CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  7awm_wt  ***

LOGs for ID: 22031510354555331

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22031510354555331.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22031510354555331.atom to be opened. Openam> File opened: 22031510354555331.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 412 First residue number = 29 Last residue number = 488 Number of atoms found = 3135 Mean number per residue = 7.6 Pdbmat> Coordinate statistics: = -35.984583 +/- 12.250893 From: -66.259000 To: -0.462000 = 30.261989 +/- 12.047476 From: 1.799000 To: 59.083000 = 4.637274 +/- 14.020146 From: -31.683000 To: 34.700000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.5425 % Filled. Pdbmat> 1124578 non-zero elements. Pdbmat> 122882 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.39 +/- 22.45 Maximum number = 126 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 2.457640E+06 Pdbmat> Larger element = 485.809 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 412 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22031510354555331.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22031510354555331.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22031510354555331.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3135 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 412 residues. Blocpdb> 23 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 24 Blocpdb> 23 atoms in block 3 Block first atom: 49 Blocpdb> 26 atoms in block 4 Block first atom: 72 Blocpdb> 22 atoms in block 5 Block first atom: 98 Blocpdb> 30 atoms in block 6 Block first atom: 120 Blocpdb> 24 atoms in block 7 Block first atom: 150 Blocpdb> 24 atoms in block 8 Block first atom: 174 Blocpdb> 22 atoms in block 9 Block first atom: 198 Blocpdb> 20 atoms in block 10 Block first atom: 220 Blocpdb> 20 atoms in block 11 Block first atom: 240 Blocpdb> 22 atoms in block 12 Block first atom: 260 Blocpdb> 23 atoms in block 13 Block first atom: 282 Blocpdb> 26 atoms in block 14 Block first atom: 305 Blocpdb> 27 atoms in block 15 Block first atom: 331 Blocpdb> 24 atoms in block 16 Block first atom: 358 Blocpdb> 25 atoms in block 17 Block first atom: 382 Blocpdb> 28 atoms in block 18 Block first atom: 407 Blocpdb> 22 atoms in block 19 Block first atom: 435 Blocpdb> 25 atoms in block 20 Block first atom: 457 Blocpdb> 27 atoms in block 21 Block first atom: 482 Blocpdb> 25 atoms in block 22 Block first atom: 509 Blocpdb> 24 atoms in block 23 Block first atom: 534 Blocpdb> 23 atoms in block 24 Block first atom: 558 Blocpdb> 19 atoms in block 25 Block first atom: 581 Blocpdb> 23 atoms in block 26 Block first atom: 600 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 623 Blocpdb> 22 atoms in block 28 Block first atom: 640 Blocpdb> 19 atoms in block 29 Block first atom: 662 Blocpdb> 21 atoms in block 30 Block first atom: 681 Blocpdb> 20 atoms in block 31 Block first atom: 702 Blocpdb> 23 atoms in block 32 Block first atom: 722 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 745 Blocpdb> 21 atoms in block 34 Block first atom: 776 Blocpdb> 23 atoms in block 35 Block first atom: 797 Blocpdb> 19 atoms in block 36 Block first atom: 820 Blocpdb> 20 atoms in block 37 Block first atom: 839 Blocpdb> 23 atoms in block 38 Block first atom: 859 Blocpdb> 24 atoms in block 39 Block first atom: 882 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 906 Blocpdb> 24 atoms in block 41 Block first atom: 923 Blocpdb> 25 atoms in block 42 Block first atom: 947 Blocpdb> 24 atoms in block 43 Block first atom: 972 Blocpdb> 24 atoms in block 44 Block first atom: 996 Blocpdb> 26 atoms in block 45 Block first atom: 1020 Blocpdb> 22 atoms in block 46 Block first atom: 1046 Blocpdb> 18 atoms in block 47 Block first atom: 1068 Blocpdb> 27 atoms in block 48 Block first atom: 1086 Blocpdb> 24 atoms in block 49 Block first atom: 1113 Blocpdb> 7 atoms in block 50 Block first atom: 1137 Blocpdb> 25 atoms in block 51 Block first atom: 1144 Blocpdb> 21 atoms in block 52 Block first atom: 1169 Blocpdb> 24 atoms in block 53 Block first atom: 1190 Blocpdb> 19 atoms in block 54 Block first atom: 1214 Blocpdb> 24 atoms in block 55 Block first atom: 1233 Blocpdb> 26 atoms in block 56 Block first atom: 1257 Blocpdb> 20 atoms in block 57 Block first atom: 1283 Blocpdb> 21 atoms in block 58 Block first atom: 1303 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 1324 Blocpdb> 22 atoms in block 60 Block first atom: 1345 Blocpdb> 23 atoms in block 61 Block first atom: 1367 Blocpdb> 30 atoms in block 62 Block first atom: 1390 Blocpdb> 22 atoms in block 63 Block first atom: 1420 Blocpdb> 22 atoms in block 64 Block first atom: 1442 Blocpdb> 24 atoms in block 65 Block first atom: 1464 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 1488 Blocpdb> 24 atoms in block 67 Block first atom: 1508 Blocpdb> 31 atoms in block 68 Block first atom: 1532 Blocpdb> 19 atoms in block 69 Block first atom: 1563 Blocpdb> 27 atoms in block 70 Block first atom: 1582 Blocpdb> 21 atoms in block 71 Block first atom: 1609 Blocpdb> 21 atoms in block 72 Block first atom: 1630 Blocpdb> 7 atoms in block 73 Block first atom: 1651 Blocpdb> 17 atoms in block 74 Block