***    ***
output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 22012515524046256.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 22012515524046256.atom to be opened.
Openam> File opened: 22012515524046256.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 409
First residue number = 37
Last residue number = 445
Number of atoms found = 4110
Mean number per residue = 10.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -14.396748 +/- 11.939537 From: -44.267000 To: 18.315000
= -41.026509 +/- 14.885837 From: -73.442000 To: -7.973000
= 0.620305 +/- 9.677629 From: -25.006000 To: 21.878000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 2.5731 % Filled.
Pdbmat> 1956066 non-zero elements.
Pdbmat> 214644 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 104.45 +/- 30.97
Maximum number = 173
Minimum number = 13
Pdbmat> Matrix trace = 4.292880E+06
Pdbmat> Larger element = 634.601
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
409 non-zero elements, NRBL set to 3
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 22012515524046256.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 3
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 22012515524046256.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
22012515524046256.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 4110 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 3 residue(s) per block.
Blocpdb> 409 residues.
Blocpdb> 24 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 31 atoms in block 2
Block first atom: 25
Blocpdb> 33 atoms in block 3
Block first atom: 56
Blocpdb> 28 atoms in block 4
Block first atom: 89
Blocpdb> 27 atoms in block 5
Block first atom: 117
Blocpdb> 27 atoms in block 6
Block first atom: 144
Blocpdb> 39 atoms in block 7
Block first atom: 171
Blocpdb> 30 atoms in block 8
Block first atom: 210
Blocpdb> 27 atoms in block 9
Block first atom: 240
Blocpdb> 28 atoms in block 10
Block first atom: 267
Blocpdb> 31 atoms in block 11
Block first atom: 295
Blocpdb> 26 atoms in block 12
Block first atom: 326
Blocpdb> 35 atoms in block 13
Block first atom: 352
Blocpdb> 36 atoms in block 14
Block first atom: 387
Blocpdb> 26 atoms in block 15
Block first atom: 423
Blocpdb> 20 atoms in block 16
Block first atom: 449
Blocpdb> 28 atoms in block 17
Block first atom: 469
Blocpdb> 29 atoms in block 18
Block first atom: 497
Blocpdb> 26 atoms in block 19
Block first atom: 526
Blocpdb> 22 atoms in block 20
Block first atom: 552
Blocpdb> 36 atoms in block 21
Block first atom: 574
Blocpdb> 19 atoms in block 22
Block first atom: 610
Blocpdb> 19 atoms in block 23
Block first atom: 629
Blocpdb> 36 atoms in block 24
Block first atom: 648
Blocpdb> 38 atoms in block 25
Block first atom: 684
Blocpdb> 48 atoms in block 26
Block first atom: 722
Blocpdb> 38 atoms in block 27
Block first atom: 770
Blocpdb> 25 atoms in block 28
Block first atom: 808
Blocpdb> 44 atoms in block 29
Block first atom: 833
Blocpdb> 39 atoms in block 30
Block first atom: 877
Blocpdb> 31 atoms in block 31
Block first atom: 916
Blocpdb> 33 atoms in block 32
Block first atom: 947
Blocpdb> 26 atoms in block 33
Block first atom: 980
Blocpdb> 44 atoms in block 34
Block first atom: 1006
Blocpdb> 24 atoms in block 35
Block first atom: 1050
Blocpdb> 23 atoms in block 36
Block first atom: 1074
Blocpdb> 25 atoms in block 37
Block first atom: 1097
Blocpdb> 28 atoms in block 38
Block first atom: 1122
Blocpdb> 23 atoms in block 39
Block first atom: 1150
Blocpdb> 25 atoms in block 40
Block first atom: 1173
Blocpdb> 34 atoms in block 41
Block first atom: 1198
Blocpdb> 21 atoms in block 42
Block first atom: 1232
Blocpdb> 28 atoms in block 43
Block first atom: 1253
Blocpdb> 30 atoms in block 44
Block first atom: 1281
Blocpdb> 43 atoms in block 45
Block first atom: 1311
Blocpdb> 24 atoms in block 46
Block first atom: 1354
Blocpdb> 42 atoms in block 47
Block first atom: 1378
Blocpdb> 23 atoms in block 48
Block first atom: 1420
Blocpdb> 20 atoms in block 49
Block first atom: 1443
Blocpdb> 34 atoms in block 50
Block first atom: 1463
Blocpdb> 32 atoms in block 51
Block first atom: 1497
Blocpdb> 25 atoms in block 52
Block first atom: 1529
Blocpdb> 27 atoms in block 53
Block first atom: 1554
Blocpdb> 41 atoms in block 54
Block first atom: 1581
Blocpdb> 26 atoms in block 55
Block first atom: 1622
Blocpdb> 33 atoms in block 56
Block first atom: 1648
Blocpdb> 29 atoms in block 57
Block first atom: 1681
Blocpdb> 27 atoms in block 58
Block first atom: 1710
Blocpdb> 34 atoms in block 59
Block first atom: 1737
Blocpdb> 28 atoms in block 60
Block first atom: 1771
Blocpdb> 16 atoms in block 61
Block first atom: 1799
Blocpdb> 33 atoms in block 62
Block first atom: 1815
Blocpdb> 31 atoms in block 63
Block first atom: 1848
