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LOGs for ID: 211108205108114614

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 211108205108114614.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 211108205108114614.atom to be opened. Openam> File opened: 211108205108114614.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 763 First residue number = 19 Last residue number = 400 Number of atoms found = 5944 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 10.640102 +/- 15.118541 From: -25.534000 To: 44.799000 = 15.061370 +/- 16.309636 From: -28.462000 To: 53.508000 = -29.566402 +/- 21.285495 From: -74.153000 To: 20.415000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.4122 % Filled. Pdbmat> 2245307 non-zero elements. Pdbmat> 245562 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 82.63 +/- 21.02 Maximum number = 125 Minimum number = 14 Pdbmat> Matrix trace = 4.911240E+06 Pdbmat> Larger element = 487.019 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 763 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 211108205108114614.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 211108205108114614.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 211108205108114614.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5944 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 763 residues. Blocpdb> 24 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 28 atoms in block 2 Block first atom: 25 Blocpdb> 30 atoms in block 3 Block first atom: 53 Blocpdb> 23 atoms in block 4 Block first atom: 83 Blocpdb> 40 atoms in block 5 Block first atom: 106 Blocpdb> 30 atoms in block 6 Block first atom: 146 Blocpdb> 30 atoms in block 7 Block first atom: 176 Blocpdb> 29 atoms in block 8 Block first atom: 206 Blocpdb> 32 atoms in block 9 Block first atom: 235 Blocpdb> 30 atoms in block 10 Block first atom: 267 Blocpdb> 34 atoms in block 11 Block first atom: 297 Blocpdb> 41 atoms in block 12 Block first atom: 331 Blocpdb> 22 atoms in block 13 Block first atom: 372 Blocpdb> 33 atoms in block 14 Block first atom: 394 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 427 Blocpdb> 31 atoms in block 16 Block first atom: 458 Blocpdb> 33 atoms in block 17 Block first atom: 489 Blocpdb> 31 atoms in block 18 Block first atom: 522 Blocpdb> 39 atoms in block 19 Block first atom: 553 Blocpdb> 29 atoms in block 20 Block first atom: 592 Blocpdb> 31 atoms in block 21 Block first atom: 621 Blocpdb> 38 atoms in block 22 Block first atom: 652 Blocpdb> 34 atoms in block 23 Block first atom: 690 Blocpdb> 40 atoms in block 24 Block first atom: 724 Blocpdb> 32 atoms in block 25 Block first atom: 764 Blocpdb> 29 atoms in block 26 Block first atom: 796 Blocpdb> 39 atoms in block 27 Block first atom: 825 Blocpdb> 38 atoms in block 28 Block first atom: 864 Blocpdb> 33 atoms in block 29 Block first atom: 902 Blocpdb> 27 atoms in block 30 Block first atom: 935 Blocpdb> 33 atoms in block 31 Block first atom: 962 Blocpdb> 34 atoms in block 32 Block first atom: 995 Blocpdb> 32 atoms in block 33 Block first atom: 1029 Blocpdb> 32 atoms in block 34 Block first atom: 1061 Blocpdb> 30 atoms in block 35 Block first atom: 1093 Blocpdb> 28 atoms in block 36 Block first atom: 1123 Blocpdb> 35 atoms in block 37 Block first atom: 1151 Blocpdb> 31 atoms in block 38 Block first atom: 1186 Blocpdb> 32 atoms in block 39 Block first atom: 1217 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 1249 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 1275 Blocpdb> 31 atoms in block 42 Block first atom: 1297 Blocpdb> 35 atoms in block 43 Block first atom: 1328 Blocpdb> 28 atoms in block 44 Block first atom: 1363 Blocpdb> 23 atoms in block 45 Block first atom: 1391 Blocpdb> 32 atoms in block 46 Block first atom: 1414 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1446 Blocpdb> 32 atoms in block 48 Block first atom: 1473 Blocpdb> 34 atoms in block 49 Block first atom: 1505 Blocpdb> 24 atoms in block 50 Block first atom: 1539 Blocpdb> 30 atoms in block 51 Block first atom: 1563 Blocpdb> 29 atoms in block 52 Block first atom: 1593 Blocpdb> 32 atoms in block 53 Block first atom: 1622 Blocpdb> 32 atoms in block 54 Block first atom: 1654 Blocpdb> 28 atoms in block 55 Block first atom: 1686 Blocpdb> 24 atoms