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***  2HAD  ***

LOGs for ID: 21072611411360907

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 21072611411360907.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 21072611411360907.atom to be opened. Openam> File opened: 21072611411360907.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 681 First residue number = 10 Last residue number = 236 Number of atoms found = 10130 Mean number per residue = 14.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 55.887440 +/- 18.000226 From: 13.385000 To: 94.705000 = 8.631648 +/- 17.998247 From: -34.941000 To: 46.410000 = 20.117243 +/- 9.999961 From: -4.644000 To: 43.792000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.6316 % Filled. Pdbmat> 7534653 non-zero elements. Pdbmat> 830567 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 163.98 +/- 46.54 Maximum number = 248 Minimum number = 27 Pdbmat> Matrix trace = 1.661134E+07 Pdbmat> Larger element = 881.443 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 681 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 21072611411360907.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 21072611411360907.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 21072611411360907.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10130 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 681 residues. Blocpdb> 50 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 61 atoms in block 2 Block first atom: 51 Blocpdb> 60 atoms in block 3 Block first atom: 112 Blocpdb> 72 atoms in block 4 Block first atom: 172 Blocpdb> 55 atoms in block 5 Block first atom: 244 Blocpdb> 52 atoms in block 6 Block first atom: 299 Blocpdb> 58 atoms in block 7 Block first atom: 351 Blocpdb> 63 atoms in block 8 Block first atom: 409 Blocpdb> 66 atoms in block 9 Block first atom: 472 Blocpdb> 94 atoms in block 10 Block first atom: 538 Blocpdb> 72 atoms in block 11 Block first atom: 632 Blocpdb> 71 atoms in block 12 Block first atom: 704 Blocpdb> 55 atoms in block 13 Block first atom: 775 Blocpdb> 38 atoms in block 14 Block first atom: 830 Blocpdb> 83 atoms in block 15 Block first atom: 868 Blocpdb> 75 atoms in block 16 Block first atom: 951 Blocpdb> 55 atoms in block 17 Block first atom: 1026 Blocpdb> 73 atoms in block 18 Block first atom: 1081 Blocpdb> 77 atoms in block 19 Block first atom: 1154 Blocpdb> 55 atoms in block 20 Block first atom: 1231 Blocpdb> 45 atoms in block 21 Block first atom: 1286 Blocpdb> 48 atoms in block 22 Block first atom: 1331 Blocpdb> 65 atoms in block 23 Block first atom: 1379 Blocpdb> 51 atoms in block 24 Block first atom: 1444 Blocpdb> 61 atoms in block 25 Block first atom: 1495 Blocpdb> 54 atoms in block 26 Block first atom: 1556 Blocpdb> 84 atoms in block 27 Block first atom: 1610 Blocpdb> 48 atoms in block 28 Block first atom: 1694 Blocpdb> 58 atoms in block 29 Block first atom: 1742 Blocpdb> 64 atoms in block 30 Block first atom: 1800 Blocpdb> 46 atoms in block 31 Block first atom: 1864 Blocpdb> 67 atoms in block 32 Block first atom: 1910 Blocpdb> 60 atoms in block 33 Block first atom: 1977 Blocpdb> 50 atoms in block 34 Block first atom: 2037 Blocpdb> 54 atoms in block 35 Block first atom: 2087 Blocpdb> 72 atoms in block 36 Block first atom: 2141 Blocpdb> 52 atoms in block 37 Block first atom: 2213 Blocpdb> 58 atoms in block 38 Block first atom: 2265 Blocpdb> 68 atoms in block 39 Block first atom: 2323 Blocpdb> 55 atoms in block 40 Block first atom: 2391 Blocpdb> 50 atoms in block 41 Block first atom: 2446 Blocpdb> 47 atoms in block 42 Block first atom: 2496 Blocpdb> 63 atoms in block 43 Block first atom: 2543 Blocpdb> 62 atoms in block 44 Block first atom: 2606 Blocpdb> 52 atoms in block 45 Block first atom: 2668 Blocpdb> 62 atoms in block 46 Block first atom: 2720 Blocpdb> 43 atoms in block 47 Block first atom: 2782 Blocpdb> 72 atoms in block 48 Block first atom: 2825 Blocpdb> 72 atoms in block 49 Block first atom: 2897 Blocpdb> 71 atoms in block 50 Block first atom: 2969 Blocpdb> 41 atoms in block 51 Block first atom: 3040 Blocpdb> 56 atoms in block 52 Block first atom: 3081 Blocpdb> 50 atoms in block 53 Block first atom: 3137 Blocpdb> 42 atoms in block 54 Block first atom: 3187 Blocpdb> 46 atoms in block 55 Block first atom: 3229 Blocpdb> 68 atoms in block 56 Block first atom: 3275 Blocpdb> 39 atoms in block 57 Block first atom: 3343 Blocpdb> 55 atoms in block 58 Block first atom: 3382 Blocpdb> 61 atoms in block 59 Block first atom: 3437 Blocpdb> 60 atoms in block 60 Block first atom: 3498 Blocpdb> 72 atoms in block 61 Block first atom: 3558 Blocpdb> 55 atoms in block 62 Block first atom: 3630 Blocpdb> 52 atoms in block 63 Block first atom: 3685 Blocpdb> 58 atoms in block 64 Block first atom: 3737 Blocpdb> 46 atoms in block 65 Block first atom: 3795 Blocpdb> 66 atoms in block 66 Block first atom: 3841 Blocpdb> 77 atoms in block 67 Block first atom: 3907 Blocpdb> 72 atoms in block 68 Block first atom: 3984 Blocpdb> 71 atoms in block 69 Block first atom: 4056 Blocpdb> 55 atoms in block 70 Block first atom: 4127 Blocpdb> 38 atoms in block 71 Block first atom: 4182 