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***  Leucine binding protein  ***

LOGs for ID: 22050108083495805

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22050108083495805.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22050108083495805.atom to be opened. Openam> File opened: 22050108083495805.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 345 First residue number = 1 Last residue number = 345 Number of atoms found = 2595 Mean number per residue = 7.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 35.050608 +/- 15.706378 From: 1.053000 To: 64.391000 = 0.143452 +/- 10.184973 From: -24.308000 To: 23.520000 = 9.280610 +/- 12.126535 From: -19.482000 To: 37.584000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.2387 % Filled. Pdbmat> 981544 non-zero elements. Pdbmat> 107351 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.74 +/- 22.69 Maximum number = 133 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 2.147020E+06 Pdbmat> Larger element = 489.926 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 345 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22050108083495805.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22050108083495805.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22050108083495805.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2595 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 345 residues. Blocpdb> 16 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 17 atoms in block 2 Block first atom: 17 Blocpdb> 12 atoms in block 3 Block first atom: 34 Blocpdb> 14 atoms in block 4 Block first atom: 46 Blocpdb> 9 atoms in block 5 Block first atom: 60 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 69 Blocpdb> 11 atoms in block 7 Block first atom: 83 Blocpdb> 13 atoms in block 8 Block first atom: 94 Blocpdb> 23 atoms in block 9 Block first atom: 107 Blocpdb> 12 atoms in block 10 Block first atom: 130 Blocpdb> 17 atoms in block 11 Block first atom: 142 Blocpdb> 19 atoms in block 12 Block first atom: 159 Blocpdb> 9 atoms in block 13 Block first atom: 178 Blocpdb> 20 atoms in block 14 Block first atom: 187 Blocpdb> 13 atoms in block 15 Block first atom: 207 Blocpdb> 17 atoms in block 16 Block first atom: 220 Blocpdb> 16 atoms in block 17 Block first atom: 237 Blocpdb> 14 atoms in block 18 Block first atom: 253 Blocpdb> 8 atoms in block 19 Block first atom: 267 Blocpdb> 17 atoms in block 20 Block first atom: 275 Blocpdb> 12 atoms in block 21 Block first atom: 292 Blocpdb> 17 atoms in block 22 Block first atom: 304 Blocpdb> 11 atoms in block 23 Block first atom: 321 Blocpdb> 16 atoms in block 24 Block first atom: 332 Blocpdb> 20 atoms in block 25 Block first atom: 348 Blocpdb> 13 atoms in block 26 Block first atom: 368 Blocpdb> 14 atoms in block 27 Block first atom: 381 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 395 Blocpdb> 14 atoms in block 29 Block first atom: 411 Blocpdb> 12 atoms in block 30 Block first atom: 425 Blocpdb> 12 atoms in block 31 Block first atom: 437 Blocpdb> 17 atoms in block 32 Block first atom: 449 Blocpdb> 15 atoms in block 33 Block first atom: 466 Blocpdb> 16 atoms in block 34 Block first atom: 481 Blocpdb> 12 atoms in block 35 Block first atom: 497 Blocpdb> 21 atoms in block 36 Block first atom: 509 Blocpdb> 15 atoms in block 37 Block first atom: 530 Blocpdb> 14 atoms in block 38 Block first atom: 545 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 559 Blocpdb> 12 