*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22031716075569948.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22031716075569948.atom to be opened.
Openam> File opened: 22031716075569948.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 57
First residue number = 3
Last residue number = 207
Number of atoms found = 423
Mean number per residue = 7.4
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 6.109317 +/- 5.680374 From: -8.078000 To: 17.576000
= 38.617097 +/- 6.438463 From: 22.755000 To: 54.032000
= 121.455078 +/- 7.303324 From: 107.489000 To: 138.108000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 7 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 15.4674 % Filled.
Pdbmat> 124639 non-zero elements.
Pdbmat> 13569 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 64.16 +/- 21.82
Maximum number = 122
Minimum number = 13
Pdbmat> Matrix trace = 271380.
Pdbmat> Larger element = 435.377
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
57 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22031716075569948.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22031716075569948.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22031716075569948.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 423 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 57 residues.
Blocpdb> 6 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 8 atoms in block 2
Block first atom: 7
Blocpdb> 8 atoms in block 3
Block first atom: 15
Blocpdb> 9 atoms in block 4
Block first atom: 23
Blocpdb> 9 atoms in block 5
Block first atom: 32
Blocpdb> 7 atoms in block 6
Block first atom: 41
Blocpdb> 9 atoms in block 7
Block first atom: 48
Blocpdb> 9 atoms in block 8
Block first atom: 57
Blocpdb> 4 atoms in block 9
Block first atom: 66
Blocpdb> 8 atoms in block 10
Block first atom: 70
Blocpdb> 8 atoms in block 11
Block first atom: 78
Blocpdb> 9 atoms in block 12
Block first atom: 86
Blocpdb> 11 atoms in block 13
Block first atom: 95
Blocpdb> 9 atoms in block 14
Block first atom: 106
Blocpdb> 6 atoms in block 15
Block first atom: 115
Blocpdb> 8 atoms in block 16
Block first atom: 121
Blocpdb> 9 atoms in block 17
Block first atom: 129
Blocpdb> 9 atoms in block 18
Block first atom: 138
Blocpdb> 8 atoms in block 19
Block first atom: 147
Blocpdb> 6 atoms in block 20
Block first atom: 155
Blocpdb> 8 atoms in block 21
Block first atom: 161
Blocpdb> 9 atoms in block 22
Block first atom: 169
Blocpdb> 9 atoms in block 23
Block first atom: 178
Blocpdb> 9 atoms in block 24
Block first atom: 187
Blocpdb> 5 atoms in block 25
Block first atom: 196
Blocpdb> 11 atoms in block 26
Block first atom: 201
Blocpdb> 9 atoms in block 27
Block first atom: 212
Blocpdb> 7 atoms in block 28
Block first atom: 221
Blocpdb> 11 atoms in block 29
Block first atom: 228
Blocpdb> 9 atoms in block 30
Block first atom: 239
Blocpdb> 8 atoms in block 31
Block first atom: 248
Blocpdb> 8 atoms in block 32
Block first atom: 256
Blocpdb> 7 atoms in block 33
Block first atom: 264
Blocpdb> 9 atoms in block 34
Block first atom: 271
Blocpdb> 7 atoms in block 35
Block first atom: 280
Blocpdb> 8 atoms in block 36
Block first atom: 287
Blocpdb> 12 atoms in block 37
Block first atom: 295
Blocpdb> 11 atoms in block 38
Block first atom: 307
Blocpdb> 12 atoms in block 39
Block first atom: 318
Blocpdb> 7 atoms in block 40
Block first atom: 330
Blocpdb> 9 atoms in block 41
Block first atom: 337
Blocpdb> 12 atoms in block 42
Block first atom: 346
Blocpdb> 8 atoms in block 43
Block first atom: 358
Blocpdb> 7 atoms in block 44
Block first atom: 366
Blocpdb> 8 atoms in block 45
Block first atom: 373
Blocpdb> 7 atoms in block 46
Block first atom: 381
Blocpdb> 8 atoms in block 47
Block first atom: 388
Blocpdb> 9 atoms in block 48
Block first atom: 396
Blocpdb> 6 atoms in block 49
Block first atom: 405
Blocpdb> 6 atoms in block 50
Block first atom: 411
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 51 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 417th, in residue A 201
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 51 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 418th, in residue A 202
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 3 atoms in block 51
Block first atom: 417
%Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 52 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 420th, in residue A 204
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
%Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 52 i.e., less than what is required for a rigid body.
%Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 421th, in residue A 205
%Blocpdb-Wn> It will be merged with next block.
Blocpdb> 4 atoms in block 52
Block first atom: 419
Blocpdb> 52 blocks.
Blocpdb> At most, 12 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 124691 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 1269
Prepmat> Matrix trace = 271380.0000
Prepmat> Last element read: 1269 1269 105.2764
Prepmat> 1379 lines saved.
