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***  DARK TET  ***

LOGs for ID: 22022316112813361

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22022316112813361.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22022316112813361.atom to be opened. Openam> File opened: 22022316112813361.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 786 First residue number = 80 Last residue number = 301 Number of atoms found = 6268 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -6.675623 +/- 15.433344 From: -42.435000 To: 33.926000 = -2.503884 +/- 13.647716 From: -41.838000 To: 30.385000 = 32.697066 +/- 19.188709 From: -9.662000 To: 80.210000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'B12 ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'B12 ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'B12 ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'B12 ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 4 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3710 % Filled. Pdbmat> 2423999 non-zero elements. Pdbmat> 265204 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.62 +/- 21.02 Maximum number = 131 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 5.304080E+06 Pdbmat> Larger element = 496.823 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 786 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22022316112813361.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22022316112813361.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22022316112813361.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6268 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 786 residues. Blocpdb> 32 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 23 atoms in block 2 Block first atom: 33 Blocpdb> 30 atoms in block 3 Block first atom: 56 Blocpdb> 31 atoms in block 4 Block first atom: 86 Blocpdb> 22 atoms in block 5 Block first atom: 117 Blocpdb> 33 atoms in block 6 Block first atom: 139 Blocpdb> 34 atoms in block 7 Block first atom: 172 Blocpdb> 40 atoms in block 8 Block first atom: 206 Blocpdb> 27 atoms in block 9 Block first atom: 246 Blocpdb> 35 atoms in block 10 Block first atom: 273 Blocpdb> 30 atoms in block 11 Block first atom: 308 Blocpdb> 35 atoms in block 12 Block first atom: 338 Blocpdb> 32 atoms in block 13 Block first atom: 373 Blocpdb> 34 atoms in block 14 Block first atom: 405 Blocpdb> 24 atoms in block 15 Block first atom: 439 Blocpdb> 36 atoms in block 16 Block first atom: 463 Blocpdb> 29 atoms in block 17 Block first atom: 499 Blocpdb> 35 atoms in block 18 Block first atom: 528 Blocpdb> 34 atoms in block 19 Block first atom: 563 Blocpdb> 29 atoms in block 20 Block first atom: 597 Blocpdb> 29 atoms in block 21 Block first atom: 626 Blocpdb> 25 atoms in block 22 Block first atom: 655 Blocpdb> 29 atoms in block 23 Block first atom: 680 Blocpdb> 27 atoms in block 24 Block first atom: 709 Blocpdb> 38 atoms in block 25 Block first atom: 736 Blocpdb> 25 atoms in block 26 Block first atom: 774 Blocpdb> 32 atoms in block 27 Block first atom: 799 Blocpdb> 39 atoms in block 28 Block first atom: 831 Blocpdb> 23 atoms in block 29 Block first atom: 870 Blocpdb> 32 atoms in block 30 Block first atom: 893 Blocpdb> 29 atoms in block 31 Block first atom: 925 Blocpdb> 31 atoms in block 32 Block first atom: 954 Blocpdb> 29 atoms in block 33 Block first atom: 985 Blocpdb> 34 atoms in block 34 Block first atom: 1014 Blocpdb> 21 atoms in block 35 Block first atom: 1048 Blocpdb> 26 atoms in block 36 Block first atom: 1069 Blocpdb> 30 atoms in block 37 Block first atom: 1095 Blocpdb> 31 atoms in block 38 Block first atom: 1125 Blocpdb> 27 atoms in block 39 Block first atom: 1156 Blocpdb> 30 atoms in block 40 Block first atom: 1183 Blocpdb> 31 atoms in block 41 Block first atom: 1213 Blocpdb> 30 atoms in block 42 Block first atom: 1244 Blocpdb> 22 atoms in block 43 Block first atom: 1274 Blocpdb> 29 atoms in block 44 Block first atom: 1296 Blocpdb> 35 atoms in block 45 Block first atom: 1325 Blocpdb> 30 atoms in block 46 Block first atom: 1360 Blocpdb> 33 atoms in block 47 Block first atom: 1390 Blocpdb> 26 atoms in block 48 Block first atom: 1423 Blocpdb> 22 atoms in block 49 Block first atom: 1449 Blocpdb> 91 atoms in block 50 Block first atom: 1471 Blocpdb> 27 atoms in block 51 Block first atom: 1562 Blocpdb> 29 atoms in block 52 Block first atom: 1589 Blocpdb> 32 atoms in block 53 Block first atom: 1618 Blocpdb> 