*** ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22022514524899168.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 4.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22022514524899168.atom to be opened.
Openam> File opened: 22022514524899168.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 786
First residue number = 80
Last residue number = 301
Number of atoms found = 6268
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -6.675623 +/- 15.433344 From: -42.435000 To: 33.926000
= -2.503884 +/- 13.647716 From: -41.838000 To: 30.385000
= 32.697066 +/- 19.188709 From: -9.662000 To: 80.210000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'B12 ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'B12 ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'B12 ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'B12 ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> 4 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.2146 % Filled.
Pdbmat> 379372 non-zero elements.
Pdbmat> 37986 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 12.12 +/- 3.87
Maximum number = 24
Minimum number = 3
Pdbmat> Matrix trace = 759720.
Pdbmat> Larger element = 110.911
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22022514524899168.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22022514524899168.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22022514524899168.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 6268 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 786 residues.
Blocpdb> 24 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 19 atoms in block 2
Block first atom: 25
Blocpdb> 20 atoms in block 3
Block first atom: 44
Blocpdb> 22 atoms in block 4
Block first atom: 64
Blocpdb> 23 atoms in block 5
Block first atom: 86
Blocpdb> 21 atoms in block 6
Block first atom: 109
Blocpdb> 18 atoms in block 7
Block first atom: 130
Blocpdb> 24 atoms in block 8
Block first atom: 148
Blocpdb> 26 atoms in block 9
Block first atom: 172
Blocpdb> 30 atoms in block 10
Block first atom: 198
Blocpdb> 25 atoms in block 11
Block first atom: 228
Blocpdb> 20 atoms in block 12
Block first atom: 253
Blocpdb> 27 atoms in block 13
Block first atom: 273
Blocpdb> 24 atoms in block 14
Block first atom: 300
Blocpdb> 22 atoms in block 15
Block first atom: 324
Blocpdb> 27 atoms in block 16
Block first atom: 346
Blocpdb> 18 atoms in block 17
Block first atom: 373
Blocpdb> 35 atoms in block 18
Block first atom: 391
Blocpdb> 21 atoms in block 19
Block first atom: 426
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 447
Blocpdb> 28 atoms in block 21
Block first atom: 463
Blocpdb> 19 atoms in block 22
Block first atom: 491
Blocpdb> 26 atoms in block 23
Block first atom: 510
Blocpdb> 27 atoms in block 24
Block first atom: 536
Blocpdb> 26 atoms in block 25
Block first atom: 563
Blocpdb> 24 atoms in block 26
Block first atom: 589
Blocpdb> 17 atoms in block 27
Block first atom: 613
Blocpdb> 25 atoms in block 28
Block first atom: 630
Blocpdb> 18 atoms in block 29
Block first atom: 655
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Block first atom: 673
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Block first atom: 716
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Block first atom: 766
Blocpdb> 21 atoms in block 35
Block first atom: 783
Blocpdb> 27 atoms in block 36
Block first atom: 804
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Block first atom: 881
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Blocpdb> 91 atoms in block 266
Block first atom: 6177
Blocpdb> 266 blocks.
Blocpdb> At most, 91 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 379638 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 18804
Prepmat> Matrix trace = 759720.0000
Prepmat> Last element read: 18804 18804 11.0205
Prepmat> 35512 lines saved.
