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***  OXIDOREDUCTASE 08-NOV-18 6N1F  ***

LOGs for ID: 210812113332114885

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210812113332114885.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210812113332114885.atom to be opened. Openam> File opened: 210812113332114885.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 808 First residue number = 3 Last residue number = 215 Number of atoms found = 6283 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = -6.782537 +/- 13.100205 From: -38.435000 To: 30.664000 = -11.586555 +/- 16.957181 From: -50.066000 To: 30.257000 = 65.472240 +/- 30.153822 From: 7.379000 To: 123.250000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.3016 % Filled. Pdbmat> 2312387 non-zero elements. Pdbmat> 252776 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.46 +/- 20.90 Maximum number = 129 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 5.055520E+06 Pdbmat> Larger element = 486.563 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 808 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210812113332114885.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210812113332114885.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210812113332114885.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 6283 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 808 residues. Blocpdb> 39 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 39 atoms in block 2 Block first atom: 40 Blocpdb> 8 atoms in block 3 Block first atom: 79 Blocpdb> 35 atoms in block 4 Block first atom: 87 Blocpdb> 44 atoms in block 5 Block first atom: 122 Blocpdb> 18 atoms in block 6 Block first atom: 166 Blocpdb> 39 atoms in block 7 Block first atom: 184 Blocpdb> 39 atoms in block 8 Block first atom: 223 Blocpdb> 41 atoms in block 9 Block first atom: 262 Blocpdb> 35 atoms in block 10 Block first atom: 303 Blocpdb> 44 atoms in block 11 Block first atom: 338 Blocpdb> 14 atoms in block 12 Block first atom: 382 Blocpdb> 45 atoms in block 13 Block first atom: 396 Blocpdb> 30 atoms in block 14 Block first atom: 441 Blocpdb> 35 atoms in block 15 Block first atom: 471 Blocpdb> 38 atoms in block 16 Block first atom: 506 Blocpdb> 40 atoms in block 17 Block first atom: 544 Blocpdb> 34 atoms in block 18 Block first atom: 584 Blocpdb> 36 atoms in block 19 Block first atom: 618 Blocpdb> 45 atoms in block 20 Block first atom: 654 Blocpdb> 34 atoms in block 21 Block first atom: 699 Blocpdb> 32 atoms in block 22 Block first atom: 733 Blocpdb> 51 atoms in block 23 Block first atom: 765 Blocpdb> 42 atoms in block 24 Block first atom: 816 Blocpdb> 11 atoms in block 25 Block first atom: 858 Blocpdb> 42 atoms in block 26 Block first atom: 869 Blocpdb> 12 atoms in block 27 Block first atom: 911 Blocpdb> 36 atoms in block 28 Block first atom: 923 Blocpdb> 41 atoms in block 29 Block first atom: 959 Blocpdb> 40 atoms in block 30 Block first atom: 1000 Blocpdb> 34 atoms in block 31 Block first atom: 1040 Blocpdb> 32 atoms in block 32 Block first atom: 1074 Blocpdb> 44 atoms in block 33 Block first atom: 1106 Blocpdb> 34 atoms in block 34 Block first atom: 1150 Blocpdb> 38 atoms in block 35 Block first atom: 1184 Blocpdb> 35 atoms in block 36 Block first atom: 1222 Blocpdb> 38 atoms in block 37 Block first atom: 1257 Blocpdb> 42 atoms in block 38 Block first atom: 1295 Blocpdb> 41 atoms in block 39 Block first atom: 1337 Blocpdb> 44 atoms in block 40 Block first atom: 1378 Blocpdb> 40 atoms in block 41 Block first atom: 1422 Blocpdb> 50 atoms in block 42 Block first atom: 1462 Blocpdb> 36 atoms in block 43 Block first atom: 1512 Blocpdb> 21 atoms in block 44 Block first atom: 1548 Blocpdb> 37 atoms in block 45 Block first atom: 1569 Blocpdb> 39 atoms in block 46 Block first atom: 1606 Blocpdb> 8 atoms in block 47 Block first atom: 1645 Blocpdb> 35 atoms in block 48 Block first atom: 1653 Blocpdb> 44 atoms in block 49 Block first atom: 1688 Blocpdb> 18 atoms in block 50 Block first atom: 1732 Blocpdb> 39 atoms in block 51 Block first atom: 1750 Blocpdb> 39 atoms in block 52 Block first atom: 1789 Blocpdb> 41 atoms in block 53 Block first atom: 1828 Blocpdb> 35 atoms in block 54 Block first atom: 1869 Blocpdb> 34 atoms in block 55 Block first atom: 1904 Blocpdb> 30 atoms in block 56 Block first atom: 1938 Blocpdb> 43 atoms in block 57 Block first atom: 1968 Blocpdb> 37 atoms in block 58 Block first atom: 2011 Blocpdb> 35 atoms in block 59 Block first atom: 2048 Blocpdb> 44 atoms in block 60 Block first atom: 2083 Blocpdb> 40 atoms in block 61 Block first atom: 2127 Blocpdb> 38 atoms in block 62 Block first atom: 2167 Blocpdb> 36 atoms in block 63 Block first atom: 2205 Blocpdb> 45 atoms in block 64 Block first atom: 2241 Blocpdb> 34 atoms in block 65 Block first atom: 2286 Blocpdb> 32 atoms in block 66 Block first atom: 2320 Blocpdb> 47 atoms in block 67 Block first atom: 2352 Blocpdb> 42 atoms in block 68 Block first atom: 2399 Blocpdb> 11 atoms in block 69 Block first atom: 2441 Blocpdb> 42 atoms in block 70 Block first atom: 2452 Blocpdb> 17 atoms in