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***  dndCD  ***

LOGs for ID: 2205041037174332

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2205041037174332.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2205041037174332.atom to be opened. Openam> File opened: 2205041037174332.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1206 First residue number = 1 Last residue number = 666 Number of atoms found = 19401 Mean number per residue = 16.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 1.392010 +/- 23.631200 From: -51.971000 To: 56.282000 = -7.446281 +/- 38.977140 From: -116.604000 To: 60.222000 = 10.155029 +/- 41.667739 From: -41.430000 To: 150.064000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -3.0317 % Filled. Pdbmat> 13753742 non-zero elements. Pdbmat> 1515504 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 156.23 +/- 47.96 Maximum number = 255 Minimum number = 21 Pdbmat> Matrix trace = 3.031008E+07 Pdbmat> Larger element = 902.655 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1206 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2205041037174332.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2205041037174332.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2205041037174332.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 19401 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1206 residues. Blocpdb> 114 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 113 atoms in block 2 Block first atom: 115 Blocpdb> 114 atoms in block 3 Block first atom: 228 Blocpdb> 104 atoms in block 4 Block first atom: 342 Blocpdb> 110 atoms in block 5 Block first atom: 446 Blocpdb> 119 atoms in block 6 Block first atom: 556 Blocpdb> 125 atoms in block 7 Block first atom: 675 Blocpdb> 81 atoms in block 8 Block first atom: 800 Blocpdb> 115 atoms in block 9 Block first atom: 881 Blocpdb> 107 atoms in block 10 Block first atom: 996 Blocpdb> 115 atoms in block 11 Block first atom: 1103 Blocpdb> 105 atoms in block 12 Block first atom: 1218 Blocpdb> 108 atoms in block 13 Block first atom: 1323 Blocpdb> 126 atoms in block 14 Block first atom: 1431 Blocpdb> 111 atoms in block 15 Block first atom: 1557 Blocpdb> 103 atoms in block 16 Block first atom: 1668 Blocpdb> 107 atoms in block 17 Block first atom: 1771 Blocpdb> 107 atoms in block 18 Block first atom: 1878 Blocpdb> 119 atoms in block 19 Block first atom: 1985 Blocpdb> 102 atoms in block 20 Block first atom: 2104 Blocpdb> 128 atoms in block 21 Block first atom: 2206 Blocpdb> 125 atoms in block 22 Block first atom: 2334 Blocpdb> 112 atoms in block 23 Block first atom: 2459 Blocpdb> 113 atoms in block 24 Block first atom: 2571 Blocpdb> 104 atoms in block 25 Block first atom: 2684 Blocpdb> 93 atoms in block 26 Block first atom: 2788 Blocpdb> 118 atoms in block 27 Block first atom: 2881 Blocpdb> 112 atoms in block 28 Block first atom: 2999 Blocpdb> 117 atoms in block 29 Block first atom: 3111 Blocpdb> 108 atoms in block 30 Block first atom: 3228 Blocpdb> 111 atoms in block 31 Block first atom: 3336 Blocpdb> 127 atoms in block 32 Block first atom: 3447 Blocpdb> 116 atoms in block 33 Block first atom: 3574 Blocpdb> 111 atoms in block 34 Block first atom: 3690 Blocpdb> 92 atoms in block 35 Block first atom: 3801 Blocpdb> 128 atoms in block 36 Block first atom: 3893 Blocpdb> 99 atoms in block 37 Block first atom: 4021 Blocpdb> 101 atoms in block 38 Block first atom: 4120 Blocpdb> 85 atoms in block 39 Block first atom: 4221 Blocpdb> 94 atoms in block 40 Block first atom: 4306 Blocpdb> 109 atoms in block 41 Block first atom: 4400 Blocpdb> 109 atoms in block 42 Block first atom: 4509 Blocpdb> 111 atoms in block 43 Block first atom: 4618 Blocpdb> 126 atoms in block 44 Block first atom: 4729 Blocpdb> 125 atoms in block 45 Block first atom: 4855 Blocpdb> 106 atoms in block 46 Block first atom: 4980 Blocpdb> 127 atoms in block 47 Block first atom: 5086 Blocpdb> 118 atoms in block 48 Block first atom: 5213 Blocpdb> 117 atoms in block 49 Block first atom: 5331 Blocpdb> 97 atoms in block 50 Block first atom: 5448 Blocpdb> 111 atoms in block 51 Block first atom: 5545 Blocpdb> 144 atoms in block 52 Block first atom: 5656 Blocpdb> 133 atoms in block 53 Block first atom: 5800 Blocpdb> 113 atoms in block 54 Block first atom: 5933 Blocpdb> 107 atoms in block 55 Block first atom: 6046 Blocpdb> 120 atoms in block 56 Block first atom: 6153 Blocpdb> 128 atoms in block 57 Block first atom: 6273 Blocpdb> 103 atoms in block 58 Block first atom: 6401 Blocpdb> 111 atoms in block 59 Block first atom: 6504 Blocpdb> 133 atoms in block 60 Block first atom: 6615 Blocpdb> 116 atoms in block 61 Block first atom: 6748 Blocpdb> 108 atoms in block 62 Block first atom: 6864 Blocpdb> 93 atoms in block 63 Block first atom: 6972 Blocpdb> 106 atoms in block 64 Block first atom: 7065 Blocpdb> 106 atoms in block 65 Block first atom: 7171 Blocpdb> 126 atoms in block 66 Block first atom: 7277 Blocpdb> 96 atoms in block 67 Block first atom: 7403 Blocpdb> 123 atoms in block 68 Block first atom: 7499 Blocpdb> 122 atoms in block 69 Block first atom: 7622 Blocpdb> 108 atoms in block 70 Block first atom: 7744 Blocpdb> 116 atoms in block 71 Block first atom: 7852 Blocpdb> 127 atoms in block 72 Block first atom: 7968 Blocpdb> 119 atoms in block 73 Block first atom: 8095 Blocpdb> 118 atoms in block 74 Block first atom: 8214 Blocpdb> 136 atoms in block 75 Block first atom: 8332 Blocpdb> 94 atoms in block 76 Block first atom: 8468 Blocpdb> 105 atoms in block 77 Block first atom: 8562 Blocpdb> 23 atoms in block 78 Block