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***  tw_l5_r1  ***

LOGs for ID: 22021015563347801

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22021015563347801.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22021015563347801.atom to be opened. Openam> File opened: 22021015563347801.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 516 First residue number = 1 Last residue number = 258 Number of atoms found = 4036 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 3.018261 +/- 18.444058 From: -43.588000 To: 48.676000 = -6.473856 +/- 32.500179 From: -65.863000 To: 54.983000 = 3.504965 +/- 18.265636 From: -34.178000 To: 42.716000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9704 % Filled. Pdbmat> 1444493 non-zero elements. Pdbmat> 157833 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.21 +/- 22.73 Maximum number = 127 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 3.156660E+06 Pdbmat> Larger element = 505.277 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 516 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22021015563347801.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22021015563347801.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22021015563347801.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4036 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 516 residues. Blocpdb> 21 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 23 atoms in block 2 Block first atom: 22 Blocpdb> 23 atoms in block 3 Block first atom: 45 Blocpdb> 28 atoms in block 4 Block first atom: 68 Blocpdb> 26 atoms in block 5 Block first atom: 96 Blocpdb> 29 atoms in block 6 Block first atom: 122 Blocpdb> 27 atoms in block 7 Block first atom: 151 Blocpdb> 18 atoms in block 8 Block first atom: 178 Blocpdb> 26 atoms in block 9 Block first atom: 196 Blocpdb> 24 atoms in block 10 Block first atom: 222 Blocpdb> 25 atoms in block 11 Block first atom: 246 Blocpdb> 26 atoms in block 12 Block first atom: 271 Blocpdb> 17 atoms in block 13 Block first atom: 297 Blocpdb> 20 atoms in block 14 Block first atom: 314 Blocpdb> 23 atoms in block 15 Block first atom: 334 Blocpdb> 24 atoms in block 16 Block first atom: 357 Blocpdb> 28 atoms in block 17 Block first atom: 381 Blocpdb> 19 atoms in block 18 Block first atom: 409 Blocpdb> 19 atoms in block 19 Block first atom: 428 Blocpdb> 25 atoms in block 20 Block first atom: 447 Blocpdb> 23 atoms in block 21 Block first atom: 472 Blocpdb> 22 atoms in block 22 Block first atom: 495 Blocpdb> 22 atoms in block 23 Block first atom: 517 Blocpdb> 20 atoms in block 24 Block first atom: 539 Blocpdb> 19 atoms in block 25 Block first atom: 559 Blocpdb> 28 atoms in block 26 Block first atom: 578 Blocpdb> 29 atoms in block 27 Block first atom: 606 Blocpdb> 25 atoms in block 28 Block first atom: 635 Blocpdb> 23 atoms in block 29 Block first atom: 660 Blocpdb> 24 atoms in block 30 Block first atom: 683 Blocpdb> 20 atoms in block 31 Block first atom: 707 Blocpdb> 25 atoms in block 32 Block first atom: 727 Blocpdb> 25 atoms in block 33 Block first atom: 752 Blocpdb> 22 atoms in block 34 Block first atom: 777 Blocpdb> 34 atoms in block 35 Block first atom: 799 Blocpdb> 25 atoms in block 36 Block first atom: 833 Blocpdb> 23 atoms in block 37 Block first atom: 858 Blocpdb> 27 atoms in block 38 Block first atom: 881 Blocpdb> 26 atoms in block 39 Block first atom: 908 Blocpdb> 24 atoms in block 40 Block first atom: 934 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 958 Blocpdb> 27 atoms in block 42 Block first atom: 975 Blocpdb> 22 atoms in block 43 Block first atom: 1002 Blocpdb> 26 atoms in block 44 Block first atom: 1024 Blocpdb> 26 atoms in block 45 Block first atom: 1050 Blocpdb> 28 atoms in block 46 Block first atom: 1076 Blocpdb> 26 atoms in block 47 Block first atom: 1104 Blocpdb> 25 atoms in block 48 Block first atom: 1130 Blocpdb> 22 atoms in block 49 Block first atom: 1155 Blocpdb> 28 atoms in block 50 Block first atom: 1177 Blocpdb> 26 atoms in block 51 Block first atom: 1205 Blocpdb> 26 atoms in block 52 Block first atom: 1231 Blocpdb> 21 atoms in block 53 Block first atom: 1257 Blocpdb> 18 atoms in block 54 Block first atom: 1278 Blocpdb> 16 atoms in block 