*** 01-JUL-21 ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22031815292778224.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22031815292778224.atom to be opened.
Openam> File opened: 22031815292778224.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 290
First residue number = 58
Last residue number = 347
Number of atoms found = 2364
Mean number per residue = 8.2
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -6.950580 +/- 12.911558 From: -38.456000 To: 21.685000
= 1.679303 +/- 9.657399 From: -29.356000 To: 29.335000
= -3.339867 +/- 13.418772 From: -34.237000 To: 25.174000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 1 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.3878 % Filled.
Pdbmat> 852097 non-zero elements.
Pdbmat> 93112 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.77 +/- 22.89
Maximum number = 128
Minimum number = 10
Pdbmat> Matrix trace = 1.862240E+06
Pdbmat> Larger element = 488.181
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
290 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22031815292778224.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22031815292778224.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22031815292778224.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 2364 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 290 residues.
Blocpdb> 12 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 19 atoms in block 2
Block first atom: 13
Blocpdb> 12 atoms in block 3
Block first atom: 32
Blocpdb> 20 atoms in block 4
Block first atom: 44
Blocpdb> 15 atoms in block 5
Block first atom: 64
Blocpdb> 19 atoms in block 6
Block first atom: 79
Blocpdb> 18 atoms in block 7
Block first atom: 98
Blocpdb> 12 atoms in block 8
Block first atom: 116
Blocpdb> 18 atoms in block 9
Block first atom: 128
Blocpdb> 12 atoms in block 10
Block first atom: 146
Blocpdb> 16 atoms in block 11
Block first atom: 158
Blocpdb> 16 atoms in block 12
Block first atom: 174
Blocpdb> 14 atoms in block 13
Block first atom: 190
Blocpdb> 16 atoms in block 14
Block first atom: 204
Blocpdb> 17 atoms in block 15
Block first atom: 220
Blocpdb> 20 atoms in block 16
Block first atom: 237
Blocpdb> 17 atoms in block 17
Block first atom: 257
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 274
Blocpdb> 15 atoms in block 19
Block first atom: 289
Blocpdb> 20 atoms in block 20
Block first atom: 304
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 324
Blocpdb> 16 atoms in block 22
Block first atom: 343
Blocpdb> 12 atoms in block 23
Block first atom: 359
Blocpdb> 13 atoms in block 24
Block first atom: 371
Blocpdb> 16 atoms in block 25
Block first atom: 384
Blocpdb> 15 atoms in block 26
Block first atom: 400
Blocpdb> 13 atoms in block 27
Block first atom: 415
Blocpdb> 14 atoms in block 28
Block first atom: 428
Blocpdb> 17 atoms in block 29
Block first atom: 442
Blocpdb> 18 atoms in block 30
Block first atom: 459
Blocpdb> 16 atoms in block 31
Block first atom: 477
Blocpdb> 19 atoms in block 32
Block first atom: 493
Blocpdb> 23 atoms in block 33
Block first atom: 512
Blocpdb> 20 atoms in block 34
Block first atom: 535
Blocpdb> 13 atoms in block 35
Block first atom: 555
Blocpdb> 15 atoms in block 36
Block first atom: 568
Blocpdb> 13 atoms in block 37
Block first atom: 583
Blocpdb> 19 atoms in block 38
Block first atom: 596
Blocpdb> 14 atoms in block 39
Block first atom: 615
Blocpdb> 19 atoms in block 40
Block first atom: 629
Blocpdb> 16 atoms in block 41
Block first atom: 648
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 664
Blocpdb> 18 atoms in block 43
Block first atom: 680
Blocpdb> 13 atoms in block 44
Block first atom: 698
Blocpdb> 22 atoms in block 45
Block first atom: 711
Blocpdb> 15 atoms in block 46
Block first atom: 733
Blocpdb> 22 atoms in block 47
Block first atom: 748
Blocpdb> 17 atoms in block 48
Block first atom: 770
Blocpdb> 19 atoms in block 49
Block first atom: 787
Blocpdb> 20 atoms in block 50
Block first atom: 806
Blocpdb> 13 atoms in block 51
Block first atom: 826
Blocpdb> 16 atoms in block 52
Block first atom: 839
Blocpdb> 13 atoms in block 53
Block first atom: 855
Blocpdb> 17 atoms in block 54
Block first atom: 868
Blocpdb> 14 atoms in block 55
Block first atom: 885
Blocpdb> 22 atoms in block 56
Block first atom: 899
Blocpdb> 16 atoms in block 57
