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***  TRANSFERASE 04-FEB-04 1S9I  ***

LOGs for ID: 21080402425042499

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21080402425042499.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21080402425042499.atom to be opened. Openam> File opened: 21080402425042499.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 594 First residue number = 60 Last residue number = 389 Number of atoms found = 4686 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 28.163845 +/- 16.635716 From: -12.845000 To: 64.846000 = 105.822657 +/- 17.269559 From: 67.347000 To: 143.916000 = 45.133117 +/- 11.507650 From: 10.490000 To: 73.457000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.7046 % Filled. Pdbmat> 1684537 non-zero elements. Pdbmat> 184074 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.56 +/- 22.75 Maximum number = 130 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 3.681480E+06 Pdbmat> Larger element = 496.247 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 594 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21080402425042499.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21080402425042499.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21080402425042499.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4686 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 594 residues. Blocpdb> 23 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 20 atoms in block 2 Block first atom: 24 Blocpdb> 26 atoms in block 3 Block first atom: 44 Blocpdb> 24 atoms in block 4 Block first atom: 70 Blocpdb> 31 atoms in block 5 Block first atom: 94 Blocpdb> 23 atoms in block 6 Block first atom: 125 Blocpdb> 17 atoms in block 7 Block first atom: 148 Blocpdb> 16 atoms in block 8 Block first atom: 165 Blocpdb> 18 atoms in block 9 Block first atom: 181 Blocpdb> 23 atoms in block 10 Block first atom: 199 Blocpdb> 30 atoms in block 11 Block first atom: 222 Blocpdb> 17 atoms in block 12 Block first atom: 252 Blocpdb> 24 atoms in block 13 Block first atom: 269 Blocpdb> 25 atoms in block 14 Block first atom: 293 Blocpdb> 26 atoms in block 15 Block first atom: 318 Blocpdb> 25 atoms in block 16 Block first atom: 344 Blocpdb> 21 atoms in block 17 Block first atom: 369 Blocpdb> 27 atoms in block 18 Block first atom: 390 Blocpdb> 25 atoms in block 19 Block first atom: 417 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 442 Blocpdb> 24 atoms in block 21 Block first atom: 470 Blocpdb> 25 atoms in block 22 Block first atom: 494 Blocpdb> 21 atoms in block 23 Block first atom: 519 Blocpdb> 27 atoms in block 24 Block first atom: 540 Blocpdb> 27 atoms in block 25 Block first atom: 567 Blocpdb> 20 atoms in block 26 Block first atom: 594 Blocpdb> 26 atoms in block 27 Block first atom: 614 Blocpdb> 21 atoms in block 28 Block first atom: 640 Blocpdb> 20 atoms in block 29 Block first atom: 661 Blocpdb> 27 atoms in block 30 Block first atom: 681 Blocpdb> 20 atoms in block 31 Block first atom: 708 Blocpdb> 18 atoms in block 32 Block first atom: 728 Blocpdb> 24 atoms in block 33 Block first atom: 746 Blocpdb> 26 atoms in block 34 Block first atom: 770 Blocpdb> 25 atoms in block 35 Block first atom: 796 Blocpdb> 24 atoms in block 36 Block first atom: 821 Blocpdb> 25 atoms in block 37 Block first atom: 845 Blocpdb> 20 atoms in block 38 Block first atom: 870 Blocpdb> 19 atoms in block 39 Block first atom: 890 Blocpdb> 26 atoms in block 40 Block first atom: 909 Blocpdb> 17 atoms in block 41 Block first atom: 935 Blocpdb> 31 atoms in block 42 Block first atom: 952 Blocpdb> 28 atoms in block 43 Block first atom: 983 Blocpdb> 25 atoms in block 44 Block first atom: 1011 Blocpdb> 29 atoms in block 45 Block first atom: 1036 Blocpdb> 23 atoms in block 46 Block first atom: 1065 Blocpdb> 22 atoms in block 47 Block first atom: 1088 Blocpdb> 23 atoms in block 48 Block first atom: 1110 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1133 Blocpdb> 26 atoms in block 50 Block first atom: 1154 Blocpdb> 22 atoms in block 51 Block first atom: 1180 Blocpdb> 22 atoms in block 52 Block first atom: 1202 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 1224 Blocpdb> 24 atoms in block 54 Block first atom: 1243 Blocpdb> 14 atoms in block 55 Block first atom: 1267 Blocpdb> 18 atoms in block 56 Block first atom: 1281 Blocpdb> 29 atoms in block 57 Block first atom: 1299 Blocpdb> 20 atoms in block 58 Block first atom: 1328 Blocpdb> 28 atoms in block 59 Block first atom: 1348 Blocpdb> 20 atoms in block 60 Block first atom: 1376 Blocpdb> 28 atoms in block 61 Block first atom: 1396 Blocpdb> 22 