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LOGs for ID: 22040120230993067

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22040120230993067.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22040120230993067.atom to be opened. Openam> File opened: 22040120230993067.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 199 First residue number = 1 Last residue number = 200 Number of atoms found = 3218 Mean number per residue = 16.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = 62.562436 +/- 7.300885 From: 41.870000 To: 80.280000 = 62.564378 +/- 10.012731 From: 33.500000 To: 83.260000 = 29.494127 +/- 12.063299 From: 2.130000 To: 56.300000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'ASH ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'BEC ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 2 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 5.1527 % Filled. Pdbmat> 2401380 non-zero elements. Pdbmat> 265105 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 164.76 +/- 52.03 Maximum number = 258 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 5.302100E+06 Pdbmat> Larger element = 913.997 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 199 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22040120230993067.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22040120230993067.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22040120230993067.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3218 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 199 residues. Blocpdb> 16 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 17 atoms in block 2 Block first atom: 17 Blocpdb> 19 atoms in block 3 Block first atom: 34 Blocpdb> 14 atoms in block 4 Block first atom: 53 Blocpdb> 19 atoms in block 5 Block first atom: 67 Blocpdb> 24 atoms in block 6 Block first atom: 86 Blocpdb> 17 atoms in block 7 Block first atom: 110 Blocpdb> 24 atoms in block 8 Block first atom: 127 Blocpdb> 14 atoms in block 9 Block first atom: 151 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 165 Blocpdb> 16 atoms in block 11 Block first atom: 184 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 200 Blocpdb> 19 atoms in block 13 Block first atom: 214 Blocpdb> 22 atoms in block 14 Block first atom: 233 Blocpdb> 19 atoms in block 15 Block first atom: 255 Blocpdb> 7 atoms in block 16 Block first atom: 274 Blocpdb> 7 atoms in block 17 Block first atom: 281 Blocpdb> 17 atoms in block 18 Block first atom: 288 Blocpdb> 19 atoms in block 19 Block first atom: 305 Blocpdb> 22 atoms in block 20 Block first atom: 324 Blocpdb> 15 atoms in block 21 Block first atom: 346 Blocpdb> 10 atoms in block 22 Block first atom: 361 Blocpdb> 19 atoms in block 23 Block first atom: 371 Blocpdb> 19 atoms in block 24 Block first atom: 390 Blocpdb> 13 atoms in block 25 Block first atom: 409 Blocpdb> 14 atoms in block 26 Block first atom: 422 Blocpdb> 7 atoms in block 27 Block first atom: 436 Blocpdb> 10 atoms in block 28 Block first atom: 443 Blocpdb> 12 atoms in block 29 Block first atom: 453 Blocpdb> 12 atoms in block 30 Block first atom: 465 Blocpdb> 14 atoms in block 31 Block first atom: 477 Blocpdb> 16 atoms in block 32 Block first atom: 491 Blocpdb> 19 atoms in block 33 Block first atom: 507 Blocpdb> 15 atoms in block 34 Block first atom: 526 Blocpdb> 15 atoms in block 35 Block first atom: 541 Blocpdb> 17 atoms in block 36 Block first atom: 556 Blocpdb> 11 atoms in block 37 Block first atom: 573 Blocpdb> 19 atoms in block 38 Block first atom: 584 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 603 Blocpdb> 7 atoms in block 40 Block first atom: 617 Blocpdb> 24 atoms in block 41 Block first atom: 624 Blocpdb> 24 atoms in block 42 Block first atom: 648 Blocpdb> 22 atoms in block 43 Block first atom: 672 Blocpdb> 14 atoms in block 44 Block first atom: 694 Blocpdb> 22 atoms in block 45 Block first atom: 708 Blocpdb> 17 atoms in block 46 Block first atom: 730 Blocpdb> 19 atoms in block 47 Block first atom: 747 Blocpdb> 7 atoms in block 48 Block first atom: 766 Blocpdb> 7 atoms in block 49 Block first atom: 773 Blocpdb> 19 atoms in block 50 Block first atom: 780 Blocpdb> 7 atoms in block 51 Block first atom: 799 Blocpdb> 7 atoms in block 52 Block first atom: 806 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 813 Blocpdb> 19 atoms in block 54 Block first atom: 833 Blocpdb> 22 atoms in block 55 Block first atom: 852 Blocpdb> 16 atoms in block 56 Block first atom: 874 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 890 Blocpdb> 17 atoms in block 58 Block first atom: 914 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 931 Blocpdb> 12 atoms in block 60 Block first atom: 952 Blocpdb> 17 atoms in block 61 Block first atom: 964 Blocpdb> 19 atoms in block 62 Block first atom: 981 Blocpdb> 19 atoms in block 63 Block first atom: 1000 Blocpdb> 19 atoms in block 64 Block first atom: 1019 Blocpdb> 15 atoms in block 65 Block first atom: 1038 Blocpdb> 19 atoms in block 66 Block first atom: 1053 Blocpdb> 11 atoms in block 67 Block