first atom: 8667 Blocpdb> 131 atoms in block 79 Block first atom: 8690 Blocpdb> 130 atoms in block 80 Block first atom: 8821 Blocpdb> 97 atoms in block 81 Block first atom: 8951 Blocpdb> 127 atoms in block 82 Block first atom: 9048 Blocpdb> 114 atoms in block 83 Block first atom: 9175 Blocpdb> 107 atoms in block 84 Block first atom: 9289 Blocpdb> 85 atoms in block 85 Block first atom: 9396 Blocpdb> 121 atoms in block 86 Block first atom: 9481 Blocpdb> 110 atoms in block 87 Block first atom: 9602 Blocpdb> 104 atoms in block 88 Block first atom: 9712 Blocpdb> 123 atoms in block 89 Block first atom: 9816 Blocpdb> 97 atoms in block 90 Block first atom: 9939 Blocpdb> 117 atoms in block 91 Block first atom: 10036 Blocpdb> 101 atoms in block 92 Block first atom: 10153 Blocpdb> 112 atoms in block 93 Block first atom: 10254 Blocpdb> 98 atoms in block 94 Block first atom: 10366 Blocpdb> 136 atoms in block 95 Block first atom: 10464 Blocpdb> 119 atoms in block 96 Block first atom: 10600 Blocpdb> 103 atoms in block 97 Block first atom: 10719 Blocpdb> 109 atoms in block 98 Block first atom: 10822 Blocpdb> 105 atoms in block 99 Block first atom: 10931 Blocpdb> 110 atoms in block 100 Block first atom: 11036 Blocpdb> 113 atoms in block 101 Block first atom: 11146 Blocpdb> 107 atoms in block 102 Block first atom: 11259 Blocpdb> 84 atoms in block 103 Block first atom: 11366 Blocpdb> 126 atoms in block 104 Block first atom: 11450 Blocpdb> 119 atoms in block 105 Block first atom: 11576 Blocpdb> 121 atoms in block 106 Block first atom: 11695 Blocpdb> 137 atoms in block 107 Block first atom: 11816 Blocpdb> 102 atoms in block 108 Block first atom: 11953 Blocpdb> 109 atoms in block 109 Block first atom: 12055 Blocpdb> 109 atoms in block 110 Block first atom: 12164 Blocpdb> 108 atoms in block 111 Block first atom: 12273 Blocpdb> 99 atoms in block 112 Block first atom: 12381 Blocpdb> 118 atoms in block 113 Block first atom: 12480 Blocpdb> 118 atoms in block 114 Block first atom: 12598 Blocpdb> 112 atoms in block 115 Block first atom: 12716 Blocpdb> 85 atoms in block 116 Block first atom: 12828 Blocpdb> 105 atoms in block 117 Block first atom: 12913 Blocpdb> 125 atoms in block 118 Block first atom: 13018 Blocpdb> 126 atoms in block 119 Block first atom: 13143 Blocpdb> 122 atoms in block 120 Block first atom: 13269 Blocpdb> 95 atoms in block 121 Block first atom: 13391 Blocpdb> 105 atoms in block 122 Block first atom: 13486 Blocpdb> 119 atoms in block 123 Block first atom: 13591 Blocpdb> 109 atoms in block 124 Block first atom: 13710 Blocpdb> 117 atoms in block 125 Block first atom: 13819 Blocpdb> 115 atoms in block 126 Block first atom: 13936 Blocpdb> 115 atoms in block 127 Block first atom: 14051 Blocpdb> 93 atoms in block 128 Block first atom: 14166 Blocpdb> 105 atoms in block 129 Block first atom: 14259 Blocpdb> 114 atoms in block 130 Block first atom: 14364 Blocpdb> 106 atoms in block 131 Block first atom: 14478 Blocpdb> 112 atoms in block 132 Block first atom: 14584 Blocpdb> 107 atoms in block 133 Block first atom: 14696 Blocpdb> 110 atoms in block 134 Block first atom: 14803 Blocpdb> 132 atoms in block 135 Block first atom: 14913 Blocpdb> 130 atoms in block 136 Block first atom: 15045 Blocpdb> 113 atoms in block 137 Block first atom: 15175 Blocpdb> 95 atoms in block 138 Block first atom: 15288 Blocpdb> 104 atoms in block 139 Block first atom: 15383 Blocpdb> 119 atoms in block 140 Block first atom: 15487 Blocpdb> 123 atoms in block 141 Block first atom: 15606 Blocpdb> 126 atoms in block 142 Block first atom: 15729 Blocpdb> 133 atoms in block 143 Block first atom: 15855 Blocpdb> 127 atoms in block 144 Block first atom: 15988 Blocpdb> 109 atoms in block 145 Block first atom: 16115 Blocpdb> 126 atoms in block 146 Block first atom: 16224 Blocpdb> 111 atoms in block 147 Block first atom: 16350 Blocpdb> 106 atoms in block 148 Block first atom: 16461 Blocpdb> 103 atoms in block 149 Block first atom: 16567 Blocpdb> 118 atoms in block 150 Block first atom: 16670 Blocpdb> 116 atoms in block 151 Block first atom: 16788 Blocpdb> 114 atoms in block 152 Block first atom: 16904 Blocpdb> 130 atoms in block 153 Block first atom: 17018 Blocpdb> 119 atoms in block 154 Block first atom: 17148 Blocpdb> 104 atoms in block 155 Block first atom: 17267 Blocpdb> 113 atoms in block 156 Block first atom: 17371 Blocpdb> 94 atoms in block 157 Block first atom: 17484 Blocpdb> 128 atoms in block 158 Block first atom: 17578 Blocpdb> 111 atoms in block 159 Block first atom: 17706 Blocpdb> 102 atoms in block 160 Block first atom: 17817 Blocpdb> 107 atoms in block 161 Block first atom: 17919 Blocpdb> 111 atoms in block 162 Block first atom: 18026 Blocpdb> 109 atoms in block 163 Block first atom: 18137 Blocpdb> 122 atoms in block 164 Block first atom: 18246 Blocpdb> 120 atoms in block 165 Block first atom: 18368 Blocpdb> 106 atoms in block 166 Block first atom: 18488 Blocpdb> 101 atoms in block 167 Block first atom: 18594 Blocpdb> 120 atoms in block 168 Block first atom: 18695 Blocpdb> 114 atoms in block 169 Block first atom: 18815 Blocpdb> 118 atoms in block 170 Block first atom: 18929 Blocpdb> 99 atoms in block 171 Block first atom: 19047 Blocpdb> 117 atoms in block 172 Block first atom: 19146 Blocpdb> 119 atoms in block 173 Block first atom: 19263 Blocpdb> 20 atoms in block 174 Block first atom: 19381 Blocpdb> 174 blocks. Blocpdb> At most, 144 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 20 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 13753916 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 58203 Prepmat> Matrix trace = 30310080.0001 Prepmat> Last element read: 58203 58203 107.4055 Prepmat> 15226 lines saved. Prepmat> 13831 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 19401 RTB> Total mass = 19401.