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***  pfprmt  ***

LOGs for ID: 2108121251545562

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2108121251545562.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2108121251545562.atom to be opened. Openam> File opened: 2108121251545562.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 321 First residue number = 1 Last residue number = 321 Number of atoms found = 5267 Mean number per residue = 16.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = 17.169380 +/- 10.727219 From: -9.741000 To: 51.086000 = 39.864773 +/- 16.462558 From: 0.235000 To: 76.093000 = 45.562517 +/- 10.800542 From: 15.660000 To: 71.839000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 14 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 2.9726 % Filled. Pdbmat> 3711104 non-zero elements. Pdbmat> 408903 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 155.27 +/- 47.26 Maximum number = 247 Minimum number = 25 Pdbmat> Matrix trace = 8.178060E+06 Pdbmat> Larger element = 871.087 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 321 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2108121251545562.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2108121251545562.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2108121251545562.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5267 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 321 residues. Blocpdb> 31 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 41 atoms in block 2 Block first atom: 32 Blocpdb> 25 atoms in block 3 Block first atom: 73 Blocpdb> 35 atoms in block 4 Block first atom: 98 Blocpdb> 40 atoms in block 5 Block first atom: 133 Blocpdb> 36 atoms in block 6 Block first atom: 173 Blocpdb> 32 atoms in block 7 Block first atom: 209 Blocpdb> 29 atoms in block 8 Block first atom: 241 Blocpdb> 41 atoms in block 9 Block first atom: 270 Blocpdb> 27 atoms in block 10 Block first atom: 311 Blocpdb> 40 atoms in block 11 Block first atom: 338 Blocpdb> 38 atoms in block 12 Block first atom: 378 Blocpdb> 35 atoms in block 13 Block first atom: 416 Blocpdb> 33 atoms in block 14 Block first atom: 451 Blocpdb> 30 atoms in block 15 Block first atom: 484 Blocpdb> 46 atoms in block 16 Block first atom: 514 Blocpdb> 29 atoms in block 17 Block first atom: 560 Blocpdb> 36 atoms in block 18 Block first atom: 589 Blocpdb> 41 atoms in block 19 Block first atom: 625 Blocpdb> 34 atoms in block 20 Block first atom: 666 Blocpdb> 35 atoms in block 21 Block first atom: 700 Blocpdb> 31 atoms in block 22 Block first atom: 735 Blocpdb> 23 atoms in block 23 Block first atom: 766 Blocpdb> 18 atoms in block 24 Block first atom: 789 Blocpdb> 21 atoms in block 25 Block first atom: 807 Blocpdb> 38 atoms in block 26 Block first atom: 828 Blocpdb> 31 atoms in block 27 Block first atom: 866 Blocpdb> 30 atoms in block 28 Block first atom: 897 Blocpdb> 24 atoms in block 29 Block first atom: 927 Blocpdb> 24 atoms in block 30 Block first atom: 951 Blocpdb> 32 atoms in block 31 Block first atom: 975 Blocpdb> 33 atoms in block 32 Block first atom: 1007 Blocpdb> 32 atoms in block 33 Block first atom: 1040 Blocpdb> 34 atoms in block 34 Block first atom: 1072 Blocpdb> 33 atoms in block 35 Block first atom: 1106 Blocpdb> 31 atoms in block 36 Block first atom: 1139 Blocpdb> 40 atoms in block 37 Block first atom: 1170 Blocpdb> 24 atoms in block 38 Block first atom: 1210 Blocpdb> 41 atoms in block 39 Block first atom: 1234 Blocpdb> 43 atoms in block 40 Block first atom: 1275 Blocpdb> 27 atoms in block 41 Block first atom: 1318 Blocpdb> 28 atoms in block 42 Block first atom: 1345 Blocpdb> 33 atoms in block 43 Block first atom: 1373 Blocpdb> 34 atoms in block 44 Block first atom: 1406 Blocpdb> 30 atoms in block 45 Block first atom: 1440 Blocpdb> 39 atoms in block 46 Block first atom: 1470 Blocpdb> 29 atoms in block 47 Block first atom: 1509 Blocpdb> 29 atoms in block 48 Block first atom: 1538 Blocpdb> 30 atoms in block 49 Block first atom: 1567 Blocpdb> 34 atoms in block 50 Block first atom: 1597 Blocpdb> 33 atoms in block 51 Block first atom: 1631 Blocpdb> 28 atoms in block 52 Block first atom: 1664 Blocpdb> 38 atoms in block 53 Block first atom: 1692 Blocpdb> 31 atoms in block 54 Block first atom: 1730 Blocpdb> 38 atoms in block 55 Block first atom: 1761 Blocpdb> 26 atoms in block 56 Block first atom: 1799 Blocpdb> 41 atoms in block 57 Block first atom: 1825 Blocpdb> 28 atoms in block 58 Block first atom: 1866 Blocpdb> 30 atoms in block 59 Block first atom: 1894 Blocpdb> 40 atoms in block 60 Block first atom: 1924 Blocpdb> 29 atoms in block 61 Block first atom: 1964 Blocpdb> 36 atoms in block 62 Block first atom: 1993 Blocpdb> 26 atoms in block 63 Block first atom: 2029 Blocpdb> 35 atoms in block 64 Block first atom: 2055 Blocpdb> 32 atoms in