first atom: 1658 Blocpdb> 20 atoms in block 75 Block first atom: 1675 Blocpdb> 27 atoms in block 76 Block first atom: 1695 Blocpdb> 22 atoms in block 77 Block first atom: 1722 Blocpdb> 19 atoms in block 78 Block first atom: 1744 Blocpdb> 25 atoms in block 79 Block first atom: 1763 Blocpdb> 20 atoms in block 80 Block first atom: 1788 Blocpdb> 22 atoms in block 81 Block first atom: 1808 Blocpdb> 28 atoms in block 82 Block first atom: 1830 Blocpdb> 27 atoms in block 83 Block first atom: 1858 Blocpdb> 27 atoms in block 84 Block first atom: 1885 Blocpdb> 26 atoms in block 85 Block first atom: 1912 Blocpdb> 26 atoms in block 86 Block first atom: 1938 Blocpdb> 17 atoms in block 87 Block first atom: 1964 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 1981 Blocpdb> 23 atoms in block 89 Block first atom: 2003 Blocpdb> 17 atoms in block 90 Block first atom: 2026 Blocpdb> 19 atoms in block 91 Block first atom: 2043 Blocpdb> 17 atoms in block 92 Block first atom: 2062 Blocpdb> 22 atoms in block 93 Block first atom: 2079 Blocpdb> 26 atoms in block 94 Block first atom: 2101 Blocpdb> 23 atoms in block 95 Block first atom: 2127 Blocpdb> 26 atoms in block 96 Block first atom: 2150 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 2176 Blocpdb> 28 atoms in block 98 Block first atom: 2195 Blocpdb> 26 atoms in block 99 Block first atom: 2223 Blocpdb> 26 atoms in block 100 Block first atom: 2249 Blocpdb> 18 atoms in block 101 Block first atom: 2275 Blocpdb> 20 atoms in block 102 Block first atom: 2293 Blocpdb> 24 atoms in block 103 Block first atom: 2313 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 2337 Blocpdb> 29 atoms in block 105 Block first atom: 2353 Blocpdb> 17 atoms in block 106 Block first atom: 2382 Blocpdb> 24 atoms in block 107 Block first atom: 2399 Blocpdb> 22 atoms in block 108 Block first atom: 2423 Blocpdb> 23 atoms in block 109 Block first atom: 2445 Blocpdb> 29 atoms in block 110 Block first atom: 2468 Blocpdb> 23 atoms in block 111 Block first atom: 2497 Blocpdb> 25 atoms in block 112 Block first atom: 2520 Blocpdb> 21 atoms in block 113 Block first atom: 2545 Blocpdb> 20 atoms in block 114 Block first atom: 2566 Blocpdb> 17 atoms in block 115 Block first atom: 2586 Blocpdb> 18 atoms in block 116 Block first atom: 2603 Blocpdb> 14 atoms in block 117 Block first atom: 2621 Blocpdb> 24 atoms in block 118 Block first atom: 2635 Blocpdb> 17 atoms in block 119 Block first atom: 2659 Blocpdb> 22 atoms in block 120 Block first atom: 2676 Blocpdb> 22 atoms in block 121 Block first atom: 2698 Blocpdb> 20 atoms in block 122 Block first atom: 2720 Blocpdb> 19 atoms in block 123 Block first atom: 2740 Blocpdb> 22 atoms in block 124 Block first atom: 2759 Blocpdb> 23 atoms in block 125 Block first atom: 2781 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2804 Blocpdb> 20 atoms in block 127 Block first atom: 2828 Blocpdb> 30 atoms in block 128 Block first atom: 2848 Blocpdb> 30 atoms in block 129 Block first atom: 2878 Blocpdb> 26 atoms in block 130 Block first atom: 2908 Blocpdb> 22 atoms in block 131 Block first atom: 2934 Blocpdb> 20 atoms in block 132 Block first atom: 2956 Blocpdb> 17 atoms in block 133 Block first atom: 2976 Blocpdb> 17 atoms in block 134 Block first atom: 2993 Blocpdb> 26 atoms in block 135 Block first atom: 3010 Blocpdb> 25 atoms in block 136 Block first atom: 3036 Blocpdb> 26 atoms in block 137 Block first atom: 3061 Blocpdb> 27 atoms in block 138 Block first atom: 3087 Blocpdb> 22 atoms in block 139 Block first atom: 3113 Blocpdb> 139 blocks. Blocpdb> At most, 31 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1124717 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9405 Prepmat> Matrix trace = 2457640.0000 Prepmat> Last element read: 9405 9405 83.7611 Prepmat> 9731 lines saved. Prepmat> 8400 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3135 RTB> Total mass = 3135.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3135 RTB> Number of blocks = 139 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 171574.6527 RTB> 45795 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 834 Diagstd> Nb of non-zero elements: 45795 Diagstd> Projected matrix trace = 171574.6527 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 834 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 171574.6527 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0326950 0.0499558 0.3100635 0.4651082 1.1952933 1.6510109 2.0395253 2.5129963 2.9324268 3.1044743 3.4522931 3.6614925 4.0087032 4.6540060 5.2530928 5.8750422 6.0524671 7.2336064 7.3984533 8.1555086 8.2788681 8.6000166 9.3564962 9.9603974 10.6785410 10.8173637 11.2528953 12.3807006 12.5866837 13.1478426 13.8519197 14.1313727 14.9943672 16.0444863 17.6321388 18.2253038 18.7296609 18.9121774 20.3285659 20.6084521 21.4022513 21.7826234 22.3572198 23.8200917 24.0355402 24.7481580 26.0546931 26.8253633 27.2194919 28.4739401 28.7544128 29.3962707 30.1646257 30.6068259 31.0308965 31.5827691 31.9700134 32.6513479 34.0788215 35.4412841 35.9893900 36.3052516 37.0681657 37.5784788 38.6454657 39.3323648 39.8553038 40.7542748 41.3345854 41.7624011 42.6754444 43.2693654 44.0271634 44.1122438 44.5577986 44.6878875 45.6277760 45.9570811 46.0350172 