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***  SapA_largerange  ***

LOGs for ID: 210907223114100145

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210907223114100145.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210907223114100145.atom to be opened. Openam> File opened: 210907223114100145.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 509 First residue number = 34 Last residue number = 560 Number of atoms found = 8162 Mean number per residue = 16.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -29.504703 +/- 10.465978 From: -55.049000 To: 2.441000 = 3.339896 +/- 12.698724 From: -28.856000 To: 37.440000 = -31.042250 +/- 17.697248 From: -67.920000 To: 11.194000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.0458 % Filled. Pdbmat> 6133206 non-zero elements. Pdbmat> 676136 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 165.68 +/- 46.89 Maximum number = 248 Minimum number = 21 Pdbmat> Matrix trace = 1.352272E+07 Pdbmat> Larger element = 885.221 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 509 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210907223114100145.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210907223114100145.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210907223114100145.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8162 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 509 residues. Blocpdb> 41 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 45 atoms in block 2 Block first atom: 42 Blocpdb> 42 atoms in block 3 Block first atom: 87 Blocpdb> 46 atoms in block 4 Block first atom: 129 Blocpdb> 57 atoms in block 5 Block first atom: 175 Blocpdb> 55 atoms in block 6 Block first atom: 232 Blocpdb> 51 atoms in block 7 Block first atom: 287 Blocpdb> 53 atoms in block 8 Block first atom: 338 Blocpdb> 35 atoms in block 9 Block first atom: 391 Blocpdb> 47 atoms in block 10 Block first atom: 426 Blocpdb> 46 atoms in block 11 Block first atom: 473 Blocpdb> 49 atoms in block 12 Block first atom: 519 Blocpdb> 38 atoms in block 13 Block first atom: 568 Blocpdb> 29 atoms in block 14 Block first atom: 606 Blocpdb> 56 atoms in block 15 Block first atom: 635 Blocpdb> 52 atoms in block 16 Block first atom: 691 Blocpdb> 60 atoms in block 17 Block first atom: 743 Blocpdb> 45 atoms in block 18 Block first atom: 803 Blocpdb> 54 atoms in block 19 Block first atom: 848 Blocpdb> 52 atoms in block 20 Block first atom: 902 Blocpdb> 48 atoms in block 21 Block first atom: 954 Blocpdb> 50 atoms in block 22 Block first atom: 1002 Blocpdb> 44 atoms in block 23 Block first atom: 1052 Blocpdb> 43 atoms in block 24 Block first atom: 1096 Blocpdb> 47 atoms in block 25 Block first atom: 1139 Blocpdb> 57 atoms in block 26 Block first atom: 1186 Blocpdb> 42 atoms in block 27 Block first atom: 1243 Blocpdb> 45 atoms in block 28 Block first atom: 1285 Blocpdb> 54 atoms in block 29 Block first atom: 1330 Blocpdb> 43 atoms in block 30 Block first atom: 1384 Blocpdb> 39 atoms in block 31 Block first atom: 1427 Blocpdb> 51 atoms in block 32 Block first atom: 1466 Blocpdb> 39 atoms in block 33 Block first atom: 1517 Blocpdb> 62 atoms in block 34 Block first atom: 1556 Blocpdb> 53 atoms in block 35 Block first atom: 1618 Blocpdb> 42 atoms in block 36 Block first atom: 1671 Blocpdb> 62 atoms in block 37 Block first atom: 1713 Blocpdb> 58 atoms in block 38 Block first atom: 1775 Blocpdb> 53 atoms in block 39 Block first atom: 1833 Blocpdb> 52 atoms in block 40 Block first atom: 1886 Blocpdb> 48 atoms in block 41 Block first atom: 1938 Blocpdb> 63 atoms in block 42 Block first atom: 1986 Blocpdb> 41 atoms in block 43 Block first atom: 2049 Blocpdb> 40 atoms in block 44 Block first atom: 2090 Blocpdb> 52 atoms in block 45 Block first atom: 2130 Blocpdb> 57 atoms in block 46 Block first atom: 2182 Blocpdb> 54 atoms in block 47 Block first atom: 2239 Blocpdb> 36 atoms in block 48 Block first atom: 2293 Blocpdb> 41 atoms in block 49 Block first atom: 2329 Blocpdb> 47 atoms in block 50 Block first atom: 2370 Blocpdb> 40 atoms in block 