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***  Jon  ***

LOGs for ID: 22011415395742824

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 22011415395742824.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 22011415395742824.atom to be opened. Openam> File opened: 22011415395742824.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 158 First residue number = 1 Last residue number = 159 Number of atoms found = 5501 Mean number per residue = 34.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 27.273931 +/- 8.437872 From: 6.644000 To: 47.488000 = 43.601765 +/- 9.773786 From: 21.539000 To: 68.401000 = 13.020456 +/- 8.240315 From: -5.179000 To: 33.071000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 6.1383 % Filled. Pdbmat> 8359336 non-zero elements. Pdbmat> 925322 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 336.42 +/- 106.00 Maximum number = 578 Minimum number = 52 Pdbmat> Matrix trace = 1.850644E+07 Pdbmat> Larger element = 2414.31 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 158 non-zero elements, NRBL set to 1 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 22011415395742824.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 1 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 22011415395742824.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 22011415395742824.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5501 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 1 residue(s) per block. Blocpdb> 158 residues. Blocpdb> 38 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 20 atoms in block 2 Block first atom: 39 Blocpdb> 11 atoms in block 3 Block first atom: 59 Blocpdb> 38 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 38 atoms in block 5 Block first atom: 108 Blocpdb> 11 atoms in block 6 Block first atom: 146 Blocpdb> 20 atoms in block 7 Block first atom: 157 Blocpdb> 38 atoms in block 8 Block first atom: 177 Blocpdb> 11 atoms in block 9 Block first atom: 215 Blocpdb> 64 atoms in block 10 Block first atom: 226 Blocpdb> 48 atoms in block 11 Block first atom: 290 Blocpdb> 96 atoms in block 12 Block first atom: 338 Blocpdb> 64 atoms in block 13 Block first atom: 434 Blocpdb> 76 atoms in block 14 Block first atom: 498 Blocpdb> 10 atoms in block 15 Block first atom: 574 Blocpdb> 17 atoms in block 16 Block first atom: 584 Blocpdb> 24 atoms in block 17 Block first atom: 601 Blocpdb> 28 atoms in block 18 Block first atom: 625 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 653 Blocpdb> 34 atoms in block 20 Block first atom: 673 Blocpdb> 28 atoms in block 21 Block first atom: 707 Blocpdb> 48 atoms in block 22 Block first atom: 735 Blocpdb> 28 atoms in block 23 Block first atom: 783 Blocpdb> 38 atoms in block 24 Block first atom: 811 Blocpdb> 28 atoms in block 25 Block first atom: 849 Blocpdb> 20 atoms in block 26 Block first atom: 877 Blocpdb> 24 atoms in block 27 Block first atom: 897 Blocpdb> 46 atoms in block 28 Block first atom: 921 Blocpdb> 10 atoms in block 29 Block first atom: 967 Blocpdb> 24 atoms in block 30 Block first atom: 977 Blocpdb> 20 atoms in block 31 Block first atom: 1001 Blocpdb> 54 atoms in block 32 Block first atom: 1021 Blocpdb> 72 atoms in block 33 Block first atom: 1075 Blocpdb> 42 atoms in block 34 Block first atom: 1147 Blocpdb> 42 atoms in block 35 Block first atom: 1189 Blocpdb> 21 atoms in block 36 Block first atom: 1231 Blocpdb> 42 atoms in block 37 Block first atom: 1252 Blocpdb> 66 atoms in block 38 Block first atom: 1294 Blocpdb> 23 atoms in block 39 Block first atom: 1360 Blocpdb> 48 atoms in block 40 Block first atom: 1383 Blocpdb> 57 atoms in block 41 Block first atom: 1431 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 1488 Blocpdb> 7 atoms in block 43 Block first atom: 1507 Blocpdb> 72 atoms in block 44 Block first atom: 1514 Blocpdb> 51 atoms in block 45 Block first atom: 1586 Blocpdb> 42 atoms in block 46 Block first atom: 1637 Blocpdb> 72 atoms in block 47 Block first atom: 1679 Blocpdb> 45 atoms in block 48 Block first atom: 1751 Blocpdb> 33 atoms in block 49 Block first atom: 1796 Blocpdb> 57 atoms in block 50 Block first atom: 1829 Blocpdb> 9 atoms in block 51 Block first atom: 1886 Blocpdb> 72 atoms in block 52 Block first atom: 1895 Blocpdb> 14 atoms in block 53 Block first atom: 1967 Blocpdb> 57 atoms in block 54 Block first atom: 1981 Blocpdb> 42 atoms in block 55 Block first atom: 2038 Blocpdb> 9 atoms in block 56 Block first atom: 2080 Blocpdb> 48 atoms in block 57 Block first atom: 2089 Blocpdb> 23 atoms in block 58 Block first atom: 2137 Blocpdb> 28 atoms in block 59 Block first atom: 2160 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 2188 Blocpdb> 38 atoms in block 61 Block first atom: 2208 Blocpdb> 20 atoms in block 62 Block first atom: 2246 Blocpdb> 11 atoms in block 63 Block first atom: 2266 Blocpdb> 22 atoms in block 64 Block