*** ANT1-conformation-change ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22021521271471098.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22021521271471098.atom to be opened.
Openam> File opened: 22021521271471098.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 292
First residue number = 11
Last residue number = 306
Number of atoms found = 4521
Mean number per residue = 15.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -20.366134 +/- 10.961617 From: -50.510000 To: 8.857000
= 29.862504 +/- 11.579596 From: 0.697000 To: 56.480000
= -8.625914 +/- 13.921549 From: -39.605000 To: 25.186000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 3.2375 % Filled.
Pdbmat> 2978030 non-zero elements.
Pdbmat> 327941 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 145.07 +/- 45.58
Maximum number = 243
Minimum number = 20
Pdbmat> Matrix trace = 6.558820E+06
Pdbmat> Larger element = 870.358
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
292 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22021521271471098.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 2
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22021521271471098.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22021521271471098.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4521 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 2 residue(s) per block.
Blocpdb> 292 residues.
Blocpdb> 25 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 28 atoms in block 2
Block first atom: 26
Blocpdb> 36 atoms in block 3
Block first atom: 54
Blocpdb> 28 atoms in block 4
Block first atom: 90
Blocpdb> 39 atoms in block 5
Block first atom: 118
Blocpdb> 24 atoms in block 6
Block first atom: 157
Blocpdb> 23 atoms in block 7
Block first atom: 181
Blocpdb> 21 atoms in block 8
Block first atom: 204
Blocpdb> 26 atoms in block 9
Block first atom: 225
Blocpdb> 33 atoms in block 10
Block first atom: 251
Blocpdb> 24 atoms in block 11
Block first atom: 284
Blocpdb> 20 atoms in block 12
Block first atom: 308
Blocpdb> 33 atoms in block 13
Block first atom: 328
Blocpdb> 39 atoms in block 14
Block first atom: 361
Blocpdb> 41 atoms in block 15
Block first atom: 400
Blocpdb> 38 atoms in block 16
Block first atom: 441
Blocpdb> 33 atoms in block 17
Block first atom: 479
Blocpdb> 31 atoms in block 18
Block first atom: 512
Blocpdb> 27 atoms in block 19
Block first atom: 543
Blocpdb> 36 atoms in block 20
Block first atom: 570
Blocpdb> 32 atoms in block 21
Block first atom: 606
Blocpdb> 31 atoms in block 22
Block first atom: 638
Blocpdb> 31 atoms in block 23
Block first atom: 669
Blocpdb> 48 atoms in block 24
Block first atom: 700
Blocpdb> 35 atoms in block 25
Block first atom: 748
Blocpdb> 26 atoms in block 26
Block first atom: 783
Blocpdb> 31 atoms in block 27
Block first atom: 809
Blocpdb> 31 atoms in block 28
Block first atom: 840
Blocpdb> 48 atoms in block 29
Block first atom: 871
Blocpdb> 28 atoms in block 30
Block first atom: 919
Blocpdb> 22 atoms in block 31
Block first atom: 947
Blocpdb> 22 atoms in block 32
Block first atom: 969
Blocpdb> 36 atoms in block 33
Block first atom: 991
Blocpdb> 29 atoms in block 34
Block first atom: 1027
Blocpdb> 48 atoms in block 35
Block first atom: 1056
Blocpdb> 21 atoms in block 36
Block first atom: 1104
Blocpdb> 24 atoms in block 37
Block first atom: 1125
Blocpdb> 30 atoms in block 38
Block first atom: 1149
Blocpdb> 43 atoms in block 39
Block first atom: 1179
Blocpdb> 41 atoms in block 40
Block first atom: 1222
Blocpdb> 28 atoms in block 41
Block first atom: 1263
Blocpdb> 27 atoms in block 42
Block first atom: 1291
Blocpdb> 33 atoms in block 43
Block first atom: 1318
Blocpdb> 30 atoms in block 44
Block first atom: 1351
Blocpdb> 44 atoms in block 45
Block first atom: 1381
Blocpdb> 34 atoms in block 46
Block first atom: 1425
Blocpdb> 42 atoms in block 47
Block first atom: 1459
Blocpdb> 27 atoms in block 48
Block first atom: 1501
Blocpdb> 27 atoms in block 49
Block first atom: 1528
Blocpdb> 43 atoms in block 50
Block first atom: 1555
Blocpdb> 34 atoms in block 51
Block first atom: 1598
Blocpdb> 34 atoms in block 52
Block first atom: 1632
Blocpdb> 28 atoms in block 53
Block first atom: 1666
Blocpdb> 32 atoms in block 54
Block first atom: 1694
Blocpdb> 41 atoms in block 55
Block first atom: 1726
Blocpdb> 17 atoms in block 56
Block first atom: 1767
Blocpdb> 33 atoms in block 57
Block first atom: 1784
Blocpdb> 21 atoms in block 58
Block first atom: 1817
Blocpdb> 14 atoms in block 59
Block first atom: 1838
Blocpdb> 20 atoms in block 60
Block first atom: 1852
Blocpdb> 17 atoms in block 61
Block first atom: 1872
Blocpdb> 25 atoms in block 62
Block first atom: 1889
Blocpdb> 38 atoms in block 63
Block first atom: 1914
Blocpdb> 36 atoms in block 64
Block first atom: 1952
Blocpdb> 32 atoms in block 65
Block first atom: 1988
Blocpdb> 31 atoms in block 66
Block first atom: 2020
Blocpdb> 31 atoms in block 67
Block first atom: 2051
Blocpdb> 38 atoms in block 68
Block first atom: 2082
Blocpdb> 43 atoms in block 69
Block first atom: 2120
Blocpdb> 24 atoms in block 70
Block first atom: 2163
Blocpdb> 22 atoms in block 71
Block first atom: 2187
Blocpdb> 33 atoms in block 72
Block first atom: 2209
Blocpdb> 32 atoms in block 73
Block first atom: 2242