51 Block first atom: 2417 Blocpdb> 48 atoms in block 52 Block first atom: 2457 Blocpdb> 58 atoms in block 53 Block first atom: 2505 Blocpdb> 43 atoms in block 54 Block first atom: 2563 Blocpdb> 52 atoms in block 55 Block first atom: 2606 Blocpdb> 47 atoms in block 56 Block first atom: 2658 Blocpdb> 34 atoms in block 57 Block first atom: 2705 Blocpdb> 43 atoms in block 58 Block first atom: 2739 Blocpdb> 48 atoms in block 59 Block first atom: 2782 Blocpdb> 45 atoms in block 60 Block first atom: 2830 Blocpdb> 37 atoms in block 61 Block first atom: 2875 Blocpdb> 42 atoms in block 62 Block first atom: 2912 Blocpdb> 55 atoms in block 63 Block first atom: 2954 Blocpdb> 49 atoms in block 64 Block first atom: 3009 Blocpdb> 52 atoms in block 65 Block first atom: 3058 Blocpdb> 61 atoms in block 66 Block first atom: 3110 Blocpdb> 59 atoms in block 67 Block first atom: 3171 Blocpdb> 43 atoms in block 68 Block first atom: 3230 Blocpdb> 55 atoms in block 69 Block first atom: 3273 Blocpdb> 30 atoms in block 70 Block first atom: 3328 Blocpdb> 56 atoms in block 71 Block first atom: 3358 Blocpdb> 55 atoms in block 72 Block first atom: 3414 Blocpdb> 47 atoms in block 73 Block first atom: 3469 Blocpdb> 37 atoms in block 74 Block first atom: 3516 Blocpdb> 42 atoms in block 75 Block first atom: 3553 Blocpdb> 59 atoms in block 76 Block first atom: 3595 Blocpdb> 62 atoms in block 77 Block first atom: 3654 Blocpdb> 43 atoms in block 78 Block first atom: 3716 Blocpdb> 46 atoms in block 79 Block first atom: 3759 Blocpdb> 42 atoms in block 80 Block first atom: 3805 Blocpdb> 45 atoms in block 81 Block first atom: 3847 Blocpdb> 47 atoms in block 82 Block first atom: 3892 Blocpdb> 45 atoms in block 83 Block first atom: 3939 Blocpdb> 48 atoms in block 84 Block first atom: 3984 Blocpdb> 51 atoms in block 85 Block first atom: 4032 Blocpdb> 59 atoms in block 86 Block first atom: 4083 Blocpdb> 42 atoms in block 87 Block first atom: 4142 Blocpdb> 36 atoms in block 88 Block first atom: 4184 Blocpdb> 43 atoms in block 89 Block first atom: 4220 Blocpdb> 50 atoms in block 90 Block first atom: 4263 Blocpdb> 54 atoms in block 91 Block first atom: 4313 Blocpdb> 48 atoms in block 92 Block first atom: 4367 Blocpdb> 60 atoms in block 93 Block first atom: 4415 Blocpdb> 44 atoms in block 94 Block first atom: 4475 Blocpdb> 50 atoms in block 95 Block first atom: 4519 Blocpdb> 40 atoms in block 96 Block first atom: 4569 Blocpdb> 47 atoms in block 97 Block first atom: 4609 Blocpdb> 48 atoms in block 98 Block first atom: 4656 Blocpdb> 62 atoms in block 99 Block first atom: 4704 Blocpdb> 47 atoms in block 100 Block first atom: 4766 Blocpdb> 52 atoms in block 101 Block first atom: 4813 Blocpdb> 38 atoms in block 102 Block first atom: 4865 Blocpdb> 40 atoms in block 103 Block first atom: 4903 Blocpdb> 52 atoms in block 104 Block first atom: 4943 Blocpdb> 45 atoms in block 105 Block first atom: 4995 Blocpdb> 45 atoms in block 106 Block first atom: 5040 Blocpdb> 41 atoms in block 107 Block first atom: 5085 Blocpdb> 42 atoms in block 108 Block first atom: 5126 Blocpdb> 50 atoms in block 109 Block first atom: 5168 Blocpdb> 53 atoms in block 110 Block first atom: 5218 Blocpdb> 53 atoms in block 111 Block first atom: 5271 Blocpdb> 51 atoms in block 112 Block first atom: 5324 Blocpdb> 55 atoms in block 113 Block first atom: 5375 Blocpdb> 44 atoms in block 114 Block first atom: 5430 Blocpdb> 52 atoms in block 115 Block first atom: 5474 Blocpdb> 52 atoms in block 116 Block first atom: 5526 Blocpdb> 59 atoms in block 117 Block first atom: 5578 Blocpdb> 44 atoms in block 118 Block first atom: 5637 Blocpdb> 54 atoms in block 119 Block first atom: 5681 Blocpdb> 38 atoms in block 120 Block first atom: 5735 Blocpdb> 56 atoms in block 121 Block first atom: 5773 Blocpdb> 42 atoms in block 122 Block first atom: 5829 Blocpdb> 58 atoms in block 123 Block first atom: 5871 Blocpdb> 55 atoms in block 124 Block first atom: 5929 Blocpdb> 37 atoms in block 125 Block first atom: 5984 Blocpdb> 45 atoms in block 126 Block first atom: 6021 Blocpdb> 54 atoms in block 