atoms in block 62 Block first atom: 1424 Blocpdb> 30 atoms in block 63 Block first atom: 1446 Blocpdb> 18 atoms in block 64 Block first atom: 1476 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1494 Blocpdb> 24 atoms in block 66 Block first atom: 1516 Blocpdb> 16 atoms in block 67 Block first atom: 1540 Blocpdb> 30 atoms in block 68 Block first atom: 1556 Blocpdb> 22 atoms in block 69 Block first atom: 1586 Blocpdb> 20 atoms in block 70 Block first atom: 1608 Blocpdb> 26 atoms in block 71 Block first atom: 1628 Blocpdb> 22 atoms in block 72 Block first atom: 1654 Blocpdb> 26 atoms in block 73 Block first atom: 1676 Blocpdb> 21 atoms in block 74 Block first atom: 1702 Blocpdb> 8 atoms in block 75 Block first atom: 1723 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1731 Blocpdb> 21 atoms in block 77 Block first atom: 1754 Blocpdb> 28 atoms in block 78 Block first atom: 1775 Blocpdb> 28 atoms in block 79 Block first atom: 1803 Blocpdb> 23 atoms in block 80 Block first atom: 1831 Blocpdb> 23 atoms in block 81 Block first atom: 1854 Blocpdb> 24 atoms in block 82 Block first atom: 1877 Blocpdb> 19 atoms in block 83 Block first atom: 1901 Blocpdb> 25 atoms in block 84 Block first atom: 1920 Blocpdb> 26 atoms in block 85 Block first atom: 1945 Blocpdb> 29 atoms in block 86 Block first atom: 1971 Blocpdb> 24 atoms in block 87 Block first atom: 2000 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 2024 Blocpdb> 24 atoms in block 89 Block first atom: 2046 Blocpdb> 25 atoms in block 90 Block first atom: 2070 Blocpdb> 21 atoms in block 91 Block first atom: 2095 Blocpdb> 25 atoms in block 92 Block first atom: 2116 Blocpdb> 25 atoms in block 93 Block first atom: 2141 Blocpdb> 26 atoms in block 94 Block first atom: 2166 Blocpdb> 26 atoms in block 95 Block first atom: 2192 Blocpdb> 25 atoms in block 96 Block first atom: 2218 Blocpdb> 24 atoms in block 97 Block first atom: 2243 Blocpdb> 20 atoms in block 98 Block first atom: 2267 Blocpdb> 28 atoms in block 99 Block first atom: 2287 Blocpdb> 24 atoms in block 100 Block first atom: 2315 Blocpdb> 27 atoms in block 101 Block first atom: 2339 Blocpdb> 20 atoms in block 102 Block first atom: 2366 Blocpdb> 25 atoms in block 103 Block first atom: 2386 Blocpdb> 21 atoms in block 104 Block first atom: 2411 Blocpdb> 21 atoms in block 105 Block first atom: 2432 Blocpdb> 25 atoms in block 106 Block first atom: 2453 Blocpdb> 28 atoms in block 107 Block first atom: 2478 Blocpdb> 25 atoms in block 108 Block first atom: 2506 Blocpdb> 21 atoms in block 109 Block first atom: 2531 Blocpdb> 17 atoms in block 110 Block first atom: 2552 Blocpdb> 15 atoms in block 111 Block first atom: 2569 Blocpdb> 23 atoms in block 112 Block first atom: 2584 Blocpdb> 26 atoms in block 113 Block first atom: 2607 Blocpdb> 24 atoms in block 114 Block first atom: 2633 Blocpdb> 20 atoms in block 115 Block first atom: 2657 Blocpdb> 24 atoms in block 116 Block first atom: 2677 Blocpdb> 25 atoms in block 117 Block first atom: 2701 Blocpdb> 27 atoms in block 118 Block first atom: 2726 Blocpdb> 24 atoms in block 119 Block first atom: 2753 Blocpdb> 24 atoms in block 120 Block first atom: 2777 Blocpdb> 25 atoms in block 121 Block first atom: 2801 Blocpdb> 28 atoms in block 122 Block first atom: 2826 Blocpdb> 24 atoms in block 123 Block first atom: 2854 Blocpdb> 27 atoms in block 124 Block first atom: 2878 Blocpdb> 20 atoms in block 125 Block first atom: 2905 Blocpdb> 27 atoms in block 126 Block first atom: 2925 Blocpdb> 22 atoms in block 127 Block first atom: 2952 Blocpdb> 21 atoms in block 128 Block first atom: 2974 Blocpdb> 29 atoms in block 129 Block first atom: 2995 Blocpdb> 21 atoms in block 130 Block first atom: 3024 Blocpdb> 22 atoms in block 131 Block first atom: 3045 Blocpdb> 23 atoms in block 132 Block first atom: 3067 Blocpdb> 26 atoms in block 133 Block first atom: 3090 Blocpdb> 14 atoms in block 134 Block first atom: 3116 Blocpdb> 25 atoms in block 135 Block first atom: 3130 Blocpdb> 24 atoms in block 136 Block first atom: 3155 Blocpdb> 23 atoms in block 137 Block first atom: 3179 Blocpdb> 26 atoms in block 138 Block first atom: 3202 Blocpdb> 26 atoms in block 139 Block first atom: 3228 Blocpdb> 21 atoms in block 140 Block first atom: 3254 Blocpdb> 21 atoms in block 141 Block first atom: 3275 Blocpdb> 20 atoms in block 142 Block first atom: 3296 Blocpdb> 23 atoms in block 143 Block first atom: 3316 Blocpdb> 25 atoms in block 144 Block first atom: 3339 Blocpdb> 29 atoms in block 145 Block first atom: 3364 Blocpdb> 27 atoms in block 146 Block first atom: 3393 Blocpdb> 29 atoms in block 147 Block first atom: 