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***  HEBERTH  ***

LOGs for ID: 22040801552493864

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22040801552493864.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22040801552493864.atom to be opened. Openam> File opened: 22040801552493864.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 163 First residue number = 113 Last residue number = 306 Number of atoms found = 2468 Mean number per residue = 15.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 19.809319 +/- 9.258698 From: -0.951000 To: 40.347000 = -8.807297 +/- 7.084427 From: -26.488000 To: 6.031000 = 15.143848 +/- 8.856062 From: -6.983000 To: 37.345000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'N73 ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'ZN ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'ZN ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 6 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 6.4155 % Filled. Pdbmat> 1758700 non-zero elements. Pdbmat> 193793 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 157.04 +/- 50.67 Maximum number = 245 Minimum number = 29 Pdbmat> Matrix trace = 3.875860E+06 Pdbmat> Larger element = 891.900 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 163 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22040801552493864.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22040801552493864.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22040801552493864.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2468 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 163 residues. Blocpdb> 13 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 19 atoms in block 2 Block first atom: 14 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 33 Blocpdb> 24 atoms in block 4 Block first atom: 55 Blocpdb> 17 atoms in block 5 Block first atom: 79 Blocpdb> 17 atoms in block 6 Block first atom: 96 Blocpdb> 17 atoms in block 7 Block first atom: 113 Blocpdb> 14 atoms in block 8 Block first atom: 130 Blocpdb> 19 atoms in block 9 Block first atom: 144 Blocpdb> 14 atoms in block 10 Block first atom: 163 Blocpdb> 21 atoms in block 11 Block first atom: 177 Blocpdb> 24 atoms in block 12 Block first atom: 198 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 222 Blocpdb> 17 atoms in block 14 Block first atom: 241 Blocpdb> 14 atoms in block 15 Block first atom: 258 Blocpdb> 21 atoms in block 16 Block first atom: 272 Blocpdb> 11 atoms in block 17 Block first atom: 293 Blocpdb> 15 atoms in block 18 Block first atom: 304 Blocpdb> 12 atoms in block 19 Block first atom: 319 Blocpdb> 19 atoms in block 20 Block first atom: 331 Blocpdb> 14 atoms in block 21 Block first atom: 350 Blocpdb> 24 atoms in block 22 Block first atom: 364 Blocpdb> 10 atoms in block 23 Block first atom: 388 Blocpdb> 16 atoms in block 24 Block first atom: 398 Blocpdb> 19 atoms in block 25 Block first atom: 414 Blocpdb> 12 atoms in block 26 Block first atom: 433 Blocpdb> 12 atoms in block 27 Block first atom: 445 Blocpdb> 10 atoms in block 28 Block first atom: 457 Blocpdb> 20 atoms in block 29 Block first atom: 467 Blocpdb> 10 atoms in block 30 Block first atom: 487 Blocpdb> 24 atoms in block 31 Block first atom: 497 Blocpdb> 10 atoms in block 32 Block first atom: 521 Blocpdb> 20 atoms in block 33 Block first atom: 531 Blocpdb> 10 atoms in block 34 Block first atom: 551 Blocpdb> 19 atoms in block 35 Block first atom: 561 Blocpdb> 24 atoms in block 36 Block first atom: 580 Blocpdb> 11 atoms in block 37 Block first atom: 604 Blocpdb> 10 atoms in block 38 Block first atom: 615 Blocpdb> 16 atoms in block 39 Block first atom: 625 Blocpdb> 14 atoms in block 40 Block first atom: 641 Blocpdb> 14 atoms in block 41 Block first atom: 655 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 669 Blocpdb> 14 atoms in block 43 Block first atom: 688 Blocpdb> 20 atoms in block 44 Block first atom: 702 Blocpdb> 14 atoms in block 45 Block first atom: 722 Blocpdb> 24 atoms in block 46 Block first atom: 736 Blocpdb> 16 atoms in block 47 Block first atom: 760 Blocpdb> 21 atoms in block 48 Block first atom: 776 Blocpdb> 11 atoms in block 49 Block first atom: 797 Blocpdb> 24 atoms in block 50 Block first atom: 808 Blocpdb> 12 atoms in block 51 Block first atom: 832 Blocpdb> 10 atoms in block 52 Block first atom: 844 Blocpdb> 12 atoms in block 53 Block first atom: 854 Blocpdb> 19 atoms in block 54 Block first atom: 866 Blocpdb> 16 atoms in block 55 Block first atom: 885 Blocpdb> 19 atoms in block 56 Block first atom: 901 Blocpdb> 17 atoms in block 57 Block first atom: 920 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 937 Blocpdb> 7 atoms in block 59 Block first atom: 957 Blocpdb> 16 atoms in block 60 Block first atom: 964 Blocpdb> 10 atoms in block 61 Block first atom: 980 Blocpdb> 15 atoms in block 62 Block first atom: 990 Blocpdb> 17 atoms in block 63 Block first atom: 1005 