*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2203030929459476.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2203030929459476.atom to be opened.
Openam> File opened: 2203030929459476.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 19
Last residue number = 91
Number of atoms found = 1573
Mean number per residue = 15.9
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -33.513813 +/- 7.133804 From: -48.167000 To: -13.146000
= 22.661912 +/- 16.343337 From: -6.177000 To: 57.162000
= -8.618802 +/- 5.950025 From: -23.281000 To: 5.000000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 8.0772 % Filled.
Pdbmat> 899542 non-zero elements.
Pdbmat> 98921 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 125.77 +/- 39.63
Maximum number = 207
Minimum number = 22
Pdbmat> Matrix trace = 1.978420E+06
Pdbmat> Larger element = 781.379
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
99 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2203030929459476.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2203030929459476.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2203030929459476.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1573 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 99 residues.
Blocpdb> 13 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 14
Blocpdb> 19 atoms in block 3
Block first atom: 28
Blocpdb> 15 atoms in block 4
Block first atom: 47
Blocpdb> 15 atoms in block 5
Block first atom: 62
Blocpdb> 17 atoms in block 6
Block first atom: 77
Blocpdb> 10 atoms in block 7
Block first atom: 94
Blocpdb> 22 atoms in block 8
Block first atom: 104
Blocpdb> 14 atoms in block 9
Block first atom: 126
Blocpdb> 20 atoms in block 10
Block first atom: 140
Blocpdb> 19 atoms in block 11
Block first atom: 160
Blocpdb> 12 atoms in block 12
Block first atom: 179
Blocpdb> 22 atoms in block 13
Block first atom: 191
Blocpdb> 20 atoms in block 14
Block first atom: 213
Blocpdb> 14 atoms in block 15
Block first atom: 233
Blocpdb> 17 atoms in block 16
Block first atom: 247
Blocpdb> 15 atoms in block 17
Block first atom: 264
Blocpdb> 10 atoms in block 18
Block first atom: 279
Blocpdb> 15 atoms in block 19
Block first atom: 289
Blocpdb> 12 atoms in block 20
Block first atom: 304
Blocpdb> 19 atoms in block 21
Block first atom: 316
Blocpdb> 20 atoms in block 22
Block first atom: 335
Blocpdb> 21 atoms in block 23
Block first atom: 355
Blocpdb> 17 atoms in block 24
Block first atom: 376
Blocpdb> 11 atoms in block 25
Block first atom: 393
Blocpdb> 11 atoms in block 26
Block first atom: 404
Blocpdb> 19 atoms in block 27
Block first atom: 415
Blocpdb> 10 atoms in block 28
Block first atom: 434
Blocpdb> 11 atoms in block 29
Block first atom: 444
Blocpdb> 24 atoms in block 30
Block first atom: 455
Blocpdb> 14 atoms in block 31
Block first atom: 479
Blocpdb> 21 atoms in block 32
Block first atom: 493
Blocpdb> 14 atoms in block 33
Block first atom: 514
Blocpdb> 14 atoms in block 34
Block first atom: 528
Blocpdb> 17 atoms in block 35
Block first atom: 542
Blocpdb> 22 atoms in block 36
Block first atom: 559
Blocpdb> 10 atoms in block 37
Block first atom: 581
Blocpdb> 16 atoms in block 38
Block first atom: 591
Blocpdb> 11 atoms in block 39
Block first atom: 607
Blocpdb> 17 atoms in block 40
Block first atom: 618
Blocpdb> 14 atoms in block 41
Block first atom: 635
