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please let us know.

* 01-JUL-21 *

LOGs for ID: 220201125949101310

output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 220201125949101310.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 220201125949101310.atom to be opened.

 Openam> File opened: 220201125949101310.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    201
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    201
            Number of atoms found    =   1522
            Mean number per residue  =      7.6

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =   -15.650982 +/-    23.925322 From:   -75.269000 To:    14.629000
 =    -2.318920 +/-    14.098161 From:   -52.505000 To:    20.629000
 =     9.788584 +/-    29.663874 From:   -53.400000 To:    66.770000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   4.2129 % Filled.
 Pdbmat>       439255  non-zero elements.
 Pdbmat>        47797 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     62.81 +/-     24.89
         Maximum number =    127
         Minimum number =      8

 Pdbmat> Matrix trace   =  955940.    
 Pdbmat> Larger element =  471.431    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
201 non-zero elements, NRBL set to 2
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 220201125949101310.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          2
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 220201125949101310.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 220201125949101310.atom                                                                                                         

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  1522 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     2 residue(s) per block.
 Blocpdb>   201 residues.
 Blocpdb>    13 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    22 atoms in block      2
 Block first atom:     14
 Blocpdb>    16 atoms in block      3
 Block first atom:     36
 Blocpdb>    16 atoms in block      4
 Block first atom:     52
 Blocpdb>    16 atoms in block      5
 Block first atom:     68
 Blocpdb>    15 atoms in block      6
 Block first atom:     84
 Blocpdb>    17 atoms in block      7
 Block first atom:     99
 Blocpdb>    10 atoms in block      8
 Block first atom:    116
 Blocpdb>    11 atoms in block      9
 Block first atom:    126
 Blocpdb>    22 atoms in block     10
 Block first atom:    137
 Blocpdb>    13 atoms in block     11
 Block first atom:    159
 Blocpdb>    16 atoms in block     12
 Block first atom:    172
 Blocpdb>    16 atoms in block     13
 Block first atom:    188
 Blocpdb>    19 atoms in block     14
 Block first atom:    204
 Blocpdb>    15 atoms in block     15
 Block first atom:    223
 Blocpdb>    13 atoms in block     16
 Block first atom:    238
 Blocpdb>    12 atoms in block     17
 Block first atom:    251
 Blocpdb>    16 atoms in block     18
 Block first atom:    263
 Blocpdb>    15 atoms in block     19
 Block first atom:    279
 Blocpdb>    12 atoms in block     20
 Block first atom:    294
 Blocpdb>    19 atoms in block     21
 Block first atom:    306
 Blocpdb>    11 atoms in block     22
 Block first atom:    325
 Blocpdb>    13 atoms in block     23
 Block first atom:    336
 Blocpdb>    19 atoms in block     24
 Block first atom:    349
 Blocpdb>    13 atoms in block     25
 Block first atom:    368
 Blocpdb>    10 atoms in block     26
 Block first atom:    381
 Blocpdb>    14 atoms in block     27
 Block first atom:    391
 Blocpdb>    25 atoms in block     28
 Block first atom:    405
 Blocpdb>    19 atoms in block     29
 Block first atom:    430
 Blocpdb>    16 atoms in block     30
 Block first atom:    449
 Blocpdb>    14 atoms in block     31
 Block first atom:    465
 Blocpdb>    13 atoms in block     32
 Block first atom:    479
 Blocpdb>    16 atoms in block     33
 Block first atom:    492
 Blocpdb>    19 atoms in block     34
 Block first atom:    508
 Blocpdb>    11 atoms in block     35
 Block first atom:    527
 Blocpdb>    16 atoms in block     36
 Block first atom:    538
 Blocpdb>    22 atoms in block     37
 Block first atom:    554
 Blocpdb>    15 atoms in block     38
 Block first atom:    576
 Blocpdb>    13 atoms in block     39
 Block first atom:    591
 Blocpdb>    15 atoms in block     40
 Block first atom:    604
 Blocpdb>    11 atoms in block     41
 Block first atom:    619
 Blocpdb>    17 atoms in block     42
 Block first atom:    630
 Blocpdb>    19 atoms in block     43
 Block first atom:    647
