*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 220511184140126110.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 220511184140126110.atom to be opened.
Openam> File opened: 220511184140126110.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 812
First residue number = 48
Last residue number = 467
Number of atoms found = 6501
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -35.312127 +/- 19.015843 From: -75.895000 To: 5.926000
= 24.160448 +/- 16.336441 From: -16.473000 To: 62.235000
= -18.723198 +/- 17.592195 From: -61.615000 To: 20.228000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.3149 % Filled.
Pdbmat> 2500912 non-zero elements.
Pdbmat> 273594 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 84.17 +/- 22.92
Maximum number = 129
Minimum number = 13
Pdbmat> Matrix trace = 5.471880E+06
Pdbmat> Larger element = 510.279
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
812 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 220511184140126110.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 220511184140126110.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
220511184140126110.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 6501 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 812 residues.
Blocpdb> 42 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 36 atoms in block 2
Block first atom: 43
Blocpdb> 40 atoms in block 3
Block first atom: 79
Blocpdb> 33 atoms in block 4
Block first atom: 119
Blocpdb> 33 atoms in block 5
Block first atom: 152
Blocpdb> 36 atoms in block 6
Block first atom: 185
Blocpdb> 37 atoms in block 7
Block first atom: 221
Blocpdb> 44 atoms in block 8
Block first atom: 258
Blocpdb> 43 atoms in block 9
Block first atom: 302
Blocpdb> 42 atoms in block 10
Block first atom: 345
Blocpdb> 43 atoms in block 11
Block first atom: 387
Blocpdb> 34 atoms in block 12
Block first atom: 430
Blocpdb> 41 atoms in block 13
Block first atom: 464
Blocpdb> 49 atoms in block 14
Block first atom: 505
Blocpdb> 40 atoms in block 15
Block first atom: 554
Blocpdb> 39 atoms in block 16
Block first atom: 594
Blocpdb> 29 atoms in block 17
Block first atom: 633
Blocpdb> 33 atoms in block 18
Block first atom: 662
Blocpdb> 38 atoms in block 19
Block first atom: 695
Blocpdb> 45 atoms in block 20
Block first atom: 733
Blocpdb> 36 atoms in block 21
Block first atom: 778
Blocpdb> 32 atoms in block 22
Block first atom: 814
Blocpdb> 45 atoms in block 23
Block first atom: 846
Blocpdb> 47 atoms in block 24
Block first atom: 891
Blocpdb> 41 atoms in block 25
Block first atom: 938
Blocpdb> 38 atoms in block 26
Block first atom: 979
Blocpdb> 41 atoms in block 27
Block first atom: 1017
Blocpdb> 51 atoms in block 28
Block first atom: 1058
Blocpdb> 44 atoms in block 29
Block first atom: 1109
Blocpdb> 38 atoms in block 30
Block first atom: 1153
Blocpdb> 41 atoms in block 31
Block first atom: 1191
Blocpdb> 36 atoms in block 32
Block first atom: 1232
Blocpdb> 45 atoms in block 33
Block first atom: 1268
Blocpdb> 34 atoms in block 34
Block first atom: 1313
Blocpdb> 43 atoms in block 35
Block first atom: 1347
Blocpdb> 48 atoms in block 36
Block first atom: 1390
Blocpdb> 33 atoms in block 37
Block first atom: 1438
Blocpdb> 39 atoms in block 38
Block first atom: 1471
Blocpdb> 42 atoms in block 39
Block first atom: 1510
Blocpdb> 38 atoms in block 40