Blocpdb> 83 atoms in block 72 Block first atom: 4220 Blocpdb> 75 atoms in block 73 Block first atom: 4303 Blocpdb> 55 atoms in block 74 Block first atom: 4378 Blocpdb> 73 atoms in block 75 Block first atom: 4433 Blocpdb> 77 atoms in block 76 Block first atom: 4506 Blocpdb> 55 atoms in block 77 Block first atom: 4583 Blocpdb> 45 atoms in block 78 Block first atom: 4638 Blocpdb> 48 atoms in block 79 Block first atom: 4683 Blocpdb> 65 atoms in block 80 Block first atom: 4731 Blocpdb> 51 atoms in block 81 Block first atom: 4796 Blocpdb> 61 atoms in block 82 Block first atom: 4847 Blocpdb> 54 atoms in block 83 Block first atom: 4908 Blocpdb> 84 atoms in block 84 Block first atom: 4962 Blocpdb> 48 atoms in block 85 Block first atom: 5046 Blocpdb> 66 atoms in block 86 Block first atom: 5094 Blocpdb> 64 atoms in block 87 Block first atom: 5160 Blocpdb> 46 atoms in block 88 Block first atom: 5224 Blocpdb> 67 atoms in block 89 Block first atom: 5270 Blocpdb> 60 atoms in block 90 Block first atom: 5337 Blocpdb> 50 atoms in block 91 Block first atom: 5397 Blocpdb> 54 atoms in block 92 Block first atom: 5447 Blocpdb> 72 atoms in block 93 Block first atom: 5501 Blocpdb> 52 atoms in block 94 Block first atom: 5573 Blocpdb> 58 atoms in block 95 Block first atom: 5625 Blocpdb> 68 atoms in block 96 Block first atom: 5683 Blocpdb> 55 atoms in block 97 Block first atom: 5751 Blocpdb> 50 atoms in block 98 Block first atom: 5806 Blocpdb> 47 atoms in block 99 Block first atom: 5856 Blocpdb> 63 atoms in block 100 Block first atom: 5903 Blocpdb> 62 atoms in block 101 Block first atom: 5966 Blocpdb> 52 atoms in block 102 Block first atom: 6028 Blocpdb> 62 atoms in block 103 Block first atom: 6080 Blocpdb> 43 atoms in block 104 Block first atom: 6142 Blocpdb> 72 atoms in block 105 Block first atom: 6185 Blocpdb> 72 atoms in block 106 Block first atom: 6257 Blocpdb> 71 atoms in block 107 Block first atom: 6329 Blocpdb> 41 atoms in block 108 Block first atom: 6400 Blocpdb> 56 atoms in block 109 Block first atom: 6441 Blocpdb> 50 atoms in block 110 Block first atom: 6497 Blocpdb> 42 atoms in block 111 Block first atom: 6547 Blocpdb> 46 atoms in block 112 Block first atom: 6589 Blocpdb> 68 atoms in block 113 Block first atom: 6635 Blocpdb> 39 atoms in block 114 Block first atom: 6703 Blocpdb> 55 atoms in block 115 Block first atom: 6742 Blocpdb> 61 atoms in block 116 Block first atom: 6797 Blocpdb> 60 atoms in block 117 Block first atom: 6858 Blocpdb> 72 atoms in block 118 Block first atom: 6918 Blocpdb> 55 atoms in block 119 Block first atom: 6990 Blocpdb> 52 atoms in block 120 Block first atom: 7045 Blocpdb> 58 atoms in block 121 Block first atom: 7097 Blocpdb> 63 atoms in block 122 Block first atom: 7155 Blocpdb> 66 atoms in block 123 Block first atom: 7218 Blocpdb> 94 atoms in block 124 Block first atom: 7284 Blocpdb> 72 atoms in block 125 Block first atom: 7378 Blocpdb> 71 atoms in block 126 Block first atom: 7450 Blocpdb> 55 atoms in block 127 Block first atom: 7521 Blocpdb> 38 atoms in block 128 Block first atom: 7576 Blocpdb> 66 atoms in block 129 Block first atom: 7614 Blocpdb> 75 atoms in block 130 Block first atom: 7680 Blocpdb> 55 atoms in block 131 Block first atom: 7755 Blocpdb> 73 atoms in block 132 Block first atom: 7810 Blocpdb> 77 atoms in block 133 Block first atom: 7883 Blocpdb> 55 atoms in block 134 Block first atom: 7960 Blocpdb> 45 atoms in block 135 Block first atom: 8015 Blocpdb> 48 atoms in block 136 Block first atom: 8060 Blocpdb> 65 atoms in block 137 Block first atom: 8108 Blocpdb> 51 atoms in block 138 Block first atom: 8173 Blocpdb> 61 atoms in block 139 Block first atom: 8224 Blocpdb> 54 atoms in block 140 Block first atom: 8285 Blocpdb> 84 atoms in block 141 Block first atom: 8339 Blocpdb> 60 atoms in block 142 Block first atom: 8423 Blocpdb> 66 atoms in block 143 Block first atom: 8483 Blocpdb> 64 atoms in block 144 Block first atom: 8549 Blocpdb> 46 atoms in block 145 Block first atom: 8613 Blocpdb> 67 atoms in block 146 Block first atom: 8659 Blocpdb> 60 atoms in block 147 Block first atom: 8726 Blocpdb> 50 atoms in block 148 Block first atom: 8786 Blocpdb> 54 atoms in block 149 Block first atom: 8836 Blocpdb> 72 atoms in block 150 Block first atom: 8890 Blocpdb> 52 atoms in block 151 Block first atom: 8962 Blocpdb> 58 atoms in block 152 Block first atom: 9014 Blocpdb> 68 atoms in block 153 Block first atom: 9072 Blocpdb> 55 atoms in block 154 Block first atom: 9140 Blocpdb> 50 atoms in block 155 Block first atom: 9195 Blocpdb> 47 atoms in block 156 Block first atom: 9245 Blocpdb> 63 atoms in block 157 Block first atom: 9292 Blocpdb> 62 atoms in block 158 Block first atom: 9355 Blocpdb> 52 atoms in block 159 Block first atom: 9417 Blocpdb> 62 atoms in block 160 Block first atom: 9469 Blocpdb> 43 atoms in block 161 Block first atom: 9531 Blocpdb> 72 atoms in block 162 Block first atom: 9574 Blocpdb> 72 atoms in block 163 Block first atom: 9646 Blocpdb> 71 atoms in block 164 Block first atom: 9718 Blocpdb> 41 atoms in block 165 Block first atom: 9789 Blocpdb> 56 atoms in block 166 Block first atom: 9830 Blocpdb> 50 atoms in block 167 Block first atom: 9886 Blocpdb> 42 atoms in block 168 Block first atom: 9936 Blocpdb> 46 atoms in block 169 Block first atom: 9978 Blocpdb> 68 atoms in block 170 Block first atom: 10024 Blocpdb> 39 atoms in block 171 Block first atom: 10091 Blocpdb> 171 blocks. Blocpdb> At most, 94 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 38 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 7534824 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 30390 Prepmat> Matrix trace = 16611340.0000 Prepmat> Last element read: 30390 30390 346.7608 Prepmat> 14707 lines saved. Prepmat> 12933 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10130 RTB> Total mass = 10130.