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***  OXYGEN TRANSPORT 11-APR-14 3WTG  ***

LOGs for ID: 210803214731129569

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210803214731129569.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210803214731129569.atom to be opened. Openam> File opened: 210803214731129569.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 568 First residue number = 1 Last residue number = 146 Number of atoms found = 4419 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = -16.368642 +/- 14.963450 From: -50.608000 To: 15.469000 = -1.566735 +/- 13.642533 From: -33.825000 To: 28.017000 = 13.701210 +/- 12.120502 From: -13.645000 To: 42.405000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8649 % Filled. Pdbmat> 1638874 non-zero elements. Pdbmat> 179187 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.10 +/- 20.16 Maximum number = 129 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 3.583740E+06 Pdbmat> Larger element = 533.503 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 568 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210803214731129569.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210803214731129569.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210803214731129569.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4419 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 568 residues. Blocpdb> 21 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 18 atoms in block 2 Block first atom: 22 Blocpdb> 24 atoms in block 3 Block first atom: 40 Blocpdb> 22 atoms in block 4 Block first atom: 64 Blocpdb> 23 atoms in block 5 Block first atom: 86 Blocpdb> 21 atoms in block 6 Block first atom: 109 Blocpdb> 22 atoms in block 7 Block first atom: 130 Blocpdb> 30 atoms in block 8 Block first atom: 152 Blocpdb> 18 atoms in block 9 Block first atom: 182 Blocpdb> 24 atoms in block 10 Block first atom: 200 Blocpdb> 30 atoms in block 11 Block first atom: 224 Blocpdb> 26 atoms in block 12 Block first atom: 254 Blocpdb> 23 atoms in block 13 Block first atom: 280 Blocpdb> 28 atoms in block 14 Block first atom: 303 Blocpdb> 28 atoms in block 15 Block first atom: 331 Blocpdb> 27 atoms in block 16 Block first atom: 359 Blocpdb> 24 atoms in block 17 Block first atom: 386 Blocpdb> 20 atoms in block 18 Block first atom: 410 Blocpdb> 21 atoms in block 19 Block first atom: 430 Blocpdb> 23 atoms in block 20 Block first atom: 451 Blocpdb> 21 atoms in block 21 Block first atom: 474 Blocpdb> 18 atoms in block 22 Block first atom: 495 Blocpdb> 21 atoms in block 23 Block first atom: 513 Blocpdb> 23 atoms in block 24 Block first atom: 534 Blocpdb> 24 atoms in block 25 Block first atom: 557 Blocpdb> 21 atoms in block 26 Block first atom: 581 Blocpdb> 19 atoms in block 27 Block first atom: 602 Blocpdb> 23 atoms in block 28 Block first atom: 621 Blocpdb> 26 atoms in block 29 Block first atom: 644 Blocpdb> 23 atoms in block 30 Block first atom: 670 Blocpdb> 26 atoms in block 31 Block first atom: 693 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 719 Blocpdb> 28 atoms in block 33 Block first atom: 741 Blocpdb> 20 atoms in block 34 Block first atom: 769 Blocpdb> 26 atoms in block 35 Block first atom: 789 Blocpdb> 22 atoms in block 36 Block first atom: 815 Blocpdb> 20 atoms in block 37 Block first atom: 837 Blocpdb> 27 atoms in block 38 Block first atom: 857 Blocpdb> 22 atoms in block 39 Block first atom: 884 Blocpdb> 23 atoms in block 40 Block first atom: 906 Blocpdb> 22 atoms in block 41 Block first atom: 929 Blocpdb> 22 atoms in block 42 Block first atom: 951 Blocpdb> 28 atoms in block 43 Block first atom: 973 Blocpdb> 18 atoms in block 44 Block first atom: 1001 Blocpdb> 20 atoms in block 45 Block first atom: 1019 Blocpdb> 20 atoms in block 46 Block first atom: 1039 Blocpdb> 30 atoms in block 47 Block first atom: 1059 Blocpdb> 20 atoms in block 48 Block first atom: 1089 Blocpdb> 27 atoms in block 49 