*** TRANSFERASE 31-MAR-09 2WEL ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22013106484481261.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22013106484481261.atom to be opened.
Openam> File opened: 22013106484481261.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 448
First residue number = -1
Last residue number = 147
Number of atoms found = 3580
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 44.333719 +/- 35.123978 From: -5.146000 To: 105.881000
= -17.411991 +/- 10.230772 From: -43.699000 To: 10.640000
= -28.234992 +/- 22.244559 From: -71.293000 To: 21.064000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.2170 % Filled.
Pdbmat> 1278743 non-zero elements.
Pdbmat> 139722 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 78.06 +/- 23.58
Maximum number = 131
Minimum number = 11
Pdbmat> Matrix trace = 2.794440E+06
Pdbmat> Larger element = 509.606
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
448 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22013106484481261.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22013106484481261.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22013106484481261.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 3580 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 449 residues.
Blocpdb> 14 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 24 atoms in block 2
Block first atom: 15
Blocpdb> 29 atoms in block 3
Block first atom: 39
Blocpdb> 29 atoms in block 4
Block first atom: 68
Blocpdb> 21 atoms in block 5
Block first atom: 97
Blocpdb> 20 atoms in block 6
Block first atom: 118
Blocpdb> 20 atoms in block 7
Block first atom: 138
Blocpdb> 28 atoms in block 8
Block first atom: 158
Blocpdb> 25 atoms in block 9
Block first atom: 186
Blocpdb> 18 atoms in block 10
Block first atom: 211
Blocpdb> 30 atoms in block 11
Block first atom: 229
Blocpdb> 19 atoms in block 12
Block first atom: 259
Blocpdb> 24 atoms in block 13
Block first atom: 278
Blocpdb> 25 atoms in block 14
Block first atom: 302
Blocpdb> 19 atoms in block 15
Block first atom: 327
Blocpdb> 33 atoms in block 16
Block first atom: 346
Blocpdb> 26 atoms in block 17
Block first atom: 379
Blocpdb> 29 atoms in block 18
Block first atom: 405
Blocpdb> 24 atoms in block 19
Block first atom: 434
Blocpdb> 25 atoms in block 20
Block first atom: 458
Blocpdb> 27 atoms in block 21
Block first atom: 483
Blocpdb> 23 atoms in block 22
Block first atom: 510
Blocpdb> 29 atoms in block 23
Block first atom: 533
Blocpdb> 24 atoms in block 24
Block first atom: 562
Blocpdb> 23 atoms in block 25
Block first atom: 586
Blocpdb> 24 atoms in block 26
Block first atom: 609
Blocpdb> 30 atoms in block 27
Block first atom: 633
Blocpdb> 26 atoms in block 28
Block first atom: 663
Blocpdb> 22 atoms in block 29
Block first atom: 689
Blocpdb> 17 atoms in block 30
Block first atom: 711
Blocpdb> 28 atoms in block 31
Block first atom: 728
Blocpdb> 23 atoms in block 32
Block first atom: 756
Blocpdb> 25 atoms in block 33
Block first atom: 779
Blocpdb> 30 atoms in block 34
Block first atom: 804
Blocpdb> 22 atoms in block 35
Block first atom: 834
Blocpdb> 23 atoms in block 36
Block first atom: 856
Blocpdb> 23 atoms in block 37
Block first atom: 879
Blocpdb> 25 atoms in block 38
Block first atom: 902
Blocpdb> 22 atoms in block 39
Block first atom: 927
Blocpdb> 24 atoms in block 40
Block first atom: 949
Blocpdb> 26 atoms in block 41
Block first atom: 973
Blocpdb> 19 atoms in block 42
Block first atom: 999
Blocpdb> 29 atoms in block 43
Block first atom: 1018
Blocpdb> 24 atoms in block 44
Block first atom: 1047
Blocpdb> 25 atoms in block 45
Block first atom: 1071
Blocpdb> 21 atoms in block 46
Block first atom: 1096
Blocpdb> 21 atoms in block 47
Block first atom: 1117
Blocpdb> 18 atoms in block 48
Block first atom: 1138
Blocpdb> 21 atoms in block 49
Block first atom: 1156
Blocpdb> 21 atoms in block 50
Block first atom: 1177
Blocpdb> 26 atoms in block 51
Block first atom: 1198
Blocpdb> 22 atoms in block 52
Block first atom: 1224
Blocpdb> 20 atoms in block 53
Block first atom: 1246
Blocpdb> 26 atoms in block 54
Block first atom: 1266
Blocpdb> 30 atoms in block 55
Block first atom: 1292
Blocpdb> 20 atoms in block 56
Block first atom: 1322
Blocpdb> 18 atoms in block 57
Block first atom: 1342
Blocpdb> 24 atoms in block 58
Block first atom: 1360
Blocpdb> 22 atoms in block 59
Block first atom: 1384
Blocpdb> 26 atoms in block 60
Block first atom: 1406
Blocpdb> 28 atoms in block 61
Block first atom: 1432
Blocpdb> 25 atoms in block 62
Block first atom: 1460
Blocpdb> 22 atoms in block 63
Block first atom: 1485
Blocpdb> 27 atoms in block 64
Block first atom: 1507
Blocpdb> 17 atoms in block 65
Block first atom: 1534
Blocpdb> 28 atoms in block 66
Block first atom: 1551
Blocpdb> 24 atoms in block 67
Block first atom: 1579
Blocpdb> 23 atoms in block 68
Block first atom: 1603
Blocpdb> 25 atoms in block 69
Block first atom: 1626
Blocpdb> 31 atoms in block 70
Block first atom: 1651
Blocpdb> 27 atoms in block 71
Block first atom: 1682
Blocpdb> 31 atoms in block 72
Block first atom: 1709
Blocpdb> 26 atoms in block 73
Block first atom: 1740
Blocpdb> 18 atoms in block 74
Block first atom: 1766
Blocpdb> 25 atoms in block 75
Block first atom: 1784
Blocpdb> 24 atoms in block 76
Block first atom: 1809
Blocpdb> 30 atoms in block 77
Block first atom: 1833
Blocpdb> 22 atoms in block 78
Block first atom: 1863
Blocpdb> 23 atoms in block 79
Block first atom: 1885
Blocpdb> 22 atoms in block 80
Block first atom: 1908
Blocpdb> 24 atoms in block 81
Block first atom: 1930
Blocpdb> 25 atoms in block 82