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 19401 RTB> Number of blocks = 174 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 334502.8422 RTB> 47574 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1044 Diagstd> Nb of non-zero elements: 47574 Diagstd> Projected matrix trace = 334502.8422 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1044 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 334502.8422 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0049658 0.0092958 0.0493973 0.0846032 0.1907139 0.2131484 0.2812062 0.3186909 0.4760896 0.7645658 0.9091240 0.9884351 1.1339360 1.5013165 1.7974197 2.1495912 2.9887358 3.1151973 3.5091980 4.3408489 4.7710020 5.2842342 6.0080827 6.3406194 7.0559181 7.7598780 8.3549632 8.6497666 9.5905556 10.2367859 10.4056750 11.5125345 12.2869813 12.9253651 14.0350996 14.5002268 15.3273184 16.2709596 17.0294052 17.2580281 18.6450723 19.7583680 20.7188118 21.1569035 21.4132445 22.3449402 23.0262973 23.8352336 24.7677052 26.1671530 26.4572931 27.0331479 27.3313857 27.8716446 28.0156860 28.8413180 29.3141035 31.1884695 31.3516450 32.2137859 32.6095480 33.1194647 33.9260330 34.3840341 35.2740904 35.5439519 36.4727084 37.1279873 37.6707107 38.9048395 39.5678323 40.4335126 41.9961253 43.7253972 44.0229890 45.0477350 45.5526442 46.5719215 47.8820017 48.9970081 49.1513139 49.5211273 51.0973898 51.2827296 52.7228593 53.2402308 54.0502743 55.5352580 56.1560641 57.5401559 57.8882262 59.2499141 59.4709620 59.7096670 61.5319708 62.2894916 62.8598584 63.5795924 64.1518961 65.3910627 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034326 0.0034346 0.0034349 0.0034350 0.0034357 7.6522504 10.4698009 24.1349837 31.5855681 47.4227243 50.1344625 57.5847851 61.3027690 74.9272249 94.9516908 103.5396843 107.9616137 115.6350684 133.0550652 145.5861410 159.2110556 187.7323180 191.6629020 203.4226085 226.2468871 237.1920242 249.6239845 266.1725303 273.4394192 288.4509972 302.4981519 313.8828244 319.3724687 336.2924868 347.4378200 350.2921530 368.4518600 380.6430272 390.4061856 406.8206884 413.5068207 425.1364770 438.0279903 448.1207141 451.1187373 468.8968515 482.6927938 494.2853091 499.4837149 502.5005231 513.3160908 521.0835153 530.1575941 540.4284017 555.4865110 558.5576244 564.6035319 567.7094265 573.2929194 574.7724065 583.1802820 587.9407861 606.4462461 608.0306144 616.3340537 620.1084789 624.9380026 632.5018792 636.7569512 644.9457601 647.4081120 655.8118922 661.6769164 666.4954470 677.3249822 683.0718834 690.5037094 703.7199962 718.0623599 720.5017558 728.8392629 732.9124109 741.0668024 751.4177145 760.1163270 761.3122997 764.1709812 776.2375327 777.6440379 788.4874006 792.3466842 798.3516576 809.2443521 813.7548890 823.7222503 826.2099131 835.8707787 837.4285485 839.1075036 851.8158032 857.0431208 860.9580272 865.8729052 869.7611979 878.1212319 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 19401 Rtb_to_modes> Number of blocs = 174 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9923E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9658E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.2958E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9397E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.4603E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1907 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2131 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2812 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3187 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4761 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7646 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9091 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9884 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.134 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.501 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.797 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.150 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.989 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.115 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.509 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.341 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.771 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.284 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.008 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.341 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.056 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.760 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.355 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.650 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.591 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.39 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1044 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00005 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99994 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00004 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 349218 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00005 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99994 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00004 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2205041037174332.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2205041037174332.