Block first atom: 1109 Blocpdb> 22 atoms in block 50 Block first atom: 1136 Blocpdb> 28 atoms in block 51 Block first atom: 1158 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 1186 Blocpdb> 20 atoms in block 53 Block first atom: 1206 Blocpdb> 19 atoms in block 54 Block first atom: 1226 Blocpdb> 19 atoms in block 55 Block first atom: 1245 Blocpdb> 24 atoms in block 56 Block first atom: 1264 Blocpdb> 24 atoms in block 57 Block first atom: 1288 Blocpdb> 26 atoms in block 58 Block first atom: 1312 Blocpdb> 30 atoms in block 59 Block first atom: 1338 Blocpdb> 33 atoms in block 60 Block first atom: 1368 Blocpdb> 24 atoms in block 61 Block first atom: 1401 Blocpdb> 20 atoms in block 62 Block first atom: 1425 Blocpdb> 17 atoms in block 63 Block first atom: 1445 Blocpdb> 19 atoms in block 64 Block first atom: 1462 Blocpdb> 20 atoms in block 65 Block first atom: 1481 Blocpdb> 22 atoms in block 66 Block first atom: 1501 Blocpdb> 26 atoms in block 67 Block first atom: 1523 Blocpdb> 22 atoms in block 68 Block first atom: 1549 Blocpdb> 22 atoms in block 69 Block first atom: 1571 Blocpdb> 21 atoms in block 70 Block first atom: 1593 Blocpdb> 20 atoms in block 71 Block first atom: 1614 Blocpdb> 25 atoms in block 72 Block first atom: 1634 Blocpdb> 24 atoms in block 73 Block first atom: 1659 Blocpdb> 24 atoms in block 74 Block first atom: 1683 Blocpdb> 25 atoms in block 75 Block first atom: 1707 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1732 Blocpdb> 24 atoms in block 77 Block first atom: 1755 Blocpdb> 25 atoms in block 78 Block first atom: 1779 Blocpdb> 25 atoms in block 79 Block first atom: 1804 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1829 Blocpdb> 30 atoms in block 81 Block first atom: 1853 Blocpdb> 20 atoms in block 82 Block first atom: 1883 Blocpdb> 24 atoms in block 83 Block first atom: 1903 Blocpdb> 23 atoms in block 84 Block first atom: 1927 Blocpdb> 20 atoms in block 85 Block first atom: 1950 Blocpdb> 25 atoms in block 86 Block first atom: 1970 Blocpdb> 27 atoms in block 87 Block first atom: 1995 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 2022 Blocpdb> 19 atoms in block 89 Block first atom: 2044 Blocpdb> 32 atoms in block 90 Block first atom: 2063 Blocpdb> 26 atoms in block 91 Block first atom: 2095 Blocpdb> 19 atoms in block 92 Block first atom: 2121 Blocpdb> 23 atoms in block 93 Block first atom: 2140 Blocpdb> 25 atoms in block 94 Block first atom: 2163 Blocpdb> 23 atoms in block 95 Block first atom: 2188 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 2211 Blocpdb> 18 atoms in block 97 Block first atom: 2232 Blocpdb> 24 atoms in block 98 Block first atom: 2250 Blocpdb> 22 atoms in block 99 Block first atom: 2274 Blocpdb> 23 atoms in block 100 Block first atom: 2296 Blocpdb> 21 atoms in block 101 Block first atom: 2319 Blocpdb> 22 atoms in block 102 Block first atom: 2340 Blocpdb> 30 atoms in block 103 Block first atom: 2362 Blocpdb> 18 atoms in block 104 Block first atom: 2392 Blocpdb> 24 atoms in block 105 Block first atom: 2410 Blocpdb> 30 atoms in block 106 Block first atom: 2434 Blocpdb> 26 atoms in block 107 Block first atom: 2464 Blocpdb> 23 atoms in block 108 Block first atom: 2490 Blocpdb> 28 atoms in block 109 Block first atom: 2513 Blocpdb> 28 atoms in block 110 Block first atom: 2541 Blocpdb> 27 atoms in block 111 Block first atom: 2569 Blocpdb> 24 atoms in block 112 Block first atom: 2596 Blocpdb> 20 atoms in block 113 Block first atom: 2620 Blocpdb> 21 atoms in block 114 Block first atom: 2640 Blocpdb> 23 atoms in block 115 Block first atom: 2661 Blocpdb> 21 atoms in block 116 Block first atom: 2684 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 2705 Blocpdb> 21 atoms in block 118 Block first atom: 2723 Blocpdb> 23 atoms in block 119 Block first atom: 2744 Blocpdb> 24 atoms in block 120 Block first atom: 2767 Blocpdb> 21 atoms in block 121 Block first atom: 2791 Blocpdb> 19 atoms in block 122 Block first