpdb> 42 atoms in block 45 Block first atom: 2206 Blocpdb> 65 atoms in block 46 Block first atom: 2248 Blocpdb> 50 atoms in block 47 Block first atom: 2313 Blocpdb> 45 atoms in block 48 Block first atom: 2363 Blocpdb> 50 atoms in block 49 Block first atom: 2408 Blocpdb> 33 atoms in block 50 Block first atom: 2458 Blocpdb> 50 atoms in block 51 Block first atom: 2491 Blocpdb> 29 atoms in block 52 Block first atom: 2541 Blocpdb> 53 atoms in block 53 Block first atom: 2570 Blocpdb> 41 atoms in block 54 Block first atom: 2623 Blocpdb> 46 atoms in block 55 Block first atom: 2664 Blocpdb> 57 atoms in block 56 Block first atom: 2710 Blocpdb> 53 atoms in block 57 Block first atom: 2767 Blocpdb> 41 atoms in block 58 Block first atom: 2820 Blocpdb> 41 atoms in block 59 Block first atom: 2861 Blocpdb> 38 atoms in block 60 Block first atom: 2902 Blocpdb> 52 atoms in block 61 Block first atom: 2940 Blocpdb> 58 atoms in block 62 Block first atom: 2992 Blocpdb> 50 atoms in block 63 Block first atom: 3050 Blocpdb> 50 atoms in block 64 Block first atom: 3100 Blocpdb> 45 atoms in block 65 Block first atom: 3150 Blocpdb> 50 atoms in block 66 Block first atom: 3195 Blocpdb> 67 atoms in block 67 Block first atom: 3245 Blocpdb> 51 atoms in block 68 Block first atom: 3312 Blocpdb> 47 atoms in block 69 Block first atom: 3363 Blocpdb> 35 atoms in block 70 Block first atom: 3410 Blocpdb> 49 atoms in block 71 Block first atom: 3445 Blocpdb> 41 atoms in block 72 Block first atom: 3494 Blocpdb> 46 atoms in block 73 Block first atom: 3535 Blocpdb> 50 atoms in block 74 Block first atom: 3581 Blocpdb> 54 atoms in block 75 Block first atom: 3631 Blocpdb> 46 atoms in block 76 Block first atom: 3685 Blocpdb> 50 atoms in block 77 Block first atom: 3731 Blocpdb> 61 atoms in block 78 Block first atom: 3781 Blocpdb> 54 atoms in block 79 Block first atom: 3842 Blocpdb> 56 atoms in block 80 Block first atom: 3896 Blocpdb> 50 atoms in block 81 Block first atom: 3952 Blocpdb> 70 atoms in block 82 Block first atom: 4002 Blocpdb> 40 atoms in block 83 Block first atom: 4072 Blocpdb> 55 atoms in block 84 Block first atom: 4112 Blocpdb> 45 atoms in block 85 Block first atom: 4167 Blocpdb> 62 atoms in block 86 Block first atom: 4212 Blocpdb> 38 atoms in block 87 Block first atom: 4274 Blocpdb> 63 atoms in block 88 Block first atom: 4312 Blocpdb> 59 atoms in block 89 Block first atom: 4375 Blocpdb> 44 atoms in block 90 Block first atom: 4434 Blocpdb> 52 atoms in block 91 Block first atom: 4478 Blocpdb> 45 atoms in block 92 Block first atom: 4530 Blocpdb> 54 atoms in block 93 Block first atom: 4575 Blocpdb> 55 atoms in block 94 Block first atom: 4629 Blocpdb> 50 atoms in block 95 Block first atom: 4684 Blocpdb> 54 atoms in block 96 Block first atom: 4734 Blocpdb> 48 atoms in block 97 Block first atom: 4788 Blocpdb> 59 atoms in block 98 Block first atom: 4836 Blocpdb> 43 atoms in block 99 Block first atom: 4895 Blocpdb> 51 atoms in block 100 Block first atom: 4938 Blocpdb> 39 atoms in block 101 Block first atom: 4989 Blocpdb> 41 atoms in block 102 Block first atom: 5028 Blocpdb> 49 atoms in block 103 Block first atom: 5069 Blocpdb> 48 atoms in block 104 Block first atom: 5118 Blocpdb> 46 atoms in block 105 Block first atom: 5166 Blocpdb> 58 atoms in block 106 Block first atom: 5212 Blocpdb> 37 atoms in block 107 Block first atom: 5270 Blocpdb> 45 atoms in block 108 Block first atom: 5307 Blocpdb> 55 atoms in block 109 Block first atom: 5352 Blocpdb> 62 atoms in block 110 Block first atom: 5407 Blocpdb> 47 atoms in block 111 Block first atom: 5469 Blocpdb> 47 atoms in block 112 Block first atom: 5516 Blocpdb> 54 atoms in block 113 Block first atom: 5563 Blocpdb> 43 atoms in block 114 Block first atom: 5617 Blocpdb> 42 atoms in block 115 Block first atom: 5660 Blocpdb> 51 atoms in block 116 Block first atom: 5702 Blocpdb> 40 atoms in block 117 Block first atom: 5753 Blocpdb> 43 atoms in block 118 Block first atom: 5793 Blocpdb> 47 atoms in block 119 Block first atom: 5836 Blocpdb> 47 atoms in block 120 Block first atom: 5883 Blocpdb> 63 atoms in block 121 Block first atom: 5930 Blocpdb> 58 atoms in block 122 Block first atom: 5993 Blocpdb> 44 