first atom: 2277 Blocpdb> 34 atoms in block 65 Block first atom: 2299 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 2333 Blocpdb> 8 atoms in block 67 Block first atom: 2361 Blocpdb> 42 atoms in block 68 Block first atom: 2369 Blocpdb> 36 atoms in block 69 Block first atom: 2411 Blocpdb> 36 atoms in block 70 Block first atom: 2447 Blocpdb> 72 atoms in block 71 Block first atom: 2483 Blocpdb> 48 atoms in block 72 Block first atom: 2555 Blocpdb> 42 atoms in block 73 Block first atom: 2603 Blocpdb> 72 atoms in block 74 Block first atom: 2645 Blocpdb> 48 atoms in block 75 Block first atom: 2717 Blocpdb> 66 atoms in block 76 Block first atom: 2765 Blocpdb> 33 atoms in block 77 Block first atom: 2831 Blocpdb> 48 atoms in block 78 Block first atom: 2864 Blocpdb> 36 atoms in block 79 Block first atom: 2912 Blocpdb> 17 atoms in block 80 Block first atom: 2948 Blocpdb> 10 atoms in block 81 Block first atom: 2965 Blocpdb> 57 atoms in block 82 Block first atom: 2975 Blocpdb> 30 atoms in block 83 Block first atom: 3032 Blocpdb> 12 atoms in block 84 Block first atom: 3062 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 3074 Blocpdb> 8 atoms in block 86 Block first atom: 3096 Blocpdb> 24 atoms in block 87 Block first atom: 3104 Blocpdb> 32 atoms in block 88 Block first atom: 3128 Blocpdb> 28 atoms in block 89 Block first atom: 3160 Blocpdb> 16 atoms in block 90 Block first atom: 3188 Blocpdb> 57 atoms in block 91 Block first atom: 3204 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 3261 Blocpdb> 48 atoms in block 93 Block first atom: 3280 Blocpdb> 57 atoms in block 94 Block first atom: 3328 Blocpdb> 9 atoms in block 95 Block first atom: 3385 Blocpdb> 7 atoms in block 96 Block first atom: 3394 Blocpdb> 7 atoms in block 97 Block first atom: 3401 Blocpdb> 72 atoms in block 98 Block first atom: 3408 Blocpdb> 48 atoms in block 99 Block first atom: 3480 Blocpdb> 23 atoms in block 100 Block first atom: 3528 Blocpdb> 33 atoms in block 101 Block first atom: 3551 Blocpdb> 28 atoms in block 102 Block first atom: 3584 Blocpdb> 40 atoms in block 103 Block first atom: 3612 Blocpdb> 38 atoms in block 104 Block first atom: 3652 Blocpdb> 28 atoms in block 105 Block first atom: 3690 Blocpdb> 44 atoms in block 106 Block first atom: 3718 Blocpdb> 20 atoms in block 107 Block first atom: 3762 Blocpdb> 34 atoms in block 108 Block first atom: 3782 Blocpdb> 44 atoms in block 109 Block first atom: 3816 Blocpdb> 38 atoms in block 110 Block first atom: 3860 Blocpdb> 42 atoms in block 111 Block first atom: 3898 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 3940 Blocpdb> 56 atoms in block 113 Block first atom: 3960 Blocpdb> 68 atoms in block 114 Block first atom: 4016 Blocpdb> 35 atoms in block 115 Block first atom: 4084 Blocpdb> 24 atoms in block 116 Block first atom: 4119 Blocpdb> 20 atoms in block 117 Block first atom: 4143 Blocpdb> 30 atoms in block 118 Block first atom: 4163 Blocpdb> 32 atoms in block 119 Block first atom: 4193 Blocpdb> 30 atoms in block 120 Block first atom: 4225 Blocpdb> 8 atoms in block 121 Block first atom: 4255 Blocpdb> 12 atoms in block 122 Block first atom: 4263 Blocpdb> 28 atoms in block 123 Block first atom: 4275 Blocpdb> 18 atoms in block 124 Block first atom: 4303 Blocpdb> 20 atoms in block 125 Block first atom: 4321 Blocpdb> 56 atoms in block 126 Block first atom: 4341 Blocpdb> 48 atoms in block 127 Block first atom: 4397 Blocpdb> 84 atoms in block 128 Block first atom: 4445 Blocpdb> 27 atoms in block 129 Block first atom: 4529 Blocpdb> 42 atoms in block 130 Block first atom: 4556 Blocpdb> 36 atoms in block 131 Block first atom: 4598 Blocpdb> 36 atoms in block 132 Block first atom: 4634 Blocpdb> 26 atoms in block 133 Block first atom: 4670 Blocpdb> 15 atoms in block 134 Block first atom: 4696 Blocpdb> 11 atoms in block 135 Block first atom: 4711 Blocpdb> 48 atoms in block 136 Block first atom: 4722 Blocpdb> 60 atoms in block 137 Block first atom: 4770 Blocpdb> 33 atoms in block 138 Block first atom: 4830 Blocpdb> 45 atoms in block 139 Block first atom: 4863 Blocpdb> 22 atoms in block 140 Block first atom: 4908 Blocpdb> 51 atoms in block 141 Block first atom: 4930 Blocpdb> 36 atoms in block 142 Block first atom: 4981 Blocpdb> 12 atoms in block 143 Block first atom: 5017 Blocpdb> 36 atoms in block 144 Block first atom: 5029 Blocpdb> 30 atoms in block 145 Block first atom: 5065 Blocpdb> 51 atoms in block 146 Block first atom: 5095 Blocpdb> 42 atoms in block 147 Block first atom: 5146 Blocpdb> 33 atoms in block 148 Block first atom: 5188 Blocpdb> 34 atoms in block 149 Block first atom: 5221 Blocpdb> 12 atoms in block 150 Block first atom: 5255 Blocpdb> 42 atoms in block 151 Block first atom: 5267 Blocpdb> 40 atoms in block 152 Block first atom: 5309 Blocpdb> 16 atoms in block 153 Block first atom: 5349 Blocpdb> 19 atoms in block 154 Block first atom: 5365 Blocpdb> 38 atoms in block 155 Block first atom: 5384 Blocpdb> 30 atoms in block 156 Block first atom: 5422 Blocpdb> 25 atoms in block 157 Block first atom: 5452 Blocpdb> 25 atoms in block 158 Block first atom: 5476 Blocpdb> 158 blocks. Blocpdb> At most, 96 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 8359494 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 16503 Prepmat> Matrix trace = 18506440.0000 Prepmat> Last element read: 16503 16503 431.6762 Prepmat> 12562 lines saved. Prepmat> 10217 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5501 RTB> Total mass = 5501.