CNRS Nantes University UFIP UFIP
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.


***  m2open  ***

LOGs for ID: 21090804063211364

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21090804063211364.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21090804063211364.atom to be opened. Openam> File opened: 21090804063211364.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 496 First residue number = 7 Last residue number = 502 Number of atoms found = 3824 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = 32.622262 +/- 13.504670 From: 0.897000 To: 69.563000 = 31.802222 +/- 13.928297 From: -1.248000 To: 62.882000 = -14.032179 +/- 22.314584 From: -56.084000 To: 36.083000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.1132 % Filled. Pdbmat> 1390703 non-zero elements. Pdbmat> 151996 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 79.50 +/- 24.78 Maximum number = 136 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 3.039920E+06 Pdbmat> Larger element = 480.752 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 496 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21090804063211364.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21090804063211364.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21090804063211364.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 3824 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 496 residues. Blocpdb> 21 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 17 atoms in block 2 Block first atom: 22 Blocpdb> 27 atoms in block 3 Block first atom: 39 Blocpdb> 31 atoms in block 4 Block first atom: 66 Blocpdb> 21 atoms in block 5 Block first atom: 97 Blocpdb> 23 atoms in block 6 Block first atom: 118 Blocpdb> 24 atoms in block 7 Block first atom: 141 Blocpdb> 33 atoms in block 8 Block first atom: 165 Blocpdb> 28 atoms in block 9 Block first atom: 198 Blocpdb> 22 atoms in block 10 Block first atom: 226 Blocpdb> 28 atoms in block 11 Block first atom: 248 Blocpdb> 23 atoms in block 12 Block first atom: 276 Blocpdb> 26 atoms in block 13 Block first atom: 299 Blocpdb> 25 atoms in block 14 Block first atom: 325 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 350 Blocpdb> 21 atoms in block 16 Block first atom: 381 Blocpdb> 24 atoms in block 17 Block first atom: 402 Blocpdb> 21 atoms in block 18 Block first atom: 426 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 447 Blocpdb> 26 atoms in block 20 Block first atom: 467 Blocpdb> 27 atoms in block 21 Block first atom: 493 Blocpdb> 21 atoms in block 22 Block first atom: 520 Blocpdb> 22 atoms in block 23 Block first atom: 541 Blocpdb> 27 atoms in block 24 Block first atom: 563 Blocpdb> 25 atoms in block 25 Block first atom: 590 Blocpdb> 20 atoms in block 26 Block first atom: 615 Blocpdb> 22 atoms in block 27 Block first atom: 635 Blocpdb> 24 atoms in block 28 Block first atom: 657 Blocpdb> 24 atoms in block 29 Block first atom: 681 Blocpdb> 22 atoms in block 30 Block first atom: 705 Blocpdb> 21 atoms in block 31 Block first atom: 727 Blocpdb> 25 atoms in block 32 Block first atom: 748 Blocpdb> 22 atoms in block 33 Block first atom: 773 Blocpdb> 29 atoms in block 34 Block first atom: 795 Blocpdb> 23 atoms in block 35 Block first atom: 824 Blocpdb> 24 atoms in block 36 Block first atom: 847 Blocpdb> 27 atoms in block 37 Block first atom: 871 Blocpdb> 17 atoms in block 38 Block first atom: 898 Blocpdb> 24 atoms in block 39 Block first atom: 915 Blocpdb> 24 atoms in block 40 Block first atom: 939 Blocpdb> 23 atoms in block 41 Block first atom: 963 Blocpdb> 24 atoms in block 42 Block first atom: 986 Blocpdb> 19 atoms in block 43 Block first atom: 1010 Blocpdb> 28 atoms in block 44 Block first atom: 1029 Blocpdb> 20 atoms in block 45 Block first atom: 1057 Blocpdb> 27 atoms in block 46 Block first atom: 1077 Blocpdb> 23 atoms in block 47 Block first atom: 1104 Blocpdb> 15 atoms in block 48 Block first atom: 1127 Blocpdb> 22 atoms in block 49 Block first atom: 1142 Blocpdb> 25 atoms in block 50 Block first atom: 1164 Blocpdb> 19 atoms in block 51 Block first atom: 1189 Blocpdb> 16 atoms in block 52 Block first atom: 1208 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1224 Blocpdb> 24 atoms in block 54 Block first atom: 1244 Blocpdb> 22 atoms in block 55 Block first atom: 1268 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 1290 Blocpdb> 25 atoms in block 57 Block first atom: 1308 Blocpdb> 23 atoms in block 58 Block first atom: 1333 Blocpdb> 21 atoms in block 59 Block first atom: 1356 Blocpdb> 27 atoms in block 60 Block first atom: 1377 Blocpdb> 20 atoms in block 