***    ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 220208102030121730.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 220208102030121730.atom to be opened.
Openam> File opened: 220208102030121730.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 850
First residue number = 1
Last residue number = 850
Number of atoms found = 13203
Mean number per residue = 15.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -4.715288 +/- 16.604840 From: -39.241000 To: 39.100000
= 5.395861 +/- 15.617453 From: -38.590000 To: 38.578000
= 4.403352 +/- 21.795929 From: -49.520000 To: 50.090000
Pdbmat> Masses are all set to one.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid.
%Pdbmat-W> ........
%Pdbmat-W> 21 residue(s) not known.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.3659 % Filled.
Pdbmat> 10714822 non-zero elements.
Pdbmat> 1181931 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 179.04 +/- 48.12
Maximum number = 259
Minimum number = 35
Pdbmat> Matrix trace = 2.363862E+07
Pdbmat> Larger element = 909.130
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
850 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 220208102030121730.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 220208102030121730.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
220208102030121730.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 13203 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 850 residues.
Blocpdb> 81 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 79 atoms in block 2
Block first atom: 82
Blocpdb> 60 atoms in block 3
Block first atom: 161
Blocpdb> 80 atoms in block 4
Block first atom: 221
Blocpdb> 81 atoms in block 5
Block first atom: 301
Blocpdb> 95 atoms in block 6
Block first atom: 382
Blocpdb> 95 atoms in block 7
Block first atom: 477
Blocpdb> 77 atoms in block 8
Block first atom: 572
Blocpdb> 80 atoms in block 9
Block first atom: 649
Blocpdb> 93 atoms in block 10
Block first atom: 729
Blocpdb> 83 atoms in block 11
Block first atom: 822
Blocpdb> 91 atoms in block 12
Block first atom: 905
Blocpdb> 87 atoms in block 13
Block first atom: 996
Blocpdb> 89 atoms in block 14
Block first atom: 1083
Blocpdb> 67 atoms in block 15
Block first atom: 1172
Blocpdb> 88 atoms in block 16
Block first atom: 1239
Blocpdb> 63 atoms in block 17
Block first atom: 1327
Blocpdb> 83 atoms in block 18
Block first atom: 1390
Blocpdb> 70 atoms in block 19
Block first atom: 1473
Blocpdb> 91 atoms in block 20
Block first atom: 1543
Blocpdb> 85 atoms in block 21
Block first atom: 1634
Blocpdb> 75 atoms in block 22
Block first atom: 1719
Blocpdb> 98 atoms in block 23
Block first atom: 1794
Blocpdb> 74 atoms in block 24
Block first atom: 1892
Blocpdb> 80 atoms in block 25
Block first atom: 1966
Blocpdb> 71 atoms in block 26
Block first atom: 2046
Blocpdb> 82 atoms in block 27
Block first atom: 2117
Blocpdb> 77 atoms in block 28
Block first atom: 2199
Blocpdb> 77 atoms in block 29
Block first atom: 2276
Blocpdb> 71 atoms in block 30
Block first atom: 2353
Blocpdb> 83 atoms in block 31
Block first atom: 2424
Blocpdb> 70 atoms in block 32
Block first atom: 2507
Blocpdb> 100 atoms in block 33
Block first atom: 2577
Blocpdb> 73 atoms in block 34
Block first atom: 2677
Blocpdb> 77 atoms in block 35
Block first atom: 2750
Blocpdb> 83 atoms in block 36
Block first atom: 2827
Blocpdb> 76 atoms in block 37
Block first atom: 2910
Blocpdb> 82 atoms in block 38
Block first atom: 2986
Blocpdb> 71 atoms in block 39
Block first atom: 3068
Blocpdb> 65 atoms in block 40
Block first atom: 3139
Blocpdb> 74 atoms in block 41
Block first atom: 3204
