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LOGs for ID: 21090819540414848

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21090819540414848.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21090819540414848.atom to be opened. Openam> File opened: 21090819540414848.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 344 First residue number = 0 Last residue number = 343 Number of atoms found = 5208 Mean number per residue = 15.1 Pdbmat> Coordinate statistics: = -21.236954 +/- 18.720891 From: -83.535000 To: 14.937000 = -3.924673 +/- 17.304660 From: -38.503000 To: 32.640000 = -13.370744 +/- 11.862799 From: -51.736000 To: 14.091000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'ACE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.9859 % Filled. Pdbmat> 3644648 non-zero elements. Pdbmat> 401560 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 154.21 +/- 53.54 Maximum number = 270 Minimum number = 25 Pdbmat> Matrix trace = 8.031200E+06 Pdbmat> Larger element = 922.744 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 344 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21090819540414848.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21090819540414848.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21090819540414848.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5208 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 344 residues. Blocpdb> 23 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 35 atoms in block 2 Block first atom: 24 Blocpdb> 24 atoms in block 3 Block first atom: 59 Blocpdb> 28 atoms in block 4 Block first atom: 83 Blocpdb> 29 atoms in block 5 Block first atom: 111 Blocpdb> 31 atoms in block 6 Block first atom: 140 Blocpdb> 31 atoms in block 7 Block first atom: 171 Blocpdb> 29 atoms in block 8 Block first atom: 202 Blocpdb> 38 atoms in block 9 Block first atom: 231 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 269 Blocpdb> 29 atoms in block 11 Block first atom: 288 Blocpdb> 29 atoms in block 12 Block first atom: 317 Blocpdb> 41 atoms in block 13 Block first atom: 346 Blocpdb> 23 atoms in block 14 Block first atom: 387 Blocpdb> 25 atoms in block 15 Block first atom: 410 Blocpdb> 34 atoms in block 16 Block first atom: 435 Blocpdb> 21 atoms in block 17 Block first atom: 469 Blocpdb> 26 atoms in block 18 Block first atom: 490 Blocpdb> 24 atoms in block 19 Block first atom: 516 Blocpdb> 30 atoms in block 20 Block first atom: 540 Blocpdb> 39 atoms in block 21 Block first atom: 570 Blocpdb> 27 atoms in block 22 Block first atom: 609 Blocpdb> 36 atoms in block 23 Block first atom: 636 Blocpdb> 31 atoms in block 24 Block first atom: 672 Blocpdb> 37 atoms in block 25 Block first atom: 703 Blocpdb> 31 atoms in block 26 Block first atom: 740 Blocpdb> 25 atoms in block 27 Block first atom: 771 Blocpdb> 33 atoms in block 28 Block first atom: 796 Blocpdb> 27 atoms in block 29 Block first atom: 829 Blocpdb> 38 atoms in block 30 Block first atom: 856 Blocpdb> 27 atoms in block 31 Block first atom: 894 Blocpdb> 37 atoms in block 32 Block first atom: 921 Blocpdb> 38 atoms in block 33 Block first atom: 958 Blocpdb> 41 atoms in block 34 Block first atom: 996 Blocpdb> 26 atoms in block 35 Block first atom: 1037 Blocpdb> 35 atoms in block 36 Block first atom: 1063 Blocpdb> 28 atoms in block 37 Block first atom: 1098 Blocpdb> 38 atoms in block 38 Block first atom: 1126 Blocpdb> 32 atoms in block 39 Block first atom: 1164 Blocpdb> 34 atoms in block 40 Block first atom: 1196 Blocpdb> 31 atoms in block 41 Block first atom: 1230 Blocpdb> 30 atoms in block 42 Block first atom: 1261 Blocpdb> 37 atoms in block 43 Block first atom: 1291 Blocpdb> 35 atoms in block 44 Block first atom: 1328 Blocpdb> 31 atoms in block 45 Block first atom: 1363 Blocpdb> 40 atoms in block 46 Block first atom: 1394 Blocpdb> 32 atoms in block 47 Block first atom: 1434 Blocpdb> 39 atoms in block 48 Block first atom: 1466 Blocpdb> 31 atoms in block 49 Block first atom: 1505 Blocpdb> 37 atoms in block 50 Block first atom: 1536 Blocpdb> 26 atoms in block 51 Block first atom: 1573 Blocpdb> 29 atoms in block 52 Block first atom: 1599 Blocpdb> 18 atoms in block 53 Block first atom: 1628 Blocpdb> 30 atoms in block 54 Block first atom: 1646 Blocpdb> 29 atoms in block 55 Block first atom: 1676 Blocpdb> 24 atoms in block 56 Block first atom: 1705 Blocpdb> 35 atoms in block 57 Block first atom: 