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***  s_long  ***

LOGs for ID: 22022511510884478

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22022511510884478.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22022511510884478.atom to be opened. Openam> File opened: 22022511510884478.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 214 First residue number = 1 Last residue number = 214 Number of atoms found = 6802 Mean number per residue = 31.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 152.097270 +/- 43.193165 From: 65.160000 To: 229.170000 = 143.187004 +/- 42.136547 From: 57.320000 To: 237.010000 = 77.138840 +/- 22.233191 From: 18.630000 To: 120.110000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'A ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'A ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'U ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'G ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 214 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.4424 % Filled. Pdbmat> 3003306 non-zero elements. Pdbmat> 329736 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 96.95 +/- 27.50 Maximum number = 175 Minimum number = 20 Pdbmat> Matrix trace = 6.594720E+06 Pdbmat> Larger element = 706.589 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 214 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22022511510884478.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22022511510884478.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22022511510884478.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6802 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 214 residues. Blocpdb> 62 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 64 atoms in block 2 Block first atom: 63 Blocpdb> 66 atoms in block 3 Block first atom: 127 Blocpdb> 60 atoms in block 4 Block first atom: 193 Blocpdb> 64 atoms in block 5 Block first atom: 253 Blocpdb> 64 atoms in block 6 Block first atom: 317 Blocpdb> 67 atoms in block 7 Block first atom: 381 Blocpdb> 61 atoms in block 8 Block first atom: 448 Blocpdb> 60 atoms in block 9 Block first atom: 509 Blocpdb> 60 atoms in block 10 Block first atom: 569 Blocpdb> 64 atoms in block 11 Block first atom: 629 Blocpdb> 67 atoms in block 12 Block first atom: 693 Blocpdb> 64 atoms in block 13 Block first atom: 760 Blocpdb> 64 atoms in block 14 Block first atom: 824 Blocpdb> 61 atoms in block 15 Block first atom: 888 Blocpdb> 60 atoms in block 16 Block first atom: 949 Blocpdb> 66 atoms in block 17 Block first atom: 1009 Blocpdb> 67 atoms in block 18 Block first atom: 1075 Blocpdb> 63 atoms in block 19 Block first atom: 1142 Blocpdb> 62 atoms in block 20 Block first atom: 1205 Blocpdb> 64 atoms in block 21 Block first atom: 1267 Blocpdb> 63 atoms in block 22 Block first atom: 1331 Blocpdb> 64 atoms in block 23 Block first atom: 1394 Blocpdb> 67 atoms in block 24 Block first atom: 1458 Blocpdb> 67 atoms in block 25 Block first atom: 1525 Blocpdb> 66 atoms in block 26 Block first atom: 1592 Blocpdb> 61 atoms in block 27 Block first atom: 1658 Blocpdb> 67 atoms in block 28 Block first atom: 1719 Blocpdb> 60 atoms in block 29 Block first atom: 1786 Blocpdb> 63 atoms in block 30 Block first atom: 1846 Blocpdb> 64 atoms in block 31 Block first atom: 1909 Blocpdb> 63 atoms in block 32 Block first atom: 1973 Blocpdb> 64 atoms in block 33 Block first atom: 2036 Blocpdb> 61 atoms in block 34 Block first atom: 2100 Blocpdb> 64 atoms in block 35 Block first atom: 2161 Blocpdb> 67 atoms in block 36 Block first atom: 2225 Blocpdb> 67 atoms in block 37 Block first atom: 2292 Blocpdb> 63 atoms in block 38 Block first atom: 2359 Blocpdb> 60 atoms in block 39 Block first atom: 2422 Blocpdb> 64 atoms in block 40 Block first atom: 2482 Blocpdb> 63 atoms in block 41 Block first atom: 2546 Blocpdb> 67 atoms in block 42 Block first atom: 2609 Blocpdb> 60 atoms in block 43 Block first atom: 2676 Blocpdb> 60 atoms in block 44 Block first atom: 2736 Blocpdb> 63 atoms in block 45 Block first atom: 2796 Blocpdb> 66 atoms in block 46 Block first atom: 2859 Blocpdb> 66 atoms in block 47 Block first atom: 2925 Blocpdb> 61 atoms in block 48 Block first atom: 2991 Blocpdb> 64 atoms in block 49 Block first atom: 3052 Blocpdb> 64 atoms in block 50 Block first atom: 3116 Blocpdb> 63 atoms in block 51 Block first atom: 3180 Blocpdb> 66 atoms in block 52 Block first atom: 3243 Blocpdb> 63 atoms in block 53 Block first atom: 3309 Blocpdb> 64 atoms in block 54 Block first atom: 3372 Blocpdb> 61 atoms in block 55 Block first atom: 3436 Blocpdb> 64 atoms in block 56 Block first atom: 3497 Blocpdb> 60 atoms in block 57 Block first atom: 3561 Blocpdb> 64 atoms in block 58 Block first atom: 3621 Blocpdb> 63 atoms in block 59 Block first atom: 3685 Blocpdb> 67 atoms in block 60 Block first atom: 3748 Blocpdb> 62 atoms in block 61 Block first atom: 3815 Blocpdb> 64 atoms in block 62 Block first atom: 3877 Blocpdb> 63 atoms in block 63 Block first atom: 3941 Blocpdb> 60 atoms in block 64 Block first atom: 4004 Blocpdb> 60 atoms in block 65 Block first atom: 4064 Blocpdb> 65 atoms in block 66 Block first atom: 4124 Blocpdb> 64 atoms in block 67 Block first atom: 4189 Blocpdb> 67 atoms in block 68 Block first atom: 4253 Blocpdb> 61 atoms in block 69 Block first atom: 4320 Blocpdb> 63 atoms in block 70 Block first atom: 4381 Blocpdb> 66 atoms in block 71 Block first atom: 4444 Blocpdb> 61 atoms in block 72 Block first atom: 4510 Blocpdb> 64 atoms in block 73 Block first atom: 4571 Blocpdb> 67 atoms in block 74 Block first atom: 4635 Blocpdb> 63 atoms in block 75 Block first atom: 4702 Blocpdb> 68 atoms in block 76 Block first atom: 4765 Blocpdb> 64 atoms in block 77 Block first atom: 4833 Blocpdb> 63 atoms in block 78 Block first atom: 4897 Blocpdb> 63 atoms in block 79 Block first atom: 4960 Blocpdb> 66 atoms in block 80 Block first atom: 5023 Blocpdb> 61 atoms in block 81 Block first