block 71 Block first atom: 2494 Blocpdb> 36 atoms in block 72 Block first atom: 2511 Blocpdb> 41 atoms in block 73 Block first atom: 2547 Blocpdb> 40 atoms in block 74 Block first atom: 2588 Blocpdb> 34 atoms in block 75 Block first atom: 2628 Blocpdb> 32 atoms in block 76 Block first atom: 2662 Blocpdb> 44 atoms in block 77 Block first atom: 2694 Blocpdb> 34 atoms in block 78 Block first atom: 2738 Blocpdb> 38 atoms in block 79 Block first atom: 2772 Blocpdb> 35 atoms in block 80 Block first atom: 2810 Blocpdb> 35 atoms in block 81 Block first atom: 2845 Blocpdb> 42 atoms in block 82 Block first atom: 2880 Blocpdb> 41 atoms in block 83 Block first atom: 2922 Blocpdb> 44 atoms in block 84 Block first atom: 2963 Blocpdb> 40 atoms in block 85 Block first atom: 3007 Blocpdb> 50 atoms in block 86 Block first atom: 3047 Blocpdb> 36 atoms in block 87 Block first atom: 3097 Blocpdb> 11 atoms in block 88 Block first atom: 3133 Blocpdb> 39 atoms in block 89 Block first atom: 3144 Blocpdb> 39 atoms in block 90 Block first atom: 3183 Blocpdb> 8 atoms in block 91 Block first atom: 3222 Blocpdb> 35 atoms in block 92 Block first atom: 3230 Blocpdb> 40 atoms in block 93 Block first atom: 3265 Blocpdb> 18 atoms in block 94 Block first atom: 3305 Blocpdb> 39 atoms in block 95 Block first atom: 3323 Blocpdb> 39 atoms in block 96 Block first atom: 3362 Blocpdb> 41 atoms in block 97 Block first atom: 3401 Blocpdb> 35 atoms in block 98 Block first atom: 3442 Blocpdb> 40 atoms in block 99 Block first atom: 3477 Blocpdb> 14 atoms in block 100 Block first atom: 3517 Blocpdb> 45 atoms in block 101 Block first atom: 3531 Blocpdb> 30 atoms in block 102 Block first atom: 3576 Blocpdb> 35 atoms in block 103 Block first atom: 3606 Blocpdb> 38 atoms in block 104 Block first atom: 3641 Blocpdb> 40 atoms in block 105 Block first atom: 3679 Blocpdb> 38 atoms in block 106 Block first atom: 3719 Blocpdb> 36 atoms in block 107 Block first atom: 3757 Blocpdb> 45 atoms in block 108 Block first atom: 3793 Blocpdb> 34 atoms in block 109 Block first atom: 3838 Blocpdb> 32 atoms in block 110 Block first atom: 3872 Blocpdb> 51 atoms in block 111 Block first atom: 3904 Blocpdb> 42 atoms in block 112 Block first atom: 3955 Blocpdb> 11 atoms in block 113 Block first atom: 3997 Blocpdb> 42 atoms in block 114 Block first atom: 4008 Blocpdb> 12 atoms in block 115 Block first atom: 4050 Blocpdb> 36 atoms in block 116 Block first atom: 4062 Blocpdb> 41 atoms in block 117 Block first atom: 4098 Blocpdb> 40 atoms in block 118 Block first atom: 4139 Blocpdb> 34 atoms in block 119 Block first atom: 4179 Blocpdb> 29 atoms in block 120 Block first atom: 4213 Blocpdb> 44 atoms in block 121 Block first atom: 4242 Blocpdb> 38 atoms in block 122 Block first atom: 4286 Blocpdb> 38 atoms in block 123 Block first atom: 4324 Blocpdb> 35 atoms in block 124 Block first atom: 4362 Blocpdb> 35 atoms in block 125 Block first atom: 4397 Blocpdb> 42 atoms in block 126 Block first atom: 4432 Blocpdb> 41 atoms in block 127 Block first atom: 4474 Blocpdb> 44 atoms in block 128 Block first atom: 4515 Blocpdb> 40 atoms in block 129 Block first atom: 4559 Blocpdb> 50 atoms in block 130 Block first atom: 4599 Blocpdb> 36 atoms in block 131 Block first atom: 4649 Blocpdb> 10 atoms in block 132 Block first atom: 4685 Blocpdb> 39 atoms in block 133 Block first atom: 4695 Blocpdb> 39 atoms in block 134 Block first atom: 4734 Blocpdb> 8 atoms in block 135 Block first atom: 4773 Blocpdb> 35 atoms in block 136 Block first atom: 4781 Blocpdb> 44 atoms in block 137 Block first atom: 4816 Blocpdb> 18 atoms in block 138 Block first atom: 4860 Blocpdb> 39 atoms in block 139 Block first atom: 4878 Blocpdb> 39 atoms in block 140 Block first atom: 4917 Blocpdb> 41 atoms in block 141 Block first atom: 4956 Blocpdb> 35 atoms in block 142 Block first atom: 4997 Blocpdb> 44 atoms in block 143 Block first atom: 5032 Blocpdb> 30 atoms in block 144 Block first atom: 5076 Blocpdb> 29 atoms in block 145 Block first atom: 5106 Blocpdb> 45 atoms in block 146 Block first atom: 5135 Blocpdb> 30 atoms in block 147 Block first atom: 5180 Blocpdb> 35 atoms in block 148 Block first atom: 5210 Blocpdb> 40 atoms in block 149 Block first atom: 5245 Blocpdb> 40 atoms in block 150 Block first atom: 5285 Blocpdb> 38 atoms in block 151 Block first atom: 5325 Blocpdb> 36 atoms in block 152 Block first atom: 5363 Blocpdb> 45 atoms in block 153 Block first atom: 5399 Blocpdb> 34 atoms in block 154 Block first atom: 5444 Blocpdb> 32 atoms in block 155 Block first atom: 5478 Blocpdb> 47 atoms in block 156 Block first atom: 5510 Blocpdb> 42 atoms in block 157 Block first atom: 5557 Blocpdb> 11 atoms in block 158 Block first atom: 5599 Blocpdb> 42 atoms in block 159 Block first atom: 5610 Blocpdb> 12 atoms in block 160 Block first atom: 5652 Blocpdb> 36 atoms in block 161 Block first atom: 5664 Blocpdb> 41 atoms in block 162 Block first atom: 5700 Blocpdb> 40 atoms in block 163 Block first atom: 5741 Blocpdb> 34 atoms in block 164 Block first atom: 5781 Blocpdb> 32 atoms in block 165 Block first atom: 5815 Blocpdb> 44 atoms