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LOGs for ID: 2203030929459476

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2203030929459476.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2203030929459476.atom to be opened. Openam> File opened: 2203030929459476.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 99 First residue number = 19 Last residue number = 91 Number of atoms found = 1573 Mean number per residue = 15.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -33.513813 +/- 7.133804 From: -48.167000 To: -13.146000 = 22.661912 +/- 16.343337 From: -6.177000 To: 57.162000 = -8.618802 +/- 5.950025 From: -23.281000 To: 5.000000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 8.0772 % Filled. Pdbmat> 899542 non-zero elements. Pdbmat> 98921 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 125.77 +/- 39.63 Maximum number = 207 Minimum number = 22 Pdbmat> Matrix trace = 1.978420E+06 Pdbmat> Larger element = 781.379 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 99 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2203030929459476.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2203030929459476.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2203030929459476.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1573 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 99 residues. Blocpdb> 13 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 14 atoms in block 2 Block first atom: 14 Blocpdb> 19 atoms in block 3 Block first atom: 28 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 47 Blocpdb> 15 atoms in block 5 Block first atom: 62 Blocpdb> 17 atoms in block 6 Block first atom: 77 Blocpdb> 10 atoms in block 7 Block first atom: 94 Blocpdb> 22 atoms in block 8 Block first atom: 104 Blocpdb> 14 atoms in block 9 Block first atom: 126 Blocpdb> 20 atoms in block 10 Block first atom: 140 Blocpdb> 19 atoms in block 11 Block first atom: 160 Blocpdb> 12 atoms in block 12 Block first atom: 179 Blocpdb> 22 atoms in block 13 Block first atom: 191 Blocpdb> 20 atoms in block 14 Block first atom: 213 Blocpdb> 14 atoms in block 15 Block first atom: 233 Blocpdb> 17 atoms in block 16 Block first atom: 247 Blocpdb> 15 atoms in block 17 Block first atom: 264 Blocpdb> 10 atoms in block 18 Block first atom: 279 Blocpdb> 15 atoms in block 19 Block first atom: 289 Blocpdb> 12 atoms in block 20 Block first atom: 304 Blocpdb> 19 atoms in block 21 Block first atom: 316 Blocpdb> 20 atoms in block 22 Block first atom: 335 Blocpdb> 21 atoms in block 23 Block first atom: 355 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 376 Blocpdb> 11 atoms in block 25 Block first atom: 393 Blocpdb> 11 atoms in block 26 Block first atom: 404 Blocpdb> 19 atoms in block 27 Block first atom: 415 Blocpdb> 10 atoms in block 28 Block first atom: 434 Blocpdb> 11 atoms in block 29 Block first atom: 444 Blocpdb> 24 atoms in block 30 Block first atom: 455 Blocpdb> 14 atoms in block 31 Block first atom: 479 Blocpdb> 21 atoms in block 32 Block first atom: 493 Blocpdb> 14 atoms in block 33 Block first atom: 514 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 528 Blocpdb> 17 atoms in block 35 Block first atom: 542 Blocpdb> 22 atoms in block 36 Block first atom: 559 Blocpdb> 10 atoms in block 37 Block first atom: 581 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 591 Blocpdb> 11 atoms in block 39 Block first atom: 607 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 618 Blocpdb> 14 atoms in block 41 Block first atom: 635 Blocpdb> 14 atoms in block 42 Block first atom: 649 Blocpdb> 10 atoms in block 43 Block first atom: 663 Blocpdb> 24 atoms in block 44 Block first atom: 673 Blocpdb> 12 atoms in block 45 Block first atom: 697 Blocpdb> 19 atoms in block 46 Block first atom: 709 Blocpdb> 7 atoms in block 47 Block first atom: 728 Blocpdb> 22 atoms in block 48 Block first atom: 735 Blocpdb> 7 atoms in block 49 Block first atom: 757 Blocpdb> 12 atoms in block 50 Block first atom: 764 Blocpdb> 20 atoms in block 51 Block first atom: 776 Blocpdb> 24 atoms in block 52 Block first atom: 796 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 820 Blocpdb> 19 atoms in block 54 Block first atom: 839 Blocpdb> 17 atoms in block 55 Block first atom: 858 Blocpdb> 11 atoms in block 56 Block first atom: 875 Blocpdb> 14 atoms in block 57 Block first atom: 886 Blocpdb> 22 atoms in block 58 Block first atom: 900 Blocpdb> 16 atoms in block 59 Block first atom: 922 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 938 Blocpdb> 17 atoms in block 61 Block first atom: 952 Blocpdb> 19 atoms in block 62 Block first atom: 969 Blocpdb> 14 atoms in block 63 Block first atom: 988 Blocpdb> 15 atoms in block 64 Block first atom: 1002 Blocpdb> 15 atoms in block 65 Block first atom: 1017 Blocpdb> 14 atoms in block 66 Block first atom: 1032 Blocpdb> 16 atoms in block 67 Block first atom: 1046 Blocpdb> 17 atoms in block 68 Block first atom: 1062 Blocpdb> 14 atoms in block 69 Block first atom: 1079 Blocpdb> 22 atoms in block 70 Block first atom: 1093 Blocpdb> 14 atoms in block 71 Block