***  Xhaly  ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22042218234111840.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22042218234111840.atom to be opened.
Openam> File opened: 22042218234111840.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 555
First residue number = 11
Last residue number = 565
Number of atoms found = 4438
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 18.883987 +/- 22.519894 From: -33.887000 To: 62.749000
= 90.894226 +/- 11.015469 From: 58.415000 To: 118.810000
= 93.092431 +/- 14.113938 From: 62.449000 To: 125.355000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.8355 % Filled.
Pdbmat> 1626957 non-zero elements.
Pdbmat> 177836 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.14 +/- 22.46
Maximum number = 126
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 3.556720E+06
Pdbmat> Larger element = 509.788
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
555 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22042218234111840.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22042218234111840.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22042218234111840.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4438 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 555 residues.
Blocpdb> 29 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 27 atoms in block 2
Block first atom: 30
Blocpdb> 22 atoms in block 3
Block first atom: 57
Blocpdb> 31 atoms in block 4
Block first atom: 79
Blocpdb> 28 atoms in block 5
Block first atom: 110
Blocpdb> 23 atoms in block 6
Block first atom: 138
Blocpdb> 24 atoms in block 7
Block first atom: 161
Blocpdb> 24 atoms in block 8
Block first atom: 185
Blocpdb> 27 atoms in block 9
Block first atom: 209
Blocpdb> 24 atoms in block 10
Block first atom: 236
Blocpdb> 26 atoms in block 11
Block first atom: 260
Blocpdb> 22 atoms in block 12
Block first atom: 286
Blocpdb> 24 atoms in block 13
Block first atom: 308
Blocpdb> 24 atoms in block 14
Block first atom: 332
Blocpdb> 27 atoms in block 15
Block first atom: 356
Blocpdb> 20 atoms in block 16
Block first atom: 383
Blocpdb> 27 atoms in block 17
Block first atom: 403
Blocpdb> 29 atoms in block 18
Block first atom: 430
Blocpdb> 28 atoms in block 19
Block first atom: 459
Blocpdb> 21 atoms in block 20
Block first atom: 487
Blocpdb> 20 atoms in block 21
Block first atom: 508
Blocpdb> 25 atoms in block 22
Block first atom: 528
Blocpdb> 22 atoms in block 23
Block first atom: 553
Blocpdb> 21 atoms in block 24
Block first atom: 575
Blocpdb> 16 atoms in block 25
Block first atom: 596
Blocpdb> 23 atoms in block 26
Block first atom: 612
Blocpdb> 26 atoms in block 27
Block first atom: 635
Blocpdb> 23 atoms in block 28
Block first atom: 661
Blocpdb> 25 atoms in block 29
Block first atom: 684
Blocpdb> 19 atoms in block 30
Block first atom: 709
Blocpdb> 21 atoms in block 31
Block first atom: 728
Blocpdb> 18 atoms in block 32
Block first atom: 749
Blocpdb> 21 atoms in block 33
Block first atom: 767
Blocpdb> 29 atoms in block 34
Block first atom: 788
Blocpdb> 29 atoms in block 35
Block first atom: 817
Blocpdb> 28 atoms in block 36
Block first atom: 846
Blocpdb> 22 atoms in block 37
Block first atom: 874
Blocpdb> 23 atoms in block 38
Block first atom: 896
Blocpdb> 27 atoms in block 39
Block first atom: 919
Blocpdb> 27 atoms in block 40
Block first atom: 946
Blocpdb> 27 atoms in block 41
Block first atom: 973
Blocpdb> 21 atoms in block 42
Block first atom: 1000
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 1021
Blocpdb> 19 atoms in block 44
Block first atom: 1036
Blocpdb> 28 atoms in block 45
Block first atom: 1055
Blocpdb> 26 atoms in block 46
Block first atom: 1083
Blocpdb> 25 atoms in block 47
Block first atom: 1109