Prepmat> 34162 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6268
RTB> Total mass = 6268.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 6268
RTB> Number of blocks = 266
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 22635.8287
RTB> 44574 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1596
Diagstd> Nb of non-zero elements: 44574
Diagstd> Projected matrix trace = 22635.8287
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1596 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 22635.8287
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0165516 0.0206499 0.0332839 0.0599570
0.0641502 0.0801385 0.0874985 0.0951535 0.1109516
0.1191318 0.1257723 0.1328832 0.1432446 0.1560509
0.1687157 0.1851208 0.1974909 0.2040655 0.2115667
0.2166882 0.2349434 0.2360314 0.2481324 0.2523838
0.2614983 0.2701923 0.2847879 0.2883246 0.3000204
0.3025305 0.3104217 0.3219250 0.3288774 0.3367999
0.3438283 0.3471836 0.3604829 0.3623291 0.3696168
0.3773166 0.3866526 0.3929129 0.3999848 0.4063223
0.4086428 0.4213095 0.4254007 0.4328510 0.4453189
0.4500035 0.4614556 0.4722593 0.4777296 0.4805935
0.5004150 0.5066247 0.5164597 0.5206948 0.5263961
0.5378006 0.5457573 0.5558160 0.5708114 0.5811233
0.5899488 0.6011394 0.6018107 0.6115851 0.6223529
0.6263317 0.6309874 0.6432699 0.6434306 0.6577727
0.6616612 0.6727314 0.6761087 0.6871338 0.6947631
0.6998338 0.7081237 0.7174257 0.7266797 0.7296817
0.7429958 0.7491169 0.7526132 0.7619901 0.7717538
0.7787164 0.7878955 0.8071358 0.8112843 0.8151454
0.8171529 0.8291984 0.8338812 0.8487840 0.8592547
0.8601197
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034339 0.0034339 0.0034339 0.0034340 0.0034340
0.0034341 13.9706261 15.6046706 19.8112837 26.5898105
27.5039108 30.7408526 32.1214808 33.4971339 36.1711340
37.4808227 38.5112641 39.5849698 41.0992970 42.8971461
44.6039168 46.7221571 48.2579510 49.0546409 49.9480989
50.5490372 52.6352778 52.7570151 54.0924914 54.5539259
55.5302583 56.4458127 57.9503508 58.3090738 59.4799568
59.7282613 60.5022202 61.6130398 62.2747966 63.0204118
63.6745758 63.9845178 65.1984984 65.3652397 66.0193334
66.7034405 67.5236208 68.0680643 68.6779048 69.2198449
69.4172150 70.4848722 70.8262756 71.4437929 72.4654258
72.8455812 73.7666788 74.6252083 75.0561664 75.2808010
76.8175476 77.2926996 78.0393226 78.3586397 78.7864667
79.6353523 80.2222869 80.9581953 82.0430101 82.7807602
83.4069908 84.1943332 84.2413350 84.9226867 85.6670139
85.9404208 86.2592398 87.0947303 87.1056092 88.0710528
88.3309963 89.0668577 89.2901449 90.0152178 90.5135585
90.8432663 91.3797225 91.9779511 92.5692613 92.7602676
93.6027151 93.9874979 94.2065715 94.7916171 95.3969909
95.8263481 96.3894714 97.5592799 97.8096739 98.0421491
98.1627999 98.8836545 99.1624773 100.0446498 100.6598381
100.7104967
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6268
Rtb_to_modes> Number of blocs = 266
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.6552E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.0650E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3284E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.9957E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.4150E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.0139E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.7498E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.5153E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1110
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1191
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1258
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1329
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1432
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1561
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1687
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1851
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1975
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2041
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2116
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2167
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2349
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2360
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2481
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2524
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2615
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2702
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2848
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2883
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3000
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3025
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3104
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3219
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3289
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3368
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3438
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3472
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3605
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3623
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3696
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3773
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3867
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3929
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4000
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4063
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4086
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4213
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4254
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4329
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4453
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4500
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4615
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4723
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4777
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4806
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5004
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5066
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5165
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5207
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5264
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5378
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5458
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5558
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5708
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5811
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5899
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6011
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6018
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6116
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6224
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6263
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6310
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6433
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6434
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6578
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6617
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6727
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6761
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6871
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6948
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6998
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7081
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7174
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7267
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7297
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7430
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7491
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7526
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7620
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7718
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7787
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7879
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8071
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8113
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8151
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8172
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8292
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8339
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8488
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8593
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8601
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1596 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002
0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002
0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
0.99999 1.00001 0.99997 1.00004 0.99998
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000
1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00002
1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 112824 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999
0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 1.00002
0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002
0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000
0.99999 0.99996 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000
1.00000 1.00000 0.99998 1.00003 0.99999
0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000
1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998
0.99999 1.00001 0.99997 1.00004 0.99998
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000
1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00002
1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001
1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001
1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22022514524899168.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22022514524899168.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22022514524899168.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22022514524899168.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 786