Blocpdb> 7 atoms in block 64 Block first atom: 1022 Blocpdb> 12 atoms in block 65 Block first atom: 1029 Blocpdb> 7 atoms in block 66 Block first atom: 1041 Blocpdb> 21 atoms in block 67 Block first atom: 1048 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1069 Blocpdb> 20 atoms in block 69 Block first atom: 1083 Blocpdb> 12 atoms in block 70 Block first atom: 1103 Blocpdb> 7 atoms in block 71 Block first atom: 1115 Blocpdb> 22 atoms in block 72 Block first atom: 1122 Blocpdb> 12 atoms in block 73 Block first atom: 1144 Blocpdb> 7 atoms in block 74 Block first atom: 1156 Blocpdb> 19 atoms in block 75 Block first atom: 1163 Blocpdb> 19 atoms in block 76 Block first atom: 1182 Blocpdb> 10 atoms in block 77 Block first atom: 1201 Blocpdb> 17 atoms in block 78 Block first atom: 1211 Blocpdb> 10 atoms in block 79 Block first atom: 1228 Blocpdb> 20 atoms in block 80 Block first atom: 1238 Blocpdb> 14 atoms in block 81 Block first atom: 1258 Blocpdb> 14 atoms in block 82 Block first atom: 1272 Blocpdb> 7 atoms in block 83 Block first atom: 1286 Blocpdb> 14 atoms in block 84 Block first atom: 1293 Blocpdb> 7 atoms in block 85 Block first atom: 1307 Blocpdb> 19 atoms in block 86 Block first atom: 1314 Blocpdb> 17 atoms in block 87 Block first atom: 1333 Blocpdb> 7 atoms in block 88 Block first atom: 1350 Blocpdb> 12 atoms in block 89 Block first atom: 1357 Blocpdb> 10 atoms in block 90 Block first atom: 1369 Blocpdb> 17 atoms in block 91 Block first atom: 1379 Blocpdb> 20 atoms in block 92 Block first atom: 1396 Blocpdb> 12 atoms in block 93 Block first atom: 1416 Blocpdb> 12 atoms in block 94 Block first atom: 1428 Blocpdb> 12 atoms in block 95 Block first atom: 1440 Blocpdb> 15 atoms in block 96 Block first atom: 1452 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 1467 Blocpdb> 24 atoms in block 98 Block first atom: 1486 Blocpdb> 11 atoms in block 99 Block first atom: 1510 Blocpdb> 19 atoms in block 100 Block first atom: 1521 Blocpdb> 7 atoms in block 101 Block first atom: 1540 Blocpdb> 22 atoms in block 102 Block first atom: 1547 Blocpdb> 7 atoms in block 103 Block first atom: 1569 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1576 Blocpdb> 7 atoms in block 105 Block first atom: 1592 Blocpdb> 21 atoms in block 106 Block first atom: 1599 Blocpdb> 11 atoms in block 107 Block first atom: 1620 Blocpdb> 19 atoms in block 108 Block first atom: 1631 Blocpdb> 20 atoms in block 109 Block first atom: 1650 Blocpdb> 19 atoms in block 110 Block first atom: 1670 Blocpdb> 16 atoms in block 111 Block first atom: 1689 Blocpdb> 10 atoms in block 112 Block first atom: 1705 Blocpdb> 10 atoms in block 113 Block first atom: 1715 Blocpdb> 17 atoms in block 114 Block first atom: 1725 Blocpdb> 15 atoms in block 115 Block first atom: 1742 Blocpdb> 20 atoms in block 116 Block first atom: 1757 Blocpdb> 7 atoms in block 117 Block first atom: 1777 Blocpdb> 17 atoms in block 118 Block first atom: 1784 Blocpdb> 10 atoms in block 119 Block first atom: 1801 Blocpdb> 19 atoms in block 120 Block first atom: 1811 Blocpdb> 7 atoms in block 121 Block first atom: 1830 Blocpdb> 19 atoms in block 122 Block first atom: 1837 Blocpdb> 12 atoms in block 123 Block first atom: 1856 Blocpdb> 17 atoms in block 124 Block first atom: 1868 Blocpdb> 11 atoms in block 125 Block first atom: 1885 Blocpdb> 11 atoms in block 126 Block first atom: 1896 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 1907 Blocpdb> 14 atoms in block 128 Block first atom: 1923 Blocpdb> 15 atoms in block 129 Block first atom: 1937 Blocpdb> 10 atoms in block 130 Block first atom: 1952 Blocpdb> 19 atoms in block 131 Block first atom: 1962 Blocpdb> 17 atoms in block 132 Block first atom: 1981 Blocpdb> 21 atoms in block 133 Block first atom: 1998 Blocpdb> 14 atoms in block 134 Block first atom: 2019 Blocpdb> 17 atoms in block 135 Block first atom: 2033 Blocpdb> 21 atoms in block 136 Block first atom: 2050 Blocpdb> 24 atoms in block 137 Block first atom: 2071 Blocpdb> 20 atoms in block 138 Block first atom: 2095 Blocpdb> 14 atoms in block 139 Block first atom: 2115 Blocpdb> 15 atoms in block 140 Block first atom: 2129 Blocpdb> 7 atoms in block 141 Block first atom: 2144 Blocpdb> 14 atoms in block 142 Block first atom: 2151 Blocpdb> 14 atoms in block 143 Block first atom: 2165 Blocpdb> 19 atoms in block 144 Block first atom: 2179 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 2198 Blocpdb> 22 atoms in block 146 Block first atom: 2215 Blocpdb> 12 atoms in block 147 Block first atom: 2237 Blocpdb> 12 atoms in block 148 Block first atom: 2249 Blocpdb> 16 atoms in block 149 Block first atom: 2261 Blocpdb> 14 atoms in block 150 Block first atom: 2277 Blocpdb> 7 atoms in block 151 Block first atom: 2291 Blocpdb> 19 atoms in block 152 Block first atom: 2298 Blocpdb> 24 atoms in block 153 Block first atom: 2317 Blocpdb> 17 atoms in block 154 Block first atom: 2341 Blocpdb> 19 atoms in