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LOGs for ID: 220208102030121730

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 220208102030121730.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 220208102030121730.atom to be opened. Openam> File opened: 220208102030121730.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 850 First residue number = 1 Last residue number = 850 Number of atoms found = 13203 Mean number per residue = 15.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = -4.715288 +/- 16.604840 From: -39.241000 To: 39.100000 = 5.395861 +/- 15.617453 From: -38.590000 To: 38.578000 = 4.403352 +/- 21.795929 From: -49.520000 To: 50.090000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 21 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3659 % Filled. Pdbmat> 10714822 non-zero elements. Pdbmat> 1181931 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 179.04 +/- 48.12 Maximum number = 259 Minimum number = 35 Pdbmat> Matrix trace = 2.363862E+07 Pdbmat> Larger element = 909.130 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 850 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 220208102030121730.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 220208102030121730.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 220208102030121730.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 13203 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 850 residues. Blocpdb> 81 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 79 atoms in block 2 Block first atom: 82 Blocpdb> 60 atoms in block 3 Block first atom: 161 Blocpdb> 80 atoms in block 4 Block first atom: 221 Blocpdb> 81 atoms in block 5 Block first atom: 301 Blocpdb> 95 atoms in block 6 Block first atom: 382 Blocpdb> 95 atoms in block 7 Block first atom: 477 Blocpdb> 77 atoms in block 8 Block first atom: 572 Blocpdb> 80 atoms in block 9 Block first atom: 649 Blocpdb> 93 atoms in block 10 Block first atom: 729 Blocpdb> 83 atoms in block 11 Block first atom: 822 Blocpdb> 91 atoms in block 12 Block first atom: 905 Blocpdb> 87 atoms in block 13 Block first atom: 996 Blocpdb> 89 atoms in block 14 Block first atom: 1083 Blocpdb> 67 atoms in block 15 Block first atom: 1172 Blocpdb> 88 atoms in block 16 Block first atom: 1239 Blocpdb> 63 atoms in block 17 Block first atom: 1327 Blocpdb> 83 atoms in block 18 Block first atom: 1390 Blocpdb> 70 atoms in block 19 Block first atom: 1473 Blocpdb> 91 atoms in block 20 Block first atom: 1543 Blocpdb> 85 atoms in block 21 Block first atom: 1634 Blocpdb> 75 atoms in block 22 Block first atom: 1719 Blocpdb> 98 atoms in block 23 Block first atom: 1794 Blocpdb> 74 atoms in block 24 Block first atom: 1892 Blocpdb> 80 atoms in block 25 Block first atom: 1966 Blocpdb> 71 atoms in block 26 Block first atom: 2046 Blocpdb> 82 atoms in block 27 Block first atom: 2117 Blocpdb> 77 atoms in block 28 Block first atom: 2199 Blocpdb> 77 atoms in block 29 Block first atom: 2276 Blocpdb> 71 atoms in block 30 Block first atom: 2353 Blocpdb> 83 atoms in block 31 Block first atom: 2424 Blocpdb> 70 atoms in block 32 Block first atom: 2507 Blocpdb> 100 atoms in block 33 Block first atom: 2577 Blocpdb> 73 atoms in block 34 Block first atom: 2677 Blocpdb> 77 atoms in block 35 Block first atom: 2750 Blocpdb> 83 atoms in block 36 Block first atom: 2827 Blocpdb> 76 atoms in block 37 Block first atom: 2910 Blocpdb> 82 atoms in block 38 Block first atom: 2986 Blocpdb> 71 atoms in block 39 Block first atom: 3068 Blocpdb> 65 atoms in block 40 Block first atom: 3139 Blocpdb> 74 atoms in block 41 Block first atom: 3204 Blocpdb> 93 atoms in block 42 Block first atom: 3278 Blocpdb> 87 atoms in block 43 Block first atom: 3371 Blocpdb> 81 atoms in block 44 Block first atom: 3458 Blocpdb> 