Blocpdb> 14 atoms in block 42
Block first atom: 649
Blocpdb> 10 atoms in block 43
Block first atom: 663
Blocpdb> 24 atoms in block 44
Block first atom: 673
Blocpdb> 12 atoms in block 45
Block first atom: 697
Blocpdb> 19 atoms in block 46
Block first atom: 709
Blocpdb> 7 atoms in block 47
Block first atom: 728
Blocpdb> 22 atoms in block 48
Block first atom: 735
Blocpdb> 7 atoms in block 49
Block first atom: 757
Blocpdb> 12 atoms in block 50
Block first atom: 764
Blocpdb> 20 atoms in block 51
Block first atom: 776
Blocpdb> 24 atoms in block 52
Block first atom: 796
Blocpdb> 19 atoms in block 53
Block first atom: 820
Blocpdb> 19 atoms in block 54
Block first atom: 839
Blocpdb> 17 atoms in block 55
Block first atom: 858
Blocpdb> 11 atoms in block 56
Block first atom: 875
Blocpdb> 14 atoms in block 57
Block first atom: 886
Blocpdb> 22 atoms in block 58
Block first atom: 900
Blocpdb> 16 atoms in block 59
Block first atom: 922
Blocpdb> 14 atoms in block 60
Block first atom: 938
Blocpdb> 17 atoms in block 61
Block first atom: 952
Blocpdb> 19 atoms in block 62
Block first atom: 969
Blocpdb> 14 atoms in block 63
Block first atom: 988
Blocpdb> 15 atoms in block 64
Block first atom: 1002
Blocpdb> 15 atoms in block 65
Block first atom: 1017
Blocpdb> 14 atoms in block 66
Block first atom: 1032
Blocpdb> 16 atoms in block 67
Block first atom: 1046
Blocpdb> 17 atoms in block 68
Block first atom: 1062
Blocpdb> 14 atoms in block 69
Block first atom: 1079
Blocpdb> 22 atoms in block 70
Block first atom: 1093
Blocpdb> 14 atoms in block 71
Block first atom: 1115
Blocpdb> 14 atoms in block 72
Block first atom: 1129
Blocpdb> 10 atoms in block 73
Block first atom: 1143
Blocpdb> 7 atoms in block 74
Block first atom: 1153
Blocpdb> 12 atoms in block 75
Block first atom: 1160
Blocpdb> 22 atoms in block 76
Block first atom: 1172
Blocpdb> 22 atoms in block 77
Block first atom: 1194
Blocpdb> 11 atoms in block 78
Block first atom: 1216
Blocpdb> 10 atoms in block 79
Block first atom: 1227
Blocpdb> 20 atoms in block 80
Block first atom: 1237
Blocpdb> 19 atoms in block 81
Block first atom: 1257
Blocpdb> 22 atoms in block 82
Block first atom: 1276
Blocpdb> 15 atoms in block 83
Block first atom: 1298
Blocpdb> 17 atoms in block 84
Block first atom: 1313
Blocpdb> 11 atoms in block 85
Block first atom: 1330
Blocpdb> 14 atoms in block 86
Block first atom: 1341
Blocpdb> 19 atoms in block 87
Block first atom: 1355
Blocpdb> 10 atoms in block 88
Block first atom: 1374
Blocpdb> 17 atoms in block 89
Block first atom: 1384
Blocpdb> 17 atoms in block 90
Block first atom: 1401
Blocpdb> 21 atoms in block 91
Block first atom: 1418
Blocpdb> 14 atoms in block 92
Block first atom: 1439
Blocpdb> 19 atoms in block 93
Block first atom: 1453
Blocpdb> 17 atoms in block 94
Block first atom: 1472
Blocpdb> 15 atoms in block 95
Block first atom: 1489
Blocpdb> 19 atoms in block 96
Block first atom: 1504
Blocpdb> 17 atoms in block 97
Block first atom: 1523
Blocpdb> 14 atoms in block 98
Block first atom: 1540
Blocpdb> 20 atoms in block 99
Block first atom: 1553
Blocpdb> 99 blocks.
Blocpdb> At most, 24 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 899641 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 4719
Prepmat> Matrix trace = 1978420.0000
Prepmat> Last element read: 4719 4719 52.5340
Prepmat> 4951 lines saved.