Block first atom: 1552
Blocpdb> 47 atoms in block 41
Block first atom: 1590
Blocpdb> 41 atoms in block 42
Block first atom: 1637
Blocpdb> 45 atoms in block 43
Block first atom: 1678
Blocpdb> 48 atoms in block 44
Block first atom: 1723
Blocpdb> 41 atoms in block 45
Block first atom: 1771
Blocpdb> 45 atoms in block 46
Block first atom: 1812
Blocpdb> 47 atoms in block 47
Block first atom: 1857
Blocpdb> 54 atoms in block 48
Block first atom: 1904
Blocpdb> 37 atoms in block 49
Block first atom: 1958
Blocpdb> 37 atoms in block 50
Block first atom: 1995
Blocpdb> 36 atoms in block 51
Block first atom: 2032
Blocpdb> 38 atoms in block 52
Block first atom: 2068
Blocpdb> 39 atoms in block 53
Block first atom: 2106
Blocpdb> 36 atoms in block 54
Block first atom: 2145
Blocpdb> 38 atoms in block 55
Block first atom: 2181
Blocpdb> 38 atoms in block 56
Block first atom: 2219
Blocpdb> 45 atoms in block 57
Block first atom: 2257
Blocpdb> 43 atoms in block 58
Block first atom: 2302
Blocpdb> 46 atoms in block 59
Block first atom: 2345
Blocpdb> 35 atoms in block 60
Block first atom: 2391
Blocpdb> 38 atoms in block 61
Block first atom: 2426
Blocpdb> 38 atoms in block 62
Block first atom: 2464
Blocpdb> 40 atoms in block 63
Block first atom: 2502
Blocpdb> 37 atoms in block 64
Block first atom: 2542
Blocpdb> 6 atoms in block 65
Block first atom: 2579
Blocpdb> 47 atoms in block 66
Block first atom: 2585
Blocpdb> 45 atoms in block 67
Block first atom: 2632
Blocpdb> 39 atoms in block 68
Block first atom: 2677
Blocpdb> 44 atoms in block 69
Block first atom: 2716
Blocpdb> 37 atoms in block 70
Block first atom: 2760
Blocpdb> 30 atoms in block 71
Block first atom: 2797
Blocpdb> 43 atoms in block 72
Block first atom: 2827
Blocpdb> 32 atoms in block 73
Block first atom: 2870
Blocpdb> 42 atoms in block 74
Block first atom: 2902
Blocpdb> 43 atoms in block 75
Block first atom: 2944
Blocpdb> 35 atoms in block 76
Block first atom: 2987
Blocpdb> 45 atoms in block 77
Block first atom: 3022
Blocpdb> 38 atoms in block 78
Block first atom: 3067
Blocpdb> 42 atoms in block 79
Block first atom: 3105
Blocpdb> 47 atoms in block 80
Block first atom: 3147
Blocpdb> 29 atoms in block 81
Block first atom: 3194
Blocpdb> 40 atoms in block 82
Block first atom: 3223
Blocpdb> 25 atoms in block 83
Block first atom: 3263
Blocpdb> 34 atoms in block 84
Block first atom: 3288
Blocpdb> 36 atoms in block 85
Block first atom: 3322
Blocpdb> 40 atoms in block 86
Block first atom: 3358
Blocpdb> 31 atoms in block 87
Block first atom: 3398
Blocpdb> 34 atoms in block 88
Block first atom: 3429
Blocpdb> 36 atoms in block 89
Block first atom: 3463
Blocpdb> 39 atoms in block 90
Block first atom: 3499
Blocpdb> 42 atoms in block 91
Block first atom: 3538
Blocpdb> 46 atoms in block 92
Block first atom: 3580
Blocpdb> 46 atoms in block 93
Block first atom: 3626
Blocpdb> 44 atoms in block 94
Block first atom: 3672
Blocpdb> 36 atoms in block 95
Block first atom: 3716
Blocpdb> 37 atoms in block 96
Block first atom: 3752
Blocpdb> 42 atoms in block 97
Block first atom: 3789
Blocpdb> 41 atoms in block 98
Block first atom: 3831
Blocpdb> 38 atoms in block 99
Block first atom: 3872
Blocpdb> 30 atoms in block 100
Block first atom: 3910
Blocpdb> 36 atoms in block 101
Block first atom: 3940
Blocpdb> 37 atoms in block 102
Block first atom: 3976
Blocpdb> 41 atoms in block 103