62 atoms in block 45 Block first atom: 3539 Blocpdb> 67 atoms in block 46 Block first atom: 3601 Blocpdb> 81 atoms in block 47 Block first atom: 3668 Blocpdb> 70 atoms in block 48 Block first atom: 3749 Blocpdb> 77 atoms in block 49 Block first atom: 3819 Blocpdb> 69 atoms in block 50 Block first atom: 3896 Blocpdb> 83 atoms in block 51 Block first atom: 3965 Blocpdb> 79 atoms in block 52 Block first atom: 4048 Blocpdb> 68 atoms in block 53 Block first atom: 4127 Blocpdb> 78 atoms in block 54 Block first atom: 4195 Blocpdb> 79 atoms in block 55 Block first atom: 4273 Blocpdb> 75 atoms in block 56 Block first atom: 4352 Blocpdb> 81 atoms in block 57 Block first atom: 4427 Blocpdb> 69 atoms in block 58 Block first atom: 4508 Blocpdb> 81 atoms in block 59 Block first atom: 4577 Blocpdb> 92 atoms in block 60 Block first atom: 4658 Blocpdb> 80 atoms in block 61 Block first atom: 4750 Blocpdb> 86 atoms in block 62 Block first atom: 4830 Blocpdb> 73 atoms in block 63 Block first atom: 4916 Blocpdb> 80 atoms in block 64 Block first atom: 4989 Blocpdb> 84 atoms in block 65 Block first atom: 5069 Blocpdb> 62 atoms in block 66 Block first atom: 5153 Blocpdb> 65 atoms in block 67 Block first atom: 5215 Blocpdb> 77 atoms in block 68 Block first atom: 5280 Blocpdb> 82 atoms in block 69 Block first atom: 5357 Blocpdb> 73 atoms in block 70 Block first atom: 5439 Blocpdb> 93 atoms in block 71 Block first atom: 5512 Blocpdb> 85 atoms in block 72 Block first atom: 5605 Blocpdb> 74 atoms in block 73 Block first atom: 5690 Blocpdb> 73 atoms in block 74 Block first atom: 5764 Blocpdb> 88 atoms in block 75 Block first atom: 5837 Blocpdb> 86 atoms in block 76 Block first atom: 5925 Blocpdb> 88 atoms in block 77 Block first atom: 6011 Blocpdb> 80 atoms in block 78 Block first atom: 6099 Blocpdb> 95 atoms in block 79 Block first atom: 6179 Blocpdb> 68 atoms in block 80 Block first atom: 6274 Blocpdb> 88 atoms in block 81 Block first atom: 6342 Blocpdb> 72 atoms in block 82 Block first atom: 6430 Blocpdb> 91 atoms in block 83 Block first atom: 6502 Blocpdb> 77 atoms in block 84 Block first atom: 6593 Blocpdb> 62 atoms in block 85 Block first atom: 6670 Blocpdb> 87 atoms in block 86 Block first atom: 6732 Blocpdb> 83 atoms in block 87 Block first atom: 6819 Blocpdb> 77 atoms in block 88 Block first atom: 6902 Blocpdb> 94 atoms in block 89 Block first atom: 6979 Blocpdb> 77 atoms in block 90 Block first atom: 7073 Blocpdb> 75 atoms in block 91 Block first atom: 7150 Blocpdb> 71 atoms in block 92 Block first atom: 7225 Blocpdb> 78 atoms in block 93 Block first atom: 7296 Blocpdb> 86 atoms in block 94 Block first atom: 7374 Blocpdb> 65 atoms in block 95 Block first atom: 7460 Blocpdb> 72 atoms in block 96 Block first atom: 7525 Blocpdb> 76 atoms in block 97 Block first atom: 7597 Blocpdb> 72 atoms in block 98 Block first atom: 7673 Blocpdb> 73 atoms in block 99 Block first atom: 7745 Blocpdb> 72 atoms in block 100 Block first atom: 7818 Blocpdb> 86 atoms in block 101 Block first atom: 7890 Blocpdb> 84 atoms in block 102 Block first atom: 7976 Blocpdb> 58 atoms in block 103 Block first atom: 8060 Blocpdb> 80 atoms in block 104 Block first atom: 8118 Blocpdb> 97 atoms in block 105 Block first atom: 8198 Blocpdb> 73 atoms in block 106 Block first atom: 8295 Blocpdb> 79 atoms in block 107 Block first atom: 8368 Blocpdb> 72 atoms in block 108 Block first atom: 8447 Blocpdb> 62 atoms in block 109 Block first atom: 8519 Blocpdb> 85 atoms in block 110 Block first atom: 8581 Blocpdb> 84 atoms in block 111 Block first atom: 8666 Blocpdb> 66 atoms in block 112 Block first atom: 8750 Blocpdb> 79 atoms in block 113 Block first atom: 8816 Blocpdb> 72 atoms in block 114 Block first atom: 8895 Blocpdb> 70 atoms in block 115 Block first atom: 