25 atoms in block 54 Block first atom: 1650 Blocpdb> 23 atoms in block 55 Block first atom: 1675 Blocpdb> 41 atoms in block 56 Block first atom: 1698 Blocpdb> 34 atoms in block 57 Block first atom: 1739 Blocpdb> 34 atoms in block 58 Block first atom: 1773 Blocpdb> 28 atoms in block 59 Block first atom: 1807 Blocpdb> 34 atoms in block 60 Block first atom: 1835 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1869 Blocpdb> 29 atoms in block 62 Block first atom: 1902 Blocpdb> 40 atoms in block 63 Block first atom: 1931 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1971 Blocpdb> 30 atoms in block 65 Block first atom: 1996 Blocpdb> 29 atoms in block 66 Block first atom: 2026 Blocpdb> 37 atoms in block 67 Block first atom: 2055 Blocpdb> 33 atoms in block 68 Block first atom: 2092 Blocpdb> 33 atoms in block 69 Block first atom: 2125 Blocpdb> 28 atoms in block 70 Block first atom: 2158 Blocpdb> 25 atoms in block 71 Block first atom: 2186 Blocpdb> 29 atoms in block 72 Block first atom: 2211 Blocpdb> 28 atoms in block 73 Block first atom: 2240 Blocpdb> 34 atoms in block 74 Block first atom: 2268 Blocpdb> 26 atoms in block 75 Block first atom: 2302 Blocpdb> 26 atoms in block 76 Block first atom: 2328 Blocpdb> 41 atoms in block 77 Block first atom: 2354 Blocpdb> 31 atoms in block 78 Block first atom: 2395 Blocpdb> 32 atoms in block 79 Block first atom: 2426 Blocpdb> 27 atoms in block 80 Block first atom: 2458 Blocpdb> 29 atoms in block 81 Block first atom: 2485 Blocpdb> 32 atoms in block 82 Block first atom: 2514 Blocpdb> 35 atoms in block 83 Block first atom: 2546 Blocpdb> 21 atoms in block 84 Block first atom: 2581 Blocpdb> 27 atoms in block 85 Block first atom: 2602 Blocpdb> 26 atoms in block 86 Block first atom: 2629 Blocpdb> 30 atoms in block 87 Block first atom: 2655 Blocpdb> 31 atoms in block 88 Block first atom: 2685 Blocpdb> 25 atoms in block 89 Block first atom: 2716 Blocpdb> 30 atoms in block 90 Block first atom: 2741 Blocpdb> 36 atoms in block 91 Block first atom: 2771 Blocpdb> 25 atoms in block 92 Block first atom: 2807 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 2832 Blocpdb> 34 atoms in block 94 Block first atom: 2852 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2886 Blocpdb> 38 atoms in block 96 Block first atom: 2914 Blocpdb> 29 atoms in block 97 Block first atom: 2952 Blocpdb> 27 atoms in block 98 Block first atom: 2981 Blocpdb> 37 atoms in block 99 Block first atom: 3008 Blocpdb> 11 atoms in block 100 Block first atom: 3045 Blocpdb> 91 atoms in block 101 Block first atom: 3056 Blocpdb> 35 atoms in block 102 Block first atom: 3147 Blocpdb> 23 atoms in block 103 Block first atom: 3182 Blocpdb> 30 atoms in block 104 Block first atom: 3205 Blocpdb> 31 atoms in block 105 Block first atom: 3235 Blocpdb> 25 atoms in block 106 Block first atom: 3266 Blocpdb> 27 atoms in block 107 Block first atom: 3291 Blocpdb> 37 atoms in block 108 Block first atom: 3318 Blocpdb> 44 atoms in block 109 Block first atom: 3355 Blocpdb> 24 atoms in block 110 Block first atom: 3399 Blocpdb> 34 atoms in block 111 Block first atom: 3423 Blocpdb> 31 atoms in block 112 Block first atom: 3457 Blocpdb> 35 atoms in block 113 Block first atom: 3488 Blocpdb> 25 atoms in block 114 Block first atom: 3523 Blocpdb> 39 atoms in block 115 Block first atom: 3548 Blocpdb> 28 atoms in block 116 Block first atom: 3587 Blocpdb> 33 atoms in block 117 Block first atom: 3615 Blocpdb> 26 atoms in block 118 Block first atom: 3648 Blocpdb> 35 atoms in block 119 Block first atom: 3674 Blocpdb> 37 atoms in block 120 Block first atom: 3709 Blocpdb> 32 atoms in block 121 Block first atom: 3746 Blocpdb> 27 atoms in block 122 Block first atom: 3778 Blocpdb> 25 atoms in block 123 Block first atom: 3805 Blocpdb> 29 atoms in block 124 Block first atom: 3830 Blocpdb> 25 atoms in block 125 Block first atom: 3859 Blocpdb> 39 atoms in block 126 Block first atom: 3884 Blocpdb> 25 atoms in block 127 Block first atom: 3923 Blocpdb> 30 atoms in block 128 Block first atom: 3948 Blocpdb> 40 atoms in block 129 Block first atom: 3978 Blocpdb> 27 atoms in block 130 Block first atom: 4018 Blocpdb> 33 atoms in block 131 Block first atom: 4045 Blocpdb> 26 atoms in block 132 Block first atom: 4078 Blocpdb> 30 atoms in block 133 Block first atom: 4104 Blocpdb> 32 atoms in block 134 Block first atom: 4134 Blocpdb> 35 atoms in block 135 Block first atom: 4166 Blocpdb> 18 atoms in block 136 