47.1977801 47.4080167 48.0188624 48.2862557 49.0992276 49.7586617 50.2580336 51.1208085 52.1123802 53.4953973 53.8162966 54.0435605 54.9634041 55.2973552 55.6288804 55.9928269 56.4585198 57.0045133 57.6052964 58.1150761 58.8034147 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034336 0.0034337 0.0034339 0.0034347 0.0034347 0.0034355 19.6352177 24.2710422 60.4673058 74.0580484 118.7223620 139.5308555 155.0814422 172.1437279 185.9554321 191.3327518 201.7665242 207.7898617 217.4188694 234.2657243 248.8873459 263.2090245 267.1538884 292.0604286 295.3695694 310.1135952 312.4501681 318.4526924 332.1634966 342.7153939 354.8552534 357.1543936 364.2733659 382.0919522 385.2573561 393.7517786 404.1571468 408.2135874 420.4935620 434.9688828 455.9820825 463.5885155 469.9592878 472.2435632 489.6081648 492.9671349 502.3715193 506.8160636 513.4571177 529.9891696 532.3806036 540.2151017 554.2915543 562.4294936 566.5461433 579.4541321 582.3009944 588.7642057 596.4090855 600.7647281 604.9123363 610.2676976 613.9976228 620.5057888 633.9245403 646.4724245 651.4521521 654.3046483 661.1436451 665.6790331 675.0633851 681.0363762 685.5487484 693.2372088 698.1553542 701.7590314 709.3887657 714.3080478 720.5359153 721.2317795 724.8650213 725.9223920 733.5165729 736.1587848 736.7827256 746.0296126 747.6893138 752.4908330 754.5830491 760.9088062 766.0015101 769.8356637 776.4153930 783.9091524 794.2431705 796.6217951 798.3020732 805.0671228 807.5091651 809.9261846 812.5712972 815.9433818 819.8792612 824.1883812 827.8271877 832.7153176 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3135 Rtb_to_modes> Number of blocs = 139 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.2695E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.9956E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3101 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4651 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.195 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.651 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.040 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.513 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.932 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.452 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.661 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.009 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.654 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.253 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.875 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.052 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.234 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.398 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.156 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.279 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.600 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.356 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.960 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.80 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 834 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00004 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00004 1.00006 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00004 1.00004 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99995 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 1.00000 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 56430 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00004 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00004 1.00006 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 0.99999 1.00004 1.00004 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 0.99995 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 0.99998 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 1.00000 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00004 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22031510354555331.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22031510354555331.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22031510354555331.atom Openam> file on opening on unit 11: 22031510354555331.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 412 First residue number = 29 Last residue number = 488 Number of atoms found = 3135 Mean number per residue = 7.6 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.2695E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.9956E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3101 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4651 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.195 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.651 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.040 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.513 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.932 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.452 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.661 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.009 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.654 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.253 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.875 