Blocpdb> 27 atoms in block 48
Block first atom: 1134
Blocpdb> 21 atoms in block 49
Block first atom: 1161
Blocpdb> 20 atoms in block 50
Block first atom: 1182
Blocpdb> 22 atoms in block 51
Block first atom: 1202
Blocpdb> 25 atoms in block 52
Block first atom: 1224
Blocpdb> 25 atoms in block 53
Block first atom: 1249
Blocpdb> 19 atoms in block 54
Block first atom: 1274
Blocpdb> 26 atoms in block 55
Block first atom: 1293
Blocpdb> 16 atoms in block 56
Block first atom: 1319
Blocpdb> 21 atoms in block 57
Block first atom: 1335
Blocpdb> 27 atoms in block 58
Block first atom: 1356
Blocpdb> 18 atoms in block 59
Block first atom: 1383
Blocpdb> 25 atoms in block 60
Block first atom: 1401
Blocpdb> 25 atoms in block 61
Block first atom: 1426
Blocpdb> 24 atoms in block 62
Block first atom: 1451
Blocpdb> 27 atoms in block 63
Block first atom: 1475
Blocpdb> 25 atoms in block 64
Block first atom: 1502
Blocpdb> 21 atoms in block 65
Block first atom: 1527
Blocpdb> 23 atoms in block 66
Block first atom: 1548
Blocpdb> 24 atoms in block 67
Block first atom: 1571
Blocpdb> 22 atoms in block 68
Block first atom: 1595
Blocpdb> 26 atoms in block 69
Block first atom: 1617
Blocpdb> 21 atoms in block 70
Block first atom: 1643
Blocpdb> 18 atoms in block 71
Block first atom: 1664
Blocpdb> 22 atoms in block 72
Block first atom: 1682
Blocpdb> 25 atoms in block 73
Block first atom: 1704
Blocpdb> 20 atoms in block 74
Block first atom: 1729
Blocpdb> 26 atoms in block 75
Block first atom: 1749
Blocpdb> 21 atoms in block 76
Block first atom: 1775
Blocpdb> 22 atoms in block 77
Block first atom: 1796
Blocpdb> 18 atoms in block 78
Block first atom: 1818
Blocpdb> 22 atoms in block 79
Block first atom: 1836
Blocpdb> 25 atoms in block 80
Block first atom: 1858
Blocpdb> 16 atoms in block 81
Block first atom: 1883
Blocpdb> 19 atoms in block 82
Block first atom: 1899
Blocpdb> 28 atoms in block 83
Block first atom: 1918
Blocpdb> 28 atoms in block 84
Block first atom: 1946
Blocpdb> 20 atoms in block 85
Block first atom: 1974
Blocpdb> 23 atoms in block 86
Block first atom: 1994
Blocpdb> 29 atoms in block 87
Block first atom: 2017
Blocpdb> 21 atoms in block 88
Block first atom: 2046
Blocpdb> 23 atoms in block 89
Block first atom: 2067
Blocpdb> 29 atoms in block 90
Block first atom: 2090
Blocpdb> 28 atoms in block 91
Block first atom: 2119
Blocpdb> 22 atoms in block 92
Block first atom: 2147
Blocpdb> 25 atoms in block 93
Block first atom: 2169
Blocpdb> 24 atoms in block 94
Block first atom: 2194
Blocpdb> 21 atoms in block 95
Block first atom: 2218
Blocpdb> 21 atoms in block 96
Block first atom: 2239
Blocpdb> 23 atoms in block 97
Block first atom: 2260
Blocpdb> 22 atoms in block 98
Block first atom: 2283
Blocpdb> 22 atoms in block 99
Block first atom: 2305
Blocpdb> 22 atoms in block 100
Block first atom: 2327
Blocpdb> 20 atoms in block 101
Block first atom: 2349
Blocpdb> 20 atoms in block 102
Block first atom: 2369
Blocpdb> 23 atoms in block 103
Block first atom: 2389
Blocpdb> 25 atoms in block 104
Block first atom: 2412
Blocpdb> 32 atoms in block 105
Block first atom: 2437
Blocpdb> 26 atoms in block 106
Block first atom: 2469
Blocpdb> 33 atoms in block 107
Block first atom: 2495
Blocpdb> 32 atoms in block 108
Block first atom: 2528
Blocpdb> 25 atoms in block 109
Block first atom: 2560
Blocpdb> 25 atoms in block 110
Block first atom: 2585
Blocpdb> 26 atoms in block 111
Block first atom: 2610
Blocpdb> 24 atoms in block 112
Block first atom: 2636
Blocpdb> 24 atoms in block 113
Block first atom: 2660
Blocpdb> 27 atoms in block 114
Block first atom: 2684
Blocpdb> 27 atoms in block 115
Block first atom: 2711
Blocpdb> 21 atoms in block 116
Block first atom: 2738
Blocpdb> 22 atoms in block 117
