CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  01-JUL-21  ***

LOGs for ID: 22031814571370746

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22031814571370746.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22031814571370746.atom to be opened. Openam> File opened: 22031814571370746.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 290 First residue number = 58 Last residue number = 347 Number of atoms found = 2364 Mean number per residue = 8.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = -6.953527 +/- 12.911007 From: -38.456000 To: 21.685000 = 1.683332 +/- 9.659556 From: -29.356000 To: 29.335000 = -3.341817 +/- 13.416106 From: -34.237000 To: 25.174000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.3883 % Filled. Pdbmat> 852223 non-zero elements. Pdbmat> 93126 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.79 +/- 22.87 Maximum number = 128 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 1.862520E+06 Pdbmat> Larger element = 488.181 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 290 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22031814571370746.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22031814571370746.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22031814571370746.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2364 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 290 residues. Blocpdb> 12 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 19 atoms in block 2 Block first atom: 13 Blocpdb> 12 atoms in block 3 Block first atom: 32 Blocpdb> 20 atoms in block 4 Block first atom: 44 Blocpdb> 15 atoms in block 5 Block first atom: 64 Blocpdb> 19 atoms in block 6 Block first atom: 79 Blocpdb> 18 atoms in block 7 Block first atom: 98 Blocpdb> 12 atoms in block 8 Block first atom: 116 Blocpdb> 18 atoms in block 9 Block first atom: 128 Blocpdb> 12 atoms in block 10 Block first atom: 146 Blocpdb> 16 atoms in block 11 Block first atom: 158 Blocpdb> 16 atoms in block 12 Block first atom: 174 Blocpdb> 14 atoms in block 13 Block first atom: 190 Blocpdb> 16 atoms in block 14 Block first atom: 204 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 220 Blocpdb> 20 atoms in block 16 Block first atom: 237 Blocpdb> 17 atoms in block 17 Block first atom: 257 Blocpdb> 15 atoms in block 18 Block first atom: 274 Blocpdb> 15 atoms in block 19 Block first atom: 289 Blocpdb> 20 atoms in block 20 Block first atom: 304 Blocpdb> 19 atoms in block 21 Block first atom: 324 Blocpdb> 16 atoms in block 22 Block first atom: 343 Blocpdb> 12 atoms in block 23 Block first atom: 359 Blocpdb> 13 atoms in block 24 Block first atom: 371 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 384 Blocpdb> 15 atoms in block 26 Block first atom: 400 Blocpdb> 13 atoms in block 27 Block first atom: 415 Blocpdb> 14 atoms in block 28 Block first atom: 428 Blocpdb> 17 atoms in block 29 Block first atom: 442 Blocpdb> 18 atoms in block 30 Block first atom: 459 Blocpdb> 16 atoms in block 31 Block first atom: 477 Blocpdb> 19 atoms in block 32 Block first atom: 493 Blocpdb> 23 atoms in block 33 Block first atom: 512 Blocpdb> 20 atoms in block 34 Block first atom: 535 Blocpdb> 13 atoms in block 35 Block first atom: 555 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 568 Blocpdb> 13 atoms in block 37 Block first atom: 583 Blocpdb> 19 atoms in block 38 Block first atom: 596 Blocpdb> 14 atoms in block 39 Block first atom: 615 Blocpdb> 19 atoms in block 40 Block first atom: 629 Blocpdb> 16 atoms in block 41 Block first atom: 648 Blocpdb> 16 atoms in block 42 Block first atom: 664 Blocpdb> 18 atoms in block 43 Block first atom: 680 Blocpdb> 13 atoms in block 44 Block first atom: 698 Blocpdb> 22 atoms in block 45 Block first atom: 711 Blocpdb> 15 atoms in block 46 Block first atom: 733 Blocpdb> 22 atoms in block 47 Block first atom: 748 Blocpdb> 17 atoms in block 48 Block first atom: 770 Blocpdb> 19 atoms in block 49 Block first atom: 787 Blocpdb> 20 atoms in block 50 Block first atom: 806 Blocpdb> 13 atoms in block 51 Block first atom: 826 Blocpdb> 16 atoms in block 52 Block first atom: 839 Blocpdb> 13 atoms in block 53 Block first atom: 855 Blocpdb> 17 atoms in block 54 Block first atom: 868 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 885 Blocpdb> 22 atoms in block 56 Block first atom: 899 Blocpdb> 16 atoms in block 57 Block first atom: 921 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 937 Blocpdb> 16 atoms in block 59 Block first atom: 957 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 973 Blocpdb> 10 atoms in block 61 Block first atom: 987 Blocpdb> 16 atoms in block 62 Block first atom: 997 Blocpdb> 22 atoms in block 63 Block first atom: 1013 Blocpdb> 11 atoms in block 64 Block first atom: 1035 Blocpdb> 13 atoms in block 65 Block first atom: 1046 Blocpdb> 12 atoms in block 66 Block first atom: 1059 Blocpdb> 15 atoms in block 67 Block first atom: 1071 Blocpdb> 18 atoms in block 68 Block first atom: 1086 Blocpdb> 12 atoms in block 69 Block first atom: 1104 Blocpdb> 17 atoms in block 70 Block first atom: 1116 Blocpdb> 17 atoms