First residue number = 80
Last residue number = 301
Number of atoms found = 6268
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9997E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.6552E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.0650E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.3284E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.9957E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.4150E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.0139E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.7498E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.5153E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1110
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1191
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1258
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1329
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1432
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1561
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1687
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1851
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1975
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2041
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2116
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2167
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2349
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2360
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2481
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2524
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2615
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2702
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2848
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2883
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3000
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3025
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3104
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3219
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3289
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3368
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3438
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3472
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3605
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3623
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3696
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3773
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3867
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3929
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4000
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4063
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4086
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4213
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4254
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4329
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4453
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4500
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4615
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4723
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4777
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4806
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5004
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5066
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5165
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5207
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5264
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5378
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5458
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5558
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5708
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5811
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5899
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6011
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6018
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6116
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6224
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6263
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6310
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6433
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6434
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6578
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6617
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6727
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6761
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6871
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6948
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6998
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7081
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7174
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7267
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7297
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7430
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7491
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7526
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7620
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7718
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7787
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7879
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8071
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8113
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8151
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8172
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8292
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8339
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8488
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8593
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8601
Bfactors> 106 vectors, 18804 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.016552
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.470 for 782 C-alpha atoms.
Bfactors> = 1.061 +/- 0.83
Bfactors> = 28.990 +/- 5.86
Bfactors> Shiftng-fct= 27.929
Bfactors> Scaling-fct= 7.027
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22022514524899168.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22022514524899168.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.7
Chkmod> 106 vectors, 18804 coordinates in file.
Chkmod> That is: 6268 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 34 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8559
0.0034 0.6741
0.0034 0.7300
0.0034 0.7851
0.0034 0.7328
0.0034 0.7282
13.9702 0.6787
15.6040 0.6026
19.8105 0.7207
26.5887 0.4805
27.5027 0.5282
30.7396 0.6607
32.1200 0.6181
33.4956 0.6484
36.1775 0.0882
37.4742 0.1758
38.5139 0.4933
39.5858 0.3720
41.0911 0.4685
42.9021 0.0132
44.5999 0.2490
46.7175 0.4873
48.2570 0.4311
49.0567 0.3048
49.9499 0.3186
50.5482 0.4565
52.6282 0.2040
52.7512 0.3858
54.0866 0.3439
54.5533 0.2737
55.5281 0.3045
56.4442 0.4205
57.9491 0.3638
58.3041 0.1718
59.4754 0.4279
59.7227 0.4050
60.4975 0.4335
61.6080 0.2737
62.2743 0.4659
63.0177 0.3919
63.6692 0.4131
63.9833 0.4577
65.1972 0.5423
65.3598 0.4468
66.0150 0.4011
66.6991 0.4800
67.5249 0.4648
68.0640 0.3256
68.6763 0.4538
69.2150 0.4846
69.4106 0.3912
70.4811 0.3186
70.8232 0.3662
71.4448 0.2961
72.4608 0.3957
72.8422 0.2581
73.7671 0.3771
74.6252 0.4607
75.0506 0.5271
75.2781 0.4682
76.8131 0.3514
77.2875 0.3368
78.0390 0.3877
78.3557 0.4628
78.7834 0.3257
79.6319 0.4257
80.2220 0.3599
80.9536 0.3574
82.0387 0.2872
82.7755 0.3498
83.4000 0.4271
84.1880 0.5324
84.2370 0.4189
84.9201 0.4549
85.6666 0.4405
85.9346 0.3992
86.2564 0.3956
87.0930 0.3716
87.0998 0.3972
88.0691 0.3620
88.3298 0.3746
89.0610 0.4355
89.2857 0.4583
90.0091 0.4842
90.5121 0.4164
90.8372 0.4652
91.3743 0.5111
91.9724 0.4346
92.5666 0.4454
92.7575 0.3948
93.5990 0.4746
93.9824 0.5193
94.2017 0.5311
94.7882 0.4844
95.3957 0.4776
95.8212 0.2917
96.3856 0.6009
97.5529 0.4858
97.8064 0.4441
98.0352 0.4533
98.1614 0.4787
98.8795 0.4886
99.1593 0.5127
100.0413 0.5501
100.6582 0.4816
100.7050 0.5152
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 22022514524899168.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22022514524899168.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 22022514524899168.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22022514524899168.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 22022514524899168.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
22022514524899168.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 15.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 38.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 42.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 46.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 48.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 50.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 55.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 60.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 62.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 66.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 69.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 71.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 89.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 97.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 98.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.7
Projmod> 106 vectors, 18804 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 786
First residue number = 80
Last residue number = 301
Number of atoms found = 6268
Mean number per residue = 8.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 786
First residue number = 80
Last residue number = 301
Number of atoms found = 6268
Mean number per residue = 8.0
%Projmod-Wn> Atom 6173 belongs to residue TRP in a file and ALA in the other.
