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LOGs for ID: 22031716075569948

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22031716075569948.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22031716075569948.atom to be opened. Openam> File opened: 22031716075569948.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 57 First residue number = 3 Last residue number = 207 Number of atoms found = 423 Mean number per residue = 7.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = 6.109317 +/- 5.680374 From: -8.078000 To: 17.576000 = 38.617097 +/- 6.438463 From: 22.755000 To: 54.032000 = 121.455078 +/- 7.303324 From: 107.489000 To: 138.108000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 7 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 15.4674 % Filled. Pdbmat> 124639 non-zero elements. Pdbmat> 13569 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 64.16 +/- 21.82 Maximum number = 122 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 271380. Pdbmat> Larger element = 435.377 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 57 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22031716075569948.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22031716075569948.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22031716075569948.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 423 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 57 residues. Blocpdb> 6 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 8 atoms in block 2 Block first atom: 7 Blocpdb> 8 atoms in block 3 Block first atom: 15 Blocpdb> 9 atoms in block 4 Block first atom: 23 Blocpdb> 9 atoms in block 5 Block first atom: 32 Blocpdb> 7 atoms in block 6 Block first atom: 41 Blocpdb> 9 atoms in block 7 Block first atom: 48 Blocpdb> 9 atoms in block 8 Block first atom: 57 Blocpdb> 4 atoms in block 9 Block first atom: 66 Blocpdb> 8 atoms in block 10 Block first atom: 70 Blocpdb> 8 atoms in block 11 Block first atom: 78 Blocpdb> 9 atoms in block 12 Block first atom: 86 Blocpdb> 11 atoms in block 13 Block first atom: 95 Blocpdb> 9 atoms in block 14 Block first atom: 106 Blocpdb> 6 atoms in block 15 Block first atom: 115 Blocpdb> 8 atoms in block 16 Block first atom: 121 Blocpdb> 9 atoms in block 17 Block first atom: 129 Blocpdb> 9 atoms in block 18 Block first atom: 138 Blocpdb> 8 atoms in block 19 Block first atom: 147 Blocpdb> 6 atoms in block 20 Block first atom: 155 Blocpdb> 8 atoms in block 21 Block first atom: 161 Blocpdb> 9 atoms in block 22 Block first atom: 169 Blocpdb> 9 atoms in block 23 Block first atom: 178 Blocpdb> 9 atoms in block 24 Block first atom: 187 Blocpdb> 5 atoms in block 25 Block first atom: 196 Blocpdb> 11 atoms in block 26 Block first atom: 201 Blocpdb> 9 atoms in block 27 Block first atom: 212 Blocpdb> 7 atoms in block 28 Block first atom: 221 Blocpdb> 11 atoms in block 29 Block first atom: 228 Blocpdb> 9 atoms in block 30 Block first atom: 239 Blocpdb> 8 atoms in block 31 Block first atom: 248 Blocpdb> 8 atoms in block 32 Block first atom: 256 Blocpdb> 7 atoms in block 33 Block first atom: 264 Blocpdb> 9 atoms in block 34 Block first atom: 271 Blocpdb> 7 atoms in block 35 Block first atom: 280 Blocpdb> 8 atoms in block 36 Block first atom: 287 Blocpdb> 12 atoms in block 37 Block first atom: 295 Blocpdb> 11 atoms in block 38 Block first atom: 307 Blocpdb> 12 atoms in block 39 Block first atom: 318 Blocpdb> 7 atoms in block 40 Block first atom: 330 Blocpdb> 9 atoms in block 41 Block first atom: 337 Blocpdb> 12 atoms in block 42 Block first atom: 346 Blocpdb> 8 atoms in block 43 Block first atom: 358 Blocpdb> 7 atoms in block 44 Block first atom: 366 Blocpdb> 8 atoms in block 45 Block first atom: 373 Blocpdb> 7 atoms in block 46 Block first atom: 381 Blocpdb> 8 atoms in block 47 Block first atom: 388 Blocpdb> 9 atoms in block 48 Block first atom: 396 Blocpdb> 6 atoms in block 49 Block first atom: 405 Blocpdb> 6 atoms in block 50 Block first atom: 411 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 51 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 417th, in residue A 201 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 51 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 418th, in residue A 202 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 3 atoms in block 51 Block first atom: 417 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 52 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 420th, in residue A 204 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 52 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 421th, in residue A 205 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 52 Block first atom: 419 Blocpdb> 52 blocks. Blocpdb> At most, 12 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 124691 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 1269 Prepmat> Matrix trace = 271380.0000 Prepmat> Last element read: 1269 1269 105.2764 Prepmat> 1379 lines saved. Prepmat> 889 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 423 RTB> Total mass = 423.