in block 71 Block first atom: 1133 Blocpdb> 17 atoms in block 72 Block first atom: 1150 Blocpdb> 17 atoms in block 73 Block first atom: 1167 Blocpdb> 11 atoms in block 74 Block first atom: 1184 Blocpdb> 17 atoms in block 75 Block first atom: 1195 Blocpdb> 16 atoms in block 76 Block first atom: 1212 Blocpdb> 15 atoms in block 77 Block first atom: 1228 Blocpdb> 20 atoms in block 78 Block first atom: 1243 Blocpdb> 16 atoms in block 79 Block first atom: 1263 Blocpdb> 22 atoms in block 80 Block first atom: 1279 Blocpdb> 16 atoms in block 81 Block first atom: 1301 Blocpdb> 15 atoms in block 82 Block first atom: 1317 Blocpdb> 15 atoms in block 83 Block first atom: 1332 Blocpdb> 15 atoms in block 84 Block first atom: 1347 Blocpdb> 18 atoms in block 85 Block first atom: 1362 Blocpdb> 13 atoms in block 86 Block first atom: 1380 Blocpdb> 12 atoms in block 87 Block first atom: 1393 Blocpdb> 14 atoms in block 88 Block first atom: 1405 Blocpdb> 18 atoms in block 89 Block first atom: 1419 Blocpdb> 16 atoms in block 90 Block first atom: 1437 Blocpdb> 18 atoms in block 91 Block first atom: 1453 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1471 Blocpdb> 18 atoms in block 93 Block first atom: 1486 Blocpdb> 15 atoms in block 94 Block first atom: 1504 Blocpdb> 21 atoms in block 95 Block first atom: 1519 Blocpdb> 15 atoms in block 96 Block first atom: 1540 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 1555 Blocpdb> 18 atoms in block 98 Block first atom: 1574 Blocpdb> 20 atoms in block 99 Block first atom: 1592 Blocpdb> 14 atoms in block 100 Block first atom: 1612 Blocpdb> 19 atoms in block 101 Block first atom: 1626 Blocpdb> 16 atoms in block 102 Block first atom: 1645 Blocpdb> 13 atoms in block 103 Block first atom: 1661 Blocpdb> 14 atoms in block 104 Block first atom: 1674 Blocpdb> 15 atoms in block 105 Block first atom: 1688 Blocpdb> 22 atoms in block 106 Block first atom: 1703 Blocpdb> 13 atoms in block 107 Block first atom: 1725 Blocpdb> 22 atoms in block 108 Block first atom: 1738 Blocpdb> 16 atoms in block 109 Block first atom: 1760 Blocpdb> 15 atoms in block 110 Block first atom: 1776 Blocpdb> 19 atoms in block 111 Block first atom: 1791 Blocpdb> 13 atoms in block 112 Block first atom: 1810 Blocpdb> 18 atoms in block 113 Block first atom: 1823 Blocpdb> 17 atoms in block 114 Block first atom: 1841 Blocpdb> 18 atoms in block 115 Block first atom: 1858 Blocpdb> 16 atoms in block 116 Block first atom: 1876 Blocpdb> 9 atoms in block 117 Block first atom: 1892 Blocpdb> 12 atoms in block 118 Block first atom: 1901 Blocpdb> 15 atoms in block 119 Block first atom: 1913 Blocpdb> 15 atoms in block 120 Block first atom: 1928 Blocpdb> 22 atoms in block 121 Block first atom: 1943 Blocpdb> 15 atoms in block 122 Block first atom: 1965 Blocpdb> 17 atoms in block 123 Block first atom: 1980 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 1997 Blocpdb> 14 atoms in block 125 Block first atom: 2012 Blocpdb> 15 atoms in block 126 Block first atom: 2026 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 2041 Blocpdb> 10 atoms in block 128 Block first atom: 2057 Blocpdb> 17 atoms in block 129 Block first atom: 2067 Blocpdb> 14 atoms in block 130 Block first atom: 2084 Blocpdb> 14 atoms in block 131 Block first atom: 2098 Blocpdb> 15 atoms in block 132 Block first atom: 2112 Blocpdb> 16 atoms in block 133 Block first atom: 2127 Blocpdb> 18 atoms in block 134 Block first atom: 2143 Blocpdb> 19 atoms in block 135 Block first atom: 2161 Blocpdb> 13 atoms in block 136 Block first atom: 2180 Blocpdb> 18 atoms in block 137 Block first atom: 2193 Blocpdb> 19 atoms in block 138 Block first atom: 2211 Blocpdb> 17 atoms in block 139 Block first atom: 2230 Blocpdb> 19 atoms in block 140 Block first atom: 2247 Blocpdb> 20 atoms in block 141 Block first atom: 2266 Blocpdb> 18 atoms in block 142 Block first atom: 2286 Blocpdb> 16 atoms in block 143 Block first atom: 2304 Blocpdb> 16 atoms in block 144 Block first atom: 2320 Blocpdb> 29 atoms in block 145 Block first atom: 2335 Blocpdb> 145 blocks. Blocpdb> At most, 29 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 9 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 852368 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 7092 Prepmat> Matrix trace = 1862520.0000 Prepmat> Last element read: 7092 7092 263.2494 Prepmat> 10586 lines saved. Prepmat> 9065 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2364 RTB> Total mass = 2364.