Block first atom: 4013
Blocpdb> 39 atoms in block 104
Block first atom: 4054
Blocpdb> 33 atoms in block 105
Block first atom: 4093
Blocpdb> 39 atoms in block 106
Block first atom: 4126
Blocpdb> 51 atoms in block 107
Block first atom: 4165
Blocpdb> 43 atoms in block 108
Block first atom: 4216
Blocpdb> 34 atoms in block 109
Block first atom: 4259
Blocpdb> 36 atoms in block 110
Block first atom: 4293
Blocpdb> 44 atoms in block 111
Block first atom: 4329
Blocpdb> 55 atoms in block 112
Block first atom: 4373
Blocpdb> 33 atoms in block 113
Block first atom: 4428
Blocpdb> 44 atoms in block 114
Block first atom: 4461
Blocpdb> 44 atoms in block 115
Block first atom: 4505
Blocpdb> 35 atoms in block 116
Block first atom: 4549
Blocpdb> 40 atoms in block 117
Block first atom: 4584
Blocpdb> 39 atoms in block 118
Block first atom: 4624
Blocpdb> 41 atoms in block 119
Block first atom: 4663
Blocpdb> 35 atoms in block 120
Block first atom: 4704
Blocpdb> 38 atoms in block 121
Block first atom: 4739
Blocpdb> 37 atoms in block 122
Block first atom: 4777
Blocpdb> 42 atoms in block 123
Block first atom: 4814
Blocpdb> 41 atoms in block 124
Block first atom: 4856
Blocpdb> 35 atoms in block 125
Block first atom: 4897
Blocpdb> 35 atoms in block 126
Block first atom: 4932
Blocpdb> 46 atoms in block 127
Block first atom: 4967
Blocpdb> 43 atoms in block 128
Block first atom: 5013
Blocpdb> 46 atoms in block 129
Block first atom: 5056
Blocpdb> 46 atoms in block 130
Block first atom: 5102
Blocpdb> 52 atoms in block 131
Block first atom: 5148
Blocpdb> 42 atoms in block 132
Block first atom: 5200
Blocpdb> 38 atoms in block 133
Block first atom: 5242
Blocpdb> 38 atoms in block 134
Block first atom: 5280
Blocpdb> 38 atoms in block 135
Block first atom: 5318
Blocpdb> 36 atoms in block 136
Block first atom: 5356
Blocpdb> 42 atoms in block 137
Block first atom: 5392
Blocpdb> 34 atoms in block 138
Block first atom: 5434
Blocpdb> 46 atoms in block 139
Block first atom: 5468
Blocpdb> 48 atoms in block 140
Block first atom: 5514
Blocpdb> 37 atoms in block 141
Block first atom: 5562
Blocpdb> 37 atoms in block 142
Block first atom: 5599
Blocpdb> 43 atoms in block 143
Block first atom: 5636
Blocpdb> 41 atoms in block 144
Block first atom: 5679
Blocpdb> 37 atoms in block 145
Block first atom: 5720
Blocpdb> 42 atoms in block 146
Block first atom: 5757
Blocpdb> 36 atoms in block 147
Block first atom: 5799
Blocpdb> 44 atoms in block 148
Block first atom: 5835
Blocpdb> 44 atoms in block 149
Block first atom: 5879
Blocpdb> 39 atoms in block 150
Block first atom: 5923
Blocpdb> 37 atoms in block 151
Block first atom: 5962
Blocpdb> 46 atoms in block 152
Block first atom: 5999
Blocpdb> 31 atoms in block 153
Block first atom: 6045
Blocpdb> 44 atoms in block 154
Block first atom: 6076
Blocpdb> 36 atoms in block 155
Block first atom: 6120
Blocpdb> 42 atoms in block 156
Block first atom: 6156
Blocpdb> 43 atoms in block 157
Block first atom: 6198
Blocpdb> 43 atoms in block 158
Block first atom: 6241
Blocpdb> 38 atoms in block 159
Block first atom: 6284
Blocpdb> 35 atoms in block 160
Block first atom: 6322
Blocpdb> 41 atoms in block 161
Block first atom: 6357
Blocpdb> 46 atoms in block 162
Block first atom: 6398
Blocpdb> 33 atoms in block 163
Block first atom: 6444
Blocpdb> 25 atoms in block 164
Block first atom: 6476
Blocpdb> 164 blocks.
