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***  1crn  ***

LOGs for ID: 22031613564279271

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22031613564279271.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22031613564279271.atom to be opened. Openam> File opened: 22031613564279271.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 46 First residue number = 1 Last residue number = 46 Number of atoms found = 327 Mean number per residue = 7.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 9.268829 +/- 5.802600 From: -3.097000 To: 24.284000 = 9.787284 +/- 4.741781 From: -0.516000 To: 20.937000 = 6.967089 +/- 6.105933 From: -7.422000 To: 19.580000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 21.2780 % Filled. Pdbmat> 102490 non-zero elements. Pdbmat> 11172 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 68.33 +/- 21.38 Maximum number = 134 Minimum number = 26 Pdbmat> Matrix trace = 223440. Pdbmat> Larger element = 500.215 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 46 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22031613564279271.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22031613564279271.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22031613564279271.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 327 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 46 residues. Blocpdb> 7 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 7 atoms in block 2 Block first atom: 8 Blocpdb> 6 atoms in block 3 Block first atom: 15 Blocpdb> 6 atoms in block 4 Block first atom: 21 Blocpdb> 7 atoms in block 5 Block first atom: 27 Blocpdb> 6 atoms in block 6 Block first atom: 34 Blocpdb> 8 atoms in block 7 Block first atom: 40 Blocpdb> 7 atoms in block 8 Block first atom: 48 Blocpdb> 5 atoms in block 9 Block first atom: 55 Blocpdb> 11 atoms in block 10 Block first atom: 60 Blocpdb> 6 atoms in block 11 Block first atom: 71 Blocpdb> 8 atoms in block 12 Block first atom: 77 Blocpdb> 11 atoms in block 13 Block first atom: 85 Blocpdb> 8 atoms in block 14 Block first atom: 96 Blocpdb> 7 atoms in block 15 Block first atom: 104 Blocpdb> 6 atoms in block 16 Block first atom: 111 Blocpdb> 11 atoms in block 17 Block first atom: 117 Blocpdb> 8 atoms in block 18 Block first atom: 128 Blocpdb> 7 atoms in block 19 Block first atom: 136 Blocpdb> 4 atoms in block 20 Block first atom: 143 Blocpdb> 7 atoms in block 21 Block first atom: 147 Blocpdb> 7 atoms in block 22 Block first atom: 154 Blocpdb> 9 atoms in block 23 Block first atom: 161 Blocpdb> 5 atoms in block 24 Block first atom: 170 Blocpdb> 8 atoms in block 25 Block first atom: 175 Blocpdb> 6 atoms in block 26 Block first atom: 183 Blocpdb> 5 atoms in block 27 Block first atom: 189 Blocpdb> 7 atoms in block 28 Block first atom: 194 Blocpdb> 12 atoms in block 29 Block first atom: 201 Blocpdb> 7 atoms in block 30 Block first atom: 213 Blocpdb> 4 atoms in block 31 Block first atom: 220 Blocpdb> 6 atoms in block 32 Block first atom: 224 Blocpdb> 8 atoms in block 33 Block first atom: 230 Blocpdb> 8 atoms in block 34 Block first atom: 238 Blocpdb> 8 atoms in block 35 Block first atom: 246 Blocpdb> 7 atoms in block 36 Block first atom: 254 Blocpdb> 4 atoms in block 37 Block first atom: 261 Blocpdb> 5 atoms in block 38 Block first atom: 265 Blocpdb> 7 atoms in block 39 Block first atom: 270 Blocpdb> 6 atoms in block 40 Block first atom: 277 Blocpdb> 7 atoms in block 41 Block first atom: 283 Blocpdb> 4 atoms in block 42 Block first atom: 290 Blocpdb> 8 atoms in block 43 Block first atom: 294 Blocpdb> 12 atoms in block 44 Block first atom: 302 Blocpdb> 5 atoms in block 45 Block first atom: 314 Blocpdb> 9 atoms in block 46 Block first atom: 318 Blocpdb> 46 blocks. Blocpdb> At most, 12 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 102536 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 981 Prepmat> Matrix trace = 223440.0000 Prepmat> Last element read: 981 981 277.7341 Prepmat> 1082 lines saved. Prepmat> 628 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 327 RTB> Total mass = 327.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 327 RTB> Number of blocks = 46 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 56509.2148 RTB> 15618 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 276 Diagstd> Nb of non-zero elements: 15618 Diagstd> Projected matrix trace = 56509.2148 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 276 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 56509.2148 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 7.6723425 8.8110154 11.5436938 18.0119262 20.5318293 21.1459402 24.4711226 29.2015222 33.6706224 35.3229756 39.4524390 41.3751943 43.5565799 46.3632790 48.1955778 50.0119395 52.3947721 56.5038548 57.0643868 58.4766175 59.7817515 60.6156329 64.9036547 66.2198914 67.6445412 70.1434583 73.0601420 75.0631632 76.9559786 77.9654549 79.1620963 81.2374236 83.1974260 86.0989245 88.6795927 91.1475939 92.3760760 93.2694903 94.2337298 95.6740764 96.2153607 98.0906274 99.1425855 100.7820922 102.2971856 105.3610293 107.9108151 108.8669423 112.2742027 113.7614951 114.8065713 115.4468370 116.1998220 117.3424637 119.4121572 120.7251675 121.1258308 121.5348370 122.8579621 124.7005949 125.4315008 126.7680399 127.7843191 128.7911610 130.1991621 131.6523846 132.9741196 133.2401822 135.0471218 135.8469025 137.5703444 139.1954567 141.1347653 142.2640845 143.1516635 143.9302120 145.5375877 147.2715641 147.8201625 148.6906000 150.8170073 151.7342731 152.3803264 153.8600063 154.4657367 157.8109301 158.5005957 159.0584020 159.8217795 160.4220171 162.1440908 163.0243654 163.9600641 164.7283020 165.2627989 166.5845449 167.2464730 168.4893020 169.0068085 170.6121262 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034329 0.0034331 0.0034336 0.0034337 0.0034342 0.0034351 300.7871446 322.3355912 368.9501404 460.8667319 492.0498491 499.3542839 537.1829589 586.8107015 630.1165011 645.3925103 682.0751214 698.4982191 716.6748525 739.4049471 753.8741917 767.9485573 786.0302464 816.2709086 820.3097198 830.3982056 839.6138571 