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***  VIRAL PROTEIN 19-DEC-21 7T9L  ***

LOGs for ID: 220221231036115893

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 220221231036115893.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 220221231036115893.atom to be opened. Openam> File opened: 220221231036115893.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 796 First residue number = 330 Last residue number = 613 Number of atoms found = 6469 Mean number per residue = 8.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = 214.768462 +/- 13.811339 From: 180.658000 To: 243.117000 = 160.030640 +/- 16.391961 From: 123.962000 To: 197.818000 = 266.773974 +/- 22.690997 From: 200.660000 To: 310.168000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3210 % Filled. Pdbmat> 2487772 non-zero elements. Pdbmat> 272157 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.14 +/- 22.56 Maximum number = 130 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 5.443140E+06 Pdbmat> Larger element = 497.512 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 796 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 220221231036115893.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 220221231036115893.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 220221231036115893.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6469 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 796 residues. Blocpdb> 30 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 29 atoms in block 2 Block first atom: 31 Blocpdb> 35 atoms in block 3 Block first atom: 60 Blocpdb> 31 atoms in block 4 Block first atom: 95 Blocpdb> 33 atoms in block 5 Block first atom: 126 Blocpdb> 38 atoms in block 6 Block first atom: 159 Blocpdb> 39 atoms in block 7 Block first atom: 197 Blocpdb> 28 atoms in block 8 Block first atom: 236 Blocpdb> 32 atoms in block 9 Block first atom: 264 Blocpdb> 33 atoms in block 10 Block first atom: 296 Blocpdb> 28 atoms in block 11 Block first atom: 329 Blocpdb> 40 atoms in block 12 Block first atom: 357 Blocpdb> 31 atoms in block 13 Block first atom: 397 Blocpdb> 27 atoms in block 14 Block first atom: 428 Blocpdb> 33 atoms in block 15 Block first atom: 455 Blocpdb> 32 atoms in block 16 Block first atom: 488 Blocpdb> 32 atoms in block 17 Block first atom: 520 Blocpdb> 32 atoms in block 18 Block first atom: 552 Blocpdb> 31 atoms in block 19 Block first atom: 584 Blocpdb> 36 atoms in block 20 Block first atom: 615 Blocpdb> 24 atoms in block 21 Block first atom: 651 Blocpdb> 28 atoms in block 22 Block first atom: 675 Blocpdb> 33 atoms in block 23 Block first atom: 703 Blocpdb> 37 atoms in block 24 Block first atom: 736 Blocpdb> 34 atoms in block 25 Block first atom: 773 Blocpdb> 24 atoms in block 26 Block first atom: 807 Blocpdb> 35 atoms in block 27 Block first atom: 831 Blocpdb> 31 atoms in block 28 Block first atom: 866 Blocpdb> 30 atoms in block 29 Block first atom: 897 Blocpdb> 30 atoms in block 30 Block first atom: 927 Blocpdb> 40 atoms in block 31 Block first atom: 957 Blocpdb> 41 atoms in block 32 Block first atom: 997 Blocpdb> 31 atoms in block 33 Block first atom: 1038 Blocpdb> 36 atoms in block 34 Block first atom: 1069 Blocpdb> 33 atoms in block 35 Block first atom: 1105 Blocpdb> 36 atoms in block 36 Block first atom: 1138 Blocpdb> 26 atoms in block 37 Block first atom: 1174 Blocpdb> 30 atoms in block 38 Block first atom: 1200 Blocpdb> 20 atoms in block 39 Block first atom: 1230 Blocpdb> 37 atoms in block 40 Block first atom: 1250 Blocpdb> 37 atoms in block 41 Block first atom: 1287 Blocpdb> 35 atoms in block 42 Block first atom: 1324 Blocpdb> 37 atoms in block 43 Block first atom: 1359 Blocpdb> 25 atoms in block 44 Block first atom: 1396 Blocpdb> 39 atoms in block 45 Block first atom: 1421 Blocpdb> 29 atoms in block 46 Block first atom: 1460 Blocpdb> 34 atoms in block 47 Block first atom: 1489 Blocpdb> 30 atoms in block 48 Block first atom: 1523 Blocpdb> 25 atoms in block 49 Block first atom: 1553 Blocpdb> 29 atoms in block 50 Block first atom: 1578 Blocpdb> 6 atoms in block 51 Block first atom: 1607 Blocpdb> 30 atoms in block 52 Block first atom: 1613 Blocpdb> 32 atoms in block 53 Block first atom: 1643 Blocpdb> 34 atoms in block 54 Block first atom: 1675 Blocpdb> 38 atoms in block 55 Block first atom: 1709 