1729 Blocpdb> 19 atoms in block 58 Block first atom: 1764 Blocpdb> 32 atoms in block 59 Block first atom: 1783 Blocpdb> 40 atoms in block 60 Block first atom: 1815 Blocpdb> 17 atoms in block 61 Block first atom: 1855 Blocpdb> 34 atoms in block 62 Block first atom: 1872 Blocpdb> 37 atoms in block 63 Block first atom: 1906 Blocpdb> 26 atoms in block 64 Block first atom: 1943 Blocpdb> 32 atoms in block 65 Block first atom: 1969 Blocpdb> 41 atoms in block 66 Block first atom: 2001 Blocpdb> 22 atoms in block 67 Block first atom: 2042 Blocpdb> 18 atoms in block 68 Block first atom: 2064 Blocpdb> 36 atoms in block 69 Block first atom: 2082 Blocpdb> 35 atoms in block 70 Block first atom: 2118 Blocpdb> 33 atoms in block 71 Block first atom: 2153 Blocpdb> 40 atoms in block 72 Block first atom: 2186 Blocpdb> 29 atoms in block 73 Block first atom: 2226 Blocpdb> 23 atoms in block 74 Block first atom: 2255 Blocpdb> 41 atoms in block 75 Block first atom: 2278 Blocpdb> 29 atoms in block 76 Block first atom: 2319 Blocpdb> 24 atoms in block 77 Block first atom: 2348 Blocpdb> 41 atoms in block 78 Block first atom: 2372 Blocpdb> 23 atoms in block 79 Block first atom: 2413 Blocpdb> 17 atoms in block 80 Block first atom: 2436 Blocpdb> 43 atoms in block 81 Block first atom: 2453 Blocpdb> 33 atoms in block 82 Block first atom: 2496 Blocpdb> 32 atoms in block 83 Block first atom: 2529 Blocpdb> 35 atoms in block 84 Block first atom: 2561 Blocpdb> 19 atoms in block 85 Block first atom: 2596 Blocpdb> 24 atoms in block 86 Block first atom: 2615 Blocpdb> 35 atoms in block 87 Block first atom: 2639 Blocpdb> 28 atoms in block 88 Block first atom: 2674 Blocpdb> 28 atoms in block 89 Block first atom: 2702 Blocpdb> 32 atoms in block 90 Block first atom: 2730 Blocpdb> 14 atoms in block 91 Block first atom: 2762 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2776 Blocpdb> 27 atoms in block 93 Block first atom: 2795 Blocpdb> 37 atoms in block 94 Block first atom: 2822 Blocpdb> 28 atoms in block 95 Block first atom: 2859 Blocpdb> 25 atoms in block 96 Block first atom: 2887 Blocpdb> 27 atoms in block 97 Block first atom: 2912 Blocpdb> 44 atoms in block 98 Block first atom: 2939 Blocpdb> 33 atoms in block 99 Block first atom: 2983 Blocpdb> 36 atoms in block 100 Block first atom: 3016 Blocpdb> 21 atoms in block 101 Block first atom: 3052 Blocpdb> 35 atoms in block 102 Block first atom: 3073 Blocpdb> 34 atoms in block 103 Block first atom: 3108 Blocpdb> 24 atoms in block 104 Block first atom: 3142 Blocpdb> 31 atoms in block 105 Block first atom: 3166 Blocpdb> 26 atoms in block 106 Block first atom: 3197 Blocpdb> 25 atoms in block 107 Block first atom: 3223 Blocpdb> 22 atoms in block 108 Block first atom: 3248 Blocpdb> 31 atoms in block 109 Block first atom: 3270 Blocpdb> 34 atoms in block 110 Block first atom: 3301 Blocpdb> 33 atoms in block 111 Block first atom: 3335 Blocpdb> 18 atoms in block 112 Block first atom: 3368 Blocpdb> 33 atoms in block 113 Block first atom: 3386 Blocpdb> 26 atoms in block 114 Block first atom: 3419 Blocpdb> 29 atoms in block 115 Block first atom: 3445 Blocpdb> 36 atoms in block 116 Block first atom: 3474 Blocpdb> 31 atoms in block 117 Block first atom: 3510 Blocpdb> 33 atoms in block 118 Block first atom: 3541 Blocpdb> 36 atoms in block 119 Block first atom: 3574 Blocpdb> 29 atoms in block 120 Block first atom: 3610 Blocpdb> 31 atoms in block 121 Block first atom: 3639 Blocpdb> 38 atoms in block 122 Block first atom: 3670 Blocpdb> 26 atoms in block 123 Block first atom: 3708 Blocpdb> 31 atoms in block 124 Block first atom: 3734 Blocpdb> 30 atoms in block 125 Block first atom: 3765 Blocpdb> 29 atoms in block 126 Block first atom: 3795 Blocpdb> 27 atoms in block 127 Block first atom: 3824 Blocpdb> 17 atoms in block 128 Block first atom: 3851 Blocpdb> 29 atoms in block 129 Block first atom: 3868 Blocpdb> 18 atoms in block 130 Block first atom: 3897 Blocpdb> 28 atoms in block 131 Block first atom: 3915 Blocpdb> 26 atoms in block 132 Block first atom: 3943 Blocpdb> 36 atoms in block 133 Block first atom: 3969 Blocpdb> 31 atoms in block 134 Block first atom: 4005 Blocpdb> 26 atoms in block 135 Block first atom: 4036 Blocpdb> 24 atoms in block 136 Block first atom: 4062 Blocpdb> 23 atoms in block 137 Block first atom: 4086 Blocpdb> 35 atoms in block 138 Block first atom: 4109 Blocpdb> 24 atoms in block 139 Block first atom: 