Block first atom: 1954
Blocpdb> 23 atoms in block 83
Block first atom: 1979
Blocpdb> 21 atoms in block 84
Block first atom: 2002
Blocpdb> 26 atoms in block 85
Block first atom: 2023
Blocpdb> 24 atoms in block 86
Block first atom: 2049
Blocpdb> 22 atoms in block 87
Block first atom: 2073
Blocpdb> 31 atoms in block 88
Block first atom: 2095
Blocpdb> 23 atoms in block 89
Block first atom: 2126
Blocpdb> 16 atoms in block 90
Block first atom: 2149
Blocpdb> 26 atoms in block 91
Block first atom: 2165
Blocpdb> 35 atoms in block 92
Block first atom: 2191
Blocpdb> 22 atoms in block 93
Block first atom: 2226
Blocpdb> 19 atoms in block 94
Block first atom: 2248
Blocpdb> 26 atoms in block 95
Block first atom: 2267
Blocpdb> 27 atoms in block 96
Block first atom: 2293
Blocpdb> 26 atoms in block 97
Block first atom: 2320
Blocpdb> 17 atoms in block 98
Block first atom: 2346
Blocpdb> 22 atoms in block 99
Block first atom: 2363
Blocpdb> 21 atoms in block 100
Block first atom: 2385
Blocpdb> 26 atoms in block 101
Block first atom: 2406
Blocpdb> 16 atoms in block 102
Block first atom: 2432
Blocpdb> 25 atoms in block 103
Block first atom: 2448
Blocpdb> 21 atoms in block 104
Block first atom: 2473
Blocpdb> 22 atoms in block 105
Block first atom: 2494
Blocpdb> 29 atoms in block 106
Block first atom: 2516
Blocpdb> 25 atoms in block 107
Block first atom: 2545
Blocpdb> 25 atoms in block 108
Block first atom: 2570
Blocpdb> 25 atoms in block 109
Block first atom: 2595
Blocpdb> 16 atoms in block 110
Block first atom: 2620
Blocpdb> 22 atoms in block 111
Block first atom: 2636
Blocpdb> 25 atoms in block 112
Block first atom: 2658
Blocpdb> 19 atoms in block 113
Block first atom: 2683
Blocpdb> 26 atoms in block 114
Block first atom: 2702
Blocpdb> 18 atoms in block 115
Block first atom: 2728
Blocpdb> 24 atoms in block 116
Block first atom: 2746
Blocpdb> 21 atoms in block 117
Block first atom: 2770
Blocpdb> 26 atoms in block 118
Block first atom: 2791
Blocpdb> 24 atoms in block 119
Block first atom: 2817
Blocpdb> 21 atoms in block 120
Block first atom: 2841
Blocpdb> 21 atoms in block 121
Block first atom: 2862
Blocpdb> 16 atoms in block 122
Block first atom: 2883
Blocpdb> 23 atoms in block 123
Block first atom: 2899
Blocpdb> 27 atoms in block 124
Block first atom: 2922
Blocpdb> 26 atoms in block 125
Block first atom: 2949
Blocpdb> 21 atoms in block 126
Block first atom: 2975
Blocpdb> 18 atoms in block 127
Block first atom: 2996
Blocpdb> 24 atoms in block 128
Block first atom: 3014
Blocpdb> 23 atoms in block 129
Block first atom: 3038
Blocpdb> 26 atoms in block 130
Block first atom: 3061
Blocpdb> 25 atoms in block 131
Block first atom: 3087
Blocpdb> 29 atoms in block 132
Block first atom: 3112
Blocpdb> 25 atoms in block 133
Block first atom: 3141
Blocpdb> 20 atoms in block 134
Block first atom: 3166
Blocpdb> 24 atoms in block 135
Block first atom: 3186
Blocpdb> 16 atoms in block 136
Block first atom: 3210
Blocpdb> 34 atoms in block 137
Block first atom: 3226
Blocpdb> 25 atoms in block 138
Block first atom: 3260
Blocpdb> 23 atoms in block 139
Block first atom: 3285
Blocpdb> 19 atoms in block 140
Block first atom: 3308
Blocpdb> 23 atoms in block 141
Block first atom: 3327
Blocpdb> 25 atoms in block 142
Block first atom: 3350
Blocpdb> 29 atoms in block 143
Block first atom: 3375
Blocpdb> 28 atoms in block 144
Block first atom: 3404
Blocpdb> 21 atoms in block 145
Block first atom: 3432
Blocpdb> 20 atoms in block 146
Block first atom: 3453
Blocpdb> 20 atoms in block 147
Block first atom: 3473
Blocpdb> 29 atoms in block 148
Block first atom: 3493
Blocpdb> 27 atoms in block 149
Block first atom: 3522
Blocpdb> 25 atoms in block 150
Block first atom: 3549
Blocpdb> 7 atoms in block 151
Block first atom: 3573
Blocpdb> 151 blocks.
Blocpdb> At most, 35 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1278894 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 10740
Prepmat> Matrix trace = 2794440.0000
Prepmat> Last element read: 10740 10740 165.1942
Prepmat> 11477 lines saved.
Prepmat> 10126 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3580
RTB> Total mass = 3580.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 3580
RTB> Number of blocks = 151
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 179390.5307
RTB> 46335 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 906
Diagstd> Nb of non-zero elements: 46335
Diagstd> Projected matrix trace = 179390.5307
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 906 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 179390.5307
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 12 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
%Diagstd-Wn> Six expected. Parts of the structure interact too little ?
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.0000000 0.0076723 0.0152010 0.0516263
0.2476054 0.3960919 1.0367543 1.4407528 1.4795745
1.6867860 3.1916444 3.7247221 4.2780648 5.3934840
5.5927874 5.7946623 6.7576912 6.8001436 7.3087443
7.6069439 8.0309721 8.3055937 8.4732413 8.4864112
8.9866385 9.6307376 10.0393906 10.7182948 11.2539016
12.3080252 12.7080401 12.7546543 13.6521210 14.4574373
15.7254410 15.9516057 16.1495682 16.4380006 17.3171682
17.8296339 18.3523905 19.2227266 19.6224823 20.4328277
20.5968406 21.3415790 22.3162845 22.6596371 23.1307967
23.7467368 24.9363663 25.2932781 25.6493121 25.8438747
26.0225044 26.4955537 27.0499890 27.8782478 28.3466584
29.0895016 29.5653718 30.3867857 31.0055267 31.2486337
31.5994513 32.0037946 32.0142202 32.4682632 32.7671985
33.1729648 33.3205508 33.6031359 34.0642272 35.0196940
