CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  Q20HUZ_NMA  ***

LOGs for ID: 220512003338119574

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 220512003338119574.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 220512003338119574.atom to be opened. Openam> File opened: 220512003338119574.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 559 First residue number = 1 Last residue number = 559 Number of atoms found = 8992 Mean number per residue = 16.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 1.133539 +/- 15.802308 From: -34.062000 To: 41.171000 = 0.289532 +/- 11.920934 From: -33.783000 To: 27.245000 = -1.120212 +/- 14.708685 From: -38.764000 To: 32.442000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8926 % Filled. Pdbmat> 6886482 non-zero elements. Pdbmat> 759285 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 168.88 +/- 47.19 Maximum number = 253 Minimum number = 19 Pdbmat> Matrix trace = 1.518570E+07 Pdbmat> Larger element = 893.814 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 559 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 220512003338119574.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 220512003338119574.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 220512003338119574.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8992 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 559 residues. Blocpdb> 43 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 51 atoms in block 2 Block first atom: 44 Blocpdb> 47 atoms in block 3 Block first atom: 95 Blocpdb> 39 atoms in block 4 Block first atom: 142 Blocpdb> 43 atoms in block 5 Block first atom: 181 Blocpdb> 46 atoms in block 6 Block first atom: 224 Blocpdb> 50 atoms in block 7 Block first atom: 270 Blocpdb> 49 atoms in block 8 Block first atom: 320 Blocpdb> 48 atoms in block 9 Block first atom: 369 Blocpdb> 56 atoms in block 10 Block first atom: 417 Blocpdb> 59 atoms in block 11 Block first atom: 473 Blocpdb> 52 atoms in block 12 Block first atom: 532 Blocpdb> 48 atoms in block 13 Block first atom: 584 Blocpdb> 42 atoms in block 14 Block first atom: 632 Blocpdb> 52 atoms in block 15 Block first atom: 674 Blocpdb> 47 atoms in block 16 Block first atom: 726 Blocpdb> 50 atoms in block 17 Block first atom: 773 Blocpdb> 60 atoms in block 18 Block first atom: 823 Blocpdb> 57 atoms in block 19 Block first atom: 883 Blocpdb> 39 atoms in block 20 Block first atom: 940 Blocpdb> 58 atoms in block 21 Block first atom: 979 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 1037 Blocpdb> 61 atoms in block 23 Block first atom: 1075 Blocpdb> 51 atoms in block 24 Block first atom: 1136 Blocpdb> 52 atoms in block 25 Block first atom: 1187 Blocpdb> 41 atoms in block 26 Block first atom: 1239 Blocpdb> 58 atoms in block 27 Block first atom: 1280 Blocpdb> 56 atoms in block 28 Block first atom: 1338 Blocpdb> 51 atoms in block 29 Block first atom: 1394 Blocpdb> 33 atoms in block 30 Block first atom: 1445 Blocpdb> 42 atoms in block 31 Block first atom: 1478 Blocpdb> 39 atoms in block 32 Block first atom: 1520 Blocpdb> 38 atoms in block 33 Block first atom: 1559 Blocpdb> 44 atoms in block 34 Block first atom: 1597 Blocpdb> 43 atoms in block 35 Block first atom: 1641 Blocpdb> 51 atoms in block 36 Block first atom: 1684 Blocpdb> 57 atoms in block 37 Block first atom: 1735 Blocpdb> 43 atoms in block 38 Block first atom: 1792 Blocpdb> 51 atoms in block 39 Block first atom: 1835 Blocpdb> 37 atoms in block 40 Block first atom: 1886 Blocpdb> 57 atoms in block 41 Block first atom: 1923 Blocpdb> 51 atoms in block 42 Block first atom: 1980 Blocpdb> 43 atoms in block 43 Block first atom: 2031 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 2074 Blocpdb> 32 atoms in block 45 Block first atom: 2118 Blocpdb> 47 atoms in block 46 Block first atom: 2150 Blocpdb> 36 atoms in block 47 Block first atom: 2197 Blocpdb> 58 atoms in block 48 Block first atom: 2233 Blocpdb> 40 atoms in block 49 Block first atom: 2291 Blocpdb> 54 atoms in block 50 Block first atom: 2331 Blocpdb> 45 atoms in block 51 Block first atom: 2385 Blocpdb> 48 atoms in block 52 Block first atom: 2430 Blocpdb> 41 atoms in block 53 Block first atom: 2478 Blocpdb> 53 atoms in block 54 Block first atom: 2519 Blocpdb> 44 atoms in block 55 Block first atom: 2572 Blocpdb> 44 atoms in block 56 Block first atom: 2616 Blocpdb> 42 atoms in block 57 Block first atom: 2660 Blocpdb> 64 atoms in block 58 Block first atom: 2702 Blocpdb> 47 