4144 Blocpdb> 41 atoms in block 140 Block first atom: 4168 Blocpdb> 26 atoms in block 141 Block first atom: 4209 Blocpdb> 31 atoms in block 142 Block first atom: 4235 Blocpdb> 38 atoms in block 143 Block first atom: 4266 Blocpdb> 36 atoms in block 144 Block first atom: 4304 Blocpdb> 27 atoms in block 145 Block first atom: 4340 Blocpdb> 18 atoms in block 146 Block first atom: 4367 Blocpdb> 30 atoms in block 147 Block first atom: 4385 Blocpdb> 22 atoms in block 148 Block first atom: 4415 Blocpdb> 30 atoms in block 149 Block first atom: 4437 Blocpdb> 34 atoms in block 150 Block first atom: 4467 Blocpdb> 29 atoms in block 151 Block first atom: 4501 Blocpdb> 40 atoms in block 152 Block first atom: 4530 Blocpdb> 18 atoms in block 153 Block first atom: 4570 Blocpdb> 24 atoms in block 154 Block first atom: 4588 Blocpdb> 30 atoms in block 155 Block first atom: 4612 Blocpdb> 35 atoms in block 156 Block first atom: 4642 Blocpdb> 33 atoms in block 157 Block first atom: 4677 Blocpdb> 43 atoms in block 158 Block first atom: 4710 Blocpdb> 32 atoms in block 159 Block first atom: 4753 Blocpdb> 33 atoms in block 160 Block first atom: 4785 Blocpdb> 44 atoms in block 161 Block first atom: 4818 Blocpdb> 31 atoms in block 162 Block first atom: 4862 Blocpdb> 29 atoms in block 163 Block first atom: 4893 Blocpdb> 35 atoms in block 164 Block first atom: 4922 Blocpdb> 35 atoms in block 165 Block first atom: 4957 Blocpdb> 33 atoms in block 166 Block first atom: 4992 Blocpdb> 33 atoms in block 167 Block first atom: 5025 Blocpdb> 29 atoms in block 168 Block first atom: 5058 Blocpdb> 25 atoms in block 169 Block first atom: 5087 Blocpdb> 34 atoms in block 170 Block first atom: 5112 Blocpdb> 28 atoms in block 171 Block first atom: 5146 Blocpdb> 35 atoms in block 172 Block first atom: 5173 Blocpdb> 172 blocks. Blocpdb> At most, 44 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3644820 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 15624 Prepmat> Matrix trace = 8031200.0000 Prepmat> Last element read: 15624 15624 50.8504 Prepmat> 14879 lines saved. Prepmat> 12978 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5208 RTB> Total mass = 5208.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5208 RTB> Number of blocks = 172 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 448748.6193 RTB> 65820 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1032 Diagstd> Nb of non-zero elements: 65820 Diagstd> Projected matrix trace = 448748.6193 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1032 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 448748.6193 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0272592 0.0804853 0.1170430 0.1666053 0.1781398 0.8780988 1.0229696 1.6828081 2.0495235 2.2116192 2.4871925 3.4842925 3.6289166 4.4317182 4.7894331 6.7845589 7.3060979 8.1495842 8.8856695 9.8755488 10.4991955 13.0229659 14.9843219 17.3959171 17.9020073 20.2478947 22.2397525 23.8660507 25.7857423 27.1841152 27.7654384 30.0928630 31.2209130 32.9275706 35.1051600 36.1947302 37.9833309 38.8504293 39.2092346 40.2957571 41.8533720 44.7497411 45.5531320 46.5628269 48.8772741 50.8084409 51.7660107 52.7737581 55.0287322 56.1483820 57.6695159 58.5897216 59.8926252 61.8804977 62.1640739 63.1620843 63.9515629 64.6041299 67.1298239 68.6750062 70.5013429 71.9462884 75.0276694 76.1886873 76.5579436 77.4387882 79.1894384 79.8581968 81.7945392 83.0816768 85.1544407 85.5055307 86.7424984 86.8769418 88.0075110 91.2175075 91.5432868 92.4107810 94.0066602 94.7130494 96.0697377 97.3070015 98.2952877 100.4485616 100.6201467 101.0357380 104.0985392 105.7530802 106.5399051 108.6103736 109.1974089 110.6338401 111.9173136 113.2904072 114.0251576 114.5122836 115.4341684 117.4566065 117.8135553 118.0306968 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034302 0.0034311 0.0034315 0.0034328 0.0034328 0.0034348 17.9288270 30.8072873 37.1507780 44.3240804 45.8327283 101.7576273 109.8314318 140.8680723 155.4610996 161.4917936 171.2576491 202.6994555 206.8634562 228.6026967 237.6497369 282.8499387 293.5202204 310.0009369 323.6982547 341.2525462 351.8627487 391.8774133 420.3526865 452.9173365 459.4583467 488.6357262 512.1064609 530.5002100 551.4232830 566.1778584 572.1995972 595.6992241 606.7615890 623.1249271 643.3995591 653.3079634 669.2552766 676.8511814 679.9695469 689.3264455 702.5229346 726.4246013 732.9163355 740.9944408 759.1870109 774.0396614 