 Blocpdb>    18 atoms in block     44
 Block first atom:    666
 Blocpdb>    19 atoms in block     45
 Block first atom:    684
 Blocpdb>    14 atoms in block     46
 Block first atom:    703
 Blocpdb>    18 atoms in block     47
 Block first atom:    717
 Blocpdb>    19 atoms in block     48
 Block first atom:    735
 Blocpdb>    15 atoms in block     49
 Block first atom:    754
 Blocpdb>    15 atoms in block     50
 Block first atom:    769
 Blocpdb>    18 atoms in block     51
 Block first atom:    784
 Blocpdb>    11 atoms in block     52
 Block first atom:    802
 Blocpdb>    20 atoms in block     53
 Block first atom:    813
 Blocpdb>    13 atoms in block     54
 Block first atom:    833
 Blocpdb>    18 atoms in block     55
 Block first atom:    846
 Blocpdb>    16 atoms in block     56
 Block first atom:    864
 Blocpdb>    12 atoms in block     57
 Block first atom:    880
 Blocpdb>    12 atoms in block     58
 Block first atom:    892
 Blocpdb>    11 atoms in block     59
 Block first atom:    904
 Blocpdb>    11 atoms in block     60
 Block first atom:    915
 Blocpdb>    12 atoms in block     61
 Block first atom:    926
 Blocpdb>    18 atoms in block     62
 Block first atom:    938
 Blocpdb>    15 atoms in block     63
 Block first atom:    956
 Blocpdb>    16 atoms in block     64
 Block first atom:    971
 Blocpdb>    18 atoms in block     65
 Block first atom:    987
 Blocpdb>    17 atoms in block     66
 Block first atom:   1005
 Blocpdb>    17 atoms in block     67
 Block first atom:   1022
 Blocpdb>     9 atoms in block     68
 Block first atom:   1039
 Blocpdb>    11 atoms in block     69
 Block first atom:   1048
 Blocpdb>    15 atoms in block     70
 Block first atom:   1059
 Blocpdb>    16 atoms in block     71
 Block first atom:   1074
 Blocpdb>    16 atoms in block     72
 Block first atom:   1090
 Blocpdb>    15 atoms in block     73
 Block first atom:   1106
 Blocpdb>    17 atoms in block     74
 Block first atom:   1121
 Blocpdb>    13 atoms in block     75
 Block first atom:   1138
 Blocpdb>    19 atoms in block     76
 Block first atom:   1151
 Blocpdb>    13 atoms in block     77
 Block first atom:   1170
 Blocpdb>    12 atoms in block     78
 Block first atom:   1183
 Blocpdb>    10 atoms in block     79
 Block first atom:   1195
 Blocpdb>    14 atoms in block     80
 Block first atom:   1205
 Blocpdb>    24 atoms in block     81
 Block first atom:   1219
 Blocpdb>    13 atoms in block     82
 Block first atom:   1243
 Blocpdb>    15 atoms in block     83
 Block first atom:   1256
 Blocpdb>    15 atoms in block     84
 Block first atom:   1271
 Blocpdb>    23 atoms in block     85
 Block first atom:   1286
 Blocpdb>    11 atoms in block     86
 Block first atom:   1309
 Blocpdb>    22 atoms in block     87
 Block first atom:   1320
 Blocpdb>    17 atoms in block     88
 Block first atom:   1342
 Blocpdb>    12 atoms in block     89
 Block first atom:   1359
 Blocpdb>    14 atoms in block     90
 Block first atom:   1371
 Blocpdb>    12 atoms in block     91
 Block first atom:   1385
 Blocpdb>    15 atoms in block     92
 Block first atom:   1397
 Blocpdb>    14 atoms in block     93
 Block first atom:   1412
 Blocpdb>    13 atoms in block     94
 Block first atom:   1426
 Blocpdb>    10 atoms in block     95
 Block first atom:   1439
 Blocpdb>    11 atoms in block     96
 Block first atom:   1449
 Blocpdb>    18 atoms in block     97
 Block first atom:   1460
 Blocpdb>    15 atoms in block     98
 Block first atom:   1478
 Blocpdb>    14 atoms in block     99
 Block first atom:   1493
 Blocpdb>    11 atoms in block    100
 Block first atom:   1507
 Blocpdb>     5 atoms in block    101
 Block first atom:   1517

 Blocpdb>   101 blocks.

 Blocpdb> At most,     25 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     5 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>       439356 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =       4566

 Prepmat> Matrix trace    =     955940.0000
 Prepmat> Last element read:    4566   4566         5.2178
 Prepmat>         5152 lines saved.
 Prepmat>         4442 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  1522
 RTB> Total mass =        1522.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  1522
 RTB> Number of blocks =   101
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =   98564.0966
 RTB>     24009 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      606
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    24009
 Diagstd> Projected matrix trace =   98564.0966