atom: 5089 Blocpdb> 64 atoms in block 82 Block first atom: 5150 Blocpdb> 61 atoms in block 83 Block first atom: 5214 Blocpdb> 67 atoms in block 84 Block first atom: 5275 Blocpdb> 66 atoms in block 85 Block first atom: 5342 Blocpdb> 60 atoms in block 86 Block first atom: 5408 Blocpdb> 61 atoms in block 87 Block first atom: 5468 Blocpdb> 60 atoms in block 88 Block first atom: 5529 Blocpdb> 64 atoms in block 89 Block first atom: 5589 Blocpdb> 61 atoms in block 90 Block first atom: 5653 Blocpdb> 63 atoms in block 91 Block first atom: 5714 Blocpdb> 61 atoms in block 92 Block first atom: 5777 Blocpdb> 66 atoms in block 93 Block first atom: 5838 Blocpdb> 65 atoms in block 94 Block first atom: 5904 Blocpdb> 61 atoms in block 95 Block first atom: 5969 Blocpdb> 64 atoms in block 96 Block first atom: 6030 Blocpdb> 67 atoms in block 97 Block first atom: 6094 Blocpdb> 63 atoms in block 98 Block first atom: 6161 Blocpdb> 66 atoms in block 99 Block first atom: 6224 Blocpdb> 66 atoms in block 100 Block first atom: 6290 Blocpdb> 64 atoms in block 101 Block first atom: 6356 Blocpdb> 62 atoms in block 102 Block first atom: 6420 Blocpdb> 64 atoms in block 103 Block first atom: 6482 Blocpdb> 63 atoms in block 104 Block first atom: 6546 Blocpdb> 64 atoms in block 105 Block first atom: 6609 Blocpdb> 65 atoms in block 106 Block first atom: 6673 Blocpdb> 65 atoms in block 107 Block first atom: 6737 Blocpdb> 107 blocks. Blocpdb> At most, 68 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 60 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3003413 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 20406 Prepmat> Matrix trace = 6594720.0000 Prepmat> Last element read: 20406 20406 199.2682 Prepmat> 5779 lines saved. Prepmat> 5347 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6802 RTB> Total mass = 6802.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6802 RTB> Number of blocks = 107 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 106904.6040 RTB> 13911 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 642 Diagstd> Nb of non-zero elements: 13911 Diagstd> Projected matrix trace = 106904.6040 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 642 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 106904.6040 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0008743 0.0014815 0.0051571 0.0071561 0.0110033 0.0145144 0.0178428 0.0282905 0.0338025 0.0409723 0.0532720 0.0617875 0.0714302 0.0861935 0.0939680 0.1151496 0.1326007 0.1492288 0.1722060 0.2344512 0.2771686 0.2941934 0.3513574 0.3871322 0.4689185 0.4908757 0.6168033 0.6665347 0.7306475 0.7631076 0.8543371 0.9135820 1.0439389 1.1666917 1.3352885 1.4511332 1.8182205 1.8613248 1.8906402 1.9748717 2.1909836 2.3797697 2.7505491 2.9781601 3.2414630 3.4085300 3.6826585 3.8129199 4.0355338 4.3579696 4.3973019 4.8988961 5.0865892 5.5440681 5.6163536 6.0149703 6.3595467 7.0685410 7.2039867 7.2954868 7.7927821 7.9612525 8.3689954 8.4525599 8.9788555 9.3441994 9.7027414 10.5737280 11.4524640 11.8899748 11.9763684 12.2275375 12.5706046 13.6086531 13.8771092 14.3219971 15.2001738 16.2476168 16.3662738 16.6268407 16.7977324 17.0376368 18.0256788 19.0342390 20.1077119 20.2916437 20.5711923 20.8387679 20.9258648 21.9543551 22.7396283 22.8545620 23.5230839 23.8776645 24.7809829 25.1506845 25.1912133 25.3710870 25.9385344 26.0709302 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034335 0.0034336 0.0034337 0.0034339 0.0034339 0.0034341 3.2109614 4.1796450 7.7982852 9.1861458 11.3908603 13.0826412 14.5052889 18.2648296 19.9650296 21.9806573 25.0636727 26.9926470 29.0226028 31.8810474 33.2878077 36.8490694 39.5428770 41.9489962 45.0629234 52.5801092 57.1698854 58.8995161 64.3679723 67.5654874 74.3607825 76.0818436 85.2842094 88.6556975 92.8216418 94.8611052 100.3713844 103.7932364 110.9514100 117.2933360 125.4824038 130.8124039 146.4261213 148.1516040 149.3137247 152.6035821 160.7366243 167.5184875 180.0963791 187.3998775 195.5085779 200.4835938 208.3895822 212.0430879 218.1452557 226.6926171 227.7133122 240.3501488 244.9111799 255.6875367 257.3490108 266.3250551 273.8472359 288.7088992 291.4618598 293.3069933 303.1388132 306.3980383 314.1462974 315.7107774 325.3911754 331.9451513 338.2536638 353.1094561 367.4893414 374.4430265 375.8009325 379.7211455 385.0111999 400.5925351 404.5244569 410.9576515 423.3694895 437.7136742 439.3090868 442.7923903 445.0620960 448.2290074 461.0426411 473.7650715 486.9412959 489.1633312 492.5212946 495.7141304 496.7489839 508.8099819 517.8297061 519.1366992 526.6746429 530.6292705 540.5732417 544.5906557 545.0292659 546.9716505 553.0545847 554.4642427 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6802 Rtb_to_modes> Number of blocs = 107 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.7434E-04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4815E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.1571E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1561E-03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.1003E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4514E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.7843E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.8291E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.3803E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.0972E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.3272E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.1787E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.1430E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.6194E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.3968E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1151 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1326 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1492 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1722 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2345 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2772 