Block first atom: 2759
Blocpdb> 24 atoms in block 118
Block first atom: 2781
Blocpdb> 27 atoms in block 119
Block first atom: 2805
Blocpdb> 31 atoms in block 120
Block first atom: 2832
Blocpdb> 28 atoms in block 121
Block first atom: 2863
Blocpdb> 22 atoms in block 122
Block first atom: 2891
Blocpdb> 24 atoms in block 123
Block first atom: 2913
Blocpdb> 25 atoms in block 124
Block first atom: 2937
Blocpdb> 22 atoms in block 125
Block first atom: 2962
Blocpdb> 26 atoms in block 126
Block first atom: 2984
Blocpdb> 23 atoms in block 127
Block first atom: 3010
Blocpdb> 24 atoms in block 128
Block first atom: 3033
Blocpdb> 23 atoms in block 129
Block first atom: 3057
Blocpdb> 32 atoms in block 130
Block first atom: 3080
Blocpdb> 25 atoms in block 131
Block first atom: 3112
Blocpdb> 25 atoms in block 132
Block first atom: 3137
Blocpdb> 23 atoms in block 133
Block first atom: 3162
Blocpdb> 20 atoms in block 134
Block first atom: 3185
Blocpdb> 25 atoms in block 135
Block first atom: 3205
Blocpdb> 21 atoms in block 136
Block first atom: 3230
Blocpdb> 29 atoms in block 137
Block first atom: 3251
Blocpdb> 19 atoms in block 138
Block first atom: 3280
Blocpdb> 24 atoms in block 139
Block first atom: 3299
Blocpdb> 31 atoms in block 140
Block first atom: 3323
Blocpdb> 26 atoms in block 141
Block first atom: 3354
Blocpdb> 22 atoms in block 142
Block first atom: 3380
Blocpdb> 25 atoms in block 143
Block first atom: 3402
Blocpdb> 23 atoms in block 144
Block first atom: 3427
Blocpdb> 20 atoms in block 145
Block first atom: 3450
Blocpdb> 28 atoms in block 146
Block first atom: 3470
Blocpdb> 17 atoms in block 147
Block first atom: 3498
Blocpdb> 27 atoms in block 148
Block first atom: 3515
Blocpdb> 26 atoms in block 149
Block first atom: 3542
Blocpdb> 21 atoms in block 150
Block first atom: 3568
Blocpdb> 19 atoms in block 151
Block first atom: 3589
Blocpdb> 25 atoms in block 152
Block first atom: 3608
Blocpdb> 22 atoms in block 153
Block first atom: 3633
Blocpdb> 24 atoms in block 154
Block first atom: 3655
Blocpdb> 21 atoms in block 155
Block first atom: 3679
Blocpdb> 20 atoms in block 156
Block first atom: 3700
Blocpdb> 14 atoms in block 157
Block first atom: 3720
Blocpdb> 26 atoms in block 158
Block first atom: 3734
Blocpdb> 25 atoms in block 159
Block first atom: 3760
Blocpdb> 27 atoms in block 160
Block first atom: 3785
Blocpdb> 24 atoms in block 161
Block first atom: 3812
Blocpdb> 24 atoms in block 162
Block first atom: 3836
Blocpdb> 24 atoms in block 163
Block first atom: 3860
Blocpdb> 29 atoms in block 164
Block first atom: 3884
Blocpdb> 24 atoms in block 165
Block first atom: 3913
Blocpdb> 24 atoms in block 166
Block first atom: 3937
Blocpdb> 25 atoms in block 167
Block first atom: 3961
Blocpdb> 22 atoms in block 168
Block first atom: 3986
Blocpdb> 23 atoms in block 169
Block first atom: 4008
Blocpdb> 30 atoms in block 170
Block first atom: 4031
Blocpdb> 26 atoms in block 171
Block first atom: 4061
Blocpdb> 22 atoms in block 172
Block first atom: 4087
Blocpdb> 27 atoms in block 173
Block first atom: 4109
Blocpdb> 20 atoms in block 174
Block first atom: 4136
Blocpdb> 30 atoms in block 175
Block first atom: 4156
Blocpdb> 30 atoms in block 176
Block first atom: 4186
Blocpdb> 20 atoms in block 177
Block first atom: 4216
Blocpdb> 28 atoms in block 178
Block first atom: 4236
Blocpdb> 22 atoms in block 179
Block first atom: 4264
Blocpdb> 23 atoms in block 180
Block first atom: 4286
Blocpdb> 23 atoms in block 181
Block first atom: 4309
Blocpdb> 27 atoms in block 182
Block first atom: 4332
Blocpdb> 22 atoms in block 183
Block first atom: 4359
Blocpdb> 29 atoms in block 184
Block first atom: 4381
Blocpdb> 29 atoms in block 185
Block first atom: 4409
Blocpdb> 185 blocks.
Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1627142 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 13314
Prepmat> Matrix trace = 3556720.0000
Prepmat> Last element read: 13314 13314 105.3497
Prepmat> 17206 lines saved.
Prepmat> 15430 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4438
RTB> Total mass = 4438.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4438
RTB> Number of blocks = 185
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 230784.4496
RTB> 61125 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1110
Diagstd> Nb of non-zero elements: 61125
Diagstd> Projected matrix trace = 230784.4496
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1110 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 230784.4496
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.1281875 0.2823456 0.3001360 0.7411489
0.8870797 1.0765290 1.7342787 2.3792907 2.5082025
3.2211235 3.7922338 4.3161744 4.7175748 5.1834622
5.3387566 5.5009093 5.7277179 6.6350226 7.3793460
7.7404840 8.1995660 9.2135244 9.4708791 9.7573954
10.1003571 10.6778500 10.6839135 11.1771810 11.6044396
12.6549007 13.2033827 13.8207607 14.4219809 14.4609952
14.7288120 15.3097366 15.6766060 16.2597670 16.5030381
17.0093227 18.4889614 18.7331423 19.4997921 20.1661749
21.1304004 21.5886811 21.8763438 22.0934365 22.6258869
22.9996803 23.2924223 23.4187865 23.9513280 24.6526068
25.1322015 25.7457036 26.7626646 27.3192103 27.8635330
28.1948298 28.6149177 29.1778536 29.6651686 30.1590122
30.5194289 30.5730477 31.1970926 31.6427774 32.9003402
33.4754629 33.8098991 34.0218038 34.5536503 36.1096239
36.3449985 36.9822187 37.3210224 37.9440739 38.3443070
38.5605605 39.0875034 39.2965031 39.4627008 39.9984710
40.1085091 40.8039668 40.9905684 41.5778537 42.0258219
42.6554078 42.9530285 44.0085018 44.4231228 44.6552500
44.8219288 45.1774510 45.5871015 45.7111378 46.7161473
47.1515494
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034316 0.0034330 0.0034335 0.0034338 0.0034344
0.0034348 38.8792648 57.7013249 59.4914227 93.4863080
102.2766724 112.6699620 143.0061522 167.5016298 171.9794593
194.8942238 211.4671111 225.6029482 235.8602075 247.2323228
250.9084813 254.6903700 259.8879171 279.7154680 294.9879105
302.1199051 310.9501085 329.6159163 334.1876739 339.2049897
345.1148483 354.8437732 354.9445086 363.0458037 369.9196205
386.2999493 394.5825596 403.7023287 412.3896316 412.9470537
416.7533890 424.8925723 429.9533152 437.8773080 441.1408053
447.8564062 466.9297416 470.0029636 479.5239147 487.6486705
499.1707664 504.5547922 507.9051890 510.4190996 516.5330166
520.7822575 524.0860602 525.5057524 531.4471458 539.1712229
544.3905116 550.9950061 561.7718276 567.5829634 573.2094893
576.6071439 580.8868312 586.5728409 591.4508914 596.3535883
599.9063813 600.4331299 606.5300766 610.8471866 622.8672184
628.2877265 631.4183771 633.3940049 638.3255783 652.5394354
654.6627162 660.3767300 663.3947748 668.9093382 672.4279033
674.3214105 678.9131897 680.7258341 682.1638212 686.7789501
687.7229857 693.6597149 695.2440014 700.2067835 703.9687622
709.2222133 711.6921498 720.3831934 723.7687414 725.6572571
727.0102783 729.8878634 733.1895566 734.1863330 742.2133978
745.6641512
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4438
Rtb_to_modes> Number of blocs = 185
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9864E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9943E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1282
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2823
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3001
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7411
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8871
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.077
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.734
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.379
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.508
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.221
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.792
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.316
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.718
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.183
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.339
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.501
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.728
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.635
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.379
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.740
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.200
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.214
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.471
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.757
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.15
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1110 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002
1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
0.99998 1.00001 0.99997 0.99997 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999
1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00003
1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000
1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
1.00004 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003
0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001
1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 79884 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002
1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
0.99998 1.00001 0.99997 0.99997 1.00001
1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999
1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 1.00003
1.00002 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000
1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
1.00004 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998
0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00003
0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001
1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999
0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002