atoms in block 123 Block first atom: 6051 Blocpdb> 53 atoms in block 124 Block first atom: 6095 Blocpdb> 48 atoms in block 125 Block first atom: 6148 Blocpdb> 54 atoms in block 126 Block first atom: 6196 Blocpdb> 54 atoms in block 127 Block first atom: 6250 Blocpdb> 44 atoms in block 128 Block first atom: 6304 Blocpdb> 44 atoms in block 129 Block first atom: 6348 Blocpdb> 62 atoms in block 130 Block first atom: 6392 Blocpdb> 40 atoms in block 131 Block first atom: 6454 Blocpdb> 41 atoms in block 132 Block first atom: 6494 Blocpdb> 40 atoms in block 133 Block first atom: 6535 Blocpdb> 58 atoms in block 134 Block first atom: 6575 Blocpdb> 52 atoms in block 135 Block first atom: 6633 Blocpdb> 59 atoms in block 136 Block first atom: 6685 Blocpdb> 43 atoms in block 137 Block first atom: 6744 Blocpdb> 45 atoms in block 138 Block first atom: 6787 Blocpdb> 51 atoms in block 139 Block first atom: 6832 Blocpdb> 60 atoms in block 140 Block first atom: 6883 Blocpdb> 45 atoms in block 141 Block first atom: 6943 Blocpdb> 47 atoms in block 142 Block first atom: 6988 Blocpdb> 49 atoms in block 143 Block first atom: 7035 Blocpdb> 43 atoms in block 144 Block first atom: 7084 Blocpdb> 52 atoms in block 145 Block first atom: 7127 Blocpdb> 67 atoms in block 146 Block first atom: 7179 Blocpdb> 43 atoms in block 147 Block first atom: 7246 Blocpdb> 44 atoms in block 148 Block first atom: 7289 Blocpdb> 48 atoms in block 149 Block first atom: 7333 Blocpdb> 54 atoms in block 150 Block first atom: 7381 Blocpdb> 47 atoms in block 151 Block first atom: 7435 Blocpdb> 39 atoms in block 152 Block first atom: 7482 Blocpdb> 42 atoms in block 153 Block first atom: 7521 Blocpdb> 62 atoms in block 154 Block first atom: 7563 Blocpdb> 46 atoms in block 155 Block first atom: 7625 Blocpdb> 29 atoms in block 156 Block first atom: 7671 Blocpdb> 45 atoms in block 157 Block first atom: 7700 Blocpdb> 49 atoms in block 158 Block first atom: 7745 Blocpdb> 55 atoms in block 159 Block first atom: 7794 Blocpdb> 52 atoms in block 160 Block first atom: 7849 Blocpdb> 45 atoms in block 161 Block first atom: 7901 Blocpdb> 49 atoms in block 162 Block first atom: 7946 Blocpdb> 55 atoms in block 163 Block first atom: 7995 Blocpdb> 46 atoms in block 164 Block first atom: 8050 Blocpdb> 37 atoms in block 165 Block first atom: 8096 Blocpdb> 42 atoms in block 166 Block first atom: 8133 Blocpdb> 54 atoms in block 167 Block first atom: 8175 Blocpdb> 38 atoms in block 168 Block first atom: 8229 Blocpdb> 44 atoms in block 169 Block first atom: 8267 Blocpdb> 45 atoms in block 170 Block first atom: 8311 Blocpdb> 61 atoms in block 171 Block first atom: 8356 Blocpdb> 50 atoms in block 172 Block first atom: 8417 Blocpdb> 44 atoms in block 173 Block first atom: 8467 Blocpdb> 43 atoms in block 174 Block first atom: 8511 Blocpdb> 52 atoms in block 175 Block first atom: 8554 Blocpdb> 46 atoms in block 176 Block first atom: 8606 Blocpdb> 57 atoms in block 177 Block first atom: 8652 Blocpdb> 57 atoms in block 178 Block first atom: 8709 Blocpdb> 50 atoms in block 179 Block first atom: 8766 Blocpdb> 20 atoms in block 180 Block first atom: 8815 Blocpdb> 180 blocks. Blocpdb> At most, 70 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 20 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 6565908 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 26505 Prepmat> Matrix trace = 14475040.0000 Prepmat> Last element read: 26505 26505 316.7793 Prepmat> 16291 lines saved. Prepmat> 14139 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8835 RTB> Total mass = 8835.