Prepmat> 3881 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1573
RTB> Total mass = 1573.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1573
RTB> Number of blocks = 99
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 220649.3842
RTB> 36999 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 594
Diagstd> Nb of non-zero elements: 36999
Diagstd> Projected matrix trace = 220649.3842
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 594 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 220649.3842
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.6782738 1.4776418 2.6400591 4.1289637
5.7162936 7.8279573 9.8682507 11.2585600 13.2641637
15.6220419 17.6872163 18.6701566 20.2091864 21.7751875
23.5244839 26.4734160 28.7561980 30.1958552 31.5013416
32.4138528 34.5357137 36.0865881 37.9551068 44.4152102
45.5018926 46.6523675 48.0988011 52.0838475 53.8832910
54.5854488 58.1983969 59.4187039 62.9429892 65.2427273
69.2712773 69.9811801 71.9876048 72.8308362 76.1739897
78.8935187 81.1955622 83.2048954 84.8309643 87.3926972
88.1823603 90.4700908 91.7237229 93.0488229 96.8734307
97.2781192 97.9273164 98.7795310 100.6628253 101.6752544
106.3377287 106.7498591 110.1800445 111.2449429 111.7053489
112.4283509 114.2276056 117.4011584 118.1008058 120.1304775
122.3582962 123.7946383 125.2795665 128.4668819 128.9281217
131.8969120 133.3109601 134.4550602 136.0906735 139.1369636
140.1248057 141.8718293 143.9121315 145.5727351 147.0666679
148.0436460 150.1982232 150.9249901 152.0771398 154.8465942
155.0064849 158.7746871 159.6528073 160.5598525 162.2329940
167.2742501 168.2449209 171.5818435 173.6208144 175.3823239
176.2146637 177.5019323 179.8192454 182.7106818 183.3665673
184.5686957
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034309 0.0034318 0.0034324 0.0034341 0.0034345
0.0034347 89.4330037 132.0018028 176.4420526 220.6560374
259.6286063 303.8222002 341.1264291 364.3650421 395.4897359
429.2044132 456.6937030 469.2121626 488.1684358 506.7295507
526.6903153 558.7277893 582.3190704 596.7177374 609.4804864
618.2449937 638.1598808 652.3312610 669.0065795 723.7042799
732.5040171 741.7065672 753.1169217 783.6945190 797.1174875
802.2943300 828.4204124 837.0605366 861.5271380 877.1246858
903.7990450 908.4183767 921.3489432 926.7293730 947.7605591
964.5304516 978.5013450 990.5347586 1000.1669105 1015.1561544
1019.7322156 1032.8750654 1040.0066519 1047.4920174 1068.8028924
1071.0330264 1074.6009172 1079.2666572 1089.5065314 1094.9717487
1119.7961502 1121.9640346 1139.8475025 1145.3426125 1147.7102624
1151.4184933 1160.5953253 1176.6071180 1180.1078810 1190.2053057
1201.1907819 1208.2204938 1215.4452514 1230.8095911 1233.0171243
1247.1324920 1253.7998349 1259.1685157 1266.8041048 1280.9038796
1285.4429063 1293.4312947 1302.6987100 1310.1930797 1316.8988141
1321.2657167 1330.8456147 1334.0615224 1339.1439027 1351.2823651
1351.9798352 1368.3144491 1372.0930356 1375.9851932 1383.1359572
1404.4614596 1408.5305191 1422.4301368 1430.8568098 1438.0970336
1441.5054974 1446.7610994 1456.1743127 1467.8350350 1470.4672545
1475.2794805
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1573
Rtb_to_modes> Number of blocs = 99
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9821E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9877E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9908E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6783
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.478
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.640
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.129
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.716
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.828
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.868
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.24
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 184.6
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 594 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00000 1.00003 1.00000 1.00002 1.00000
1.00001 1.00000 1.00002 1.00004 0.99999
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1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999
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1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997
1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000
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1.00000 1.00000 0.99995 0.99999 1.00000
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0.99996 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 28314 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
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1.00001 1.00000 1.00002 1.00004 0.99999
0.99995 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002
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1.00001 0.99996 1.00002 1.00000 1.00001
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0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999
0.99999 1.00002 1.00004 0.99998 1.00000
1.00001 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997
1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002
1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000
0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 1.00006
1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001
1.00000 1.00000 0.99995 0.99999 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99996
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1.00003 0.99999 0.99998 1.00003 1.00001
0.99996 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2203030929459476.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2203030929459476.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2203030929459476.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2203030929459476.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 19
Last residue number = 91
Number of atoms found = 1573
Mean number per residue = 15.9
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9821E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9877E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9908E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6783
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.478
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.640
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.129
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.716
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.828
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.868
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 140.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 141.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 143.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 148.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 158.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 167.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 168.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 171.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 173.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 175.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 176.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 177.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 182.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 183.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 184.6
Bfactors> 106 vectors, 4719 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.678300
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.040 for 99 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.035 +/- 0.03
Bfactors> = 59.365 +/- 28.06
Bfactors> Shiftng-fct= 59.329
Bfactors> Scaling-fct= 823.644
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2203030929459476.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2203030929459476.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4307E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 877.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 903.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1000.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1020.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1079.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1120.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1122.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1148.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1177.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1180.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1190.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1201.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1208.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1231.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1233.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1247.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1254.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1259.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1267.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1281.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1285.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1294.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1303.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1310.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1317.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1321.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1331.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1334.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1339.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1351.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1352.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1368.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1372.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1376.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1383.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1405.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1408.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1422.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1431.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1438.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1441.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1447.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1456.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1468.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1471.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1475.