%Projmod-Wn> Atom 6174 belongs to residue TRP in a file and ALA in the other.
%Projmod-Wn> Atom 6175 belongs to residue TRP in a file and ALA in the other.
%Projmod-Wn> Atom 6176 belongs to residue TRP in a file and ALA in the other.
%Projmod-Wn> ...
%Projmod-Wn> 5 atoms belong to different residues in the two pdb files.
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 6268 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 1.91
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.025 Sum= 0.001 q= 3.7414
Vector: 2 F= 0.00 Cos= 0.013 Sum= 0.001 q= 1.9347
Vector: 3 F= 0.00 Cos= -0.005 Sum= 0.001 q= -0.7368
Vector: 4 F= 0.00 Cos= -0.021 Sum= 0.001 q= -3.1472
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.006 Sum= 0.001 q= 0.8509
Vector: 6 F= 0.00 Cos= -0.001 Sum= 0.001 q= -0.1264
Vector: 7 F= 13.97 Cos= 0.135 Sum= 0.020 q= 20.4467
Vector: 8 F= 15.60 Cos= -0.051 Sum= 0.022 q= -7.6933
Vector: 9 F= 19.81 Cos= 0.202 Sum= 0.063 q= 30.4990
Vector: 10 F= 26.59 Cos= 0.081 Sum= 0.069 q= 12.2186
Vector: 11 F= 27.50 Cos= -0.186 Sum= 0.104 q= -28.0651
Vector: 12 F= 30.74 Cos= 0.119 Sum= 0.118 q= 18.0312
Vector: 13 F= 32.12 Cos= 0.034 Sum= 0.119 q= 5.1930
Vector: 14 F= 33.50 Cos= -0.002 Sum= 0.119 q= -0.3650
Vector: 15 F= 36.18 Cos= -0.041 Sum= 0.121 q= -6.2503
Vector: 16 F= 37.47 Cos= 0.017 Sum= 0.121 q= 2.5267
Vector: 17 F= 38.51 Cos= 0.070 Sum= 0.126 q= 10.6474
Vector: 18 F= 39.59 Cos= 0.012 Sum= 0.126 q= 1.7864
Vector: 19 F= 41.09 Cos= -0.036 Sum= 0.128 q= -5.3750
Vector: 20 F= 42.90 Cos= 0.001 Sum= 0.128 q= 0.1882
Vector: 21 F= 44.60 Cos= -0.012 Sum= 0.128 q= -1.8416
Vector: 22 F= 46.72 Cos= 0.009 Sum= 0.128 q= 1.3453
Vector: 23 F= 48.26 Cos= 0.040 Sum= 0.129 q= 6.1117
Vector: 24 F= 49.06 Cos= -0.073 Sum= 0.135 q= -11.0484
Vector: 25 F= 49.95 Cos= 0.099 Sum= 0.145 q= 14.9642
Vector: 26 F= 50.55 Cos= 0.034 Sum= 0.146 q= 5.1481
Vector: 27 F= 52.63 Cos= -0.007 Sum= 0.146 q= -1.0051
Vector: 28 F= 52.75 Cos= -0.045 Sum= 0.148 q= -6.8658
Vector: 29 F= 54.09 Cos= 0.011 Sum= 0.148 q= 1.6859
Vector: 30 F= 54.55 Cos= 0.056 Sum= 0.151 q= 8.4564
Vector: 31 F= 55.53 Cos= 0.045 Sum= 0.153 q= 6.8498
Vector: 32 F= 56.44 Cos= -0.023 Sum= 0.154 q= -3.4751
Vector: 33 F= 57.95 Cos= 0.004 Sum= 0.154 q= 0.6500
%Projmod-Wn> Eigenvector 34 Norm= 0.9999
Vector: 34 F= 58.30 Cos= 0.034 Sum= 0.155 q= 5.0943
Vector: 35 F= 59.48 Cos= 0.000 Sum= 0.155 q= 0.0053
Vector: 36 F= 59.72 Cos= -0.055 Sum= 0.158 q= -8.3773
Vector: 37 F= 60.50 Cos= -0.042 Sum= 0.160 q= -6.3672
Vector: 38 F= 61.61 Cos= 0.069 Sum= 0.164 q= 10.4061
Vector: 39 F= 62.27 Cos= 0.052 Sum= 0.167 q= 7.8271
Vector: 40 F= 63.02 Cos= 0.054 Sum= 0.170 q= 8.1995
Vector: 41 F= 63.67 Cos= -0.036 Sum= 0.171 q= -5.4379
Vector: 42 F= 63.98 Cos= -0.009 Sum= 0.171 q= -1.3035
Vector: 43 F= 65.20 Cos= 0.003 Sum= 0.171 q= 0.5189