atoms in block 40 Block first atom: 573 Blocpdb> 13 atoms in block 41 Block first atom: 585 Blocpdb> 16 atoms in block 42 Block first atom: 598 Blocpdb> 11 atoms in block 43 Block first atom: 614 Blocpdb> 16 atoms in block 44 Block first atom: 625 Blocpdb> 21 atoms in block 45 Block first atom: 641 Blocpdb> 17 atoms in block 46 Block first atom: 662 Blocpdb> 12 atoms in block 47 Block first atom: 679 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 691 Blocpdb> 14 atoms in block 49 Block first atom: 707 Blocpdb> 11 atoms in block 50 Block first atom: 721 Blocpdb> 12 atoms in block 51 Block first atom: 732 Blocpdb> 15 atoms in block 52 Block first atom: 744 Blocpdb> 17 atoms in block 53 Block first atom: 759 Blocpdb> 16 atoms in block 54 Block first atom: 776 Blocpdb> 15 atoms in block 55 Block first atom: 792 Blocpdb> 21 atoms in block 56 Block first atom: 807 Blocpdb> 18 atoms in block 57 Block first atom: 828 Blocpdb> 19 atoms in block 58 Block first atom: 846 Blocpdb> 12 atoms in block 59 Block first atom: 865 Blocpdb> 12 atoms in block 60 Block first atom: 877 Blocpdb> 14 atoms in block 61 Block first atom: 889 Blocpdb> 15 atoms in block 62 Block first atom: 903 Blocpdb> 11 atoms in block 63 Block first atom: 918 Blocpdb> 12 atoms in block 64 Block first atom: 929 Blocpdb> 14 atoms in block 65 Block first atom: 941 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 955 Blocpdb> 17 atoms in block 67 Block first atom: 975 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 992 Blocpdb> 16 atoms in block 69 Block first atom: 1006 Blocpdb> 20 atoms in block 70 Block first atom: 1022 Blocpdb> 13 atoms in block 71 Block first atom: 1042 Blocpdb> 16 atoms in block 72 Block first atom: 1055 Blocpdb> 18 atoms in block 73 Block first atom: 1071 Blocpdb> 18 atoms in block 74 Block first atom: 1089 Blocpdb> 21 atoms in block 75 Block first atom: 1107 Blocpdb> 13 atoms in block 76 Block first atom: 1128 Blocpdb> 12 atoms in block 77 Block first atom: 1141 Blocpdb> 16 atoms in block 78 Block first atom: 1153 Blocpdb> 13 atoms in block 79 Block first atom: 1169 Blocpdb> 17 atoms in block 80 Block first atom: 1182 Blocpdb> 12 atoms in block 81 Block first atom: 1199 Blocpdb> 14 atoms in block 82 Block first atom: 1211 Blocpdb> 13 atoms in block 83 Block first atom: 1225 Blocpdb> 13 atoms in block 84 Block first atom: 1238 Blocpdb> 14 atoms in block 85 Block first atom: 1251 Blocpdb> 22 atoms in block 86 Block first atom: 1265 Blocpdb> 12 atoms in block 87 Block first atom: 1287 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1299 Blocpdb> 9 atoms in block 89 Block first atom: 1314 Blocpdb> 18 atoms in block 90 Block first atom: 1323 Blocpdb> 19 atoms in block 91 Block first atom: 1341 Blocpdb> 11 atoms in block 92 Block first atom: 1360 Blocpdb> 16 atoms in block 93 Block first atom: 1371 Blocpdb> 16 atoms in block 94 Block first atom: 1387 Blocpdb> 17 atoms in block 95 Block first atom: 1403 Blocpdb> 18 atoms in block 96 Block first atom: 1420 Blocpdb> 16 atoms in block 97 Block first atom: 1438 Blocpdb> 19 atoms in block 98 Block first atom: 1454 Blocpdb> 19 atoms in block 99 Block first atom: 1473 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1492 Blocpdb> 16 atoms in block 101 Block first atom: 1508 Blocpdb> 19 atoms in block 102 Block first atom: 1524 Blocpdb> 17 atoms in block 103 Block first atom: 1543 Blocpdb> 13 atoms in block 104 Block first atom: 1560 Blocpdb> 16 atoms in