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***  f101nl2ca  ***

LOGs for ID: 22031706475285135

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22031706475285135.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22031706475285135.atom to be opened. Openam> File opened: 22031706475285135.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 59 First residue number = 1 Last residue number = 207 Number of atoms found = 443 Mean number per residue = 7.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 5.567273 +/- 5.771123 From: -8.913000 To: 16.896000 = 38.143345 +/- 6.620023 From: 23.027000 To: 53.825000 = 121.787239 +/- 7.341319 From: 107.197000 To: 138.106000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'CA ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 7 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 14.6852 % Filled. Pdbmat> 129786 non-zero elements. Pdbmat> 14127 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 63.78 +/- 22.44 Maximum number = 125 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 282540. Pdbmat> Larger element = 441.982 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 59 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22031706475285135.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22031706475285135.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22031706475285135.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 443 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 59 residues. Blocpdb> 5 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 8 atoms in block 2 Block first atom: 6 Blocpdb> 6 atoms in block 3 Block first atom: 14 Blocpdb> 11 atoms in block 4 Block first atom: 20 Blocpdb> 8 atoms in block 5 Block first atom: 31 Blocpdb> 9 atoms in block 6 Block first atom: 39 Blocpdb> 9 atoms in block 7 Block first atom: 48 Blocpdb> 8 atoms in block 8 Block first atom: 57 Blocpdb> 9 atoms in block 9 Block first atom: 65 Blocpdb> 9 atoms in block 10 Block first atom: 74 Blocpdb> 4 atoms in block 11 Block first atom: 83 Blocpdb> 10 atoms in block 12 Block first atom: 87 Blocpdb> 8 atoms in block 13 Block first atom: 97 Blocpdb> 9 atoms in block 14 Block first atom: 105 Blocpdb> 11 atoms in block 15 Block first atom: 114 Blocpdb> 9 atoms in block 16 Block first atom: 125 Blocpdb> 6 atoms in block 17 Block first atom: 134 Blocpdb> 8 atoms in block 18 Block first atom: 140 Blocpdb> 9 atoms in block 19 Block first atom: 148 Blocpdb> 9 atoms in block 20 Block first atom: 157 Blocpdb> 7 atoms in block 21 Block first atom: 166 Blocpdb> 6 atoms in block 22 Block first atom: 173 Blocpdb> 6 atoms in block 23 Block first atom: 179 Blocpdb> 12 atoms in block 24 Block first atom: 185 Blocpdb> 9 atoms in block 25 Block first atom: 197 Blocpdb> 9 atoms in block 26 Block first atom: 206 Blocpdb> 5 atoms in block 27 Block first atom: 215 Blocpdb> 11 atoms in block 28 Block first atom: 220 Blocpdb> 9 atoms in block 29 Block first atom: 231 Blocpdb> 7 atoms in block 30 Block first atom: 240 Blocpdb> 11 atoms in block 31 Block first atom: 247 Blocpdb> 9 atoms in block 32 Block first atom: 258 Blocpdb> 8 atoms in block 33 Block first atom: 267 Blocpdb> 6 atoms in block 34 Block first atom: 275 Blocpdb> 8 atoms in block 35 Block first atom: 281 Blocpdb> 9 atoms in block 36 Block first atom: 289 Blocpdb> 7 atoms in block 37 Block first atom: 298 Blocpdb> 8 atoms in block 38 Block first atom: 305 Blocpdb> 9 atoms in block 39 Block first atom: 313 Blocpdb> 11 atoms in block 40 Block first atom: 322 Blocpdb> 14 atoms in block 41 Block first atom: 333 Blocpdb> 8 atoms in block 42 Block first atom: 347 Blocpdb> 9 atoms in block 43 Block first atom: 355 Blocpdb> 12 atoms in block 44 Block first atom: 364 Blocpdb> 9 atoms in block 45 Block first atom: 376 Blocpdb> 8 atoms in block 46 Block first atom: 385 Blocpdb> 4 atoms in block 47 Block first atom: 393 Blocpdb> 8 atoms in block 48 Block first atom: 397 Blocpdb> 9 atoms in block 49 Block first atom: 405 Blocpdb> 6 atoms in block 50 Block first atom: 414 Blocpdb> 9 atoms in block 51 Block first atom: 420 Blocpdb> 8 atoms in block 52 Block first atom: 429 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 53 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 437th, in residue A 201 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 53 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 438th, in residue A 202 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 3 atoms in block 53 Block first atom: 437 %Blocpdb-Wn> 1 atoms in block 54 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 440th, in residue A 204 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. %Blocpdb-Wn> 2 atoms in block 54 i.e., less than what is required for a rigid body. %Blocpdb-Wn> Last atom in this block is the 441th, in residue A 205 %Blocpdb-Wn> It will be merged with next block. Blocpdb> 4 atoms in block 54 Block first atom: 439 Blocpdb> 54 blocks. Blocpdb> At most, 14 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 3 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 129840 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 1329 Prepmat> Matrix trace = 282540.0000 Prepmat> Last element read: 1329 1329 89.6020 Prepmat> 1486 lines saved. Prepmat> 974 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 443 RTB> Total mass = 443.