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LOGs for ID: 210722052159119798

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210722052159119798.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210722052159119798.atom to be opened. Openam> File opened: 210722052159119798.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1308 First residue number = 1263 Last residue number = 1589 Number of atoms found = 10312 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 243.047999 +/- 22.744628 From: 186.703000 To: 299.407000 = 243.002273 +/- 22.647006 From: 186.779000 To: 299.124000 = 342.478776 +/- 15.735320 From: 311.187000 To: 378.057000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.7769 % Filled. Pdbmat> 3717701 non-zero elements. Pdbmat> 406271 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.80 +/- 21.21 Maximum number = 121 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 8.125420E+06 Pdbmat> Larger element = 495.870 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1308 non-zero elements, NRBL set to 7 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210722052159119798.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 7 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210722052159119798.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210722052159119798.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 10312 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 7 residue(s) per block. Blocpdb> 1308 residues. Blocpdb> 60 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 56 atoms in block 2 Block first atom: 61 Blocpdb> 50 atoms in block 3 Block first atom: 117 Blocpdb> 62 atoms in block 4 Block first atom: 167 Blocpdb> 57 atoms in block 5 Block first atom: 229 Blocpdb> 59 atoms in block 6 Block first atom: 286 Blocpdb> 56 atoms in block 7 Block first atom: 345 Blocpdb> 62 atoms in block 8 Block first atom: 401 Blocpdb> 47 atoms in block 9 Block first atom: 463 Blocpdb> 61 atoms in block 10 Block first atom: 510 Blocpdb> 66 atoms in block 11 Block first atom: 571 Blocpdb> 58 atoms in block 12 Block first atom: 637 Blocpdb> 53 atoms in block 13 Block first atom: 695 Blocpdb> 50 atoms in block 14 Block first atom: 748 Blocpdb> 45 atoms in block 15 Block first atom: 798 Blocpdb> 55 atoms in block 16 Block first atom: 843 Blocpdb> 39 atoms in block 17 Block first atom: 898 Blocpdb> 52 atoms in block 18 Block first atom: 937 Blocpdb> 53 atoms in block 19 Block first atom: 989 Blocpdb> 59 atoms in block 20 Block first atom: 1042 Blocpdb> 55 atoms in block 21 Block first atom: 1101 Blocpdb> 51 atoms in block 22 Block first atom: 1156 Blocpdb> 62 atoms in block 23 Block first atom: 1207 Blocpdb> 59 atoms in block 24 Block first atom: 1269 Blocpdb> 52 atoms in block 25 Block first atom: 1328 Blocpdb> 60 atoms in block 26 Block first atom: 1380 Blocpdb> 51 atoms in block 27 Block first atom: 1440 Blocpdb> 58 atoms in block 28 Block first atom: 1491 Blocpdb> 54 atoms in block 29 Block first atom: 1549 Blocpdb> 46 atoms in block 30 Block first atom: 1603 Blocpdb> 44 atoms in block 31 Block first atom: 1649 Blocpdb> 56 atoms in block 32 Block first atom: 1693 Blocpdb> 57 atoms in block 33 Block first atom: 1749 Blocpdb> 54 atoms in block 34 Block first atom: 1806 Blocpdb> 58 atoms in block 35 Block first atom: 1860 Blocpdb> 55 atoms in block 36 Block first atom: 1918 Blocpdb> 56 atoms in block 37 Block first atom: 1973 Blocpdb> 54 atoms in block 38 Block first atom: 2029 Blocpdb> 70 atoms in block 39 Block first atom: 2083 Blocpdb> 58 atoms in block 40 Block first atom: 2153 Blocpdb> 50 atoms in block 41 Block first atom: 2211 Blocpdb> 54 atoms in block 42 Block first atom: 2261 Blocpdb> 61 atoms in block 43 Block first atom: 2315 Blocpdb> 53 atoms in block 44 Block first atom: 2376 Blocpdb> 61 atoms in block 45 Block first atom: 2429 Blocpdb> 62 atoms in block 46 Block first atom: 2490 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 2552 Blocpdb> 60 atoms in block 48 Block first atom: 2579 Blocpdb> 56 atoms in block 49 Block first atom: 2639 Blocpdb> 50 atoms in block 50 Block first atom: 2695 Blocpdb> 62 atoms in block 51 Block first atom: 2745 Blocpdb> 57 atoms in block 52 Block first atom: 2807 Blocpdb> 59 atoms in block 53 Block first atom: 2864 Blocpdb> 56 atoms in block 54 Block first atom: 2923 Blocpdb> 62 atoms in block 55 Block first atom: 2979 Blocpdb> 47 atoms in block 56 Block first atom: 3041 Blocpdb> 61 atoms in block 57 Block first atom: 3088 Blocpdb> 66 atoms in block 58 Block first atom: 3149 Blocpdb> 58 atoms in block 59 Block first atom: 3215 Blocpdb> 53 atoms in block 60 Block first atom: 3273 Blocpdb> 50 atoms in block 61 Block first atom: 3326 Blocpdb> 45 atoms in block 62 Block first atom: 3376 Blocpdb> 55 atoms in block 63 Block first atom: 3421 Blocpdb> 39 atoms in block 64 Block first atom: 3476 Blocpdb> 52 atoms in block 65 Block