Blocpdb> 31 atoms in block 56 Block first atom: 1747 Blocpdb> 40 atoms in block 57 Block first atom: 1778 Blocpdb> 25 atoms in block 58 Block first atom: 1818 Blocpdb> 40 atoms in block 59 Block first atom: 1843 Blocpdb> 31 atoms in block 60 Block first atom: 1883 Blocpdb> 33 atoms in block 61 Block first atom: 1914 Blocpdb> 32 atoms in block 62 Block first atom: 1947 Blocpdb> 25 atoms in block 63 Block first atom: 1979 Blocpdb> 37 atoms in block 64 Block first atom: 2004 Blocpdb> 33 atoms in block 65 Block first atom: 2041 Blocpdb> 31 atoms in block 66 Block first atom: 2074 Blocpdb> 30 atoms in block 67 Block first atom: 2105 Blocpdb> 36 atoms in block 68 Block first atom: 2135 Blocpdb> 34 atoms in block 69 Block first atom: 2171 Blocpdb> 31 atoms in block 70 Block first atom: 2205 Blocpdb> 34 atoms in block 71 Block first atom: 2236 Blocpdb> 31 atoms in block 72 Block first atom: 2270 Blocpdb> 24 atoms in block 73 Block first atom: 2301 Blocpdb> 30 atoms in block 74 Block first atom: 2325 Blocpdb> 32 atoms in block 75 Block first atom: 2355 Blocpdb> 34 atoms in block 76 Block first atom: 2387 Blocpdb> 31 atoms in block 77 Block first atom: 2421 Blocpdb> 29 atoms in block 78 Block first atom: 2452 Blocpdb> 29 atoms in block 79 Block first atom: 2481 Blocpdb> 30 atoms in block 80 Block first atom: 2510 Blocpdb> 30 atoms in block 81 Block first atom: 2540 Blocpdb> 32 atoms in block 82 Block first atom: 2570 Blocpdb> 32 atoms in block 83 Block first atom: 2602 Blocpdb> 29 atoms in block 84 Block first atom: 2634 Blocpdb> 29 atoms in block 85 Block first atom: 2663 Blocpdb> 34 atoms in block 86 Block first atom: 2692 Blocpdb> 36 atoms in block 87 Block first atom: 2726 Blocpdb> 42 atoms in block 88 Block first atom: 2762 Blocpdb> 37 atoms in block 89 Block first atom: 2804 Blocpdb> 29 atoms in block 90 Block first atom: 2841 Blocpdb> 35 atoms in block 91 Block first atom: 2870 Blocpdb> 38 atoms in block 92 Block first atom: 2905 Blocpdb> 34 atoms in block 93 Block first atom: 2943 Blocpdb> 34 atoms in block 94 Block first atom: 2977 Blocpdb> 29 atoms in block 95 Block first atom: 3011 Blocpdb> 39 atoms in block 96 Block first atom: 3040 Blocpdb> 36 atoms in block 97 Block first atom: 3079 Blocpdb> 37 atoms in block 98 Block first atom: 3115 Blocpdb> 36 atoms in block 99 Block first atom: 3152 Blocpdb> 23 atoms in block 100 Block first atom: 3188 Blocpdb> 38 atoms in block 101 Block first atom: 3211 Blocpdb> 32 atoms in block 102 Block first atom: 3249 Blocpdb> 32 atoms in block 103 Block first atom: 3281 Blocpdb> 37 atoms in block 104 Block first atom: 3313 Blocpdb> 35 atoms in block 105 Block first atom: 3350 Blocpdb> 36 atoms in block 106 Block first atom: 3385 Blocpdb> 33 atoms in block 107 Block first atom: 3421 Blocpdb> 35 atoms in block 108 Block first atom: 3454 Blocpdb> 33 atoms in block 109 Block first atom: 3489 Blocpdb> 30 atoms in block 110 Block first atom: 3522 Blocpdb> 33 atoms in block 111 Block first atom: 3552 Blocpdb> 26 atoms in block 112 Block first atom: 3585 Blocpdb> 30 atoms in block 113 Block first atom: 3611 Blocpdb> 28 atoms in block 114 Block first atom: 3641 Blocpdb> 40 atoms in block 115 Block first atom: 3669 Blocpdb> 37 atoms in block 116 Block first atom: 3709 Blocpdb> 33 atoms in block 117 Block first atom: 3746 Blocpdb> 29 atoms in block 118 Block first atom: 3779 Blocpdb> 33 atoms in block 119 Block first atom: 3808 Blocpdb> 30 atoms in block 120 Block first atom: 3841 Blocpdb> 28 atoms in block 121 Block first atom: 3871 Blocpdb> 36 atoms in block 122 Block first atom: 3899 Blocpdb> 33 atoms in block 123 Block first atom: 3935 Blocpdb> 37 atoms in block 124 Block first atom: 3968 Blocpdb> 34 atoms in block 125 Block first atom: 4005 Blocpdb> 31 atoms in block 126 Block first atom: 4039 Blocpdb> 27 atoms in block 127 Block first atom: 4070 Blocpdb> 28 atoms in block 128 Block first atom: 4097 Blocpdb> 42 atoms in block 129 Block first atom: 4125 Blocpdb> 29 atoms in block 130 Block first atom: 4167 Blocpdb> 27 atoms in block 131 Block first atom: 4196 Blocpdb> 30 atoms in block 132 Block first atom: 4223 Blocpdb> 30 atoms in block 133 Block first atom: 4253 Blocpdb> 34 atoms in block 134 Block first atom: 4283 Blocpdb> 25 atoms in block 135 Block first atom: 4317 Blocpdb> 38 atoms in block 136 Block first