block 65 Block first atom: 2090 Blocpdb> 36 atoms in block 66 Block first atom: 2122 Blocpdb> 46 atoms in block 67 Block first atom: 2158 Blocpdb> 41 atoms in block 68 Block first atom: 2204 Blocpdb> 22 atoms in block 69 Block first atom: 2245 Blocpdb> 26 atoms in block 70 Block first atom: 2267 Blocpdb> 39 atoms in block 71 Block first atom: 2293 Blocpdb> 26 atoms in block 72 Block first atom: 2332 Blocpdb> 32 atoms in block 73 Block first atom: 2358 Blocpdb> 34 atoms in block 74 Block first atom: 2390 Blocpdb> 40 atoms in block 75 Block first atom: 2424 Blocpdb> 17 atoms in block 76 Block first atom: 2464 Blocpdb> 34 atoms in block 77 Block first atom: 2481 Blocpdb> 23 atoms in block 78 Block first atom: 2515 Blocpdb> 40 atoms in block 79 Block first atom: 2538 Blocpdb> 39 atoms in block 80 Block first atom: 2578 Blocpdb> 37 atoms in block 81 Block first atom: 2617 Blocpdb> 32 atoms in block 82 Block first atom: 2654 Blocpdb> 44 atoms in block 83 Block first atom: 2686 Blocpdb> 36 atoms in block 84 Block first atom: 2730 Blocpdb> 32 atoms in block 85 Block first atom: 2766 Blocpdb> 31 atoms in block 86 Block first atom: 2798 Blocpdb> 34 atoms in block 87 Block first atom: 2829 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 2863 Blocpdb> 35 atoms in block 89 Block first atom: 2885 Blocpdb> 33 atoms in block 90 Block first atom: 2920 Blocpdb> 41 atoms in block 91 Block first atom: 2953 Blocpdb> 30 atoms in block 92 Block first atom: 2994 Blocpdb> 32 atoms in block 93 Block first atom: 3024 Blocpdb> 31 atoms in block 94 Block first atom: 3056 Blocpdb> 37 atoms in block 95 Block first atom: 3087 Blocpdb> 36 atoms in block 96 Block first atom: 3124 Blocpdb> 34 atoms in block 97 Block first atom: 3160 Blocpdb> 32 atoms in block 98 Block first atom: 3194 Blocpdb> 26 atoms in block 99 Block first atom: 3226 Blocpdb> 25 atoms in block 100 Block first atom: 3252 Blocpdb> 30 atoms in block 101 Block first atom: 3277 Blocpdb> 33 atoms in block 102 Block first atom: 3307 Blocpdb> 31 atoms in block 103 Block first atom: 3340 Blocpdb> 33 atoms in block 104 Block first atom: 3371 Blocpdb> 25 atoms in block 105 Block first atom: 3404 Blocpdb> 28 atoms in block 106 Block first atom: 3429 Blocpdb> 29 atoms in block 107 Block first atom: 3457 Blocpdb> 30 atoms in block 108 Block first atom: 3486 Blocpdb> 36 atoms in block 109 Block first atom: 3516 Blocpdb> 25 atoms in block 110 Block first atom: 3552 Blocpdb> 37 atoms in block 111 Block first atom: 3577 Blocpdb> 41 atoms in block 112 Block first atom: 3614 Blocpdb> 36 atoms in block 113 Block first atom: 3655 Blocpdb> 46 atoms in block 114 Block first atom: 3691 Blocpdb> 33 atoms in block 115 Block first atom: 3737 Blocpdb> 36 atoms in block 116 Block first atom: 3770 Blocpdb> 29 atoms in block 117 Block first atom: 3806 Blocpdb> 35 atoms in block 118 Block first atom: 3835 Blocpdb> 44 atoms in block 119 Block first atom: 3870 Blocpdb> 31 atoms in block 120 Block first atom: 3914 Blocpdb> 31 atoms in block 121 Block first atom: 3945 Blocpdb> 21 atoms in block 122 Block first atom: 3976 Blocpdb> 28 atoms in block 123 Block first atom: 3997 Blocpdb> 29 atoms in block 124 Block first atom: 4025 Blocpdb> 30 atoms in block 125 Block first atom: 4054 Blocpdb> 34 atoms in block 126 Block first atom: 4084 Blocpdb> 21 atoms in block 127 Block first atom: 4118 Blocpdb> 35 atoms in block 128 Block first atom: 4139 Blocpdb> 17 atoms in block 129 Block first atom: 4174 Blocpdb> 31 atoms in block 130 Block first atom: 4191 Blocpdb> 41 atoms in block 131 Block first atom: 4222 Blocpdb> 39 atoms in block 132 Block first atom: 4263 Blocpdb> 35 atoms in block 133 Block first atom: 4302 Blocpdb> 40 atoms in block 134 Block first atom: 4337 Blocpdb> 26 atoms in block 135 Block first atom: 4377 Blocpdb> 36 atoms in block 136 Block first atom: 4403 Blocpdb> 33 atoms in block 137 Block first atom: 4439 Blocpdb> 25 atoms in block 138 Block first atom: 4472 Blocpdb> 38 atoms in block 139 Block first atom: 4497 Blocpdb> 29 atoms in block 140 Block first atom: 4535 Blocpdb> 41 atoms in block 141 Block first atom: 4564 Blocpdb> 26 atoms in block 142 Block first atom: 4605 Blocpdb> 30 atoms in block 143 Block first atom: 4631 Blocpdb> 41 atoms in block 144 Block first atom: 4661 Blocpdb> 38 atoms in block 145 Block first atom: 4702 Blocpdb> 39 atoms in block 146 Block first atom: 4740 Blocpdb> 36 atoms in block 147 Block first atom: 4779 Blocpdb> 41 atoms in block 148 Block first atom: 4815 Blocpdb> 31 atoms in block 149 Block first atom: 4856 Blocpdb> 39 atoms in block 150 Block first atom: 4887 Blocpdb> 36 atoms in block 151 Block first atom: 4926 Blocpdb> 40 atoms in block 152 Block first atom: 4962 Blocpdb> 32 atoms in block 153 Block first atom: 5002 Blocpdb> 23 atoms in block 154 Block first atom: 5034 Blocpdb> 