Chkmod> 106 vectors, 4719 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1573 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 75 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7274
0.0034 0.7586
0.0034 0.8092
0.0034 0.8797
0.0034 0.8835
0.0034 0.8201
89.4309 0.6386
132.0121 0.4864
176.4325 0.5921
220.6475 0.2882
259.6108 0.1640
303.8100 0.2400
341.1075 0.4139
364.3727 0.3489
395.4107 0.6223
429.1579 0.2407
456.7100 0.2354
469.1901 0.2326
488.1573 0.3898
506.7638 0.3161
526.6175 0.1604
558.6678 0.1815
582.3326 0.3469
596.7331 0.3013
609.4413 0.2206
618.1817 0.3279
638.1721 0.1070
652.3341 0.3599
669.0210 0.4240
723.7122 0.0332
732.4573 0.4057
741.6559 0.3476
753.0940 0.4949
783.6319 0.5596
797.0589 0.3592
802.2933 0.5116
828.3963 0.3793
837.0337 0.4168
861.4697 0.6750
877.0687 0.4674
903.7519 0.4133
908.3717 0.3736
921.3247 0.4182
926.6843 0.2330
947.6951 0.4626
964.4675 0.3314
978.4861 0.3726
990.4631 0.3608
1000.1183 0.3950
1015.0969 0.2432
1019.6748 0.2294
1032.8302 0.2926
1039.9409 0.2979
1047.4537 0.3061
1068.7381 0.3063
1070.9974 0.3578
1074.5695 0.1047
1079.2229 0.3873
1089.6609 0.2415
1095.0580 0.4183
1119.5494 0.3684
1121.6538 0.4071
1139.9018 0.4069
1145.0621 0.2959
1147.6335 0.3057
1151.2239 0.3121
1160.4053 0.2506
1176.5508 0.3686
1180.0532 0.4545
1190.0032 0.3838
1201.3439 0.2929
1208.1948 0.3801
1215.4922 0.3842
1230.9154 0.5125
1232.8297 0.2571
1247.0936 0.3263
1253.6945 0.3647
1259.3249 0.5295
1266.7931 0.2621
1280.6787 0.4917
1285.2739 0.4451
1293.5042 0.4587
1302.5879 0.3076
1310.2595 0.3330
1316.9915 0.1281
1321.0142 0.2064
1330.7964 0.3429
1333.8938 0.3478
1339.1871 0.4359
1351.0210 0.1133
1351.8935 0.3131
1368.3648 0.3515
1372.2369 0.3722
1376.0981 0.2594
1382.9359 0.2770
1404.5093 0.4528
1408.2820 0.4287
1422.4443 0.4256
1430.7096 0.3727
1438.1078 0.3335
1441.3836 0.2638
1446.6911 0.2662
1456.0339 0.5266
1467.7291 0.4305
1470.5382 0.3899
1475.3412 0.3189
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2203030929459476.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2203030929459476.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2203030929459476.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2203030929459476.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2203030929459476.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2203030929459476.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4307E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.6
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1475.