Blocpdb> 14 atoms in block 74
Block first atom: 2274
Blocpdb> 17 atoms in block 75
Block first atom: 2288
Blocpdb> 41 atoms in block 76
Block first atom: 2305
Blocpdb> 34 atoms in block 77
Block first atom: 2346
Blocpdb> 26 atoms in block 78
Block first atom: 2380
Blocpdb> 31 atoms in block 79
Block first atom: 2406
Blocpdb> 37 atoms in block 80
Block first atom: 2437
Blocpdb> 46 atoms in block 81
Block first atom: 2474
Blocpdb> 33 atoms in block 82
Block first atom: 2520
Blocpdb> 21 atoms in block 83
Block first atom: 2553
Blocpdb> 19 atoms in block 84
Block first atom: 2574
Blocpdb> 29 atoms in block 85
Block first atom: 2593
Blocpdb> 26 atoms in block 86
Block first atom: 2622
Blocpdb> 45 atoms in block 87
Block first atom: 2648
Blocpdb> 27 atoms in block 88
Block first atom: 2693
Blocpdb> 21 atoms in block 89
Block first atom: 2720
Blocpdb> 27 atoms in block 90
Block first atom: 2741
Blocpdb> 17 atoms in block 91
Block first atom: 2768
Blocpdb> 35 atoms in block 92
Block first atom: 2785
Blocpdb> 37 atoms in block 93
Block first atom: 2820
Blocpdb> 31 atoms in block 94
Block first atom: 2857
Blocpdb> 40 atoms in block 95
Block first atom: 2888
Blocpdb> 27 atoms in block 96
Block first atom: 2928
Blocpdb> 38 atoms in block 97
Block first atom: 2955
Blocpdb> 23 atoms in block 98
Block first atom: 2993
Blocpdb> 41 atoms in block 99
Block first atom: 3016
Blocpdb> 30 atoms in block 100
Block first atom: 3057
Blocpdb> 35 atoms in block 101
Block first atom: 3087
Blocpdb> 23 atoms in block 102
Block first atom: 3122
Blocpdb> 33 atoms in block 103
Block first atom: 3145
Blocpdb> 24 atoms in block 104
Block first atom: 3178
Blocpdb> 34 atoms in block 105
Block first atom: 3202
Blocpdb> 29 atoms in block 106
Block first atom: 3236
Blocpdb> 31 atoms in block 107
Block first atom: 3265
Blocpdb> 38 atoms in block 108
Block first atom: 3296
Blocpdb> 31 atoms in block 109
Block first atom: 3334
Blocpdb> 27 atoms in block 110
Block first atom: 3365
Blocpdb> 28 atoms in block 111
Block first atom: 3392
Blocpdb> 17 atoms in block 112
Block first atom: 3420
Blocpdb> 26 atoms in block 113
Block first atom: 3437
Blocpdb> 21 atoms in block 114
Block first atom: 3463
Blocpdb> 35 atoms in block 115
Block first atom: 3484
Blocpdb> 31 atoms in block 116
Block first atom: 3519
Blocpdb> 30 atoms in block 117
Block first atom: 3550
Blocpdb> 48 atoms in block 118
Block first atom: 3580
Blocpdb> 41 atoms in block 119
Block first atom: 3628
Blocpdb> 34 atoms in block 120
Block first atom: 3669
Blocpdb> 26 atoms in block 121
Block first atom: 3703
Blocpdb> 44 atoms in block 122
Block first atom: 3729
Blocpdb> 33 atoms in block 123
Block first atom: 3773
Blocpdb> 30 atoms in block 124
Block first atom: 3806
Blocpdb> 22 atoms in block 125
Block first atom: 3836
Blocpdb> 44 atoms in block 126
Block first atom: 3858
Blocpdb> 36 atoms in block 127
Block first atom: 3902
Blocpdb> 29 atoms in block 128
Block first atom: 3938
Blocpdb> 37 atoms in block 129
Block first atom: 3967
Blocpdb> 23 atoms in block 130
Block first atom: 4004
Blocpdb> 33 atoms in block 131
Block first atom: 4027
Blocpdb> 39 atoms in block 132
Block first atom: 4060
Blocpdb> 29 atoms in block 133
Block first atom: 4099
Blocpdb> 17 atoms in block 134
Block first atom: 4128
Blocpdb> 24 atoms in block 135
Block first atom: 4145
Blocpdb> 38 atoms in block 136
Block first atom: 4169
Blocpdb> 31 atoms in block 137
Block first atom: 4207
Blocpdb> 26 atoms in block 138
Block first atom: 4238
Blocpdb> 17 atoms in block 139
Block first atom: 4264
Blocpdb> 23 atoms in block 140
Block first atom: 4281
Blocpdb> 30 atoms in block 141
Block first atom: 4304
Blocpdb> 40 atoms in block 142
Block first atom: 4334
Blocpdb> 29 atoms in block 143
Block first atom: 4374
Blocpdb> 41 atoms in block 144
Block first atom: 4403
Blocpdb> 38 atoms in block 145
Block first atom: 4444
Blocpdb> 40 atoms in block 146
Block first atom: 4481
Blocpdb> 146 blocks.
Blocpdb> At most, 48 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 2978176 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 13563
Prepmat> Matrix trace = 6558820.0000
Prepmat> Last element read: 13563 13563 295.1532
Prepmat> 10732 lines saved.
Prepmat> 9169 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4521
RTB> Total mass = 4521.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4521
RTB> Number of blocks = 146
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 356768.1716
RTB> 54042 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 876
Diagstd> Nb of non-zero elements: 54042
Diagstd> Projected matrix trace = 356768.1716
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 876 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 356768.1716
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.4818107 2.4169514 2.8298558 3.6784225
4.0803057 4.7208217 6.0627337 7.2595368 7.8394586
8.5093219 10.1724460 11.7896696 12.7384862 13.8941522
14.4964669 15.9142276 16.8261906 18.9623748 20.1726205
21.6259460 22.8386500 24.6994915 25.5959163 28.5792835
29.4180764 30.2363255 31.2826698 32.5285513 32.8283762
34.0815965 34.2255027 37.0839843 38.7159143 41.4108661
43.8549379 45.6663967 47.1587123 47.3635956 49.3423686