block 105 Block first atom: 1573 Blocpdb> 20 atoms in block 106 Block first atom: 1589 Blocpdb> 16 atoms in block 107 Block first atom: 1609 Blocpdb> 13 atoms in block 108 Block first atom: 1625 Blocpdb> 12 atoms in block 109 Block first atom: 1638 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1650 Blocpdb> 20 atoms in block 111 Block first atom: 1666 Blocpdb> 12 atoms in block 112 Block first atom: 1686 Blocpdb> 16 atoms in block 113 Block first atom: 1698 Blocpdb> 11 atoms in block 114 Block first atom: 1714 Blocpdb> 12 atoms in block 115 Block first atom: 1725 Blocpdb> 11 atoms in block 116 Block first atom: 1737 Blocpdb> 14 atoms in block 117 Block first atom: 1748 Blocpdb> 16 atoms in block 118 Block first atom: 1762 Blocpdb> 9 atoms in block 119 Block first atom: 1778 Blocpdb> 13 atoms in block 120 Block first atom: 1787 Blocpdb> 14 atoms in block 121 Block first atom: 1800 Blocpdb> 12 atoms in block 122 Block first atom: 1814 Blocpdb> 15 atoms in block 123 Block first atom: 1826 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 1841 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 1856 Blocpdb> 23 atoms in block 126 Block first atom: 1872 Blocpdb> 17 atoms in block 127 Block first atom: 1895 Blocpdb> 15 atoms in block 128 Block first atom: 1912 Blocpdb> 13 atoms in block 129 Block first atom: 1927 Blocpdb> 13 atoms in block 130 Block first atom: 1940 Blocpdb> 15 atoms in block 131 Block first atom: 1953 Blocpdb> 13 atoms in block 132 Block first atom: 1968 Blocpdb> 17 atoms in block 133 Block first atom: 1981 Blocpdb> 13 atoms in block 134 Block first atom: 1998 Blocpdb> 18 atoms in block 135 Block first atom: 2011 Blocpdb> 15 atoms in block 136 Block first atom: 2029 Blocpdb> 10 atoms in block 137 Block first atom: 2044 Blocpdb> 19 atoms in block 138 Block first atom: 2054 Blocpdb> 21 atoms in block 139 Block first atom: 2073 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2094 Blocpdb> 17 atoms in block 141 Block first atom: 2109 Blocpdb> 12 atoms in block 142 Block first atom: 2126 Blocpdb> 15 atoms in block 143 Block first atom: 2138 Blocpdb> 13 atoms in block 144 Block first atom: 2153 Blocpdb> 12 atoms in block 145 Block first atom: 2166 Blocpdb> 17 atoms in block 146 Block first atom: 2178 Blocpdb> 18 atoms in block 147 Block first atom: 2195 Blocpdb> 10 atoms in block 148 Block first atom: 2213 Blocpdb> 17 atoms in block 149 Block first atom: 2223 Blocpdb> 15 atoms in block 150 Block first atom: 2240 Blocpdb> 13 atoms in block 151 Block first atom: 2255 Blocpdb> 16 atoms in block 152 Block first atom: 2268 Blocpdb> 16 atoms in block 153 Block first atom: 2284 Blocpdb> 14 atoms in block 154 Block first atom: 2300 Blocpdb> 12 atoms in block 155 Block first atom: 2314 Blocpdb> 13 atoms in block 156 Block first atom: 2326 Blocpdb> 14 atoms in block 157 Block first atom: 2339 Blocpdb> 12 atoms in block 158 Block first atom: 2353 Blocpdb> 15 atoms in block 159 Block first atom: 2365 Blocpdb> 22 atoms in block 160 Block first atom: 2380 Blocpdb> 17 atoms in block 161 Block first atom: 2402 Blocpdb> 13 atoms in block 162 Block first atom: 2419 Blocpdb> 16 atoms in block 163 Block first atom: 2432 Blocpdb> 13 atoms in block 164 Block first atom: 2448 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 2461 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2480 Blocpdb> 18 atoms in block 167 Block first atom: 2495 Blocpdb> 23 atoms in block 168 Block first atom: 2513 Blocpdb> 15 atoms in block 169 Block first atom: 2536 Blocpdb> 12 atoms in block 170 Block first atom: 2551 Blocpdb> 12 atoms in block 171 Block first atom: 2563 Blocpdb> 16 atoms in block 172 Block first atom: 2575 Blocpdb> 5 atoms in block 173 Block first atom: 2590 Blocpdb> 173 blocks. Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 981717 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 7785 Prepmat> Matrix trace = 2147020.0000 Prepmat> Last element read: 7785 7785 191.6530 Prepmat> 15052 lines saved. Prepmat> 13133 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2595 RTB> Total mass = 2595.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2595 RTB> Number of blocks = 173 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 245074.6036 RTB> 66453 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1038 Diagstd> Nb of non-zero elements: 66453 Diagstd> Projected matrix trace = 245074.6036 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1038 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 245074.6036 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.3911624 0.4760476 1.1597623 3.6519103 3.8734600 4.8110985 9.4190525 10.0388981 10.3638957 12.6632875 12.8635151 13.8969097 13.9955725 14.5235300 18.0917389 18.9384842 19.9060720 20.0855160 20.5086386 21.2801675 22.1210342 22.5636787 24.4407063 25.4266252 26.5769670 26.9549645 27.8456168 29.3311880 29.6236557 30.3736929 30.8239432 31.6158218 32.3827254 33.1878928 34.0169744 34.1314206 34.7938974 35.3088125 35.9115279 36.0132871 37.2976583 37.8622068 38.2708778 39.0990380 39.9663875 40.0771654 40.4266788 41.4091340 41.7531470 42.7745353 43.7216927 44.5078892 45.2390199 46.1328082 47.0727082 47.7596053 48.6171395 48.6461625 49.3773637 50.0419161 51.0920914 51.9883682 52.4299228 53.7330259 54.1849000 54.9170555 55.7262320 56.1845710 56.8049385 57.3552374 57.5735457 58.2248226 59.8459022 60.5302460 60.9496330 61.3651177 61.8035432 61.9818244 62.9145436 63.5416767 63.7724884 65.3632937 65.4256229 66.6287664 66.9393287 67.3854677 67.4556405 69.6237786 70.0725001 70.5096296 71.0251651 71.5082985 71.6632747 72.1885134 72.4479760 72.6320647 73.6158422 74.2777155 74.7838351 75.0690233 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034327 0.0034332 0.0034332 0.0034338 0.0034344 67.9162702 74.9239147 116.9444917 207.5177895 213.7198296 238.1866436 333.2720479 344.0632631 349.5882260 386.4279351 389.4709865 404.8129507 406.2474179 413.8389590 461.8866775 472.5718937 484.4936228 486.6724663 491.7718857 500.9366438 510.7377906 515.8224425 536.8490095 547.5699930 559.8194569 563.7864872 573.0251736 588.1120898 591.0369139 598.4723342 602.8918012 610.5869497 617.9480684 625.5832608 633.3490479 634.4135685 640.5408319 645.2631083 650.7470709 651.6683995 663.1870894 668.1873385 671.7837465 679.0133552 686.5034553 687.4542147 690.4453552 698.7846465 701.6812757 710.2118765 718.0319408 724.4589457 730.3850480 737.5648751 745.0404852 750.4567094 757.1640432 757.3900119 763.0609514 768.1786726 776.1972869 782.9758613 786.2938689 796.0052448 799.3452862 804.7276097 810.6345684 813.9614091 818.4427901 822.3975749 823.9612133 828.6084683 840.0642239 844.8536792 847.7754337 850.6601065 853.6934855 854.9238993 861.3324427 865.6146848 867.1854088 877.9347601 878.3532512 886.3926916 888.4560657 891.4118516 891.8758727 906.0957116 909.0108915 911.8418002 915.1692224 918.2765681 919.2710957 922.6337335 924.2903284 925.4638843 931.7103564 