***    ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 220306205521121170.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 220306205521121170.atom to be opened.
Openam> File opened: 220306205521121170.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 213
First residue number = 24
Last residue number = 246
Number of atoms found = 1720
Mean number per residue = 8.1
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 61.267055 +/- 9.437155 From: 35.919000 To: 80.693000
= 25.171850 +/- 9.962273 From: 2.774000 To: 50.352000
= 5.698661 +/- 10.935171 From: -26.542000 To: 30.958000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 4.7660 % Filled.
Pdbmat> 634609 non-zero elements.
Pdbmat> 69376 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 80.67 +/- 24.49
Maximum number = 133
Minimum number = 15
Pdbmat> Matrix trace = 1.387520E+06
Pdbmat> Larger element = 513.124
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
213 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 220306205521121170.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 220306205521121170.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
220306205521121170.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1720 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 213 residues.
Blocpdb> 15 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 17 atoms in block 2
Block first atom: 16
Blocpdb> 17 atoms in block 3
Block first atom: 33
Blocpdb> 20 atoms in block 4
Block first atom: 50
Blocpdb> 19 atoms in block 5
Block first atom: 70
Blocpdb> 15 atoms in block 6
Block first atom: 89
Blocpdb> 17 atoms in block 7
Block first atom: 104
Blocpdb> 18 atoms in block 8
Block first atom: 121
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 139
Blocpdb> 18 atoms in block 10
Block first atom: 153
Blocpdb> 15 atoms in block 11
Block first atom: 171
Blocpdb> 19 atoms in block 12
Block first atom: 186
Blocpdb> 17 atoms in block 13
Block first atom: 205
Blocpdb> 14 atoms in block 14
Block first atom: 222
Blocpdb> 20 atoms in block 15
Block first atom: 236
Blocpdb> 15 atoms in block 16
Block first atom: 256
Blocpdb> 16 atoms in block 17
Block first atom: 271
Blocpdb> 20 atoms in block 18
Block first atom: 287
Blocpdb> 17 atoms in block 19
Block first atom: 307
Blocpdb> 19 atoms in block 20
Block first atom: 324
Blocpdb> 15 atoms in block 21
Block first atom: 343
Blocpdb> 15 atoms in block 22
Block first atom: 358
Blocpdb> 16 atoms in block 23
Block first atom: 373
Blocpdb> 14 atoms in block 24
Block first atom: 389
Blocpdb> 11 atoms in block 25
Block first atom: 403
Blocpdb> 10 atoms in block 26
Block first atom: 414
Blocpdb> 14 atoms in block 27
Block first atom: 424
Blocpdb> 16 atoms in block 28
Block first atom: 438
Blocpdb> 19 atoms in block 29
Block first atom: 454
Blocpdb> 20 atoms in block 30
Block first atom: 473
Blocpdb> 15 atoms in block 31
Block first atom: 493
Blocpdb> 20 atoms in block 32
Block first atom: 508
Blocpdb> 16 atoms in block 33
Block first atom: 528
Blocpdb> 14 atoms in block 34
Block first atom: 544
Blocpdb> 19 atoms in block 35
Block first atom: 558
Blocpdb> 13 atoms in block 36
Block first atom: 577
Blocpdb> 11 atoms in block 37
Block first atom: 590
Blocpdb> 20 atoms in block 38
Block first atom: 601
Blocpdb> 16 atoms in block 39
Block first atom: 621
Blocpdb> 21 atoms in block 40
Block first atom: 637
Blocpdb> 14 atoms in block 41
Block first atom: 658
Blocpdb> 13 atoms in block 42
Block first atom: 672
Blocpdb> 12 atoms in block 43
Block first atom: 685
Blocpdb> 12 atoms in block 44
Block first atom: 697