first atom: 3515 Blocpdb> 53 atoms in block 66 Block first atom: 3567 Blocpdb> 59 atoms in block 67 Block first atom: 3620 Blocpdb> 55 atoms in block 68 Block first atom: 3679 Blocpdb> 51 atoms in block 69 Block first atom: 3734 Blocpdb> 62 atoms in block 70 Block first atom: 3785 Blocpdb> 59 atoms in block 71 Block first atom: 3847 Blocpdb> 52 atoms in block 72 Block first atom: 3906 Blocpdb> 60 atoms in block 73 Block first atom: 3958 Blocpdb> 51 atoms in block 74 Block first atom: 4018 Blocpdb> 58 atoms in block 75 Block first atom: 4069 Blocpdb> 54 atoms in block 76 Block first atom: 4127 Blocpdb> 46 atoms in block 77 Block first atom: 4181 Blocpdb> 44 atoms in block 78 Block first atom: 4227 Blocpdb> 56 atoms in block 79 Block first atom: 4271 Blocpdb> 57 atoms in block 80 Block first atom: 4327 Blocpdb> 54 atoms in block 81 Block first atom: 4384 Blocpdb> 58 atoms in block 82 Block first atom: 4438 Blocpdb> 55 atoms in block 83 Block first atom: 4496 Blocpdb> 56 atoms in block 84 Block first atom: 4551 Blocpdb> 54 atoms in block 85 Block first atom: 4607 Blocpdb> 70 atoms in block 86 Block first atom: 4661 Blocpdb> 58 atoms in block 87 Block first atom: 4731 Blocpdb> 50 atoms in block 88 Block first atom: 4789 Blocpdb> 54 atoms in block 89 Block first atom: 4839 Blocpdb> 61 atoms in block 90 Block first atom: 4893 Blocpdb> 53 atoms in block 91 Block first atom: 4954 Blocpdb> 61 atoms in block 92 Block first atom: 5007 Blocpdb> 62 atoms in block 93 Block first atom: 5068 Blocpdb> 27 atoms in block 94 Block first atom: 5130 Blocpdb> 60 atoms in block 95 Block first atom: 5157 Blocpdb> 56 atoms in block 96 Block first atom: 5217 Blocpdb> 50 atoms in block 97 Block first atom: 5273 Blocpdb> 62 atoms in block 98 Block first atom: 5323 Blocpdb> 57 atoms in block 99 Block first atom: 5385 Blocpdb> 59 atoms in block 100 Block first atom: 5442 Blocpdb> 56 atoms in block 101 Block first atom: 5501 Blocpdb> 62 atoms in block 102 Block first atom: 5557 Blocpdb> 47 atoms in block 103 Block first atom: 5619 Blocpdb> 61 atoms in block 104 Block first atom: 5666 Blocpdb> 66 atoms in block 105 Block first atom: 5727 Blocpdb> 58 atoms in block 106 Block first atom: 5793 Blocpdb> 53 atoms in block 107 Block first atom: 5851 Blocpdb> 50 atoms in block 108 Block first atom: 5904 Blocpdb> 45 atoms in block 109 Block first atom: 5954 Blocpdb> 55 atoms in block 110 Block first atom: 5999 Blocpdb> 39 atoms in block 111 Block first atom: 6054 Blocpdb> 52 atoms in block 112 Block first atom: 6093 Blocpdb> 53 atoms in block 113 Block first atom: 6145 Blocpdb> 59 atoms in block 114 Block first atom: 6198 Blocpdb> 55 atoms in block 115 Block first atom: 6257 Blocpdb> 51 atoms in block 116 Block first atom: 6312 Blocpdb> 62 atoms in block 117 Block first atom: 6363 Blocpdb> 59 atoms in block 118 Block first atom: 6425 Blocpdb> 52 atoms in block 119 Block first atom: 6484 Blocpdb> 60 atoms in block 120 Block first atom: 6536 Blocpdb> 51 atoms in block 121 Block first atom: 6596 Blocpdb> 58 atoms in block 122 Block first atom: 6647 Blocpdb> 54 atoms in block 123 Block first atom: 6705 Blocpdb> 46 atoms in block 124 Block first atom: 6759 Blocpdb> 44 atoms in block 125 Block first atom: 6805 Blocpdb> 56 atoms in block 126 Block first atom: 6849 Blocpdb> 57 atoms in block 127 Block first atom: 6905 Blocpdb> 54 atoms in block 128 Block first atom: 6962 Blocpdb> 58 atoms in block 129 Block first atom: 7016 Blocpdb> 55 atoms in block 130 Block first atom: 7074 Blocpdb> 56 atoms in block 131 Block first atom: 7129 Blocpdb> 54 atoms in block 132 Block first atom: 7185 Blocpdb> 70 atoms in block 133 Block first atom: 7239 Blocpdb> 58 atoms in block 134 Block first atom: 7309 Blocpdb> 50 atoms in block 135 Block first atom: 7367 Blocpdb> 54 atoms in block 136 Block first atom: 7417 Blocpdb> 61 atoms in block 137 Block first atom: 7471 Blocpdb> 53 atoms in block 138 Block first atom: 7532 Blocpdb> 61 atoms in block 139 Block first atom: 7585 Blocpdb> 62 atoms in block 140 Block first atom: 7646 Blocpdb> 27 atoms in block 141 Block first atom: 7708 Blocpdb> 60 atoms in block 142 Block first atom: 7735 Blocpdb> 56 atoms in block 143 Block first atom: 7795 Blocpdb> 50 atoms in block 144 Block first atom: 7851 Blocpdb> 62 atoms in block 145 Block first atom: 7901 Blocpdb> 57 atoms in block 146 Block first atom: 7963 Blocpdb> 59 atoms in block 147 Block first atom: 8020 Blocpdb> 56 atoms in block 148 Block first atom: 8079 Blocpdb> 62 atoms in block 149 Block first atom: 8135 Blocpdb> 47 atoms in block 150 Block first atom: 8197 Blocpdb> 61 atoms in block 151 Block first atom: 8244 Blocpdb> 66 atoms in block 152 Block first atom: 8305 Blocpdb> 58 atoms in block 153 Block first atom: 8371 Blocpdb> 53 atoms in block 154 Block first atom: 8429 Blocpdb> 50 atoms in block 155 Block first atom: 8482 Blocpdb> 45 atoms in block 156 Block first atom: 8532 Blocpdb> 