31 atoms in block 155 Block first atom: 5057 Blocpdb> 32 atoms in block 156 Block first atom: 5088 Blocpdb> 33 atoms in block 157 Block first atom: 5120 Blocpdb> 31 atoms in block 158 Block first atom: 5153 Blocpdb> 39 atoms in block 159 Block first atom: 5184 Blocpdb> 33 atoms in block 160 Block first atom: 5223 Blocpdb> 12 atoms in block 161 Block first atom: 5255 Blocpdb> 161 blocks. Blocpdb> At most, 46 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 12 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3711265 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 15801 Prepmat> Matrix trace = 8178060.0000 Prepmat> Last element read: 15801 15801 400.4588 Prepmat> 13042 lines saved. Prepmat> 11111 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5267 RTB> Total mass = 5267.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5267 RTB> Number of blocks = 161 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 417172.9386 RTB> 67065 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 966 Diagstd> Nb of non-zero elements: 67065 Diagstd> Projected matrix trace = 417172.9386 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 966 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 417172.9386 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 2.2844216 2.9120375 4.2661452 5.2612717 10.2189193 11.2771630 12.1301509 13.0010134 14.6556976 15.9860347 18.7085931 18.9900615 24.5157439 24.8573009 26.1071852 29.1085079 29.3995662 30.3821582 32.3111093 33.7565211 35.2673650 37.3612526 38.5752204 40.2821128 40.9783320 43.0531822 43.6816786 44.0648131 46.2447147 47.7761061 50.4043514 51.0052105 52.5486076 53.2140885 54.7138869 56.1673907 57.6801362 59.2904817 62.1656392 65.0512209 65.9677307 68.7554767 69.7434746 71.9634611 73.4800102 74.6853224 75.6381400 76.0971030 77.0886591 79.5543852 79.9859522 80.1733094 80.4780425 82.2186399 82.9762763 83.9019479 85.5184792 87.4925613 88.1408966 89.6975134 91.8564199 92.6511849 94.2885965 94.9117727 96.2644067 96.7235314 98.6338518 99.5663211 101.6718272 102.3078172 103.2850417 106.0949868 106.8481746 108.3113667 110.5602921 110.8284340 111.0449636 113.3681172 113.9450896 114.7442503 115.9704266 117.9265832 118.1295471 120.3793633 121.2372541 121.9668830 122.5228429 123.1513942 124.0352095 125.8287989 127.0515353 129.2481704 129.9970576 131.4776679 131.9412956 133.8799727 134.7683851 136.1786076 136.3379973 137.2015217 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034321 0.0034323 0.0034324 0.0034328 0.0034353 0.0034366 164.1282759 185.3078261 224.2916445 249.0810260 347.1344891 364.6659463 378.2059717 391.5469844 415.7177114 434.1758431 469.6949001 473.2149596 537.6724921 541.4050033 554.8496360 585.8753855 588.7972069 598.5557270 617.2643772 630.9197484 644.8842740 663.7522323 674.4495796 689.2097315 695.1402229 712.5213935 717.7032943 720.8439315 738.4589063 750.5863382 770.9554727 775.5370533 787.1833270 792.1521294 803.2376637 813.8369514 824.7235937 836.1568839 856.1906525 875.8364315 881.9847024 900.4278704 906.8742495 921.1944265 930.8503880 938.4538284 944.4211420 947.2821244 953.4337604 968.5618128 971.1853889 972.3221645 974.1682759 984.6466880 989.1729937 994.6752282 1004.2116716 1015.7360011 1019.4924459 1028.4554455 1040.7586705 1045.2514269 1054.4472682 1057.9260780 1065.4379193 1067.9756542 1078.4705170 1083.5563725 1094.9532942 1098.3725982 1103.6058522 1118.5173157 1122.4805743 1130.1401343 1141.8126994 1143.1964804 1144.3126880 1156.2207185 1159.1592026 1163.2170163 1169.4156660 1179.2371105 1180.2514693 1191.4375988 1195.6754877 1199.2679925 1201.9981875 1205.0774135 1209.3938968 1218.1066265 1224.0107696 1234.5465844 1238.1180112 1245.1488630 1247.3423058 1256.4727897 1260.6348021 1267.2133074 1267.9546930 1271.9637791 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5267 Rtb_to_modes> Number of blocs = 161 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9894E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9910E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.284 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.912 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.266 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.261 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 108.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 111.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 131.