Blocpdb> At most, 55 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2501076 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 19503
Prepmat> Matrix trace = 5471880.0000
Prepmat> Last element read: 19503 19503 139.7354
Prepmat> 13531 lines saved.
Prepmat> 12048 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6501
RTB> Total mass = 6501.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 6501
RTB> Number of blocks = 164
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 194818.1083
RTB> 50892 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 984
Diagstd> Nb of non-zero elements: 50892
Diagstd> Projected matrix trace = 194818.1083
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 984 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 194818.1083
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1074146 0.1162796 0.3610392 0.5735079
0.7426744 1.2159507 1.5685325 1.9328309 2.9168006
4.2685108 4.8040088 5.2158189 5.5429655 6.3367394
6.9973134 8.2808029 8.8346142 9.5362834 9.9466349
11.3937600 12.1865551 12.9879871 13.3524394 15.1594417
15.4916918 16.4236306 16.9012150 17.0961370 18.2127827
18.3556906 19.0435196 19.1489438 20.3340718 20.4779219
20.9754207 21.4762733 22.5872984 23.3310692 24.1256851
24.8783254 25.1458291 25.9155960 26.8934811 27.1630311
27.4874486 27.7324445 28.3365238 29.2700074 29.7504253
29.9413845 30.2431714 30.5355679 31.1347192 31.5969325
31.7845490 32.4878813 32.8634761 33.4744512 33.7139836
34.1996324 34.7053966 35.1453752 35.5379873 35.9212653
36.0431249 36.5315610 37.2782945 37.3707303 37.5892263
37.7426986 38.2961289 38.9904350 39.6764652 40.0218890
40.3091948 40.5583411 41.2386558 42.0413551 42.5877206
43.2269320 43.6841281 43.7348009 44.5787906 44.7724675
44.9019101 45.3551452 45.8730973 46.8329560 47.2822877
47.9844339 48.0089107 48.4676168 48.7231301 49.5273908
50.2293541 50.4450234 50.8756682 51.5908697 52.0012914
52.1469848
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034320 0.0034334 0.0034339 0.0034343 0.0034343
0.0034346 35.5899100 37.0294247 65.2487890 82.2365723
93.5824709 119.7438649 136.0009823 150.9705409 185.4593138
224.3538229 238.0110824 248.0027715 255.6621104 273.3557429
287.2506001 312.4866762 322.7669628 335.3396090 342.4785435
366.5462773 379.0842655 391.3507810 396.8035851 422.8018549
427.4100254 440.0782084 446.4308963 448.9978635 463.4292418
465.2438542 473.8805555 475.1904380 489.6744640 491.4034732
497.3368288 503.2395223 516.0923541 524.5206628 533.3780117
541.6339175 544.5380853 552.8099880 563.1431302 565.9582505
569.3279372 571.8595219 578.0542072 587.4984111 592.3001869
594.1980466 597.1850756 600.0649786 605.9234446 610.4045210
612.2140710 618.9505811 622.5181667 628.2782320 630.5221036
635.0471913 639.7256821 643.7679804 647.3537892 650.8352896
651.9383048 656.3407895 663.0149144 663.8364162 665.7742191
667.1319726 672.0053312 678.0696730 684.0089227 686.9799658
689.4413736 691.5687682 697.3447420 704.0988476 708.6592799
713.9577083 717.7234169 718.1395699 725.0357505 726.6090373
727.6586363 731.3218697 735.4858341 743.1407313 746.6971964
752.2210249 752.4128543 755.9988118 757.9889431 764.2193060
769.6159810 771.2664575 774.5515785 779.9768357 783.0731707
784.1693824
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6501
Rtb_to_modes> Number of blocs = 164
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9887E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.569
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.269
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.804
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.216
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.997
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.39
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.35
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.16
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.49
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.36
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.48
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.60
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.78
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.15
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 984 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998
0.99997 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000
0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997
1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001
1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003
1.00001 0.99998 1.00001 0.99996 1.00000
0.99997 1.00003 1.00001 1.00001 0.99996
1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 1.00004 0.99998 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997
0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002
0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000
0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999
0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
1.00001 0.99995 0.99999 1.00002 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001
1.00004
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 117018 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998
0.99997 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000
0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997
1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001
1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001
0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003
1.00001 0.99998 1.00001 0.99996 1.00000
0.99997 1.00003 1.00001 1.00001 0.99996
1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999
1.00001 1.00001 1.00004 0.99998 1.00001
1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997