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    606 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues =  98564.0966
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.0003851      0.0006343      0.0027295      0.0054529
      0.0092593      0.0123652      0.0129874      0.0247290      0.0354999
      0.0457622      0.0663988      0.0731963      0.1088691      0.1216180
      0.1905819      0.2746013      0.2990985      0.4556907      0.5678247
      0.6339274      0.7113877      0.7491320      0.8851358      0.9933285
      1.1168554      1.3479883      1.4109471      1.5179553      1.5886173
      1.9136100      2.0882434      2.6547501      2.9088120      3.1428146
      3.1885733      3.2317867      4.1290739      4.4561381      4.6520463
      5.1401233      5.2492425      5.6053536      5.7036391      5.8762068
      6.2458552      6.7443652      7.2058543      7.4624004      7.5715353
      7.7101170      8.1348325      8.7691309      9.0771455      9.4383084
     10.0423962     10.4168416     10.6958587     11.1545539     11.3437448
     12.1541612     12.3232052     13.0239998     13.2646742     14.2419855
     15.4615854     15.9751954     16.0765669     16.6925655     17.2096865
     18.0638625     18.3525500     18.6852381     19.1692979     20.1025063
     20.8928279     21.2397339     21.9030350     22.4228378     23.2172764
     23.3612036     23.5459062     24.6796378     25.5154584     26.0866489
     26.5244473     27.8963101     28.2740692     28.8390510     29.1557346
     30.0010207     30.1460786     31.1626555     31.8568156     32.1821802
     32.8456347     34.0883549     34.6235356     35.1644009     35.4462010
     37.4529280

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034330      0.0034333      0.0034335      0.0034338      0.0034338
      0.0034339      2.1309045      2.7348394      5.6733517      8.0187806
     10.4492108     12.0752293     12.3752952     17.0765039     20.4601441
     23.2299646     27.9817751     29.3791997     35.8300652     37.8699039
     47.4063073     56.9044986     59.3885076     73.3044575     81.8280884
     86.4599621     91.5900846     93.9884441    102.1645512    108.2285241
    114.7608498    126.0777173    128.9883950    133.7903451    136.8689444
    150.2180068    156.9227244    176.9322910    185.2051693    192.5106054
    193.9069978    195.2165454    220.6589806    229.2316599    234.2163956
    246.1965983    248.7961175    257.0968693    259.3410702    263.2351119
    271.3883730    282.0108509    291.4996365    296.6433069    298.8045848
    301.5266932    309.7202396    321.5685418    327.1673296    333.6125357
    344.1232032    350.4800561    355.1428776    362.6781423    365.7408795
    378.5800961    381.2037108    391.8929674    395.4973468    409.8081114
    426.9945104    434.0286223    435.4035210    443.6666910    450.4864788
    461.5306943    465.2040509    469.4016361    475.4429184    486.8782607
    496.3567057    500.4605118    508.2149407    514.2100586    523.2399751
    524.8592887    526.9300727    539.4667364    548.5256844    554.6313659
    559.2660443    573.5465365    577.4168309    583.1573623    586.3504658
    594.7895029    596.2257021    606.1952226    612.9096524    616.0316297
    622.3491624    634.0132027    638.9707637    643.9422068    646.5172667
    664.5660757

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   1522
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    101

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9945E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9960E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9972E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9991E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9993E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9997E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  3.8507E-04

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  6.3427E-04

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  2.7295E-03

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  5.4529E-03

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.2593E-03

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.2365E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.2987E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  2.4729E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  3.5500E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  4.5762E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  6.6399E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  7.3196E-02

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1089    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1216    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.1906    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2746    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.2991    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.4557    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.5678    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.6339    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.7114    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.7491    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.8851    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.9933    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.117    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.348    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.411    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.518    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.589    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   1.914    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.088    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.655    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.909    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.143    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.189    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.232    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.129    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.456    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   4.652    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.140    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.249    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.605    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.704    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.876    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.246    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.744    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.206    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.462    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.572    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.710    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.135    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.769    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.077    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.438    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.04    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   10.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.34    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.32    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.26    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.46    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.98    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.08    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.17    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.10    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.89    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.55    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.68    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.52    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   27.90    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.27    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.00    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.15    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.18    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.85    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.62    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.45    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    606 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999
 1.00000 1.00002 0.99998 0.99997 0.99996
 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998
 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 1.00002
 1.00004 1.00003 0.99999 0.99997 0.99997
 1.00002 0.99994 0.99998 0.99996 0.99999
 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 0.99996
 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
 0.99994 0.99999 1.00003 0.99997 1.00000
 0.99998 1.00000 1.00003 1.00000 0.99997
 1.00004 0.99998 0.99995 0.99997 1.00000
 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99996 1.00003 1.00000 1.00005
 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999
 1.00000 1.00004 0.99999 0.99998 0.99998
 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999 1.00003
 1.00002 0.99996 0.99999 1.00004 1.00005
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000
 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003
 0.99995