atom: 2812 Blocpdb> 23 atoms in block 123 Block first atom: 2831 Blocpdb> 26 atoms in block 124 Block first atom: 2854 Blocpdb> 23 atoms in block 125 Block first atom: 2880 Blocpdb> 26 atoms in block 126 Block first atom: 2903 Blocpdb> 22 atoms in block 127 Block first atom: 2929 Blocpdb> 28 atoms in block 128 Block first atom: 2951 Blocpdb> 20 atoms in block 129 Block first atom: 2979 Blocpdb> 26 atoms in block 130 Block first atom: 2999 Blocpdb> 22 atoms in block 131 Block first atom: 3025 Blocpdb> 20 atoms in block 132 Block first atom: 3047 Blocpdb> 27 atoms in block 133 Block first atom: 3067 Blocpdb> 22 atoms in block 134 Block first atom: 3094 Blocpdb> 23 atoms in block 135 Block first atom: 3116 Blocpdb> 22 atoms in block 136 Block first atom: 3139 Blocpdb> 22 atoms in block 137 Block first atom: 3161 Blocpdb> 28 atoms in block 138 Block first atom: 3183 Blocpdb> 18 atoms in block 139 Block first atom: 3211 Blocpdb> 20 atoms in block 140 Block first atom: 3229 Blocpdb> 20 atoms in block 141 Block first atom: 3249 Blocpdb> 30 atoms in block 142 Block first atom: 3269 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3299 Blocpdb> 27 atoms in block 144 Block first atom: 3319 Blocpdb> 22 atoms in block 145 Block first atom: 3346 Blocpdb> 28 atoms in block 146 Block first atom: 3368 Blocpdb> 20 atoms in block 147 Block first atom: 3396 Blocpdb> 20 atoms in block 148 Block first atom: 3416 Blocpdb> 19 atoms in block 149 Block first atom: 3436 Blocpdb> 19 atoms in block 150 Block first atom: 3455 Blocpdb> 24 atoms in block 151 Block first atom: 3474 Blocpdb> 24 atoms in block 152 Block first atom: 3498 Blocpdb> 26 atoms in block 153 Block first atom: 3522 Blocpdb> 30 atoms in block 154 Block first atom: 3548 Blocpdb> 33 atoms in block 155 Block first atom: 3578 Blocpdb> 24 atoms in block 156 Block first atom: 3611 Blocpdb> 20 atoms in block 157 Block first atom: 3635 Blocpdb> 17 atoms in block 158 Block first atom: 3655 Blocpdb> 19 atoms in block 159 Block first atom: 3672 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3691 Blocpdb> 22 atoms in block 161 Block first atom: 3711 Blocpdb> 26 atoms in block 162 Block first atom: 3733 Blocpdb> 22 atoms in block 163 Block first atom: 3759 Blocpdb> 22 atoms in block 164 Block first atom: 3781 Blocpdb> 21 atoms in block 165 Block first atom: 3803 Blocpdb> 20 atoms in block 166 Block first atom: 3824 Blocpdb> 25 atoms in block 167 Block first atom: 3844 Blocpdb> 24 atoms in block 168 Block first atom: 3869 Blocpdb> 24 atoms in block 169 Block first atom: 3893 Blocpdb> 25 atoms in block 170 Block first atom: 3917 Blocpdb> 23 atoms in block 171 Block first atom: 3942 Blocpdb> 24 atoms in block 172 Block first atom: 3965 Blocpdb> 25 atoms in block 173 Block first atom: 3989 Blocpdb> 25 atoms in block 174 Block first atom: 4014 Blocpdb> 24 atoms in block 175 Block first atom: 4039 Blocpdb> 30 atoms in block 176 Block first atom: 4063 Blocpdb> 20 atoms in block 177 Block first atom: 4093 Blocpdb> 24 atoms in block 178 Block first atom: 4113 Blocpdb> 23 atoms in block 179 Block first atom: 4137 Blocpdb> 20 atoms in block 180 Block first atom: 4160 Blocpdb> 25 atoms in block 181 Block first atom: 4180 Blocpdb> 27 atoms in block 182 Block first atom: 4205 Blocpdb> 22 atoms in block 183 Block first atom: 4232 Blocpdb> 19 atoms in block 184 Block first atom: 4254 Blocpdb> 32 atoms in block 185 Block first atom: 4273 Blocpdb> 26 atoms in block 186 Block first atom: 4305 Blocpdb> 19 atoms in block 187 Block first atom: 4331 Blocpdb> 23 atoms in block 188 Block first atom: 4350 Blocpdb> 25 atoms in block 189 Block first atom: 4373 Blocpdb> 22 atoms in block 190 Block first atom: 4397 Blocpdb> 190 blocks. Blocpdb> At most, 33 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 17 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1639064 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13257 Prepmat> Matrix trace = 3583740.0000 Prepmat> Last element read: 13257 13257 207.0201 Prepmat> 18146 lines saved. Prepmat> 16217 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4419 RTB> Total mass = 4419.