*** SIGNALING PROTEIN 24-APR-12 4ETX ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 220403083527107527.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 220403083527107527.atom to be opened.
Openam> File opened: 220403083527107527.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 300
First residue number = 155
Last residue number = 454
Number of atoms found = 2370
Mean number per residue = 7.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -4.370601 +/- 14.430923 From: -34.311000 To: 32.362000
= 1.497582 +/- 9.103842 From: -23.875000 To: 25.406000
= 15.045764 +/- 14.418440 From: -16.066000 To: 46.336000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.2362 % Filled.
Pdbmat> 818094 non-zero elements.
Pdbmat> 89331 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 75.38 +/- 21.75
Maximum number = 122
Minimum number = 18
Pdbmat> Matrix trace = 1.786620E+06
Pdbmat> Larger element = 474.284
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
300 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 220403083527107527.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 220403083527107527.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
220403083527107527.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2370 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 300 residues.
Blocpdb> 12 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 17 atoms in block 2
Block first atom: 13
Blocpdb> 14 atoms in block 3
Block first atom: 30
Blocpdb> 17 atoms in block 4
Block first atom: 44
Blocpdb> 14 atoms in block 5
Block first atom: 61
Blocpdb> 12 atoms in block 6
Block first atom: 75
Blocpdb> 19 atoms in block 7
Block first atom: 87
Blocpdb> 17 atoms in block 8
Block first atom: 106
Blocpdb> 19 atoms in block 9
Block first atom: 123
Blocpdb> 17 atoms in block 10
Block first atom: 142
Blocpdb> 11 atoms in block 11
Block first atom: 159
Blocpdb> 17 atoms in block 12
Block first atom: 170
Blocpdb> 12 atoms in block 13
Block first atom: 187
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 199
Blocpdb> 13 atoms in block 15
Block first atom: 215
Blocpdb> 14 atoms in block 16
Block first atom: 228
Blocpdb> 14 atoms in block 17
Block first atom: 242
Blocpdb> 13 atoms in block 18
Block first atom: 256
Blocpdb> 16 atoms in block 19
Block first atom: 269
Blocpdb> 14 atoms in block 20
Block first atom: 285
Blocpdb> 16 atoms in block 21
Block first atom: 299
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 315
Blocpdb> 19 atoms in block 23
Block first atom: 329
Blocpdb> 9 atoms in block 24
Block first atom: 348
Blocpdb> 20 atoms in block 25
Block first atom: 357
Blocpdb> 18 atoms in block 26
Block first atom: 377
Blocpdb> 23 atoms in block 27
Block first atom: 395
Blocpdb> 19 atoms in block 28
Block first atom: 418
Blocpdb> 14 atoms in block 29
Block first atom: 437
Blocpdb> 16 atoms in block 30
Block first atom: 451
Blocpdb> 16 atoms in block 31
Block first atom: 467
Blocpdb> 13 atoms in block 32
Block first atom: 483
Blocpdb> 15 atoms in block 33
Block first atom: 496
Blocpdb> 13 atoms in block 34
Block first atom: 511
Blocpdb> 15 atoms in block 35
Block first atom: 524
Blocpdb> 13 atoms in block 36