Blocpdb> 24 atoms in block 45
Block first atom: 709
Blocpdb> 21 atoms in block 46
Block first atom: 733
Blocpdb> 14 atoms in block 47
Block first atom: 754
Blocpdb> 15 atoms in block 48
Block first atom: 768
Blocpdb> 23 atoms in block 49
Block first atom: 783
Blocpdb> 15 atoms in block 50
Block first atom: 806
Blocpdb> 20 atoms in block 51
Block first atom: 821
Blocpdb> 17 atoms in block 52
Block first atom: 841
Blocpdb> 16 atoms in block 53
Block first atom: 858
Blocpdb> 20 atoms in block 54
Block first atom: 874
Blocpdb> 17 atoms in block 55
Block first atom: 894
Blocpdb> 13 atoms in block 56
Block first atom: 911
Blocpdb> 15 atoms in block 57
Block first atom: 924
Blocpdb> 21 atoms in block 58
Block first atom: 939
Blocpdb> 15 atoms in block 59
Block first atom: 960
Blocpdb> 16 atoms in block 60
Block first atom: 975
Blocpdb> 19 atoms in block 61
Block first atom: 991
Blocpdb> 19 atoms in block 62
Block first atom: 1010
Blocpdb> 16 atoms in block 63
Block first atom: 1029
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 1045
Blocpdb> 13 atoms in block 65
Block first atom: 1060
Blocpdb> 17 atoms in block 66
Block first atom: 1073
Blocpdb> 16 atoms in block 67
Block first atom: 1090
Blocpdb> 14 atoms in block 68
Block first atom: 1106
Blocpdb> 16 atoms in block 69
Block first atom: 1120
Blocpdb> 10 atoms in block 70
Block first atom: 1136
Blocpdb> 13 atoms in block 71
Block first atom: 1146
Blocpdb> 10 atoms in block 72
Block first atom: 1159
Blocpdb> 13 atoms in block 73
Block first atom: 1169
Blocpdb> 13 atoms in block 74
Block first atom: 1182
Blocpdb> 12 atoms in block 75
Block first atom: 1195
Blocpdb> 20 atoms in block 76
Block first atom: 1207
Blocpdb> 11 atoms in block 77
Block first atom: 1227
Blocpdb> 10 atoms in block 78
Block first atom: 1238
Blocpdb> 13 atoms in block 79
Block first atom: 1248
Blocpdb> 18 atoms in block 80
Block first atom: 1261
Blocpdb> 19 atoms in block 81
Block first atom: 1279
Blocpdb> 17 atoms in block 82
Block first atom: 1298
Blocpdb> 17 atoms in block 83
Block first atom: 1315
Blocpdb> 15 atoms in block 84
Block first atom: 1332
Blocpdb> 21 atoms in block 85
Block first atom: 1347
Blocpdb> 12 atoms in block 86
Block first atom: 1368
Blocpdb> 12 atoms in block 87
Block first atom: 1380
Blocpdb> 13 atoms in block 88
Block first atom: 1392
Blocpdb> 15 atoms in block 89
Block first atom: 1405
Blocpdb> 15 atoms in block 90
Block first atom: 1420
Blocpdb> 14 atoms in block 91
Block first atom: 1435
Blocpdb> 16 atoms in block 92
Block first atom: 1449
Blocpdb> 18 atoms in block 93
Block first atom: 1465
Blocpdb> 11 atoms in block 94
Block first atom: 1483
Blocpdb> 16 atoms in block 95
Block first atom: 1494
Blocpdb> 21 atoms in block 96
Block first atom: 1510
Blocpdb> 17 atoms in block 97
Block first atom: 1531
Blocpdb> 12 atoms in block 98
Block first atom: 1548
Blocpdb> 16 atoms in block 99
Block first atom: 1560
Blocpdb> 23 atoms in block 100
Block first atom: 1576
Blocpdb> 18 atoms in block 101
Block first atom: 1599
Blocpdb> 16 atoms in block 102
Block first atom: 1617
Blocpdb> 16 atoms in block 103
Block first atom: 1633
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1649
Blocpdb> 15 atoms in block 105
Block first atom: 1664
Blocpdb> 18 atoms in block 106
Block first atom: 1679
Blocpdb> 24 atoms in block 107
Block first atom: 1696
Blocpdb> 107 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 634716 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 5160
Prepmat> Matrix trace = 1387520.0000
Prepmat> Last element read: 5160 5160 295.1665
Prepmat> 5779 lines saved.