0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000
0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002
0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000
0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999
0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
1.00001 0.99995 0.99999 1.00002 0.99999
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998
0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001
1.00004
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 220511184140126110.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220511184140126110.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 220511184140126110.atom
Openam> file on opening on unit 11:
220511184140126110.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 812
First residue number = 48
Last residue number = 467
Number of atoms found = 6501
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9887E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1074
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1163
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3610
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5735
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7427
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.216
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.569
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.933
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.917
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.269
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.804
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.216
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.543
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.337
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.997
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.281
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.835
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.536
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.947
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.15
Bfactors> 106 vectors, 19503 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.107400
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.586 for 812 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.070 +/- 0.06
Bfactors> = 63.230 +/- 14.72
Bfactors> Shiftng-fct= 63.160
Bfactors> Scaling-fct= 252.836
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 220511184140126110.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220511184140126110.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.2
Chkmod> 106 vectors, 19503 coordinates in file.
Chkmod> That is: 6501 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7343
0.0034 0.9092
0.0034 0.7656
0.0034 0.9707
0.0034 0.8091
0.0034 0.9995
35.5860 0.5905
37.0311 0.5444
65.2424 0.5947
82.2325 0.7416
93.5801 0.5792
119.7411 0.6704
136.0154 0.6161
150.9707 0.6021
185.4577 0.7808
224.3570 0.5360
238.0006 0.4418
247.9964 0.6794
255.6519 0.4708
273.3496 0.2552
287.2318 0.6936
312.4770 0.5422
322.7602 0.2817
335.3202 0.3180
342.4701 0.1834
366.4701 0.5064
379.1216 0.0409
391.3643 0.1001
396.7503 0.3221
422.7915 0.1475
427.3683 0.3053
440.0107 0.0570
446.3957 0.0521
449.0293 0.0762
463.3739 0.3879
465.2785 0.1821
473.8164 0.3377
475.1831 0.2409
489.6044 0.1865
491.4073 0.4462
497.3698 0.2903
503.2616 0.2416
516.1011 0.2932
524.4861 0.3811
533.4028 0.3303
541.6289 0.3604
544.5599 0.1858
552.8332 0.3005
563.0825 0.3658
565.9024 0.4183
569.3299 0.3586
571.8098 0.3959
578.0648 0.3945
587.4731 0.3552
592.2705 0.4536
594.1588 0.5390
597.1281 0.3466
600.0828 0.4475
605.8515 0.2444
610.4079 0.4991
612.1440 0.4670
618.9442 0.4394
622.4585 0.4548
628.2095 0.4519
630.4578 0.4243
635.0233 0.3314
639.7406 0.3776
643.7827 0.5583
647.3443 0.2761
650.7959 0.4144
651.8821 0.5913
656.2986 0.5247
663.0016 0.3311
663.8014 0.5167
665.7525 0.4314
667.0795 0.3533
672.0104 0.4151
678.0368 0.4420
684.0100 0.5192
686.9343 0.5255
689.4187 0.4550
691.5532 0.5066
697.3262 0.6122
704.0573 0.1344
708.6478 0.3630
713.9524 0.3680
717.6587 0.3926
718.0693 0.3521
725.0145 0.1510
726.5578 0.4115
727.6119 0.3001
731.3296 0.2249
735.4294 0.4301
743.0854 0.2830
746.6471 0.5049
752.1540 0.4969
752.3891 0.4426
755.9849 0.3281
757.9321 0.4978
764.2066 0.3549
769.5879 0.3998
771.2714 0.4057
774.5513 0.4796
779.9368 0.4437
783.0298 0.4569
784.1584 0.1699
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 220511184140126110.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220511184140126110.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 220511184140126110.atom
Openam> file on opening on unit 11:
220511184140126110.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 220511184140126110.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
220511184140126110.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 35.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 151.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.2
Projmod> 106 vectors, 19503 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 812
First residue number = 48
Last residue number = 467
Number of atoms found = 6501
Mean number per residue = 8.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 803
First residue number = 50
Last residue number = 467
Number of atoms found = 6419
Mean number per residue = 8.0
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 220511184140126110 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
making animated gifs
11 models are in 220511184140126110.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220511184140126110.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220511184140126110.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 395 4.018 207 2.050