Block first atom: 539
Blocpdb> 13 atoms in block 37
Block first atom: 552
Blocpdb> 16 atoms in block 38
Block first atom: 565
Blocpdb> 16 atoms in block 39
Block first atom: 581
Blocpdb> 18 atoms in block 40
Block first atom: 597
Blocpdb> 13 atoms in block 41
Block first atom: 615
Blocpdb> 17 atoms in block 42
Block first atom: 628
Blocpdb> 15 atoms in block 43
Block first atom: 645
Blocpdb> 17 atoms in block 44
Block first atom: 660
Blocpdb> 13 atoms in block 45
Block first atom: 677
Blocpdb> 18 atoms in block 46
Block first atom: 690
Blocpdb> 18 atoms in block 47
Block first atom: 708
Blocpdb> 16 atoms in block 48
Block first atom: 726
Blocpdb> 20 atoms in block 49
Block first atom: 742
Blocpdb> 13 atoms in block 50
Block first atom: 762
Blocpdb> 20 atoms in block 51
Block first atom: 775
Blocpdb> 15 atoms in block 52
Block first atom: 795
Blocpdb> 11 atoms in block 53
Block first atom: 810
Blocpdb> 17 atoms in block 54
Block first atom: 821
Blocpdb> 13 atoms in block 55
Block first atom: 838
Blocpdb> 14 atoms in block 56
Block first atom: 851
Blocpdb> 15 atoms in block 57
Block first atom: 865
Blocpdb> 15 atoms in block 58
Block first atom: 880
Blocpdb> 12 atoms in block 59
Block first atom: 895
Blocpdb> 19 atoms in block 60
Block first atom: 907
Blocpdb> 13 atoms in block 61
Block first atom: 926
Blocpdb> 16 atoms in block 62
Block first atom: 939
Blocpdb> 12 atoms in block 63
Block first atom: 955
Blocpdb> 18 atoms in block 64
Block first atom: 967
Blocpdb> 15 atoms in block 65
Block first atom: 985
Blocpdb> 22 atoms in block 66
Block first atom: 1000
Blocpdb> 18 atoms in block 67
Block first atom: 1022
Blocpdb> 17 atoms in block 68
Block first atom: 1040
Blocpdb> 18 atoms in block 69
Block first atom: 1057
Blocpdb> 17 atoms in block 70
Block first atom: 1075
Blocpdb> 16 atoms in block 71
Block first atom: 1092
Blocpdb> 13 atoms in block 72
Block first atom: 1108
Blocpdb> 13 atoms in block 73
Block first atom: 1121
Blocpdb> 14 atoms in block 74
Block first atom: 1134
Blocpdb> 13 atoms in block 75
Block first atom: 1148
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1161
Blocpdb> 17 atoms in block 77
Block first atom: 1177
Blocpdb> 14 atoms in block 78
Block first atom: 1194
Blocpdb> 22 atoms in block 79
Block first atom: 1208
Blocpdb> 13 atoms in block 80
Block first atom: 1230
Blocpdb> 17 atoms in block 81
Block first atom: 1243
Blocpdb> 13 atoms in block 82
Block first atom: 1260
Blocpdb> 16 atoms in block 83
Block first atom: 1273
Blocpdb> 14 atoms in block 84
Block first atom: 1289
Blocpdb> 22 atoms in block 85
Block first atom: 1303
Blocpdb> 15 atoms in block 86
Block first atom: 1325
Blocpdb> 20 atoms in block 87
Block first atom: 1340
Blocpdb> 20 atoms in block 88
Block first atom: 1360
Blocpdb> 14 atoms in block 89
Block first atom: 1380
Blocpdb> 16 atoms in block 90
Block first atom: 1394
Blocpdb> 16 atoms in block 91
Block first atom: 1410
Blocpdb> 18 atoms in block 92
Block first atom: 1426
Blocpdb> 12 atoms in block 93
Block first atom: 1444
Blocpdb> 12 atoms in block 94
Block first atom: 1456
Blocpdb> 14 atoms in block 95
Block first atom: 1468
Blocpdb> 17 atoms in block 96
Block first atom: 1482