Blocpdb> 27 atoms in block 64
Block first atom: 1879
Blocpdb> 22 atoms in block 65
Block first atom: 1906
Blocpdb> 18 atoms in block 66
Block first atom: 1928
Blocpdb> 27 atoms in block 67
Block first atom: 1946
Blocpdb> 19 atoms in block 68
Block first atom: 1973
Blocpdb> 29 atoms in block 69
Block first atom: 1992
Blocpdb> 36 atoms in block 70
Block first atom: 2021
Blocpdb> 22 atoms in block 71
Block first atom: 2057
Blocpdb> 48 atoms in block 72
Block first atom: 2079
Blocpdb> 33 atoms in block 73
Block first atom: 2127
Blocpdb> 48 atoms in block 74
Block first atom: 2160
Blocpdb> 46 atoms in block 75
Block first atom: 2208
Blocpdb> 26 atoms in block 76
Block first atom: 2254
Blocpdb> 33 atoms in block 77
Block first atom: 2280
Blocpdb> 30 atoms in block 78
Block first atom: 2313
Blocpdb> 26 atoms in block 79
Block first atom: 2343
Blocpdb> 31 atoms in block 80
Block first atom: 2369
Blocpdb> 29 atoms in block 81
Block first atom: 2400
Blocpdb> 39 atoms in block 82
Block first atom: 2429
Blocpdb> 40 atoms in block 83
Block first atom: 2468
Blocpdb> 25 atoms in block 84
Block first atom: 2508
Blocpdb> 22 atoms in block 85
Block first atom: 2533
Blocpdb> 29 atoms in block 86
Block first atom: 2555
Blocpdb> 35 atoms in block 87
Block first atom: 2584
Blocpdb> 33 atoms in block 88
Block first atom: 2619
Blocpdb> 35 atoms in block 89
Block first atom: 2652
Blocpdb> 20 atoms in block 90
Block first atom: 2687
Blocpdb> 30 atoms in block 91
Block first atom: 2707
Blocpdb> 25 atoms in block 92
Block first atom: 2737
Blocpdb> 25 atoms in block 93
Block first atom: 2762
Blocpdb> 40 atoms in block 94
Block first atom: 2787
Blocpdb> 21 atoms in block 95
Block first atom: 2827
Blocpdb> 47 atoms in block 96
Block first atom: 2848
Blocpdb> 27 atoms in block 97
Block first atom: 2895
Blocpdb> 24 atoms in block 98
Block first atom: 2922
Blocpdb> 39 atoms in block 99
Block first atom: 2946
Blocpdb> 23 atoms in block 100
Block first atom: 2985
Blocpdb> 39 atoms in block 101
Block first atom: 3008
Blocpdb> 33 atoms in block 102
Block first atom: 3047
Blocpdb> 25 atoms in block 103
Block first atom: 3080
Blocpdb> 36 atoms in block 104
Block first atom: 3105
Blocpdb> 24 atoms in block 105
Block first atom: 3141
Blocpdb> 28 atoms in block 106
Block first atom: 3165
Blocpdb> 37 atoms in block 107
Block first atom: 3193
Blocpdb> 35 atoms in block 108
Block first atom: 3230
Blocpdb> 25 atoms in block 109
Block first atom: 3265
Blocpdb> 42 atoms in block 110
Block first atom: 3290
Blocpdb> 33 atoms in block 111
Block first atom: 3332
Blocpdb> 27 atoms in block 112
Block first atom: 3365
Blocpdb> 23 atoms in block 113
Block first atom: 3392
Blocpdb> 29 atoms in block 114
Block first atom: 3415
Blocpdb> 34 atoms in block 115
Block first atom: 3444
Blocpdb> 36 atoms in block 116
Block first atom: 3478
Blocpdb> 29 atoms in block 117
Block first atom: 3514
Blocpdb> 25 atoms in block 118
Block first atom: 3543
Blocpdb> 22 atoms in block 119
Block first atom: 3568
Blocpdb> 20 atoms in block 120
Block first atom: 3590
Blocpdb> 26 atoms in block 121
Block first atom: 3610
Blocpdb> 32 atoms in block 122
Block first atom: 3636
Blocpdb> 34 atoms in block 123
Block first atom: 3668
Blocpdb> 43 atoms in block 124
Block first atom: 3702
Blocpdb> 36 atoms in block 125
Block first atom: 3745
Blocpdb> 31 atoms in block 126
Block first atom: 3781
Blocpdb> 31 atoms in block 127
Block first atom: 3812
Blocpdb> 21 atoms in block 128
Block first atom: 3843
Blocpdb> 32 atoms in block 129
Block first atom: 3864
Blocpdb> 36 atoms in block 130
Block first atom: 3896
Blocpdb> 32 atoms in block 131
Block first atom: 3932
Blocpdb> 24 atoms in block 132
Block first atom: 3964
Blocpdb> 29 atoms in block 133
Block first atom: 3988
Blocpdb> 26 atoms in block 134
Block first atom: 4017
Blocpdb> 28 atoms in block 135
Block first atom: 4043
Blocpdb> 21 atoms in block 136
Block first atom: 4071
Blocpdb> 19 atoms in block 137
Block first atom: 4091
Blocpdb> 137 blocks.
Blocpdb> At most, 48 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 16 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1956203 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 12330
Prepmat> Matrix trace = 4292880.0000
Prepmat> Last element read: 12330 12330 296.0492
Prepmat> 9454 lines saved.
Prepmat> 7989 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4110
RTB> Total mass = 4110.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 4110
RTB> Number of blocks = 137
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 224788.6081
RTB> 50649 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 822
Diagstd> Nb of non-zero elements: 50649
Diagstd> Projected matrix trace = 224788.6081