935.8894452 939.0725523 940.8614248 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2595 Rtb_to_modes> Number of blocs = 173 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9924E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3912 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4760 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.160 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.652 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.873 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.811 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.419 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.07 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1038 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 46710 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00004 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00004 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00002 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99996 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22050108083495805.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22050108083495805.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22050108083495805.atom Openam> file on opening on unit 11: 22050108083495805.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 345 First residue number = 1 Last residue number = 345 Number of atoms found = 2595 Mean number per residue = 7.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9924E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9958E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3912 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4760 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.160 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.652 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.873 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.811 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.419 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.07 Bfactors> 106 vectors, 7785 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.391200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.466 for 345 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.050 +/- 0.03 Bfactors> = 18.437 +/- 5.22 Bfactors> Shiftng-fct= 18.387 Bfactors> Scaling-fct= 174.871 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22050108083495805.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22050108083495805.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 718.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.0 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vecteur en lecture: 828.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 2595 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 79 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7289 0.0034 0.7995 0.0034 0.8757 0.0034 0.9942 0.0034 0.8834 0.0034 0.6932 67.9166 0.7493 74.9170 0.6504 116.9515 0.7423 207.5114 0.7604 213.6980 0.7673 238.1740 0.7274 333.2568 0.1324 344.0674 0.2281 349.5075 0.2984 386.3612 0.3818 389.4011 0.1596 404.8406 0.3585 406.2942 0.1040 413.7709 0.3095 461.8447 0.3396 472.5705 0.2494 484.5206 0.3321 486.7059 0.3254 491.7671 0.3124 500.9132 0.4582 510.7039 0.2261 515.7583 0.4647 536.8182 0.5411 547.5828 0.5615 559.8274 0.5326 563.7104 0.5388 573.0457 0.4539 588.0749 0.4762 590.9751 0.4032 598.4103 0.5345 602.8274 0.5526 610.6011 0.5632 617.8955 0.4686 625.5763 0.5391 