in block 56 Block first atom: 1714 Blocpdb> 26 atoms in block 57 Block first atom: 1738 Blocpdb> 36 atoms in block 58 Block first atom: 1764 Blocpdb> 34 atoms in block 59 Block first atom: 1800 Blocpdb> 42 atoms in block 60 Block first atom: 1834 Blocpdb> 37 atoms in block 61 Block first atom: 1876 Blocpdb> 33 atoms in block 62 Block first atom: 1913 Blocpdb> 28 atoms in block 63 Block first atom: 1946 Blocpdb> 27 atoms in block 64 Block first atom: 1974 Blocpdb> 35 atoms in block 65 Block first atom: 2001 Blocpdb> 37 atoms in block 66 Block first atom: 2036 Blocpdb> 43 atoms in block 67 Block first atom: 2073 Blocpdb> 32 atoms in block 68 Block first atom: 2116 Blocpdb> 32 atoms in block 69 Block first atom: 2148 Blocpdb> 28 atoms in block 70 Block first atom: 2180 Blocpdb> 33 atoms in block 71 Block first atom: 2208 Blocpdb> 35 atoms in block 72 Block first atom: 2241 Blocpdb> 32 atoms in block 73 Block first atom: 2276 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 2308 Blocpdb> 33 atoms in block 75 Block first atom: 2334 Blocpdb> 37 atoms in block 76 Block first atom: 2367 Blocpdb> 31 atoms in block 77 Block first atom: 2404 Blocpdb> 34 atoms in block 78 Block first atom: 2435 Blocpdb> 27 atoms in block 79 Block first atom: 2469 Blocpdb> 33 atoms in block 80 Block first atom: 2496 Blocpdb> 26 atoms in block 81 Block first atom: 2529 Blocpdb> 36 atoms in block 82 Block first atom: 2555 Blocpdb> 31 atoms in block 83 Block first atom: 2591 Blocpdb> 29 atoms in block 84 Block first atom: 2622 Blocpdb> 21 atoms in block 85 Block first atom: 2651 Blocpdb> 46 atoms in block 86 Block first atom: 2672 Blocpdb> 29 atoms in block 87 Block first atom: 2718 Blocpdb> 37 atoms in block 88 Block first atom: 2747 Blocpdb> 32 atoms in block 89 Block first atom: 2784 Blocpdb> 31 atoms in block 90 Block first atom: 2816 Blocpdb> 28 atoms in block 91 Block first atom: 2847 Blocpdb> 29 atoms in block 92 Block first atom: 2875 Blocpdb> 26 atoms in block 93 Block first atom: 2904 Blocpdb> 26 atoms in block 94 Block first atom: 2930 Blocpdb> 29 atoms in block 95 Block first atom: 2956 Blocpdb> 4 atoms in block 96 Block first atom: 2985 Blocpdb> 24 atoms in block 97 Block first atom: 2989 Blocpdb> 28 atoms in block 98 Block first atom: 3013 Blocpdb> 30 atoms in block 99 Block first atom: 3041 Blocpdb> 23 atoms in block 100 Block first atom: 3071 Blocpdb> 40 atoms in block 101 Block first atom: 3094 Blocpdb> 30 atoms in block 102 Block first atom: 3134 Blocpdb> 30 atoms in block 103 Block first atom: 3164 Blocpdb> 29 atoms in block 104 Block first atom: 3194 Blocpdb> 32 atoms in block 105 Block first atom: 3223 Blocpdb> 30 atoms in block 106 Block first atom: 3255 Blocpdb> 34 atoms in block 107 Block first atom: 3285 Blocpdb> 36 atoms in block 108 Block first atom: 3319 Blocpdb> 22 atoms in block 109 Block first atom: 3355 Blocpdb> 41 atoms in block 110 Block first atom: 3377 Blocpdb> 31 atoms in block 111 Block first atom: 3418 Blocpdb> 31 atoms in block 112 Block first atom: 3449 Blocpdb> 33 atoms in block 113 Block first atom: 3480 Blocpdb> 31 atoms in block 114 Block first atom: 3513 Blocpdb> 39 atoms in block 115 Block first atom: 3544 Blocpdb> 25 atoms in block 116 Block first atom: 3583 Blocpdb> 31 atoms in block 117 Block first atom: 3608 Blocpdb> 38 atoms in block 118 Block first atom: 3639 Blocpdb> 34 atoms in block 119 Block first atom: 3677 Blocpdb> 31 atoms in block 120 Block first atom: 3711 Blocpdb> 32 atoms in block 121 Block first atom: 3742 Blocpdb> 29 atoms in block 122 Block first atom: 3774 Blocpdb> 33 atoms in block 123 Block first atom: 3803 Blocpdb> 38 atoms in block 124 Block first atom: 3836 Blocpdb> 33 atoms in block 125 Block first atom: 3874 Blocpdb> 27 atoms in block 126 Block first atom: 3907 Blocpdb> 33 atoms in block 127 Block first atom: 3934 Blocpdb> 34 atoms in block 128 Block first atom: 3967 Blocpdb> 32 atoms in block 129 Block first atom: 4001 Blocpdb> 32 atoms in block 130 Block first atom: 4033 Blocpdb> 39 atoms in block 131 Block first atom: 4065 Blocpdb> 28 atoms in block 132 Block first atom: 4104 Blocpdb> 35 atoms in block 133 Block first atom: 4132 Blocpdb> 39 atoms in block 134 Block first atom: 4167 Blocpdb> 32 atoms in block 135 Block first atom: 4206 Blocpdb> 