Prepmat> 4674 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1720
RTB> Total mass = 1720.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1720
RTB> Number of blocks = 107
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 144303.8285
RTB> 38139 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 642
Diagstd> Nb of non-zero elements: 38139
Diagstd> Projected matrix trace = 144303.8285
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 642 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 144303.8285
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.2704118 1.9266745 2.7627696 3.0378079
4.2427716 5.0192772 6.2310076 7.3580133 8.0069473
8.8484942 9.9845928 10.3964553 11.9608058 13.4165733
13.8159456 14.7138667 16.0533257 16.5570883 16.8118637
17.4790138 19.0667488 20.6175755 21.7115048 22.4876580
23.0918832 24.3136260 26.6249664 26.8054993 27.1886307
29.1647999 29.3773543 31.6117973 32.5828326 32.8910402
33.6877440 33.9511062 35.6861903 36.2381499 37.5058653
38.1539318 38.7136521 41.2029178 41.7471319 42.9828175
43.5110019 44.0700339 45.3327887 47.3830936 47.7231519
48.5616657 49.3481384 50.6570277 51.3849080 52.6800651
53.1995356 53.8013221 54.5171378 55.0129207 55.8629894
57.1319501 58.4291167 59.1108691 59.9246085 60.5893163
62.7226857 63.1517692 63.6585436 64.7909886 65.3939764
66.7635831 67.7962842 68.3449370 69.1932379 70.3622890
70.5824236 71.5149703 72.1416060 72.4828883 73.1289918
74.0638932 74.6050938 74.9147112 75.8633647 77.8042404
78.4502976 80.1744700 80.4280473 82.0198703 82.5799526
83.0829760 83.8349473 84.9078496 85.3273716 85.6170968
86.3342804 87.5598230 87.9386221 88.4550089 88.9416225
89.9542502
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034329 0.0034336 0.0034338 0.0034339 0.0034341
0.0034351 122.3960864 150.7299168 180.4960152 189.2672325
223.6763694 243.2853012 271.0656081 294.5612161 307.2760890
323.0204111 343.1313968 350.1369352 375.5566881 397.7554001
403.6319977 416.5418953 435.0886841 441.8626191 445.2492636
453.9977941 474.1694861 493.0762417 505.9880294 514.9527645
521.8250900 535.4515078 560.3247606 562.2212173 566.2248793
586.4416144 588.5747413 610.5480867 619.8544149 622.7791793
630.2766880 632.7355635 648.7022044 653.6997050 665.0355708
670.7565618 675.6586661 697.0425125 701.6307304 711.9388951
716.2997869 720.8866326 731.1416061 747.4927524 750.1702548
756.7319450 762.8350988 772.8854514 778.4183623 788.1673350
792.0438039 796.5109568 801.7921569 805.4296841 811.6286456
820.7951932 830.0608689 834.8894108 840.6164470 845.2658173
860.0181232 862.9547850 866.4103454 874.0828183 878.1407950
887.2890021 894.1249755 897.7356131 903.2898022 910.8885857
912.3123704 918.3194053 922.3339258 924.5130073 928.6243629
934.5414074 937.9496391 939.8939089 945.8261792 957.8486992
961.8172859 972.3292022 973.8656383 983.4557399 986.8078482
989.8087814 994.2779956 1000.6200508 1003.0889914 1004.7905199
1008.9901281 1016.1263598 1018.3219580 1021.3074397 1024.1128234
1029.9262425
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1720
Rtb_to_modes> Number of blocs = 107
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.270
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.927
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.763
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.038
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.243
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.019
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.231
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.358
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.007
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.848
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.985
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.95
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 642 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002
0.99999 1.00003 0.99998 0.99999 0.99999
1.00003 1.00000 0.99997 1.00000 0.99996
0.99998 0.99999 0.99997 0.99997 0.99999
0.99998 0.99997 0.99997 1.00001 1.00002
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
0.99997 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999
1.00003 1.00003 1.00001 0.99999 1.00002
0.99999 1.00002 0.99999 1.00004 0.99997
0.99998 1.00001 0.99997 1.00004 0.99997
0.99998 0.99998 1.00002 0.99998 1.00003
0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003
0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002
0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001
1.00002 0.99997 1.00002 1.00002 1.00002
1.00004
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 30960 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002
0.99999 1.00003 0.99998 0.99999 0.99999
1.00003 1.00000 0.99997 1.00000 0.99996
0.99998 0.99999 0.99997 0.99997 0.99999
0.99998 0.99997 0.99997 1.00001 1.00002
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999
1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999
0.99997 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999
1.00003 1.00003 1.00001 0.99999 1.00002
0.99999 1.00002 0.99999 1.00004 0.99997
0.99998 1.00001 0.99997 1.00004 0.99997
0.99998 0.99998 1.00002 0.99998 1.00003
0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00003
0.99999 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002
0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001
1.00002 0.99997 1.00002 1.00002 1.00002
1.00004
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 220306205521121170.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220306205521121170.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 220306205521121170.atom
Openam> file on opening on unit 11:
220306205521121170.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 213
First residue number = 24
Last residue number = 246
Number of atoms found = 1720
Mean number per residue = 8.1
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9940E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.270
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.927
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.763
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.038
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.243
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.019
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.231
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.358
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.007
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.848
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.985
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.95
Bfactors> 106 vectors, 5160 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.270000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.585 for 214 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.044 +/- 0.10
Bfactors> = 32.249 +/- 17.06
Bfactors> Shiftng-fct= 32.206
Bfactors> Scaling-fct= 176.020
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 220306205521121170.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220306205521121170.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 122.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 243.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 648.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 670.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 801.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 830.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 845.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 862.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 874.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 939.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 945.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 957.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 986.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1005.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1009.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1030.