block 155 Block first atom: 2358 Blocpdb> 21 atoms in block 156 Block first atom: 2377 Blocpdb> 9 atoms in block 157 Block first atom: 2398 Blocpdb> 57 atoms in block 158 Block first atom: 2407 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 159 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 2464th, in residue A 302 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 159 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 2465th, in residue A 303 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 3 atoms in block 159 Block first atom: 2464 %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 160 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 2468th, in residue A 306 %Blocpdb-Wn> It is merged with last block. Blocpdb> 159 blocks. Blocpdb> At most, 57 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1758859 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 7404 Prepmat> Matrix trace = 3875860.0000 Prepmat> Last element read: 7404 7404 423.2696 Prepmat> 12721 lines saved. Prepmat> 10241 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2468 RTB> Total mass = 2468.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2468 RTB> Number of blocks = 159 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 454762.0874 RTB> 86848 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 954 Diagstd> Nb of non-zero elements: 86848 Diagstd> Projected matrix trace = 454762.0874 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 954 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 454762.0874 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 15.9889247 16.5240529 22.8581361 27.3062283 28.3826702 29.0628062 31.6774471 33.0345726 34.7317978 37.6442297 41.9701212 44.5553254 45.3576770 46.5769513 50.9750854 52.9421840 53.6485975 54.4011174 56.4679543 59.3616526 61.7499207 63.3641546 63.8942034 67.1104159 69.4678905 71.3656495 73.2119656 73.6261441 76.1061881 77.9070899 78.6812248 82.9500132 85.3543459 89.5851122 91.8840530 93.1326180 93.6540330 96.0822659 99.6377486 100.1503376 102.5581474 104.6509798 106.3597260 107.6828162 108.6316442 111.9240601 113.3523955 115.7023339 118.9897243 119.7153178 122.6581362 124.1182059 126.1920095 127.4902489 128.2492490 129.9248126 130.7870769 132.6970029 133.2226992 134.3345147 136.6749125 137.9253737 137.9761863 140.6729697 142.6971771 143.1647718 144.5835883 145.1803422 146.9473954 148.8251719 150.4246504 152.1036320 153.6119670 154.2209020 157.0743583 157.9800737 159.7941218 162.8425741 163.2047974 164.1121304 164.4290209 166.7808040 168.5864620 168.8461101 170.1005639 172.5577037 173.7739171 175.4848707 176.6665257 177.8339582 178.5863664 179.9559070 181.1235000 182.1835639 183.8264946 185.2526617 186.9338155 188.6316883 190.7791406 191.4736845 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034334 0.0034341 0.0034355 0.0034358 0.0034363 0.0034367 434.2150866 441.4215879 519.1772897 567.4480906 578.5247003 585.4152795 611.1817360 624.1365653 639.9689632 666.2611460 703.5020900 724.8449043 731.3422817 741.1068195 775.3079929 790.1257343 795.3796344 800.9385371 816.0115533 836.6585848 853.3230609 864.4046666 868.0125615 889.5907233 905.0807662 917.3601946 929.1510322 931.7755463 947.3386700 958.4815810 963.2318540 989.0164384 1003.2475307 1027.8108579 1040.9152043 1047.9635708 1050.8930560 1064.4294907 1083.9449668 1086.7295819 1099.7155446 1110.8794418 1119.9119663 1126.8561589 1131.8098171 1148.8332811 1156.1405443 1168.0631956 1184.5407602 1188.1469068 1202.6616455 1209.7984532 1219.8634199 1226.1222254 1229.7666056 1237.7739256 1241.8744638 1250.9093458 1253.3847160 1258.6039362 1269.5203957 1275.3146981 1275.5495932 1287.9547589 1297.1881455 1299.3117413 1305.7342011 1308.4260682 1316.3646971 1324.7486227 1331.8483768 1339.2605384 1345.8845429 1348.5495228 1360.9680423 1364.8861798 1372.7001460 1385.7320435 1387.2723830 1391.1232911 1392.4657302 1402.3884035 1409.9594689 1411.0448246 1416.2768520 1426.4693896 1431.4875517 1438.5174029 1443.3525188 1448.1135851 1451.1738065 1456.7275496 1461.4456912 1465.7161632 1472.3102416 1478.0104634 1484.7017330 1491.4290779 1499.8945404 1502.6222921 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2468 Rtb_to_modes> Number of blocs = 159 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0016E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 140.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 146.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 150.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 152.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 153.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 154.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 157.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 158.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 159.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 162.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 163.