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    27396 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00003 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999
 1.00000 1.00002 0.99998 0.99997 0.99996
 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99998
 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 1.00002
 1.00004 1.00003 0.99999 0.99997 0.99997
 1.00002 0.99994 0.99998 0.99996 0.99999
 0.99998 0.99998 1.00000 1.00001 0.99996
 1.00002 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001
 0.99994 0.99999 1.00003 0.99997 1.00000
 0.99998 1.00000 1.00003 1.00000 0.99997
 1.00004 0.99998 0.99995 0.99997 1.00000
 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000
 1.00002 0.99996 1.00003 1.00000 1.00005
 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999
 1.00000 1.00004 0.99999 0.99998 0.99998
 0.99998 1.00003 1.00001 0.99999 1.00003
 1.00002 0.99996 0.99999 1.00004 1.00005
 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000
 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001
 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003
 0.99995

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4:-0.000-0.000-0.000
 Vector   5: 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
 Vector   9:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector  10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 220201125949101310.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 220201125949101310.eigenfacs                                    
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 220201125949101310.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 220201125949101310.atom                                         
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    201
            First residue number     =      1
            Last  residue number     =    201
            Number of atoms found    =   1522
            Mean number per residue  =      7.6

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9945E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9960E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9972E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9991E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9993E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9997E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  3.8507E-04

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  6.3427E-04

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  2.7295E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  5.4529E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.2593E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.2365E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.2987E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  2.4729E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  3.5500E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  4.5762E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  6.6399E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  7.3196E-02

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1089    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1216    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.1906    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2746    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.2991    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.4557    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.5678    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.6339    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.7114    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.7491    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.8851    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.9933    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.117    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.348    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.411    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.518    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.589    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   1.914    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.088    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.655    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.909    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.143    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.189    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.232    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.129    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.456    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   4.652    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.140    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.249    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.605    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.704    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.876    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.246    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.744    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.206    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.462    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.572    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.710    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.135    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.769    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.077    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.438    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.04    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   10.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.34    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.32    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.26    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.17    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.10    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.89    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.55    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.68    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.52    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   27.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.27    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.00    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.15    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.18    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.85    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.62    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.45    

 Bfactors>  106 vectors,   4566 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.000385
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=     -0.401 for    201 C-alpha atoms.
 Bfactors> =     56.721 +/- 144.66
 Bfactors> =     83.485 +/-  17.05
 Bfactors> Shiftng-fct=     26.763
 Bfactors> Scaling-fct=      0.118

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 220201125949101310.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 220201125949101310.eigenfacs                                    

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4329E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4331E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4333E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4337E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4338E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   2.131    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   2.735    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   5.673    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   8.018    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   10.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   12.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   12.37    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   17.08    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   20.46    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   23.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   27.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   29.38    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   35.83    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   37.87    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   47.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   56.90    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   59.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   73.30    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   81.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   86.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   91.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   93.98    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   102.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   108.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   114.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   126.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   129.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   133.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   136.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   150.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   156.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   176.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   185.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   192.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   193.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   195.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   220.6    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   229.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   234.2    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   523.2    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   527.0    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   638.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   643.9    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   646.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   664.5    

 Chkmod>  106 vectors,   4566 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   1522 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector    21 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    27 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    52 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    65 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    68 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    87 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector    90 is:   1.0001 (instead of 1.0000). 
%Chkmod-Wn> Norm of vector   106 is:   0.9999 (instead of 1.0000). 

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.7896
      0.0034      0.8357
      0.0034      0.4497
      0.0034      0.9831
      0.0034      0.7943
      0.0034      0.9337
      2.1308      0.1239
      2.7347      0.3989
      5.6731      0.4307
      8.0184      0.5281
     10.4488      0.2967
     12.0746      0.4239
     12.3746      0.4677
     17.0758      0.3564
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    128.9853      0.5465
    133.7866      0.2571
    136.8796      0.0838
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    646.5242      0.1193
    664.5116      0.2315
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 220201125949101310 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
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calculating perturbed structure for DQ=-80
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calculating perturbed structure for DQ=-60
220201125949101310.eigenfacs
220201125949101310.atom
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220201125949101310.eigenfacs
220201125949101310.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
220201125949101310.eigenfacs
220201125949101310.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
220201125949101310.eigenfacs
220201125949101310.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
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220201125949101310.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
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calculating perturbed structure for DQ=60
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making animated gifs
11 models are in 220201125949101310.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220201125949101310.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220201125949101310.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 220201125949101310 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
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calculating perturbed structure for DQ=40
220201125949101310.eigenfacs
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11 models are in 220201125949101310.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 220201125949101310.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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getting mode 11
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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It was developed by Karsten Suhre.
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*** 01-JUL-21 ***

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