781.2996486 788.8679125 805.5454224 813.6992264 824.6476645 831.2008863 840.3920879 854.2248071 856.1798730 863.0252590 868.4020930 872.8214709 889.7193465 899.9007920 911.7882160 921.0845072 940.6022389 947.8519890 950.1461436 955.5965089 966.3376750 970.4094790 982.1038991 989.8010421 1002.0720082 1004.1356442 1011.3727396 1012.1562070 1018.7207435 1037.1328276 1038.9832137 1043.8944790 1052.8696140 1056.8179718 1064.3600931 1071.1920115 1076.6179824 1088.3463907 1089.2755446 1091.5227435 1107.9434589 1116.7135687 1120.8601608 1131.6990049 1134.7532803 1142.1924203 1148.7986560 1155.8243754 1159.5663953 1162.0406429 1166.7087894 1176.8849384 1178.6718495 1179.7575510 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5208 Rtb_to_modes> Number of blocs = 172 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9781E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9836E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9855E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.7259E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.0485E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1170 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1666 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1781 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8781 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.023 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.683 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.050 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.212 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.487 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.484 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.629 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.432 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.789 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.785 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.306 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.150 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.886 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.876 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.0 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1032 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 0.99996 0.99997 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00005 0.99998 1.00001 1.00002 0.99994 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99996 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00002 1.00002 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 93744 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99997 0.99996 0.99997 1.00001 0.99997 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999 1.00005 0.99998 1.00001 1.00002 0.99994 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 0.99996 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00002 1.00002 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21090819540414848.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21090819540414848.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21090819540414848.atom Openam> file on opening on unit 11: 21090819540414848.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 344 First residue number = 0 Last residue number = 343 Number of atoms found = 5208 Mean number per residue = 15.1 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9781E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9836E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9855E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9934E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.7259E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.0485E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1170 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1666 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1781 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8781 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.023 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.683 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.050 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.212 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.487 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.484 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.629 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.432 