633.3500 0.5044 634.3731 0.3823 640.4775 0.2612 645.2463 0.2506 650.7053 0.3262 651.6107 0.4053 663.1794 0.4133 668.1392 0.3808 671.7472 0.2452 678.9926 0.3820 686.5050 0.4898 687.4490 0.4214 690.4441 0.2474 698.7620 0.4652 701.6247 0.4177 710.1437 0.3572 717.9872 0.3418 724.4450 0.3138 730.3616 0.4702 737.5108 0.4527 744.9871 0.3542 750.4276 0.4535 757.1538 0.3410 757.3874 0.3405 763.0486 0.4277 768.1310 0.4038 776.1481 0.3426 782.9545 0.3773 786.2607 0.4986 795.9487 0.3754 799.2748 0.3086 804.7146 0.4972 810.6272 0.4101 813.8934 0.3141 818.3721 0.4580 822.3964 0.3524 823.9005 0.3760 828.5386 0.3443 840.0569 0.2991 844.8157 0.4007 847.7416 0.3332 850.6574 0.3323 853.6324 0.5134 854.8746 0.4110 861.2644 0.4433 865.5661 0.5034 867.1313 0.3883 877.8750 0.4676 878.3449 0.3341 886.3628 0.3672 888.4224 0.4225 891.4036 0.5045 891.8664 0.4974 906.0322 0.5075 908.9557 0.3806 911.8051 0.3983 915.1611 0.2829 918.2481 0.3880 919.2106 0.4829 922.6036 0.4333 924.2636 0.1979 925.4110 0.2595 931.6967 0.4470 935.8637 0.4972 939.0082 0.3966 940.8272 0.4136 project conformational change on normal modes Projmod> Version 1.36, April 2003. Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors. Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ? Getnam> 22050108083495805.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22050108083495805.eigenfacs Getnam> Pdb file with the reference structure ? Getnam> 22050108083495805.atom Openam> file on opening on unit 11: 22050108083495805.atom Getnam> Pdb file with the other conformer ? Getnam> 22050108083495805.atom2 Openam> file on opening on unit 12: 22050108083495805.atom2 Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n) Getrep> F Projmod> All masses will all be assumed to be of 1. Getrep> Displacement along one mode ? (y/n) Getrep> F Openam> file on opening on unit 13: projmod.res Openam> file on opening on unit 14: dr.res Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 757.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 822.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 919.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 939.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.8 Projmod> 106 vectors, 7785 coordinates in file. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 345 First residue number = 1 Last residue number = 345 Number of atoms found = 2595 Mean number per residue = 7.5 Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 345 First residue number = 1 Last residue number = 345 Number of atoms found = 2595 Mean number per residue = 7.5 Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number). Projmod> 2595 atoms are considered. Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 7.23 Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00 Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum. Vector: 1 F= 0.00 Cos= -0.019 Sum= 0.000 q= -6.9844 Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.005 Sum= 0.000 q= 1.7008 Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.010 Sum= 0.000 q= -3.7140 Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.001 Sum= 0.000 q= -0.3539 Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.016 Sum= 0.001 q= 5.8717 Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.002 Sum= 0.001 q= 0.7968 Vector: 7 F= 67.92 Cos= -0.938 Sum= 0.881 q= -345.3382 Vector: 8 F= 74.92 Cos= -0.058 Sum= 0.884 q= -21.3499 Vector: 9 F= 116.95 Cos= 0.055 Sum= 0.887 q= 20.1050 Vector: 10 F= 