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2942 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3514 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3871 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4689 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4909 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6168 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6665 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7306 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7631 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8543 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9136 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.044 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.167 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.335 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.451 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.818 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.861 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.891 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.975 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.191 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.380 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.751 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.978 Rdmodfacs> Eigenvector 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.7434E-04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4815E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.1571E-03 Rdmodfacs> 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en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2942 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3514 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3871 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4689 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4909 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6168 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6665 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7306 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7631 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur 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lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.358 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.397 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.899 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.087 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.544 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.616 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.015 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.360 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du 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vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.07 Bfactors> 106 vectors, 20406 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.000874 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> 0 negative values found in the B-factors column of pdb file. %Bfactors-Wn> So, only mass-weighted predicted B-factors will be saved. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22022511510884478.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22022511510884478.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.211 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 4.180 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 7.798 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.186 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 11.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 14.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 19.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 21.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 26.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 29.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 31.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 33.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 36.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 39.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 41.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 52.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 57.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 58.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 88.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 100.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 103.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 125.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 146.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 187.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 314.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.4 Chkmod> 106 vectors, 20406 coordinates in file. Chkmod> That is: 6802 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.5823 0.0034 0.6931 0.0034 0.9433 0.0034 0.8858 0.0034 0.8404 0.0034 0.9428 3.2108 0.6827 4.1795 0.6557 7.7979 0.7388 9.1858 0.6572 11.3902 0.5790 13.0819 0.4391 14.5048 0.6798 18.2642 0.5597 19.9643 0.6031 21.9796 0.5534 25.0626 0.5862 26.9914 0.7034 29.0213 0.7200 31.8798 0.6864 33.2864 0.4697 36.8395 0.6113 39.5411 0.4352 41.9432 0.6077 45.0602 0.6799 52.5833 0.6319 57.1707 0.4953 58.8977 0.4740 64.3691 0.5359 67.5598 0.5135 74.3561 0.5542 76.0805 0.4916 85.2803 0.6084 88.6496 0.4814 92.8146 0.5069 94.8566 0.1855 100.3649 0.3751 103.7898 0.5373 110.9499 0.3568 117.3038 0.4354 125.4635 0.4476 130.8008 0.3681 146.4110 0.5676 148.1323 0.4534 149.3215 0.3697 152.6020 0.2595 160.7303 0.5569 167.5194 0.4500 180.1034 0.4219 187.3868 0.2141 195.4862 0.5250 200.4888 0.5315 208.3903 0.3657 212.0362 0.3988 218.1485 0.4721 226.6837 0.5947 227.6957 0.5352 240.3424 0.2460 244.9106 0.5722 255.6750 0.5494 257.3299 0.5673 266.3143 0.5384 273.8452 0.3771 288.7059 0.3191 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