52.1128957 54.0032764 55.0188895 56.8231805 59.3261239
59.7492482 60.4709101 62.2937891 63.8589277 65.7486991
66.7367036 68.6775159 69.5405255 70.5999914 71.3440190
73.6330304 75.1359501 75.3499404 76.0069080 77.8277145
80.1868592 81.0277966 82.4411168 83.5553038 85.5294516
86.1096926 86.6029815 87.7501545 89.3049326 90.5091696
92.5305231 93.5350695 95.4069204 95.5329516 96.8757772
97.9490526 99.8119816 100.7763355 101.9472799 104.1557030
104.9197059 105.6366026 107.1569558 108.0466079 109.2987692
109.9812832 110.6951584 111.1376017 112.7098551 113.2439025
114.0702338 115.5063754 117.8577494 118.0590704 120.6632493
121.7452735 122.8607534 124.4194653 126.2435345 127.3760182
128.3952602
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034297 0.0034324 0.0034333 0.0034339 0.0034352
0.0034357 132.1878828 168.8220774 182.6742924 208.2696966
219.3520169 235.9413615 267.3803743 292.5834367 304.0453147
316.7690609 346.3442455 372.8602596 387.5736039 404.7727858
413.4532061 433.1996154 445.4389421 472.8698705 487.7265965
504.9900690 518.9559487 539.6836817 549.3898366 580.5250289
588.9825337 597.1174818 607.3613970 619.3378767 622.1856368
633.9503497 635.2873364 661.2846997 675.6784071 698.7992615
719.1252374 733.8269423 745.7207872 747.3389415 762.7905022
783.9130298 798.0044901 805.4733769 818.5741944 836.4081724
839.3855777 844.4394860 857.0726849 867.7729156 880.5192648
887.1103695 899.9172347 905.5538144 912.4258997 917.2211607
931.8191202 941.2807380 942.6201882 946.7205690 957.9931832
972.4043253 977.4899365 985.9779744 992.6183321 1004.2760922
1007.6768926 1010.5590649 1017.2301531 1026.2023474 1033.0981181
1044.5705776 1050.2253985 1060.6820496 1061.3823913 1068.8158366
1074.7201710 1084.8922811 1090.1206369 1096.4355329 1108.2476205
1112.3048030 1116.0984191 1124.1013361 1128.7580188 1135.2798143
1138.8189142 1142.5089040 1144.7899037 1152.8590844 1155.5871232
1159.7955715 1167.0736350 1178.8929001 1179.8993448 1192.8416324
1198.1779832 1203.6545650 1211.2657734 1220.1124335 1225.5728023
1230.4664484
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4521
Rtb_to_modes> Number of blocs = 146
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9751E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.0
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
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Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.4
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 876 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998
1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99997
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1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000
0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00002 0.99996 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00000
0.99998 0.99995 0.99999 1.00000 1.00002
1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
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0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
0.99998
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 81378 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998
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1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001
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0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999
1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00002 0.99996 0.99998 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002
1.00000 0.99998 1.00000 1.00003 1.00000
0.99998 0.99995 0.99999 1.00000 1.00002
1.00001 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002
1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99999
0.99998
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22021521271471098.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22021521271471098.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22021521271471098.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22021521271471098.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 292
First residue number = 11
Last residue number = 306
Number of atoms found = 4521
Mean number per residue = 15.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9751E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9909E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9962E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9995E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.482
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.417
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.830
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.678
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.080
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.721
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.063
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.260
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.839
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.509
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.83
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.84
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.28
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.54
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.4
