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***  dndD  ***

LOGs for ID: 22050408112993371

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22050408112993371.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22050408112993371.atom to be opened. Openam> File opened: 22050408112993371.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 666 First residue number = 1 Last residue number = 666 Number of atoms found = 10712 Mean number per residue = 16.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 2.581512 +/- 27.036173 From: -52.031000 To: 87.081000 = -0.464152 +/- 16.963462 From: -47.471000 To: 40.261000 = -6.169245 +/- 24.260327 From: -55.945000 To: 49.343000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3831 % Filled. Pdbmat> 7142266 non-zero elements. Pdbmat> 786591 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 146.86 +/- 47.85 Maximum number = 245 Minimum number = 21 Pdbmat> Matrix trace = 1.573182E+07 Pdbmat> Larger element = 875.328 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 666 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22050408112993371.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22050408112993371.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22050408112993371.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10712 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 666 residues. Blocpdb> 79 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 71 atoms in block 2 Block first atom: 80 Blocpdb> 75 atoms in block 3 Block first atom: 151 Blocpdb> 57 atoms in block 4 Block first atom: 226 Blocpdb> 64 atoms in block 5 Block first atom: 283 Blocpdb> 55 atoms in block 6 Block first atom: 347 Blocpdb> 84 atoms in block 7 Block first atom: 402 Blocpdb> 62 atoms in block 8 Block first atom: 486 Blocpdb> 71 atoms in block 9 Block first atom: 548 Blocpdb> 62 atoms in block 10 Block first atom: 619 Blocpdb> 47 atoms in block 11 Block first atom: 681 Blocpdb> 53 atoms in block 12 Block first atom: 728 Blocpdb> 60 atoms in block 13 Block first atom: 781 Blocpdb> 72 atoms in block 14 Block first atom: 841 Blocpdb> 57 atoms in block 15 Block first atom: 913 Blocpdb> 73 atoms in block 16 Block first atom: 970 Blocpdb> 50 atoms in block 17 Block first atom: 1043 Blocpdb> 66 atoms in block 18 Block first atom: 1093 Blocpdb> 72 atoms in block 19 Block first atom: 1159 Blocpdb> 59 atoms in block 20 Block first atom: 1231 Blocpdb> 57 atoms in block 21 Block first atom: 1290 Blocpdb> 71 atoms in block 22 Block first atom: 1347 Blocpdb> 61 atoms in block 23 Block first atom: 1418 Blocpdb> 52 atoms in block 24 Block first atom: 1479 Blocpdb> 68 atoms in block 25 Block first atom: 1531 Blocpdb> 71 atoms in block 26 Block first atom: 1599 Blocpdb> 46 atoms in block 27 Block first atom: 1670 Blocpdb> 59 atoms in block 28 Block first atom: 1716 Blocpdb> 68 atoms in block 29 Block first atom: 1775 Blocpdb> 75 atoms in block 30 Block first atom: 1843 Blocpdb> 82 atoms in block 31 Block first atom: 1918 Blocpdb> 66 atoms in block 32 Block first atom: 2000 Blocpdb> 53 atoms in block 33 Block first atom: 2066 Blocpdb> 59 atoms in block 34 Block first atom: 2119 Blocpdb> 64 atoms in block 35 Block first atom: 2178 Blocpdb> 52 atoms in block 36 Block first atom: 2242 Blocpdb> 68 atoms in block 37 Block first atom: 2294 Blocpdb> 69 atoms in block 38 Block first atom: 2362 Blocpdb> 48 atoms in block 39 Block first atom: 2431 Blocpdb> 79 atoms in block 40 Block first atom: 2479 Blocpdb> 56 atoms in block 41 Block first atom: 2558 Blocpdb> 63 atoms in block 42 Block first atom: 2614 Blocpdb> 52 atoms in block 43 Block first atom: 2677 Blocpdb> 51 atoms in block 44 Block first atom: 2729 Blocpdb> 67 atoms in block 45 Block first atom: 2780 Blocpdb> 83 atoms in block 46 Block first atom: 2847 Blocpdb> 57 atoms in block 47 Block first atom: 2930 Blocpdb> 71 atoms in block 48 Block first atom: 2987 Blocpdb> 69 atoms in block 49 Block first atom: 3058 Blocpdb> 75 atoms in block 50 Block first atom: 3127 Blocpdb> 79 atoms in block 51 Block first atom: 3202 Blocpdb> 56 atoms in block 52 Block first atom: 3281 Blocpdb> 51 atoms in block 53 Block first atom: 3337 Blocpdb> 68 atoms in block 54 Block first atom: 3388 Blocpdb> 63 atoms in block 55 Block first atom: 3456 Blocpdb> 65 atoms in block 56 Block first atom: 3519 Blocpdb> 66 atoms in block 57 Block first atom: 3584 Blocpdb> 57 atoms in block 58 Block first atom: 3650 Blocpdb> 63 atoms in block 59 Block first atom: 3707 Blocpdb> 53 atoms in block 60 Block first atom: 3770 Blocpdb> 67 atoms in block 61 Block first atom: 3823 Blocpdb> 73 atoms in block 62 Block first atom: 3890 Blocpdb> 64 atoms in block 63 Block first atom: 3963 Blocpdb> 67 atoms in block 64 Block first atom: 4027 Blocpdb> 59 atoms in block 65 Block