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10130 RTB> Number of blocks = 171 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 421326.9997 RTB> 61263 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1026 Diagstd> Nb of non-zero elements: 61263 Diagstd> Projected matrix trace = 421326.9997 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1026 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 421326.9997 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.8868699 1.9707143 3.0439344 5.0690498 5.1963168 6.3595166 6.7128930 7.1283461 9.5649191 12.2627767 12.9888334 13.2525354 13.3605809 13.9753781 20.1778817 21.0968659 21.3674354 24.5473784 25.7620441 26.1752719 27.8973273 29.7653108 30.7958008 31.7318194 34.8335212 35.5638072 36.6346027 37.8101929 39.3990147 39.9506659 42.0318922 42.5198674 43.2458286 46.8034281 48.0548798 49.3498574 50.4389134 50.7605051 51.8122094 52.3765037 53.0706276 56.9217612 58.0509723 58.9901530 62.6487435 63.7879866 64.6103037 65.0985503 66.5151126 67.0370301 68.9948331 69.5702059 70.2972985 70.8938075 73.0912719 73.3356763 73.5571220 74.2199107 74.6225019 75.2067319 76.8824201 77.2716188 78.1094208 79.6758393 80.7522054 82.4210875 83.1372559 84.3097783 84.5552842 85.1770191 87.5488049 88.1165810 88.6592602 89.0611252 91.5344990 92.0984308 92.7722599 93.2346182 94.9336273 96.6817156 97.8834665 99.4905049 100.6884907 101.7188883 103.2453799 103.9449051 105.8272732 106.0598990 107.2982796 107.8533502 109.7364475 110.5706884 110.7703267 113.0335118 113.8948065 114.9379615 115.4368020 116.9908358 117.3907229 118.2278080 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034288 0.0034293 0.0034311 0.0034344 0.0034355 0.0034359 149.1647692 152.4428700 189.4579905 244.4885693 247.5386918 273.8465869 281.3520886 289.9276720 335.8427148 380.2679210 391.3635306 395.3163408 396.9245401 405.9542225 487.7901940 498.7745104 501.9627391 538.0192804 551.1698341 555.5726792 573.5569933 592.4483462 602.6165175 611.7060376 640.9054571 647.5889113 657.2657823 667.7282134 681.6131505 686.3684171 704.0196012 708.0945159 714.1137436 742.9064214 752.7729899 762.8483851 771.2197476 773.6744371 781.6482078 785.8932024 791.0836196 819.2839457 827.3704947 834.0364702 859.5110472 867.2907757 872.8631752 876.1549905 885.6363746 889.1042026 901.9938248 905.7470426 910.4678150 914.3225500 928.3848394 929.9357227 931.3386894 935.5252073 938.0590615 941.7240003 952.1575230 954.5645143 959.7254003 969.3008728 975.8262045 985.8581944 990.1320601 997.0897551 998.5404378 1002.2048469 1016.0624259 1019.3518119 1022.4859092 1024.8005957 1038.9333436 1042.1287937 1045.9341624 1048.5372860 1058.0478716 1067.7447736 1074.3602979 1083.1437491 1089.6454151 1095.2066772 1103.3939378 1107.1255765 1117.1052252 1118.3323421 1124.8423515 1127.7480903 1137.5506125 1141.8663820 1142.8967523 1154.5131680 1158.9034100 1164.1984735 1166.7220983 1174.5491696 1176.5548238 1180.7422377 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10130 Rtb_to_modes> Number of blocs = 171 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9702E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9728E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9836E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.887 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.971 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.044 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.069 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.196 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.360 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.713 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.128 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.565 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.7 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.6 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.4 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.2 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1026 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00004 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00005 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99997 0.99997 0.99999 1.00003 1.00002 1.00001 1.00003 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 0.99997 1.00004 1.00000 1.00005 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 182340 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00004 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00005 0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 0.99997 0.99997 0.99999 1.00003 1.00002 1.00001 1.00003 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 0.99997 1.00004 1.00000 1.00005 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 1.00002 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21072611411360907.