Blocpdb> 20 atoms in block 97
Block first atom: 1499
Blocpdb> 15 atoms in block 98
Block first atom: 1519
Blocpdb> 13 atoms in block 99
Block first atom: 1534
Blocpdb> 23 atoms in block 100
Block first atom: 1547
Blocpdb> 13 atoms in block 101
Block first atom: 1570
Blocpdb> 16 atoms in block 102
Block first atom: 1583
Blocpdb> 20 atoms in block 103
Block first atom: 1599
Blocpdb> 16 atoms in block 104
Block first atom: 1619
Blocpdb> 13 atoms in block 105
Block first atom: 1635
Blocpdb> 15 atoms in block 106
Block first atom: 1648
Blocpdb> 15 atoms in block 107
Block first atom: 1663
Blocpdb> 16 atoms in block 108
Block first atom: 1678
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 1694
Blocpdb> 19 atoms in block 110
Block first atom: 1710
Blocpdb> 19 atoms in block 111
Block first atom: 1729
Blocpdb> 16 atoms in block 112
Block first atom: 1748
Blocpdb> 13 atoms in block 113
Block first atom: 1764
Blocpdb> 22 atoms in block 114
Block first atom: 1777
Blocpdb> 15 atoms in block 115
Block first atom: 1799
Blocpdb> 15 atoms in block 116
Block first atom: 1814
Blocpdb> 16 atoms in block 117
Block first atom: 1829
Blocpdb> 15 atoms in block 118
Block first atom: 1845
Blocpdb> 13 atoms in block 119
Block first atom: 1860
Blocpdb> 14 atoms in block 120
Block first atom: 1873
Blocpdb> 10 atoms in block 121
Block first atom: 1887
Blocpdb> 13 atoms in block 122
Block first atom: 1897
Blocpdb> 20 atoms in block 123
Block first atom: 1910
Blocpdb> 20 atoms in block 124
Block first atom: 1930
Blocpdb> 19 atoms in block 125
Block first atom: 1950
Blocpdb> 16 atoms in block 126
Block first atom: 1969
Blocpdb> 16 atoms in block 127
Block first atom: 1985
Blocpdb> 20 atoms in block 128
Block first atom: 2001
Blocpdb> 15 atoms in block 129
Block first atom: 2021
Blocpdb> 14 atoms in block 130
Block first atom: 2036
Blocpdb> 20 atoms in block 131
Block first atom: 2050
Blocpdb> 17 atoms in block 132
Block first atom: 2070
Blocpdb> 14 atoms in block 133
Block first atom: 2087
Blocpdb> 11 atoms in block 134
Block first atom: 2101
Blocpdb> 19 atoms in block 135
Block first atom: 2112
Blocpdb> 20 atoms in block 136
Block first atom: 2131
Blocpdb> 21 atoms in block 137
Block first atom: 2151
Blocpdb> 16 atoms in block 138
Block first atom: 2172
Blocpdb> 9 atoms in block 139
Block first atom: 2188
Blocpdb> 16 atoms in block 140
Block first atom: 2197
Blocpdb> 20 atoms in block 141
Block first atom: 2213
Blocpdb> 13 atoms in block 142
Block first atom: 2233
Blocpdb> 14 atoms in block 143
Block first atom: 2246
Blocpdb> 19 atoms in block 144
Block first atom: 2260
Blocpdb> 19 atoms in block 145
Block first atom: 2279
Blocpdb> 15 atoms in block 146
Block first atom: 2298
Blocpdb> 12 atoms in block 147
Block first atom: 2313
Blocpdb> 16 atoms in block 148
Block first atom: 2325
Blocpdb> 18 atoms in block 149
Block first atom: 2341
Blocpdb> 12 atoms in block 150
Block first atom: 2358
Blocpdb> 150 blocks.
Blocpdb> At most, 23 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 818244 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7110
Prepmat> Matrix trace = 1786620.0000
Prepmat> Last element read: 7110 7110 186.9743
Prepmat> 11326 lines saved.