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4419 RTB> Number of blocks = 190 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 240882.4641 RTB> 66558 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1140 Diagstd> Nb of non-zero elements: 66558 Diagstd> Projected matrix trace = 240882.4641 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1140 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 240882.4641 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.9178305 2.2073328 3.5235727 4.4968684 5.1036853 5.1789630 6.2200773 7.1809490 7.3304342 7.5451938 7.7473594 8.8837416 9.8711926 10.2127533 10.6825154 11.0599866 11.6989452 12.2715820 12.7501960 13.1217256 13.2000026 13.9134595 14.1456585 15.6588266 16.2212720 16.3917942 16.7564671 17.0845584 17.4781825 18.2900832 19.5574905 19.9144104 20.2167848 20.8636673 21.2181176 21.8676674 22.4540198 22.8512103 24.1341394 24.5172506 24.7255377 26.0299394 26.2502582 26.4494202 26.8494812 26.9632659 27.6081739 27.8788371 28.0051702 28.8214737 29.3213798 30.0474059 30.4093708 30.7848249 30.8357775 31.9986619 32.3877387 33.5775302 34.2189424 34.5179983 35.2219747 35.6033224 36.2035894 36.6463961 37.2856711 37.5738286 38.1152388 39.3939864 39.5769370 40.7182432 41.3175492 41.3721116 41.6680861 42.6186597 42.7298215 43.2948768 44.1681870 44.5935616 45.2850446 46.1473367 46.3535665 47.0431918 47.6182818 48.2753447 48.6195261 48.8482565 49.0188398 49.6145272 50.0013084 51.0404982 52.0412181 52.1281178 52.4072297 52.9906874 53.1521450 53.4872896 54.0104714 54.4239338 54.7370573 55.2328286 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034339 0.0034341 0.0034348 0.0034350 0.0034352 0.0034357 150.3835702 161.3352224 203.8388198 230.2768979 245.3224103 247.1250011 270.8277556 290.9954518 294.0086651 298.2843578 302.2540515 323.6631366 341.1772720 347.0297450 354.9212844 361.1374945 371.4228640 380.4044216 387.7517000 393.3605085 394.5320501 405.0539245 408.4198715 429.7094331 437.3586640 439.6514673 444.5150910 448.8457936 453.9869984 464.4116658 480.2328273 484.5950868 488.2601992 496.0101972 500.2057811 507.8044594 514.5674746 519.0986310 533.4714577 537.6890148 539.9681615 554.0281841 556.3679060 558.4745136 562.6822687 563.8732960 570.5768161 573.3668859 574.6645256 582.9796189 588.0137502 595.2491336 598.8237232 602.5091187 603.0075252 614.2726643 617.9958998 629.2448274 635.2264477 637.9961849 644.4691469 647.9485816 653.3879123 657.3715677 663.0805091 665.6378437 670.4163586 681.5696538 683.1504674 692.9306894 698.0114663 698.4721981 700.9661667 708.9166460 709.8405736 714.5185932 721.6889681 725.1558588 730.7564886 737.6810054 739.3274952 744.8068641 749.3455636 754.4977898 757.1826269 758.9616191 760.2856513 764.8912779 767.8669310 775.8052832 783.3737358 784.0275116 786.1236857 790.4875909 791.6909458 794.1829803 798.0576484 801.1064810 803.4077249 807.0378854 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4419 Rtb_to_modes> Number of blocs = 190 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.918 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.207 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.497 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.104 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.179 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.220 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.181 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.330 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.545 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.747 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.884 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.871 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.23 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1140 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00004 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 79542 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 0.99997 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00004 1.00003 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 0.99998 1.00000 0.99998 1.00001 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5: 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210803214731129569.