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***  TRANSPORT PROTEIN 02-MAY-09 3HAP  ***

LOGs for ID: 21111011205899072

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21111011205899072.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21111011205899072.atom to be opened. Openam> File opened: 21111011205899072.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 226 First residue number = 6 Last residue number = 231 Number of atoms found = 1914 Mean number per residue = 8.5 Pdbmat> Coordinate statistics: = 20.697971 +/- 8.491817 From: 2.530000 To: 40.740000 = 15.046947 +/- 7.712902 From: -2.235000 To: 35.904000 = 3.949479 +/- 14.122394 From: -26.809000 To: 34.826000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 4.6484 % Filled. Pdbmat> 766431 non-zero elements. Pdbmat> 83898 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 87.67 +/- 22.19 Maximum number = 137 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 1.677960E+06 Pdbmat> Larger element = 541.027 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 226 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21111011205899072.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21111011205899072.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21111011205899072.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 1914 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 226 residues. Blocpdb> 23 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 16 atoms in block 2 Block first atom: 24 Blocpdb> 22 atoms in block 3 Block first atom: 40 Blocpdb> 22 atoms in block 4 Block first atom: 62 Blocpdb> 18 atoms in block 5 Block first atom: 84 Blocpdb> 15 atoms in block 6 Block first atom: 102 Blocpdb> 13 atoms in block 7 Block first atom: 117 Blocpdb> 12 atoms in block 8 Block first atom: 130 Blocpdb> 12 atoms in block 9 Block first atom: 142 Blocpdb> 20 atoms in block 10 Block first atom: 154 Blocpdb> 23 atoms in block 11 Block first atom: 174 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 197 Blocpdb> 13 atoms in block 13 Block first atom: 217 Blocpdb> 17 atoms in block 14 Block first atom: 230 Blocpdb> 20 atoms in block 15 Block first atom: 247 Blocpdb> 15 atoms in block 16 Block first atom: 267 Blocpdb> 13 atoms in block 17 Block first atom: 282 Blocpdb> 24 atoms in block 18 Block first atom: 295 Blocpdb> 23 atoms in block 19 Block first atom: 319 Blocpdb> 13 atoms in block 20 Block first atom: 342 Blocpdb> 14 atoms in block 21 Block first atom: 355 Blocpdb> 20 atoms in block 22 Block first atom: 369 Blocpdb> 12 atoms in block 23 Block first atom: 389 Blocpdb> 13 atoms in block 24 Block first atom: 401 Blocpdb> 22 atoms in block 25 Block first atom: 414 Blocpdb> 25 atoms in block 26 Block first atom: 436 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 461 Blocpdb> 16 atoms in block 28 Block first atom: 478 Blocpdb> 12 atoms in block 29 Block first atom: 494 Blocpdb> 16 atoms in block 30 Block first atom: 506 Blocpdb> 15 atoms in block 31 Block first atom: 522 Blocpdb> 15 atoms in block 32 Block first atom: 537 Blocpdb> 18 atoms in block 33 Block first atom: 552 Blocpdb> 8 atoms in block 34 Block first atom: 570 Blocpdb> 18 atoms in block 35 Block first atom: 578 Blocpdb> 15 atoms in block 36 Block first atom: 596 Blocpdb> 20 atoms in block 37 Block first atom: 611 Blocpdb> 19 atoms in block 38 Block first atom: 631 Blocpdb> 23 atoms in block 39 Block first atom: 650 Blocpdb> 13 atoms in block 40 Block first atom: 673 Blocpdb> 27 atoms in block 41 Block first atom: 686 Blocpdb> 18 atoms in block 42 Block first atom: 713 Blocpdb> 14 atoms in block 43 Block first atom: 731 Blocpdb> 16 atoms in block 44 Block first atom: 745 Blocpdb> 21 atoms in block 45 Block first atom: 761 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 782 Blocpdb> 13 atoms in block 47 Block first atom: 798 Blocpdb> 20 atoms in block 48 Block first atom: 811 Blocpdb> 18 atoms in block 49 Block first atom: 831 Blocpdb> 17 atoms in block 50 Block first atom: 849 Blocpdb> 15 atoms in block 51 Block first atom: 866 Blocpdb> 16 atoms in block 52 Block first atom: 881 Blocpdb> 10 atoms in block 53 Block first atom: 897 Blocpdb> 11 atoms in block 54 Block first atom: 907 Blocpdb> 13 atoms in block 55 Block first atom: 918 Blocpdb> 12 atoms in block 56 Block first atom: 931 Blocpdb> 16 atoms in block 57 Block first atom: 943 Blocpdb> 11 atoms in block 58 Block first atom: 959 Blocpdb> 12 atoms in block 59 Block first atom: 970 Blocpdb> 11 atoms in block 60 Block first atom: 982 Blocpdb> 13 atoms in block 61 Block first atom: 993 Blocpdb> 16 atoms in block 62 Block first atom: 1006 Blocpdb> 19 atoms in block 63 Block first atom: 1022 Blocpdb> 21 atoms in block 64 Block first atom: 1041 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1062 Blocpdb> 21 atoms in block 66 Block first atom: 1084 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1105 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1124 Blocpdb> 16 atoms in block 69 Block first atom: 1138 Blocpdb> 18 atoms in block 70 Block first atom: 1154 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1172 