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 443 RTB> Number of blocks = 54 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 60664.2154 RTB> 17586 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 324 Diagstd> Nb of non-zero elements: 17586 Diagstd> Projected matrix trace = 60664.2154 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 324 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 60664.2154 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.9310930 4.0995865 5.4782030 5.9380660 7.9452552 9.3015277 11.8674968 12.9885537 13.9642135 16.1037131 17.4621365 18.1987779 18.5979050 21.0136383 23.0160699 24.8792373 27.5516768 29.0331497 30.5776267 32.6465448 34.3991978 36.9373448 38.9683619 40.1597311 40.6982457 44.0037137 44.8774548 45.5553964 47.0236243 50.1412377 51.7859362 52.0513740 54.8441020 56.8443086 57.7361306 59.7631408 60.6769693 61.3016820 62.3829693 63.9124556 64.5109794 65.6794761 65.9192004 68.3615966 69.3462002 69.9419295 70.4028422 73.9298315 75.8162326 76.5105237 77.6681905 77.8607311 79.2914771 79.7381016 82.0387862 83.0214848 84.8384426 85.4958600 86.7622167 88.3579632 88.6792783 89.5808222 90.4646465 91.7779602 93.2542101 94.5961229 95.7463907 97.2719085 97.8820929 99.1218918 100.0864867 101.1862467 102.4850288 103.0466750 103.5853057 105.7294918 106.3587575 107.4705951 109.1695823 110.9800704 111.3571804 112.2964150 114.7376149 115.8685020 116.7935517 117.7094535 118.3749499 118.7486159 120.9348159 121.3222682 122.0705783 122.5979512 123.7393148 124.5625365 125.0442996 126.8438537 127.6307328 128.0179308 128.5203015 129.9013067 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034328 0.0034333 0.0034335 0.0034336 0.0034338 0.0034339 185.9131369 219.8696610 254.1641779 264.6170293 306.0900454 331.1863447 374.0889175 391.3593167 405.7920366 435.7709672 453.7785564 463.2510287 468.3033805 497.7897006 520.9677798 541.6438436 569.9927051 585.1165161 600.4780926 620.4601478 636.8973440 659.9759606 677.8777126 688.1619854 692.7605127 720.3440035 727.4604541 732.9345509 744.6519473 768.9406228 781.4500012 783.4501703 804.1929197 818.7263621 825.1238065 839.4831566 845.8770078 850.2203114 857.6859612 868.1365324 872.1919981 880.0556189 881.6602189 897.8450217 904.2876812 908.1635870 911.1510424 933.6952266 945.5323239 949.8518380 957.0108771 958.1963651 966.9600564 969.6795266 983.5691381 989.4424262 1000.2109944 1004.0788589 1011.4876859 1020.7470382 1022.6013348 1027.7862476 1032.8439868 1040.3140904 1048.6474478 1056.1654309 1062.5673965 1070.9988356 1074.3527596 1081.1353589 1086.3831039 1092.3354387 1099.3234547 1102.3316368 1105.2088561 1116.5890191 1119.9068676 1125.7452083 1134.6086876 1143.9782782 1145.9202480 1150.7426940 1163.1833825 1168.9016628 1173.5584182 1178.1509886 1181.4767627 1183.3400363 1194.1831919 1196.0946306 1199.7776884 1202.3665527 1207.9504883 1211.9619968 1214.3034515 1223.0099610 1226.7975829 1228.6570641 1231.0654645 1237.6619521 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 443 Rtb_to_modes> Number of blocs = 54 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.931 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.100 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.478 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.938 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.945 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.302 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> 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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.9 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 324 coordinates in vector file. 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001 1.00002 0.99997 1.00003 0.99996 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 1.00003 1.00003 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00004 1.00001 1.00000 0.99996 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 0.99996 0.99999 0.99995 1.00003 1.00000 1.00002 1.00005 1.00001 1.00004 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99996 1.00005 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99996 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 1.00003 0.99999 0.99997 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00002 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 1.00007 0.99998 1.00001 0.99997 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22031706475285135.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22031706475285135.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22031706475285135.atom Openam> file on opening on unit 11: 22031706475285135.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 59 First residue number = 1 Last residue number = 207 Number of atoms found = 443 Mean number per residue = 7.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.931 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.100 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.478 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.938 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.945 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.302 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.9 Bfactors> 106 vectors, 1329 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.931000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.171 for 59 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.072 +/- 0.09 Bfactors> = 5.833 +/- 14.67 Bfactors> Shiftng-fct= 5.761 Bfactors> Scaling-fct= 157.490 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22031706475285135.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22031706475285135.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 881.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 904.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 945.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 949.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1028. