CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  LIGASE 27-MAY-17 5XOB  ***

LOGs for ID: 220114105920126917

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 220114105920126917.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 220114105920126917.atom to be opened. Openam> File opened: 220114105920126917.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 416 First residue number = 1 Last residue number = 420 Number of atoms found = 3271 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 22.344942 +/- 15.810460 From: -11.513000 To: 67.205000 = 7.815761 +/- 11.087342 From: -15.702000 To: 34.980000 = 50.949247 +/- 18.736249 From: 18.867000 To: 101.424000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.4725 % Filled. Pdbmat> 1190564 non-zero elements. Pdbmat> 130122 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.56 +/- 22.53 Maximum number = 128 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 2.602440E+06 Pdbmat> Larger element = 491.550 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 416 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 220114105920126917.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 220114105920126917.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 220114105920126917.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3271 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 416 residues. Blocpdb> 26 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 25 atoms in block 2 Block first atom: 27 Blocpdb> 24 atoms in block 3 Block first atom: 52 Blocpdb> 21 atoms in block 4 Block first atom: 76 Blocpdb> 15 atoms in block 5 Block first atom: 97 Blocpdb> 14 atoms in block 6 Block first atom: 112 Blocpdb> 27 atoms in block 7 Block first atom: 126 Blocpdb> 20 atoms in block 8 Block first atom: 153 Blocpdb> 22 atoms in block 9 Block first atom: 173 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 195 Blocpdb> 28 atoms in block 11 Block first atom: 222 Blocpdb> 16 atoms in block 12 Block first atom: 250 Blocpdb> 23 atoms in block 13 Block first atom: 266 Blocpdb> 26 atoms in block 14 Block first atom: 289 Blocpdb> 27 atoms in block 15 Block first atom: 315 Blocpdb> 22 atoms in block 16 Block first atom: 342 Blocpdb> 15 atoms in block 17 Block first atom: 364 Blocpdb> 17 atoms in block 18 Block first atom: 379 Blocpdb> 16 atoms in block 19 Block first atom: 396 Blocpdb> 25 atoms in block 20 Block first atom: 412 Blocpdb> 23 atoms in block 21 Block first atom: 437 Blocpdb> 23 atoms in block 22 Block first atom: 460 Blocpdb> 21 atoms in block 23 Block first atom: 483 Blocpdb> 22 atoms in block 24 Block first atom: 504 Blocpdb> 24 atoms in block 25 Block first atom: 526 Blocpdb> 23 atoms in block 26 Block first atom: 550 Blocpdb> 24 atoms in block 27 Block first atom: 573 Blocpdb> 24 atoms in block 28 Block first atom: 597 Blocpdb> 26 atoms in block 29 Block first atom: 621 Blocpdb> 22 atoms in block 30 Block first atom: 647 Blocpdb> 16 atoms in block 31 Block first atom: 669 Blocpdb> 23 atoms in block 32 Block first atom: 685 Blocpdb> 26 atoms in block 33 Block first atom: 708 Blocpdb> 21 atoms in block 34 Block first atom: 734 Blocpdb> 24 atoms in block 35 Block first atom: 755 Blocpdb> 24 atoms in block 36 Block first atom: 779 Blocpdb> 22 atoms in block 37 Block first atom: 803 Blocpdb> 24 atoms in block 38 Block first atom: 825 Blocpdb> 25 atoms in block 39 Block first atom: 849 Blocpdb> 22 atoms in block 40 Block first atom: 874 Blocpdb> 26 atoms in block 41 Block first atom: 896 Blocpdb> 21 atoms in block 42 Block first atom: 922 Blocpdb> 31 atoms in block 43 Block first atom: 943 Blocpdb> 25 atoms in block 44 Block first atom: 974 Blocpdb> 30 atoms in block 45 Block first atom: 999 Blocpdb> 18 atoms in block 46 Block first atom: 1029 Blocpdb> 20 atoms in block 47 Block first atom: 1047 Blocpdb> 17 atoms in block 48 Block first atom: 1067 Blocpdb> 17 atoms in block 49 Block first atom: 1084 Blocpdb> 18 atoms in block 50 Block first atom: 1101 Blocpdb> 25 atoms in block 51 Block first atom: 1119 Blocpdb> 26 atoms in block 52 Block first atom: 1144 Blocpdb> 25 atoms in block 53 Block first atom: 1170 Blocpdb> 28 atoms in block 54 Block first atom: 1195 Blocpdb> 28 atoms in block 55 Block first atom: 1223 Blocpdb> 26 atoms in block 56 Block first atom: 1251 Blocpdb> 27 atoms in block 57 Block first atom: 1277 Blocpdb> 25 atoms in block 58 Block first atom: 1304 Blocpdb> 24 atoms in block 59 Block first atom: 1329 Blocpdb> 30 atoms in block 60 Block first atom: 1353 Blocpdb> 21 atoms in block 61 Block first atom: 1383 Blocpdb> 29 atoms in block 62 Block first atom: 1404 Blocpdb> 23 atoms in block 63 Block first atom: 1433 Blocpdb> 27 atoms in block 64 Block first atom: 1456 Blocpdb> 29 atoms in block 65 Block first atom: 1483 Blocpdb> 22 atoms in block 66 Block first atom: 1512 Blocpdb> 21 atoms in block 67 Block first atom: 1534 Blocpdb> 21 atoms in block 68 Block first atom: 1555 Blocpdb> 22 atoms in block 69 Block first atom: 1576 Blocpdb> 20 atoms in block 70 Block first atom: 1598 Blocpdb> 24 atoms in block 71 Block first atom: 1618 Blocpdb> 23 atoms in block 72 Block first atom: 1642 Blocpdb> 22 atoms in block 73 Block first atom: 1665 Blocpdb> 22 atoms in block 74 Block first atom: 1687 Blocpdb> 26 atoms in block 75 Block first atom: 1709 Blocpdb> 19 atoms in block 76 Block first atom: 1735 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1754 Blocpdb> 23 atoms in block 78 Block first atom: 1777 Blocpdb> 30 atoms