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8835 RTB> Number of blocks = 180 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 461436.1326 RTB> 74736 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1080 Diagstd> Nb of non-zero elements: 74736 Diagstd> Projected matrix trace = 461436.1326 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1080 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 461436.1326 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 3.3629357 3.8090182 4.1546136 6.6320376 7.4129335 9.1131888 10.2348019 11.1485502 11.8463678 12.8711237 13.4868650 14.8100831 15.6380348 16.6021672 17.0507361 18.0519981 19.0598486 19.7668855 20.6371071 21.7258384 23.1529819 24.7982501 25.1614876 27.1267926 28.2675548 30.1699228 30.3411884 30.8638995 32.2200491 32.6737557 33.3615658 34.2052073 35.5674340 35.6508293 37.1688066 37.6735548 38.9845531 39.6675688 40.9679501 41.6668968 42.1973379 44.2115607 45.6178826 46.9523732 47.8280305 49.7721772 50.2550115 52.0283063 53.3750318 53.9874179 54.5088206 56.7116070 57.9403892 59.1284772 60.1689484 60.5502515 63.0295168 64.2365568 65.5295643 66.5218651 68.7538389 69.7207572 69.9682319 70.9786883 73.3004300 74.3997765 75.7886475 76.5090592 77.3190239 78.3136403 78.8746077 79.8025448 80.8115941 82.0833416 83.0556284 83.5333221 85.1568621 85.6240663 87.3271174 88.3020792 88.6684983 90.6162855 92.1029205 92.9652665 93.6751745 94.2734692 95.5415275 96.0711697 97.4298948 98.1567035 98.9889012 99.8363777 101.7644412 102.2568526 103.8360986 105.3737510 106.3473703 107.1104671 108.2671913 109.5638313 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034294 0.0034294 0.0034331 0.0034343 0.0034348 0.0034377 199.1381942 211.9345718 221.3403534 279.6525417 295.6584757 327.8162403 347.4041487 362.5805285 373.7557525 389.5861537 398.7959920 417.9015939 429.4240539 442.4637253 448.4012837 461.3791030 474.0836782 482.7968226 493.3097388 506.1550247 522.5149802 540.7615426 544.7076034 565.5805988 577.3503078 596.4614498 598.1520198 603.2824319 616.3939667 620.7186708 627.2179706 635.0989483 647.6219313 648.3807291 662.0405470 666.5206070 678.0185252 683.9322327 695.0521596 700.9561634 705.4038199 722.0432350 733.4370453 744.0875782 750.9941067 766.1055343 769.8125177 783.2765498 793.3491371 797.8873114 801.7309931 817.7701561 826.5820775 835.0137505 842.3284919 844.9932815 862.1191046 870.3349169 879.0506924 885.6813276 900.4171458 906.7265400 908.3343331 914.8697433 929.7122249 936.6581057 945.3602963 949.8427474 954.8572757 960.9791969 964.4148443 970.0712882 976.1849711 983.8361912 989.6458650 992.4877547 1002.0862552 1004.8314154 1014.7751943 1020.4241897 1022.5391784 1033.7092634 1042.1541950 1047.0215958 1051.0116639 1054.3626789 1061.4300301 1064.3680257 1071.8682259 1075.8587656 1080.4098425 1085.0248580 1095.4518833 1098.0989872 1106.5459713 1114.7089810 1119.8469149 1123.8574708 1129.9096439 1136.6555731 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8835 Rtb_to_modes> Number of blocs = 180 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9735E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9735E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0022E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.363 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.809 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.155 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.632 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.413 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.113 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.6 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99996 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 0.99996 1.00002 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00005 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 159030 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 0.99996 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 0.99996 1.00002 1.00002 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00005 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00003 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220512003914130743.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220512003914130743.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 220512003914130743.atom Openam> file on opening on unit 11: 220512003914130743.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 538 First residue number = 1 Last residue number = 538 Number of atoms found = 8835 Mean number per residue = 16.