55 Block first atom: 1296 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 1312 Blocpdb> 22 atoms in block 57 Block first atom: 1330 Blocpdb> 28 atoms in block 58 Block first atom: 1352 Blocpdb> 26 atoms in block 59 Block first atom: 1380 Blocpdb> 25 atoms in block 60 Block first atom: 1406 Blocpdb> 22 atoms in block 61 Block first atom: 1431 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 1453 Blocpdb> 20 atoms in block 63 Block first atom: 1470 Blocpdb> 28 atoms in block 64 Block first atom: 1490 Blocpdb> 20 atoms in block 65 Block first atom: 1518 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 1538 Blocpdb> 21 atoms in block 67 Block first atom: 1558 Blocpdb> 28 atoms in block 68 Block first atom: 1579 Blocpdb> 21 atoms in block 69 Block first atom: 1607 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1628 Blocpdb> 31 atoms in block 71 Block first atom: 1652 Blocpdb> 23 atoms in block 72 Block first atom: 1683 Blocpdb> 28 atoms in block 73 Block first atom: 1706 Blocpdb> 27 atoms in block 74 Block first atom: 1734 Blocpdb> 17 atoms in block 75 Block first atom: 1761 Blocpdb> 19 atoms in block 76 Block first atom: 1778 Blocpdb> 28 atoms in block 77 Block first atom: 1797 Blocpdb> 17 atoms in block 78 Block first atom: 1825 Blocpdb> 26 atoms in block 79 Block first atom: 1842 Blocpdb> 22 atoms in block 80 Block first atom: 1868 Blocpdb> 22 atoms in block 81 Block first atom: 1890 Blocpdb> 23 atoms in block 82 Block first atom: 1912 Blocpdb> 19 atoms in block 83 Block first atom: 1935 Blocpdb> 21 atoms in block 84 Block first atom: 1954 Blocpdb> 21 atoms in block 85 Block first atom: 1975 Blocpdb> 23 atoms in block 86 Block first atom: 1996 Blocpdb> 21 atoms in block 87 Block first atom: 2019 Blocpdb> 23 atoms in block 88 Block first atom: 2040 Blocpdb> 23 atoms in block 89 Block first atom: 2063 Blocpdb> 28 atoms in block 90 Block first atom: 2086 Blocpdb> 26 atoms in block 91 Block first atom: 2114 Blocpdb> 29 atoms in block 92 Block first atom: 2140 Blocpdb> 27 atoms in block 93 Block first atom: 2169 Blocpdb> 18 atoms in block 94 Block first atom: 2196 Blocpdb> 26 atoms in block 95 Block first atom: 2214 Blocpdb> 24 atoms in block 96 Block first atom: 2240 Blocpdb> 25 atoms in block 97 Block first atom: 2264 Blocpdb> 26 atoms in block 98 Block first atom: 2289 Blocpdb> 17 atoms in block 99 Block first atom: 2315 Blocpdb> 20 atoms in block 100 Block first atom: 2332 Blocpdb> 23 atoms in block 101 Block first atom: 2352 Blocpdb> 24 atoms in block 102 Block first atom: 2375 Blocpdb> 28 atoms in block 103 Block first atom: 2399 Blocpdb> 19 atoms in block 104 Block first atom: 2427 Blocpdb> 19 atoms in block 105 Block first atom: 2446 Blocpdb> 25 atoms in block 106 Block first atom: 2465 Blocpdb> 23 atoms in block 107 Block first atom: 2490 Blocpdb> 22 atoms in block 108 Block first atom: 2513 Blocpdb> 22 atoms in block 109 Block first atom: 2535 Blocpdb> 20 atoms in block 110 Block first atom: 2557 Blocpdb> 19 atoms in block 111 Block first atom: 2577 Blocpdb> 28 atoms in block 112 Block first atom: 2596 Blocpdb> 29 atoms in block 113 Block first atom: 2624 Blocpdb> 25 atoms in block 114 Block first atom: 2653 Blocpdb> 23 atoms in block 115 Block first atom: 2678 Blocpdb> 24 atoms in block 116 Block first atom: 2701 Blocpdb> 20 atoms in block 117 Block first atom: 2725 Blocpdb> 25 atoms in block 118 Block first atom: 2745 Blocpdb> 25 atoms in block 119 Block first atom: 2770 Blocpdb> 22 atoms in block 120 Block first atom: 2795 Blocpdb> 34 atoms in block 121 Block first atom: 2817 Blocpdb> 25 atoms in block 122 Block first atom: 2851 Blocpdb> 23 atoms in block 123 Block first atom: 2876 Blocpdb> 27 atoms in block 124 Block first atom: 2899 Blocpdb> 26 atoms in block 125 Block first atom: 2926 Blocpdb> 24 atoms in block 126 Block first atom: 2952 Blocpdb> 17 atoms in block 127 Block first atom: 2976 Blocpdb> 27 atoms in block 128 Block first atom: 2993 Blocpdb> 22 atoms in block 129 Block first atom: 3020 Blocpdb> 26 atoms in block 130 Block first atom: 3042 Blocpdb> 26 atoms in block 131 Block first atom: 3068 Blocpdb> 28 atoms in block 132 Block first atom: 3094 Blocpdb> 26 atoms in block 133 Block first atom: 