Block first atom: 4201 Blocpdb> 28 atoms in block 137 Block first atom: 4219 Blocpdb> 26 atoms in block 138 Block first atom: 4247 Blocpdb> 35 atoms in block 139 Block first atom: 4273 Blocpdb> 28 atoms in block 140 Block first atom: 4308 Blocpdb> 26 atoms in block 141 Block first atom: 4336 Blocpdb> 28 atoms in block 142 Block first atom: 4362 Blocpdb> 37 atoms in block 143 Block first atom: 4390 Blocpdb> 21 atoms in block 144 Block first atom: 4427 Blocpdb> 25 atoms in block 145 Block first atom: 4448 Blocpdb> 36 atoms in block 146 Block first atom: 4473 Blocpdb> 26 atoms in block 147 Block first atom: 4509 Blocpdb> 37 atoms in block 148 Block first atom: 4535 Blocpdb> 29 atoms in block 149 Block first atom: 4572 Blocpdb> 27 atoms in block 150 Block first atom: 4601 Blocpdb> 91 atoms in block 151 Block first atom: 4628 Blocpdb> 27 atoms in block 152 Block first atom: 4719 Blocpdb> 29 atoms in block 153 Block first atom: 4746 Blocpdb> 32 atoms in block 154 Block first atom: 4775 Blocpdb> 25 atoms in block 155 Block first atom: 4807 Blocpdb> 23 atoms in block 156 Block first atom: 4832 Blocpdb> 41 atoms in block 157 Block first atom: 4855 Blocpdb> 34 atoms in block 158 Block first atom: 4896 Blocpdb> 34 atoms in block 159 Block first atom: 4930 Blocpdb> 28 atoms in block 160 Block first atom: 4964 Blocpdb> 34 atoms in block 161 Block first atom: 4992 Blocpdb> 33 atoms in block 162 Block first atom: 5026 Blocpdb> 29 atoms in block 163 Block first atom: 5059 Blocpdb> 40 atoms in block 164 Block first atom: 5088 Blocpdb> 25 atoms in block 165 Block first atom: 5128 Blocpdb> 30 atoms in block 166 Block first atom: 5153 Blocpdb> 29 atoms in block 167 Block first atom: 5183 Blocpdb> 37 atoms in block 168 Block first atom: 5212 Blocpdb> 33 atoms in block 169 Block first atom: 5249 Blocpdb> 33 atoms in block 170 Block first atom: 5282 Blocpdb> 28 atoms in block 171 Block first atom: 5315 Blocpdb> 25 atoms in block 172 Block first atom: 5343 Blocpdb> 29 atoms in block 173 Block first atom: 5368 Blocpdb> 28 atoms in block 174 Block first atom: 5397 Blocpdb> 34 atoms in block 175 Block first atom: 5425 Blocpdb> 26 atoms in block 176 Block first atom: 5459 Blocpdb> 26 atoms in block 177 Block first atom: 5485 Blocpdb> 41 atoms in block 178 Block first atom: 5511 Blocpdb> 31 atoms in block 179 Block first atom: 5552 Blocpdb> 32 atoms in block 180 Block first atom: 5583 Blocpdb> 27 atoms in block 181 Block first atom: 5615 Blocpdb> 29 atoms in block 182 Block first atom: 5642 Blocpdb> 32 atoms in block 183 Block first atom: 5671 Blocpdb> 35 atoms in block 184 Block first atom: 5703 Blocpdb> 21 atoms in block 185 Block first atom: 5738 Blocpdb> 27 atoms in block 186 Block first atom: 5759 Blocpdb> 26 atoms in block 187 Block first atom: 5786 Blocpdb> 30 atoms in block 188 Block first atom: 5812 Blocpdb> 31 atoms in block 189 Block first atom: 5842 Blocpdb> 25 atoms in block 190 Block first atom: 5873 Blocpdb> 30 atoms in block 191 Block first atom: 5898 Blocpdb> 36 atoms in block 192 Block first atom: 5928 Blocpdb> 25 atoms in block 193 Block first atom: 5964 Blocpdb> 20 atoms in block 194 Block first atom: 5989 Blocpdb> 34 atoms in block 195 Block first atom: 6009 Blocpdb> 28 atoms in block 196 Block first atom: 6043 Blocpdb> 38 atoms in block 197 Block first atom: 6071 Blocpdb> 29 atoms in block 198 Block first atom: 6109 Blocpdb> 27 atoms in block 199 Block first atom: 6138 Blocpdb> 13 atoms in block 200 Block first atom: 6165 Blocpdb> 91 atoms in block 201 Block first atom: 6177 Blocpdb> 201 blocks. Blocpdb> At most, 91 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 11 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2424200 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 18804 Prepmat> Matrix trace = 5304080.0000 Prepmat> Last element read: 18804 18804 260.9509 Prepmat> 20302 lines saved. Prepmat> 18232 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6268 RTB> Total mass = 6268.