Prepmat> 9761 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2370
RTB> Total mass = 2370.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2370
RTB> Number of blocks = 150
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 189429.6957
RTB> 54054 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 900
Diagstd> Nb of non-zero elements: 54054
Diagstd> Projected matrix trace = 189429.6957
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 900 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 189429.6957
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.9314871 1.2534173 1.6877066 3.7386911
3.8575642 4.5210313 5.1800641 6.0776466 6.2176491
7.2510045 8.3698966 8.9022068 9.3596435 10.6370915
10.8011082 11.3371399 12.5175379 12.8062947 13.2230991
13.6714064 15.6352011 15.7195039 17.0214418 17.8298041
18.5400755 19.4573030 20.2334556 21.0137326 21.4427807
21.8332497 22.2591970 22.7832370 23.5192876 24.0406284
24.3299505 25.7674565 26.3098349 26.9505738 27.4083231
27.4958752 29.4302460 29.6382002 30.1583302 30.9133417
31.7448805 32.2414150 32.6449394 33.4060767 33.6972368
34.4571396 35.2724191 35.9584299 36.3723767 36.4727285
36.8882658 37.3356135 37.8406649 38.0582702 38.4962020
39.4211363 39.5278533 40.6708850 41.1926668 41.7207480
42.2727828 43.2724370 44.1653056 44.4145865 44.7003474
45.9350802 46.2131387 46.8789018 47.6367740 48.0687480
48.2730229 49.8688521 50.3367384 50.5730061 50.7185395
51.6084893 52.2771385 52.9246800 53.2788204 53.7439958
54.1351857 54.7013879 54.8851079 55.4018364 56.1929392
56.7822646 57.1795768 57.4743502 58.3439941 58.9618535
59.4334892 59.9966765 60.8415333 61.0025395 61.8763788
62.1416976
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034315 0.0034330 0.0034331 0.0034337 0.0034340
0.0034343 104.8054127 121.5746775 141.0729525 209.9689469
213.2808497 230.8947386 247.1512694 267.7090193 270.7748884
292.4114461 314.1632115 323.9993365 332.2193568 354.1658872
356.8859407 365.6343870 384.1976795 388.6037852 394.8770621
401.5150948 429.3851451 430.5411809 448.0159262 458.5308558
467.5747272 479.0012002 488.4614688 497.7908170 502.8469634
507.4046832 512.3302831 518.3260005 526.6321421 532.4369517
535.6312325 551.2277293 556.9989056 563.7405676 568.5079121
569.4151978 589.1043458 591.1819880 596.3468452 603.7654507
611.8319167 616.5983055 620.4448927 627.6362479 630.3654845
637.4335110 644.9304806 651.1718839 654.9092435 655.8120729
659.5373571 663.5244435 667.9972271 669.9151556 673.7584459
681.8044786 682.7267113 692.5276086 696.9557972 701.4089827
706.0341365 714.3334011 721.6654277 723.6991990 726.0235858
735.9825541 738.2067519 743.5051735 749.4910513 752.8816042
754.4796460 766.8491952 770.4382145 772.2442176 773.3545586
780.1100152 785.1473770 789.9951055 792.6337867 796.0864951
798.9785053 803.1459116 804.4935035 808.2716765 814.0220229
818.2794313 821.1372403 823.2510915 829.4560104 833.8363885
837.1646742 841.1217765 847.0232970 848.1433040 854.1963767
856.0257659
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2370
Rtb_to_modes> Number of blocs = 150
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9857E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9315
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.253
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.688
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.739
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.858
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.521
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.180
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.078
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.218
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.251
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.370
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.902
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.360
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.14
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 900 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999
1.00003 0.99997 1.00002 0.99999 0.99997
1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998
0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999
0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998
1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998
1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 0.99997
0.99998 0.99997 0.99998 1.00002 0.99999
0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999
0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
0.99997 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002
0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 42660 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999
1.00003 0.99997 1.00002 0.99999 0.99997
1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99998
0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999
0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998
1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001
0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998
1.00000 1.00002 0.99998 1.00003 0.99997
0.99998 0.99997 0.99998 1.00002 0.99999
0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999
0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999
0.99997 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999
1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002
0.99997 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 220403083527107527.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220403083527107527.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 220403083527107527.atom