8967 Blocpdb> 77 atoms in block 116 Block first atom: 9037 Blocpdb> 59 atoms in block 117 Block first atom: 9114 Blocpdb> 78 atoms in block 118 Block first atom: 9173 Blocpdb> 59 atoms in block 119 Block first atom: 9251 Blocpdb> 66 atoms in block 120 Block first atom: 9310 Blocpdb> 75 atoms in block 121 Block first atom: 9376 Blocpdb> 62 atoms in block 122 Block first atom: 9451 Blocpdb> 92 atoms in block 123 Block first atom: 9513 Blocpdb> 72 atoms in block 124 Block first atom: 9605 Blocpdb> 71 atoms in block 125 Block first atom: 9677 Blocpdb> 95 atoms in block 126 Block first atom: 9748 Blocpdb> 79 atoms in block 127 Block first atom: 9843 Blocpdb> 74 atoms in block 128 Block first atom: 9922 Blocpdb> 91 atoms in block 129 Block first atom: 9996 Blocpdb> 69 atoms in block 130 Block first atom: 10087 Blocpdb> 73 atoms in block 131 Block first atom: 10156 Blocpdb> 73 atoms in block 132 Block first atom: 10229 Blocpdb> 69 atoms in block 133 Block first atom: 10302 Blocpdb> 75 atoms in block 134 Block first atom: 10371 Blocpdb> 72 atoms in block 135 Block first atom: 10446 Blocpdb> 83 atoms in block 136 Block first atom: 10518 Blocpdb> 78 atoms in block 137 Block first atom: 10601 Blocpdb> 78 atoms in block 138 Block first atom: 10679 Blocpdb> 67 atoms in block 139 Block first atom: 10757 Blocpdb> 89 atoms in block 140 Block first atom: 10824 Blocpdb> 79 atoms in block 141 Block first atom: 10913 Blocpdb> 81 atoms in block 142 Block first atom: 10992 Blocpdb> 76 atoms in block 143 Block first atom: 11073 Blocpdb> 77 atoms in block 144 Block first atom: 11149 Blocpdb> 85 atoms in block 145 Block first atom: 11226 Blocpdb> 70 atoms in block 146 Block first atom: 11311 Blocpdb> 95 atoms in block 147 Block first atom: 11381 Blocpdb> 61 atoms in block 148 Block first atom: 11476 Blocpdb> 76 atoms in block 149 Block first atom: 11537 Blocpdb> 84 atoms in block 150 Block first atom: 11613 Blocpdb> 68 atoms in block 151 Block first atom: 11697 Blocpdb> 69 atoms in block 152 Block first atom: 11765 Blocpdb> 77 atoms in block 153 Block first atom: 11834 Blocpdb> 71 atoms in block 154 Block first atom: 11911 Blocpdb> 83 atoms in block 155 Block first atom: 11982 Blocpdb> 89 atoms in block 156 Block first atom: 12065 Blocpdb> 92 atoms in block 157 Block first atom: 12154 Blocpdb> 62 atoms in block 158 Block first atom: 12246 Blocpdb> 70 atoms in block 159 Block first atom: 12308 Blocpdb> 104 atoms in block 160 Block first atom: 12378 Blocpdb> 84 atoms in block 161 Block first atom: 12482 Blocpdb> 68 atoms in block 162 Block first atom: 12566 Blocpdb> 67 atoms in block 163 Block first atom: 12634 Blocpdb> 85 atoms in block 164 Block first atom: 12701 Blocpdb> 67 atoms in block 165 Block first atom: 12786 Blocpdb> 85 atoms in block 166 Block first atom: 12853 Blocpdb> 67 atoms in block 167 Block first atom: 12938 Blocpdb> 86 atoms in block 168 Block first atom: 13005 Blocpdb> 108 atoms in block 169 Block first atom: 13091 Blocpdb> 5 atoms in block 170 Block first atom: 13198 Blocpdb> 170 blocks. Blocpdb> At most, 108 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 5 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 10714992 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 39609 Prepmat> Matrix trace = 23638620.0000 Prepmat> Last element read: 39609 39609 590.4296 Prepmat> 14536 lines saved. Prepmat> 12597 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 13203 RTB> Total mass = 13203.