first atom: 1115 Blocpdb> 14 atoms in block 72 Block first atom: 1129 Blocpdb> 10 atoms in block 73 Block first atom: 1143 Blocpdb> 7 atoms in block 74 Block first atom: 1153 Blocpdb> 12 atoms in block 75 Block first atom: 1160 Blocpdb> 22 atoms in block 76 Block first atom: 1172 Blocpdb> 22 atoms in block 77 Block first atom: 1194 Blocpdb> 11 atoms in block 78 Block first atom: 1216 Blocpdb> 10 atoms in block 79 Block first atom: 1227 Blocpdb> 20 atoms in block 80 Block first atom: 1237 Blocpdb> 19 atoms in block 81 Block first atom: 1257 Blocpdb> 22 atoms in block 82 Block first atom: 1276 Blocpdb> 15 atoms in block 83 Block first atom: 1298 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1313 Blocpdb> 11 atoms in block 85 Block first atom: 1330 Blocpdb> 14 atoms in block 86 Block first atom: 1341 Blocpdb> 19 atoms in block 87 Block first atom: 1355 Blocpdb> 10 atoms in block 88 Block first atom: 1374 Blocpdb> 17 atoms in block 89 Block first atom: 1384 Blocpdb> 17 atoms in block 90 Block first atom: 1401 Blocpdb> 21 atoms in block 91 Block first atom: 1418 Blocpdb> 14 atoms in block 92 Block first atom: 1439 Blocpdb> 19 atoms in block 93 Block first atom: 1453 Blocpdb> 17 atoms in block 94 Block first atom: 1472 Blocpdb> 15 atoms in block 95 Block first atom: 1489 Blocpdb> 19 atoms in block 96 Block first atom: 1504 Blocpdb> 17 atoms in block 97 Block first atom: 1523 Blocpdb> 14 atoms in block 98 Block first atom: 1540 Blocpdb> 20 atoms in block 99 Block first atom: 1553 Blocpdb> 99 blocks. Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 899641 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 4719 Prepmat> Matrix trace = 1978420.0000 Prepmat> Last element read: 4719 4719 52.5340 Prepmat> 4951 lines saved. Prepmat> 3881 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1573 RTB> Total mass = 1573.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1573 RTB> Number of blocks = 99 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 220649.3842 RTB> 36999 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 594 Diagstd> Nb of non-zero elements: 36999 Diagstd> Projected matrix trace = 220649.3842 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 594 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 220649.3842 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.6782738 1.4776418 2.6400591 4.1289637 5.7162936 7.8279573 9.8682507 11.2585600 13.2641637 15.6220419 17.6872163 18.6701566 20.2091864 21.7751875 23.5244839 26.4734160 28.7561980 30.1958552 31.5013416 32.4138528 34.5357137 36.0865881 37.9551068 44.4152102 45.5018926 46.6523675 48.0988011 52.0838475 53.8832910 54.5854488 58.1983969 59.4187039 62.9429892 65.2427273 69.2712773 69.9811801 71.9876048 72.8308362 76.1739897 78.8935187 81.1955622 83.2048954 84.8309643 87.3926972 88.1823603 90.4700908 91.7237229 93.0488229 96.8734307 97.2781192 97.9273164 98.7795310 100.6628253 101.6752544 106.3377287 106.7498591 110.1800445 111.2449429 111.7053489 112.4283509 114.2276056 117.4011584 118.1008058 120.1304775 122.3582962 123.7946383 125.2795665 128.4668819 128.9281217 131.8969120 133.3109601 134.4550602 136.0906735 139.1369636 140.1248057 141.8718293 143.9121315 145.5727351 147.0666679 148.0436460 150.1982232 150.9249901 152.0771398 154.8465942 155.0064849 158.7746871 159.6528073 160.5598525 162.2329940 167.2742501 168.2449209 171.5818435 173.6208144 175.3823239 176.2146637 177.5019323 179.8192454 182.7106818 183.3665673 184.5686957 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034309 0.0034318 0.0034324 0.0034341 0.0034345 0.0034347 89.4330037 132.0018028 176.4420526 220.6560374 259.6286063 303.8222002 341.1264291 364.3650421 395.4897359 429.2044132 456.6937030 469.2121626 488.1684358 506.7295507 526.6903153 558.7277893 582.3190704 596.7177374 609.4804864 618.2449937 638.1598808 652.3312610 669.0065795 723.7042799 732.5040171 741.7065672 753.1169217 783.6945190 797.1174875 802.2943300 828.4204124 837.0605366 861.5271380 877.1246858 903.7990450 908.4183767 921.3489432 926.7293730 947.7605591 964.5304516 978.5013450 990.5347586 1000.1669105 1015.1561544 1019.7322156 1032.8750654 1040.0066519 1047.4920174 1068.8028924 1071.0330264 1074.6009172 1079.2666572 1089.5065314 1094.9717487 1119.7961502 1121.9640346 1139.8475025 1145.3426125 1147.7102624 1151.4184933 1160.5953253 1176.6071180 1180.1078810 1190.2053057 1201.1907819 1208.2204938 1215.4452514 1230.8095911 1233.0171243 1247.1324920 1253.7998349 1259.1685157 1266.8041048 1280.9038796 1285.4429063 1293.4312947 1302.6987100 1310.1930797 1316.8988141 1321.2657167 1330.8456147 1334.0615224 1339.1439027 1351.2823651 1351.9798352 1368.3144491 1372.0930356 1375.9851932 1383.1359572 1404.4614596 1408.5305191 1422.4301368 1430.8568098 1438.0970336 1441.5054974 1446.7610994 1456.1743127 1467.8350350 1470.4672545 1475.2794805 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1573 Rtb_to_modes> Number of blocs = 99 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9821E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9877E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6783 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.478 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.640 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.129 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.716 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.828 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.868 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> 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Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2203030929459476.