first atom: 1072 Blocpdb> 7 atoms in block 68 Block first atom: 1083 Blocpdb> 17 atoms in block 69 Block first atom: 1090 Blocpdb> 22 atoms in block 70 Block first atom: 1107 Blocpdb> 10 atoms in block 71 Block first atom: 1129 Blocpdb> 19 atoms in block 72 Block first atom: 1139 Blocpdb> 7 atoms in block 73 Block first atom: 1158 Blocpdb> 14 atoms in block 74 Block first atom: 1165 Blocpdb> 16 atoms in block 75 Block first atom: 1179 Blocpdb> 19 atoms in block 76 Block first atom: 1195 Blocpdb> 16 atoms in block 77 Block first atom: 1214 Blocpdb> 7 atoms in block 78 Block first atom: 1230 Blocpdb> 14 atoms in block 79 Block first atom: 1237 Blocpdb> 14 atoms in block 80 Block first atom: 1251 Blocpdb> 14 atoms in block 81 Block first atom: 1265 Blocpdb> 16 atoms in block 82 Block first atom: 1279 Blocpdb> 14 atoms in block 83 Block first atom: 1295 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1309 Blocpdb> 19 atoms in block 85 Block first atom: 1328 Blocpdb> 7 atoms in block 86 Block first atom: 1347 Blocpdb> 24 atoms in block 87 Block first atom: 1354 Blocpdb> 14 atoms in block 88 Block first atom: 1378 Blocpdb> 19 atoms in block 89 Block first atom: 1392 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 1411 Blocpdb> 14 atoms in block 91 Block first atom: 1430 Blocpdb> 17 atoms in block 92 Block first atom: 1444 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 1461 Blocpdb> 7 atoms in block 94 Block first atom: 1480 Blocpdb> 11 atoms in block 95 Block first atom: 1487 Blocpdb> 14 atoms in block 96 Block first atom: 1498 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 1512 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 1531 Blocpdb> 21 atoms in block 99 Block first atom: 1545 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1566 Blocpdb> 17 atoms in block 101 Block first atom: 1582 Blocpdb> 19 atoms in block 102 Block first atom: 1599 Blocpdb> 14 atoms in block 103 Block first atom: 1618 Blocpdb> 19 atoms in block 104 Block first atom: 1632 Blocpdb> 24 atoms in block 105 Block first atom: 1651 Blocpdb> 17 atoms in block 106 Block first atom: 1675 Blocpdb> 24 atoms in block 107 Block first atom: 1692 Blocpdb> 14 atoms in block 108 Block first atom: 1716 Blocpdb> 19 atoms in block 109 Block first atom: 1730 Blocpdb> 16 atoms in block 110 Block first atom: 1749 Blocpdb> 14 atoms in block 111 Block first atom: 1765 Blocpdb> 19 atoms in block 112 Block first atom: 1779 Blocpdb> 22 atoms in block 113 Block first atom: 1798 Blocpdb> 19 atoms in block 114 Block first atom: 1820 Blocpdb> 7 atoms in block 115 Block first atom: 1839 Blocpdb> 7 atoms in block 116 Block first atom: 1846 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 1853 Blocpdb> 19 atoms in block 118 Block first atom: 1870 Blocpdb> 22 atoms in block 119 Block first atom: 1889 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1911 Blocpdb> 10 atoms in block 121 Block first atom: 1926 Blocpdb> 19 atoms in block 122 Block first atom: 1936 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 1955 Blocpdb> 12 atoms in block 124 Block first atom: 1974 Blocpdb> 14 atoms in block 125 Block first atom: 1986 Blocpdb> 7 atoms in block 126 Block first atom: 2000 Blocpdb> 10 atoms in block 127 Block first atom: 2007 Blocpdb> 12 atoms in block 128 Block first atom: 2017 Blocpdb> 12 atoms in block 129 Block first atom: 2029 Blocpdb> 14 atoms in block 130 Block first atom: 2041 Blocpdb> 16 atoms in block 131 Block first atom: 2055 Blocpdb> 19 atoms in block 132 Block first atom: 2071 Blocpdb> 15 atoms in block 133 Block first atom: 2090 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 2105 Blocpdb> 17 atoms in block 135 Block first atom: 2120 Blocpdb> 11 atoms in block 136 Block first atom: 2137 Blocpdb> 19 atoms in block 137 Block first atom: 2148 Blocpdb> 14 atoms in block 138 Block first atom: 2167 Blocpdb> 7 atoms in block 139 Block first atom: 2181 Blocpdb> 24 atoms in block 140 Block first atom: 2188 Blocpdb> 24 atoms in block 141 Block first atom: 2212 Blocpdb> 22 atoms in block 142 Block first atom: 2236 Blocpdb> 14 atoms in block 143 Block first atom: 2258 Blocpdb> 22 atoms in block 144 Block first atom: 2272 Blocpdb> 17 atoms in block 145 Block first atom: 2294 Blocpdb> 19 atoms in block 146 Block first atom: 2311 Blocpdb> 7 atoms in block 147 Block first atom: 2330 Blocpdb> 7 atoms in block 148 Block first atom: 2337 Blocpdb> 19 atoms in block 149 Block first atom: 2344 Blocpdb> 7 atoms in block 150 Block first atom: 2363 Blocpdb> 7 atoms in block 151 Block first atom: 2370 Blocpdb> 20 atoms in block 152 Block first atom: 2377 Blocpdb> 19 atoms in block 153 Block first atom: 2397 Blocpdb> 22 atoms in block 154 Block first atom: 2416 Blocpdb> 16 atoms in block 155 Block first atom: 2438 Blocpdb> 24 atoms in block 156 Block first atom: 2454 Blocpdb> 17 atoms in block 157 Block first atom: 2478 Blocpdb> 21 atoms in block 158 Block first atom: 2495 Blocpdb> 12 atoms in block 159 Block first atom: 2516 Blocpdb> 17 atoms in block 160 Block first atom: 2528 