3122 Blocpdb> 25 atoms in block 134 Block first atom: 3148 Blocpdb> 22 atoms in block 135 Block first atom: 3173 Blocpdb> 28 atoms in block 136 Block first atom: 3195 Blocpdb> 26 atoms in block 137 Block first atom: 3223 Blocpdb> 26 atoms in block 138 Block first atom: 3249 Blocpdb> 21 atoms in block 139 Block first atom: 3275 Blocpdb> 18 atoms in block 140 Block first atom: 3296 Blocpdb> 16 atoms in block 141 Block first atom: 3314 Blocpdb> 18 atoms in block 142 Block first atom: 3330 Blocpdb> 22 atoms in block 143 Block first atom: 3348 Blocpdb> 28 atoms in block 144 Block first atom: 3370 Blocpdb> 26 atoms in block 145 Block first atom: 3398 Blocpdb> 25 atoms in block 146 Block first atom: 3424 Blocpdb> 22 atoms in block 147 Block first atom: 3449 Blocpdb> 17 atoms in block 148 Block first atom: 3471 Blocpdb> 20 atoms in block 149 Block first atom: 3488 Blocpdb> 28 atoms in block 150 Block first atom: 3508 Blocpdb> 20 atoms in block 151 Block first atom: 3536 Blocpdb> 20 atoms in block 152 Block first atom: 3556 Blocpdb> 21 atoms in block 153 Block first atom: 3576 Blocpdb> 28 atoms in block 154 Block first atom: 3597 Blocpdb> 21 atoms in block 155 Block first atom: 3625 Blocpdb> 24 atoms in block 156 Block first atom: 3646 Blocpdb> 31 atoms in block 157 Block first atom: 3670 Blocpdb> 23 atoms in block 158 Block first atom: 3701 Blocpdb> 28 atoms in block 159 Block first atom: 3724 Blocpdb> 27 atoms in block 160 Block first atom: 3752 Blocpdb> 17 atoms in block 161 Block first atom: 3779 Blocpdb> 19 atoms in block 162 Block first atom: 3796 Blocpdb> 28 atoms in block 163 Block first atom: 3815 Blocpdb> 17 atoms in block 164 Block first atom: 3843 Blocpdb> 26 atoms in block 165 Block first atom: 3860 Blocpdb> 22 atoms in block 166 Block first atom: 3886 Blocpdb> 22 atoms in block 167 Block first atom: 3908 Blocpdb> 23 atoms in block 168 Block first atom: 3930 Blocpdb> 19 atoms in block 169 Block first atom: 3953 Blocpdb> 21 atoms in block 170 Block first atom: 3972 Blocpdb> 21 atoms in block 171 Block first atom: 3993 Blocpdb> 23 atoms in block 172 Block first atom: 4013 Blocpdb> 172 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 16 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1444665 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 12108 Prepmat> Matrix trace = 3156660.0000 Prepmat> Last element read: 12108 12108 175.7311 Prepmat> 14879 lines saved. Prepmat> 13351 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4036 RTB> Total mass = 4036.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4036 RTB> Number of blocks = 172 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 204506.9385 RTB> 52392 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1032 Diagstd> Nb of non-zero elements: 52392 Diagstd> Projected matrix trace = 204506.9385 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1032 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 204506.9385 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0146142 0.0285706 0.0466337 0.2533141 0.4195352 0.6414996 1.1685170 1.4256128 1.6042433 1.9727938 2.4604416 2.8421694 3.5165206 3.8420958 4.1027953 4.8292686 5.2427995 6.4343827 7.0324356 8.0086852 8.6400144 8.9953687 9.3941797 9.7487452 10.4873772 10.6833996 11.2581903 12.4456464 12.8976055 13.5211281 13.7749681 14.2455299 14.3118347 14.7049794 15.1388371 15.7245883 16.3095216 16.9204554 17.7575748 18.3641083 18.4666761 19.5341379 19.9534324 21.8018562 22.0261024 22.3757792 22.9080710 23.4952169 23.7677418 23.9251225 24.7831224 25.2954037 26.1160402 26.2434201 26.6864950 27.0195471 27.2680047 27.8442610 28.5709448 29.3295230 29.5325758 29.8916921 29.9615362 30.1388843 30.6339138 30.7883326 30.9943138 31.4053548 32.7517025 33.1592967 34.7012671 35.0059384 35.3929653 35.5596777 35.8364897 36.0182285 36.1801115 36.7530122 37.6684072 37.7067909 37.8705686 38.3673764 39.1323321 39.2748215 40.2873750 40.5854314 40.7393933 40.8256205 41.4317736 41.4578225 41.7405389 42.3686433 42.7265567 42.8980898 43.4697685 43.6676306 44.5214329 44.7271714 45.1482135 45.3055346 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034331 0.0034334 0.0034340 0.0034343 0.0034345 0.0034360 13.1275143 18.3550280 23.4501215 