atom: 4342 Blocpdb> 29 atoms in block 137 Block first atom: 4380 Blocpdb> 31 atoms in block 138 Block first atom: 4409 Blocpdb> 35 atoms in block 139 Block first atom: 4440 Blocpdb> 32 atoms in block 140 Block first atom: 4475 Blocpdb> 31 atoms in block 141 Block first atom: 4507 Blocpdb> 37 atoms in block 142 Block first atom: 4538 Blocpdb> 30 atoms in block 143 Block first atom: 4575 Blocpdb> 32 atoms in block 144 Block first atom: 4605 Blocpdb> 35 atoms in block 145 Block first atom: 4637 Blocpdb> 26 atoms in block 146 Block first atom: 4672 Blocpdb> 34 atoms in block 147 Block first atom: 4698 Blocpdb> 25 atoms in block 148 Block first atom: 4732 Blocpdb> 30 atoms in block 149 Block first atom: 4757 Blocpdb> 23 atoms in block 150 Block first atom: 4787 Blocpdb> 34 atoms in block 151 Block first atom: 4810 Blocpdb> 27 atoms in block 152 Block first atom: 4844 Blocpdb> 29 atoms in block 153 Block first atom: 4871 Blocpdb> 37 atoms in block 154 Block first atom: 4900 Blocpdb> 32 atoms in block 155 Block first atom: 4937 Blocpdb> 36 atoms in block 156 Block first atom: 4969 Blocpdb> 34 atoms in block 157 Block first atom: 5005 Blocpdb> 28 atoms in block 158 Block first atom: 5039 Blocpdb> 26 atoms in block 159 Block first atom: 5067 Blocpdb> 37 atoms in block 160 Block first atom: 5093 Blocpdb> 34 atoms in block 161 Block first atom: 5130 Blocpdb> 47 atoms in block 162 Block first atom: 5164 Blocpdb> 31 atoms in block 163 Block first atom: 5211 Blocpdb> 33 atoms in block 164 Block first atom: 5242 Blocpdb> 39 atoms in block 165 Block first atom: 5275 Blocpdb> 46 atoms in block 166 Block first atom: 5314 Blocpdb> 37 atoms in block 167 Block first atom: 5360 Blocpdb> 28 atoms in block 168 Block first atom: 5397 Blocpdb> 30 atoms in block 169 Block first atom: 5425 Blocpdb> 32 atoms in block 170 Block first atom: 5455 Blocpdb> 34 atoms in block 171 Block first atom: 5487 Blocpdb> 26 atoms in block 172 Block first atom: 5521 Blocpdb> 36 atoms in block 173 Block first atom: 5547 Blocpdb> 34 atoms in block 174 Block first atom: 5583 Blocpdb> 36 atoms in block 175 Block first atom: 5617 Blocpdb> 42 atoms in block 176 Block first atom: 5653 Blocpdb> 36 atoms in block 177 Block first atom: 5695 Blocpdb> 40 atoms in block 178 Block first atom: 5731 Blocpdb> 28 atoms in block 179 Block first atom: 5771 Blocpdb> 28 atoms in block 180 Block first atom: 5799 Blocpdb> 30 atoms in block 181 Block first atom: 5827 Blocpdb> 33 atoms in block 182 Block first atom: 5857 Blocpdb> 30 atoms in block 183 Block first atom: 5890 Blocpdb> 27 atoms in block 184 Block first atom: 5920 Blocpdb> 30 atoms in block 185 Block first atom: 5947 Blocpdb> 35 atoms in block 186 Block first atom: 5977 Blocpdb> 32 atoms in block 187 Block first atom: 6012 Blocpdb> 36 atoms in block 188 Block first atom: 6044 Blocpdb> 28 atoms in block 189 Block first atom: 6080 Blocpdb> 31 atoms in block 190 Block first atom: 6108 Blocpdb> 26 atoms in block 191 Block first atom: 6139 Blocpdb> 34 atoms in block 192 Block first atom: 6165 Blocpdb> 31 atoms in block 193 Block first atom: 6199 Blocpdb> 39 atoms in block 194 Block first atom: 6230 Blocpdb> 40 atoms in block 195 Block first atom: 6269 Blocpdb> 34 atoms in block 196 Block first atom: 6309 Blocpdb> 31 atoms in block 197 Block first atom: 6343 Blocpdb> 36 atoms in block 198 Block first atom: 6374 Blocpdb> 35 atoms in block 199 Block first atom: 6410 Blocpdb> 25 atoms in block 200 Block first atom: 6444 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 47 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 6 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2487972 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 19407 Prepmat> Matrix trace = 5443140.0000 Prepmat> Last element read: 19407 19407 140.0343 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18245 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6469 RTB> Total mass = 6469.