atoms in block 59 Block first atom: 2766 Blocpdb> 55 atoms in block 60 Block first atom: 2813 Blocpdb> 45 atoms in block 61 Block first atom: 2868 Blocpdb> 41 atoms in block 62 Block first atom: 2913 Blocpdb> 43 atoms in block 63 Block first atom: 2954 Blocpdb> 50 atoms in block 64 Block first atom: 2997 Blocpdb> 44 atoms in block 65 Block first atom: 3047 Blocpdb> 52 atoms in block 66 Block first atom: 3091 Blocpdb> 45 atoms in block 67 Block first atom: 3143 Blocpdb> 55 atoms in block 68 Block first atom: 3188 Blocpdb> 44 atoms in block 69 Block first atom: 3243 Blocpdb> 59 atoms in block 70 Block first atom: 3287 Blocpdb> 45 atoms in block 71 Block first atom: 3346 Blocpdb> 44 atoms in block 72 Block first atom: 3391 Blocpdb> 36 atoms in block 73 Block first atom: 3435 Blocpdb> 57 atoms in block 74 Block first atom: 3471 Blocpdb> 58 atoms in block 75 Block first atom: 3528 Blocpdb> 53 atoms in block 76 Block first atom: 3586 Blocpdb> 50 atoms in block 77 Block first atom: 3639 Blocpdb> 44 atoms in block 78 Block first atom: 3689 Blocpdb> 53 atoms in block 79 Block first atom: 3733 Blocpdb> 51 atoms in block 80 Block first atom: 3786 Blocpdb> 54 atoms in block 81 Block first atom: 3837 Blocpdb> 53 atoms in block 82 Block first atom: 3891 Blocpdb> 47 atoms in block 83 Block first atom: 3944 Blocpdb> 49 atoms in block 84 Block first atom: 3991 Blocpdb> 51 atoms in block 85 Block first atom: 4040 Blocpdb> 51 atoms in block 86 Block first atom: 4091 Blocpdb> 72 atoms in block 87 Block first atom: 4142 Blocpdb> 45 atoms in block 88 Block first atom: 4214 Blocpdb> 40 atoms in block 89 Block first atom: 4259 Blocpdb> 51 atoms in block 90 Block first atom: 4299 Blocpdb> 55 atoms in block 91 Block first atom: 4350 Blocpdb> 58 atoms in block 92 Block first atom: 4405 Blocpdb> 52 atoms in block 93 Block first atom: 4463 Blocpdb> 54 atoms in block 94 Block first atom: 4515 Blocpdb> 29 atoms in block 95 Block first atom: 4569 Blocpdb> 43 atoms in block 96 Block first atom: 4598 Blocpdb> 48 atoms in block 97 Block first atom: 4641 Blocpdb> 51 atoms in block 98 Block first atom: 4689 Blocpdb> 63 atoms in block 99 Block first atom: 4740 Blocpdb> 43 atoms in block 100 Block first atom: 4803 Blocpdb> 47 atoms in block 101 Block first atom: 4846 Blocpdb> 50 atoms in block 102 Block first atom: 4893 Blocpdb> 49 atoms in block 103 Block first atom: 4943 Blocpdb> 43 atoms in block 104 Block first atom: 4992 Blocpdb> 47 atoms in block 105 Block first atom: 5035 Blocpdb> 41 atoms in block 106 Block first atom: 5082 Blocpdb> 44 atoms in block 107 Block first atom: 5123 Blocpdb> 53 atoms in block 108 Block first atom: 5167 Blocpdb> 49 atoms in block 109 Block first atom: 5220 Blocpdb> 50 atoms in block 110 Block first atom: 5269 Blocpdb> 60 atoms in block 111 Block first atom: 5319 Blocpdb> 40 atoms in block 112 Block first atom: 5379 Blocpdb> 40 atoms in block 113 Block first atom: 5419 Blocpdb> 45 atoms in block 114 Block first atom: 5459 Blocpdb> 60 atoms in block 115 Block first atom: 5504 Blocpdb> 44 atoms in block 116 Block first atom: 5564 Blocpdb> 52 atoms in block 117 Block first atom: 5608 Blocpdb> 46 atoms in block 118 Block first atom: 5660 Blocpdb> 48 atoms in block 119 Block first atom: 5706 Blocpdb> 44 atoms in block 120 Block first atom: 5754 Blocpdb> 40 atoms in block 121 Block first atom: 5798 Blocpdb> 53 atoms in block 122 Block first atom: 5838 Blocpdb> 43 atoms in block 123 Block first atom: 5891 Blocpdb> 47 atoms in block 124 Block first atom: 5934 Blocpdb> 55 atoms in block 125 Block first atom: 5981 Blocpdb> 56 atoms in block 126 Block first atom: 6036 Blocpdb> 55 atoms in block 127 Block first atom: 6092 Blocpdb> 42 atoms in block 128 Block first atom: 6147 Blocpdb> 57 atoms in block 129 Block first atom: 6189 Blocpdb> 47 atoms in block 130 Block first atom: 6246 Blocpdb> 53 atoms in block 131 Block first atom: 6293 Blocpdb> 39 atoms in block 132 Block first atom: 6346 Blocpdb> 47 atoms in block 133 Block first atom: 6385 Blocpdb> 52 atoms in block 134 Block first atom: 6432 Blocpdb> 56 atoms in block 135 Block first atom: 6484 Blocpdb> 43 atoms in block 136 Block first atom: 6540 Blocpdb> 41 atoms in block 137 Block first atom: 6583 Blocpdb> 55 atoms in block 138 Block first atom: 6624 Blocpdb> 30 atoms in block 139 Block first atom: 6679 Blocpdb> 47 atoms in block 140 Block first atom: 6709 Blocpdb> 52 atoms in block 141 Block first atom: 6756 Blocpdb> 47 atoms in block 142 Block first atom: 