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6268 RTB> Number of blocks = 201 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 254024.9955 RTB> 71469 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1206 Diagstd> Nb of non-zero elements: 71469 Diagstd> Projected matrix trace = 254024.9955 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1206 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 254024.9955 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0305982 1.1763548 1.8596385 3.6764941 3.9692044 4.9182509 4.9541763 5.4599455 6.9759695 7.8238932 7.8816922 8.6915966 9.2753072 10.9688819 11.6510491 11.8500147 12.4880869 12.8968567 13.3446396 13.4633122 14.0535605 15.1302248 15.2751447 15.9180857 16.1696043 16.6950616 17.5384429 18.2447561 19.0576324 19.3287947 19.9717826 20.4988747 20.8919842 21.5394344 21.9840916 22.6250566 23.5551368 24.0278952 24.2460322 24.5208341 24.6020657 25.4718472 25.8366261 26.2561017 26.6569991 26.8696545 27.1481849 27.6751747 27.7580735 28.3934933 28.7445260 29.1797959 29.4958347 30.1682793 31.1266660 31.3745207 31.9192937 32.2217167 32.7374431 33.9025585 34.5118236 35.1189774 35.4368416 35.7658884 35.9009037 37.0093214 37.1329004 37.7600179 37.9641542 38.1634612 38.9496820 39.3935909 39.7052404 40.3161586 40.4862254 40.6202416 41.4333823 41.7003223 41.8459125 42.6264323 42.7754216 43.0634112 43.5166328 43.9471944 44.3531458 44.8234790 45.4173416 45.9962304 46.1918737 46.7310393 47.3593384 47.4287768 47.9720189 48.3748170 48.8755459 48.9705131 49.3476113 49.7554690 49.9193780 50.0332717 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034335 0.0034340 0.0034341 0.0034343 0.0034344 0.0034353 110.2401932 117.7780709 148.0844789 208.2150980 216.3450759 240.8244734 241.7024268 253.7402906 286.8121643 303.7433215 304.8632074 320.1437742 330.7192166 359.6470152 370.6617711 373.8132793 383.7454482 389.9754049 396.6876724 398.4476219 407.0881537 422.3942244 424.4122858 433.2521231 436.6615741 443.6998609 454.7689413 463.8358487 474.0561153 477.4167668 485.2926292 491.6548078 496.3466840 503.9789856 509.1544484 516.5235389 527.0333481 532.2959286 534.7066918 537.7283073 538.6182537 548.0567117 551.9670851 556.4298283 560.6617252 562.8936141 565.8035654 571.2687471 572.1237030 578.6349934 582.2008777 586.5923637 589.7604239 596.4452035 605.8450767 608.2523983 613.5103829 616.4099174 621.3233262 632.2830174 637.9391189 643.5261674 646.4319063 649.4261750 650.6508037 660.6186671 661.7206941 667.2850206 669.0863106 670.8403215 677.7152192 681.5662319 684.2569155 689.5009245 690.9536648 692.0963063 698.9892137 701.2372634 702.4603272 708.9812876 710.2192343 712.6060327 716.3461348 719.8812428 723.1984631 727.0228504 731.8231360 736.4722723 738.0368891 742.3316886 747.3053539 747.8530042 752.1237076 755.2747189 759.1735885 759.9107833 762.8310254 765.9769350 767.2375733 768.1123211 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6268 Rtb_to_modes> Number of blocs = 201 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.031 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.176 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.860 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.676 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.969 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.918 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.954 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.460 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.976 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.824 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.882 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.692 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.275 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.03 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1206 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99995 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00004 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 112824 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99995 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00004 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 0.99997 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22022316112813361.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22022316112813361.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22022316112813361.atom Openam> file on opening on unit 11: 22022316112813361.