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2364 RTB> Number of blocks = 145 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 192411.8634 RTB> 52545 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 870 Diagstd> Nb of non-zero elements: 52545 Diagstd> Projected matrix trace = 192411.8634 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 870 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 192411.8634 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.5833423 2.1117835 2.6317005 3.1358780 3.5395783 3.5994458 4.5801649 4.9628961 5.3678062 7.8077664 8.3246373 9.1033076 9.3067403 10.2655688 10.6574570 10.9355750 11.5879281 12.8127465 12.8937216 13.7129089 13.9328341 14.6564073 15.8338180 16.3764433 16.6973822 17.5680708 18.5534753 19.2640535 19.6887700 20.6534830 22.0329582 22.3180063 23.0573528 23.3210967 23.8322988 24.7498273 25.0206473 25.6001866 27.1191271 27.3780068 27.8173882 28.4879561 29.0017226 29.6788796 30.3391564 31.0276263 31.2823659 31.6915131 32.1615728 33.4060730 34.2472188 35.1467260 35.2152325 35.9722445 36.4305864 37.2999002 37.5267773 38.5390066 38.6842419 39.4865390 40.0872961 40.6669458 41.5888329 41.8633387 42.1921053 42.7404344 43.9664345 44.6829097 45.7563457 46.3954225 47.2429772 48.2091650 49.3674288 49.5691517 50.1027978 50.3787720 50.8892185 52.1197402 52.5538805 53.5926652 54.3030625 54.9552663 55.0970887 55.7350629 56.7335442 57.2733825 57.8250182 58.7248607 59.0599041 59.6891615 60.0723697 61.7268465 61.7986832 62.6555928 63.8417435 63.9614197 65.1608965 65.5520015 66.2551668 66.7138143 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034313 0.0034317 0.0034332 0.0034335 0.0034353 0.0034371 136.6415230 157.8047142 176.1625207 192.2980413 204.3012587 206.0217644 232.3998459 241.9150410 251.5901853 303.4301186 313.3126582 327.6384701 331.2791314 347.9259245 354.5047633 359.1005682 369.6563547 388.7016620 389.9280029 402.1240752 405.3358468 415.7277771 432.1038188 439.4455526 443.7306977 455.1529028 467.7436658 476.6165493 481.8419111 493.5054247 509.7200125 513.0066302 521.4347883 524.4085513 530.1249536 540.2333200 543.1809754 549.4356631 565.5006827 568.1934118 572.7346463 579.5967295 584.7997489 591.5875573 598.1319906 604.8804615 607.3584472 611.3174144 615.8343647 627.6362130 635.4888492 643.7803524 644.4074615 651.2969565 655.4330871 663.2070212 665.2209459 674.1329242 675.4019739 682.3698268 687.5410965 692.4940695 700.2992270 702.6065773 705.3600820 709.9287207 720.0388079 725.8819604 734.5492955 739.6612165 746.3867300 753.9804499 762.9841819 764.5414282 768.6458192 770.7598242 774.6547190 783.9645078 787.2228196 794.9649080 800.2163889 805.0075225 806.0455898 810.6987961 817.9283054 821.8105203 825.7587215 832.1589301 834.5294147 838.9634084 841.6521990 853.1636146 853.6599187 859.5580300 867.6561507 868.4690133 876.5744455 879.2011726 883.9041158 886.9582267 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2364 Rtb_to_modes> Number of blocs = 145 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9845E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9866E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0018E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.583 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.112 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.632 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.136 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.540 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.599 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.580 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.963 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.368 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.808 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.325 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.103 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.307 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.71 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 870 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99996 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 0.99997 1.00002 1.00002 1.00002 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 1.00005 1.00000 0.99999 1.00002 0.99996 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00004 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 42552 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99996 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 0.99997 0.99997 1.00002 1.00002 1.00002 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 1.00005 1.00000 0.99999 1.00002 0.99996 1.00001 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00004 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99997 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22031814571370746.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22031814571370746.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22031814571370746.atom Openam> file on opening on unit 11: 22031814571370746.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 290 First residue number = 58 Last residue number = 347 Number of atoms found = 2364 Mean number per residue = 8.