26 atoms in block 136 Block first atom: 4238 Blocpdb> 22 atoms in block 137 Block first atom: 4264 Blocpdb> 31 atoms in block 138 Block first atom: 4286 Blocpdb> 35 atoms in block 139 Block first atom: 4317 Blocpdb> 28 atoms in block 140 Block first atom: 4352 Blocpdb> 23 atoms in block 141 Block first atom: 4380 Blocpdb> 32 atoms in block 142 Block first atom: 4403 Blocpdb> 29 atoms in block 143 Block first atom: 4435 Blocpdb> 32 atoms in block 144 Block first atom: 4464 Blocpdb> 34 atoms in block 145 Block first atom: 4496 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 4530 Blocpdb> 30 atoms in block 147 Block first atom: 4554 Blocpdb> 29 atoms in block 148 Block first atom: 4584 Blocpdb> 32 atoms in block 149 Block first atom: 4613 Blocpdb> 32 atoms in block 150 Block first atom: 4645 Blocpdb> 24 atoms in block 151 Block first atom: 4677 Blocpdb> 24 atoms in block 152 Block first atom: 4701 Blocpdb> 26 atoms in block 153 Block first atom: 4725 Blocpdb> 36 atoms in block 154 Block first atom: 4751 Blocpdb> 34 atoms in block 155 Block first atom: 4787 Blocpdb> 33 atoms in block 156 Block first atom: 4821 Blocpdb> 33 atoms in block 157 Block first atom: 4854 Blocpdb> 26 atoms in block 158 Block first atom: 4887 Blocpdb> 28 atoms in block 159 Block first atom: 4913 Blocpdb> 27 atoms in block 160 Block first atom: 4941 Blocpdb> 35 atoms in block 161 Block first atom: 4968 Blocpdb> 37 atoms in block 162 Block first atom: 5003 Blocpdb> 35 atoms in block 163 Block first atom: 5040 Blocpdb> 32 atoms in block 164 Block first atom: 5075 Blocpdb> 26 atoms in block 165 Block first atom: 5107 Blocpdb> 28 atoms in block 166 Block first atom: 5133 Blocpdb> 33 atoms in block 167 Block first atom: 5161 Blocpdb> 35 atoms in block 168 Block first atom: 5194 Blocpdb> 32 atoms in block 169 Block first atom: 5229 Blocpdb> 23 atoms in block 170 Block first atom: 5261 Blocpdb> 33 atoms in block 171 Block first atom: 5284 Blocpdb> 33 atoms in block 172 Block first atom: 5317 Blocpdb> 31 atoms in block 173 Block first atom: 5350 Blocpdb> 45 atoms in block 174 Block first atom: 5381 Blocpdb> 27 atoms in block 175 Block first atom: 5426 Blocpdb> 33 atoms in block 176 Block first atom: 5453 Blocpdb> 26 atoms in block 177 Block first atom: 5486 Blocpdb> 36 atoms in block 178 Block first atom: 5512 Blocpdb> 31 atoms in block 179 Block first atom: 5548 Blocpdb> 29 atoms in block 180 Block first atom: 5579 Blocpdb> 21 atoms in block 181 Block first atom: 5608 Blocpdb> 35 atoms in block 182 Block first atom: 5629 Blocpdb> 29 atoms in block 183 Block first atom: 5664 Blocpdb> 37 atoms in block 184 Block first atom: 5693 Blocpdb> 32 atoms in block 185 Block first atom: 5730 Blocpdb> 31 atoms in block 186 Block first atom: 5762 Blocpdb> 28 atoms in block 187 Block first atom: 5793 Blocpdb> 29 atoms in block 188 Block first atom: 5821 Blocpdb> 26 atoms in block 189 Block first atom: 5850 Blocpdb> 26 atoms in block 190 Block first atom: 5876 Blocpdb> 29 atoms in block 191 Block first atom: 5902 Blocpdb> 14 atoms in block 192 Block first atom: 5930 Blocpdb> 192 blocks. Blocpdb> At most, 46 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2245499 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 17832 Prepmat> Matrix trace = 4911240.0000 Prepmat> Last element read: 17832 17832 146.5793 Prepmat> 18529 lines saved. Prepmat> 16685 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5944 RTB> Total mass = 5944.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5944 RTB> Number of blocks = 192 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 237387.0110 RTB> 63468 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1152 Diagstd> Nb of non-zero elements: 63468 Diagstd> Projected matrix trace = 237387.0110 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1152 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 237387.0110 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4664771 0.5402493 0.9446583 1.6553021 2.0696827 2.7642555 2.8291382 3.3962279 4.1485545 4.4148008 4.8562380 5.6593726 6.1505098 6.4732918 7.0721714 7.1565130 8.2729939 8.7290560 9.5453649 9.7460024 10.4249964 11.4234855 11.6998706 12.5623809 12.8990667 13.3574597 13.8696620 14.7601182 15.4724753 16.4214098 17.1026525 17.3370902 17.3597760 