Prepmat> 889 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 423
RTB> Total mass = 423.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 423
RTB> Number of blocks = 52
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 58611.2753
RTB> 16824 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 312
Diagstd> Nb of non-zero elements: 16824
Diagstd> Projected matrix trace = 58611.2753
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 312 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 58611.2753
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 2.7665822 3.4038731 4.7020926 5.3582297
7.3560314 8.1639424 9.4913122 10.4739544 12.3997589
14.5432170 15.9769669 17.0774298 18.0081154 20.0175150
22.5712732 24.3175405 26.4463172 28.1316029 30.9631164
33.5000009 36.5377415 37.5320916 39.6837151 41.7317486
43.4045456 45.7882968 46.9277519 47.5066131 48.7630449
50.4154247 52.0130405 54.2057604 55.8208268 57.5034323
59.2946851 60.4105789 61.5532637 61.9524558 63.5626637
64.8590164 66.8088453 67.6405425 70.3419831 71.5857957
72.0050780 72.6615804 73.6899563 76.1608652 76.8991630
78.8536324 79.5556441 80.1860967 81.5257520 82.4218897
83.4155796 84.9826300 85.2591547 87.2250313 87.5498559
88.0105511 89.7341253 90.6739089 93.0715521 94.2414389
94.7699346 95.1115771 96.5684774 98.6018576 99.4820310
100.8147442 101.6874634 104.5543051 105.3390918 106.8586348
107.6358288 109.4887788 109.9596940 111.0321979 112.6822043
114.2871379 116.6664374 117.7416003 119.5264131 120.3404743
120.8416809 122.7240485 123.8611562 124.0744193 126.6116063
127.8985431 128.4614822 128.8419267 129.6089387 131.0903496
131.9903521 133.1120423 133.6602375 134.8188492 136.5220628
138.1978995
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034328 0.0034331 0.0034335 0.0034337 0.0034339
0.0034343 180.6205135 200.3465929 235.4728656 251.3656579
294.5215442 310.2739006 334.5479775 351.4395386 382.3859272
414.1193486 434.0526859 448.7521414 460.8179768 485.8479358
515.9092434 535.4946102 558.4417532 575.9602602 604.2513277
628.5179559 656.3963078 665.2680458 684.0714132 701.5014479
715.4229823 734.8057144 743.8924568 748.4664106 758.2993579
771.0401536 783.1616290 799.4991398 811.3222994 823.4593483
836.1865235 844.0181367 851.9631743 854.7213326 865.7576242
874.5415728 887.5897192 893.0973925 910.7571393 918.7740251
921.4607541 925.6519066 932.1792464 947.6789078 952.2611940
964.2866008 968.5694759 972.3997016 980.4889128 985.8629916
991.7880384 1001.0605894 1002.6879401 1014.1818805 1016.0685245
1018.7383385 1028.6653167 1034.0378819 1047.6199457 1054.1835489
1057.1352892 1059.0390443 1067.1192940 1078.2955889 1083.0976209
1090.3283550 1095.0374882 1110.3662179 1114.5256431 1122.5355171
1126.6102802 1136.2661951 1138.7071343 1144.2469110 1152.7176614
1160.8977210 1172.9196128 1178.3118557 1187.2091189 1191.2451344
1193.7232677 1202.9847365 1208.5450534 1209.5850374 1221.8898006
1228.0840161 1230.7837245 1232.6048876 1236.2683687 1243.3134764
1247.5741685 1252.8640671 1255.4412508 1260.8708027 1268.8103162
1276.5740188
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 423
Rtb_to_modes> Number of blocs = 52
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.767
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.404
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.702
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.358
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.356
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.164
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.491
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.2
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 312 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00002 0.99998 0.99997 1.00002
1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002
0.99995 0.99998 0.99998 1.00001 0.99995
0.99997 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001
1.00002 1.00004 1.00000 1.00001 1.00005
0.99999 0.99998 0.99995 1.00002 0.99999
0.99999 1.00003 0.99998 1.00002 0.99998
0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997
1.00002 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001
0.99999 0.99995 1.00000 0.99997 1.00003
1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 0.99995
0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001
1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00005
0.99999 1.00000 0.99996 1.00001 0.99999
0.99995 1.00004 1.00002 1.00000 1.00002
0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997
1.00005 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001
0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 0.99996
1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99996
1.00003
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 7614 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00002 0.99998 0.99997 1.00002
1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002
0.99995 0.99998 0.99998 1.00001 0.99995
0.99997 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001
1.00002 1.00004 1.00000 1.00001 1.00005
0.99999 0.99998 0.99995 1.00002 0.99999
0.99999 1.00003 0.99998 1.00002 0.99998
0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997
1.00002 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001
0.99999 0.99995 1.00000 0.99997 1.00003
1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 0.99995
0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001
1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00005
0.99999 1.00000 0.99996 1.00001 0.99999
0.99995 1.00004 1.00002 1.00000 1.00002
0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997
1.00005 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001
0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 0.99996
1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99996
1.00003
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22031716075569948.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22031716075569948.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22031716075569948.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22031716075569948.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 57
First residue number = 3
Last residue number = 207
Number of atoms found = 423
Mean number per residue = 7.4
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.767
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.404
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.702
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.358
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.356
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.164
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.491
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.2
Bfactors> 106 vectors, 1269 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.767000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.143 for 57 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.090 +/- 0.14
Bfactors> = 5.956 +/- 14.92
Bfactors> Shiftng-fct= 5.866
Bfactors> Scaling-fct= 110.061
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22031716075569948.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22031716075569948.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 991.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1019.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1034.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1054.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1057.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1067.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1083.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1111.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1114.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1123.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1139.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1144.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1153.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1161.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1173.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1178.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1191.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1203.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1210.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1222.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1228.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1231.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1232.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1236.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1248.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1253.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1256.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1261.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1269.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277.