Openam> file on opening on unit 11:
220403083527107527.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 300
First residue number = 155
Last residue number = 454
Number of atoms found = 2370
Mean number per residue = 7.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9857E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9315
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.253
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.688
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.739
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.858
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.521
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.180
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.078
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.218
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.251
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.370
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.902
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.360
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.14
Bfactors> 106 vectors, 7110 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.931500
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.713 for 300 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.041 +/- 0.04
Bfactors> = 41.373 +/- 12.96
Bfactors> Shiftng-fct= 41.332
Bfactors> Scaling-fct= 357.813
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 220403083527107527.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220403083527107527.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 104.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 213.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 808.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 848.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.0
Chkmod> 106 vectors, 7110 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2370 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7206
0.0034 0.8948
0.0034 0.8414
0.0034 0.9257
0.0034 0.7625
0.0034 0.8460
104.8016 0.6690
121.5492 0.7123
141.0792 0.6985
209.9686 0.3761
213.2837 0.4953
230.8840 0.3093
247.1391 0.1288
267.7053 0.5344
270.7709 0.4585
292.3988 0.2231
314.1517 0.4913
323.9817 0.2265
332.2114 0.3560
354.1991 0.4851
356.8523 0.0619
365.6648 0.4310
384.2190 0.2847
388.6433 0.1507
394.8138 0.4100
401.4772 0.4176
429.4326 0.4008
430.5295 0.2765
447.9777 0.3934
458.5137 0.3738
467.5537 0.2246
479.0138 0.4096
488.3988 0.4290
497.7252 0.5239
502.7928 0.6024
507.3451 0.3829
512.3175 0.3024
518.2669 0.2570
526.6175 0.4409
532.4071 0.4738
535.6088 0.4196
551.2313 0.4315
556.9767 0.3602
563.7104 0.4454
568.5009 0.3452
569.4335 0.5524
589.0766 0.2120
591.1746 0.4614
596.3378 0.4253
603.7069 0.4423
611.7586 0.4457
616.5583 0.3375
620.3713 0.4612
627.6462 0.5385
630.3643 0.3697
637.4326 0.4446
644.8807 0.3626
651.1581 0.3496
654.8597 0.4552
655.7594 0.3669
659.5245 0.3841
663.5349 0.5059
667.9627 0.3866
669.9016 0.4717
673.7628 0.3565
681.7654 0.4485
682.7159 0.4108
692.4903 0.3017
696.9033 0.2887
701.3726 0.4909
705.9806 0.4800
714.2826 0.4373
721.6728 0.5149
723.6308 0.3850
725.9896 0.5156
735.9904 0.3145
738.1500 0.5532
743.4820 0.4544
749.4843 0.3780
752.8591 0.4101
754.4236 0.4499
766.8251 0.4763
770.4301 0.4718
772.1881 0.4769
773.3325 0.2150
780.0879 0.4626
785.1352 0.4051
789.9263 0.3862
792.6085 0.2205
796.0227 0.3260
798.9797 0.3696
803.1012 0.5252
804.4948 0.4192
808.2236 0.3264
813.9658 0.4889
818.2280 0.4813
821.1050 0.5151
823.1846 0.5355
829.3920 0.3595
833.7875 0.4813
837.1042 0.3246
841.1090 0.3820
846.9763 0.3468
848.0892 0.4489
854.1847 0.4873
855.9773 0.5493
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 220403083527107527 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
making animated gifs
11 models are in 220403083527107527.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220403083527107527.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220403083527107527.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 220403083527107527 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
making animated gifs
11 models are in 220403083527107527.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220403083527107527.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220403083527107527.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 220403083527107527 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
making animated gifs
11 models are in 220403083527107527.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220403083527107527.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220403083527107527.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 220403083527107527 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
making animated gifs
11 models are in 220403083527107527.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220403083527107527.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220403083527107527.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 220403083527107527 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220403083527107527.eigenfacs
220403083527107527.atom
making animated gifs
11 models are in 220403083527107527.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220403083527107527.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220403083527107527.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
220403083527107527.10.pdb
220403083527107527.11.pdb
220403083527107527.7.pdb
220403083527107527.8.pdb
220403083527107527.9.pdb
STDERR:
real 0m9.557s
user 0m9.524s
sys 0m0.028s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|