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.2 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 966 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 0.99997 1.00003 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 0.99998 0.99997 0.99996 0.99996 1.00000 1.00004 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 1.00004 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 94806 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 0.99997 1.00003 1.00002 1.00001 1.00002 1.00001 1.00003 1.00003 1.00001 0.99998 0.99997 0.99996 0.99996 1.00000 1.00004 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99998 1.00002 0.99997 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 0.99997 1.00004 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 0.99998 1.00001 1.00003 0.99999 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2108121251545562.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2108121251545562.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2108121251545562.atom Openam> file on opening on unit 11: 2108121251545562.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 321 First residue number = 1 Last residue number = 321 Number of atoms found = 5267 Mean number per residue = 16.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9894E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9910E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9931E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0008E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.284 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.912 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.266 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.261 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 108.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 111.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 131.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.2 Bfactors> 106 vectors, 15801 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 2.284000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.008 +/- 0.01 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.008 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2108121251545562.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2108121251545562.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4352E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4364E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 164.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 185.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 224.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 644.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 750.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 770.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 787.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 813.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 856.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 882.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 900.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 921.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 930.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 947.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 968.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 972.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 974.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 984.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 994.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004. 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2108121251545562.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2108121251545562.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2108121251545562 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating 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making animated gifs 11 models are in 2108121251545562.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2108121251545562.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2108121251545562.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2108121251545562 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating 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perturbed structure for DQ=80 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom making animated gifs 11 models are in 2108121251545562.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2108121251545562.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2108121251545562.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2108121251545562 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2108121251545562.eigenfacs 2108121251545562.atom making animated gifs 11 models are in 2108121251545562.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2108121251545562.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2108121251545562.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2108121251545562.10.pdb 2108121251545562.11.pdb 2108121251545562.7.pdb 2108121251545562.8.pdb 2108121251545562.9.pdb STDERR: real 0m17.738s user 0m17.620s sys 0m0.092s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: 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