35.4790687 36.0721106 36.8195753 37.6624667 38.2574518
38.8626242 39.4271164 39.7249366 40.0369487 40.9605454
41.4781105 41.8903241 42.3016273 42.6045413 43.1269024
45.2316066 45.5391924 45.7385951 45.9062888 46.7742053
47.6097668
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034318 0.0034326 0.0034328 0.0034331 0.0034332
0.0034335 0.0034336 0.0034337 0.0034341 0.0034341
0.0034351 0.0034354 9.5116870 13.3884934 24.6734917
54.0350231 68.3428808 110.5689552 130.3436917 132.0881018
141.0344729 194.0003583 209.5763236 224.6047626 252.1912289
256.8085254 261.4022652 282.2893235 283.1746162 293.5733737
299.5024556 307.7367328 312.9540821 316.0967764 316.3423358
325.5321724 336.9962397 344.0717015 355.5151643 364.2896530
380.9688512 387.1101595 387.8194865 401.2317984 412.8962510
430.6224788 433.7080496 436.3909523 440.2706921 451.8910271
458.5286678 465.2020302 476.1050360 481.0301002 490.8621180
492.8282382 501.6589375 512.9868411 516.9181187 522.2645837
529.1724793 542.2653632 546.1322710 549.9625808 552.0445082
553.9490549 558.9613516 564.7793729 573.3608265 578.1575682
585.6840815 590.4552010 598.6013088 604.6650082 607.0308974
610.4288501 614.3219281 614.4219812 618.7636737 621.6056258
625.4425504 626.8322990 629.4847082 633.7887862 642.6158800
646.8169404 652.2003945 658.9230013 666.4225138 671.6659003
676.9574032 681.8561907 684.4266110 687.1092038 694.9893438
699.3663980 702.8329934 706.2749739 708.7992135 713.1311600
730.3252016 732.8041877 734.4068020 735.7518664 742.6744596
749.2785627
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3580
Rtb_to_modes> Number of blocs = 151
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9874E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9923E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9934E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9955E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.6723E-03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.5201E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.1626E-02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2476
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3961
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.037
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.441
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.480
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.687
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.192
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.725
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.278
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.393
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.593
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.795
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.758
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.800
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.309
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.607
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.031
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.306
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.473
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.486
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.987
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.631
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.15
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.34
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.72
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.60
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.61
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 906 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
0.99996 0.99999 1.00003 0.99996 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002
0.99996 0.99996 0.99998 0.99998 1.00000
0.99997 0.99999 0.99997 0.99998 1.00000
1.00000 0.99998 0.99994 0.99999 1.00002
1.00000 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002
0.99998 1.00002 0.99996 0.99999 1.00000
0.99997 0.99999 0.99998 1.00004 1.00000
0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 1.00003
1.00002 1.00002 1.00002 0.99998 1.00003
0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 0.99998 0.99997 0.99997 1.00005
1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003
0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99996
0.99995
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 64440 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000
0.99996 0.99999 1.00003 0.99996 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002
0.99996 0.99996 0.99998 0.99998 1.00000
0.99997 0.99999 0.99997 0.99998 1.00000
1.00000 0.99998 0.99994 0.99999 1.00002
1.00000 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002
0.99998 1.00002 0.99996 0.99999 1.00000
0.99997 0.99999 0.99998 1.00004 1.00000
0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999
1.00002 1.00000 0.99998 0.99997 1.00003
1.00002 1.00002 1.00002 0.99998 1.00003
0.99999 1.00001 1.00000 0.99997 0.99999
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998
0.99998 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002
0.99999 0.99998 0.99997 0.99997 1.00005
1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999
0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003
0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99996
0.99995
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22013106484481261.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22013106484481261.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22013106484481261.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22013106484481261.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 448