6808 Blocpdb> 47 atoms in block 143 Block first atom: 6855 Blocpdb> 55 atoms in block 144 Block first atom: 6902 Blocpdb> 48 atoms in block 145 Block first atom: 6957 Blocpdb> 51 atoms in block 146 Block first atom: 7005 Blocpdb> 49 atoms in block 147 Block first atom: 7056 Blocpdb> 46 atoms in block 148 Block first atom: 7105 Blocpdb> 40 atoms in block 149 Block first atom: 7151 Blocpdb> 50 atoms in block 150 Block first atom: 7191 Blocpdb> 67 atoms in block 151 Block first atom: 7241 Blocpdb> 33 atoms in block 152 Block first atom: 7308 Blocpdb> 56 atoms in block 153 Block first atom: 7341 Blocpdb> 44 atoms in block 154 Block first atom: 7397 Blocpdb> 58 atoms in block 155 Block first atom: 7441 Blocpdb> 37 atoms in block 156 Block first atom: 7499 Blocpdb> 32 atoms in block 157 Block first atom: 7536 Blocpdb> 41 atoms in block 158 Block first atom: 7568 Blocpdb> 60 atoms in block 159 Block first atom: 7609 Blocpdb> 40 atoms in block 160 Block first atom: 7669 Blocpdb> 32 atoms in block 161 Block first atom: 7709 Blocpdb> 42 atoms in block 162 Block first atom: 7741 Blocpdb> 43 atoms in block 163 Block first atom: 7783 Blocpdb> 50 atoms in block 164 Block first atom: 7826 Blocpdb> 47 atoms in block 165 Block first atom: 7876 Blocpdb> 48 atoms in block 166 Block first atom: 7923 Blocpdb> 56 atoms in block 167 Block first atom: 7971 Blocpdb> 57 atoms in block 168 Block first atom: 8027 Blocpdb> 53 atoms in block 169 Block first atom: 8084 Blocpdb> 50 atoms in block 170 Block first atom: 8137 Blocpdb> 44 atoms in block 171 Block first atom: 8187 Blocpdb> 45 atoms in block 172 Block first atom: 8231 Blocpdb> 56 atoms in block 173 Block first atom: 8276 Blocpdb> 47 atoms in block 174 Block first atom: 8332 Blocpdb> 45 atoms in block 175 Block first atom: 8379 Blocpdb> 53 atoms in block 176 Block first atom: 8424 Blocpdb> 53 atoms in block 177 Block first atom: 8477 Blocpdb> 64 atoms in block 178 Block first atom: 8530 Blocpdb> 43 atoms in block 179 Block first atom: 8594 Blocpdb> 47 atoms in block 180 Block first atom: 8637 Blocpdb> 46 atoms in block 181 Block first atom: 8684 Blocpdb> 51 atoms in block 182 Block first atom: 8730 Blocpdb> 46 atoms in block 183 Block first atom: 8781 Blocpdb> 52 atoms in block 184 Block first atom: 8827 Blocpdb> 50 atoms in block 185 Block first atom: 8879 Blocpdb> 44 atoms in block 186 Block first atom: 8929 Blocpdb> 20 atoms in block 187 Block first atom: 8972 Blocpdb> 187 blocks. Blocpdb> At most, 72 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 20 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 6886669 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 26976 Prepmat> Matrix trace = 15185700.0000 Prepmat> Last element read: 26976 26976 403.5626 Prepmat> 17579 lines saved. Prepmat> 15257 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8992 RTB> Total mass = 8992.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8992 RTB> Number of blocks = 187 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 504317.5608 RTB> 80751 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1122 Diagstd> Nb of non-zero elements: 80751 Diagstd> Projected matrix trace = 504317.5608 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1122 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 504317.5608 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 3.6493143 4.5238602 7.0274374 11.3133240 12.6813521 13.4107330 14.4808107 15.5408991 16.8612781 17.9072571 18.9284884 21.5653694 22.6168209 23.2438388 24.9179953 27.1201582 29.8741535 30.6556389 32.5518148 34.5741876 35.7973689 36.6537862 38.7000884 38.8059530 39.9273298 41.5066347 42.4372405 44.0230604 45.0919780 45.7122522 46.9348861 48.8159464 49.8247275 51.6242013 52.7061164 53.2570062 55.6482214 56.8575570 57.8539243 58.4449786 59.6478757 60.4837386 62.0556717 64.6615854 65.6681714 65.8244590 69.3932715 69.8508201 71.0202957 72.3522621 72.8860678 75.7431435 76.2083172 78.0247134 80.2404887 80.5091382 82.2867514 83.2641967 83.8506201 85.6203564 87.2454191 88.6912885 88.8943503 90.4829191 90.9312402 92.0986137 93.6691494 94.1601399 95.9819549 97.3273566 97.4563720 99.3769002 100.2733251 100.9100521 101.5839989 103.6311195 104.4266266 104.9893993 106.6063901 106.9983128 108.4010114 108.8255347 110.2019704 111.1788108 112.9058723 113.4883326 114.1105992 114.7769995 116.0224553 116.7828223 117.5324289 118.6553500 120.9469969 121.9964430 122.7813196 123.5999799 124.6727181 125.3456255 126.9488908 128.2640376 