17.9495420 18.5495404 20.3264366 20.5552201 21.0039677 22.2776767 22.4174517 23.1822001 23.6312819 24.2418994 24.8884259 25.2353386 25.6255004 26.6016055 26.8698432 26.9230068 27.6397247 27.8624645 28.1755648 29.1712493 29.3038993 29.6217066 30.3215018 30.4700554 31.2368031 32.1858911 32.8738394 33.3018308 34.7103457 35.0754178 35.5299921 35.9275209 36.7832809 37.0406482 37.5219101 37.8987752 38.0630959 38.6447648 39.0698669 39.5896606 39.9911786 40.1490622 40.3380036 41.4701613 41.9927962 42.0189727 42.8582079 42.9464400 43.1492122 43.6804813 43.9819318 44.4336077 44.7174907 45.3086886 45.8504597 46.1323590 46.5749396 46.7952201 47.8523306 47.8861983 48.5549309 48.7384774 49.0240668 49.1829945 49.7541176 49.9087521 50.0632438 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034331 0.0034333 0.0034337 0.0034341 0.0034341 74.1669525 79.8164495 105.5437819 139.7120662 156.2237878 180.5445452 182.6511293 200.1214738 221.1788930 228.1659520 239.3014135 258.3327255 269.3089807 276.2853599 288.7830295 290.4999167 312.3392997 320.8329169 335.4992453 339.0068992 350.6172165 367.0241131 371.4375523 384.8852414 390.0088160 396.8781747 404.4158979 417.1960604 427.1448549 440.0484546 449.0834148 452.1508845 452.4466105 460.0679355 467.6940629 489.5825222 492.3300513 497.6751447 512.5429087 514.1482964 522.8445736 527.8845126 534.6611185 541.7438570 545.5063974 549.7072409 560.0788904 562.8955902 563.4521759 570.9027525 573.1984987 576.4101182 586.5064528 587.8384467 591.0174695 597.9579359 599.4209284 606.9159765 616.0671459 622.6163121 626.6561921 639.7712938 643.1269466 647.2809654 650.8919581 658.5981585 660.8982008 665.1778049 668.5099382 669.9576260 675.0572635 678.7600078 683.2602724 686.7163414 688.0705701 689.6876998 699.2993787 703.6921033 703.9113946 710.9061709 711.6375647 713.3155896 717.6934583 720.1656965 723.8541494 726.1627932 730.9472331 735.3043371 737.5612839 741.0908150 742.8412765 751.1848621 751.4506426 756.6794688 758.1083136 760.3261857 761.5576128 765.9665324 767.1559109 768.3423531 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5944 Rtb_to_modes> Number of blocs = 192 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4665 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5402 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9447 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.655 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.070 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.764 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.829 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.396 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.149 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.415 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.856 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.659 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.151 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.473 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.072 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.157 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.273 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.729 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.545 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.746 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.06 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1152 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00004 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00004 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 106992 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00004 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 0.99998 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 1.00004 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 211108205108114614.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 211108205108114614.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 211108205108114614.atom Openam> file on opening on unit 11: 211108205108114614.