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LOGs for ID: 22042213264754725

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22042213264754725.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22042213264754725.atom to be opened. Openam> File opened: 22042213264754725.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 792 First residue number = 43 Last residue number = 7 Number of atoms found = 6228 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 30.525752 +/- 19.055454 From: -12.425000 To: 69.701000 = 18.021389 +/- 19.088834 From: -26.355000 To: 62.456000 = 23.770949 +/- 20.958670 From: -19.045000 To: 72.228000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3917 % Filled. Pdbmat> 2429280 non-zero elements. Pdbmat> 265813 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.36 +/- 22.98 Maximum number = 128 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 5.316260E+06 Pdbmat> Larger element = 473.049 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 792 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22042213264754725.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22042213264754725.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22042213264754725.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6228 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 792 residues. Blocpdb> 32 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 18 atoms in block 2 Block first atom: 33 Blocpdb> 32 atoms in block 3 Block first atom: 51 Blocpdb> 31 atoms in block 4 Block first atom: 83 Blocpdb> 28 atoms in block 5 Block first atom: 114 Blocpdb> 35 atoms in block 6 Block first atom: 142 Blocpdb> 31 atoms in block 7 Block first atom: 177 Blocpdb> 24 atoms in block 8 Block first atom: 208 Blocpdb> 32 atoms in block 9 Block first atom: 232 Blocpdb> 31 atoms in block 10 Block first atom: 264 Blocpdb> 23 atoms in block 11 Block first atom: 295 Blocpdb> 31 atoms in block 12 Block first atom: 318 Blocpdb> 21 atoms in block 13 Block first atom: 349 Blocpdb> 36 atoms in block 14 Block first atom: 370 Blocpdb> 45 atoms in block 15 Block first atom: 406 Blocpdb> 37 atoms in block 16 Block first atom: 451 Blocpdb> 31 atoms in block 17 Block first atom: 488 Blocpdb> 38 atoms in block 18 Block first atom: 519 Blocpdb> 32 atoms in block 19 Block first atom: 557 Blocpdb> 33 atoms in block 20 Block first atom: 589 Blocpdb> 36 atoms in block 21 Block first atom: 622 Blocpdb> 30 atoms in block 22 Block first atom: 658 Blocpdb> 27 atoms in block 23 Block first atom: 688 Blocpdb> 28 atoms in block 24 Block first atom: 715 Blocpdb> 29 atoms in block 25 Block first atom: 743 Blocpdb> 32 atoms in block 26 Block first atom: 772 Blocpdb> 26 atoms in block 27 Block first atom: 804 Blocpdb> 29 atoms in block 28 Block first atom: 830 Blocpdb> 34 atoms in block 29 Block first atom: 859 Blocpdb> 31 atoms in block 30 Block first atom: 893 Blocpdb> 37 atoms in block 31 Block first atom: 924 Blocpdb> 24 atoms in block 32 Block first atom: 961 Blocpdb> 30 atoms in block 33 Block first atom: 985 Blocpdb> 33 atoms in block 34 Block first atom: 1015 Blocpdb> 29 atoms in block 35 Block first atom: 1048 Blocpdb> 35 atoms in block 36 Block first atom: 1077 Blocpdb> 33 atoms in block 37 Block first atom: 1112 Blocpdb> 32 atoms in block 38 Block first atom: 1145 Blocpdb> 32 atoms in block 39 Block first atom: 1177 Blocpdb> 33 atoms in block 40 Block first atom: 1209 Blocpdb> 27 atoms in block 41 Block first atom: 1242 Blocpdb> 27 atoms in block 42 Block first atom: 1269 Blocpdb> 31 atoms in block 43 Block first atom: 1296 Blocpdb> 29 atoms in block 44 Block first atom: 1327 Blocpdb> 21 atoms in block 45 Block first atom: 1356 Blocpdb> 30 atoms in block 46 Block first atom: 1377 Blocpdb> 24 atoms in block 47 Block first atom: 1407 Blocpdb> 36 atoms in block 48 Block first atom: 1431 Blocpdb> 25 atoms in block 49 Block first atom: 1467 Blocpdb> 40 atoms in block 50 Block first atom: 1492 Blocpdb> 39 atoms in block 51 Block first atom: 1532 Blocpdb> 47 atoms in block 52 Block first atom: 1571 Blocpdb> 30 atoms in block 53 Block first atom: 1618 Blocpdb> 35 atoms in block 54 Block first atom: 