Block first atom: 921
Blocpdb> 20 atoms in block 58
Block first atom: 937
Blocpdb> 16 atoms in block 59
Block first atom: 957
Blocpdb> 14 atoms in block 60
Block first atom: 973
Blocpdb> 10 atoms in block 61
Block first atom: 987
Blocpdb> 16 atoms in block 62
Block first atom: 997
Blocpdb> 22 atoms in block 63
Block first atom: 1013
Blocpdb> 11 atoms in block 64
Block first atom: 1035
Blocpdb> 13 atoms in block 65
Block first atom: 1046
Blocpdb> 12 atoms in block 66
Block first atom: 1059
Blocpdb> 15 atoms in block 67
Block first atom: 1071
Blocpdb> 18 atoms in block 68
Block first atom: 1086
Blocpdb> 12 atoms in block 69
Block first atom: 1104
Blocpdb> 17 atoms in block 70
Block first atom: 1116
Blocpdb> 17 atoms in block 71
Block first atom: 1133
Blocpdb> 17 atoms in block 72
Block first atom: 1150
Blocpdb> 17 atoms in block 73
Block first atom: 1167
Blocpdb> 11 atoms in block 74
Block first atom: 1184
Blocpdb> 17 atoms in block 75
Block first atom: 1195
Blocpdb> 16 atoms in block 76
Block first atom: 1212
Blocpdb> 15 atoms in block 77
Block first atom: 1228
Blocpdb> 20 atoms in block 78
Block first atom: 1243
Blocpdb> 16 atoms in block 79
Block first atom: 1263
Blocpdb> 22 atoms in block 80
Block first atom: 1279
Blocpdb> 16 atoms in block 81
Block first atom: 1301
Blocpdb> 15 atoms in block 82
Block first atom: 1317
Blocpdb> 15 atoms in block 83
Block first atom: 1332
Blocpdb> 15 atoms in block 84
Block first atom: 1347
Blocpdb> 18 atoms in block 85
Block first atom: 1362
Blocpdb> 13 atoms in block 86
Block first atom: 1380
Blocpdb> 12 atoms in block 87
Block first atom: 1393
Blocpdb> 14 atoms in block 88
Block first atom: 1405
Blocpdb> 18 atoms in block 89
Block first atom: 1419
Blocpdb> 16 atoms in block 90
Block first atom: 1437
Blocpdb> 18 atoms in block 91
Block first atom: 1453
Blocpdb> 15 atoms in block 92
Block first atom: 1471
Blocpdb> 18 atoms in block 93
Block first atom: 1486
Blocpdb> 15 atoms in block 94
Block first atom: 1504
Blocpdb> 21 atoms in block 95
Block first atom: 1519
Blocpdb> 15 atoms in block 96
Block first atom: 1540
Blocpdb> 19 atoms in block 97
Block first atom: 1555
Blocpdb> 18 atoms in block 98
Block first atom: 1574
Blocpdb> 20 atoms in block 99
Block first atom: 1592
Blocpdb> 14 atoms in block 100
Block first atom: 1612
Blocpdb> 19 atoms in block 101
Block first atom: 1626
Blocpdb> 16 atoms in block 102
Block first atom: 1645
Blocpdb> 13 atoms in block 103
Block first atom: 1661
Blocpdb> 14 atoms in block 104
Block first atom: 1674
Blocpdb> 15 atoms in block 105
Block first atom: 1688
Blocpdb> 22 atoms in block 106
Block first atom: 1703
Blocpdb> 13 atoms in block 107
Block first atom: 1725
Blocpdb> 22 atoms in block 108
Block first atom: 1738
Blocpdb> 16 atoms in block 109
Block first atom: 1760
Blocpdb> 15 atoms in block 110
Block first atom: 1776
Blocpdb> 19 atoms in block 111
Block first atom: 1791
Blocpdb> 13 atoms in block 112
Block first atom: 1810
Blocpdb> 18 atoms in block 113
Block first atom: 1823
Blocpdb> 17 atoms in block 114
Block first atom: 1841
Blocpdb> 18 atoms in block 115
Block first atom: 1858
Blocpdb> 16 atoms in block 116
Block first atom: 1876
Blocpdb> 9 atoms in block 117
Block first atom: 1892
Blocpdb> 12 atoms in block 118
Block first atom: 1901
Blocpdb> 15 atoms in block 119
Block first atom: 1913
Blocpdb> 15 atoms in block 120
Block first atom: 1928
Blocpdb> 22 atoms in block 121
Block first atom: 1943
Blocpdb> 15 atoms in block 122
Block first atom: 1965
Blocpdb> 17 atoms in block 123
Block first atom: 1980
Blocpdb> 15 atoms in block 124
Block first atom: 1997
Blocpdb> 14 atoms in block 125
Block first atom: 2012
Blocpdb> 15 atoms in block 126
Block first atom: 2026
Blocpdb> 16 atoms in block 127
Block first atom: 2041
Blocpdb> 10 atoms in block 128
Block first atom: 2057
Blocpdb> 17 atoms in block 129
Block first atom: 2067
Blocpdb> 14 atoms in block 130
Block first atom: 2084
Blocpdb> 14 atoms in block 131
Block first atom: 2098
Blocpdb> 15 atoms in block 132
Block first atom: 2112
Blocpdb> 16 atoms in block 133
Block first atom: 2127
Blocpdb> 18 atoms in block 134
Block first atom: 2143
Blocpdb> 19 atoms in block 135
Block first atom: 2161
Blocpdb> 13 atoms in block 136
Block first atom: 2180
Blocpdb> 18 atoms in block 137