First residue number = -1
Last residue number = 147
Number of atoms found = 3580
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9874E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9923E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9934E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9950E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9955E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9985E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.6723E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.5201E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.1626E-02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2476
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3961
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.037
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.441
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.480
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.687
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.192
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.725
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.278
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.393
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.593
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.795
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.758
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.800
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.309
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.607
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.031
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.306
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.473
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.486
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.987
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.631
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.15
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.60
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.61
Bfactors> 106 vectors, 10740 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 12 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.007672
Bfactors> 94 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.283 for 449 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.833 +/- 4.96
Bfactors> = 17.512 +/- 11.00
Bfactors> Shiftng-fct= 16.680
Bfactors> Scaling-fct= 2.218
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22013106484481261.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22013106484481261.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 9.511
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 13.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 54.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.34
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 110.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.0
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.0
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 490.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.9
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.2
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 546.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.2
Chkmod> 106 vectors, 10740 coordinates in file.
Chkmod> That is: 3580 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 16 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 17 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 28 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 44 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
%Chkmod-Wn> Norm of vector 90 is: 1.0001 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
0.0034 NaN
9.5113 NaN
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312.9483 NaN
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316.3211 NaN
325.5247 NaN
336.9864 NaN
344.0674 NaN
355.5282 NaN
364.2109 NaN
380.9831 NaN
387.1234 NaN
387.7321 NaN
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412.9151 NaN
430.6664 NaN
433.6676 NaN
436.3781 NaN
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451.9086 NaN
458.5137 NaN
465.1518 NaN
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490.8071 NaN
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516.9001 NaN
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529.1861 NaN
542.2816 NaN
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getting mode 7
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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making thumbnail 100x100
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getting mode 8
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making thumbnail 100x100
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getting mode 9
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normal mode computation
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making thumbnail 100x100
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getting mode 10
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MODEL 5 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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calculating perturbed structure for DQ=-40
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
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MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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