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 423 RTB> Number of blocks = 52 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 58611.2753 RTB> 16824 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 312 Diagstd> Nb of non-zero elements: 16824 Diagstd> Projected matrix trace = 58611.2753 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 312 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 58611.2753 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.7665822 3.4038731 4.7020926 5.3582297 7.3560314 8.1639424 9.4913122 10.4739544 12.3997589 14.5432170 15.9769669 17.0774298 18.0081154 20.0175150 22.5712732 24.3175405 26.4463172 28.1316029 30.9631164 33.5000009 36.5377415 37.5320916 39.6837151 41.7317486 43.4045456 45.7882968 46.9277519 47.5066131 48.7630449 50.4154247 52.0130405 54.2057604 55.8208268 57.5034323 59.2946851 60.4105789 61.5532637 61.9524558 63.5626637 64.8590164 66.8088453 67.6405425 70.3419831 71.5857957 72.0050780 72.6615804 73.6899563 76.1608652 76.8991630 78.8536324 79.5556441 80.1860967 81.5257520 82.4218897 83.4155796 84.9826300 85.2591547 87.2250313 87.5498559 88.0105511 89.7341253 90.6739089 93.0715521 94.2414389 94.7699346 95.1115771 96.5684774 98.6018576 99.4820310 100.8147442 101.6874634 104.5543051 105.3390918 106.8586348 107.6358288 109.4887788 109.9596940 111.0321979 112.6822043 114.2871379 116.6664374 117.7416003 119.5264131 120.3404743 120.8416809 122.7240485 123.8611562 124.0744193 126.6116063 127.8985431 128.4614822 128.8419267 129.6089387 131.0903496 131.9903521 133.1120423 133.6602375 134.8188492 136.5220628 138.1978995 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034328 0.0034331 0.0034335 0.0034337 0.0034339 0.0034343 180.6205135 200.3465929 235.4728656 251.3656579 294.5215442 310.2739006 334.5479775 351.4395386 382.3859272 414.1193486 434.0526859 448.7521414 460.8179768 485.8479358 515.9092434 535.4946102 558.4417532 575.9602602 604.2513277 628.5179559 656.3963078 665.2680458 684.0714132 701.5014479 715.4229823 734.8057144 743.8924568 748.4664106 758.2993579 771.0401536 783.1616290 799.4991398 811.3222994 823.4593483 836.1865235 844.0181367 851.9631743 854.7213326 865.7576242 874.5415728 887.5897192 893.0973925 910.7571393 918.7740251 921.4607541 925.6519066 932.1792464 947.6789078 952.2611940 964.2866008 968.5694759 972.3997016 980.4889128 985.8629916 991.7880384 1001.0605894 1002.6879401 1014.1818805 1016.0685245 1018.7383385 1028.6653167 1034.0378819 1047.6199457 1054.1835489 1057.1352892 1059.0390443 1067.1192940 1078.2955889 1083.0976209 1090.3283550 1095.0374882 1110.3662179 1114.5256431 1122.5355171 1126.6102802 1136.2661951 1138.7071343 1144.2469110 1152.7176614 1160.8977210 1172.9196128 1178.3118557 1187.2091189 1191.2451344 1193.7232677 1202.9847365 1208.5450534 1209.5850374 1221.8898006 1228.0840161 1230.7837245 1232.6048876 1236.2683687 1243.3134764 1247.5741685 1252.8640671 1255.4412508 1260.8708027 1268.8103162 1276.5740188 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 423 Rtb_to_modes> Number of blocs = 52 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.767 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.404 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.702 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.358 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.356 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.164 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.491 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.2 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 312 coordinates in vector file. 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00002 0.99998 0.99997 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99995 0.99998 0.99998 1.00001 0.99995 0.99997 0.99998 1.00001 0.99998 1.00001 1.00002 1.00004 1.00000 1.00001 1.00005 0.99999 0.99998 0.99995 1.00002 0.99999 0.99999 1.00003 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99997 1.00002 1.00000 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999 0.99995 1.00000 0.99997 1.00003 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 0.99995 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 1.00003 1.00005 0.99999 1.00000 0.99996 1.00001 0.99999 0.99995 1.00004 1.00002 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00005 1.00000 1.00001 0.99998 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00003 0.99997 0.99999 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99996 1.00003 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22031716075569948.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22031716075569948.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22031716075569948.atom Openam> file on opening on unit 11: 22031716075569948.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 57 First residue number = 3 Last residue number = 207 Number of atoms found = 423 Mean number per residue = 7.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.767 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.404 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.702 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.358 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.356 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.164 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.491 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.2 Bfactors> 106 vectors, 1269 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.767000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.143 for 57 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.090 +/- 0.14 Bfactors> = 5.956 +/- 14.92 Bfactors> Shiftng-fct= 5.866 Bfactors> Scaling-fct= 110.061 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22031716075569948.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22031716075569948.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 334.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 851.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 991.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1014. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1019. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1034. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1054. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1057. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1067. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1078. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1083. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1111. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1114. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1123. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1139. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1144. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1153. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1161. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1173. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1178. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1191. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1203. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1210. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1222. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1228. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1231. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1232. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1236. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1243. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1248. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1253. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1256. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1261. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1269. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277. Chkmod> 106 vectors, 1269 coordinates in file. Chkmod> That is: 423 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 11 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 21 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 25 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 44 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 47 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 55 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 81 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 105 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7036 0.0034 0.9514 0.0034 0.6657 0.0034 0.7937 0.0034 0.8124 0.0034 0.7893 180.6264 0.2145 200.3417 0.2004 235.4604 0.2838 251.3495 0.2967 294.5083 0.1446 310.2617 0.0968 334.5281 0.4298 351.3581 0.1122 382.3732 0.2009 414.0558 0.3239 434.0753 0.2093 448.7666 0.4813 460.8223 0.4246 485.8572 0.3179 515.8725 0.2500 535.4987 0.2152 558.4567 0.2039 575.9191 0.4025 604.1950 0.3559 628.4910 0.3865 656.3884 0.1732 665.2210 0.4716 684.0100 0.1915 701.4566 0.4922 715.3548 0.4184 734.7878 0.3625 743.8783 0.2593 748.4610 0.3202 758.2431 0.4689 771.0420 0.4678 783.1051 0.1697 799.4961 0.4186 811.2815 0.5713 823.3994 0.3860 836.1176 0.3089 843.9779 0.2330 851.9040 0.3059 854.6677 0.3194 865.7023 0.2716 874.5107 0.3319 887.5593 0.3791 893.0555 0.2342 910.7052 0.3024 918.7616 0.3747 921.4527 0.1788 925.6021 0.3052 932.1395 0.3421 947.6328 0.2361 952.2255 0.1269 964.2230 0.2962 968.5544 0.1710 972.3816 0.3243 980.4724 0.4141 985.8094 0.3378 991.7717 0.2695 1001.0021 0.3977 1002.6499 0.3269 1014.1672 0.1966 1016.0257 0.3203 1018.6914 0.4791 1028.5975 0.4036 1033.9712 0.4303 1047.5662 0.4094 1054.1302 0.3083 1057.0903 0.3943 1058.9848 0.4243 1067.0819 0.2105 1078.2391 0.4694 1083.0401 0.5093 1090.2018 0.4756 1095.0580 0.2574 1110.5612 0.4475 1114.2710 0.3825 1122.7046 0.3092 1126.3744 0.4472 1136.2756 0.3928 1138.8669 0.5023 1144.0319 0.3454 1152.7592 0.4541 1160.9132 0.4529 1173.0380 0.4398 1178.0531 0.5526 1187.0270 0.5548 1190.9937 0.2714 1193.4661 0.3862 1202.8152 0.4251 1208.6827 0.4108 1209.6578 0.5336 1221.7813 0.5029 1228.0383 0.4339 1230.9154 0.4394 1232.3514 0.4905 1236.1727 0.3990 1243.3059 0.4126 1247.5662 0.4255 1252.7536 0.2353 1255.5741 0.4102 1260.7285 0.4602 1268.6533 0.4108 1276.5289 0.2420 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22031716075569948 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031716075569948.eigenfacs 22031716075569948.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031716075569948.eigenfacs 22031716075569948.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031716075569948.eigenfacs 22031716075569948.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031716075569948.eigenfacs 22031716075569948.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031716075569948.eigenfacs 22031716075569948.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031716075569948.eigenfacs 22031716075569948.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031716075569948.eigenfacs 22031716075569948.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031716075569948.eigenfacs 22031716075569948.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031716075569948.eigenfacs 22031716075569948.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031716075569948.eigenfacs 22031716075569948.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031716075569948.eigenfacs 22031716075569948.atom making animated gifs 11 models are in 22031716075569948.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031716075569948.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031716075569948.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22031716075569948 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for 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