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 763 First residue number = 19 Last residue number = 400 Number of atoms found = 5944 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9908E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9964E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9983E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4665 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5402 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9447 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.655 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.070 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.764 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.829 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.396 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.149 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.415 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.856 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.659 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.151 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.473 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.072 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.157 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.273 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.729 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.545 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.746 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.06 Bfactors> 106 vectors, 17832 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.466500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.629 for 774 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.030 +/- 0.03 Bfactors> = 34.205 +/- 11.09 Bfactors> Shiftng-fct= 34.174 Bfactors> Scaling-fct= 426.653 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 211108205108114614.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 211108205108114614.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 74.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 79.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 182.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 269.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 276.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 320.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 440.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.7 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Chkmod> That is: 5944 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7209 0.0034 0.8222 0.0034 0.7840 0.0034 0.9131 0.0034 0.7068 0.0034 0.9525 74.1656 0.4473 79.8094 0.6578 105.5416 0.7183 139.6933 0.5548 156.2291 0.5182 180.5285 0.4595 182.6388 0.4618 200.1062 0.6264 221.1813 0.6156 228.1613 0.6298 239.2853 0.5092 258.3131 0.6073 269.3082 0.4130 276.2673 0.3703 288.7671 0.4395 290.4973 0.5736 312.3260 0.6718 320.8181 0.5883 335.4784 0.6337 338.9923 0.5687 350.5181 0.6331 366.9524 0.5427 371.4237 0.2840 384.8322 0.6585 390.0062 0.4129 396.8989 0.5939 404.4035 0.5272 417.1765 0.4978 427.0924 0.6267 440.0107 0.3691 449.0293 0.3409 452.1694 0.3603 452.4301 0.6411 460.0541 0.4181 467.6798 0.5719 489.6044 0.6409 492.3662 0.5632 497.6068 0.4879 512.5476 0.4972 514.1554 0.4808 522.7973 0.5909 527.8475 0.1038 534.6172 0.0834 541.7377 0.3173 545.5334 0.6158 549.7319 0.5622 560.0379 0.2347 562.8731 0.2905 563.3965 0.4806 570.8811 0.4315 573.1485 0.4627 576.4307 0.4306 586.4687 0.5161 587.7741 0.5026 590.9751 0.4461 597.9175 0.3904 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 211108205108114614.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 211108205108114614.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 211108205108114614 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=0 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=20 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=40 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=60 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=80 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 211108205108114614 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=0 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=20 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=40 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom calculating perturbed structure for DQ=60 211108205108114614.eigenfacs 211108205108114614.atom 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