Bfactors> 106 vectors, 13563 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.482000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.702 for 292 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.015 +/- 0.02
Bfactors> = 103.719 +/- 36.88
Bfactors> Shiftng-fct= 103.704
Bfactors> Scaling-fct= 2190.301
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22021521271471098.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22021521271471098.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4295E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.0
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1010.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1045.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1085.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1108.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1124.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1128.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1135.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1139.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1153.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1155.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1167.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1179.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1180.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1198.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1211.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1220.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1226.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1230.
Chkmod> 106 vectors, 13563 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4521 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7298
0.0034 0.8941
0.0034 0.7887
0.0034 0.7510
0.0034 0.7476
0.0034 0.9730
132.1907 0.4215
168.8165 0.2969
182.6711 0.2919
208.2488 0.5105
219.3344 0.4540
235.9357 0.3840
267.3748 0.2729
292.5802 0.5944
304.0234 0.4404
316.7495 0.3501
346.2877 0.4652
372.8495 0.4980
387.5800 0.5515
404.6949 0.2194
413.4858 0.4577
433.1235 0.5052
445.4702 0.3803
472.8200 0.6966
487.6740 0.2613
505.0157 0.3531
518.9490 0.3726
539.6661 0.4521
549.4101 0.4706
580.5074 0.3007
588.9765 0.3402
597.1281 0.1463
607.3094 0.3865
619.3251 0.3874
622.1743 0.1998
633.9083 0.3204
635.3018 0.2742
661.2208 0.3762
675.6851 0.1516
698.7620 0.4465
719.0539 0.3309
733.8244 0.3986
745.6990 0.2913
747.2785 0.2331
762.7394 0.1758
783.8576 0.3827
797.9460 0.5075
805.4469 0.4245
818.5161 0.4426
836.3996 0.3505
839.3548 0.1209
844.3969 0.4269
857.0098 0.3825
867.7429 0.4379
880.4902 0.4546
887.0942 0.2673
899.8949 0.3206
905.5115 0.2984
912.3868 0.4112
917.1560 0.4667
931.7599 0.4702
941.2657 0.3915
942.5801 0.5127
946.6992 0.2372
957.9661 0.3374
972.3816 0.4391
977.4613 0.3751
985.9290 0.2485
992.6036 0.4922
1004.2362 0.3919
1007.6354 0.4911
1010.4983 0.3711
1017.1856 0.2782
1026.1300 0.4122
1033.0585 0.4173
1044.5228 0.3386
1050.2080 0.3163
1060.6536 0.4726
1061.3204 0.4583
1068.7932 0.4707
1074.6792 0.5034
1084.8349 0.3242
1090.2018 0.4825
1096.1342 0.3908
1108.4357 0.3827
1112.1526 0.4130
1115.8571 0.3447
1124.2788 0.3843
1128.4661 0.2503
1135.2375 0.4655
1138.8669 0.1402
1142.4848 0.3802
1144.5471 0.3172
1152.7592 0.4509
1155.3135 0.3880
1159.8971 0.4601
1166.9913 0.3999
1179.0536 0.5472
1180.0532 0.3997
1192.9721 0.5652
1197.9038 0.1319
1203.7951 0.4174
1211.1190 0.4832
1219.8497 0.4677
1225.6356 0.4201
1230.4363 0.4383
project conformational change on normal modes
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 22021521271471098.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22021521271471098.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 22021521271471098.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22021521271471098.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 22021521271471098.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
22021521271471098.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4295E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 208.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.8
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.9
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.7
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.5
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 733.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 745.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 839.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 912.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1010.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1033.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1045.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1085.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1108.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1116.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1124.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1128.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1135.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1139.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1142.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1145.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1153.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1155.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1167.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1179.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1180.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1198.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1204.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1211.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1220.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1226.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1230.