1648 Blocpdb> 29 atoms in block 55 Block first atom: 1683 Blocpdb> 33 atoms in block 56 Block first atom: 1712 Blocpdb> 36 atoms in block 57 Block first atom: 1745 Blocpdb> 37 atoms in block 58 Block first atom: 1781 Blocpdb> 29 atoms in block 59 Block first atom: 1818 Blocpdb> 24 atoms in block 60 Block first atom: 1847 Blocpdb> 35 atoms in block 61 Block first atom: 1871 Blocpdb> 32 atoms in block 62 Block first atom: 1906 Blocpdb> 30 atoms in block 63 Block first atom: 1938 Blocpdb> 30 atoms in block 64 Block first atom: 1968 Blocpdb> 25 atoms in block 65 Block first atom: 1998 Blocpdb> 31 atoms in block 66 Block first atom: 2023 Blocpdb> 30 atoms in block 67 Block first atom: 2054 Blocpdb> 37 atoms in block 68 Block first atom: 2084 Blocpdb> 33 atoms in block 69 Block first atom: 2121 Blocpdb> 34 atoms in block 70 Block first atom: 2154 Blocpdb> 25 atoms in block 71 Block first atom: 2188 Blocpdb> 41 atoms in block 72 Block first atom: 2213 Blocpdb> 28 atoms in block 73 Block first atom: 2254 Blocpdb> 36 atoms in block 74 Block first atom: 2282 Blocpdb> 27 atoms in block 75 Block first atom: 2318 Blocpdb> 34 atoms in block 76 Block first atom: 2345 Blocpdb> 34 atoms in block 77 Block first atom: 2379 Blocpdb> 33 atoms in block 78 Block first atom: 2413 Blocpdb> 38 atoms in block 79 Block first atom: 2446 Blocpdb> 31 atoms in block 80 Block first atom: 2484 Blocpdb> 27 atoms in block 81 Block first atom: 2515 Blocpdb> 34 atoms in block 82 Block first atom: 2542 Blocpdb> 33 atoms in block 83 Block first atom: 2576 Blocpdb> 27 atoms in block 84 Block first atom: 2609 Blocpdb> 25 atoms in block 85 Block first atom: 2636 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 2661 Blocpdb> 29 atoms in block 87 Block first atom: 2685 Blocpdb> 37 atoms in block 88 Block first atom: 2714 Blocpdb> 35 atoms in block 89 Block first atom: 2751 Blocpdb> 39 atoms in block 90 Block first atom: 2786 Blocpdb> 27 atoms in block 91 Block first atom: 2825 Blocpdb> 27 atoms in block 92 Block first atom: 2852 Blocpdb> 34 atoms in block 93 Block first atom: 2879 Blocpdb> 34 atoms in block 94 Block first atom: 2913 Blocpdb> 25 atoms in block 95 Block first atom: 2947 Blocpdb> 32 atoms in block 96 Block first atom: 2972 Blocpdb> 33 atoms in block 97 Block first atom: 3004 Blocpdb> 30 atoms in block 98 Block first atom: 3037 Blocpdb> 9 atoms in block 99 Block first atom: 3067 Blocpdb> 28 atoms in block 100 Block first atom: 3076 Blocpdb> 32 atoms in block 101 Block first atom: 3104 Blocpdb> 31 atoms in block 102 Block first atom: 3136 Blocpdb> 28 atoms in block 103 Block first atom: 3167 Blocpdb> 35 atoms in block 104 Block first atom: 3195 Blocpdb> 31 atoms in block 105 Block first atom: 3230 Blocpdb> 24 atoms in block 106 Block first atom: 3261 Blocpdb> 32 atoms in block 107 Block first atom: 3285 Blocpdb> 31 atoms in block 108 Block first atom: 3317 Blocpdb> 23 atoms in block 109 Block first atom: 3348 Blocpdb> 31 atoms in block 110 Block first atom: 3371 Blocpdb> 21 atoms in block 111 Block first atom: 3402 Blocpdb> 36 atoms in block 112 Block first atom: 3423 Blocpdb> 45 atoms in block 113 Block first atom: 3459 Blocpdb> 37 atoms in block 114 Block first atom: 3504 Blocpdb> 31 atoms in block 115 Block first atom: 3541 Blocpdb> 38 atoms in block 116 Block first atom: 3572 Blocpdb> 32 atoms in block 117 Block first atom: 3610 Blocpdb> 33 atoms in block 118 Block first atom: 3642 Blocpdb> 36 atoms in block 119 Block first atom: 3675 Blocpdb> 30 atoms in block 120 Block first atom: 3711 Blocpdb> 27 atoms in block 121 Block first atom: 3741 Blocpdb> 28 atoms in block 122 Block first atom: 3768 Blocpdb> 29 atoms in block 123 Block first atom: 3796 Blocpdb> 32 atoms in block 124 Block first atom: 3825 Blocpdb> 26 atoms in block 125 Block first atom: 3857 Blocpdb> 29 atoms in block 126 Block first atom: 3883 Blocpdb> 34 atoms in block 127 Block first atom: 3912 Blocpdb> 31 atoms in block 128 Block first atom: 3946 Blocpdb> 37 atoms in block 129 Block first atom: 3977 Blocpdb> 24 atoms in block 130 Block first atom: 4014 Blocpdb> 30 atoms in block 131 Block first atom: 4038 Blocpdb> 33 atoms in block 132 Block