Chkmod> 106 vectors, 5160 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1720 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8585
0.0034 0.9199
0.0034 0.9343
0.0034 0.7125
0.0034 0.7324
0.0034 0.8207
122.3710 0.1462
150.7362 0.1410
180.4958 0.1398
189.2651 0.2342
223.6728 0.1424
243.2681 0.1498
271.0538 0.0196
294.5483 0.3819
307.2639 0.3258
322.9975 0.0840
343.1237 0.3411
350.1816 0.3888
375.5279 0.3633
397.7891 0.3038
403.6739 0.2907
416.4693 0.2832
435.0249 0.2288
441.8825 0.3468
445.2055 0.2950
453.9911 0.3134
474.1896 0.4451
493.0841 0.4141
505.9488 0.2247
514.9575 0.2846
521.7814 0.1321
535.3886 0.5222
560.2484 0.0292
562.2443 0.6072
566.2148 0.4904
586.3682 0.4723
588.5760 0.5842
610.5045 0.5230
619.8009 0.5206
622.7426 0.6002
630.2707 0.4913
632.6981 0.4061
648.7090 0.2776
653.6883 0.3831
665.0437 0.4214
670.6932 0.5090
675.5978 0.3717
696.9879 0.4213
701.6247 0.4142
711.8850 0.4008
716.2608 0.2395
720.8554 0.5893
731.0877 0.2445
747.4363 0.2899
750.1133 0.4066
756.6865 0.3429
762.8167 0.2429
772.8749 0.4394
778.3478 0.4380
788.1330 0.4397
792.0133 0.4694
796.4670 0.4239
801.7788 0.3919
805.3737 0.4402
811.5721 0.3290
820.7460 0.4792
830.0315 0.5060
834.8474 0.5230
840.5480 0.3775
845.2343 0.4628
859.9628 0.5462
862.9057 0.4750
866.3831 0.3651
874.0386 0.5258
878.0764 0.3780
887.2271 0.3320
894.1111 0.3616
897.6647 0.2372
903.2299 0.4395
910.8347 0.3746
912.2575 0.4001
918.2481 0.4376
922.2841 0.2954
924.4549 0.2716
928.5909 0.2597
934.4767 0.2975
937.9402 0.3207
939.8240 0.3801
945.7646 0.4559
957.7815 0.3890
961.7742 0.3354
972.2604 0.5642
973.8357 0.5419
983.4143 0.2308
986.7658 0.3794
989.7486 0.4694
994.2060 0.4684
1000.5898 0.3955
1003.0614 0.3102
1004.7644 0.3204
1008.9218 0.4228
1016.0838 0.3595
1018.2862 0.3374
1021.2924 0.4319
1024.0595 0.3989
1029.8577 0.3566
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 220306205521121170 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
making animated gifs
11 models are in 220306205521121170.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220306205521121170.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220306205521121170.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 220306205521121170 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
making animated gifs
11 models are in 220306205521121170.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220306205521121170.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220306205521121170.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 220306205521121170 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
making animated gifs
11 models are in 220306205521121170.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220306205521121170.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220306205521121170.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 220306205521121170 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
making animated gifs
11 models are in 220306205521121170.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220306205521121170.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220306205521121170.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 220306205521121170 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220306205521121170.eigenfacs
220306205521121170.atom
making animated gifs
11 models are in 220306205521121170.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220306205521121170.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220306205521121170.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
220306205521121170.10.pdb
220306205521121170.11.pdb
220306205521121170.7.pdb
220306205521121170.8.pdb
220306205521121170.9.pdb
STDERR:
real 0m4.021s
user 0m4.000s
sys 0m0.016s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|