Vector: 44 F= 65.36 Cos= -0.033 Sum= 0.172 q= -4.9713
Vector: 45 F= 66.01 Cos= -0.071 Sum= 0.177 q= -10.7175
Vector: 46 F= 66.70 Cos= -0.007 Sum= 0.178 q= -1.0677
Vector: 47 F= 67.52 Cos= -0.037 Sum= 0.179 q= -5.6140
Vector: 48 F= 68.06 Cos= 0.052 Sum= 0.182 q= 7.8298
Vector: 49 F= 68.68 Cos= 0.032 Sum= 0.183 q= 4.8786
Vector: 50 F= 69.21 Cos= -0.008 Sum= 0.183 q= -1.1879
Vector: 51 F= 69.41 Cos= -0.034 Sum= 0.184 q= -5.1729
Vector: 52 F= 70.48 Cos= -0.003 Sum= 0.184 q= -0.4590
Vector: 53 F= 70.82 Cos= -0.020 Sum= 0.184 q= -3.0262
Vector: 54 F= 71.44 Cos= 0.019 Sum= 0.185 q= 2.8481
Vector: 55 F= 72.46 Cos= -0.001 Sum= 0.185 q= -0.1356
Vector: 56 F= 72.84 Cos= 0.090 Sum= 0.193 q= 13.6644
Vector: 57 F= 73.77 Cos= 0.007 Sum= 0.193 q= 1.0405
Vector: 58 F= 74.63 Cos= 0.018 Sum= 0.193 q= 2.6550
Vector: 59 F= 75.05 Cos= 0.014 Sum= 0.193 q= 2.0769
Vector: 60 F= 75.28 Cos= 0.051 Sum= 0.196 q= 7.6772
Vector: 61 F= 76.81 Cos= 0.026 Sum= 0.197 q= 3.8955
Vector: 62 F= 77.29 Cos= 0.010 Sum= 0.197 q= 1.5628
Vector: 63 F= 78.04 Cos= 0.017 Sum= 0.197 q= 2.5725
Vector: 64 F= 78.36 Cos= 0.023 Sum= 0.197 q= 3.4836
Vector: 65 F= 78.78 Cos= 0.037 Sum= 0.199 q= 5.6565
Vector: 66 F= 79.63 Cos= 0.016 Sum= 0.199 q= 2.3515
Vector: 67 F= 80.22 Cos= -0.012 Sum= 0.199 q= -1.8074
Vector: 68 F= 80.95 Cos= 0.012 Sum= 0.199 q= 1.8121
Vector: 69 F= 82.04 Cos= -0.020 Sum= 0.200 q= -3.0660
Vector: 70 F= 82.78 Cos= 0.011 Sum= 0.200 q= 1.7049
Vector: 71 F= 83.40 Cos= 0.066 Sum= 0.204 q= 9.9878
Vector: 72 F= 84.19 Cos= 0.030 Sum= 0.205 q= 4.5255
Vector: 73 F= 84.24 Cos= 0.049 Sum= 0.208 q= 7.4779
Vector: 74 F= 84.92 Cos= -0.066 Sum= 0.212 q= -9.9483
Vector: 75 F= 85.67 Cos= 0.026 Sum= 0.213 q= 3.9349
Vector: 76 F= 85.93 Cos= -0.053 Sum= 0.216 q= -8.0823
Vector: 77 F= 86.26 Cos= 0.047 Sum= 0.218 q= 7.1448
Vector: 78 F= 87.09 Cos= 0.052 Sum= 0.220 q= 7.9178
Vector: 79 F= 87.10 Cos= 0.023 Sum= 0.221 q= 3.4770
Vector: 80 F= 88.07 Cos= 0.007 Sum= 0.221 q= 1.0301
Vector: 81 F= 88.33 Cos= -0.039 Sum= 0.223 q= -5.9284
Vector: 82 F= 89.06 Cos= -0.031 Sum= 0.224 q= -4.7070
Vector: 83 F= 89.29 Cos= -0.031 Sum= 0.225 q= -4.7549
Vector: 84 F= 90.01 Cos= -0.012 Sum= 0.225 q= -1.7425
Vector: 85 F= 90.51 Cos= 0.035 Sum= 0.226 q= 5.2452
Vector: 86 F= 90.84 Cos= 0.012 Sum= 0.226 q= 1.8360
Vector: 87 F= 91.37 Cos= 0.015 Sum= 0.226 q= 2.2695
Vector: 88 F= 91.97 Cos= 0.017 Sum= 0.227 q= 2.6008
Vector: 89 F= 92.57 Cos= 0.038 Sum= 0.228 q= 5.7847
Vector: 90 F= 92.76 Cos= 0.019 Sum= 0.228 q= 2.9150
Vector: 91 F= 93.60 Cos= -0.032 Sum= 0.229 q= -4.8008
Vector: 92 F= 93.98 Cos= 0.047 Sum= 0.232 q= 7.1644
Vector: 93 F= 94.20 Cos= 0.002 Sum= 0.232 q= 0.2417
Vector: 94 F= 94.79 Cos= 0.037 Sum= 0.233 q= 5.5940
Vector: 95 F= 95.40 Cos= 0.018 Sum= 0.233 q= 2.6631
Vector: 96 F= 95.82 Cos= -0.018 Sum= 0.234 q= -2.6877
Vector: 97 F= 96.39 Cos= -0.001 Sum= 0.234 q= -0.1873