Projmod> 106 vectors, 4719 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 19
Last residue number = 91
Number of atoms found = 1573
Mean number per residue = 15.9
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 99
First residue number = 19
Last residue number = 91
Number of atoms found = 798
Mean number per residue = 8.1
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2203030929459476 7 -150 150 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-150
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calculating perturbed structure for DQ=-130
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calculating perturbed structure for DQ=-110
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calculating perturbed structure for DQ=-90
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calculating perturbed structure for DQ=-70
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calculating perturbed structure for DQ=-50
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calculating perturbed structure for DQ=-30
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calculating perturbed structure for DQ=-10
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calculating perturbed structure for DQ=10
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calculating perturbed structure for DQ=30
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
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calculating perturbed structure for DQ=70
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calculating perturbed structure for DQ=90
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2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=110
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2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=130
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2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=150
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making animated gifs
16 models are in 2203030929459476.7.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
16 models are in 2203030929459476.7.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
16 models are in 2203030929459476.7.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-150 99 7.943 51 1.466
MODEL 2 MODE=7 DQ=-130 99 7.720 53 1.401
MODEL 3 MODE=7 DQ=-110 99 7.521 55 1.344
MODEL 4 MODE=7 DQ=-90 99 7.348 60 1.320
MODEL 5 MODE=7 DQ=-70 99 7.205 63 1.252
MODEL 6 MODE=7 DQ=-50 99 7.091 63 1.128
MODEL 7 MODE=7 DQ=-30 99 7.009 63 1.118
MODEL 8 MODE=7 DQ=-10 99 6.960 63 1.223
MODEL 9 MODE=7 DQ=10 99 6.945 62 1.369
MODEL 10 MODE=7 DQ=30 99 6.963 61 1.563
MODEL 11 MODE=7 DQ=50 99 7.015 53 1.627
MODEL 12 MODE=7 DQ=70 99 7.099 41 1.499
MODEL 13 MODE=7 DQ=90 99 7.215 38 1.574
MODEL 14 MODE=7 DQ=110 99 7.361 48 1.537
MODEL 15 MODE=7 DQ=130 99 7.535 42 1.478
MODEL 16 MODE=7 DQ=150 99 7.735 41 1.526
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2203030929459476 8 -150 150 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-150
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calculating perturbed structure for DQ=-130
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2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-110
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=110
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=130
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=150
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
making animated gifs
16 models are in 2203030929459476.8.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
16 models are in 2203030929459476.8.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
16 models are in 2203030929459476.8.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-150 99 7.255 37 1.876
MODEL 2 MODE=8 DQ=-130 99 7.126 46 1.817
MODEL 3 MODE=8 DQ=-110 99 7.022 48 1.706
MODEL 4 MODE=8 DQ=-90 99 6.945 51 1.637
MODEL 5 MODE=8 DQ=-70 99 6.895 56 1.633
MODEL 6 MODE=8 DQ=-50 99 6.875 61 1.594
MODEL 7 MODE=8 DQ=-30 99 6.883 61 1.414
MODEL 8 MODE=8 DQ=-10 99 6.919 62 1.316
MODEL 9 MODE=8 DQ=10 99 6.984 62 1.229
MODEL 10 MODE=8 DQ=30 99 7.077 60 1.112
MODEL 11 MODE=8 DQ=50 99 7.195 60 1.129
MODEL 12 MODE=8 DQ=70 99 7.339 61 1.273
MODEL 13 MODE=8 DQ=90 99 7.506 59 1.323
MODEL 14 MODE=8 DQ=110 99 7.696 55 1.318
MODEL 15 MODE=8 DQ=130 99 7.905 54 1.427
MODEL 16 MODE=8 DQ=150 99 8.134 52 1.529
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2203030929459476 9 -150 150 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-150
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-130
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-110
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
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2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