in block 79 Block first atom: 1800 Blocpdb> 27 atoms in block 80 Block first atom: 1830 Blocpdb> 22 atoms in block 81 Block first atom: 1857 Blocpdb> 22 atoms in block 82 Block first atom: 1879 Blocpdb> 26 atoms in block 83 Block first atom: 1901 Blocpdb> 20 atoms in block 84 Block first atom: 1927 Blocpdb> 27 atoms in block 85 Block first atom: 1947 Blocpdb> 22 atoms in block 86 Block first atom: 1974 Blocpdb> 25 atoms in block 87 Block first atom: 1996 Blocpdb> 29 atoms in block 88 Block first atom: 2021 Blocpdb> 31 atoms in block 89 Block first atom: 2050 Blocpdb> 20 atoms in block 90 Block first atom: 2081 Blocpdb> 22 atoms in block 91 Block first atom: 2101 Blocpdb> 28 atoms in block 92 Block first atom: 2123 Blocpdb> 25 atoms in block 93 Block first atom: 2151 Blocpdb> 18 atoms in block 94 Block first atom: 2176 Blocpdb> 29 atoms in block 95 Block first atom: 2194 Blocpdb> 25 atoms in block 96 Block first atom: 2223 Blocpdb> 27 atoms in block 97 Block first atom: 2248 Blocpdb> 17 atoms in block 98 Block first atom: 2275 Blocpdb> 20 atoms in block 99 Block first atom: 2292 Blocpdb> 25 atoms in block 100 Block first atom: 2312 Blocpdb> 23 atoms in block 101 Block first atom: 2337 Blocpdb> 31 atoms in block 102 Block first atom: 2360 Blocpdb> 23 atoms in block 103 Block first atom: 2391 Blocpdb> 27 atoms in block 104 Block first atom: 2414 Blocpdb> 18 atoms in block 105 Block first atom: 2441 Blocpdb> 22 atoms in block 106 Block first atom: 2459 Blocpdb> 28 atoms in block 107 Block first atom: 2481 Blocpdb> 18 atoms in block 108 Block first atom: 2509 Blocpdb> 26 atoms in block 109 Block first atom: 2527 Blocpdb> 23 atoms in block 110 Block first atom: 2553 Blocpdb> 26 atoms in block 111 Block first atom: 2576 Blocpdb> 25 atoms in block 112 Block first atom: 2602 Blocpdb> 24 atoms in block 113 Block first atom: 2627 Blocpdb> 22 atoms in block 114 Block first atom: 2651 Blocpdb> 30 atoms in block 115 Block first atom: 2673 Blocpdb> 24 atoms in block 116 Block first atom: 2703 Blocpdb> 21 atoms in block 117 Block first atom: 2727 Blocpdb> 16 atoms in block 118 Block first atom: 2748 Blocpdb> 30 atoms in block 119 Block first atom: 2764 Blocpdb> 20 atoms in block 120 Block first atom: 2794 Blocpdb> 19 atoms in block 121 Block first atom: 2814 Blocpdb> 24 atoms in block 122 Block first atom: 2833 Blocpdb> 16 atoms in block 123 Block first atom: 2857 Blocpdb> 20 atoms in block 124 Block first atom: 2873 Blocpdb> 21 atoms in block 125 Block first atom: 2893 Blocpdb> 26 atoms in block 126 Block first atom: 2914 Blocpdb> 28 atoms in block 127 Block first atom: 2940 Blocpdb> 25 atoms in block 128 Block first atom: 2968 Blocpdb> 22 atoms in block 129 Block first atom: 2993 Blocpdb> 20 atoms in block 130 Block first atom: 3015 Blocpdb> 32 atoms in block 131 Block first atom: 3035 Blocpdb> 21 atoms in block 132 Block first atom: 3067 Blocpdb> 22 atoms in block 133 Block first atom: 3088 Blocpdb> 29 atoms in block 134 Block first atom: 3110 Blocpdb> 22 atoms in block 135 Block first atom: 3139 Blocpdb> 27 atoms in block 136 Block first atom: 3161 Blocpdb> 23 atoms in block 137 Block first atom: 3188 Blocpdb> 20 atoms in block 138 Block first atom: 3211 Blocpdb> 29 atoms in block 139 Block first atom: 3231 Blocpdb> 12 atoms in block 140 Block first atom: 3259 Blocpdb> 140 blocks. Blocpdb> At most, 32 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 12 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1190704 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 9813 Prepmat> Matrix trace = 2602440.0000 Prepmat> Last element read: 9813 9813 158.1466 Prepmat> 9871 lines saved. Prepmat> 8557 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3271 RTB> Total mass = 3271.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3271 RTB> Number of blocks = 140 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 174026.5897 RTB> 45168 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 840 Diagstd> Nb of non-zero elements: 45168 Diagstd> Projected matrix trace = 174026.5897 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 840 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 174026.5897 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0522287 0.0881601 0.2724615 0.8420501 1.4373352 1.9242480 2.2474201 3.4450335 4.2338443 4.8328952 5.3532357 7.1908771 7.4591432 8.0582847 8.6812459 8.8847935 10.5791542 11.0089460 12.4110000 13.2619700 13.7336382 14.6629357 14.9157076 15.5872528 16.1274294 17.4770219 18.3124743 18.9319974 19.9185739 20.0467009 21.5622967 22.2569131 22.7947499 23.1632907 23.6972216 24.6530472 25.1942995 26.4700332 26.8290885 27.8425825 28.6047333 29.2123417 30.5754425 30.9833275 31.4009488 32.2632099 32.8802475 34.2669973 34.6600809 35.2755231 36.0336437 36.3439191 36.7631444 37.6470196 38.7918117 39.4882505 39.8986399 40.5540096 41.3425041 41.6913107 42.1216802 42.7586285 43.2023545 43.5813127 44.1228449 44.9581948 45.4610933 45.8503752 46.5324353 47.2035324 47.6333681 48.1571652 49.0686417 50.4676349 50.9266868 51.9836373 52.3903874 52.7581246 53.4757681 53.7545836 54.0893445 54.8295749 55.8510101 56.3079287 56.6169115 57.5057633 57.8974727 58.1387121 59.3874848 59.5477439 60.0568096 60.8803411 61.4128006 61.7522018 62.4070257 62.5694114 63.2367911 63.7482871 64.4751522 65.5734882 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034330 0.0034331 0.0034335 0.0034341 0.0034342 24.8170278 32.2426852 56.6823549 99.6470015 130.1890045 150.6349701 162.7936313 201.5542719 