first atom: 4068 Blocpdb> 29 atoms in block 133 Block first atom: 4101 Blocpdb> 35 atoms in block 134 Block first atom: 4130 Blocpdb> 33 atoms in block 135 Block first atom: 4165 Blocpdb> 32 atoms in block 136 Block first atom: 4198 Blocpdb> 32 atoms in block 137 Block first atom: 4230 Blocpdb> 33 atoms in block 138 Block first atom: 4262 Blocpdb> 27 atoms in block 139 Block first atom: 4295 Blocpdb> 27 atoms in block 140 Block first atom: 4322 Blocpdb> 31 atoms in block 141 Block first atom: 4349 Blocpdb> 29 atoms in block 142 Block first atom: 4380 Blocpdb> 21 atoms in block 143 Block first atom: 4409 Blocpdb> 30 atoms in block 144 Block first atom: 4430 Blocpdb> 24 atoms in block 145 Block first atom: 4460 Blocpdb> 36 atoms in block 146 Block first atom: 4484 Blocpdb> 25 atoms in block 147 Block first atom: 4520 Blocpdb> 40 atoms in block 148 Block first atom: 4545 Blocpdb> 39 atoms in block 149 Block first atom: 4585 Blocpdb> 47 atoms in block 150 Block first atom: 4624 Blocpdb> 30 atoms in block 151 Block first atom: 4671 Blocpdb> 35 atoms in block 152 Block first atom: 4701 Blocpdb> 29 atoms in block 153 Block first atom: 4736 Blocpdb> 33 atoms in block 154 Block first atom: 4765 Blocpdb> 36 atoms in block 155 Block first atom: 4798 Blocpdb> 37 atoms in block 156 Block first atom: 4834 Blocpdb> 29 atoms in block 157 Block first atom: 4871 Blocpdb> 24 atoms in block 158 Block first atom: 4900 Blocpdb> 35 atoms in block 159 Block first atom: 4924 Blocpdb> 32 atoms in block 160 Block first atom: 4959 Blocpdb> 30 atoms in block 161 Block first atom: 4991 Blocpdb> 30 atoms in block 162 Block first atom: 5021 Blocpdb> 25 atoms in block 163 Block first atom: 5051 Blocpdb> 31 atoms in block 164 Block first atom: 5076 Blocpdb> 30 atoms in block 165 Block first atom: 5107 Blocpdb> 37 atoms in block 166 Block first atom: 5137 Blocpdb> 33 atoms in block 167 Block first atom: 5174 Blocpdb> 34 atoms in block 168 Block first atom: 5207 Blocpdb> 25 atoms in block 169 Block first atom: 5241 Blocpdb> 41 atoms in block 170 Block first atom: 5266 Blocpdb> 28 atoms in block 171 Block first atom: 5307 Blocpdb> 36 atoms in block 172 Block first atom: 5335 Blocpdb> 27 atoms in block 173 Block first atom: 5371 Blocpdb> 34 atoms in block 174 Block first atom: 5398 Blocpdb> 34 atoms in block 175 Block first atom: 5432 Blocpdb> 33 atoms in block 176 Block first atom: 5466 Blocpdb> 38 atoms in block 177 Block first atom: 5499 Blocpdb> 31 atoms in block 178 Block first atom: 5537 Blocpdb> 27 atoms in block 179 Block first atom: 5568 Blocpdb> 34 atoms in block 180 Block first atom: 5595 Blocpdb> 33 atoms in block 181 Block first atom: 5629 Blocpdb> 27 atoms in block 182 Block first atom: 5662 Blocpdb> 25 atoms in block 183 Block first atom: 5689 Blocpdb> 24 atoms in block 184 Block first atom: 5714 Blocpdb> 29 atoms in block 185 Block first atom: 5738 Blocpdb> 37 atoms in block 186 Block first atom: 5767 Blocpdb> 35 atoms in block 187 Block first atom: 5804 Blocpdb> 39 atoms in block 188 Block first atom: 5839 Blocpdb> 27 atoms in block 189 Block first atom: 5878 Blocpdb> 27 atoms in block 190 Block first atom: 5905 Blocpdb> 34 atoms in block 191 Block first atom: 5932 Blocpdb> 34 atoms in block 192 Block first atom: 5966 Blocpdb> 25 atoms in block 193 Block first atom: 6000 Blocpdb> 32 atoms in block 194 Block first atom: 6025 Blocpdb> 33 atoms in block 195 Block first atom: 6057 Blocpdb> 30 atoms in block 196 Block first atom: 6090 Blocpdb> 9 atoms in block 197 Block first atom: 6120 Blocpdb> 24 atoms in block 198 Block first atom: 6129 Blocpdb> 26 atoms in block 199 Block first atom: 6153 Blocpdb> 24 atoms in block 200 Block first atom: 6179 Blocpdb> 26 atoms in block 201 Block first atom: 6202 Blocpdb> 201 blocks. Blocpdb> At most, 47 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2429481 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 18684 Prepmat> Matrix trace = 5316260.0000 Prepmat> Last element read: 18684 18684 243.7237 Prepmat> 20302 lines saved. Prepmat> 18295 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6228 RTB> Total mass = 6228.