55 atoms in block 157 Block first atom: 8577 Blocpdb> 39 atoms in block 158 Block first atom: 8632 Blocpdb> 52 atoms in block 159 Block first atom: 8671 Blocpdb> 53 atoms in block 160 Block first atom: 8723 Blocpdb> 59 atoms in block 161 Block first atom: 8776 Blocpdb> 55 atoms in block 162 Block first atom: 8835 Blocpdb> 51 atoms in block 163 Block first atom: 8890 Blocpdb> 62 atoms in block 164 Block first atom: 8941 Blocpdb> 59 atoms in block 165 Block first atom: 9003 Blocpdb> 52 atoms in block 166 Block first atom: 9062 Blocpdb> 60 atoms in block 167 Block first atom: 9114 Blocpdb> 51 atoms in block 168 Block first atom: 9174 Blocpdb> 58 atoms in block 169 Block first atom: 9225 Blocpdb> 54 atoms in block 170 Block first atom: 9283 Blocpdb> 46 atoms in block 171 Block first atom: 9337 Blocpdb> 44 atoms in block 172 Block first atom: 9383 Blocpdb> 56 atoms in block 173 Block first atom: 9427 Blocpdb> 57 atoms in block 174 Block first atom: 9483 Blocpdb> 54 atoms in block 175 Block first atom: 9540 Blocpdb> 58 atoms in block 176 Block first atom: 9594 Blocpdb> 55 atoms in block 177 Block first atom: 9652 Blocpdb> 56 atoms in block 178 Block first atom: 9707 Blocpdb> 54 atoms in block 179 Block first atom: 9763 Blocpdb> 70 atoms in block 180 Block first atom: 9817 Blocpdb> 58 atoms in block 181 Block first atom: 9887 Blocpdb> 50 atoms in block 182 Block first atom: 9945 Blocpdb> 54 atoms in block 183 Block first atom: 9995 Blocpdb> 61 atoms in block 184 Block first atom: 10049 Blocpdb> 53 atoms in block 185 Block first atom: 10110 Blocpdb> 61 atoms in block 186 Block first atom: 10163 Blocpdb> 62 atoms in block 187 Block first atom: 10224 Blocpdb> 27 atoms in block 188 Block first atom: 10285 Blocpdb> 188 blocks. Blocpdb> At most, 70 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 27 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3717889 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 30936 Prepmat> Matrix trace = 8125420.0000 Prepmat> Last element read: 30936 30936 109.8880 Prepmat> 17767 lines saved. Prepmat> 16487 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 10312 RTB> Total mass = 10312.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 10312 RTB> Number of blocks = 188 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 170086.3779 RTB> 43224 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1128 Diagstd> Nb of non-zero elements: 43224 Diagstd> Projected matrix trace = 170086.3779 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1128 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 170086.3779 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2957504 0.3519766 0.3546607 0.3593377 0.4421264 0.7146095 0.7205669 0.7556390 1.0627628 1.2140680 1.4260404 1.7321210 1.7360823 2.3199033 2.3420326 2.4517992 2.4566164 2.8427921 3.1161328 3.7104674 3.7247204 3.9695531 3.9776670 4.1259711 4.1325512 4.3286801 4.8831703 4.9999131 5.0034181 5.6768001 6.3486439 6.3754805 6.4071344 7.3088095 7.5268977 7.8001933 7.8127291 8.0772017 8.3246488 8.3392557 8.5002316 8.9275118 9.2927965 9.3263365 9.4104049 9.4550976 10.3415166 10.3518003 10.8514742 11.2966775 11.3119263 11.5668331 11.6590480 11.7366772 12.2591282 12.5590030 12.5717606 13.4546206 13.4569210 14.3434890 14.3916753 14.7063753 14.7670768 14.9631920 15.2791025 15.5037938 15.7203745 15.9625008 15.9929016 16.4623875 16.6215552 16.6567905 16.8894600 18.7526312 18.7589549 18.7838396 18.8750734 19.4070654 19.4753181 20.0685658 20.3297349 20.8688707 20.9313161 20.9578250 21.2399314 21.3196054 21.9608782 21.9886671 22.3032575 22.4914855 22.6303468 22.6716483 23.0360416 23.1112766 24.3473865 24.4915524 24.6512451 25.0186627 25.2371726 25.4299725 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034326 0.0034337 0.0034338 0.0034338 0.0034351 0.0034358 59.0551774 64.4246670 64.6698432 65.0948566 72.2052035 91.7972535 92.1790916 94.3957566 111.9472551 119.6511233 129.6764765 142.9171673 143.0804952 165.3979879 166.1849736 170.0347653 170.2017243 183.0913529 191.6916784 209.1749108 209.5762757 216.3545777 216.5755820 220.5760584 220.7518767 225.9295443 239.9640676 242.8155564 242.9006514 258.7301742 273.6123933 274.1900811 274.8699082 293.5746837 297.9224895 303.2829266 303.5265339 308.6211920 313.3128745 313.5876313 316.5998167 324.4595011 331.0308681 331.6277175 333.1190235 333.9091259 349.2105828 349.3841697 357.7170594 364.9813267 365.2275777 369.3197339 370.7889858 372.0213470 380.2113476 384.8334932 385.0289030 398.3189865 398.3530356 411.2658821 411.9561167 416.4358436 417.2943901 420.0562050 424.4672652 427.5769367 430.5531038 433.8561376 434.2690837 440.5971573 442.7220051 443.1910095 446.2756207 470.2473820 470.3266632 470.6385157 471.7800859 478.3824243 479.2228973 486.4670714 489.6222417 496.0720449 496.8136833 497.1281840 500.4628392 501.4006137 508.8855651 509.2074304 512.8370925 514.9965864 516.5839213 517.0551022 