223.4409242 238.7255856 251.2484915 291.1965419 296.5785607 308.2595805 319.9530905 323.6822976 353.2000477 360.3032256 382.5592157 395.4570311 402.4278997 415.8203549 419.3891691 428.7262450 436.0917346 453.9719250 464.6958509 472.4909543 484.6457412 486.2019942 504.2463798 512.3039979 518.4569440 522.6312919 528.6204926 539.1760387 545.0626509 558.6920906 562.4685441 572.9939515 580.7834497 586.9194021 600.4566454 604.4485067 608.5085233 616.8066779 622.6769931 635.6723267 639.3078928 644.9588579 651.8525525 654.6529948 658.4178638 666.2858348 676.3403714 682.3846154 685.9213583 691.5318382 698.2222257 701.1614887 704.7711594 710.0798088 713.7547121 716.8782989 721.3184384 728.1145553 732.1755431 735.3036596 740.7525778 746.0750731 749.4642571 753.5737073 760.6717689 771.4392944 774.9398454 782.9402356 785.9973564 788.7510579 794.0974401 796.1649074 798.6401496 804.0864052 811.5416175 814.8544777 817.0871257 823.4760383 826.2758958 827.9955142 836.8406080 837.9689682 841.5431880 847.2933911 850.9905392 853.3388216 857.8513173 858.9666752 863.5354922 867.0208474 871.9497715 879.3452531 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3271 Rtb_to_modes> Number of blocs = 140 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9907E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.2229E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.8160E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2725 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8421 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.437 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.924 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.247 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.445 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.234 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.833 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.353 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.191 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.459 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.058 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.681 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.885 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.57 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 840 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99994 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00005 1.00004 1.00007 1.00001 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 0.99996 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 58878 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00001 0.99994 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 1.00005 1.00004 1.00007 1.00001 1.00003 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998 0.99996 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 0.99998 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220114105920126917.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220114105920126917.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 220114105920126917.atom Openam> file on opening on unit 11: 220114105920126917.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 416 First residue number = 1 Last residue number = 420 Number of atoms found = 3271 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9907E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9971E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.2229E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.8160E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2725 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8421 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.437 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.924 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.247 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.445 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.234 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.833 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.353 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.191 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.459 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.058 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.681 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.885 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.57 Bfactors> 106 vectors, 9813 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.052229 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.348 for 416 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.201 +/- 0.44 Bfactors> = 81.213 +/- 16.50 Bfactors> Shiftng-fct= 81.012 Bfactors> Scaling-fct= 37.581 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 220114105920126917.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220114105920126917.