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2203030929459476.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2203030929459476.atom Openam> file on opening on unit 11: 2203030929459476.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 99 First residue number = 19 Last residue number = 91 Number of atoms found = 1573 Mean number per residue = 15.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9821E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9877E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6783 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.478 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.640 Rdmodfacs> Numero du 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vecteur en lecture: 160.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 167.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 171.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 175.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 176.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 177.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 182.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 183.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 184.6 Bfactors> 106 vectors, 4719 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.678300 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.040 for 99 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.035 +/- 0.03 Bfactors> = 59.365 +/- 28.06 Bfactors> Shiftng-fct= 59.329 Bfactors> Scaling-fct= 823.644 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2203030929459476.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2203030929459476.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4307E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1079. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1120. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1122. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1148. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1177. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1180. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1190. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1201. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1208. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1231. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1233. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1247. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1254. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1259. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1267. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1281. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1285. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1294. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1303. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1310. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1317. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1321. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1331. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1334. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1339. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1351. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1352. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1368. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1372. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1376. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1383. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1405. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1408. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1422. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1431. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1438. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1441. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1447. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1456. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1468. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1471. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1475. Chkmod> 106 vectors, 4719 coordinates in file. Chkmod> That is: 1573 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 75 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7274 0.0034 0.7586 0.0034 0.8092 0.0034 0.8797 0.0034 0.8835 0.0034 0.8201 89.4309 0.6386 132.0121 0.4864 176.4325 0.5921 220.6475 0.2882 259.6108 0.1640 303.8100 0.2400 341.1075 0.4139 364.3727 0.3489 395.4107 0.6223 429.1579 0.2407 456.7100 0.2354 469.1901 0.2326 488.1573 0.3898 506.7638 0.3161 526.6175 0.1604 558.6678 0.1815 582.3326 0.3469 596.7331 0.3013 609.4413 0.2206 618.1817 0.3279 638.1721 0.1070 652.3341 0.3599 669.0210 0.4240 723.7122 0.0332 732.4573 0.4057 741.6559 0.3476 753.0940 0.4949 783.6319 0.5596 797.0589 0.3592 802.2933 0.5116 828.3963 0.3793 837.0337 0.4168 861.4697 0.6750 877.0687 0.4674 903.7519 0.4133 908.3717 0.3736 921.3247 0.4182 926.6843 0.2330 947.6951 0.4626 964.4675 0.3314 978.4861 0.3726 990.4631 0.3608 1000.1183 0.3950 1015.0969 0.2432 1019.6748 0.2294 1032.8302 0.2926 1039.9409 0.2979 1047.4537 0.3061 1068.7381 0.3063 1070.9974 0.3578 1074.5695 0.1047 1079.2229 0.3873 1089.6609 0.2415 1095.0580 0.4183 1119.5494 0.3684 1121.6538 0.4071 1139.9018 0.4069 1145.0621 0.2959 1147.6335 0.3057 1151.2239 0.3121 1160.4053 0.2506 1176.5508 0.3686 1180.0532 0.4545 1190.0032 0.3838 1201.3439 0.2929 1208.1948 0.3801 1215.4922 0.3842 1230.9154 0.5125 1232.8297 0.2571 1247.0936 0.3263 1253.6945 0.3647 1259.3249 0.5295 1266.7931 0.2621 1280.6787 0.4917 1285.2739 0.4451 1293.5042 0.4587 1302.5879 0.3076 1310.2595 0.3330 1316.9915 0.1281 1321.0142 0.2064 1330.7964 0.3429 1333.8938 0.3478 1339.1871 0.4359 1351.0210 0.1133 1351.8935 0.3131 1368.3648 0.3515 1372.2369 0.3722 1376.0981 0.2594 1382.9359 0.2770 1404.5093 0.4528 1408.2820 0.4287 1422.4443 0.4256 1430.7096 0.3727 1438.1078 0.3335 1441.3836 0.2638 1446.6911 0.2662 1456.0339 0.5266 1467.7291 0.4305 1470.5382 0.3899 1475.3412 0.3189 project conformational change on normal modes Projmod> Version 1.36, April 2003. Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors. Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ? Getnam> 2203030929459476.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2203030929459476.eigenfacs Getnam> Pdb file with the reference structure ? Getnam> 2203030929459476.atom Openam> file on opening on unit 11: 2203030929459476.atom Getnam> Pdb file with the other conformer ? Getnam> 2203030929459476.atom2 Openam> file on opening on unit 12: 2203030929459476.atom2 Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n) Getrep> F Projmod> All masses will all be assumed to be of 1. Getrep> Displacement along one mode ? (y/n) Getrep> F Openam> file on opening on unit 13: projmod.res Openam> file on opening on unit 14: dr.res Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4307E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1254. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1259. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1267. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1281. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1285. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1294. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1303. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1310. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1317. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1383. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1405. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1408. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1422. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1431. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1438. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1441. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1447. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1456. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1468. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1471. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1475. Projmod> 106 vectors, 4719 coordinates in file. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 99 First residue number = 19 Last residue number = 91 Number of atoms found = 1573 Mean number per residue = 15.9 Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 99 First residue number = 19 Last residue number = 91 Number of atoms found = 798 Mean number per residue = 8.1 %Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer. %Projmod-Er> Not enough of them. getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2203030929459476 7 -150 150 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-150 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-130 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-110 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-90 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-70 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-50 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=70 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=90 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=110 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=130 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=150 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom making animated gifs 16 models are in 2203030929459476.7.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2203030929459476.7.