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21072611411360907.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 21072611411360907.atom Openam> file on opening on unit 11: 21072611411360907.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 681 First residue number = 10 Last residue number = 236 Number of atoms found = 10130 Mean number per residue = 14.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9702E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9728E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9836E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.887 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.971 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.044 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.069 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.196 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.360 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.713 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.128 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.565 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.2 Bfactors> 106 vectors, 30390 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.887000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.339 for 681 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.006 +/- 0.00 Bfactors> = 57.912 +/- 13.43 Bfactors> Shiftng-fct= 57.906 Bfactors> Scaling-fct= 2808.121 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 21072611411360907.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 21072611411360907.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4287E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4291E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4310E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 189.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 247.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 281.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 502.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 742.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 752.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 773.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 834.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 867.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 901.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 905.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 910.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 928.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 929.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 931.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 954.5 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perturbed structure for DQ=-80 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom making animated gifs 11 models are in 21072611411360907.7.pdb, 1 models will 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21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom making animated gifs 11 models are in 21072611411360907.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21072611411360907.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21072611411360907.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 21072611411360907 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom making animated gifs 11 models are in 21072611411360907.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21072611411360907.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21072611411360907.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 21072611411360907 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom 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will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 21072611411360907 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=0 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=20 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=40 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=60 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=80 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom calculating perturbed structure for DQ=100 21072611411360907.eigenfacs 21072611411360907.atom making animated gifs 11 models are in 21072611411360907.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21072611411360907.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 21072611411360907.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 21072611411360907.10.pdb 21072611411360907.11.pdb 21072611411360907.7.pdb 21072611411360907.8.pdb 21072611411360907.9.pdb STDERR: real 0m41.047s user 0m40.840s sys 0m0.188s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: 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