Blocpdb> 16 atoms in block 72 Block first atom: 1192 Blocpdb> 23 atoms in block 73 Block first atom: 1208 Blocpdb> 19 atoms in block 74 Block first atom: 1231 Blocpdb> 15 atoms in block 75 Block first atom: 1250 Blocpdb> 18 atoms in block 76 Block first atom: 1265 Blocpdb> 18 atoms in block 77 Block first atom: 1283 Blocpdb> 26 atoms in block 78 Block first atom: 1301 Blocpdb> 17 atoms in block 79 Block first atom: 1327 Blocpdb> 26 atoms in block 80 Block first atom: 1344 Blocpdb> 22 atoms in block 81 Block first atom: 1370 Blocpdb> 14 atoms in block 82 Block first atom: 1392 Blocpdb> 18 atoms in block 83 Block first atom: 1406 Blocpdb> 16 atoms in block 84 Block first atom: 1424 Blocpdb> 19 atoms in block 85 Block first atom: 1440 Blocpdb> 15 atoms in block 86 Block first atom: 1459 Blocpdb> 14 atoms in block 87 Block first atom: 1474 Blocpdb> 15 atoms in block 88 Block first atom: 1488 Blocpdb> 20 atoms in block 89 Block first atom: 1503 Blocpdb> 17 atoms in block 90 Block first atom: 1523 Blocpdb> 14 atoms in block 91 Block first atom: 1540 Blocpdb> 21 atoms in block 92 Block first atom: 1554 Blocpdb> 16 atoms in block 93 Block first atom: 1575 Blocpdb> 13 atoms in block 94 Block first atom: 1591 Blocpdb> 13 atoms in block 95 Block first atom: 1604 Blocpdb> 9 atoms in block 96 Block first atom: 1617 Blocpdb> 15 atoms in block 97 Block first atom: 1626 Blocpdb> 15 atoms in block 98 Block first atom: 1641 Blocpdb> 21 atoms in block 99 Block first atom: 1656 Blocpdb> 16 atoms in block 100 Block first atom: 1677 Blocpdb> 16 atoms in block 101 Block first atom: 1693 Blocpdb> 24 atoms in block 102 Block first atom: 1709 Blocpdb> 15 atoms in block 103 Block first atom: 1733 Blocpdb> 15 atoms in block 104 Block first atom: 1748 Blocpdb> 11 atoms in block 105 Block first atom: 1763 Blocpdb> 16 atoms in block 106 Block first atom: 1774 Blocpdb> 15 atoms in block 107 Block first atom: 1790 Blocpdb> 12 atoms in block 108 Block first atom: 1805 Blocpdb> 16 atoms in block 109 Block first atom: 1817 Blocpdb> 27 atoms in block 110 Block first atom: 1833 Blocpdb> 28 atoms in block 111 Block first atom: 1860 Blocpdb> 13 atoms in block 112 Block first atom: 1888 Blocpdb> 14 atoms in block 113 Block first atom: 1900 Blocpdb> 113 blocks. Blocpdb> At most, 28 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 766544 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 5742 Prepmat> Matrix trace = 1677960.0000 Prepmat> Last element read: 5742 5742 216.0788 Prepmat> 6442 lines saved. Prepmat> 5203 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1914 RTB> Total mass = 1914.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 1914 RTB> Number of blocks = 113 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 168184.0318 RTB> 42873 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 678 Diagstd> Nb of non-zero elements: 42873 Diagstd> Projected matrix trace = 168184.0318 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 678 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 168184.0318 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 3.3639292 4.0013547 7.2646379 9.7603724 10.9836335 12.8487567 13.1547637 14.5133561 14.6274287 16.1360561 18.4636260 19.6848533 20.7209081 23.6084625 24.8896535 25.8934365 27.7396331 28.6343300 29.2170129 30.6827591 31.9619959 34.3129368 35.4242276 36.4360522 37.2281662 37.6852610 38.4877030 38.8497554 41.5614825 42.0598154 42.3293882 43.8195431 45.8823621 46.9642067 47.9990458 49.2731995 49.4306808 51.7777408 52.5093476 53.0170307 53.9749492 54.9414725 55.7594026 56.2925963 57.9042768 59.9185768 61.3023698 62.1846497 62.8996689 64.3486993 65.1577308 66.5099218 67.5770307 68.3250451 69.1031524 69.9413944 71.0275430 72.2521226 72.5581020 73.8783600 74.5339389 74.9494608 75.5628602 76.5140054 76.8621390 78.0585298 79.2335055 80.4961261 81.8939725 82.8719577 83.6569159 85.0084228 85.8997525 86.2138818 88.4680962 89.1043844 89.3604566 90.6536028 91.5434740 91.7739887 92.0753695 93.1651630 94.1842510 95.5697705 95.9353006 96.5528216 96.9192486 97.8878426 98.8742594 100.3117377 100.7947338 101.8843024 102.4471804 103.3341318 105.1529282 105.5204324 106.4775299 106.8497646 108.4909098 109.8167684 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034320 0.0034327 0.0034329 0.0034330 0.0034335 0.0034339 199.1676052 217.2194975 292.6862134 339.2567327 359.8887714 389.2475014 393.8554016 413.6939838 415.3165859 436.2083532 466.6097165 481.7939822 494.3103147 527.6295775 541.7572168 552.5735935 571.9336338 581.0838334 586.9663253 601.5094928 613.9206279 636.0982860 646.3168446 655.4822533 662.5689846 666.6241520 673.6840676 676.8453108 700.0689171 704.2534143 706.5066860 718.8349803 735.5601019 744.1813394 752.3355473 762.2556675 763.4728126 781.3881649 786.8892124 790.6840544 797.7951676 804.9064871 810.8757942 814.7435296 826.3244462 840.5741397 850.2250806 856.3215553 861.2306154 871.0942895 876.5531519 885.6018171 892.6780025 897.6049598 902.7015955 908.1601130 915.1845420 923.0401354 924.9925551 933.3701407 937.5022460 940.1118712 943.9510511 949.8734502 952.0319277 