Vector: 98 F= 97.55 Cos= 0.007 Sum= 0.234 q= 1.1235
Vector: 99 F= 97.81 Cos= -0.001 Sum= 0.234 q= -0.1478
Vector: 100 F= 98.04 Cos= -0.010 Sum= 0.234 q= -1.5180
Vector: 101 F= 98.16 Cos= -0.052 Sum= 0.237 q= -7.8617
Vector: 102 F= 98.88 Cos= -0.036 Sum= 0.238 q= -5.4517
Vector: 103 F= 99.16 Cos= 0.002 Sum= 0.238 q= 0.3453
Vector: 104 F= 100.04 Cos= 0.000 Sum= 0.238 q= 0.0548
Vector: 105 F= 100.66 Cos= -0.022 Sum= 0.238 q= -3.2656
Vector: 106 F= 100.71 Cos= -0.011 Sum= 0.238 q= -1.5898
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003434
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434
Projmod> Lowest non-zero frequency : 13.970176
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.20 for mode 9 with F= 19.81 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.041 0.093 0.126 0.142 0.157 0.238
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22022514524899168 7 -200 200 10 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-200
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-190
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-180
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-170
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-160
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-150
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-140
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-130
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-120
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-110
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-100
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-90
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-70
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-50
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-30
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=-10
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=10
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=30
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=50
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=70
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=90
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=110
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=120
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=130
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=140
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=150
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=160
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=170
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=180
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=190
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
calculating perturbed structure for DQ=200
22022514524899168.eigenfacs
22022514524899168.atom
making animated gifs