Projmod> 106 vectors, 13563 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 292
First residue number = 11
Last residue number = 306
Number of atoms found = 4521
Mean number per residue = 15.5
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 292
First residue number = 2
Last residue number = 293
Number of atoms found = 2254
Mean number per residue = 7.7
%Projmod-Wn> Different number of atoms for the other conformer.
%Projmod-Er> Not enough of them.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 22021521271471098 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
making animated gifs
11 models are in 22021521271471098.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 279 14.540
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 279 14.562
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 279 14.590
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 279 14.625
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 279 14.665
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 279 14.711
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 279 14.762
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 279 14.820
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 279 14.883
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 279 14.951
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 279 15.025 3 0.688
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 22021521271471098 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
making animated gifs
11 models are in 22021521271471098.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 279 14.617
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 279 14.624
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 279 14.637
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 279 14.655
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 279 14.680
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 279 14.711
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 279 14.747
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 279 14.789
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 279 14.838
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 279 14.891
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 279 14.951
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 22021521271471098 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
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22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
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22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
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22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 279 14.723
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 279 14.708
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 279 14.699
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MODEL 6 MODE=9 DQ=0 279 14.711
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MODEL 10 MODE=9 DQ=80 279 14.818
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 279 14.860
getting mode 10
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=40
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 279 14.876
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 279 14.831
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 279 14.792
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 279 14.759
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 279 14.732
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 279 14.711
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 279 14.695
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MODEL 9 MODE=10 DQ=60 279 14.683
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 279 14.686
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 279 14.694
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 22021521271471098 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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calculating perturbed structure for DQ=-20
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calculating perturbed structure for DQ=0
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calculating perturbed structure for DQ=20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
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22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
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22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
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making animated gifs