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 395 4.059 202 2.043
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 395 4.101 194 2.041
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 395 4.145 190 2.042
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 395 4.190 188 2.032
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 395 4.236 184 2.053
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 395 4.283 181 2.062
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 395 4.332 179 2.080
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 395 4.382 175 2.081
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 395 4.433 171 2.088
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 395 4.485 168 2.086
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 220511184140126110 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
making animated gifs
11 models are in 220511184140126110.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220511184140126110.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220511184140126110.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 395 3.989 197 2.052
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 395 4.036 194 2.051
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 395 4.085 190 2.044
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 395 4.134 189 2.054
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 395 4.185 186 2.052
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 395 4.236 184 2.053
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 395 4.288 182 2.059
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 395 4.340 181 2.073
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 395 4.394 176 2.060
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 395 4.448 174 2.066
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 395 4.502 172 2.074
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 220511184140126110 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
making animated gifs
11 models are in 220511184140126110.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220511184140126110.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220511184140126110.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 395 4.053 209 2.025
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 395 4.082 204 2.022
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 395 4.115 200 2.027
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 395 4.152 192 2.010
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 395 4.192 189 2.054
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 395 4.236 184 2.053
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 395 4.283 177 2.052
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 395 4.333 172 2.063
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 395 4.386 166 2.058
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 395 4.442 161 2.064
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 395 4.501 157 2.073
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 220511184140126110 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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220511184140126110.atom
making animated gifs
11 models are in 220511184140126110.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220511184140126110.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220511184140126110.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 395 3.694 262 2.028
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 395 3.795 244 2.036
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 395 3.900 226 2.033
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 395 4.009 208 2.036
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 395 4.121 195 2.048
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 395 4.236 184 2.053
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 395 4.354 174 2.073
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 395 4.475 166 2.098
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 395 4.598 214 1.240
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 395 4.724 153 2.110
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 395 4.851 147 2.133
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 220511184140126110 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220511184140126110.eigenfacs
220511184140126110.atom
making animated gifs
11 models are in 220511184140126110.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220511184140126110.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220511184140126110.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 395 4.534 153 2.038
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 395 4.461 216 1.174
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 395 4.394 172 2.023
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 395 4.335 169 2.057
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 395 4.282 175 2.047
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 395 4.236 184 2.053
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 395 4.198 188 2.042
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 395 4.167 195 2.020
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 395 4.144 196 1.991
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 395 4.130 202 2.011
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 395 4.123 202 2.011
220511184140126110.10.pdb
220511184140126110.11.pdb
220511184140126110.7.pdb
220511184140126110.8.pdb
220511184140126110.9.pdb
STDERR:
real 0m22.147s
user 0m22.048s
sys 0m0.088s
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