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9845E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9866E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0018E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.583 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.112 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.632 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.136 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.540 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.599 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.580 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.963 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.368 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.808 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.325 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.103 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.307 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.71 Bfactors> 106 vectors, 7092 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.583000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.597 for 289 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.033 +/- 0.05 Bfactors> = 86.356 +/- 11.80 Bfactors> Shiftng-fct= 86.323 Bfactors> Scaling-fct= 236.426 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22031814571370746.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22031814571370746.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4312E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4369E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 157.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 432.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 810.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 838.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.9 Chkmod> 106 vectors, 7092 coordinates in file. Chkmod> That is: 2364 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 48 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7124 0.0034 0.8976 0.0034 0.9083 0.0034 0.9831 0.0034 0.7024 0.0034 0.8465 136.6209 0.2279 157.8060 0.4256 176.1650 0.3249 192.2935 0.1724 204.3047 0.3387 206.0002 0.0953 232.3857 0.1190 241.9072 0.1667 251.5839 0.2179 303.4216 0.5002 313.3060 0.1708 327.6189 0.2228 331.2695 0.3752 347.9861 0.2544 354.5318 0.4156 359.1578 0.3330 369.6735 0.2937 388.6433 0.2468 389.8550 0.2868 402.0642 0.4167 405.2772 0.2974 415.7609 0.3194 432.0332 0.4944 439.4744 0.2348 443.7464 0.4151 455.1584 0.3109 467.6798 0.4086 476.5459 0.4937 481.8363 0.3716 493.4426 0.3838 509.6639 0.2569 513.0075 0.3165 521.4423 0.5222 524.3737 0.2549 530.0766 0.5354 540.2120 0.4225 543.1506 0.4615 549.4101 0.4257 565.4855 0.3135 568.1897 0.4198 572.7369 0.4510 579.5926 0.4124 584.7573 0.5465 591.5733 0.3975 598.1146 0.1742 604.8776 0.2998 607.3094 0.4138 611.2766 0.3434 615.7929 0.4511 627.6462 0.2202 635.4874 0.4043 643.7827 0.1748 644.4234 0.3730 651.2487 0.4418 655.3997 0.4528 663.1794 0.3361 665.2210 0.2970 674.1127 0.3248 675.3360 0.4635 682.3704 0.5123 687.5348 0.1784 692.4903 0.4710 700.2790 0.4184 702.5484 0.4344 705.3122 0.3434 709.8946 0.2598 720.0371 0.3998 725.8272 0.3803 734.5471 0.4555 739.6660 0.5237 746.3312 0.4331 753.9546 0.5292 762.9713 0.3439 764.5152 0.4166 768.5914 0.4047 770.7361 0.4714 774.6274 0.3423 783.9328 0.4955 787.1600 0.5597 794.9110 0.4327 800.1595 0.4486 805.0076 0.5616 806.0323 0.3977 810.6999 0.4448 817.8676 0.4861 821.7510 0.4357 825.7588 0.4958 832.0888 0.3546 834.4943 0.3830 838.9333 0.5712 841.5995 0.4498 853.1488 0.3625 853.6324 0.4448 859.5514 0.5001 867.6071 0.4819 868.4221 0.5424 876.5308 0.4493 879.1500 0.3102 883.8984 0.4222 886.8948 0.5408 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22031814571370746 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom making animated gifs 11 models are in 22031814571370746.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031814571370746.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031814571370746.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22031814571370746 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom making animated gifs 11 models are in 22031814571370746.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031814571370746.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031814571370746.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22031814571370746 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom making animated gifs 11 models are in 22031814571370746.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031814571370746.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031814571370746.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 22031814571370746 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom making animated gifs 11 models are in 22031814571370746.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031814571370746.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031814571370746.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 22031814571370746 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031814571370746.eigenfacs 22031814571370746.atom making animated gifs 11 models are in 22031814571370746.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031814571370746.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031814571370746.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 22031814571370746.10.pdb 22031814571370746.11.pdb 22031814571370746.7.pdb 22031814571370746.8.pdb 22031814571370746.9.pdb STDERR: real 0m9.881s user 0m9.828s sys 0m0.048s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.