Blocpdb> 19 atoms in block 161 Block first atom: 2545 Blocpdb> 19 atoms in block 162 Block first atom: 2564 Blocpdb> 19 atoms in block 163 Block first atom: 2583 Blocpdb> 15 atoms in block 164 Block first atom: 2602 Blocpdb> 19 atoms in block 165 Block first atom: 2617 Blocpdb> 11 atoms in block 166 Block first atom: 2636 Blocpdb> 7 atoms in block 167 Block first atom: 2647 Blocpdb> 17 atoms in block 168 Block first atom: 2654 Blocpdb> 22 atoms in block 169 Block first atom: 2671 Blocpdb> 10 atoms in block 170 Block first atom: 2693 Blocpdb> 19 atoms in block 171 Block first atom: 2703 Blocpdb> 7 atoms in block 172 Block first atom: 2722 Blocpdb> 14 atoms in block 173 Block first atom: 2729 Blocpdb> 16 atoms in block 174 Block first atom: 2743 Blocpdb> 19 atoms in block 175 Block first atom: 2759 Blocpdb> 16 atoms in block 176 Block first atom: 2778 Blocpdb> 7 atoms in block 177 Block first atom: 2794 Blocpdb> 14 atoms in block 178 Block first atom: 2801 Blocpdb> 14 atoms in block 179 Block first atom: 2815 Blocpdb> 14 atoms in block 180 Block first atom: 2829 Blocpdb> 16 atoms in block 181 Block first atom: 2843 Blocpdb> 14 atoms in block 182 Block first atom: 2859 Blocpdb> 19 atoms in block 183 Block first atom: 2873 Blocpdb> 19 atoms in block 184 Block first atom: 2892 Blocpdb> 7 atoms in block 185 Block first atom: 2911 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 2918 Blocpdb> 14 atoms in block 187 Block first atom: 2942 Blocpdb> 19 atoms in block 188 Block first atom: 2956 Blocpdb> 19 atoms in block 189 Block first atom: 2975 Blocpdb> 14 atoms in block 190 Block first atom: 2994 Blocpdb> 17 atoms in block 191 Block first atom: 3008 Blocpdb> 19 atoms in block 192 Block first atom: 3025 Blocpdb> 7 atoms in block 193 Block first atom: 3044 Blocpdb> 11 atoms in block 194 Block first atom: 3051 Blocpdb> 14 atoms in block 195 Block first atom: 3062 Blocpdb> 19 atoms in block 196 Block first atom: 3076 Blocpdb> 14 atoms in block 197 Block first atom: 3095 Blocpdb> 21 atoms in block 198 Block first atom: 3109 Blocpdb> 89 atoms in block 199 Block first atom: 3129 Blocpdb> 199 blocks. Blocpdb> At most, 89 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2401579 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9654 Prepmat> Matrix trace = 5302100.0000 Prepmat> Last element read: 9654 9654 658.0613 Prepmat> 19901 lines saved. Prepmat> 16819 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3218 RTB> Total mass = 3218.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3218 RTB> Number of blocks = 199 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 602376.9714 RTB> 107920 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1194 Diagstd> Nb of non-zero elements: 107920 Diagstd> Projected matrix trace = 602376.9714 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1194 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 602376.9714 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 5.6993814 7.4126810 8.8344043 12.1630740 15.5787526 17.8527164 23.2099926 25.4709061 29.2193022 30.7537438 33.7017657 38.6583313 40.8518095 45.4706535 46.6147184 47.8741405 50.5821690 52.8688549 55.9511969 57.1097148 58.5496778 59.6049651 62.8192940 63.8346101 65.0201801 66.0432358 70.0437738 71.5266446 73.7704320 75.9267655 76.8138895 79.3478690 80.8011542 83.6124460 84.8861809 86.7872110 87.1045535 88.6589028 89.2679877 90.0701578 92.8037492 95.1182495 97.3512846 98.5234337 100.0786124 100.9089658 103.7120689 106.2255988 107.3687628 109.3754974 112.0932500 112.3331876 112.6923315 114.2217691 115.0796986 115.8566807 116.5000941 118.8398845 121.0494660 123.2690027 125.0004170 126.0496147 126.9937499 128.1834751 130.8273878 132.6498133 134.6789905 134.9837720 136.9578337 137.4673626 139.8418099 140.6539674 142.1806332 144.5205285 145.4796598 146.6217152 147.1898601 150.2535761 151.1186207 152.1247911 156.0008848 157.4887652 160.1975652 160.4339992 165.0709591 168.0448448 169.6306710 170.0829588 171.2972671 174.9362727 177.1491692 178.4857527 179.0364696 180.7104558 180.9665889 183.0153641 184.1746964 185.4253804 186.0501641 188.8041669 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034291 0.0034328 0.0034338 0.0034344 0.0034348 0.0034367 259.2442552 295.6534394 322.7631271 378.7188793 428.6093298 458.8253808 523.1578922 548.0465872 586.9893206 602.2048880 630.4078436 675.1757447 694.0662541 732.2525256 741.4072233 751.3560283 772.3141721 789.5783511 812.2691725 820.6354539 830.9167903 838.3714866 860.6801876 867.6076755 875.6274428 882.4893072 908.8245468 918.3943565 932.6881168 946.2213216 951.7330662 967.3038451 976.1219131 992.9576920 1000.4923624 1011.6333694 1013.4812299 1022.4838487 1025.9900586 1030.5895680 1046.1116561 1059.0761911 1071.4357262 1077.8666878 1086.3403677 1090.8377472 1105.8849029 1119.2055995 1125.2117398 1135.6782300 1149.7012695 1150.9310895 1152.7694601 1160.5656741 1164.9160749 1168.8420337 1172.0831387 1183.7946989 1194.7491196 1205.6526954 1214.0903612 1219.1749800 1223.7323867 1229.4512160 1242.0658331 1250.6869022 