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1049. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1056. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1063. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1074. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1086. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1092. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1102. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1120. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1135. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1144. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1146. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1163. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1174. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1178. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1182. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1183. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1194. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1196. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1200. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1202. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1208. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1212. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1214. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1223. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1227. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1229. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1231. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1238. Chkmod> 106 vectors, 1329 coordinates in file. Chkmod> That is: 443 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 8 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 32 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 43 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 51 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 99 is: 1.0002 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8097 0.0034 0.8992 0.0034 0.7730 0.0034 0.7095 0.0034 0.7810 0.0034 0.8536 185.9022 0.1256 219.8713 0.3413 254.1486 0.3266 264.6042 0.3104 306.0720 0.3561 331.1805 0.2993 374.1123 0.1961 391.3643 0.1670 405.7134 0.2398 435.7020 0.3034 453.7313 0.0879 463.2467 0.3329 468.3097 0.5609 497.7252 0.2380 520.9899 0.4127 541.6289 0.3835 569.9509 0.3825 585.0597 0.2728 600.4756 0.3120 620.4663 0.1510 636.8774 0.4401 659.9713 0.4230 677.8629 0.3692 688.1347 0.5033 692.7457 0.3951 720.2827 0.4662 727.4499 0.2872 732.9401 0.2220 744.5913 0.4717 768.8981 0.2160 781.4471 0.4465 783.4062 0.4029 804.1283 0.3537 818.6602 0.3086 825.1160 0.4297 839.4251 0.1462 845.8618 0.2599 850.1721 0.2124 857.6287 0.2302 868.0826 0.3881 872.1479 0.2051 880.0214 0.3202 881.6277 0.2949 897.7960 0.2034 904.2736 0.2947 908.1121 0.2480 911.0935 0.4075 933.6562 0.5480 945.5152 0.4635 949.8078 0.3179 956.9809 0.4010 958.1507 0.4192 966.9095 0.1268 969.6494 0.2425 983.5342 0.4598 989.3911 0.5267 1000.1772 0.1917 1004.0601 0.3046 1011.4313 0.3049 1020.7150 0.2152 1022.5616 0.5193 1027.7374 0.2871 1032.7731 0.4040 1040.2810 0.3404 1048.5788 0.4383 1056.1417 0.3382 1062.5418 0.2923 1070.9424 0.2762 1074.2952 0.4837 1081.0786 0.3671 1086.4098 0.2850 1092.3628 0.4174 1099.3566 0.3918 1102.0346 0.4486 1105.2398 0.3859 1116.3854 0.4216 1120.0759 0.4049 1125.8509 0.3095 1134.7180 0.4289 1144.0319 0.4315 1146.0913 0.5352 1150.7117 0.3907 1162.9428 0.3268 1169.0103 0.4253 1173.5404 0.4475 1178.0531 0.3808 1181.5510 0.3067 1183.0470 0.3325 1193.9600 0.3474 1195.9335 0.3567 1199.8708 0.4011 1202.3250 0.1261 1207.7067 0.2722 1212.0922 0.4330 1214.0362 0.2379 1222.7460 0.4380 1226.5972 0.2417 1228.5183 0.3511 1230.9154 0.2545 1237.6026 0.3194 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22031706475285135 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031706475285135.eigenfacs 22031706475285135.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031706475285135.eigenfacs 22031706475285135.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031706475285135.eigenfacs 22031706475285135.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031706475285135.eigenfacs 22031706475285135.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031706475285135.eigenfacs 22031706475285135.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031706475285135.eigenfacs 22031706475285135.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031706475285135.eigenfacs 22031706475285135.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031706475285135.eigenfacs 22031706475285135.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031706475285135.eigenfacs 22031706475285135.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031706475285135.eigenfacs 22031706475285135.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031706475285135.eigenfacs 22031706475285135.atom making animated gifs 11 models are in 22031706475285135.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031706475285135.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031706475285135.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22031706475285135 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for 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22031706475285135.eigenfacs 22031706475285135.atom making animated gifs 11 models are in 22031706475285135.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031706475285135.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031706475285135.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: 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