127 Block first atom: 6066 Blocpdb> 50 atoms in block 128 Block first atom: 6120 Blocpdb> 52 atoms in block 129 Block first atom: 6170 Blocpdb> 53 atoms in block 130 Block first atom: 6222 Blocpdb> 46 atoms in block 131 Block first atom: 6275 Blocpdb> 55 atoms in block 132 Block first atom: 6321 Blocpdb> 40 atoms in block 133 Block first atom: 6376 Blocpdb> 52 atoms in block 134 Block first atom: 6416 Blocpdb> 49 atoms in block 135 Block first atom: 6468 Blocpdb> 50 atoms in block 136 Block first atom: 6517 Blocpdb> 31 atoms in block 137 Block first atom: 6567 Blocpdb> 45 atoms in block 138 Block first atom: 6598 Blocpdb> 39 atoms in block 139 Block first atom: 6643 Blocpdb> 55 atoms in block 140 Block first atom: 6682 Blocpdb> 49 atoms in block 141 Block first atom: 6737 Blocpdb> 32 atoms in block 142 Block first atom: 6786 Blocpdb> 51 atoms in block 143 Block first atom: 6818 Blocpdb> 47 atoms in block 144 Block first atom: 6869 Blocpdb> 44 atoms in block 145 Block first atom: 6916 Blocpdb> 49 atoms in block 146 Block first atom: 6960 Blocpdb> 50 atoms in block 147 Block first atom: 7009 Blocpdb> 49 atoms in block 148 Block first atom: 7059 Blocpdb> 53 atoms in block 149 Block first atom: 7108 Blocpdb> 43 atoms in block 150 Block first atom: 7161 Blocpdb> 42 atoms in block 151 Block first atom: 7204 Blocpdb> 41 atoms in block 152 Block first atom: 7246 Blocpdb> 56 atoms in block 153 Block first atom: 7287 Blocpdb> 45 atoms in block 154 Block first atom: 7343 Blocpdb> 42 atoms in block 155 Block first atom: 7388 Blocpdb> 50 atoms in block 156 Block first atom: 7430 Blocpdb> 58 atoms in block 157 Block first atom: 7480 Blocpdb> 52 atoms in block 158 Block first atom: 7538 Blocpdb> 52 atoms in block 159 Block first atom: 7590 Blocpdb> 40 atoms in block 160 Block first atom: 7642 Blocpdb> 65 atoms in block 161 Block first atom: 7682 Blocpdb> 45 atoms in block 162 Block first atom: 7747 Blocpdb> 49 atoms in block 163 Block first atom: 7792 Blocpdb> 45 atoms in block 164 Block first atom: 7841 Blocpdb> 55 atoms in block 165 Block first atom: 7886 Blocpdb> 48 atoms in block 166 Block first atom: 7941 Blocpdb> 37 atoms in block 167 Block first atom: 7989 Blocpdb> 43 atoms in block 168 Block first atom: 8026 Blocpdb> 54 atoms in block 169 Block first atom: 8069 Blocpdb> 40 atoms in block 170 Block first atom: 8122 Blocpdb> 170 blocks. Blocpdb> At most, 65 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 29 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 6133376 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 24486 Prepmat> Matrix trace = 13522720.0000 Prepmat> Last element read: 24486 24486 279.0707 Prepmat> 14536 lines saved. Prepmat> 12537 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8162 RTB> Total mass = 8162.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8162 RTB> Number of blocks = 170 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 446311.7612 RTB> 69378 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1020 Diagstd> Nb of non-zero elements: 69378 Diagstd> Projected matrix trace = 446311.7612 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1020 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 446311.7612 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 4.3128196 4.6112087 6.8079233 8.7617297 12.6408683 13.1163356 14.9333934 15.2768639 17.9824614 19.4109403 20.5726678 22.9687410 25.5369241 26.6863377 27.9087063 30.0945219 31.2390171 31.6527921 33.1852059 35.4356388 36.8661797 38.3172098 41.4105541 42.8684563 43.9661688 46.2779783 46.9551767 48.2707039 49.7648915 52.9562305 53.3810166 56.4766374 57.7867817 59.0083857 62.4216805 64.5053230 65.4451506 67.7256418 68.0546725 70.2527120 71.3345711 71.5119967 74.5648504 75.4147324 75.9735682 77.2784941 79.0993931 79.8024497 80.9090968 81.7947795 83.5608410 84.7724580 86.0605256 87.5161365 88.8938533 89.5484745 90.7828362 90.9881336 92.2424756 93.5328138 93.5762324 95.3390801 95.5225288 98.7185233 100.4342697 101.0727738 103.2835319 103.9404089 105.8560751 106.2072515 108.0876622 