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 279 14.786
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 279 14.759
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 279 14.738
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 279 14.723
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 279 14.714
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 279 14.711
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 279 14.714
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 279 14.723
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 279 14.738
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 279 14.759
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 279 14.786
getting mode 12
running: ../../bin/get_modes.sh 22021521271471098 12 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 12
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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22021521271471098.atom
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22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
making animated gifs
11 models are in 22021521271471098.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.12.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=12 DQ=-100 279 14.866
MODEL 2 MODE=12 DQ=-80 279 14.823
MODEL 3 MODE=12 DQ=-60 279 14.786
MODEL 4 MODE=12 DQ=-40 279 14.755
MODEL 5 MODE=12 DQ=-20 279 14.730
MODEL 6 MODE=12 DQ=0 279 14.711
MODEL 7 MODE=12 DQ=20 279 14.697
MODEL 8 MODE=12 DQ=40 279 14.690
MODEL 9 MODE=12 DQ=60 279 14.688
MODEL 10 MODE=12 DQ=80 279 14.693
MODEL 11 MODE=12 DQ=100 279 14.703
getting mode 13
running: ../../bin/get_modes.sh 22021521271471098 13 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 13
calculating perturbed structure for DQ=-100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
making animated gifs
11 models are in 22021521271471098.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.13.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=13 DQ=-100 279 14.700 4 1.095
MODEL 2 MODE=13 DQ=-80 279 14.692 4 1.275
MODEL 3 MODE=13 DQ=-60 279 14.689
MODEL 4 MODE=13 DQ=-40 279 14.691
MODEL 5 MODE=13 DQ=-20 279 14.698
MODEL 6 MODE=13 DQ=0 279 14.711
MODEL 7 MODE=13 DQ=20 279 14.728
MODEL 8 MODE=13 DQ=40 279 14.752
MODEL 9 MODE=13 DQ=60 279 14.780
MODEL 10 MODE=13 DQ=80 279 14.813
MODEL 11 MODE=13 DQ=100 279 14.852
getting mode 14
running: ../../bin/get_modes.sh 22021521271471098 14 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 14
calculating perturbed structure for DQ=-100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
making animated gifs
11 models are in 22021521271471098.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.14.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=14 DQ=-100 279 15.089
MODEL 2 MODE=14 DQ=-80 279 15.003
MODEL 3 MODE=14 DQ=-60 279 14.922
MODEL 4 MODE=14 DQ=-40 279 14.846
MODEL 5 MODE=14 DQ=-20 279 14.776
MODEL 6 MODE=14 DQ=0 279 14.711
MODEL 7 MODE=14 DQ=20 279 14.651
MODEL 8 MODE=14 DQ=40 279 14.597
MODEL 9 MODE=14 DQ=60 279 14.548
MODEL 10 MODE=14 DQ=80 279 14.505
MODEL 11 MODE=14 DQ=100 279 14.468
getting mode 15
running: ../../bin/get_modes.sh 22021521271471098 15 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 15
calculating perturbed structure for DQ=-100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
making animated gifs
11 models are in 22021521271471098.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.15.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=15 DQ=-100 279 14.732
MODEL 2 MODE=15 DQ=-80 279 14.717
MODEL 3 MODE=15 DQ=-60 279 14.707
MODEL 4 MODE=15 DQ=-40 279 14.703
MODEL 5 MODE=15 DQ=-20 279 14.704
MODEL 6 MODE=15 DQ=0 279 14.711
MODEL 7 MODE=15 DQ=20 279 14.723
MODEL 8 MODE=15 DQ=40 279 14.740
MODEL 9 MODE=15 DQ=60 279 14.762
MODEL 10 MODE=15 DQ=80 279 14.790
MODEL 11 MODE=15 DQ=100 279 14.823
getting mode 16
running: ../../bin/get_modes.sh 22021521271471098 16 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 16
calculating perturbed structure for DQ=-100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
22021521271471098.eigenfacs
22021521271471098.atom
making animated gifs
11 models are in 22021521271471098.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 22021521271471098.16.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=16 DQ=-100 279 14.703
MODEL 2 MODE=16 DQ=-80 279 14.693
MODEL 3 MODE=16 DQ=-60 279 14.689
MODEL 4 MODE=16 DQ=-40 279 14.691
MODEL 5 MODE=16 DQ=-20 279 14.698
MODEL 6 MODE=16 DQ=0 279 14.711
MODEL 7 MODE=16 DQ=20 279 14.729
MODEL 8 MODE=16 DQ=40 279 14.752
MODEL 9 MODE=16 DQ=60 279 14.781
MODEL 10 MODE=16 DQ=80 279 14.816
MODEL 11 MODE=16 DQ=100 279 14.855
22021521271471098.10.pdb
22021521271471098.11.pdb
22021521271471098.12.pdb
22021521271471098.13.pdb
22021521271471098.14.pdb
22021521271471098.15.pdb
22021521271471098.16.pdb
22021521271471098.7.pdb
22021521271471098.8.pdb
22021521271471098.9.pdb
STDERR:
real 0m13.571s
user 0m13.456s
sys 0m0.084s
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elNémo
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by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
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