in block 166 Block first atom: 5847 Blocpdb> 28 atoms in block 167 Block first atom: 5891 Blocpdb> 38 atoms in block 168 Block first atom: 5919 Blocpdb> 35 atoms in block 169 Block first atom: 5957 Blocpdb> 35 atoms in block 170 Block first atom: 5992 Blocpdb> 36 atoms in block 171 Block first atom: 6027 Blocpdb> 41 atoms in block 172 Block first atom: 6063 Blocpdb> 44 atoms in block 173 Block first atom: 6104 Blocpdb> 40 atoms in block 174 Block first atom: 6148 Blocpdb> 50 atoms in block 175 Block first atom: 6188 Blocpdb> 30 atoms in block 176 Block first atom: 6238 Blocpdb> 16 atoms in block 177 Block first atom: 6267 Blocpdb> 177 blocks. Blocpdb> At most, 51 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2312564 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 18849 Prepmat> Matrix trace = 5055520.0000 Prepmat> Last element read: 18849 18849 53.2534 Prepmat> 15754 lines saved. Prepmat> 14297 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 6283 RTB> Total mass = 6283.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 6283 RTB> Number of blocks = 177 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 202594.5144 RTB> 49761 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1062 Diagstd> Nb of non-zero elements: 49761 Diagstd> Projected matrix trace = 202594.5144 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1062 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 202594.5144 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0368920 0.0705687 0.1595665 0.3251743 0.4268629 0.7813009 0.9490277 1.3741174 1.6102857 2.1206580 2.5567708 3.3301455 3.8446617 4.6081676 5.6768952 5.7995573 6.4574144 7.1304586 7.3675239 8.9355568 10.1040980 11.1932606 11.6785895 12.5898820 13.1409878 13.9902547 14.3251458 14.8583339 15.0544235 15.5412171 15.8221337 16.1127543 16.6458713 17.4317671 17.6186460 18.1350991 18.3184468 19.9298801 20.4986826 20.6558423 21.0977484 21.2866706 21.7213509 21.9864248 23.0279572 23.5453857 23.7337432 23.9345807 24.2958352 24.8745742 25.1070376 25.1267753 25.9884384 26.4016929 26.7795493 27.0154419 27.2282934 27.5541197 28.2740367 28.5016846 28.9017797 29.1030127 29.4120638 30.0449564 30.2077979 31.0398807 31.3942072 31.7473942 32.2378770 32.6745510 33.2385223 33.3891120 33.6200468 34.3273443 34.7340251 35.5155412 35.9678931 36.0730595 36.6043803 37.1413954 37.6436404 38.0443170 38.4966504 38.9889390 39.2648399 39.3756821 39.7253078 40.5484761 40.9009561 41.1191835 41.4601268 41.6821462 41.8889193 42.0186091 42.6388520 42.8179279 43.3227810 43.7181629 44.3769778 44.6412624 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034310 0.0034311 0.0034328 0.0034331 0.0034336 0.0034338 20.8574501 28.8470429 43.3776645 61.9231978 70.9478908 95.9852389 105.7875892 127.2937845 137.7992146 158.1359466 173.6365627 198.1649682 212.9238687 233.1091989 258.7323411 261.5126499 275.9463224 289.9706303 294.7515230 324.6056613 345.1787534 363.3068511 371.0995925 385.3062996 393.6491208 406.1702325 411.0028241 418.5817957 421.3348139 428.0926719 431.9443572 435.8932784 443.0457212 453.3837891 455.8075815 462.4398443 464.7716237 484.7832694 491.6525050 493.5336109 498.7849432 501.0131789 506.1027482 509.1814667 521.1022965 526.9242488 529.0276843 531.2613145 535.2555722 541.5930819 544.1179045 544.3317397 553.5863492 557.9704100 561.9490125 564.4186013 566.6377329 570.0179741 577.4164988 579.7363676 583.7912395 585.8200813 588.9223408 595.2248708 596.8357286 604.9998991 608.4431984 611.8561397 616.5644737 620.7262254 626.0602559 627.4768606 629.6430835 636.2318159 639.9894825 647.1493198 651.2575626 652.2089732 656.9946145 661.7963818 666.2559309 669.7923396 673.7623703 678.0566643 680.4515314 681.4112906 684.4298082 691.4846582 694.4836256 696.3338724 699.2147691 701.0844206 702.8212085 703.9083490 709.0845651 710.5720216 714.7488151 718.0029558 723.3927329 725.5435977 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 6283 Rtb_to_modes> Number of blocs = 177 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9828E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9833E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9930E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.6892E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.0569E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1596 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3252 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4269 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7813 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9490 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.374 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.610 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.121 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.557 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.845 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.608 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.677 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.800 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.130 