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2205041037174332.atom Openam> file on opening on unit 11: 2205041037174332.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1206 First residue number = 1 Last residue number = 666 Number of atoms found = 19401 Mean number per residue = 16.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9923E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9658E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.2958E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9397E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.4603E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1907 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2131 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2812 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3187 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4761 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7646 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9091 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9884 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.134 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.501 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.797 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.150 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.989 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.115 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.509 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.341 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.771 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.284 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.008 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.341 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.056 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.760 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.355 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.650 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.591 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.39 Bfactors> 106 vectors, 58203 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.004966 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.326 for 1206 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.300 +/- 0.51 Bfactors> = 87.277 +/- 8.92 Bfactors> Shiftng-fct= 86.977 Bfactors> Scaling-fct= 17.587 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2205041037174332.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2205041037174332.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.652 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 108.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 115.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 145.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 336.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.9 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Chkmod> That is: 19401 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 8 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 26 is: 0.9999 (instead of 1.0000). 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structure for DQ=-10 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=70 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=90 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=110 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=130 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=150 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=170 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=190 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=210 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=230 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=250 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom making animated gifs 26 models are in 2205041037174332.7.pdb, 4 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 6 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 16 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 26 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 26 models are in 2205041037174332.7.pdb, 4 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 6 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 16 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 26 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 26 models are in 2205041037174332.7.pdb, 4 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 6 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 16 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 26 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2205041037174332 8 -250 250 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-250 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=-230 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=-210 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=-190 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=-170 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=-150 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=-130 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=-110 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=-90 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=-70 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=-50 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=70 2205041037174332.eigenfacs 2205041037174332.atom calculating perturbed structure for DQ=90 2205041037174332.eigenfacs 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