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 786 First residue number = 80 Last residue number = 301 Number of atoms found = 6268 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.031 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.176 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.860 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.676 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.969 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.918 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.954 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.460 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.976 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.824 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.882 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.692 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.275 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.03 Bfactors> 106 vectors, 18804 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.031000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.337 for 782 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.017 +/- 0.01 Bfactors> = 28.990 +/- 5.86 Bfactors> Shiftng-fct= 28.972 Bfactors> Scaling-fct= 460.661 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22022316112813361.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22022316112813361.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 240.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 241.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.5 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vecteur en lecture: 681.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 755.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.1 Chkmod> 106 vectors, 18804 coordinates in file. Chkmod> That is: 6268 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 19 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7286 0.0034 0.7405 0.0034 0.8024 0.0034 0.9235 0.0034 0.9783 0.0034 0.7675 110.2569 0.6869 117.7553 0.7191 148.0925 0.7482 208.1922 0.5057 216.3302 0.5940 240.8080 0.6575 241.6877 0.6234 253.7307 0.6468 286.8005 0.5586 303.7324 0.5094 304.8561 0.4356 320.1375 0.4721 330.6995 0.0176 359.6499 0.3329 370.6292 0.5137 373.7970 0.5794 383.7584 0.4889 390.0062 0.5619 396.6017 0.4177 398.3815 0.5676 407.0191 0.3354 422.3730 0.3438 424.4615 0.5791 433.2596 0.5143 436.6482 0.5718 443.7464 0.1090 454.7696 0.6570 463.7555 0.5622 474.0652 0.5029 477.4112 0.5106 485.2501 0.3922 491.6472 0.5317 496.3018 0.4410 503.9640 0.5545 509.0852 0.4753 516.5578 0.3708 527.0651 0.2966 532.2964 0.2508 534.7275 0.4823 537.6961 0.3476 538.5725 0.5388 548.0133 0.3768 551.9794 0.5339 556.4472 0.2758 560.6692 0.3947 562.8731 0.3452 565.7982 0.4551 571.2940 0.4140 572.1190 0.4343 578.5746 0.4167 582.1301 0.2360 586.5692 0.4096 589.7767 0.4065 596.4366 0.4151 605.8515 0.4292 608.1825 0.3720 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calculating perturbed structure for DQ=-35 22022316112813361.eigenfacs 22022316112813361.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 22022316112813361.eigenfacs 22022316112813361.atom calculating perturbed structure for DQ=-25 22022316112813361.eigenfacs 22022316112813361.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22022316112813361.eigenfacs 22022316112813361.atom calculating perturbed structure for DQ=-15 22022316112813361.eigenfacs 22022316112813361.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 22022316112813361.eigenfacs 22022316112813361.atom calculating perturbed structure for DQ=-5 22022316112813361.eigenfacs 22022316112813361.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22022316112813361.eigenfacs 22022316112813361.atom calculating perturbed structure for DQ=5 22022316112813361.eigenfacs 22022316112813361.atom calculating perturbed structure for DQ=10 22022316112813361.eigenfacs 22022316112813361.atom calculating perturbed structure for DQ=15 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plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 22022316112813361.7.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 22022316112813361.7.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22022316112813361 8 -200 200 5 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-200 22022316112813361.eigenfacs 22022316112813361.atom calculating perturbed 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plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 22022316112813361.8.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 22022316112813361.8.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22022316112813361 9 -200 200 5 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-200 22022316112813361.eigenfacs 22022316112813361.atom calculating perturbed 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