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 822 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 224788.6081
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.3238222 3.9027972 5.6545924 7.7394120
9.8536471 11.3790164 12.9176722 13.4176933 14.6930465
14.8706493 15.8088558 17.3353421 18.0053755 18.9725844
19.7021798 21.3889923 21.4290714 22.5497097 23.6354122
23.8479460 25.4323543 25.9264235 26.7227611 27.7961730
28.3529158 30.1231595 30.4361410 31.0362145 32.0509847
33.2492071 33.9256131 35.2080365 36.4827749 37.5014670
38.4517454 39.2542163 39.9139688 40.4282904 41.7721199
42.1648408 43.3830888 44.0603445 44.7608347 46.0905737
46.5946076 48.0266237 49.1700809 49.5359393 49.9252752
51.0567385 52.0352692 53.1061000 54.2367222 55.0297209
55.8466450 56.1961905 57.0911166 58.2869895 59.0041264
60.1063827 60.8945930 61.6417639 62.0930675 63.3500574
63.4949118 64.3286284 64.5303424 65.4059367 65.9672110
66.8278238 68.0688858 68.5730325 69.5263151 70.2408369
70.8740367 71.6080671 72.4223434 72.7909334 73.6884249
74.3701172 74.8373681 75.3822934 75.9129591 76.6191891
76.9712816 78.1317562 79.0795043 79.5211625 79.9379761
80.7512459 80.9007406 81.9891873 83.1296656 83.9128491
84.7041720 84.7475647 86.0082646 86.0139051 87.9110411
87.9796464
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034319 0.0034322 0.0034333 0.0034341 0.0034344
0.0034358 197.9767421 214.5276490 258.2236011 302.0989829
340.8739257 366.3090447 390.2899878 397.7720018 416.2470869
418.7552323 431.7630767 452.1280883 460.7829193 472.9971539
482.0059725 502.2158820 502.6861919 515.6627473 527.9306432
530.2989535 547.6316793 552.9254567 561.3528662 572.5162047
578.2213778 595.9990132 599.0872456 604.9641689 614.7746752
626.1608741 632.4979654 644.3416179 655.9023879 664.9965755
673.3692953 680.3594725 686.0531098 690.4591175 701.8406815
705.1321437 715.2461275 720.8073798 726.5146375 737.2271779
741.2472749 752.5516433 761.4576278 764.2852560 767.2828907
775.9286975 783.3289608 791.3479553 799.7274405 805.5526587
811.5099032 814.0455717 820.5018205 829.0507041 834.1352465
841.8904373 847.3925596 852.5754232 855.6907509 864.3085049
865.2960925 870.9584278 872.3228824 878.2210957 881.9812281
887.7157793 895.9207621 899.2324239 905.4612860 910.1021055
914.1950489 918.9169360 924.1268039 926.4754687 932.1695601
936.4713885 939.4086030 942.8225327 946.1352877 950.5261209
952.7076209 959.8626070 965.6666868 968.3595509 970.8940834
975.8204070 976.7232569 983.2717707 990.0868603 994.7398436
999.4191828 999.6751441 1007.0832499 1007.1162719 1018.1622527
1018.5594589
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4110
Rtb_to_modes> Number of blocs = 137
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9879E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9898E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9961E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.324
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.903
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Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.98
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 822 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
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1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 73980 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
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1.00001 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000
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1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000
1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002
1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4: 0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22012515524046256.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22012515524046256.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 22012515524046256.atom
Openam> file on opening on unit 11:
22012515524046256.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 409
First residue number = 37
Last residue number = 445
Number of atoms found = 4110
Mean number per residue = 10.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9879E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9898E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9961E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.324
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.903
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.655
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.739
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.854
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.44
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.29