Block first atom: 2193
Blocpdb> 19 atoms in block 138
Block first atom: 2211
Blocpdb> 17 atoms in block 139
Block first atom: 2230
Blocpdb> 19 atoms in block 140
Block first atom: 2247
Blocpdb> 20 atoms in block 141
Block first atom: 2266
Blocpdb> 18 atoms in block 142
Block first atom: 2286
Blocpdb> 16 atoms in block 143
Block first atom: 2304
Blocpdb> 16 atoms in block 144
Block first atom: 2320
Blocpdb> 29 atoms in block 145
Block first atom: 2335
Blocpdb> 145 blocks.
Blocpdb> At most, 29 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 852242 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 7092
Prepmat> Matrix trace = 1862240.0000
Prepmat> Last element read: 7092 7092 179.9320
Prepmat> 10586 lines saved.
Prepmat> 9066 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2364
RTB> Total mass = 2364.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 2364
RTB> Number of blocks = 145
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 192353.0811
RTB> 52509 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 870
Diagstd> Nb of non-zero elements: 52509
Diagstd> Projected matrix trace = 192353.0811
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 870 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 192353.0811
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.5801245 2.1079079 2.6407953 3.1322141
3.5468511 3.6064137 4.5958503 4.9684515 5.3893515
7.8349313 8.3169122 9.1089070 9.2990532 10.2535533
10.6554579 10.9361442 11.5828374 12.8119997 12.9002940
13.7004789 13.9425553 14.6598112 15.8099977 16.3616948
16.6882739 17.5635553 18.5552421 19.2728277 19.6752088
20.6904498 22.0388081 22.3287968 23.0579874 23.3172062
23.7848549 24.7523164 25.0125499 25.5875570 27.1254290
27.3653741 27.7953925 28.4829663 29.0290549 29.6807852
30.3413115 31.0210902 31.2557071 31.6759077 32.1674429
33.4075147 34.2492807 35.0975789 35.1948705 35.9394994
36.4258502 37.2343043 37.5611250 38.5651701 38.7005331
39.3932695 40.0852531 40.6786739 41.5967551 41.8744836
42.1924201 42.7183407 44.0105220 44.7150513 45.7654259
46.3948371 47.2620934 48.2456838 49.3798329 49.5467269
50.1410502 50.3693635 50.9044959 52.1666877 52.5598970
53.5973786 54.2406847 54.9366705 55.0924881 55.7079457
56.7586290 57.2496366 57.8052388 58.7335049 59.1324202
59.7640354 60.0867029 61.7366015 61.7965248 62.6971637
63.7769251 63.8440075 65.1430180 65.5147798 66.2416575
66.7321714
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034325 0.0034329 0.0034335 0.0034338 0.0034349
0.0034355 136.5026049 157.6598446 176.4666518 192.1856689
204.5110415 206.2210765 232.7974489 242.0504017 252.0945946
303.9575092 313.1672495 327.7392190 331.1422898 347.7222472
354.4715131 359.1099136 369.5751481 388.6903335 390.0273700
401.9417834 405.4772269 415.7760502 431.7786688 439.2476273
443.6096556 455.0944053 467.7659364 476.7250792 481.6759416
493.9468796 509.7876756 513.1306319 521.4419647 524.3648085
529.5970204 540.2604851 543.0930742 549.3001170 565.5663838
568.0623094 572.5081665 579.5459672 585.0752520 591.6065496
598.1532337 604.8167474 607.0995972 611.1668849 615.8905628
627.6497561 635.5079791 643.3300822 644.2211310 651.0004553
655.3904800 662.6236035 665.5253094 674.3617141 675.5441753
681.5634521 687.5235759 692.5939179 700.3659230 702.7000953
705.3627133 709.7452061 720.3997278 726.1429862 734.6221767
739.6565496 746.5377220 754.2659684 763.0800299 764.3684715
768.9391854 770.6878486 774.7709894 784.3175114 787.2678805
794.9998652 799.7566538 804.8713116 806.0119370 810.5015541
818.1091094 821.6401388 825.6174817 832.2201737 835.0415920
839.4894402 841.7526013 853.2310264 853.6450113 859.8431340
867.2155742 867.6715353 876.4541824 878.9515229 883.8139980
887.0802466
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2364
Rtb_to_modes> Number of blocs = 145
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9938E-10
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.73
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 870 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 42552 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000
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1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00002
1.00000 0.99998 1.00002 0.99996 0.99997
0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001