1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22042218234111840.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22042218234111840.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22042218234111840.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22042218234111840.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 555
First residue number = 11
Last residue number = 565
Number of atoms found = 4438
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9864E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9943E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1282
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2823
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3001
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7411
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8871
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.077
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.734
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.379
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.508
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.221
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.792
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.316
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.718
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.183
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.339
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.501
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.728
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.635
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.379
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.740
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.200
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.214
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.471
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.757
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.15
Bfactors> 106 vectors, 13314 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.128200
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.719 for 555 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.082 +/- 0.07
Bfactors> = 34.215 +/- 8.86
Bfactors> Shiftng-fct= 34.133
Bfactors> Scaling-fct= 119.206
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22042218234111840.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22042218234111840.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 102.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.6
Chkmod> 106 vectors, 13314 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4438 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7238
0.0034 0.7246
0.0034 0.9277
0.0034 0.9548
0.0034 0.9419
0.0034 0.9093
38.8795 0.5974
57.6942 0.4957
59.4853 0.4363
93.4792 0.7053
102.2735 0.5775
112.6898 0.5568
142.9885 0.1265
167.4842 0.2600
171.9651 0.5022
194.8821 0.5983
211.4515 0.2500
225.5887 0.1339
235.8607 0.4638
247.2107 0.2514
250.9034 0.3508
254.6815 0.1312
259.8832 0.3103
279.7030 0.2321
294.9683 0.4737
302.0975 0.4220
310.9450 0.4370
329.6103 0.2247
334.1755 0.0735
339.1836 0.2151
345.0939 0.1117
354.8643 0.0425
354.8643 0.4634
363.0760 0.1981
369.8330 0.5168
386.2086 0.4550
394.5151 0.3217
403.6739 0.2897
412.3436 0.2970
412.9151 0.1009
416.7523 0.2860
424.8780 0.4236
429.9814 0.3611
437.8616 0.0971
441.0813 0.4270
447.8461 0.2561
466.9228 0.4821
469.9434 0.3835
479.5059 0.4017
487.6740 0.5097
499.1446 0.4381
504.5485 0.2845
507.9258 0.3029
510.3575 0.4229
516.5578 0.1611
520.7635 0.0737
524.0363 0.1816
525.4968 0.2363
531.4096 0.3113
539.1196 0.3153
544.3433 0.1353
551.0173 0.5174
561.7197 0.3326
567.5668 0.4572
573.1485 0.3736
576.5330 0.2366
580.8120 0.3038
586.5692 0.4550
591.4737 0.3567
596.3378 0.4008
599.8862 0.4440
600.3774 0.5432
606.5323 0.3972
610.7942 0.4783
622.8373 0.2689
628.3033 0.3076
631.3922 0.3754
633.3500 0.1732
638.2645 0.2330
652.5148 0.2826
654.5896 0.5551
660.3286 0.2345
663.3572 0.4233
668.8447 0.4649
672.3613 0.3818
674.2876 0.5151
678.9057 0.3464
680.7269 0.5348
682.1112 0.5012
686.7626 0.4916
687.7062 0.4548
693.5962 0.4650
695.2093 0.1948
700.1948 0.3056
703.9735 0.4567
709.2299 0.1941
711.6365 0.3705
720.3645 0.5890
723.7122 0.5345
725.6647 0.4103
726.9634 0.4268
729.8771 0.5684
733.1814 0.3563
734.1457 0.5036
742.2121 0.3801
745.6199 0.5056
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22042218234111840 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
making animated gifs
11 models are in 22042218234111840.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22042218234111840.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22042218234111840.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 22042218234111840 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
making animated gifs
11 models are in 22042218234111840.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22042218234111840.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22042218234111840.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 22042218234111840 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
making animated gifs
11 models are in 22042218234111840.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22042218234111840.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22042218234111840.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 22042218234111840 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
making animated gifs
11 models are in 22042218234111840.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22042218234111840.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22042218234111840.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22042218234111840 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22042218234111840.eigenfacs
22042218234111840.atom
making animated gifs
11 models are in 22042218234111840.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22042218234111840.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22042218234111840.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
22042218234111840.10.pdb
22042218234111840.11.pdb
22042218234111840.7.pdb
22042218234111840.8.pdb
22042218234111840.9.pdb
STDERR:
real 0m19.705s
user 0m19.652s
sys 0m0.044s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|