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 164.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 164.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 166.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 168.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 168.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 170.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 172.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 173.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 175.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 176.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 177.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 178.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 180.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 181.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 182.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 183.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 185.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 186.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 188.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 190.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 191.5 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 954 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00003 1.00001 0.99996 1.00005 1.00001 0.99995 1.00002 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000 0.99996 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 1.00001 0.99997 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 44424 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00003 1.00001 0.99996 1.00005 1.00001 0.99995 1.00002 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99996 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 0.99998 1.00003 1.00001 1.00000 0.99996 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 0.99997 1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 1.00001 0.99997 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22040801552493864.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22040801552493864.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22040801552493864.atom Openam> file on opening on unit 11: 22040801552493864.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 163 First residue number = 113 Last residue number = 306 Number of atoms found = 2468 Mean number per residue = 15.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9970E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0013E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0016E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 153.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 163.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 166.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 170.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 175.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 176.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 177.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 178.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 180.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 181.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 182.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 183.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 185.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 186.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 190.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 191.5 Bfactors> 106 vectors, 7404 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 15.990000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22040801552493864.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22040801552493864.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4366E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1028. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1041. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1051. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1064. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1087. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1100. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1111. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1210. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1220. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1226. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1229. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1238. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1242. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1251. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1253. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1258. 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Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors. Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ? Getnam> 22040801552493864.