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210803214731129569.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210803214731129569.atom Openam> file on opening on unit 11: 210803214731129569.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 568 First residue number = 1 Last residue number = 146 Number of atoms found = 4419 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.918 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.207 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.497 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.104 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.179 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.220 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.181 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.330 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.545 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.747 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.884 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.871 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.23 Bfactors> 106 vectors, 13257 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.918000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.648 for 568 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.020 +/- 0.01 Bfactors> = 28.531 +/- 9.92 Bfactors> Shiftng-fct= 28.511 Bfactors> Scaling-fct= 746.685 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210803214731129569.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210803214731129569.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 230.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 245.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 294.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 302.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 448.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 480.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 4419 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7373 0.0034 0.9339 0.0034 0.9095 0.0034 0.9278 0.0034 0.7414 0.0034 0.8037 150.3838 0.6456 161.3161 0.6558 203.8424 0.7347 230.2704 0.6637 245.3194 0.7382 247.1153 0.6302 270.8144 0.6129 290.9840 0.5201 293.9873 0.6481 298.2677 0.6841 302.2341 0.4239 323.6539 0.3551 341.1593 0.3815 346.9681 0.4089 354.8643 0.5457 361.1222 0.5923 371.4237 0.6910 380.3636 0.4414 387.7321 0.4805 393.3178 0.4683 394.5151 0.5210 404.9862 0.3942 408.4650 0.4633 429.7071 0.7530 437.3227 0.3498 439.6085 0.4487 444.5429 0.3327 448.7666 0.3988 453.9911 0.5974 464.3907 0.4939 480.2430 0.5066 484.5206 0.6757 488.2781 0.5044 495.9453 0.5874 500.2065 0.5180 507.8097 0.5189 514.4993 0.6148 519.0626 0.4938 533.4028 0.6215 537.6961 0.5402 539.9937 0.5053 554.0050 0.4309 556.3413 0.3938 558.4567 0.5540 562.6635 0.5151 563.8149 0.5168 570.5712 0.5298 573.3542 0.6157 574.6894 0.6146 582.9397 0.5127 587.9747 0.5064 595.2493 0.6594 598.8042 0.5408 602.4360 0.5799 603.0229 0.5330 614.2591 0.5064 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210803214731129569.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210803214731129569.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 210803214731129569 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 210803214731129569 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210803214731129569.eigenfacs 210803214731129569.atom 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