54.6543778 70.3362919 86.9748072 117.3850521 129.6570315 137.5404363 152.5232769 170.3341813 183.0712986 203.6347367 212.8528047 219.9556913 238.6360003 248.6433827 275.4537733 287.9706074 307.3094339 319.1923792 325.6902551 332.8317216 339.0546001 351.6646584 354.9359716 364.3590596 383.0928168 389.9867255 399.3022384 403.0329753 409.8591028 410.8118254 416.4160796 422.5144220 430.6108038 438.5467446 446.6849330 457.6011493 465.3505194 466.6482546 479.9460316 485.0696336 507.0397595 509.6407045 513.6701918 519.7440675 526.3625829 529.4064647 531.1563344 540.5965764 546.1552184 554.9437243 556.2954353 560.9718250 564.4614830 567.0507912 573.0112231 580.4403317 588.0953970 590.1276233 593.7047592 594.3979717 596.1545539 601.0305167 602.5434436 604.5556622 608.5512128 621.4586255 625.3136882 639.6876214 642.4896594 646.0315907 647.5513132 650.0668373 651.7131062 653.1760180 658.3271246 666.4750693 666.8145484 668.2611186 672.6301518 679.3023948 680.5380153 689.2547473 691.7996911 693.1106286 693.8437448 698.9756439 699.1953385 701.5753248 706.8342076 709.8134555 711.2368620 715.9603039 717.5878786 724.5691635 726.2413906 729.6516442 730.9217911 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4036 Rtb_to_modes> Number of blocs = 172 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.4614E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.8571E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.6634E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2533 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4195 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6415 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.169 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.426 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.604 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.973 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.460 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.842 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.517 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.842 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.103 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.829 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.243 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.434 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.032 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.009 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.640 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.995 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.394 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.749 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.31 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1032 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 1.00004 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99997 0.99995 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 0.99996 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 0.99995 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 72648 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 1.00004 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 0.99997 0.99995 1.00002 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 0.99996 1.00002 1.00000 1.00003 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 0.99995 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22021015563347801.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22021015563347801.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22021015563347801.atom Openam> file on opening on unit 11: 22021015563347801.