41 models are in 22022514524899168.7.pdb, 7 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 17 will be plotted
MODEL 25 will be plotted
MODEL 33 will be plotted
MODEL 41 will be plotted
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
41 models are in 22022514524899168.7.pdb, 7 models will be skipped
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MODEL 9 will be plotted
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MODEL 25 will be plotted
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MODEL 33 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-200 195 0.897 194 0.871
MODEL 2 MODE=7 DQ=-190 195 0.868 194 0.843
MODEL 3 MODE=7 DQ=-180 195 0.839 195 0.839
MODEL 4 MODE=7 DQ=-170 195 0.811 195 0.811
MODEL 5 MODE=7 DQ=-160 195 0.782 195 0.782
MODEL 6 MODE=7 DQ=-150 195 0.754 195 0.754
MODEL 7 MODE=7 DQ=-140 195 0.727 195 0.727
MODEL 8 MODE=7 DQ=-130 195 0.699 195 0.699
MODEL 9 MODE=7 DQ=-120 195 0.672 195 0.672
MODEL 10 MODE=7 DQ=-110 195 0.645 195 0.645
MODEL 11 MODE=7 DQ=-100 195 0.619 195 0.619
MODEL 12 MODE=7 DQ=-90 195 0.593 195 0.593
MODEL 13 MODE=7 DQ=-80 195 0.567 195 0.567
MODEL 14 MODE=7 DQ=-70 195 0.542 195 0.542
MODEL 15 MODE=7 DQ=-60 195 0.518 195 0.518
MODEL 16 MODE=7 DQ=-50 195 0.495 195 0.495
MODEL 17 MODE=7 DQ=-40 195 0.472 195 0.472
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MODEL 19 MODE=7 DQ=-20 195 0.431 195 0.431
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MODEL 21 MODE=7 DQ=0 195 0.395 195 0.395
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getting mode 8
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normal mode computation
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getting mode 9
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normal mode computation
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MODEL 14 MODE=9 DQ=-70 195 0.345 195 0.345
MODEL 15 MODE=9 DQ=-60 195 0.346 195 0.346
MODEL 16 MODE=9 DQ=-50 195 0.349 195 0.349
MODEL 17 MODE=9 DQ=-40 195 0.355 195 0.355
MODEL 18 MODE=9 DQ=-30 195 0.362 195 0.362
MODEL 19 MODE=9 DQ=-20 195 0.372 195 0.372
MODEL 20 MODE=9 DQ=-10 195 0.382 195 0.382
MODEL 21 MODE=9 DQ=0 195 0.395 195 0.395
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MODEL 38 MODE=9 DQ=170 195 0.716 195 0.716
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MODEL 40 MODE=9 DQ=190 195 0.760 195 0.760
MODEL 41 MODE=9 DQ=200 195 0.782 195 0.782
getting mode 10
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normal mode computation
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MODEL 21 MODE=10 DQ=0 195 0.395 195 0.395
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MODEL 41 MODE=10 DQ=200 195 1.326 193 1.291
getting mode 11
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normal mode computation
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