first atom: 4094 Blocpdb> 41 atoms in block 66 Block first atom: 4153 Blocpdb> 57 atoms in block 67 Block first atom: 4194 Blocpdb> 63 atoms in block 68 Block first atom: 4251 Blocpdb> 76 atoms in block 69 Block first atom: 4314 Blocpdb> 64 atoms in block 70 Block first atom: 4390 Blocpdb> 75 atoms in block 71 Block first atom: 4454 Blocpdb> 66 atoms in block 72 Block first atom: 4529 Blocpdb> 75 atoms in block 73 Block first atom: 4595 Blocpdb> 55 atoms in block 74 Block first atom: 4670 Blocpdb> 51 atoms in block 75 Block first atom: 4725 Blocpdb> 60 atoms in block 76 Block first atom: 4776 Blocpdb> 66 atoms in block 77 Block first atom: 4836 Blocpdb> 66 atoms in block 78 Block first atom: 4902 Blocpdb> 63 atoms in block 79 Block first atom: 4968 Blocpdb> 58 atoms in block 80 Block first atom: 5031 Blocpdb> 68 atoms in block 81 Block first atom: 5089 Blocpdb> 68 atoms in block 82 Block first atom: 5157 Blocpdb> 67 atoms in block 83 Block first atom: 5225 Blocpdb> 70 atoms in block 84 Block first atom: 5292 Blocpdb> 74 atoms in block 85 Block first atom: 5362 Blocpdb> 61 atoms in block 86 Block first atom: 5436 Blocpdb> 52 atoms in block 87 Block first atom: 5497 Blocpdb> 62 atoms in block 88 Block first atom: 5549 Blocpdb> 45 atoms in block 89 Block first atom: 5611 Blocpdb> 59 atoms in block 90 Block first atom: 5656 Blocpdb> 74 atoms in block 91 Block first atom: 5715 Blocpdb> 63 atoms in block 92 Block first atom: 5789 Blocpdb> 55 atoms in block 93 Block first atom: 5852 Blocpdb> 70 atoms in block 94 Block first atom: 5907 Blocpdb> 69 atoms in block 95 Block first atom: 5977 Blocpdb> 49 atoms in block 96 Block first atom: 6046 Blocpdb> 64 atoms in block 97 Block first atom: 6095 Blocpdb> 65 atoms in block 98 Block first atom: 6159 Blocpdb> 67 atoms in block 99 Block first atom: 6224 Blocpdb> 85 atoms in block 100 Block first atom: 6291 Blocpdb> 79 atoms in block 101 Block first atom: 6376 Blocpdb> 61 atoms in block 102 Block first atom: 6455 Blocpdb> 66 atoms in block 103 Block first atom: 6516 Blocpdb> 68 atoms in block 104 Block first atom: 6582 Blocpdb> 44 atoms in block 105 Block first atom: 6650 Blocpdb> 63 atoms in block 106 Block first atom: 6694 Blocpdb> 56 atoms in block 107 Block first atom: 6757 Blocpdb> 65 atoms in block 108 Block first atom: 6813 Blocpdb> 76 atoms in block 109 Block first atom: 6878 Blocpdb> 74 atoms in block 110 Block first atom: 6954 Blocpdb> 77 atoms in block 111 Block first atom: 7028 Blocpdb> 61 atoms in block 112 Block first atom: 7105 Blocpdb> 84 atoms in block 113 Block first atom: 7166 Blocpdb> 64 atoms in block 114 Block first atom: 7250 Blocpdb> 68 atoms in block 115 Block first atom: 7314 Blocpdb> 78 atoms in block 116 Block first atom: 7382 Blocpdb> 59 atoms in block 117 Block first atom: 7460 Blocpdb> 76 atoms in block 118 Block first atom: 7519 Blocpdb> 66 atoms in block 119 Block first atom: 7595 Blocpdb> 56 atoms in block 120 Block first atom: 7661 Blocpdb> 66 atoms in block 121 Block first atom: 7717 Blocpdb> 53 atoms in block 122 Block first atom: 7783 Blocpdb> 66 atoms in block 123 Block first atom: 7836 Blocpdb> 65 atoms in block 124 Block first atom: 7902 Blocpdb> 64 atoms in block 125 Block first atom: 7967 Blocpdb> 68 atoms in block 126 Block first atom: 8031 Blocpdb> 66 atoms in block 127 Block first atom: 8099 Blocpdb> 72 atoms in block 128 Block first atom: 8165 Blocpdb> 58 atoms in block 129 Block first atom: 8237 Blocpdb> 68 atoms in block 130 Block first atom: 8295 Blocpdb> 77 atoms in block 131 Block first atom: 8363 Blocpdb> 75 atoms in block 132 Block first atom: 8440 Blocpdb> 63 atoms in block 133 Block first atom: 8515 Blocpdb> 57 atoms in block 134 Block first atom: 8578 Blocpdb> 64 atoms in block 135 Block first atom: 8635 Blocpdb> 62 atoms in block 136 Block first atom: 8699 Blocpdb> 65 atoms in block 137 Block first atom: 8761 Blocpdb> 47 atoms in block 138 Block first atom: 8826 Blocpdb> 73 atoms in block 139 Block first atom: 8873 Blocpdb> 71 atoms in block 140 Block first atom: 8946 Blocpdb> 54 atoms in block 141 Block first atom: 9017 Blocpdb> 67 atoms in block 142 Block first atom: 9071 Blocpdb> 67 atoms in block 143 Block first atom: 9138 Blocpdb> 54 atoms in block 144 Block first atom: 9205 Blocpdb> 54 atoms in block 145 Block first atom: 9259 Blocpdb> 69 atoms in block 146 Block first atom: 9313 Blocpdb> 66 atoms in block 147 Block first atom: 9382 Blocpdb> 54 atoms in block 148 Block first atom: 9448 Blocpdb> 66 atoms in block 149 Block first atom: 9502 Blocpdb> 70 atoms in block 150 Block first atom: 9568 Blocpdb> 74 atoms in block 151 Block first atom: 9638 Blocpdb> 72 atoms in block 152 Block first atom: 9712 Blocpdb> 53 atoms in block 153 Block first atom: 9784 Blocpdb> 68 atoms in block 154 Block first atom: 9837 Blocpdb> 