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 516 First residue number = 1 Last residue number = 258 Number of atoms found = 4036 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9952E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9966E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.4614E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.8571E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.6634E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2533 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4195 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6415 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.169 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.426 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.604 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.973 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.460 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.842 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.517 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.842 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.103 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.829 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.243 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.434 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.032 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.009 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.640 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.995 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.394 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.749 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.31 Bfactors> 106 vectors, 12108 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.014614 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.169 for 516 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.538 +/- 0.35 Bfactors> = 87.184 +/- 12.17 Bfactors> Shiftng-fct= 86.646 Bfactors> Scaling-fct= 34.860 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22021015563347801.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22021015563347801.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 18.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 23.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 117.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 307.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.9 Chkmod> 106 vectors, 12108 coordinates in file. Chkmod> That is: 4036 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 49 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8640 0.0034 0.9972 0.0034 0.6820 0.0034 0.9019 0.0034 0.7703 0.0034 0.8393 13.1269 0.7593 18.3544 0.6361 23.4492 0.7442 54.6505 0.7957 70.3303 0.7018 86.9711 0.8565 117.4043 0.2921 129.6691 0.2683 137.5241 0.3349 152.5247 0.4297 170.3116 0.4800 183.0580 0.2968 203.6399 0.4324 212.8410 0.6323 219.9517 0.5009 238.6191 0.5704 248.6375 0.4911 275.4338 0.1859 287.9493 0.4369 307.3023 0.5628 319.1784 0.2286 325.6696 0.4190 332.8143 0.0267 339.0445 0.3436 351.6935 0.2357 354.8643 0.4772 364.3727 0.3778 383.1434 0.5434 390.0062 0.1500 399.2684 0.3187 402.9430 0.3868 409.9058 0.5457 410.7679 0.5433 416.3277 0.4129 422.5125 0.2040 430.5295 0.3157 438.5344 0.3400 446.6597 0.0646 457.6128 0.1935 465.2785 0.3742 466.6702 0.3147 479.8746 0.2144 485.0071 0.0164 506.9964 0.4066 509.6639 0.2335 513.6966 0.2234 519.7436 0.2141 526.3936 0.0598 529.4089 0.3188 531.1877 0.2936 540.5393 0.2981 546.1814 0.2097 554.9620 0.2111 556.2353 0.3854 560.9846 0.1501 564.4420 0.1663 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22021015563347801.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22021015563347801.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 22021015563347801 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=100 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom making animated gifs 11 models are in 22021015563347801.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22021015563347801.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 22021015563347801.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 22021015563347801 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=60 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=80 22021015563347801.eigenfacs 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100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 22021015563347801 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=0 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=20 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=40 22021015563347801.eigenfacs 22021015563347801.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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