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.3 Chkmod> 106 vectors, 9813 coordinates in file. Chkmod> That is: 3271 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 14 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 22 is: 1.0002 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9982 0.0034 0.6604 0.0034 0.9711 0.0034 0.7817 0.0034 0.4672 0.0034 0.7315 24.8160 0.3469 32.2413 0.2759 56.6839 0.0827 99.6457 0.4194 130.1682 0.3479 150.6188 0.4304 162.7714 0.6230 201.5446 0.1602 223.4354 0.4837 238.7179 0.0942 251.2322 0.5419 291.1865 0.6427 296.5630 0.6683 308.2409 0.2279 319.9348 0.2376 323.6722 0.1625 353.1990 0.6661 360.3050 0.4087 382.5274 0.5497 395.4107 0.1569 402.3573 0.5980 415.7609 0.3418 419.4315 0.2973 428.7456 0.5066 436.1078 0.4500 453.9911 0.4509 464.6445 0.4719 472.4457 0.4269 484.6423 0.3465 486.2211 0.3853 504.1979 0.5166 512.3175 0.3914 518.3807 0.4126 522.5717 0.3471 528.6288 0.2606 539.1196 0.1575 544.9927 0.3185 558.6678 0.3977 562.4540 0.3634 572.9428 0.3844 580.7105 0.4432 586.8707 0.3960 600.4756 0.5844 604.3901 0.4809 608.4732 0.5388 616.7495 0.3950 622.6479 0.4851 635.6729 0.6082 639.2797 0.4511 644.9721 0.5078 651.7916 0.2262 654.5896 0.4164 658.3614 0.3720 666.2836 0.5155 676.2955 0.2611 682.3704 0.5117 685.9036 0.4839 691.4680 0.4746 698.1711 0.3768 701.1204 0.2332 704.7268 0.4703 710.0607 0.5475 713.7046 0.4952 716.8367 0.3210 721.2642 0.4776 728.0979 0.5663 732.1353 0.3243 735.2691 0.3755 740.7014 0.4511 746.0151 0.3721 749.4056 0.5574 753.5635 0.4106 760.6496 0.3689 771.4243 0.3909 774.9318 0.3114 782.8792 0.4062 785.9607 0.3964 788.7312 0.4745 794.0948 0.4437 796.0968 0.3331 798.6107 0.4921 804.0550 0.4803 811.4994 0.4739 814.8345 0.4520 817.0743 0.3383 823.4710 0.4746 826.2585 0.0967 827.9691 0.4656 836.8224 0.3227 837.9489 0.4826 841.5294 0.0581 847.2546 0.5032 850.9346 0.4455 853.2870 0.4447 857.8349 0.4146 858.9338 0.5580 863.5203 0.5278 866.9953 0.3817 871.9451 0.4208 879.2841 0.4535 project conformational change on normal modes Projmod> Version 1.36, April 2003. Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors. Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ? Getnam> 220114105920126917.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 220114105920126917.eigenfacs Getnam> Pdb file with the reference structure ? Getnam> 220114105920126917.atom Openam> file on opening on unit 11: 220114105920126917.atom Getnam> Pdb file with the other conformer ? Getnam> 220114105920126917.atom2 Openam> file on opening on unit 12: 220114105920126917.atom2 Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n) Getrep> F Projmod> All masses will all be assumed to be of 1. Getrep> Displacement along one mode ? (y/n) Getrep> F Openam> file on opening on unit 13: projmod.res Openam> file on opening on unit 14: dr.res Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 24.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 32.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 99.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 130.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 223.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 251.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 782.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 798.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 837.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 841.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 850.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 871.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.3 Projmod> 106 vectors, 9813 coordinates in file. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 416 First residue number = 1 Last residue number = 420 Number of atoms found = 3271 Mean number per residue = 7.9 Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 416 First residue number = 1 Last residue number = 420 Number of atoms found = 3271 Mean number per residue = 7.9 Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number). Projmod> 3271 atoms are considered. Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 0.00 Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00 Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum. Vector: 1 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 2 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 3 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 4 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 5 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 6 F= 0.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 7 F= 24.82 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 8 F= 32.24 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 9 F= 56.68 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 10 F= 99.65 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 11 F= 130.17 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 12 F= 150.62 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 13 F= 162.77 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 %Projmod-Wn> Eigenvector 14 Norm= 0.9999 Vector: 14 F= 201.54 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 15 F= 223.44 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 16 F= 238.72 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 17 F= 251.23 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 18 F= 291.19 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 19 F= 296.56 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 20 F= 308.24 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 21 F= 319.93 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 %Projmod-Wn> Eigenvector 22 Norm= 1.0002 Vector: 22 F= 323.67 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 23 F= 353.20 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 24 F= 360.31 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 25 F= 382.53 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 26 F= 395.41 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 27 F= 402.36 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 28 F= 415.76 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 29 F= 419.43 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 