207.51 Cos= 0.012 Sum= 0.887 q= 4.3224 Vector: 11 F= 213.70 Cos= 0.164 Sum= 0.914 q= 60.3177 Vector: 12 F= 238.17 Cos= 0.043 Sum= 0.916 q= 15.8321 Vector: 13 F= 333.26 Cos= 0.008 Sum= 0.916 q= 2.9755 Vector: 14 F= 344.07 Cos= 0.042 Sum= 0.918 q= 15.4422 Vector: 15 F= 349.51 Cos= 0.001 Sum= 0.918 q= 0.1940 Vector: 16 F= 386.36 Cos= -0.023 Sum= 0.918 q= -8.6091 Vector: 17 F= 389.40 Cos= 0.024 Sum= 0.919 q= 8.8102 Vector: 18 F= 404.84 Cos= -0.005 Sum= 0.919 q= -1.7515 Vector: 19 F= 406.29 Cos= 0.003 Sum= 0.919 q= 1.0921 Vector: 20 F= 413.77 Cos= 0.002 Sum= 0.919 q= 0.6496 Vector: 21 F= 461.84 Cos= -0.019 Sum= 0.919 q= -7.1744 Vector: 22 F= 472.57 Cos= -0.007 Sum= 0.919 q= -2.6339 Vector: 23 F= 484.52 Cos= -0.019 Sum= 0.920 q= -7.0621 Vector: 24 F= 486.71 Cos= -0.006 Sum= 0.920 q= -2.0801 Vector: 25 F= 491.77 Cos= 0.041 Sum= 0.922 q= 14.9749 Vector: 26 F= 500.91 Cos= 0.046 Sum= 0.924 q= 16.8310 Vector: 27 F= 510.70 Cos= 0.037 Sum= 0.925 q= 13.5720 Vector: 28 F= 515.76 Cos= -0.030 Sum= 0.926 q= -10.9740 Vector: 29 F= 536.82 Cos= -0.002 Sum= 0.926 q= -0.6480 Vector: 30 F= 547.58 Cos= 0.012 Sum= 0.926 q= 4.5165 Vector: 31 F= 559.83 Cos= 0.015 Sum= 0.926 q= 5.4613 Vector: 32 F= 563.71 Cos= -0.025 Sum= 0.927 q= -9.1132 Vector: 33 F= 573.05 Cos= -0.003 Sum= 0.927 q= -0.9675 Vector: 34 F= 588.07 Cos= -0.009 Sum= 0.927 q= -3.4025 Vector: 35 F= 590.98 Cos= -0.018 Sum= 0.927 q= -6.7687 Vector: 36 F= 598.41 Cos= -0.013 Sum= 0.927 q= -4.8722 Vector: 37 F= 602.83 Cos= -0.012 Sum= 0.928 q= -4.5173 Vector: 38 F= 610.60 Cos= 0.017 Sum= 0.928 q= 6.2898 Vector: 39 F= 617.90 Cos= 0.044 Sum= 0.930 q= 16.3750 Vector: 40 F= 625.58 Cos= -0.035 Sum= 0.931 q= -12.9509 Vector: 41 F= 633.35 Cos= -0.023 Sum= 0.932 q= -8.6036 Vector: 42 F= 634.37 Cos= -0.041 Sum= 0.933 q= -14.9578 Vector: 43 F= 640.48 Cos= 0.044 Sum= 0.935 q= 16.1665 Vector: 44 F= 645.25 Cos= -0.002 Sum= 0.935 q= -0.7158 Vector: 45 F= 650.71 Cos= -0.006 Sum= 0.935 q= -2.2201 Vector: 46 F= 651.61 Cos= -0.022 Sum= 0.936 q= -7.9596 Vector: 47 F= 663.18 Cos= 0.017 Sum= 0.936 q= 6.2298 Vector: 48 F= 668.14 Cos= -0.005 Sum= 0.936 q= -1.9396 Vector: 49 F= 671.75 Cos= -0.003 Sum= 0.936 q= -0.9596 Vector: 50 F= 678.99 Cos= 0.004 Sum= 0.936 q= 1.5835 Vector: 51 F= 686.51 Cos= 0.049 Sum= 0.938 q= 17.8912 Vector: 52 F= 687.45 Cos= -0.032 Sum= 0.939 q= -11.7860 Vector: 53 F= 690.44 Cos= 0.006 Sum= 0.940 q= 2.1954 Vector: 54 F= 698.76 Cos= -0.017 Sum= 0.940 q= -6.3678 Vector: 55 F= 701.62 Cos= -0.016 Sum= 0.940 q= -5.9724 Vector: 56 F= 710.14 Cos= -0.026 Sum= 0.941 q= -9.5245 Vector: 57 F= 717.99 Cos= 0.006 Sum= 0.941 q= 2.0677 Vector: 58 F= 724.45 Cos= 0.004 Sum= 0.941 q= 1.3007 Vector: 59 F= 730.36 Cos= 0.008 Sum= 0.941 q= 2.9660 Vector: 60 F= 737.51 Cos= -0.004 Sum= 0.941 q= -1.4664 Vector: 61 F= 744.99 Cos= 0.004 Sum= 0.941 q= 1.3151 Vector: 62 F= 750.43 Cos= 0.009 Sum= 0.941 q= 3.3408 Vector: 63 F= 757.15 Cos= -0.028 Sum= 0.942 q= -10.3971 Vector: 64 F= 757.39 Cos= 0.012 Sum= 0.942 q= 4.4798 Vector: 65 F= 763.05 Cos= 0.036 Sum= 0.943 q= 13.3939 Vector: 66 F= 768.13 Cos= 0.032 Sum= 0.944 q= 11.9619 Vector: 67 F= 776.15 Cos= 0.016 Sum= 0.945 q= 5.9745 Vector: 68 F= 782.95 Cos= 0.043 Sum= 0.946 q= 15.8298 Vector: 69 F= 786.26 Cos= 0.009 Sum= 0.947 q= 3.4507 Vector: 70 F= 795.95 Cos= 0.011 Sum= 0.947 q= 4.1355 Vector: 71 F= 799.27 Cos= -0.004 Sum= 0.947 q= -1.3474 Vector: 72 F= 804.71 Cos= 0.021 Sum= 0.947 q= 7.6557 Vector: 73 F= 810.63 Cos= -0.006 Sum= 0.947 q= -2.0869 Vector: 