61 Block first atom: 1404 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 1424 Blocpdb> 15 atoms in block 63 Block first atom: 1441 Blocpdb> 30 atoms in block 64 Block first atom: 1456 Blocpdb> 23 atoms in block 65 Block first atom: 1486 Blocpdb> 23 atoms in block 66 Block first atom: 1509 Blocpdb> 21 atoms in block 67 Block first atom: 1532 Blocpdb> 23 atoms in block 68 Block first atom: 1553 Blocpdb> 21 atoms in block 69 Block first atom: 1576 Blocpdb> 19 atoms in block 70 Block first atom: 1597 Blocpdb> 22 atoms in block 71 Block first atom: 1616 Blocpdb> 20 atoms in block 72 Block first atom: 1638 Blocpdb> 22 atoms in block 73 Block first atom: 1658 Blocpdb> 27 atoms in block 74 Block first atom: 1680 Blocpdb> 29 atoms in block 75 Block first atom: 1707 Blocpdb> 21 atoms in block 76 Block first atom: 1736 Blocpdb> 22 atoms in block 77 Block first atom: 1757 Blocpdb> 28 atoms in block 78 Block first atom: 1779 Blocpdb> 20 atoms in block 79 Block first atom: 1807 Blocpdb> 22 atoms in block 80 Block first atom: 1827 Blocpdb> 20 atoms in block 81 Block first atom: 1849 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 1869 Blocpdb> 22 atoms in block 83 Block first atom: 1895 Blocpdb> 26 atoms in block 84 Block first atom: 1917 Blocpdb> 26 atoms in block 85 Block first atom: 1943 Blocpdb> 26 atoms in block 86 Block first atom: 1969 Blocpdb> 23 atoms in block 87 Block first atom: 1995 Blocpdb> 21 atoms in block 88 Block first atom: 2018 Blocpdb> 26 atoms in block 89 Block first atom: 2039 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 2065 Blocpdb> 27 atoms in block 91 Block first atom: 2084 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2111 Blocpdb> 28 atoms in block 93 Block first atom: 2130 Blocpdb> 25 atoms in block 94 Block first atom: 2158 Blocpdb> 23 atoms in block 95 Block first atom: 2183 Blocpdb> 20 atoms in block 96 Block first atom: 2206 Blocpdb> 23 atoms in block 97 Block first atom: 2226 Blocpdb> 24 atoms in block 98 Block first atom: 2249 Blocpdb> 20 atoms in block 99 Block first atom: 2273 Blocpdb> 21 atoms in block 100 Block first atom: 2293 Blocpdb> 23 atoms in block 101 Block first atom: 2314 Blocpdb> 21 atoms in block 102 Block first atom: 2337 Blocpdb> 24 atoms in block 103 Block first atom: 2358 Blocpdb> 17 atoms in block 104 Block first atom: 2382 Blocpdb> 23 atoms in block 105 Block first atom: 2399 Blocpdb> 18 atoms in block 106 Block first atom: 2422 Blocpdb> 26 atoms in block 107 Block first atom: 2440 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2466 Blocpdb> 23 atoms in block 109 Block first atom: 2491 Blocpdb> 14 atoms in block 110 Block first atom: 2514 Blocpdb> 20 atoms in block 111 Block first atom: 2528 Blocpdb> 24 atoms in block 112 Block first atom: 2548 Blocpdb> 23 atoms in block 113 Block first atom: 2572 Blocpdb> 24 atoms in block 114 Block first atom: 2595 Blocpdb> 23 atoms in block 115 Block first atom: 2619 Blocpdb> 27 atoms in block 116 Block first atom: 2642 Blocpdb> 26 atoms in block 117 Block first atom: 2669 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2695 Blocpdb> 23 atoms in block 119 Block first atom: 2716 Blocpdb> 20 atoms in block 120 Block first atom: 2739 Blocpdb> 26 atoms in block 121 Block first atom: 2759 Blocpdb> 26 atoms in block 122 Block first atom: 2785 Blocpdb> 22 atoms in block 123 Block first atom: 2811 Blocpdb> 22 atoms in block 124 Block first atom: 2833 Blocpdb> 25 atoms in block 125 Block first atom: 2855 Blocpdb> 19 atoms in block 126 Block first atom: 2880 Blocpdb> 21 atoms in block 127 Block first atom: 2899 Blocpdb> 22 atoms in block 128 Block first atom: 2920 Blocpdb> 27 atoms in block 129 Block first atom: 2942 Blocpdb> 27 atoms in block 130 Block first atom: 2969 Blocpdb> 24 atoms in block 131 Block first atom: 2996 Blocpdb> 20 atoms in block 132 Block first atom: 3020 Blocpdb> 27 atoms in block 133 Block first atom: 3040 Blocpdb> 14 atoms in block 134 Block first atom: 3067 Blocpdb> 23 atoms in block 135 Block first atom: 3081 Blocpdb> 24 atoms in block 136 Block first atom: 3104 Blocpdb> 27 atoms in block 137 Block first atom: 3128 Blocpdb> 20 atoms in block 138 Block first atom: 3155 Blocpdb> 25 atoms in block 139 Block first atom: 3175 Blocpdb> 23 atoms in block 140 Block first atom: 3200 Blocpdb> 24 atoms in block 141 Block first atom: 3223 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3247 Blocpdb> 24 atoms in block 143 Block first atom: 3267 Blocpdb> 25 atoms in block 144 Block first atom: 3291 Blocpdb> 23 atoms in block 145 Block first atom: 3316 Blocpdb> 21 atoms in block 