109.7103033 110.8222797 111.1967029 112.4899997 113.5779387 113.8414620 114.0316617 115.2749374 117.2648431 117.5116845 118.4350045 120.2138453 121.5627250 122.4753633 122.8125304 125.5998985 126.2510212 127.4738159 129.6316726 130.5491292 131.2149971 131.6729128 134.1851073 134.7327896 135.2940345 135.8872360 137.3280400 138.3027150 138.7013947 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034314 0.0034326 0.0034332 0.0034338 0.0034343 0.0034345 225.5152570 233.1861058 283.3365545 321.4328107 386.0857150 393.2797088 419.6377339 424.4361688 460.4896232 478.4301790 492.5389575 520.4318597 548.7563683 560.9701712 573.6739545 595.7156426 606.9374850 610.9438440 625.5579363 646.4209353 659.3398851 672.1902656 698.7966287 710.9911624 720.0366315 738.7244435 744.1097928 754.4615236 766.0494601 790.2305440 793.3936140 816.0742898 825.4856622 834.1653520 857.9520346 872.1537601 878.4843238 893.6590233 895.8272200 910.1790340 917.1604261 918.3003128 937.6966312 943.0253719 946.5129106 954.6069802 965.7881133 970.0707101 976.7736983 982.1053417 992.6512219 999.8219528 1007.3891691 1015.8728386 1023.8377687 1027.6006637 1034.6587946 1035.8280286 1042.9434363 1050.2127343 1050.4564643 1060.3048767 1061.3244904 1078.9333200 1088.2689624 1091.7227804 1103.5977862 1107.1016314 1117.2572307 1119.1089403 1128.9724448 1137.4150964 1143.1647387 1145.0942538 1151.7341338 1157.2901895 1158.6319825 1159.5994662 1165.9038267 1175.9238364 1177.1608398 1181.7764215 1190.6182215 1197.2793543 1201.7652681 1203.4183241 1216.9981682 1220.1486115 1226.0432014 1236.3767871 1240.7442465 1243.9044394 1246.0730457 1257.9038290 1260.4683094 1263.0908937 1265.8568986 1272.5501049 1277.0580327 1278.8973702 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8162 Rtb_to_modes> Number of blocs = 170 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9852E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9922E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.313 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.611 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.808 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.762 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 135.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 138.7 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1020 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00005 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 146916 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 1.00000 1.00005 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210907223114100145.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210907223114100145.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210907223114100145.atom Openam> file on opening on unit 11: 210907223114100145.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 509 First residue number = 34 Last residue number = 560 Number of atoms found = 8162 Mean number per residue = 16.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9852E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9922E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9953E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.313 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.611 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.808 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.762 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 135.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 138.7 Bfactors> 106 vectors, 24486 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 4.313000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.557 for 509 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.004 +/- 0.00 Bfactors> = 37.018 +/- 23.72 Bfactors> Shiftng-fct= 37.014 Bfactors> Scaling-fct= 6282.134 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210907223114100145.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210907223114100145.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 321.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 419.