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034301 0.0034302 0.0034315 0.0034318 0.0034352 0.0034355 207.4440163 230.9669654 287.8682544 365.2501415 386.7034631 397.6688185 413.2298807 428.0882929 445.9031349 459.5257104 472.4471645 504.2823066 516.4295203 523.5392029 542.0655779 565.5114333 593.5305594 601.2435996 619.5593041 638.5152474 649.7119188 657.4378462 675.5402942 676.4636381 686.1679263 699.6068312 707.4061778 720.5023395 729.1970842 734.1952829 743.9489998 758.7105745 766.5098610 780.2287567 788.3621928 792.4715047 810.0669702 818.8217646 825.9650900 830.1735308 838.6732110 844.5290526 855.4330407 873.2095053 879.9798784 881.0264145 904.5945388 907.5718873 915.1378509 923.6795687 927.0807014 945.0764539 947.9740877 959.2048615 972.7294461 974.3564605 985.0544537 990.8876796 994.3709303 1004.8096468 1014.3004005 1022.6705799 1023.8406307 1032.9482920 1035.5041350 1042.1298287 1050.9778629 1053.7287457 1063.8737074 1071.3040441 1072.0138599 1082.5251705 1087.3966448 1090.8436186 1094.4802592 1105.4532357 1109.6880381 1112.6741683 1121.2098361 1123.2689270 1130.6077224 1132.8194190 1139.9609118 1145.0021246 1153.8611350 1156.8335833 1160.0007586 1163.3830012 1169.6779586 1173.5045114 1177.2647377 1182.8752440 1194.2433318 1199.4133112 1203.2653995 1207.2701988 1212.4978978 1215.7656571 1223.5162326 1229.8375065 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8992 Rtb_to_modes> Number of blocs = 187 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9775E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9782E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9858E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9875E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.649 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.027 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.3 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1122 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002 0.99996 1.00003 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 161856 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99997 1.00001 1.00002 0.99996 1.00003 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220512003338119574.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220512003338119574.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 220512003338119574.atom Openam> file on opening on unit 11: 220512003338119574.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 559 First residue number = 1 Last residue number = 559 Number of atoms found = 8992 Mean number per residue = 16.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9775E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9782E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9858E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9875E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.649 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.027 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.3 Bfactors> 106 vectors, 26976 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.649000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.429 for 559 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.004 +/- 0.00 Bfactors> = 93.042 +/- 7.45 Bfactors> Shiftng-fct= 93.037 Bfactors> Scaling-fct= 1681.580 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220512003338119574.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220512003338119574.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4299E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4301E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 231.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 907.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 927.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 945.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1035. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1054. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1064. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1072. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1082. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1087. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1109. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1113. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1123. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1131. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1154. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1157. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1163. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1170. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1174. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1177. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1183. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1194. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1199. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1203. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1207. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1213. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1223. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1230. Chkmod> 106 vectors, 26976 coordinates in file. Chkmod> That is: 8992 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7955 0.0034 0.8962 0.0034 0.7639 0.0034 0.7934 0.0034 0.7348 0.0034 0.7408 207.4262 0.6615 230.9606 0.5624 287.8469 0.6154 365.1808 0.3855 386.6662 0.5628 397.6409 0.1045 413.2006 0.3579 428.0575 0.5572 445.8671 0.3847 459.5412 0.1798 472.4457 0.3935 504.3148 0.3407 516.4436 0.1695 523.4735 0.1914 542.0641 0.2791 565.4855 0.4919 593.4638 0.4697 601.2606 0.5063 619.5154 0.4749 638.4492 0.5189 649.7079 0.4890 657.3757 0.5368 675.5105 0.6731 676.4699 0.3489 686.1614 0.5444 699.6052 0.1662 707.3988 0.3763 720.4464 0.2308 729.1498 0.2417 734.1457 0.4973 743.8783 0.5100 758.7095 0.5286 766.4406 0.2750 780.1635 0.5034 788.3574 0.4219 792.4598 0.3115 810.0451 0.3961 818.8042 0.3628 825.9016 0.3205 830.1025 0.3960 838.6521 0.4944 844.4667 0.4115 855.4261 0.3825 873.1613 0.4359 879.9544 0.4680 880.9588 0.4510 904.5344 0.2275 907.5276 0.3733 915.0967 0.5285 923.6255 0.2923 927.0659 0.5045 945.0163 0.2581 947.9439 0.3838 959.1347 0.2896 972.6847 0.3958 974.3198 0.3300 985.0316 0.1562 990.8202 0.4454 994.3246 0.4874 1004.7644 0.3441 1014.2835 0.3956 1022.6193 0.2799 1023.7716 0.4122 1032.8873 0.2803 1035.4526 0.4976 1042.0929 0.4158 1050.9375 0.3979 1053.6827 0.3405 1063.8172 0.3275 1071.2726 0.3584 1071.9878 0.4754 1082.4956 0.3857 1087.4946 0.3411 1090.7425 0.3081 1094.5195 0.4589 1105.2398 0.2325 1109.4989 0.3825 1112.6826 0.3966 1121.1281 0.3814 1123.2296 0.3683 1130.5539 0.4230 1132.6379 0.4421 1139.9018 0.4346 1145.0621 0.4997 1153.7816 0.4232 1156.8434 0.3930 1159.8971 0.3777 1163.4496 0.2751 1169.5146 0.3921 1173.5404 0.2327 1177.0518 0.4832 1183.0470 0.4236 1193.9600 0.3916 1199.3793 0.4196 1203.3053 0.5214 1207.2185 0.3639 1212.5785 0.4836 1215.4922 0.4120 1223.2281 0.3680 1229.9571 0.4407 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 220512003338119574 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom making animated gifs 11 models are in 220512003338119574.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003338119574.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003338119574.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 220512003338119574 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom making animated gifs 11 models are in 220512003338119574.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003338119574.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003338119574.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 220512003338119574 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom making animated gifs 11 models are in 220512003338119574.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003338119574.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003338119574.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 220512003338119574 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom making animated gifs 11 models are in 220512003338119574.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003338119574.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003338119574.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 220512003338119574 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220512003338119574.eigenfacs 220512003338119574.atom making animated gifs 11 models are in 220512003338119574.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003338119574.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220512003338119574.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 220512003338119574.10.pdb 220512003338119574.11.pdb 220512003338119574.7.pdb 220512003338119574.8.pdb 220512003338119574.9.pdb STDERR: real 0m41.837s user 0m41.588s sys 0m0.208s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.