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22040801552493864.eigenfacs Getnam> Pdb file with the reference structure ? Getnam> 22040801552493864.atom Openam> file on opening on unit 11: 22040801552493864.atom Getnam> Pdb file with the other conformer ? Getnam> 22040801552493864.atom2 Openam> file on opening on unit 12: 22040801552493864.atom2 Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n) Getrep> F Projmod> All masses will all be assumed to be of 1. Getrep> Displacement along one mode ? (y/n) Getrep> F Openam> file on opening on unit 13: projmod.res Openam> file on opening on unit 14: dr.res Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4360E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4366E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1439. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1443. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1448. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1451. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1457. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1461. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1466. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1472. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1478. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1485. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1491. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1500. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1503. Projmod> 106 vectors, 7404 coordinates in file. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 163 First residue number = 113 Last residue number = 306 Number of atoms found = 2468 Mean number per residue = 15.1 Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 157 First residue number = 113 Last residue number = 269 Number of atoms found = 2406 Mean number per residue = 15.3 %Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer. %Projmod-Wn> Different number of residues for the other conformer. %Projmod-Er> Not enough of them. getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22040801552493864 7 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom making animated gifs 11 models are in 22040801552493864.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22040801552493864.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22040801552493864.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 157 1.757 145 1.476 MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 157 1.405 154 1.321 MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 157 1.054 157 1.054 MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 157 0.703 157 0.703 MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 157 0.351 157 0.351 MODEL 6 MODE=7 DQ=0 157 0.000 157 0.000 MODEL 7 MODE=7 DQ=20 157 0.351 157 0.351 MODEL 8 MODE=7 DQ=40 157 0.703 157 0.703 MODEL 9 MODE=7 DQ=60 157 1.054 157 1.054 MODEL 10 MODE=7 DQ=80 157 1.405 154 1.322 MODEL 11 MODE=7 DQ=100 157 1.757 145 1.476 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22040801552493864 8 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom making animated gifs 11 models are in 22040801552493864.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22040801552493864.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22040801552493864.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 157 1.878 142 1.529 MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 157 1.502 150 1.349 MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 157 1.127 157 1.127 MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 157 0.751 157 0.751 MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 157 0.376 157 0.376 MODEL 6 MODE=8 DQ=0 157 0.000 157 0.000 MODEL 7 MODE=8 DQ=20 157 0.376 157 0.376 MODEL 8 MODE=8 DQ=40 157 0.751 157 0.751 MODEL 9 MODE=8 DQ=60 157 1.127 157 1.127 MODEL 10 MODE=8 DQ=80 157 1.502 150 1.349 MODEL 11 MODE=8 DQ=100 157 1.878 142 1.529 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22040801552493864 9 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22040801552493864.eigenfacs 22040801552493864.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22040801552493864.eigenfacs 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plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22040801552493864.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22040801552493864.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 157 1.570 146 1.007 MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 157 1.256 149 0.909 MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 157 0.942 155 0.863 MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 157 0.628 157 0.628 MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 157 0.314 157 0.314 MODEL 6 MODE=9 DQ=0 157 0.000 157 0.000 MODEL 7 MODE=9 DQ=20 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