Chkmod> 106 vectors, 1269 coordinates in file.
Chkmod> That is: 423 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 11 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 25 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 44 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 47 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 55 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 81 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 105 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7036
0.0034 0.9514
0.0034 0.6657
0.0034 0.7937
0.0034 0.8124
0.0034 0.7893
180.6264 0.2145
200.3417 0.2004
235.4604 0.2838
251.3495 0.2967
294.5083 0.1446
310.2617 0.0968
334.5281 0.4298
351.3581 0.1122
382.3732 0.2009
414.0558 0.3239
434.0753 0.2093
448.7666 0.4813
460.8223 0.4246
485.8572 0.3179
515.8725 0.2500
535.4987 0.2152
558.4567 0.2039
575.9191 0.4025
604.1950 0.3559
628.4910 0.3865
656.3884 0.1732
665.2210 0.4716
684.0100 0.1915
701.4566 0.4922
715.3548 0.4184
734.7878 0.3625
743.8783 0.2593
748.4610 0.3202
758.2431 0.4689
771.0420 0.4678
783.1051 0.1697
799.4961 0.4186
811.2815 0.5713
823.3994 0.3860
836.1176 0.3089
843.9779 0.2330
851.9040 0.3059
854.6677 0.3194
865.7023 0.2716
874.5107 0.3319
887.5593 0.3791
893.0555 0.2342
910.7052 0.3024
918.7616 0.3747
921.4527 0.1788
925.6021 0.3052
932.1395 0.3421
947.6328 0.2361
952.2255 0.1269
964.2230 0.2962
968.5544 0.1710
972.3816 0.3243
980.4724 0.4141
985.8094 0.3378
991.7717 0.2695
1001.0021 0.3977
1002.6499 0.3269
1014.1672 0.1966
1016.0257 0.3203
1018.6914 0.4791
1028.5975 0.4036
1033.9712 0.4303
1047.5662 0.4094
1054.1302 0.3083
1057.0903 0.3943
1058.9848 0.4243
1067.0819 0.2105
1078.2391 0.4694
1083.0401 0.5093
1090.2018 0.4756
1095.0580 0.2574
1110.5612 0.4475
1114.2710 0.3825
1122.7046 0.3092
1126.3744 0.4472
1136.2756 0.3928
1138.8669 0.5023
1144.0319 0.3454
1152.7592 0.4541
1160.9132 0.4529
1173.0380 0.4398
1178.0531 0.5526
1187.0270 0.5548
1190.9937 0.2714
1193.4661 0.3862
1202.8152 0.4251
1208.6827 0.4108
1209.6578 0.5336
1221.7813 0.5029
1228.0383 0.4339
1230.9154 0.4394
1232.3514 0.4905
1236.1727 0.3990
1243.3059 0.4126
1247.5662 0.4255
1252.7536 0.2353
1255.5741 0.4102
1260.7285 0.4602
1268.6533 0.4108
1276.5289 0.2420
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22031716075569948 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
making animated gifs
11 models are in 22031716075569948.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22031716075569948.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22031716075569948.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 22031716075569948 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
making animated gifs
11 models are in 22031716075569948.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22031716075569948.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22031716075569948.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 22031716075569948 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
making animated gifs
11 models are in 22031716075569948.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22031716075569948.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22031716075569948.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 22031716075569948 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
making animated gifs
11 models are in 22031716075569948.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22031716075569948.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22031716075569948.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22031716075569948 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22031716075569948.eigenfacs
22031716075569948.atom
making animated gifs
11 models are in 22031716075569948.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22031716075569948.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22031716075569948.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
22031716075569948.10.pdb
22031716075569948.11.pdb
22031716075569948.7.pdb
22031716075569948.8.pdb
22031716075569948.9.pdb
STDERR:
real 0m0.563s
user 0m0.556s
sys 0m0.004s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|