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5501 RTB> Number of blocks = 158 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 951478.9491 RTB> 82014 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 948 Diagstd> Nb of non-zero elements: 82014 Diagstd> Projected matrix trace = 951478.9491 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 948 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 951478.9491 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 18.8066907 24.6978095 31.7896201 36.4053672 45.5075797 47.4247131 50.0604420 58.2352183 64.7692438 67.8941113 72.0484523 80.7857868 80.8535527 84.6541683 94.3409193 97.3772276 103.9893772 105.1642328 115.0555097 116.6735703 121.3699789 122.5169718 127.6451122 128.8016736 131.8317110 134.6257140 142.4718192 146.2695998 150.4451373 153.4177382 161.3933030 165.6131052 166.8176220 172.6979171 174.3182401 181.7357559 182.3414218 187.2095928 188.2100358 193.0114297 199.6695615 200.7404196 204.6519371 206.5438874 208.3440623 216.5184379 224.0128978 227.5680184 232.9587806 235.2828220 238.2932851 242.3234474 242.8045627 248.1779387 254.2272769 256.8833800 260.4308029 264.2263652 266.3286465 271.2803364 274.3402723 278.1310810 281.3856543 284.8283639 286.9218187 293.7799939 294.5809979 295.4185272 299.5195405 304.5316123 306.4526180 314.3735727 315.9650673 318.1201570 320.3974864 325.7085313 326.5890302 328.9259947 337.5283485 337.7171159 339.7330675 343.1852459 344.7118948 346.5615982 347.9819701 354.3061943 357.5256844 361.0154258 363.2700513 366.0583683 368.7455884 370.9292142 371.1356343 374.1357033 376.6451708 379.7985374 383.5869148 385.0480900 386.2813123 390.0436604 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034223 0.0034304 0.0034315 0.0034323 0.0034402 0.0034431 470.9247022 539.6653055 612.2629074 655.2061849 732.5497925 747.8209651 768.3208523 828.6824365 873.9361290 894.7698347 921.7382460 976.0290854 976.4383633 999.1241443 1054.7397951 1071.5784798 1107.3623891 1113.6002229 1164.7936398 1172.9554681 1196.3297931 1201.9693885 1226.8666888 1232.4123264 1246.8242044 1259.9673468 1296.1634331 1313.3253190 1331.9390683 1345.0333974 1379.5518728 1397.4704405 1402.5431880 1427.0488175 1433.7277679 1463.9136865 1466.3510306 1485.7964953 1489.7612335 1508.6440840 1534.4445972 1538.5538242 1553.4712141 1560.6353993 1567.4216610 1597.8747091 1625.2934767 1638.1395443 1657.4285766 1665.6754717 1676.2978288 1690.4136840 1692.0909475 1710.7118623 1731.4356409 1740.4569429 1752.4331308 1765.1570659 1772.1652702 1788.5638057 1798.6226698 1811.0066379 1821.5716411 1832.6810863 1839.4037511 1861.2571926 1863.7928649 1866.4404781 1879.3508323 1895.0098476 1900.9773759 1925.3881546 1930.2555747 1936.8271945 1943.7474222 1959.7913991 1962.4385966 1969.4473659 1995.0344870 1995.5922845 2001.5396163 2011.6831790 2016.1526690 2021.5547092 2025.6931127 2044.0177028 2053.2834357 2063.2799592 2069.7127635 2077.6407272 2085.2527224 2091.4178003 2091.9996507 2100.4379551 2107.4703924 2116.2741360 2126.8025491 2130.8494511 2134.2590387 2144.6276061 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5501 Rtb_to_modes> Number of blocs = 158 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9322E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9791E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9859E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0036E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0053E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 0.99997 0.99996 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99995 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00005 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 99018 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 0.99997 0.99996 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 0.99995 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00005 1.00001 0.99999 1.00002 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 0.99996 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22011415395742824.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22011415395742824.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 22011415395742824.atom Openam> file on opening on unit 11: 22011415395742824.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 158 First residue number = 1 Last residue number = 159 Number of atoms found = 5501 Mean number per residue = 34.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9322E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9791E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9859E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0036E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0053E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 146.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 150.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 153.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 161.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 166.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 181.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 182.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 187.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 193.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 199.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 200.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 204.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 206.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 208.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 216.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 224.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 227.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 233.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 235.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 238.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 242.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 242.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 248.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 254.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 256.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 260.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 264.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 266.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 271.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 274.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 278.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 281.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 284.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 286.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 293.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 294.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 295.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 299.5 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 337.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 337.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 339.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 343.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 344.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 346.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 348.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 354.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 357.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 361.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 363.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 366.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 368.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 370.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 371.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 374.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 376.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 379.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 383.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 385.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 386.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 390.0 Bfactors> 106 vectors, 16503 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 18.810000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.601 for 333 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.002 +/- 0.00 Bfactors> = 7.422 +/- 1.94 Bfactors> Shiftng-fct= 7.421 Bfactors> Scaling-fct= 1150.822 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 22011415395742824.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 22011415395742824.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4222E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4302E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4314E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4400E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4429E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 768.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 873.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1055. 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