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 816.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 857.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 878.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 893.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 895.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 943.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 976.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 982.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 999.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1024. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1028. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1035. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1036. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1043. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1050. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1060. 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Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1277. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1279. Chkmod> 106 vectors, 24486 coordinates in file. Chkmod> That is: 8162 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 29 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7146 0.0034 0.8167 0.0034 0.7188 0.0034 0.9248 0.0034 0.9248 0.0034 0.7622 225.5103 0.6387 233.1708 0.5505 283.3260 0.5817 321.4240 0.6247 386.0559 0.4591 393.3178 0.5063 419.5720 0.4109 424.4615 0.7372 460.4383 0.4786 478.3981 0.3811 492.4859 0.4935 520.4238 0.5770 548.7659 0.5840 560.9846 0.4113 573.6626 0.5496 595.6453 0.5399 606.9210 0.3055 610.8907 0.3477 625.5763 0.2830 646.4330 0.3763 659.3457 0.3374 672.1859 0.4178 698.7620 0.0909 710.9734 0.2985 720.0371 0.4427 738.7089 0.4407 744.1161 0.4705 754.4236 0.2678 765.9789 0.5196 790.2247 0.4603 793.3520 0.4650 816.0636 0.3480 825.4732 0.5666 834.1410 0.5384 857.9037 0.5308 872.1479 0.4715 878.4792 0.4609 893.6494 0.5093 895.7580 0.4891 910.1224 0.4171 917.0917 0.5358 918.2481 0.5232 937.6259 0.5126 942.9553 0.5012 946.4501 0.4703 954.5753 0.3459 965.7504 0.5399 970.0142 0.4843 976.7372 0.5749 982.0345 0.5552 992.6036 0.4155 999.7645 0.4826 1007.3428 0.3215 1015.8517 0.4304 1023.7716 0.2878 1027.5653 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210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=100 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=120 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=140 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=160 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=180 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=200 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 210907223114100145 8 -100 200 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=100 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=120 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=140 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=160 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=180 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=200 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 210907223114100145 9 -100 200 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=100 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=120 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=140 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=160 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=180 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=200 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 210907223114100145 10 -100 200 20 0 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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structure for DQ=-40 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=100 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=120 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=140 210907223114100145.eigenfacs 210907223114100145.atom calculating perturbed structure for DQ=160 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