Blocpdb> 93 atoms in block 42
Block first atom: 3278
Blocpdb> 87 atoms in block 43
Block first atom: 3371
Blocpdb> 81 atoms in block 44
Block first atom: 3458
Blocpdb> 62 atoms in block 45
Block first atom: 3539
Blocpdb> 67 atoms in block 46
Block first atom: 3601
Blocpdb> 81 atoms in block 47
Block first atom: 3668
Blocpdb> 70 atoms in block 48
Block first atom: 3749
Blocpdb> 77 atoms in block 49
Block first atom: 3819
Blocpdb> 69 atoms in block 50
Block first atom: 3896
Blocpdb> 83 atoms in block 51
Block first atom: 3965
Blocpdb> 79 atoms in block 52
Block first atom: 4048
Blocpdb> 68 atoms in block 53
Block first atom: 4127
Blocpdb> 78 atoms in block 54
Block first atom: 4195
Blocpdb> 79 atoms in block 55
Block first atom: 4273
Blocpdb> 75 atoms in block 56
Block first atom: 4352
Blocpdb> 81 atoms in block 57
Block first atom: 4427
Blocpdb> 69 atoms in block 58
Block first atom: 4508
Blocpdb> 81 atoms in block 59
Block first atom: 4577
Blocpdb> 92 atoms in block 60
Block first atom: 4658
Blocpdb> 80 atoms in block 61
Block first atom: 4750
Blocpdb> 86 atoms in block 62
Block first atom: 4830
Blocpdb> 73 atoms in block 63
Block first atom: 4916
Blocpdb> 80 atoms in block 64
Block first atom: 4989
Blocpdb> 84 atoms in block 65
Block first atom: 5069
Blocpdb> 62 atoms in block 66
Block first atom: 5153
Blocpdb> 65 atoms in block 67
Block first atom: 5215
Blocpdb> 77 atoms in block 68
Block first atom: 5280
Blocpdb> 82 atoms in block 69
Block first atom: 5357
Blocpdb> 73 atoms in block 70
Block first atom: 5439
Blocpdb> 93 atoms in block 71
Block first atom: 5512
Blocpdb> 85 atoms in block 72
Block first atom: 5605
Blocpdb> 74 atoms in block 73
Block first atom: 5690
Blocpdb> 73 atoms in block 74
Block first atom: 5764
Blocpdb> 88 atoms in block 75
Block first atom: 5837
Blocpdb> 86 atoms in block 76
Block first atom: 5925
Blocpdb> 88 atoms in block 77
Block first atom: 6011
Blocpdb> 80 atoms in block 78
Block first atom: 6099
Blocpdb> 95 atoms in block 79
Block first atom: 6179
Blocpdb> 68 atoms in block 80
Block first atom: 6274
Blocpdb> 88 atoms in block 81
Block first atom: 6342
Blocpdb> 72 atoms in block 82
Block first atom: 6430
Blocpdb> 91 atoms in block 83
Block first atom: 6502
Blocpdb> 77 atoms in block 84
Block first atom: 6593
Blocpdb> 62 atoms in block 85
Block first atom: 6670
Blocpdb> 87 atoms in block 86
Block first atom: 6732
Blocpdb> 83 atoms in block 87
Block first atom: 6819
Blocpdb> 77 atoms in block 88
Block first atom: 6902
Blocpdb> 94 atoms in block 89
Block first atom: 6979
Blocpdb> 77 atoms in block 90
Block first atom: 7073
Blocpdb> 75 atoms in block 91
Block first atom: 7150
Blocpdb> 71 atoms in block 92
Block first atom: 7225
Blocpdb> 78 atoms in block 93
Block first atom: 7296
Blocpdb> 86 atoms in block 94
Block first atom: 7374
Blocpdb> 65 atoms in block 95
Block first atom: 7460
Blocpdb> 72 atoms in block 96
Block first atom: 7525
Blocpdb> 76 atoms in block 97
Block first atom: 7597
Blocpdb> 72 atoms in block 98
Block first atom: 7673
Blocpdb> 73 atoms in block 99
Block first atom: 7745
Blocpdb> 72 atoms in block 100
Block first atom: 7818
Blocpdb> 86 atoms in block 101
Block first atom: 7890
Blocpdb> 84 atoms in block 102
Block first atom: 7976
Blocpdb> 58 atoms in block 103
Block first atom: 8060
Blocpdb> 80 atoms in block 104
Block first atom: 8118
Blocpdb> 97 atoms in block 105
Block first atom: 8198
Blocpdb> 73 atoms in block 106
Block first atom: 8295
Blocpdb> 79 atoms in block 107
Block first atom: 8368
Blocpdb> 72 atoms in block 108
Block first atom: 8447
Blocpdb> 62 atoms in block 109
Block first atom: 8519