74 F= 813.89 Cos= -0.016 Sum= 0.947 q= -5.7351 Vector: 75 F= 818.37 Cos= 0.021 Sum= 0.948 q= 7.7015 Vector: 76 F= 822.40 Cos= -0.012 Sum= 0.948 q= -4.4917 Vector: 77 F= 823.90 Cos= 0.003 Sum= 0.948 q= 0.9762 Vector: 78 F= 828.54 Cos= -0.017 Sum= 0.948 q= -6.0812 %Projmod-Wn> Eigenvector 79 Norm= 0.9999 Vector: 79 F= 840.06 Cos= 0.016 Sum= 0.948 q= 5.9995 Vector: 80 F= 844.82 Cos= -0.011 Sum= 0.949 q= -3.9891 Vector: 81 F= 847.74 Cos= 0.016 Sum= 0.949 q= 6.0447 Vector: 82 F= 850.66 Cos= -0.023 Sum= 0.949 q= -8.5156 Vector: 83 F= 853.63 Cos= -0.045 Sum= 0.951 q= -16.6506 Vector: 84 F= 854.87 Cos= -0.008 Sum= 0.952 q= -3.0066 Vector: 85 F= 861.26 Cos= 0.013 Sum= 0.952 q= 4.9627 Vector: 86 F= 865.57 Cos= 0.002 Sum= 0.952 q= 0.5638 Vector: 87 F= 867.13 Cos= -0.028 Sum= 0.952 q= -10.1651 Vector: 88 F= 877.87 Cos= -0.024 Sum= 0.953 q= -8.7574 Vector: 89 F= 878.34 Cos= 0.015 Sum= 0.953 q= 5.3834 Vector: 90 F= 886.36 Cos= 0.035 Sum= 0.954 q= 12.7020 Vector: 91 F= 888.42 Cos= 0.027 Sum= 0.955 q= 10.0604 Vector: 92 F= 891.40 Cos= -0.016 Sum= 0.955 q= -6.0132 Vector: 93 F= 891.87 Cos= -0.011 Sum= 0.956 q= -4.2030 Vector: 94 F= 906.03 Cos= -0.012 Sum= 0.956 q= -4.3572 Vector: 95 F= 908.96 Cos= 0.026 Sum= 0.956 q= 9.5514 Vector: 96 F= 911.81 Cos= -0.013 Sum= 0.957 q= -4.8884 Vector: 97 F= 915.16 Cos= -0.014 Sum= 0.957 q= -5.3355 Vector: 98 F= 918.25 Cos= -0.015 Sum= 0.957 q= -5.6482 Vector: 99 F= 919.21 Cos= -0.009 Sum= 0.957 q= -3.2620 Vector: 100 F= 922.60 Cos= 0.006 Sum= 0.957 q= 2.2260 Vector: 101 F= 924.26 Cos= -0.008 Sum= 0.957 q= -3.0000 Vector: 102 F= 925.41 Cos= -0.020 Sum= 0.958 q= -7.5140 Vector: 103 F= 931.70 Cos= -0.003 Sum= 0.958 q= -1.2062 Vector: 104 F= 935.86 Cos= 0.034 Sum= 0.959 q= 12.4496 Vector: 105 F= 939.01 Cos= 0.040 Sum= 0.960 q= 14.5459 Vector: 106 F= 940.83 Cos= -0.013 Sum= 0.961 q= -4.8237 Projmod> Best zero-frequency found : 0.003432 Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434 Projmod> Lowest non-zero frequency : 67.916619 Projmod> Best overlap with diff.vect. = -0.94 for mode 7 with F= 67.92 cm-1. Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.880 0.910 0.918 0.924 0.929 0.961 Projmod> Normal end. getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22050108083495805 7 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom making animated gifs 11 models are in 22050108083495805.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050108083495805.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22050108083495805.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 345 5.254 206 0.814 MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 345 5.603 88 2.156 MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 345 5.957 79 2.193 MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 345 6.314 55 2.105 MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 345 6.675 54 2.191 MODEL 6 MODE=7 DQ=0 345 7.038 43 2.108 MODEL 7 MODE=7 DQ=20 345 7.403 40 2.118 MODEL 8 MODE=7 DQ=40 345 7.770 34 2.105 MODEL 9 MODE=7 DQ=60 345 8.139 32 1.986 MODEL 10 MODE=7 DQ=80 345 8.509 29 2.062 MODEL 11 MODE=7 DQ=100 345 8.881 28 2.184 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22050108083495805 8 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22050108083495805.eigenfacs 22050108083495805.atom making animated gifs 11 models are in 22050108083495805.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be 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