1260.2166307 1261.6417737 1270.8336893 1273.1954574 1284.1442114 1287.8677667 1294.8381969 1305.4494234 1309.7741614 1314.9051551 1317.4502571 1331.0908216 1334.9170213 1339.3536875 1356.3095230 1362.7621701 1374.4319299 1375.4458112 1395.1812066 1407.6927609 1414.3193080 1416.2035590 1421.2500643 1436.2671078 1445.3227550 1450.7649605 1453.0014007 1459.7783586 1460.8125133 1469.0583815 1473.7039974 1478.6993080 1481.1884233 1492.1107789 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3218 Rtb_to_modes> Number of blocs = 199 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9715E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0016E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.699 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.413 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.834 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 140.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 146.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 150.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 152.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 156.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 157.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 165.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 168.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 169.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 170.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 171.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 174.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 177.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 178.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 179.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 180.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 181.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 183.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 184.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 185.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 186.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 188.8 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1194 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99995 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 57924 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99995 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22040120230993067.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22040120230993067.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22040120230993067.atom Openam> file on opening on unit 11: 22040120230993067.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 199 First residue number = 1 Last residue number = 200 Number of atoms found = 3218 Mean number per residue = 16.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9715E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0016E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.699 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.413 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.834 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 156.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 169.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 170.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 171.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 177.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 178.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 180.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 181.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 183.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 184.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 185.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 186.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.8 Bfactors> 106 vectors, 9654 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 5.699000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22040120230993067.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22040120230993067.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4289E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4366E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 789.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 967.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1012. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1013. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1086. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1106. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1119. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1125. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1150. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1153. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1165. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1172. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1184. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1194. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1206. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1214. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1219. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1224. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1229. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1242. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1250. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1260. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1262. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1271. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1273. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1284. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1288. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1295. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1305. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1310. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1315. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1317. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1331. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1335. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1339. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1356. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1363. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1374. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1375. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1395. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1407. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1414. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1416. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1421. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1436. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1445. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1451. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1453. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1460. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1461. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1469. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1474. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1479. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1481. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1492. Chkmod> 106 vectors, 9654 coordinates in file. Chkmod> That is: 3218 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 39 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9556 0.0034 0.8325 0.0034 0.8141 0.0034 0.6968 0.0034 0.7845 0.0034 0.7719 259.2245 0.0267 295.6471 0.4489 322.7419 0.3466 378.6548 0.4062 428.6081 0.0763 458.7708 0.1491 523.1355 0.3088 548.0133 0.3789 586.9711 0.4775 602.1424 0.6834 630.3643 0.2319 675.1613 0.6301 694.0211 0.5522 732.2158 0.1804 741.3379 0.1583 751.2913 0.4330 772.2645 0.1054 789.5530 0.2142 812.2256 0.3808 820.6023 0.5050 830.8834 0.3890 838.3006 0.3536 860.6481 0.3133 867.5391 0.3425 875.5886 0.2436 882.4298 0.1661 908.7611 0.3840 918.3765 0.5208 932.6453 0.4595 946.2009 0.1587 951.6681 0.3342 967.2753 0.4145 976.0730 0.3173 992.9005 0.4144 1000.4719 0.3128 1011.6062 0.2156 1013.4112 0.2461 1022.4463 0.3417 1025.9576 0.3742 1030.5444 0.2278 1046.0456 0.3497 1059.0405 0.4830 1071.3827 0.4616 1077.8016 0.3736 1086.4098 0.2003 1090.7425 0.3656 1105.7731 0.3625 1119.0227 0.3916 1125.3271 0.3057 1135.7567 0.3662 1149.6865 0.3395 1150.7117 0.1963 1152.7592 0.3322 1160.4053 0.3487 1164.9688 0.2402 1169.0103 0.2758 1172.0324 0.3585 1183.5452 0.3847 1194.4537 0.4757 1205.7525 0.2682 1214.0362 0.3488 1218.8827 0.2745 1223.7100 0.3382 1229.4777 0.3974 1241.8825 0.2165 1250.3984 0.2948 1260.2608 0.3171 1261.6634 0.2008 1270.9747 0.4006 1273.2919 0.4154 1283.8971 0.3615 1288.0232 0.3998 1294.8708 0.4365 1305.3007 0.5053 1309.8095 0.3590 1314.7513 0.5381 1317.4391 0.4981 1331.2393 0.4813 1334.7775 0.3497 1339.1871 0.4881 1356.2475 0.4708 1362.7523 0.4574 1374.3834 0.2839 1375.2410 0.4151 1395.2440 0.3577 1407.4445 0.4355 1414.1307 0.4246 1416.2137 0.4261 1421.2004 0.3853 1436.0565 0.4096 1445.0601 0.3727 1450.7606 0.2617 1452.7910 0.3767 1459.6735 0.4212 1460.8846 0.4865 1468.9337 0.3901 1473.7420 0.3838 1478.5346 0.3133 1481.3232 0.1661 1492.0303 0.3071 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22040120230993067 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom making animated gifs 11 models are in 22040120230993067.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22040120230993067.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22040120230993067.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22040120230993067 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22040120230993067.eigenfacs 22040120230993067.atom making animated gifs 11 models are in 22040120230993067.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22040120230993067.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22040120230993067.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting 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