56 atoms in block 155 Block first atom: 9905 Blocpdb> 57 atoms in block 156 Block first atom: 9961 Blocpdb> 80 atoms in block 157 Block first atom: 10018 Blocpdb> 64 atoms in block 158 Block first atom: 10098 Blocpdb> 67 atoms in block 159 Block first atom: 10162 Blocpdb> 59 atoms in block 160 Block first atom: 10229 Blocpdb> 70 atoms in block 161 Block first atom: 10288 Blocpdb> 55 atoms in block 162 Block first atom: 10358 Blocpdb> 58 atoms in block 163 Block first atom: 10413 Blocpdb> 62 atoms in block 164 Block first atom: 10471 Blocpdb> 80 atoms in block 165 Block first atom: 10533 Blocpdb> 70 atoms in block 166 Block first atom: 10613 Blocpdb> 30 atoms in block 167 Block first atom: 10682 Blocpdb> 167 blocks. Blocpdb> At most, 85 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 30 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 7142433 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 32136 Prepmat> Matrix trace = 15731820.0000 Prepmat> Last element read: 32136 32136 89.3649 Prepmat> 14029 lines saved. Prepmat> 12667 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10712 RTB> Total mass = 10712.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10712 RTB> Number of blocks = 167 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 344975.3119 RTB> 46491 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1002 Diagstd> Nb of non-zero elements: 46491 Diagstd> Projected matrix trace = 344975.3119 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1002 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 344975.3119 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0061604 0.0085610 0.0099999 0.0232455 0.1229664 0.1295173 0.1683981 0.2567440 0.3742869 0.6944681 0.7263282 1.1957152 1.7348386 1.8962517 2.4410407 2.7133107 3.4393114 4.0476553 4.3302229 5.0692038 5.3281293 5.9544649 6.7156194 6.9133525 7.1589325 8.2042776 8.7529622 9.0685628 9.7963179 10.6085534 11.0731775 11.9582548 12.7243951 13.2889376 13.8365196 14.2209669 16.0422509 16.2621924 16.8174097 17.2461137 18.9533151 19.1909508 20.2049311 21.6957837 21.8299050 22.1599243 23.1534522 23.4992476 23.8174107 25.4588093 25.8872478 26.6303980 27.7291435 29.1264864 30.0994942 31.1356852 32.2387231 32.8607901 34.0979352 35.0708565 35.6441906 35.9550106 38.0213344 38.5102008 39.8164993 40.3296116 41.5664281 41.9045487 42.5825350 44.9895856 45.3398314 45.8001284 46.6711213 47.1088956 48.0213925 49.2341719 49.7489788 50.3775966 51.2107356 51.5593789 52.1508189 53.0621340 53.5444141 54.5892972 54.8471029 55.0678583 55.6078486 56.9953471 57.4440285 57.7250128 58.5894065 60.6525370 61.2966701 61.5187931 62.2806935 63.9427177 65.2124477 65.5051496 66.5715017 67.1048877 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034326 0.0034337 0.0034338 0.0034340 0.0034342 0.0034364 8.5231599 10.0475009 10.8590684 16.5563555 38.0792672 39.0804183 44.5619118 55.0231428 66.4351045 90.4943445 92.5468672 118.7433094 143.0292373 149.5351421 169.6613018 178.8731059 201.3868126 218.4726327 225.9698039 244.4922843 250.6586269 264.9821685 281.4092165 285.5220355 290.5490190 311.0394343 321.2719473 327.0126203 339.8808656 353.6904746 361.3527889 375.5166362 387.3591797 395.8588980 403.9324199 409.5055976 434.9385798 437.9099641 445.3226985 450.9629921 472.7568948 475.7113644 488.1170384 505.8048063 507.3658158 511.1865479 522.5202878 526.4077312 529.9593428 547.9164312 552.5075547 560.3819118 571.8254865 586.0562866 595.7648533 605.9328442 616.5725645 622.4927257 634.1022890 643.0851282 648.3203572 651.1409226 669.5899981 673.8809386 685.2149299 689.6159538 700.1105681 702.9523125 708.6161343 728.3687034 731.1983975 734.9006439 741.8556317 745.3268075 752.5106574 761.9537292 765.9269754 770.7508322 777.0979931 779.7387522 784.1982096 791.0203135 794.6069620 802.3226116 804.2149213 805.8317472 809.7730648 819.8133417 823.0339019 825.0443589 831.1986511 845.7066895 850.1855542 851.7245856 856.9825923 868.3420365 876.9211221 878.8869211 886.0117002 889.5540829 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10712 Rtb_to_modes> Number of blocs = 167 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9923E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0014E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.1604E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.5610E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.3246E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1230 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1295 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1684 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2567 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3743 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6945 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7263 