845.4493651 874.8424671 883.6687816 893.1237908 909.4710252 928.1871169 940.8247011 952.6129099 958.8405421 966.1708344 978.7535519 990.4902967 1007.6138854 1022.6031475 1036.7352961 1043.6984421 1048.7333573 1054.1404311 1062.1660588 1065.1664687 1075.4965867 1081.2482073 1090.1517722 1098.3155261 1114.6416899 1128.0484852 1133.0349145 1150.6288794 1158.2249762 1163.5328622 1166.7728089 1170.5716769 1176.3129588 1186.6415535 1193.1476453 1195.1259179 1197.1420113 1203.6408923 1212.6334473 1216.1820511 1222.6444135 1227.5355035 1232.3620313 1239.0800794 1245.9759088 1252.2148277 1253.4669550 1261.9377920 1265.6690216 1273.6722667 1281.1730970 1290.0670501 1295.2181361 1299.2522566 1302.7805402 1310.0349021 1317.8158595 1320.2680630 1324.1495498 1333.5841944 1337.6334622 1340.4781214 1346.9707136 1349.6195490 1364.1553170 1367.1328843 1369.5364256 1372.8189367 1375.3944472 1382.7569282 1386.5053172 1390.4786340 1393.7323839 1395.9916869 1401.5630309 1404.3448442 1409.5531155 1411.7161419 1418.4049161 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 327 Rtb_to_modes> Number of blocs = 46 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.672 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.811 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 141.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 143.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 148.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 150.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 152.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 153.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 154.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 157.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 158.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 159.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 159.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 162.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 163.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 164.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 164.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 165.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 166.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 167.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 168.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 169.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 170.6 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 276 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00003 0.99995 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00004 1.00005 1.00003 1.00004 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 0.99996 1.00000 1.00003 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 1.00005 1.00001 1.00003 1.00001 0.99998 0.99995 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99997 0.99999 1.00006 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00005 1.00003 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000 0.99998 1.00003 1.00003 0.99994 1.00000 0.99997 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00003 1.00002 1.00002 0.99998 0.99996 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00004 1.00003 1.00004 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 5886 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00003 0.99995 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00004 1.00005 1.00003 1.00004 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 0.99996 1.00000 1.00003 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 1.00005 1.00001 1.00003 1.00001 0.99998 0.99995 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99997 0.99999 1.00006 0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00005 1.00003 1.00001 0.99999 1.00004 1.00000 0.99998 1.00003 1.00003 0.99994 1.00000 0.99997 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00003 1.00002 1.00002 0.99998 0.99996 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99997 0.99998 1.00000 0.99998 0.99998 1.00004 1.00003 1.00004 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22031613564279271.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22031613564279271.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22031613564279271.atom Openam> file on opening on unit 11: 22031613564279271.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 46 First residue number = 1 Last residue number = 46 Number of atoms found = 327 Mean number per residue = 7.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9941E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.672 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.811 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 153.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 157.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 163.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 166.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 167.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 169.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 170.6 Bfactors> 106 vectors, 981 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 7.672000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.585 for 46 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.058 +/- 0.06 Bfactors> = 5.812 +/- 1.85 Bfactors> Shiftng-fct= 5.754 Bfactors> Scaling-fct= 29.716 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22031613564279271.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22031613564279271.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 883.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1023. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1044. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1049. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1054. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1062. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1065. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1098. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1115. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1128. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1158. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1163. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1166. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1171. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1176. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1195. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1197. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1213. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1216. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1223. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1228. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1232. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1239. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1246. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1252. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1253. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1262. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1265. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1274. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1281. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1290. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1295. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1299. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1303. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1310. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1318. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1320. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1324. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1333. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1337. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1341. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1347. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1350. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1364. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1367. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1370. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1373. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1375. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1383. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1386. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1391. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1394. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1396. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1402. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1404. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1410. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1412. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1418. Chkmod> 106 vectors, 981 coordinates in file. Chkmod> That is: 327 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 8 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 15 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 16 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 23 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 25 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 42 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 47 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 52 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 55 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 61 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 69 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 87 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 105 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7478 0.0034 0.7677 0.0034 0.7519 0.0034 0.6888 0.0034 0.8100 0.0034 0.9298 300.7675 0.4647 322.3215 0.4396 368.8753 0.2041 460.8223 0.4171 492.0068 0.3407 499.3808 0.2906 537.1476 0.3928 586.7702 0.2867 630.0836 0.3077 645.3376 0.4718 682.0248 0.1362 698.5088 0.6102 716.6722 0.3013 739.3471 0.3588 753.8764 0.7026 767.9007 0.4039 785.9607 0.3628 816.2080 0.2335 820.2430 0.2570 830.3866 0.2639 839.5655 0.2954 845.4435 0.4129 874.7803 0.3004 883.6316 0.1908 893.0555 0.1792 909.4096 0.4193 928.1464 0.2799 940.7645 0.3191 952.5969 0.4113 958.8273 0.1970 966.1166 0.3687 978.7271 0.2355 990.4631 0.4928 1007.5769 0.3515 1022.5616 0.4626 1036.7045 0.2907 1043.6758 0.1928 1048.6912 0.4143 1054.0743 0.5295 1062.0978 0.3199 1065.1464 0.1833 1075.4470 0.4658 1081.1877 0.4819 1090.2018 0.4811 1098.2835 0.5246 1114.8000 0.3689 1127.9435 0.3191 1133.1583 0.4279 1150.7117 0.1527 1158.3712 0.3776 1163.4496 0.4128 1166.4860 0.3947 1170.5223 0.3533 1176.0496 0.2500 1186.5302 0.3109 1192.9721 0.3521 1194.9472 0.4660 1196.9190 0.3927 1203.7951 0.3363 1212.5785 0.3009 1215.9771 0.3396 1222.7460 0.3406 1227.5581 0.1196 1232.3514 0.2877 1239.0309 0.2977 1246.1477 0.4916 1252.2829 0.1719 1253.2241 0.2765 1261.6634 0.3888 1265.3962 0.5188 1273.7549 0.3710 1281.1390 0.2563 1289.8528 0.3542 1295.3260 0.1899 1299.4158 0.5012 1302.5879 0.4382 1309.8095 0.3495 1317.8865 0.4328 1320.1213 0.4143 1324.1346 0.3591 1333.4518 0.4863 1337.4250 0.4848 1340.5071 0.2592 1347.0879 0.4279 1349.7113 0.4876 1364.0495 0.3916 1367.0716 0.4905 1369.6567 0.4544 1372.6665 0.4633 1375.2410 0.3355 1382.5096 0.4299 1386.3422 0.4903 1390.5883 0.4334 1393.5528 0.3359 1396.0889 0.3412 1401.5679 0.3322 1404.0894 0.3468 1409.5374 0.2683 1411.6271 0.2147 1418.2936 0.4577 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22031613564279271 7 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22031613564279271 8 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22031613564279271 9 -100 100 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed 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normal mode computation generate a series of perturbations for mode 13 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031613564279271.eigenfacs 22031613564279271.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031613564279271.eigenfacs 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