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6228 RTB> Number of blocks = 201 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 259645.1488 RTB> 69201 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1206 Diagstd> Nb of non-zero elements: 69201 Diagstd> Projected matrix trace = 259645.1488 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1206 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 259645.1488 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0464740 0.0568435 0.0878868 0.9092857 1.0994320 1.2920227 3.9506266 4.3344743 4.8312632 5.6773254 6.2403863 6.4441582 8.7067076 8.7928153 9.6612850 10.2158158 12.4450555 12.9843620 13.8199398 14.7371113 14.9605253 15.4837060 15.7061536 16.1472337 16.9696008 17.5655160 18.2979321 18.5061075 19.4265484 19.5694559 20.8075568 20.8334302 21.4649990 21.6794556 22.5351278 23.0215530 23.3496868 23.9292029 24.7478607 24.8837196 25.5312443 26.2346558 26.3030911 27.5118170 27.6138481 27.9992441 28.3153001 29.0942744 29.4551398 29.7960304 30.0326161 30.7132226 30.7228270 31.2456495 31.8435691 32.4668990 32.7345587 33.2656410 33.7024105 34.5622945 34.8712201 35.0237190 35.4727219 35.7558928 36.2241049 36.3944695 36.6955945 37.1578276 37.5838050 38.6062005 39.0107005 39.4853012 39.7268947 39.9852708 40.4827946 40.5636139 41.3291807 41.9965698 42.5667286 43.0316655 43.8486332 44.2696944 44.5739277 44.6517998 45.2306868 45.3133882 46.0650107 46.3575815 46.6926485 46.8815135 47.3569198 47.6497459 48.3289312 48.4573760 49.0781415 49.5144405 49.6095342 49.8588648 50.0796416 50.3216001 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034315 0.0034324 0.0034325 0.0034328 0.0034334 0.0034342 23.4099489 25.8902254 32.1926843 103.5488904 113.8621749 123.4327349 215.8381803 226.0807035 238.6852767 258.7421441 271.2695323 275.6629362 320.4219510 322.0025081 337.5302709 347.0817729 383.0837226 391.2961623 403.6903390 416.8707869 420.0187725 427.2998482 430.3583177 436.3594092 447.3331609 455.1198068 464.5113034 467.1462007 478.6224901 480.3797107 495.3427654 495.6506402 503.1074130 505.6144371 515.4959923 521.0298312 524.7298984 531.2016270 540.2118563 541.6926335 548.6953391 556.2025368 556.9275155 569.5802444 570.6354473 574.6037207 577.8376884 585.7321272 589.3534419 592.7539885 595.1026202 601.8080244 601.9021130 607.0019113 612.7822109 618.7506742 621.2959539 626.3155994 630.4138738 638.4054174 641.2521759 642.6528093 646.7590842 649.3354200 653.5730134 655.1081112 657.8126853 661.9427624 665.7262068 674.7203532 678.2458646 682.3591313 684.4434784 686.6656163 690.9243883 691.6137205 698.1097096 703.7237203 708.4846048 712.3433228 719.0735440 722.5177859 724.9962033 725.6292234 730.3177760 730.9851403 737.0227075 739.3595136 742.0267034 743.5258840 747.2862713 749.5930910 754.9164268 755.9189401 760.7453988 764.1193868 764.8527892 766.7724023 768.4681749 770.3223548 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6228 Rtb_to_modes> Number of blocs = 201 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9858E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9907E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9913E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6474E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.6844E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.7887E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9093 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.099 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.292 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.951 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.334 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.831 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.677 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.240 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.444 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.707 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.793 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.661 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.32 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1206 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99996 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00004 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 112104 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99996 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00004 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00004 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22042213264754725.