3420 Blocpdb> 24 atoms in block 148 Block first atom: 3449 Blocpdb> 21 atoms in block 149 Block first atom: 3473 Blocpdb> 23 atoms in block 150 Block first atom: 3494 Blocpdb> 25 atoms in block 151 Block first atom: 3517 Blocpdb> 21 atoms in block 152 Block first atom: 3542 Blocpdb> 23 atoms in block 153 Block first atom: 3563 Blocpdb> 23 atoms in block 154 Block first atom: 3586 Blocpdb> 17 atoms in block 155 Block first atom: 3609 Blocpdb> 25 atoms in block 156 Block first atom: 3626 Blocpdb> 22 atoms in block 157 Block first atom: 3651 Blocpdb> 24 atoms in block 158 Block first atom: 3673 Blocpdb> 25 atoms in block 159 Block first atom: 3697 Blocpdb> 27 atoms in block 160 Block first atom: 3722 Blocpdb> 21 atoms in block 161 Block first atom: 3749 Blocpdb> 29 atoms in block 162 Block first atom: 3770 Blocpdb> 22 atoms in block 163 Block first atom: 3799 Blocpdb> 22 atoms in block 164 Block first atom: 3821 Blocpdb> 28 atoms in block 165 Block first atom: 3843 Blocpdb> 18 atoms in block 166 Block first atom: 3871 Blocpdb> 24 atoms in block 167 Block first atom: 3889 Blocpdb> 20 atoms in block 168 Block first atom: 3913 Blocpdb> 27 atoms in block 169 Block first atom: 3933 Blocpdb> 22 atoms in block 170 Block first atom: 3960 Blocpdb> 22 atoms in block 171 Block first atom: 3982 Blocpdb> 23 atoms in block 172 Block first atom: 4004 Blocpdb> 22 atoms in block 173 Block first atom: 4027 Blocpdb> 23 atoms in block 174 Block first atom: 4049 Blocpdb> 11 atoms in block 175 Block first atom: 4072 Blocpdb> 21 atoms in block 176 Block first atom: 4083 Blocpdb> 28 atoms in block 177 Block first atom: 4104 Blocpdb> 28 atoms in block 178 Block first atom: 4132 Blocpdb> 23 atoms in block 179 Block first atom: 4160 Blocpdb> 23 atoms in block 180 Block first atom: 4183 Blocpdb> 24 atoms in block 181 Block first atom: 4206 Blocpdb> 19 atoms in block 182 Block first atom: 4230 Blocpdb> 25 atoms in block 183 Block first atom: 4249 Blocpdb> 26 atoms in block 184 Block first atom: 4274 Blocpdb> 29 atoms in block 185 Block first atom: 4300 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 4329 Blocpdb> 22 atoms in block 187 Block first atom: 4353 Blocpdb> 24 atoms in block 188 Block first atom: 4375 Blocpdb> 25 atoms in block 189 Block first atom: 4399 Blocpdb> 21 atoms in block 190 Block first atom: 4424 Blocpdb> 25 atoms in block 191 Block first atom: 4445 Blocpdb> 25 atoms in block 192 Block first atom: 4470 Blocpdb> 26 atoms in block 193 Block first atom: 4495 Blocpdb> 26 atoms in block 194 Block first atom: 4521 Blocpdb> 25 atoms in block 195 Block first atom: 4547 Blocpdb> 24 atoms in block 196 Block first atom: 4572 Blocpdb> 20 atoms in block 197 Block first atom: 4596 Blocpdb> 28 atoms in block 198 Block first atom: 4616 Blocpdb> 24 atoms in block 199 Block first atom: 4644 Blocpdb> 19 atoms in block 200 Block first atom: 4667 Blocpdb> 200 blocks. Blocpdb> At most, 31 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1684737 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 14058 Prepmat> Matrix trace = 3681480.0000 Prepmat> Last element read: 14058 14058 137.3428 Prepmat> 20101 lines saved. Prepmat> 18123 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4686 RTB> Total mass = 4686.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4686 RTB> Number of blocks = 200 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 243422.9731 RTB> 68172 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1200 Diagstd> Nb of non-zero elements: 68172 Diagstd> Projected matrix trace = 243422.9731 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1200 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 243422.9731 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.5042961 0.6474579 1.5500957 1.7462231 2.1765346 2.4545793 2.7629328 3.4762296 3.8279890 4.3900073 4.6562571 4.7081403 5.1518799 6.2287561 6.9731354 7.7754493 8.2614615 8.6338752 8.9572232 9.4224333 10.0414718 10.4131672 10.7179920 11.0009694 11.4517238 11.8561827 12.3266032 12.4153670 12.9585102 13.5077005 14.3641287 14.5527761 15.3644441 15.9353434 16.2475126 16.6118327 16.7872710 17.0073266 17.9766191 18.7763937 19.0593889 20.2735318 20.5808283 20.9055171 21.7837216 21.9921892 22.3994785 22.4719376 23.2878786 23.4452967 24.2434149 24.4800537 24.9709457 25.5134387 25.6937905 26.0430891 26.4010233 26.7452774 27.4899387 27.8640871 28.2956328 28.8322070 29.0452178 29.2670651 29.8088702 30.2483384 30.4390073 31.0411493 31.1648615 31.4843252 32.2624439 32.5682067 32.9343733 33.5483135 34.3013951 34.5990570 34.8863054 35.5569073 36.0337791 36.2300044 36.5263829 37.0542010 