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calculating perturbed structure for DQ=70
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calculating perturbed structure for DQ=90
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calculating perturbed structure for DQ=110
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calculating perturbed structure for DQ=130
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calculating perturbed structure for DQ=150
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making animated gifs
16 models are in 2203030929459476.9.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
16 models are in 2203030929459476.9.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
16 models are in 2203030929459476.9.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-150 99 8.895 11 1.792
MODEL 2 MODE=9 DQ=-130 99 8.579 15 2.039
MODEL 3 MODE=9 DQ=-110 99 8.278 44 1.581
MODEL 4 MODE=9 DQ=-90 99 7.992 47 1.554
MODEL 5 MODE=9 DQ=-70 99 7.724 48 1.455
MODEL 6 MODE=9 DQ=-50 99 7.475 57 1.582
MODEL 7 MODE=9 DQ=-30 99 7.246 61 1.492
MODEL 8 MODE=9 DQ=-10 99 7.042 62 1.331
MODEL 9 MODE=9 DQ=10 99 6.862 62 1.224
MODEL 10 MODE=9 DQ=30 99 6.710 61 1.166
MODEL 11 MODE=9 DQ=50 99 6.587 61 1.268
MODEL 12 MODE=9 DQ=70 99 6.494 59 1.358
MODEL 13 MODE=9 DQ=90 99 6.434 56 1.422
MODEL 14 MODE=9 DQ=110 99 6.408 55 1.528
MODEL 15 MODE=9 DQ=130 99 6.414 54 1.633
MODEL 16 MODE=9 DQ=150 99 6.455 50 1.665
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2203030929459476 10 -150 150 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
16 models are in 2203030929459476.10.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
16 models are in 2203030929459476.10.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-150 99 7.393 47 1.515
MODEL 2 MODE=10 DQ=-130 99 7.258 49 1.442
MODEL 3 MODE=10 DQ=-110 99 7.145 56 1.533
MODEL 4 MODE=10 DQ=-90 99 7.054 58 1.450
MODEL 5 MODE=10 DQ=-70 99 6.988 58 1.317
MODEL 6 MODE=10 DQ=-50 99 6.945 62 1.377
MODEL 7 MODE=10 DQ=-30 99 6.928 61 1.243
MODEL 8 MODE=10 DQ=-10 99 6.935 62 1.250
MODEL 9 MODE=10 DQ=10 99 6.968 62 1.294
MODEL 10 MODE=10 DQ=30 99 7.025 63 1.443
MODEL 11 MODE=10 DQ=50 99 7.106 62 1.578
MODEL 12 MODE=10 DQ=70 99 7.210 59 1.658
MODEL 13 MODE=10 DQ=90 99 7.336 51 1.797
MODEL 14 MODE=10 DQ=110 99 7.483 45 1.787
MODEL 15 MODE=10 DQ=130 99 7.651 41 1.839
MODEL 16 MODE=10 DQ=150 99 7.836 39 1.937
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2203030929459476 11 -150 150 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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calculating perturbed structure for DQ=-110
2203030929459476.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-90
2203030929459476.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=-70
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calculating perturbed structure for DQ=-10
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calculating perturbed structure for DQ=10
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
2203030929459476.eigenfacs
2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
2203030929459476.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=90
2203030929459476.eigenfacs
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calculating perturbed structure for DQ=110
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2203030929459476.atom
calculating perturbed structure for DQ=130
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calculating perturbed structure for DQ=150
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
16 models are in 2203030929459476.11.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
16 models are in 2203030929459476.11.pdb, 2 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 4 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 10 will be plotted
MODEL 13 will be plotted
MODEL 16 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-150 99 7.900 39 1.493
MODEL 2 MODE=11 DQ=-130 99 7.716 42 1.419
MODEL 3 MODE=11 DQ=-110 99 7.548 44 1.435
MODEL 4 MODE=11 DQ=-90 99 7.396 49 1.748
MODEL 5 MODE=11 DQ=-70 99 7.262 48 1.364
MODEL 6 MODE=11 DQ=-50 99 7.147 58 1.533
MODEL 7 MODE=11 DQ=-30 99 7.052 61 1.436
MODEL 8 MODE=11 DQ=-10 99 6.978 62 1.319
MODEL 9 MODE=11 DQ=10 99 6.925 63 1.258
MODEL 10 MODE=11 DQ=30 99 6.893 63 1.213
MODEL 11 MODE=11 DQ=50 99 6.884 63 1.259
MODEL 12 MODE=11 DQ=70 99 6.897 62 1.344
MODEL 13 MODE=11 DQ=90 99 6.933 60 1.400
MODEL 14 MODE=11 DQ=110 99 6.990 59 1.510
MODEL 15 MODE=11 DQ=130 99 7.069 55 1.598
MODEL 16 MODE=11 DQ=150 99 7.168 53 1.645
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2203030929459476.11.pdb
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real 0m3.359s
user 0m3.332s
sys 0m0.024s
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