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Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.00
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.98
Bfactors> 106 vectors, 12330 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.324000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.737 for 409 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.011 +/- 0.01
Bfactors> = 0.847 +/- 0.13
Bfactors> Shiftng-fct= 0.835
Bfactors> Scaling-fct= 11.942
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 22012515524046256.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
22012515524046256.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.0
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.3
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.5
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.3
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Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 741.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 767.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 799.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 820.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 855.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 864.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 865.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 870.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 887.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 924.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 936.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 939.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 942.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 950.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 959.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 975.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 990.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1018.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1019.
Chkmod> 106 vectors, 12330 coordinates in file.
Chkmod> That is: 4110 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 27 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9645
0.0034 0.7664
0.0034 0.9703
0.0034 0.7338
0.0034 0.9743
0.0034 0.7695
197.9735 0.5461
214.5240 0.5189
258.2218 0.5193
302.0780 0.3716
340.8654 0.4001
366.3092 0.3263
390.3084 0.2847
397.7891 0.3228
416.1861 0.4883
418.7281 0.5135
431.7602 0.3428
452.1694 0.4272
460.8223 0.2365
472.9446 0.3847
481.9586 0.2391
502.2062 0.3282
502.6755 0.3128
515.6439 0.6248
527.9592 0.2479
530.2990 0.2564
547.5828 0.1101
552.9399 0.3801
561.2998 0.4676
572.5310 0.4338
578.1668 0.2465
595.9422 0.4735
599.0995 0.3826
604.9751 0.4058
614.7388 0.4036
626.1415 0.3868
632.5117 0.4894
644.3319 0.4299
655.8493 0.4582
664.9550 0.3928
673.3251 0.4855
680.2937 0.3064
685.9896 0.3320
690.4441 0.4607
701.7927 0.5850
705.0614 0.4386
715.1900 0.5786
720.7736 0.4791
726.4767 0.4342
737.1909 0.2760
741.1788 0.5022
752.5458 0.3681
761.4243 0.3745
764.2838 0.4957
767.2863 0.5340
775.9202 0.4730
783.3309 0.2633
791.3430 0.4274
799.7173 0.3296
805.5201 0.5092
811.4994 0.4911
814.0382 0.5253
820.4586 0.4344
829.0365 0.4800
834.0703 0.4969
841.8796 0.3653
847.3242 0.4025
852.5266 0.4660
855.6329 0.4464
864.2710 0.4807
865.2255 0.4842
870.9303 0.4740
872.2831 0.1717
878.2107 0.4838
881.9620 0.4415
887.6921 0.4326
895.8896 0.4141
899.1739 0.3874
905.4464 0.3175
910.0576 0.4810
914.1298 0.4591
918.8899 0.4994
924.0722 0.3397
926.4298 0.4811
932.1395 0.2863
936.4305 0.4582
939.3848 0.4297
942.7677 0.3822
946.0762 0.4553
950.4903 0.3274
952.6588 0.3912
959.8106 0.4401
965.6283 0.4318
968.3109 0.3905
970.8647 0.3602
975.7710 0.3980
976.6769 0.3684
983.2344 0.2863
990.0463 0.4002
994.6803 0.3996
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999.6466 0.3994
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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MODEL 5 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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making thumbnail 100x100
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MODEL 5 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
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getting mode 9
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getting mode 10
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
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normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
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MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
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MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
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