37.3872002 37.8174615 38.2291866 38.2635562 38.4611735 39.1517165 39.3908278 39.8484458 40.3712207 40.4206727 40.8486298 41.1609917 41.4545296 42.1912080 42.8748699 42.9914545 43.9921317 44.0998751 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034328 0.0034343 0.0034346 0.0034352 0.0034357 77.1148593 87.3777874 135.1993297 143.4977692 160.2057375 170.1311416 180.5013454 202.4647886 212.4616845 227.5243590 234.3223735 235.6242461 246.4779900 271.0166323 286.7538977 302.8015036 312.1215270 319.0789565 324.9989652 333.3318521 344.1073633 350.4182382 355.5101423 360.1726722 367.4774665 373.9105527 381.2562637 382.6265134 390.9064325 399.1039181 411.5616729 414.2554239 425.6510477 433.4869155 437.7122710 442.5925048 444.9234858 447.8301265 460.4148139 470.5452256 474.0779605 488.9449738 492.6366354 496.5074139 506.8288393 509.2482108 513.9421460 514.7727401 524.0349401 525.8031055 534.6778305 537.2809762 542.6412137 548.5039737 550.4392187 554.1681081 557.9633336 561.5893112 569.3537250 573.2151895 577.6369760 583.0881615 585.2381102 587.4688820 592.8816905 597.2360877 599.1154548 605.0122617 606.2166792 609.3158497 616.7993556 619.7152786 623.1892914 628.9710069 635.9912965 638.7448496 641.3908636 647.5260873 651.8537773 653.6262321 656.2942720 661.0190976 663.9826817 667.7923922 671.4177358 671.7194835 673.4518434 679.4706216 681.5423292 685.4897639 689.9716097 690.3940645 694.0392425 696.6877832 699.1675704 705.3525817 711.0443470 712.0104205 720.2491989 721.1306592 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4686 Rtb_to_modes> Number of blocs = 200 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5043 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6475 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.550 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.746 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.177 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.455 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.763 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.476 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.828 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.390 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.656 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.708 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.152 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.229 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.973 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.775 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.261 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.634 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.957 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.422 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.10 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1200 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00005 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 0.99997 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 0.99997 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 84348 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00002 1.00005 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00004 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00003 0.99997 0.99998 0.99998 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00003 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 0.99997 1.00003 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21080402425042499.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21080402425042499.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21080402425042499.atom Openam> file on opening on unit 11: 21080402425042499.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 594 First residue number = 60 Last residue number = 389 Number of atoms found = 4686 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9868E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9935E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5043 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6475 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.550 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.746 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.177 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.455 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.763 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.476 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.828 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.390 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.656 