521.1937600 522.0441671 535.8231280 537.4071459 539.1563320 543.1594327 545.5262205 547.6060349 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 10312 Rtb_to_modes> Number of blocs = 188 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9921E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2958 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3520 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3547 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3593 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4421 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7146 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7206 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7556 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.063 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.214 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.426 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.732 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.736 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.320 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.342 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.452 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.457 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.843 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.116 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.710 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.725 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.970 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.978 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.126 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.133 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.329 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.883 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.000 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.003 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.677 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.349 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.375 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.407 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.309 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.527 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.800 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.813 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.077 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.325 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.339 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.500 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.928 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.293 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.326 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.410 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.455 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.43 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1128 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 0.99996 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 185616 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00003 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00002 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00003 0.99996 1.00000 0.99997 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 0.99996 0.99999 1.00002 0.99997 0.99998 0.99997 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 0.99996 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210722052159119798.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210722052159119798.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210722052159119798.atom Openam> file on opening on unit 11: 210722052159119798.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1308 First residue number = 1263 Last residue number = 1589 Number of atoms found = 10312 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9921E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9991E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2958 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3520 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3547 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3593 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4421 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7146 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7206 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7556 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.063 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.214 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.426 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.732 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.736 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.320 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.342 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.452 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.457 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.843 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.116 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.710 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.725 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.970 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.978 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.126 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.133 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.329 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.883 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.000 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.003 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.677 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.349 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.375 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.407 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.309 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.527 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.800 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.813 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.077 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.325 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.339 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.500 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.928 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.293 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.326 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.410 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.455 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.43 Bfactors> 106 vectors, 30936 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.295800 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.818 for 1308 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.048 +/- 0.05 Bfactors> = 91.277 +/- 39.71 Bfactors> Shiftng-fct= 91.229 Bfactors> Scaling-fct= 843.524 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210722052159119798.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210722052159119798.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 59.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 64.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 65.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 72.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 91.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 94.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 112.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 119.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 142.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 170.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 183.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 225.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 308.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 316.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 372.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 380.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 398.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.5 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Chkmod> That is: 10312 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210722052159119798.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210722052159119798.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 210722052159119798 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 210722052159119798 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=40 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=60 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=80 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=100 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom making animated gifs 11 models are in 210722052159119798.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210722052159119798.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210722052159119798.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 210722052159119798 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=0 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=20 210722052159119798.eigenfacs 210722052159119798.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 210722052159119798.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 210722052159119798.10.pdb 210722052159119798.11.pdb 210722052159119798.7.pdb 210722052159119798.8.pdb 210722052159119798.9.pdb STDERR: real 0m43.102s user 0m43.004s sys 0m0.080s pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing ppmraw file pstopnm: Writing 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