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.052 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.234 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.398 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.156 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.279 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.600 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.356 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.960 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.80 Bfactors> 106 vectors, 9405 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.032695 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.375 for 412 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.282 +/- 1.69 Bfactors> = 129.378 +/- 33.89 Bfactors> Shiftng-fct= 129.097 Bfactors> Scaling-fct= 20.040 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22031510354555331.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22031510354555331.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 172.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 263.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 776.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 812.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.7 Chkmod> 106 vectors, 9405 coordinates in file. Chkmod> That is: 3135 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 7 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 8 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 38 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 52 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8237 0.0034 0.7161 0.0034 0.7305 0.0034 0.8620 0.0034 0.7773 0.0034 0.8705 19.6344 0.0316 24.2700 0.0355 60.4683 0.0631 74.0542 0.0868 118.7027 0.1115 139.5244 0.2311 155.0928 0.2303 172.1365 0.4660 185.9339 0.0925 191.3099 0.4507 201.7493 0.4575 207.7670 0.3288 217.4176 0.4506 234.2555 0.3263 248.8745 0.2619 263.1968 0.2902 267.1321 0.1799 292.0558 0.3306 295.3478 0.1050 310.1096 0.3215 312.4392 0.5456 318.4387 0.3388 332.1404 0.4230 342.6938 0.6335 354.8643 0.0827 357.1826 0.4719 364.2109 0.1471 382.0647 0.3386 385.2916 0.2539 393.7672 0.4501 404.1118 0.4317 408.1762 0.1428 420.4143 0.2849 434.8894 0.5070 455.9349 0.5284 463.6283 0.4118 469.9434 0.4946 472.1961 0.4527 489.6044 0.5435 492.9645 0.3963 502.3235 0.4999 506.7638 0.3697 513.4670 0.4037 529.9654 0.3280 532.4071 0.5886 540.2120 0.0861 554.2178 0.4852 562.4540 0.4628 566.5271 0.4768 579.3892 0.3551 582.2313 0.4585 588.7763 0.5091 596.3378 0.2480 600.7701 0.2033 604.8776 0.2680 610.2147 0.4662 613.9711 0.3608 620.4663 0.4873 633.9083 0.4761 646.4330 0.2230 651.4297 0.3005 654.3193 0.5062 661.1316 0.5655 665.6639 0.4595 675.0740 0.4539 680.9867 0.4578 685.5597 0.5026 693.1711 0.3496 698.0867 0.3776 701.7087 0.4309 709.3962 0.4844 714.2826 0.4953 720.5282 0.4418 721.1825 0.5663 724.8518 0.4734 725.9084 0.4672 733.5030 0.5032 736.1506 0.3993 736.7910 0.3949 746.0151 0.0649 747.6729 0.5588 752.4674 0.4493 754.5799 0.4348 760.8821 0.3328 765.9789 0.5505 769.8177 0.4710 776.3759 0.4509 783.8576 0.4404 794.2432 0.3638 796.6150 0.4262 798.2415 0.4751 805.0076 0.4543 807.4938 0.4883 809.8996 0.5835 812.5159 0.5258 815.9191 0.4317 819.8116 0.5052 824.1866 0.2943 827.8267 0.4851 832.6554 0.2421 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 22031510354555331 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom making animated gifs 11 models are in 22031510354555331.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031510354555331.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031510354555331.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22031510354555331 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom making animated gifs 11 models are in 22031510354555331.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031510354555331.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031510354555331.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22031510354555331 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom making animated gifs 11 models are in 22031510354555331.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031510354555331.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031510354555331.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 22031510354555331 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom making animated gifs 11 models are in 22031510354555331.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031510354555331.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031510354555331.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 22031510354555331 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22031510354555331.eigenfacs 22031510354555331.atom making animated gifs 11 models are in 22031510354555331.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031510354555331.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22031510354555331.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 22031510354555331.10.pdb 22031510354555331.11.pdb 22031510354555331.7.pdb 22031510354555331.8.pdb 22031510354555331.9.pdb STDERR: real 0m9.238s user 0m9.220s sys 0m0.008s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.