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.708 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.152 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.229 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.973 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.775 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.261 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.634 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.957 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.422 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.10 Bfactors> 106 vectors, 14058 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.504300 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.476 for 594 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.035 +/- 0.03 Bfactors> = 41.788 +/- 14.49 Bfactors> Shiftng-fct= 41.753 Bfactors> Scaling-fct= 480.852 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21080402425042499.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21080402425042499.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 77.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 87.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 234.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 271.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 360.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 382.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 399.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 524.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 534.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 550.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 606.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 653.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.1 Chkmod> 106 vectors, 14058 coordinates in file. Chkmod> That is: 4686 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 17 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8209 0.0034 0.7761 0.0034 0.9845 0.0034 0.9634 0.0034 0.7807 0.0034 0.8175 77.1118 0.6627 87.3769 0.7331 135.1894 0.5061 143.4824 0.6468 160.2160 0.7181 170.1384 0.0145 180.4958 0.4863 202.4494 0.4578 212.4529 0.5633 227.5144 0.1257 234.3058 0.0480 235.6106 0.4150 246.4703 0.3229 271.0103 0.1465 286.7388 0.5135 302.7798 0.3487 312.0994 0.2895 319.0676 0.3997 324.9810 0.4416 333.3099 0.5765 344.0674 0.2636 350.3499 0.2997 355.5282 0.5664 360.1413 0.4225 367.4340 0.2593 373.9547 0.3282 381.2924 0.3333 382.6815 0.3850 390.9121 0.4730 399.1208 0.3798 411.4849 0.4253 414.1981 0.4144 425.5712 0.2320 433.5316 0.3904 437.7270 0.3786 442.5491 0.2737 444.9405 0.1618 447.8461 0.3461 460.4383 0.3682 470.5702 0.3150 474.0652 0.4387 488.8814 0.3569 492.6056 0.4211 496.5393 0.2889 506.7638 0.4691 509.2010 0.4521 513.9261 0.4257 514.7284 0.3640 524.0363 0.1760 525.8333 0.3365 534.6172 0.1288 537.2573 0.3262 542.6076 0.2457 548.4435 0.2744 550.3750 0.3746 554.1115 0.4384 557.9286 0.4226 561.6148 0.5230 569.3299 0.5025 573.1485 0.3184 577.6568 0.4857 583.0408 0.4124 585.2612 0.2989 587.4731 0.5666 592.8675 0.3615 597.2269 0.3892 599.0995 0.3970 604.9751 0.4950 606.1434 0.4012 609.2478 0.4145 616.7495 0.4305 619.7057 0.3690 623.1212 0.3707 628.9598 0.2243 635.9511 0.4203 638.7261 0.4110 641.3973 0.4833 647.5264 0.2749 651.7916 0.5104 653.5981 0.2960 656.2986 0.2600 660.9533 0.3051 663.9790 0.4617 667.7861 0.4136 671.3961 0.3388 671.6594 0.4275 673.4127 0.2706 679.4266 0.3005 681.5059 0.3237 685.4737 0.3843 689.9316 0.4422 690.3587 0.3000 694.0211 0.4165 696.6495 0.3927 699.0994 0.3759 705.3122 0.3272 710.9734 0.3201 711.9678 0.4230 720.2008 0.2360 721.1007 0.2648 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 21080402425042499 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 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plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21080402425042499.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21080402425042499.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 21080402425042499 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom making animated gifs 11 models are in 21080402425042499.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21080402425042499.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21080402425042499.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21080402425042499 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21080402425042499.eigenfacs 21080402425042499.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21080402425042499.eigenfacs 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