146 Block first atom: 3339 Blocpdb> 22 atoms in block 147 Block first atom: 3360 Blocpdb> 25 atoms in block 148 Block first atom: 3382 Blocpdb> 23 atoms in block 149 Block first atom: 3407 Blocpdb> 21 atoms in block 150 Block first atom: 3430 Blocpdb> 25 atoms in block 151 Block first atom: 3451 Blocpdb> 22 atoms in block 152 Block first atom: 3476 Blocpdb> 25 atoms in block 153 Block first atom: 3498 Blocpdb> 19 atoms in block 154 Block first atom: 3523 Blocpdb> 20 atoms in block 155 Block first atom: 3542 Blocpdb> 26 atoms in block 156 Block first atom: 3562 Blocpdb> 22 atoms in block 157 Block first atom: 3588 Blocpdb> 30 atoms in block 158 Block first atom: 3610 Blocpdb> 23 atoms in block 159 Block first atom: 3640 Blocpdb> 28 atoms in block 160 Block first atom: 3663 Blocpdb> 19 atoms in block 161 Block first atom: 3691 Blocpdb> 24 atoms in block 162 Block first atom: 3710 Blocpdb> 30 atoms in block 163 Block first atom: 3734 Blocpdb> 24 atoms in block 164 Block first atom: 3764 Blocpdb> 27 atoms in block 165 Block first atom: 3788 Blocpdb> 10 atoms in block 166 Block first atom: 3814 Blocpdb> 166 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1390869 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 11472 Prepmat> Matrix trace = 3039920.0000 Prepmat> Last element read: 11472 11472 52.5277 Prepmat> 13862 lines saved. Prepmat> 12219 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 3824 RTB> Total mass = 3824.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 3824 RTB> Number of blocks = 166 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 205798.1628 RTB> 56622 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 996 Diagstd> Nb of non-zero elements: 56622 Diagstd> Projected matrix trace = 205798.1628 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 996 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 205798.1628 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.3917943 0.4036033 0.6189086 0.7129900 1.3923966 1.5222167 2.0893723 2.4496667 2.5386943 3.0265707 3.2483918 3.5358202 3.9879711 4.5133194 4.7317190 5.3179774 5.6858902 6.0350340 6.7863289 7.5867232 7.8760875 8.2036900 8.8575452 9.7852762 10.6697722 11.1870432 11.9294439 12.8410255 12.9150415 13.3812902 13.5626331 14.0782488 14.2715856 14.5517086 15.0125256 15.3402862 16.2232358 16.6584619 17.1258965 18.0606756 18.6063726 19.3120144 20.3365890 20.6578764 21.1530305 21.6540854 22.2864032 22.7871929 23.4350436 23.7072883 24.3018150 24.9034089 25.5435054 25.6450251 26.2881041 26.8321147 27.1816434 27.7047967 27.8117136 28.2072879 28.8712104 29.5435276 29.7135908 30.0538912 30.4237445 30.9516774 31.4696609 32.0783042 32.3064262 32.5205548 33.2372257 33.7216083 33.8252457 34.6295216 35.4594316 35.8511810 36.2416450 36.4033079 37.2878500 37.8369737 38.5439965 38.6347536 39.2911695 39.6985574 40.5086626 40.7484166 40.7576764 41.6320818 42.0134913 42.1272684 42.3725973 42.8820989 43.4490005 43.5754482 43.8928248 44.0505183 44.6859842 45.1190756 45.5239423 45.7594086 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034320 0.0034322 0.0034326 0.0034330 0.0034338 0.0034341 67.9711027 68.9878547 85.4296314 91.6931711 128.1376495 133.9780100 156.9651343 169.9608068 173.0216655 188.9168483 195.7174193 204.1927737 216.8559200 230.6977266 236.2135199 250.4197182 258.9372408 266.7688659 282.8868329 299.1041239 304.7547938 311.0282951 323.1855762 339.6892666 354.7095269 363.2059363 375.0639993 389.1303772 390.2502439 397.2320439 399.9146253 407.4455681 410.2337560 414.2402303 420.7480969 425.3162852 437.3851370 443.2132442 449.3884829 461.4899805 468.4099771 477.2094861 489.7047721 493.5579116 499.4379951 505.3185050 512.6432836 518.3709971 525.6881213 528.7327611 535.3214374 541.9068987 548.8270754 549.9166187 556.7688292 562.5002650 566.1521170 571.5743931 572.6762262 576.7345188 583.4824205 590.2370337 591.9334053 595.3133683 598.9652308 604.1396994 609.1739334 615.0366288 617.2196436 619.2617470 626.0480442 630.5933990 631.5616639 639.0259963 646.6379143 650.2000726 653.7312285 655.1876532 663.0998839 667.9646461 674.1765651 674.9698182 680.6796363 684.1993274 691.1450993 693.1873825 693.2661388 700.6632584 703.8654802 704.8179082 706.8671890 711.1042877 715.7892563 716.8300643 719.4358017 720.7269993 725.9069326 729.4161534 732.6814770 734.5738806 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 3824 Rtb_to_modes> Number of blocs = 166 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9887E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9899E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9921E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3918 