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9735E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9735E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0022E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.363 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.809 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.155 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.632 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.413 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.113 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.6 Bfactors> 106 vectors, 26505 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.363000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.504 for 538 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.005 +/- 0.01 Bfactors> = 86.794 +/- 15.53 Bfactors> Shiftng-fct= 86.789 Bfactors> Scaling-fct= 1846.917 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220512003914130743.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220512003914130743.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4293E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4293E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4376E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.7 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vecteur en lecture: 970.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1115. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1120. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1124. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1130. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1137. Chkmod> 106 vectors, 26505 coordinates in file. Chkmod> That is: 8835 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 69 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7179 0.0034 0.8426 0.0034 0.8030 0.0034 0.9159 0.0034 0.7345 0.0034 0.9674 199.1315 0.0594 211.9250 0.5638 221.3411 0.4598 279.6397 0.6248 295.6471 0.0900 327.7988 0.1332 347.3077 0.2275 362.5885 0.1473 373.7970 0.2500 389.5524 0.3645 398.8252 0.4827 417.8825 0.1943 429.4326 0.3788 442.4159 0.0731 448.3724 0.2010 461.3338 0.1011 474.0652 0.1378 482.8141 0.1336 493.3231 0.1803 506.1818 0.4146 522.4589 0.1952 540.7574 0.1537 544.6681 0.3267 565.5898 0.3870 577.3505 0.1098 596.4366 0.3525 598.1146 0.3238 603.2184 0.1470 616.3670 0.2163 620.6564 0.2393 627.1763 0.4229 635.1162 0.2832 647.6175 0.3568 648.3454 0.4147 662.0228 0.4576 666.4605 0.4099 677.9498 0.4411 683.9238 0.2761 695.0397 0.2922 700.9522 0.3814 705.3958 0.5463 721.9995 0.1705 733.4226 0.4792 744.0368 0.2536 750.9773 0.2226 766.0559 0.2780 769.8177 0.2444 783.2557 0.3543 793.3520 0.5528 797.8721 0.4853 801.7053 0.3501 817.7235 0.4242 826.5438 0.5119 834.9887 0.3894 842.2997 0.5318 844.9553 0.4749 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perturbed structure for DQ=-80 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom making animated gifs 11 models are in 220512003914130743.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003914130743.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003914130743.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 220512003914130743 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom making animated gifs 11 models are in 220512003914130743.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003914130743.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003914130743.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 220512003914130743 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 220512003914130743 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom 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300x300 11 models are in 220512003914130743.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 220512003914130743 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220512003914130743.eigenfacs 220512003914130743.atom calculating perturbed structure for DQ=0 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will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003914130743.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 220512003914130743.10.pdb 220512003914130743.11.pdb 220512003914130743.7.pdb 220512003914130743.8.pdb 220512003914130743.9.pdb STDERR: real 0m38.729s user 0m38.464s sys 0m0.216s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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