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.789 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.785 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.306 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.150 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.886 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.876 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.0 Bfactors> 106 vectors, 15624 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.027259 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.479 for 344 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.218 +/- 0.35 Bfactors> = 2.095 +/- 4.65 Bfactors> Shiftng-fct= 1.877 Bfactors> Scaling-fct= 13.140 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21090819540414848.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21090819540414848.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4301E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 17.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 30.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 37.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 45.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 171.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 228.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 669.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 702.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 805.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 831.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 854.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.1 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Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9142 0.0034 0.7067 0.0034 0.8644 0.0034 0.7949 0.0034 0.5114 0.0034 0.9508 17.9280 0.5105 30.8059 0.3892 37.1424 0.2796 44.3215 0.3029 45.8256 0.5786 101.7533 0.1987 109.8283 0.1444 140.8701 0.2148 155.4725 0.4990 161.4988 0.3163 171.2437 0.3022 202.6822 0.3950 206.8570 0.2300 228.6002 0.5966 237.6288 0.3871 282.8470 0.3534 293.5057 0.2350 309.9955 0.2366 323.6904 0.4009 341.2457 0.1733 351.8611 0.1902 391.8160 0.3470 420.2740 0.3286 452.9510 0.1814 459.4129 0.2491 488.6402 0.3132 512.0873 0.0956 530.5213 0.4941 551.4451 0.4275 566.1107 0.4766 572.2220 0.4658 595.6453 0.3724 606.7267 0.2209 623.1212 0.4091 643.4163 0.4376 653.2372 0.1727 669.1972 0.3066 676.8184 0.0733 679.9470 0.1693 689.3331 0.2654 702.4645 0.2789 726.3955 0.2722 732.8597 0.3613 740.9401 0.3299 759.1756 0.2448 774.0183 0.1354 781.2962 0.2746 788.8060 0.2851 805.5201 0.2180 813.6760 0.1913 824.6157 0.3054 831.1672 0.3550 840.3376 0.3964 854.1847 0.2305 856.1151 0.3798 862.9740 0.3706 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perturbed structure for DQ=-80 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom making animated gifs 11 models are in 21090819540414848.7.pdb, 1 models will 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21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom making animated gifs 11 models are in 21090819540414848.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090819540414848.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090819540414848.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21090819540414848 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom making animated gifs 11 models are in 21090819540414848.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090819540414848.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090819540414848.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 21090819540414848 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom 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will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 21090819540414848 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21090819540414848.eigenfacs 21090819540414848.atom making animated gifs 11 models are in 21090819540414848.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090819540414848.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090819540414848.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21090819540414848.10.pdb 21090819540414848.11.pdb 21090819540414848.7.pdb 21090819540414848.8.pdb 21090819540414848.9.pdb STDERR: real 0m20.555s user 0m20.372s sys 0m0.140s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: 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