959.4127018 966.6065096 974.2777182 982.7006639 988.5509996 993.2217132 1001.2124919 1006.4477577 1008.2863320 1021.3829903 1025.0494507 1026.5213111 1033.9220912 1038.9842762 1040.2915815 1041.9983123 1048.1466592 1053.8636485 1061.5869025 1063.6151153 1067.0327894 1069.0556162 1074.3843133 1079.7840353 1087.6049041 1090.2201418 1096.0968215 1099.1204424 1103.8680863 1113.5403682 1115.4845548 1120.5320016 1122.4889258 1131.0764392 1137.9668477 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1914 Rtb_to_modes> Number of blocs = 113 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9888E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9924E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9936E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.364 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.001 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.265 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.760 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> 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Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99997 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 0.99996 1.00002 1.00000 1.00002 1.00002 1.00001 0.99997 1.00001 1.00003 1.00001 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 0.99996 0.99999 1.00001 1.00003 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 0.99997 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00004 1.00001 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 0.99997 0.99997 1.00001 0.99999 0.99996 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21111011205899072.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21111011205899072.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21111011205899072.atom Openam> file on opening on unit 11: 21111011205899072.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 226 First residue number = 6 Last residue number = 231 Number of atoms found = 1914 Mean number per residue = 8.5 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9888E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9924E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9936E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9945E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9996E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.364 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.001 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.265 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.760 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.89 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lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.8 Bfactors> 106 vectors, 5742 coordinates in file. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 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vecteur en lecture: 735.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 786.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 892.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 897.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 923.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.1 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vecteur en lecture: 1001. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1021. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1025. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1034. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1039. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1090. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1096. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1099. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1104. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1114. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1115. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1121. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1122. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1131. 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Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7684 0.0034 0.8958 0.0034 0.7624 0.0034 0.8382 0.0034 0.7006 0.0034 0.6515 199.1612 0.6093 217.2005 0.7027 292.6809 0.6833 339.2357 0.3151 359.8138 0.4783 389.2496 0.6010 393.7672 0.6030 413.6284 0.6255 415.3353 0.2618 436.2429 0.2842 466.5439 0.5277 481.7139 0.3812 494.2783 0.3793 527.6241 0.3491 541.7377 0.2166 552.5132 0.4484 571.9129 0.6352 581.0150 0.4322 586.9711 0.5701 601.4566 0.4690 613.8751 0.4434 636.0438 0.5482 646.2505 0.5084 655.4896 0.5012 662.5569 0.5637 666.6374 0.5305 673.6753 0.1951 676.8184 0.6363 700.0264 0.1991 704.2247 0.4422 706.4815 0.4811 718.8079 0.5117 735.5096 0.5906 744.1161 0.4767 752.3107 0.6041 762.1982 0.5360 763.4348 0.4017 781.3717 0.4406 786.8603 0.4563 790.6723 0.5052 797.7243 0.3367 804.8611 0.4979 810.8453 0.4644 814.6898 0.4485 826.2585 0.4084 840.5480 0.4109 850.1721 0.5404 856.2528 0.6049 861.1959 0.4559 871.0657 0.5646 876.5308 0.5647 885.5643 0.5422 892.6593 0.4940 897.5990 0.3882 902.6423 0.5566 908.1121 0.4871 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