30 F= 428.75 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 31 F= 436.11 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 32 F= 453.99 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 33 F= 464.64 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 34 F= 472.45 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 35 F= 484.64 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 36 F= 486.22 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 37 F= 504.20 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 38 F= 512.32 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 39 F= 518.38 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 40 F= 522.57 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 41 F= 528.63 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 42 F= 539.12 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 43 F= 544.99 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 44 F= 558.67 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 45 F= 562.45 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 46 F= 572.94 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 47 F= 580.71 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 48 F= 586.87 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 49 F= 600.48 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 50 F= 604.39 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 51 F= 608.47 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 52 F= 616.75 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 53 F= 622.65 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 54 F= 635.67 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 55 F= 639.28 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 56 F= 644.97 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 57 F= 651.79 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 58 F= 654.59 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 59 F= 658.36 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 60 F= 666.28 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 61 F= 676.30 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 62 F= 682.37 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 63 F= 685.90 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 64 F= 691.47 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 65 F= 698.17 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 66 F= 701.12 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 67 F= 704.73 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 68 F= 710.06 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 69 F= 713.70 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 70 F= 716.84 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 71 F= 721.26 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 72 F= 728.10 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 73 F= 732.14 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 74 F= 735.27 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 75 F= 740.70 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 76 F= 746.02 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 77 F= 749.41 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 78 F= 753.56 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 79 F= 760.65 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 80 F= 771.42 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 81 F= 774.93 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 82 F= 782.88 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 83 F= 785.96 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 84 F= 788.73 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 85 F= 794.09 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 86 F= 796.10 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 87 F= 798.61 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 88 F= 804.06 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 89 F= 811.50 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 90 F= 814.83 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 91 F= 817.07 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 92 F= 823.47 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 93 F= 826.26 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 94 F= 827.97 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 95 F= 836.82 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 96 F= 837.95 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 97 F= 841.53 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 98 F= 847.25 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 99 F= 850.93 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 100 F= 853.29 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 101 F= 857.83 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 102 F= 858.93 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 103 F= 863.52 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 104 F= 867.00 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 105 F= 871.95 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Vector: 106 F= 879.28 Cos= NaN Sum= NaN q= 0.0000 Projmod> Best zero-frequency found : 0.003432 Projmod> 6 frequencies less than: 0.003434 Projmod> Lowest non-zero frequency : 24.816041 Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.00 for mode -1 with F= 0.00 cm-1. Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = NaN NaN NaN NaN NaN NaN Projmod> Normal end. getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 220114105920126917 7 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom making animated gifs 11 models are in 220114105920126917.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220114105920126917.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220114105920126917.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 416 1.802 389 0.817 MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 416 1.441 391 0.742 MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 416 1.081 404 0.868 MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 416 0.721 416 0.721 MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 416 0.360 416 0.360 MODEL 6 MODE=7 DQ=0 416 0.000 416 0.000 MODEL 7 MODE=7 DQ=20 416 0.360 416 0.360 MODEL 8 MODE=7 DQ=40 416 0.721 416 0.721 MODEL 9 MODE=7 DQ=60 416 1.081 404 0.868 MODEL 10 MODE=7 DQ=80 416 1.441 391 0.740 MODEL 11 MODE=7 DQ=100 416 1.802 389 0.813 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 220114105920126917 8 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom making animated gifs 11 models are in 220114105920126917.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220114105920126917.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220114105920126917.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 416 1.793 388 0.669 MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 416 1.435 391 0.665 MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 416 1.076 399 0.715 MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 416 0.717 416 0.717 MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 416 0.359 416 0.359 MODEL 6 MODE=8 DQ=0 416 0.000 416 0.000 MODEL 7 MODE=8 DQ=20 416 0.359 416 0.359 MODEL 8 MODE=8 DQ=40 416 0.717 416 0.717 MODEL 9 MODE=8 DQ=60 416 1.076 399 0.714 MODEL 10 MODE=8 DQ=80 416 1.435 391 0.664 MODEL 11 MODE=8 DQ=100 416 1.793 388 0.667 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 220114105920126917 9 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom making animated gifs 11 models are in 220114105920126917.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220114105920126917.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220114105920126917.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 416 1.739 389 0.467 MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 416 1.391 393 0.462 MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 416 1.044 398 0.453 MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 416 0.696 409 0.513 MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 416 0.348 416 0.348 MODEL 6 MODE=9 DQ=0 416 0.000 416 0.000 MODEL 7 MODE=9 DQ=20 416 0.348 416 0.348 MODEL 8 MODE=9 DQ=40 416 0.696 409 0.513 MODEL 9 MODE=9 DQ=60 416 1.044 398 0.453 MODEL 10 MODE=9 DQ=80 416 1.391 393 0.462 MODEL 11 MODE=9 DQ=100 416 1.739 389 0.467 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 220114105920126917 10 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom making animated gifs 11 models are in 220114105920126917.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220114105920126917.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220114105920126917.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 416 1.723 380 1.076 MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 416 1.379 389 0.993 MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 416 1.034 410 0.961 MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 416 0.689 416 0.689 MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 416 0.345 416 0.345 MODEL 6 MODE=10 DQ=0 416 0.000 416 0.000 MODEL 7 MODE=10 DQ=20 416 0.345 416 0.345 MODEL 8 MODE=10 DQ=40 416 0.689 416 0.689 MODEL 9 MODE=10 DQ=60 416 1.034 410 0.961 MODEL 10 MODE=10 DQ=80 416 1.379 389 0.994 MODEL 11 MODE=10 DQ=100 416 1.723 380 1.077 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 220114105920126917 11 -100 100 20 on on normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=0 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=20 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=40 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=60 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=80 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom calculating perturbed structure for DQ=100 220114105920126917.eigenfacs 220114105920126917.atom making animated gifs 11 models are in 220114105920126917.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220114105920126917.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 220114105920126917.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 compute RMSD to second conformer MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 416 1.714 385 1.105 MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 416 1.371 392 0.980 MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 416 1.029 408 0.910 MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 416 0.686 416 0.686 MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 416 0.343 416 0.343 MODEL 6 MODE=11 DQ=0 416 0.000 416 0.000 MODEL 7 MODE=11 DQ=20 416 0.343 416 0.343 MODEL 8 MODE=11 DQ=40 416 0.686 416 0.686 MODEL 9 MODE=11 DQ=60 416 1.029 408 0.910 MODEL 10 MODE=11 DQ=80 416 1.371 392 0.980 MODEL 11 MODE=11 DQ=100 416 1.714 385 1.104 220114105920126917.10.pdb 220114105920126917.11.pdb 220114105920126917.7.pdb 220114105920126917.8.pdb 220114105920126917.9.pdb STDERR: real 0m9.703s user 0m9.660s sys 0m0.040s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.