Blocpdb> 85 atoms in block 110
Block first atom: 8581
Blocpdb> 84 atoms in block 111
Block first atom: 8666
Blocpdb> 66 atoms in block 112
Block first atom: 8750
Blocpdb> 79 atoms in block 113
Block first atom: 8816
Blocpdb> 72 atoms in block 114
Block first atom: 8895
Blocpdb> 70 atoms in block 115
Block first atom: 8967
Blocpdb> 77 atoms in block 116
Block first atom: 9037
Blocpdb> 59 atoms in block 117
Block first atom: 9114
Blocpdb> 78 atoms in block 118
Block first atom: 9173
Blocpdb> 59 atoms in block 119
Block first atom: 9251
Blocpdb> 66 atoms in block 120
Block first atom: 9310
Blocpdb> 75 atoms in block 121
Block first atom: 9376
Blocpdb> 62 atoms in block 122
Block first atom: 9451
Blocpdb> 92 atoms in block 123
Block first atom: 9513
Blocpdb> 72 atoms in block 124
Block first atom: 9605
Blocpdb> 71 atoms in block 125
Block first atom: 9677
Blocpdb> 95 atoms in block 126
Block first atom: 9748
Blocpdb> 79 atoms in block 127
Block first atom: 9843
Blocpdb> 74 atoms in block 128
Block first atom: 9922
Blocpdb> 91 atoms in block 129
Block first atom: 9996
Blocpdb> 69 atoms in block 130
Block first atom: 10087
Blocpdb> 73 atoms in block 131
Block first atom: 10156
Blocpdb> 73 atoms in block 132
Block first atom: 10229
Blocpdb> 69 atoms in block 133
Block first atom: 10302
Blocpdb> 75 atoms in block 134
Block first atom: 10371
Blocpdb> 72 atoms in block 135
Block first atom: 10446
Blocpdb> 83 atoms in block 136
Block first atom: 10518
Blocpdb> 78 atoms in block 137
Block first atom: 10601
Blocpdb> 78 atoms in block 138
Block first atom: 10679
Blocpdb> 67 atoms in block 139
Block first atom: 10757
Blocpdb> 89 atoms in block 140
Block first atom: 10824
Blocpdb> 79 atoms in block 141
Block first atom: 10913
Blocpdb> 81 atoms in block 142
Block first atom: 10992
Blocpdb> 76 atoms in block 143
Block first atom: 11073
Blocpdb> 77 atoms in block 144
Block first atom: 11149
Blocpdb> 85 atoms in block 145
Block first atom: 11226
Blocpdb> 70 atoms in block 146
Block first atom: 11311
Blocpdb> 95 atoms in block 147
Block first atom: 11381
Blocpdb> 61 atoms in block 148
Block first atom: 11476
Blocpdb> 76 atoms in block 149
Block first atom: 11537
Blocpdb> 84 atoms in block 150
Block first atom: 11613
Blocpdb> 68 atoms in block 151
Block first atom: 11697
Blocpdb> 69 atoms in block 152
Block first atom: 11765
Blocpdb> 77 atoms in block 153
Block first atom: 11834
Blocpdb> 71 atoms in block 154
Block first atom: 11911
Blocpdb> 83 atoms in block 155
Block first atom: 11982
Blocpdb> 89 atoms in block 156
Block first atom: 12065
Blocpdb> 92 atoms in block 157
Block first atom: 12154
Blocpdb> 62 atoms in block 158
Block first atom: 12246
Blocpdb> 70 atoms in block 159
Block first atom: 12308
Blocpdb> 104 atoms in block 160
Block first atom: 12378
Blocpdb> 84 atoms in block 161
Block first atom: 12482
Blocpdb> 68 atoms in block 162
Block first atom: 12566
Blocpdb> 67 atoms in block 163
Block first atom: 12634
Blocpdb> 85 atoms in block 164
Block first atom: 12701
Blocpdb> 67 atoms in block 165
Block first atom: 12786
Blocpdb> 85 atoms in block 166
Block first atom: 12853
Blocpdb> 67 atoms in block 167
Block first atom: 12938
Blocpdb> 86 atoms in block 168
Block first atom: 13005
Blocpdb> 108 atoms in block 169
Block first atom: 13091
Blocpdb> 5 atoms in block 170
Block first atom: 13198
Blocpdb> 170 blocks.
Blocpdb> At most, 108 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 10714992 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 39609
Prepmat> Matrix trace = 23638620.0000
Prepmat> Last element read: 39609 39609 590.4296
Prepmat> 14536 lines saved.