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2203030929459476.7.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=7 DQ=-150 99 7.943 51 1.466 MODEL 2 MODE=7 DQ=-130 99 7.720 53 1.401 MODEL 3 MODE=7 DQ=-110 99 7.521 55 1.344 MODEL 4 MODE=7 DQ=-90 99 7.348 60 1.320 MODEL 5 MODE=7 DQ=-70 99 7.205 63 1.252 MODEL 6 MODE=7 DQ=-50 99 7.091 63 1.128 MODEL 7 MODE=7 DQ=-30 99 7.009 63 1.118 MODEL 8 MODE=7 DQ=-10 99 6.960 63 1.223 MODEL 9 MODE=7 DQ=10 99 6.945 62 1.369 MODEL 10 MODE=7 DQ=30 99 6.963 61 1.563 MODEL 11 MODE=7 DQ=50 99 7.015 53 1.627 MODEL 12 MODE=7 DQ=70 99 7.099 41 1.499 MODEL 13 MODE=7 DQ=90 99 7.215 38 1.574 MODEL 14 MODE=7 DQ=110 99 7.361 48 1.537 MODEL 15 MODE=7 DQ=130 99 7.535 42 1.478 MODEL 16 MODE=7 DQ=150 99 7.735 41 1.526 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2203030929459476 8 -150 150 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-150 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-130 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-110 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-90 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-70 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-50 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=70 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=90 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=110 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=130 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=150 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom making animated gifs 16 models are in 2203030929459476.8.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2203030929459476.8.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2203030929459476.8.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=8 DQ=-150 99 7.255 37 1.876 MODEL 2 MODE=8 DQ=-130 99 7.126 46 1.817 MODEL 3 MODE=8 DQ=-110 99 7.022 48 1.706 MODEL 4 MODE=8 DQ=-90 99 6.945 51 1.637 MODEL 5 MODE=8 DQ=-70 99 6.895 56 1.633 MODEL 6 MODE=8 DQ=-50 99 6.875 61 1.594 MODEL 7 MODE=8 DQ=-30 99 6.883 61 1.414 MODEL 8 MODE=8 DQ=-10 99 6.919 62 1.316 MODEL 9 MODE=8 DQ=10 99 6.984 62 1.229 MODEL 10 MODE=8 DQ=30 99 7.077 60 1.112 MODEL 11 MODE=8 DQ=50 99 7.195 60 1.129 MODEL 12 MODE=8 DQ=70 99 7.339 61 1.273 MODEL 13 MODE=8 DQ=90 99 7.506 59 1.323 MODEL 14 MODE=8 DQ=110 99 7.696 55 1.318 MODEL 15 MODE=8 DQ=130 99 7.905 54 1.427 MODEL 16 MODE=8 DQ=150 99 8.134 52 1.529 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2203030929459476 9 -150 150 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-150 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-130 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-110 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-90 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-70 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-50 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=10 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=30 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=50 2203030929459476.eigenfacs 2203030929459476.atom calculating perturbed structure for DQ=70 2203030929459476.eigenfacs 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gif 300x300 16 models are in 2203030929459476.9.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=9 DQ=-150 99 8.895 11 1.792 MODEL 2 MODE=9 DQ=-130 99 8.579 15 2.039 MODEL 3 MODE=9 DQ=-110 99 8.278 44 1.581 MODEL 4 MODE=9 DQ=-90 99 7.992 47 1.554 MODEL 5 MODE=9 DQ=-70 99 7.724 48 1.455 MODEL 6 MODE=9 DQ=-50 99 7.475 57 1.582 MODEL 7 MODE=9 DQ=-30 99 7.246 61 1.492 MODEL 8 MODE=9 DQ=-10 99 7.042 62 1.331 MODEL 9 MODE=9 DQ=10 99 6.862 62 1.224 MODEL 10 MODE=9 DQ=30 99 6.710 61 1.166 MODEL 11 MODE=9 DQ=50 99 6.587 61 1.268 MODEL 12 MODE=9 DQ=70 99 6.494 59 1.358 MODEL 13 MODE=9 DQ=90 99 6.434 56 1.422 MODEL 14 MODE=9 DQ=110 99 6.408 55 1.528 MODEL 15 MODE=9 DQ=130 99 6.414 54 1.633 MODEL 16 MODE=9 DQ=150 99 6.455 50 1.665 getting 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skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2203030929459476.10.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=10 DQ=-150 99 7.393 47 1.515 MODEL 2 MODE=10 DQ=-130 99 7.258 49 1.442 MODEL 3 MODE=10 DQ=-110 99 7.145 56 1.533 MODEL 4 MODE=10 DQ=-90 99 7.054 58 1.450 MODEL 5 MODE=10 DQ=-70 99 6.988 58 1.317 MODEL 6 MODE=10 DQ=-50 99 6.945 62 1.377 MODEL 7 MODE=10 DQ=-30 99 6.928 61 1.243 MODEL 8 MODE=10 DQ=-10 99 6.935 62 1.250 MODEL 9 MODE=10 DQ=10 99 6.968 62 1.294 MODEL 10 MODE=10 DQ=30 99 7.025 63 1.443 MODEL 11 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plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2203030929459476.11.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 16 models are in 2203030929459476.11.pdb, 2 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 10 will be plotted MODEL 13 will be plotted MODEL 16 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=11 DQ=-150 99 7.900 39 1.493 MODEL 2 MODE=11 DQ=-130 99 7.716 42 1.419 MODEL 3 MODE=11 DQ=-110 99 7.548 44 1.435 MODEL 4 MODE=11 DQ=-90 99 7.396 49 1.748 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