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 13203 RTB> Number of blocks = 170 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 450886.2301 RTB> 67218 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1020 Diagstd> Nb of non-zero elements: 67218 Diagstd> Projected matrix trace = 450886.2301 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1020 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 450886.2301 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0657212 1.3715343 2.2088613 5.2694080 7.3507564 9.6901195 12.2324785 12.7977003 15.3134816 21.1345204 22.1174085 24.4278943 27.6552495 28.2812934 30.0864811 30.8470471 32.3123479 35.8114756 36.9723847 37.4710683 39.9651666 41.0751695 42.1207751 43.5950592 43.6752440 44.1518858 46.6539239 47.8550522 49.5121082 50.7817495 52.7306836 53.4659959 53.7479955 54.6438779 56.4546051 58.3186332 59.1743187 59.8976355 62.3689057 62.9549701 65.0685050 67.2854871 68.4653852 69.0738808 70.3468873 72.4140980 75.4174028 76.1727761 78.1054000 78.6975562 79.1517918 79.9597302 81.2173877 82.0522842 83.1876265 84.5296798 84.9868405 85.9531930 86.7786311 88.0688523 89.0443522 89.5507732 90.8647493 93.4438826 93.9388405 95.1850105 97.6088948 98.3293725 99.6398018 100.7345867 102.2157090 103.7672549 104.9651633 106.0340861 108.0527307 108.8572004 109.3151727 110.3999657 111.5435301 112.2670640 113.3326182 114.4050512 115.8096685 117.2743516 117.9603352 119.2298944 121.1390178 122.2869503 122.4460893 124.0315024 125.3394145 125.5995652 127.9678333 128.0061639 130.5060122 130.6431740 131.9726333 132.8284349 134.9191079 135.5727120 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034322 0.0034340 0.0034342 0.0034351 0.0034353 0.0034354 112.1029593 127.1740857 161.3910703 249.2735465 294.4159235 338.0335814 379.7978581 388.4733651 424.9445370 499.2194280 510.6959339 536.7082816 571.0630639 577.4905930 595.6360548 603.1177060 617.2762085 649.8399221 660.2889235 664.7269972 686.4929700 695.9610943 704.7635871 716.9913495 717.6504315 721.5557786 741.7189394 751.2062237 764.1013899 773.8363206 788.5459057 794.0248798 796.1161175 802.7236089 815.9150933 829.2757174 835.3373753 840.4272384 857.5892773 861.6091278 875.9527785 890.7503067 898.5263303 902.5103866 910.7888872 924.0741959 943.0420678 947.7530096 959.7006979 963.3318149 966.1079495 971.0261827 978.6328474 983.6500495 990.4319622 998.3892412 1001.0853881 1006.7607779 1011.5833621 1019.0757064 1024.7040899 1027.6138529 1035.1254742 1049.7133435 1052.4897572 1059.4477948 1072.8524024 1076.8046295 1083.9561350 1089.8948106 1097.8780517 1106.1790887 1112.5457349 1118.1962440 1128.7900010 1132.9842190 1135.3650022 1140.9845126 1146.8786622 1150.5922985 1156.0396802 1161.4964322 1168.6048636 1175.9715103 1179.4058547 1185.7356024 1195.1909727 1200.8405297 1201.6216371 1209.3758237 1215.7355354 1216.9965535 1228.4166341 1228.6005960 1240.5393367 1241.1910686 1247.4904264 1251.5286846 1261.3395422 1264.3910767 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 13203 Rtb_to_modes> Number of blocs = 170 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9898E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.066 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.372 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.209 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.269 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.351 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.690 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.6 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1020 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00004 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 0.99999 1.00002 1.00004 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 237654 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00004 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99998 0.99996 0.99999 1.00002 1.00004 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00003 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220208102030121730.