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1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000
1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3:-0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22031815292778224.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22031815292778224.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22031815292778224.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22031815292778224.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 290
First residue number = 58
Last residue number = 347
Number of atoms found = 2364
Mean number per residue = 8.2
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9990E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.580
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.108
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.641
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.132
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.547
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.606
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.596
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.317
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.25
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.56
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.19
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.73
Bfactors> 106 vectors, 7092 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.580000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.598 for 289 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.033 +/- 0.05
Bfactors> = 86.356 +/- 11.80
Bfactors> Shiftng-fct= 86.323
Bfactors> Scaling-fct= 236.855
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22031815292778224.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22031815292778224.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 401.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 662.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 784.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.0
Chkmod> 106 vectors, 7092 coordinates in file.
Chkmod> That is: 2364 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 51 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8628
0.0034 0.7148
0.0034 0.7756
0.0034 0.8583
0.0034 0.7164
0.0034 0.8031
136.4914 0.2298
157.6565 0.4246
176.4659 0.3265
192.1709 0.1746
204.5066 0.3444
206.2004 0.0959
232.7912 0.1197
242.0290 0.1619
252.0756 0.2148
303.9458 0.5025
313.1555 0.1723
327.7268 0.2240
331.1271 0.3751
347.6471 0.2581
354.5318 0.4122
359.1578 0.3288
369.5140 0.2966
388.6433 0.2719
390.0062 0.2496
401.9175 0.4148
405.4227 0.2977
415.7609 0.3184
431.7602 0.4878
439.2060 0.2375
443.6136 0.4113
455.0288 0.3123
467.8058 0.3990
476.6696 0.4930
481.7139 0.3949
493.9203 0.3775
509.7796 0.2514
513.1224 0.3201
521.4423 0.5278
524.3737 0.2490
529.5202 0.5335
540.2120 0.4213
543.0421 0.4708
549.3028 0.4338
565.5898 0.3229
568.0859 0.4181
572.5310 0.4482
579.4909 0.4129
585.0597 0.5514
591.5733 0.3955
598.1146 0.1718
604.7802 0.2985
607.1152 0.4359
611.1801 0.3290
615.8886 0.4499
627.6462 0.2204
635.4874 0.4017
643.3247 0.2160
644.1489 0.3390
650.9770 0.4422
655.3997 0.4593
662.5569 0.3516
665.4868 0.2968
674.3750 0.2974
675.5105 0.4352
681.5059 0.5111
687.5348 0.1802
692.5755 0.4632
700.3632 0.4111
702.6323 0.4376
705.3122 0.3420
709.7285 0.2648
720.3645 0.3957
726.1520 0.3830
734.6273 0.4546
739.5862 0.5206
746.4891 0.4367
754.2673 0.5343
763.0486 0.3235
764.3609 0.4303
768.8981 0.4091
770.6596 0.4684
774.7035 0.3467
784.3087 0.4945
787.2349 0.5626
794.9852 0.4354
799.7173 0.4384
804.8611 0.5665
805.9591 0.3904
810.4817 0.4409
818.0839 0.4794
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getting mode 7
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normal mode computation
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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getting mode 8
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 1 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 9
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 10
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22031815292778224 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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