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6469 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 245158.8015 RTB> 63780 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 63780 Diagstd> Projected matrix trace = 245158.8015 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 245158.8015 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1777058 0.3602063 0.7544667 1.0919489 1.3055666 1.8485260 2.2723911 2.7398233 3.2619481 3.6657031 4.0398173 4.6730099 4.8469819 5.4217659 5.5121168 6.0532895 6.4873378 6.7612618 7.4844683 7.7732011 8.5795049 8.8234000 9.3351392 10.2122836 10.4094250 11.2576013 11.6155898 12.1298023 12.3983665 13.1048433 13.3552701 13.9931264 14.2262665 14.7705361 15.2616781 15.7614448 16.0930428 16.3919394 16.7027577 17.1670853 17.6242137 18.4566884 19.0288406 19.2127976 19.5094950 19.6586100 19.9408005 20.4996244 21.3400287 21.7895592 22.0417910 22.6722710 23.3600558 23.7921372 24.0015195 25.2798685 25.4532657 25.6432537 26.3097601 26.6331042 27.0443763 27.6468628 28.2794592 28.9678520 29.3646551 29.7323149 30.5494924 30.9043533 31.1626684 31.6492646 31.8424270 32.4035388 32.6118222 33.4279673 33.6525077 34.0406793 34.2604588 34.7143983 35.2113409 35.9782181 36.1587993 36.4045135 36.9943364 37.2849798 37.5280254 37.5469623 38.3968905 38.6421601 39.9758055 40.2086423 41.2319167 41.4182139 41.7668195 42.1078922 42.7680669 43.2217638 43.6300048 43.9325419 44.1843595 44.7751429 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034319 0.0034342 0.0034343 0.0034352 0.0034358 45.7768627 65.1734804 94.3225038 113.4740172 124.0780055 147.6413690 163.6955284 179.7448937 196.1253830 207.9093039 218.2609998 234.7435309 239.0732473 252.8515729 254.9496884 267.1720375 276.5849438 282.3638907 297.0816011 302.7577240 318.0726983 322.5620453 331.7841842 347.0217639 350.3552662 364.3495293 370.0972977 378.2005380 382.3644574 393.1073798 396.8456441 406.2119152 409.5818939 417.3432645 424.2251633 431.1151574 435.6265725 439.6534149 443.8021178 449.9285606 455.8795963 466.5220448 473.6978832 475.9820604 479.6432030 481.4727187 484.9160680 491.6637987 501.6407174 506.8967450 509.8221735 517.0622033 524.8463945 529.6780892 532.0036948 545.9874814 547.8567735 549.8976264 556.9981136 560.4103849 564.7207758 570.9764667 577.4718659 584.4581607 588.4475138 592.1198794 600.2017807 603.6776680 606.1953482 610.9098001 612.7712224 618.1466233 620.1301021 627.8418550 629.9469770 633.5696858 635.6116780 639.8086407 644.3718538 651.3510314 652.9836099 655.1985028 660.4849118 663.0743622 665.2320077 665.3998271 672.8888127 675.0345130 686.5843376 688.5809200 697.2877604 698.8612549 701.7961528 704.6558008 710.1581749 713.9150262 717.2786611 719.7612241 721.8210816 726.6307466 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6469 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9867E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9878E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1777 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3602 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7545 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.092 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.306 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.849 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.272 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.740 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.262 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.666 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.040 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.673 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.847 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.422 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.512 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.053 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.487 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.761 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.484 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.773 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.580 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.823 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.335 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.78 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 116442 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00004 0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998 1.00003 0.99998 0.99999 1.00002 1.00002 1.00003 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99999 1.00003 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220221231036115893.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220221231036115893.