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4036 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6189 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7130 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.392 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.522 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.089 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.450 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.539 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.027 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.248 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.536 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.988 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.513 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.732 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.318 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.686 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.035 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.786 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.587 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.876 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.204 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.858 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.785 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.76 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 996 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00004 0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99994 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00005 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 68832 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00004 0.99997 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99994 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99997 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00003 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00005 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21090804063211364.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21090804063211364.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21090804063211364.atom Openam> file on opening on unit 11: 21090804063211364.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 496 First residue number = 7 Last residue number = 502 Number of atoms found = 3824 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9887E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9899E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9921E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9942E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3918 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4036 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6189 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7130 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.392 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.522 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.089 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.450 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.539 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.027 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.248 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.536 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.988 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.513 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.732 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.318 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.686 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.035 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.786 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.587 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.876 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.204 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.858 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.785 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.76 Bfactors> 106 vectors, 11472 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.391800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.476 for 496 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.058 +/- 0.13 Bfactors> = 0.769 +/- 0.17 Bfactors> Shiftng-fct= 0.711 Bfactors> Scaling-fct= 1.265 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21090804063211364.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21090804063211364.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4319E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4328E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 67.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 68.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 85.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 236.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 266.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 468.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 528.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 631.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 725.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.5 Chkmod> 106 vectors, 11472 coordinates in file. Chkmod> That is: 3824 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 38 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 48 is: 0.9999 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8334 0.0034 0.7505 0.0034 0.8747 0.0034 0.7632 0.0034 0.9804 0.0034 0.7375 67.9687 0.0465 68.9846 0.5259 85.4254 0.3113 91.6899 0.4046 128.1139 0.1570 133.9627 0.2704 156.9444 0.2379 169.9651 0.1538 173.0247 0.1962 188.9221 0.1031 195.6972 0.3600 204.1892 0.2630 216.8474 0.1383 230.6797 0.2460 236.2104 0.1410 250.4095 0.1114 258.9286 0.3453 266.7567 0.4490 282.8678 0.3021 299.0967 0.3578 304.7400 0.2147 311.0208 0.3083 323.1800 0.2296 339.6699 0.2987 354.6981 0.3142 363.2383 0.1894 375.0566 0.4052 389.0981 0.3051 390.3084 0.3500 397.1958 0.2487 399.8586 0.1415 407.4534 0.3085 410.1934 0.1529 414.1981 0.2351 420.6946 0.2508 425.2941 0.2877 437.3227 0.0360 443.2147 0.4151 449.4230 0.4536 461.4615 0.3270 468.4355 0.3880 477.1641 0.1308 489.7248 0.4073 493.5621 0.3120 499.3808 0.0661 505.2491 0.2770 512.6626 0.2726 518.3807 0.3518 525.7211 0.3904 528.7403 0.3435 535.2785 0.2183 541.8465 0.3379 548.7659 0.2240 549.9463 0.3764 556.7650 0.4543 562.4540 0.4448 566.1107 0.3337 571.5004 0.3093 572.6340 0.3794 576.7375 0.3417 583.4451 0.3785 590.1765 0.1723 591.8722 0.3017 595.2493 0.4201 598.9027 0.3301 604.0974 0.2884 609.1511 0.4330 615.0265 0.3171 617.2273 0.5226 619.2299 0.3480 626.0473 0.3906 630.5513 0.4463 631.5789 0.4220 639.0030 0.4947 646.6153 0.2464 650.1615 0.5224 653.6883 0.4066 655.1298 0.4695 663.0905 0.3063 667.9627 0.4417 674.1127 0.3817 674.8993 0.5287 680.6403 0.5022 684.1824 0.3000 691.1268 0.4905 693.1711 0.3397 693.2561 0.3920 700.6157 0.4578 703.8060 0.5086 704.8105 0.4274 706.8152 0.4292 711.0564 0.2600 715.7668 0.3730 716.8367 0.3169 719.3818 0.3881 720.6918 0.4306 725.9084 0.4056 729.3923 0.4040 732.6183 0.3346 734.5471 0.4792 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 21090804063211364 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom making animated gifs 11 models are in 21090804063211364.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090804063211364.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090804063211364.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21090804063211364 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom making animated gifs 11 models are in 21090804063211364.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090804063211364.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090804063211364.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21090804063211364 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom making animated gifs 11 models are in 21090804063211364.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090804063211364.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090804063211364.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 21090804063211364 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom making animated gifs 11 models are in 21090804063211364.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090804063211364.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090804063211364.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 21090804063211364 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21090804063211364.eigenfacs 21090804063211364.atom making animated gifs 11 models are in 21090804063211364.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090804063211364.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21090804063211364.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21090804063211364.10.pdb 21090804063211364.11.pdb 21090804063211364.7.pdb 21090804063211364.8.pdb 21090804063211364.9.pdb STDERR: real 0m15.022s user 0m14.956s sys 0m0.064s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Last modification: October 18th, 2018.