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22042213264754725.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22042213264754725.atom Openam> file on opening on unit 11: 22042213264754725.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 792 First residue number = 43 Last residue number = 7 Number of atoms found = 6228 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9858E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9907E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9913E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6474E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.6844E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.7887E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9093 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.099 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.292 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.951 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.334 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.831 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.677 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.240 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.444 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.707 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.793 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.661 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.32 Bfactors> 106 vectors, 18684 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.046474 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.466 for 792 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.139 +/- 0.08 Bfactors> = 26.999 +/- 8.14 Bfactors> Shiftng-fct= 26.860 Bfactors> Scaling-fct= 101.999 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22042213264754725.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22042213264754725.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.6 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Chkmod> That is: 6228 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9514 0.0034 0.9472 0.0034 0.7161 0.0034 0.8757 0.0034 0.7804 0.0034 0.7610 23.4089 0.7207 25.8892 0.7339 32.1913 0.7368 103.5453 0.6990 113.8349 0.7164 123.4264 0.7313 215.8391 0.3049 226.0586 0.1980 238.6685 0.2730 258.7236 0.4210 271.2495 0.5190 275.6477 0.3911 320.4136 0.3446 321.9921 0.3468 337.5108 0.2737 347.1379 0.1921 383.1434 0.2593 391.2136 0.3195 403.6739 0.3304 416.8937 0.5055 419.9934 0.4896 427.2304 0.3907 430.3925 0.2953 436.3781 0.4114 447.3192 0.2758 455.1584 0.3691 464.5176 0.2479 467.1753 0.4835 478.6445 0.4436 480.3658 0.2752 495.3506 0.2957 495.5886 0.1898 503.0272 0.6272 505.5991 0.5710 515.5296 0.2918 520.9899 0.3626 524.7109 0.3326 531.1877 0.4172 540.2120 0.2405 541.6289 0.1834 548.6584 0.3894 556.1293 0.4176 556.8709 0.4502 569.5370 0.4373 570.5712 0.3249 574.5868 0.3677 577.8608 0.3205 585.6640 0.4432 589.3768 0.3001 592.7680 0.5505 595.0512 0.5434 601.7506 0.4544 601.8486 0.4279 607.0181 0.3581 612.7216 0.5062 618.7537 0.2854 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22042213264754725.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22042213264754725.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22042213264754725 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom making animated gifs 11 models are in 22042213264754725.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22042213264754725.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22042213264754725.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22042213264754725 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22042213264754725.eigenfacs 22042213264754725.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22042213264754725.eigenfacs 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