Prepmat> 12597 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 13203
RTB> Total mass = 13203.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 13203
RTB> Number of blocks = 170
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 450886.2301
RTB> 67218 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1020
Diagstd> Nb of non-zero elements: 67218
Diagstd> Projected matrix trace = 450886.2301
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1020 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 450886.2301
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 1.0657212 1.3715343 2.2088613 5.2694080
7.3507564 9.6901195 12.2324785 12.7977003 15.3134816
21.1345204 22.1174085 24.4278943 27.6552495 28.2812934
30.0864811 30.8470471 32.3123479 35.8114756 36.9723847
37.4710683 39.9651666 41.0751695 42.1207751 43.5950592
43.6752440 44.1518858 46.6539239 47.8550522 49.5121082
50.7817495 52.7306836 53.4659959 53.7479955 54.6438779
56.4546051 58.3186332 59.1743187 59.8976355 62.3689057
62.9549701 65.0685050 67.2854871 68.4653852 69.0738808
70.3468873 72.4140980 75.4174028 76.1727761 78.1054000
78.6975562 79.1517918 79.9597302 81.2173877 82.0522842
83.1876265 84.5296798 84.9868405 85.9531930 86.7786311
88.0688523 89.0443522 89.5507732 90.8647493 93.4438826
93.9388405 95.1850105 97.6088948 98.3293725 99.6398018
100.7345867 102.2157090 103.7672549 104.9651633 106.0340861
108.0527307 108.8572004 109.3151727 110.3999657 111.5435301
112.2670640 113.3326182 114.4050512 115.8096685 117.2743516
117.9603352 119.2298944 121.1390178 122.2869503 122.4460893
124.0315024 125.3394145 125.5995652 127.9678333 128.0061639
130.5060122 130.6431740 131.9726333 132.8284349 134.9191079
135.5727120
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034322 0.0034340 0.0034342 0.0034351 0.0034353
0.0034354 112.1029593 127.1740857 161.3910703 249.2735465
294.4159235 338.0335814 379.7978581 388.4733651 424.9445370
499.2194280 510.6959339 536.7082816 571.0630639 577.4905930
595.6360548 603.1177060 617.2762085 649.8399221 660.2889235
664.7269972 686.4929700 695.9610943 704.7635871 716.9913495
717.6504315 721.5557786 741.7189394 751.2062237 764.1013899
773.8363206 788.5459057 794.0248798 796.1161175 802.7236089
815.9150933 829.2757174 835.3373753 840.4272384 857.5892773
861.6091278 875.9527785 890.7503067 898.5263303 902.5103866
910.7888872 924.0741959 943.0420678 947.7530096 959.7006979
963.3318149 966.1079495 971.0261827 978.6328474 983.6500495
990.4319622 998.3892412 1001.0853881 1006.7607779 1011.5833621
1019.0757064 1024.7040899 1027.6138529 1035.1254742 1049.7133435
1052.4897572 1059.4477948 1072.8524024 1076.8046295 1083.9561350
1089.8948106 1097.8780517 1106.1790887 1112.5457349 1118.1962440
1128.7900010 1132.9842190 1135.3650022 1140.9845126 1146.8786622
1150.5922985 1156.0396802 1161.4964322 1168.6048636 1175.9715103
1179.4058547 1185.7356024 1195.1909727 1200.8405297 1201.6216371
1209.3758237 1215.7355354 1216.9965535 1228.4166341 1228.6005960
1240.5393367 1241.1910686 1247.4904264 1251.5286846 1261.3395422
1264.3910767
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 13203
Rtb_to_modes> Number of blocs = 170
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9898E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.066
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.372
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.209
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.269
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.351
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.690
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.97
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.6
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1020 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998
1.00004 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001
0.99999 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999
1.00000 0.99998 0.99996 0.99999 1.00002
1.00004 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001
1.00003 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 237654 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998
0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998
1.00004 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001
0.99999 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999
1.00000 0.99998 0.99996 0.99999 1.00002
1.00004 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999
1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002
1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002
0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001
1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002
1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001
1.00003 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002
0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000
1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002
0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 220208102030121730.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220208102030121730.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 220208102030121730.atom
Openam> file on opening on unit 11:
220208102030121730.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 850
First residue number = 1
Last residue number = 850
Number of atoms found = 13203
Mean number per residue = 15.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9898E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.066
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.372
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.209
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.269
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.351
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.690
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.97
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.6
Bfactors> 106 vectors, 39609 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.066000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.005 +/- 0.00
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.005
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 220208102030121730.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
220208102030121730.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1012.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1019.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1025.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1028.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1035.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1052.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1059.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1073.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1077.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1098.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1106.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1113.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1118.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1129.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1133.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1135.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1141.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1147.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1156.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1161.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1176.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1180.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1186.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1195.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1201.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1201.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1217.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1229.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1229.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1240.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1241.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1248.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1251.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1261.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1264.