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.196 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.735 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.896 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.441 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.713 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.439 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.048 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.328 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.954 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.716 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.913 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.159 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.204 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.753 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.796 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.10 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1002 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00004 0.99997 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 192816 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 1.00002 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99997 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00004 0.99997 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22050408112993371.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22050408112993371.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22050408112993371.atom Openam> file on opening on unit 11: 22050408112993371.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 666 First residue number = 1 Last residue number = 666 Number of atoms found = 10712 Mean number per residue = 16.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9923E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0014E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.1604E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.5610E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.3246E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1230 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1295 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1684 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2567 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3743 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6945 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7263 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.196 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.735 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.896 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.441 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.713 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.439 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.048 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.328 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.954 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.716 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.913 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.159 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.204 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.753 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.796 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.38 Rdmodfacs> Numero du 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.10 Bfactors> 106 vectors, 32136 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.006160 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.465 for 666 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.666 +/- 0.56 Bfactors> = 82.125 +/- 10.49 Bfactors> Shiftng-fct= 81.459 Bfactors> Scaling-fct= 18.832 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22050408112993371.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22050408112993371.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4362E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 8.523 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 10.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 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vecteur en lecture: 387.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.2 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vecteur en lecture: 734.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 10712 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 22050408112993371.7.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 22050408112993371.7.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22050408112993371 8 -1000 1000 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-1000 22050408112993371.eigenfacs 22050408112993371.atom calculating 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