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.368 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.936 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.64 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1062 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 1.00000 0.99995 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99996 1.00003 0.99999 0.99995 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 113094 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99997 0.99997 0.99999 1.00000 0.99995 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00003 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99996 1.00003 0.99999 0.99995 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99997 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210812113332114885.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210812113332114885.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210812113332114885.atom Openam> file on opening on unit 11: 210812113332114885.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 808 First residue number = 3 Last residue number = 215 Number of atoms found = 6283 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9828E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9833E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9930E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9978E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.6892E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.0569E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1596 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3252 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4269 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7813 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9490 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.374 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.610 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.121 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.557 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.845 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.608 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.677 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.800 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.130 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.368 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.936 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.64 Bfactors> 106 vectors, 18849 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.036892 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.256 for 810 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.154 +/- 0.09 Bfactors> = 34.188 +/- 12.76 Bfactors> Shiftng-fct= 34.034 Bfactors> Scaling-fct= 138.231 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210812113332114885.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210812113332114885.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4309E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4309E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 20.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 28.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 43.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 95.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 127.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 137.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 453.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 531.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.8 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Chkmod> That is: 6283 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210812113332114885.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210812113332114885.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 210812113332114885 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 210812113332114885 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=100 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom making animated gifs 11 models are in 210812113332114885.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210812113332114885.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210812113332114885.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 210812113332114885 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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210812113332114885.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 210812113332114885 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210812113332114885.eigenfacs 210812113332114885.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210812113332114885.eigenfacs 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210812113332114885.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 210812113332114885.10.pdb 210812113332114885.11.pdb 210812113332114885.7.pdb 210812113332114885.8.pdb 210812113332114885.9.pdb STDERR: real 0m23.228s user 0m23.144s sys 0m0.072s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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