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220208102030121730.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 220208102030121730.atom Openam> file on opening on unit 11: 220208102030121730.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 850 First residue number = 1 Last residue number = 850 Number of atoms found = 13203 Mean number per residue = 15.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9898E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.066 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.372 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.209 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.269 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.351 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.690 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.6 Bfactors> 106 vectors, 39609 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.066000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.005 +/- 0.00 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.005 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220208102030121730.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220208102030121730.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 861.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001. 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Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9547 0.0034 0.7512 0.0034 0.7384 0.0034 0.7377 0.0034 0.9973 0.0034 0.9554 112.1128 0.5068 127.1902 0.5847 161.3892 0.3004 249.2532 0.6325 294.4082 0.6618 338.0170 0.5801 379.7431 0.5248 388.4916 0.7117 424.8780 0.6248 499.1446 0.2403 510.7039 0.5336 536.7084 0.6928 571.0876 0.5231 577.4526 0.5116 595.6453 0.4937 603.1207 0.6027 617.2273 0.4139 649.7986 0.4102 660.2393 0.4646 664.6890 0.4504 686.5050 0.5114 695.9721 0.4376 704.7268 0.4859 717.0012 0.5936 717.6587 0.2040 721.5094 0.4098 741.6559 0.5011 751.2128 0.4855 764.0523 0.3533 773.7898 0.2782 788.5069 0.4341 794.0205 0.3568 796.0968 0.2778 802.6607 0.1947 815.8468 0.2350 829.2498 0.5141 835.2710 0.2647 840.4077 0.5392 857.5600 0.2707 861.5381 0.4686 875.9252 0.5448 890.7419 0.4038 898.5180 0.2370 902.4463 0.3555 910.7699 0.4838 924.0084 0.4236 943.0178 0.4546 947.6951 0.1419 959.6878 0.3704 963.3054 0.3546 966.0555 0.4636 970.9861 0.3442 978.6066 0.4787 983.5941 0.3217 990.4036 0.3887 998.3483 0.4201 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a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom making animated gifs 11 models are in 220208102030121730.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220208102030121730.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220208102030121730.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 220208102030121730 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=60 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plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 220208102030121730 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom 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300x300 11 models are in 220208102030121730.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 220208102030121730 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220208102030121730.eigenfacs 220208102030121730.atom calculating perturbed structure for DQ=0 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will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220208102030121730.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 220208102030121730.10.pdb 220208102030121730.11.pdb 220208102030121730.7.pdb 220208102030121730.8.pdb 220208102030121730.9.pdb STDERR: real 1m0.164s user 0m59.784s sys 0m0.332s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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