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 220221231036115893.atom Openam> file on opening on unit 11: 220221231036115893.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 796 First residue number = 330 Last residue number = 613 Number of atoms found = 6469 Mean number per residue = 8.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9867E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9878E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1777 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3602 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7545 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.092 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.306 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.849 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.272 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.740 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.262 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.666 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.040 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.673 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.847 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.422 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.512 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.053 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.487 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.761 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.484 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.773 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.580 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.823 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.335 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.78 Bfactors> 106 vectors, 19407 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.177700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.279 for 796 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.045 +/- 0.06 Bfactors> = 89.091 +/- 21.42 Bfactors> Shiftng-fct= 89.047 Bfactors> Scaling-fct= 366.278 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220221231036115893.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220221231036115893.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 113.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 207.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 254.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 547.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.0 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vecteur en lecture: 618.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.6 Chkmod> 106 vectors, 19407 coordinates in file. Chkmod> That is: 6469 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 19 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7215 0.0034 0.6869 0.0034 0.7126 0.0034 0.8301 0.0034 0.8467 0.0034 0.8182 45.7742 0.6007 65.1701 0.5552 94.3205 0.6076 113.4718 0.4436 124.0933 0.3716 147.6540 0.2453 163.6744 0.3223 179.7430 0.1990 196.1185 0.3889 207.9088 0.1640 218.2566 0.2566 234.7332 0.3267 239.0634 0.0718 252.8462 0.2599 254.9360 0.3262 267.1542 0.3212 276.5659 0.2209 282.3463 0.2845 297.0596 0.3932 302.7408 0.2738 318.0682 0.4035 322.5409 0.5459 331.7675 0.3965 346.9681 0.2153 350.3499 0.4324 364.3727 0.3611 370.1517 0.3193 378.1874 0.1988 382.3732 0.4017 393.0179 0.4109 396.8989 0.4402 406.1491 0.5622 409.6181 0.2450 417.3178 0.3307 424.1836 0.3618 431.0769 0.3298 435.5667 0.4276 439.6085 0.3957 443.7464 0.3572 449.9474 0.5291 455.8055 0.1693 466.5439 0.3075 473.6920 0.4619 475.9270 0.3310 479.6288 0.2258 481.4691 0.3045 484.8855 0.5700 491.6472 0.3613 501.6188 0.2054 506.8801 0.2382 509.7796 0.4508 517.0141 0.5806 524.8232 0.3986 529.6316 0.3871 531.9640 0.2082 545.9655 0.5024 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220221231036115893.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220221231036115893.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 220221231036115893 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 220221231036115893 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220221231036115893.eigenfacs 220221231036115893.atom 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