Chkmod> 106 vectors, 39609 coordinates in file.
Chkmod> That is: 13203 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9547
0.0034 0.7512
0.0034 0.7384
0.0034 0.7377
0.0034 0.9973
0.0034 0.9554
112.1128 0.5068
127.1902 0.5847
161.3892 0.3004
249.2532 0.6325
294.4082 0.6618
338.0170 0.5801
379.7431 0.5248
388.4916 0.7117
424.8780 0.6248
499.1446 0.2403
510.7039 0.5336
536.7084 0.6928
571.0876 0.5231
577.4526 0.5116
595.6453 0.4937
603.1207 0.6027
617.2273 0.4139
649.7986 0.4102
660.2393 0.4646
664.6890 0.4504
686.5050 0.5114
695.9721 0.4376
704.7268 0.4859
717.0012 0.5936
717.6587 0.2040
721.5094 0.4098
741.6559 0.5011
751.2128 0.4855
764.0523 0.3533
773.7898 0.2782
788.5069 0.4341
794.0205 0.3568
796.0968 0.2778
802.6607 0.1947
815.8468 0.2350
829.2498 0.5141
835.2710 0.2647
840.4077 0.5392
857.5600 0.2707
861.5381 0.4686
875.9252 0.5448
890.7419 0.4038
898.5180 0.2370
902.4463 0.3555
910.7699 0.4838
924.0084 0.4236
943.0178 0.4546
947.6951 0.1419
959.6878 0.3704
963.3054 0.3546
966.0555 0.4636
970.9861 0.3442
978.6066 0.4787
983.5941 0.3217
990.4036 0.3887
998.3483 0.4201
1001.0610 0.3821
1006.6989 0.5137
1011.5479 0.3750
1019.0386 0.4974
1024.6351 0.2462
1027.5653 0.4424
1035.0540 0.4679
1049.6465 0.4917
1052.4511 0.4745
1059.4301 0.4458
1072.8124 0.4134
1076.7618 0.5933
1083.9107 0.2575
1089.6609 0.3928
1097.7466 0.1731
1106.3061 0.2417
1112.6826 0.1598
1117.9685 0.4842
1128.9884 0.4532
1133.1583 0.3386
1135.2375 0.4723
1140.9357 0.2465
1146.6056 0.4416
1150.7117 0.3691
1155.8237 0.4753
1161.4209 0.3622
1168.5059 0.4902
1176.0496 0.4384
1179.5535 0.4341
1185.5360 0.3642
1194.9472 0.3396
1200.8530 0.4425
1201.3439 0.5129
1209.1703 0.3234
1215.4922 0.4550
1216.9464 0.3986
1228.5183 0.4301
1228.5183 0.3348
1240.4575 0.4045
1240.9327 0.4193
1247.5662 0.3577
1251.3410 0.4322
1261.1961 0.3846
1264.4640 0.2951
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 220208102030121730 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
making animated gifs
11 models are in 220208102030121730.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220208102030121730.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220208102030121730.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 220208102030121730 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
making animated gifs
11 models are in 220208102030121730.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220208102030121730.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220208102030121730.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 220208102030121730 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
making animated gifs
11 models are in 220208102030121730.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220208102030121730.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220208102030121730.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 220208102030121730 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
making animated gifs
11 models are in 220208102030121730.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220208102030121730.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220208102030121730.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 220208102030121730 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
220208102030121730.eigenfacs
220208102030121730.atom
making animated gifs
11 models are in 220208102030121730.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220208102030121730.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220208102030121730.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
220208102030121730.10.pdb
220208102030121730.11.pdb
220208102030121730.7.pdb
220208102030121730.8.pdb
220208102030121730.9.pdb
STDERR:
real 1m0.164s
user 0m59.784s
sys 0m0.332s
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
pstopnm: Writing ppmraw file
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.
|