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***  6B73.S67.POPC  ***

LOGs for ID: 210720075323115677

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210720075323115677.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210720075323115677.atom to be opened. Openam> File opened: 210720075323115677.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 282 First residue number = 51 Last residue number = 1 Number of atoms found = 2169 Mean number per residue = 7.7 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.303349 +/- 10.037176 From: -28.013000 To: 20.688000 = -0.139548 +/- 8.708489 From: -19.403000 To: 20.343000 = -1.783512 +/- 15.221527 From: -36.523000 To: 31.636000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.6024 % Filled. Pdbmat> 762754 non-zero elements. Pdbmat> 83320 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 76.83 +/- 22.24 Maximum number = 129 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 1.666400E+06 Pdbmat> Larger element = 493.563 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 282 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210720075323115677.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210720075323115677.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210720075323115677.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2169 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 282 residues. Blocpdb> 9 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 11 atoms in block 2 Block first atom: 10 Blocpdb> 13 atoms in block 3 Block first atom: 21 Blocpdb> 13 atoms in block 4 Block first atom: 34 Blocpdb> 14 atoms in block 5 Block first atom: 47 Blocpdb> 16 atoms in block 6 Block first atom: 61 Blocpdb> 12 atoms in block 7 Block first atom: 77 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 89 Blocpdb> 13 atoms in block 9 Block first atom: 108 Blocpdb> 18 atoms in block 10 Block first atom: 121 Blocpdb> 14 atoms in block 11 Block first atom: 139 Blocpdb> 12 atoms in block 12 Block first atom: 153 Blocpdb> 11 atoms in block 13 Block first atom: 165 Blocpdb> 14 atoms in block 14 Block first atom: 176 Blocpdb> 15 atoms in block 15 Block first atom: 190 Blocpdb> 19 atoms in block 16 Block first atom: 205 Blocpdb> 15 atoms in block 17 Block first atom: 224 Blocpdb> 13 atoms in block 18 Block first atom: 239 Blocpdb> 19 atoms in block 19 Block first atom: 252 Blocpdb> 13 atoms in block 20 Block first atom: 271 Blocpdb> 16 atoms in block 21 Block first atom: 284 Blocpdb> 12 atoms in block 22 Block first atom: 300 Blocpdb> 16 atoms in block 23 Block first atom: 312 Blocpdb> 20 atoms in block 24 Block first atom: 328 Blocpdb> 19 atoms in block 25 Block first atom: 348 Blocpdb> 13 atoms in block 26 Block first atom: 367 Blocpdb> 13 atoms in block 27 Block first atom: 380 Blocpdb> 13 atoms in block 28 Block first atom: 393 Blocpdb> 15 atoms in block 29 Block first atom: 406 Blocpdb> 14 atoms in block 30 Block first atom: 421 Blocpdb> 15 atoms in block 31 Block first atom: 435 Blocpdb> 18 atoms in block 32 Block first atom: 450 Blocpdb> 15 atoms in block 33 Block first atom: 468 Blocpdb> 14 atoms in block 34 Block first atom: 483 Blocpdb> 20 atoms in block 35 Block first atom: 497 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 517 Blocpdb> 20 atoms in block 37 Block first atom: 533 Blocpdb> 18 atoms in block 38 Block first atom: 553 Blocpdb> 12 atoms in block 39 Block first atom: 571 Blocpdb> 15 atoms in block 40 Block first atom: 583 Blocpdb> 15 atoms in block 41 Block first atom: 598 Blocpdb> 15 atoms in block 42 Block first atom: 613 Blocpdb> 14 atoms in block 43 Block first atom: 628 Blocpdb> 16 atoms in block 44 Block first atom: 642 Blocpdb> 24 atoms in block 45 Block first atom: 658 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 682 Blocpdb> 18 atoms in block 47 Block first atom: 698 Blocpdb> 14 atoms in block 48 Block first atom: 716 Blocpdb> 18 atoms in block 49 Block first atom: 730 Blocpdb> 15 atoms in block 50 Block first atom: 748 Blocpdb> 16 atoms in block 51 Block first atom: 763 Blocpdb> 13 atoms in block 52 Block first atom: 779 Blocpdb> 19 atoms in block 53 Block first atom: 792 Blocpdb> 20 atoms in block 54 Block first atom: 811 Blocpdb> 12 atoms in block 55 Block first atom: 831 Blocpdb> 16 atoms in block 56 Block first atom: 843 Blocpdb> 14 atoms in block 57 Block first atom: 859 Blocpdb> 14 atoms in block 58 Block first atom: 873 Blocpdb> 16 atoms in block 59 Block first atom: 887 Blocpdb> 22 atoms in block 60 Block first atom: 903 Blocpdb> 14 atoms in block 61 Block first atom: 925 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 939 Blocpdb> 14 atoms in block 63 Block first atom: 956 Blocpdb> 16 atoms in block 64 Block first atom: 970 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 986 Blocpdb> 14 atoms in block 66 Block first atom: 1002 Blocpdb> 22 atoms in block 67 Block first atom: 1016 Blocpdb> 14 atoms in block 68 Block first atom: 1038 Blocpdb> 11 atoms in block 69 Block first atom: 1052 Blocpdb> 11 atoms in block 70 Block first atom: 1063 Blocpdb> 13 atoms in block 71 Block first atom: 1074 Blocpdb> 13 atoms in block 72 Block first atom: 1087 Blocpdb> 15 atoms in block 73 Block first atom: 1100 Blocpdb> 8 atoms in block 74 Block first atom: 1115 Blocpdb> 12 atoms in block 75 Block first atom: 1123 Blocpdb> 10 atoms in block 76 Block first atom: 1135 Blocpdb> 10 atoms in block 77 Block first atom: 1145 Blocpdb> 17 atoms in block 78 Block first atom: 1155 Blocpdb> 12 atoms in block 79 Block first atom: 1172 Blocpdb> 17 atoms in block 80 Block first atom: 1184 Blocpdb> 18 atoms in block 81 Block first atom: 1201 Blocpdb> 10 atoms in block 82 Block first atom: 1219 Blocpdb> 20 atoms in block 83 Block first atom: 1229 Blocpdb> 20 atoms in block 84 Block first atom: 1249 Blocpdb> 22 atoms in block 85 Block first atom: 1269 Blocpdb> 19 atoms in block 86 Block first atom: 1291 Blocpdb> 14 atoms in block 87 Block first atom: 1310 Blocpdb> 14 atoms in block 88 Block first atom: 1324 Blocpdb> 18 atoms in block 89 Block first atom: 1338 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 1356 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1375 Blocpdb> 15 atoms in block 92 Block first atom: 1391 Blocpdb> 14 atoms in block 93 Block first atom: 1406 Blocpdb> 16 atoms in block 94 Block first atom: 1420 Blocpdb> 16 atoms in block 95 Block first atom: 1436 Blocpdb> 13 atoms in block 96 Block first atom: 1452 Blocpdb> 19 atoms in block 97 Block first atom: 1465 Blocpdb> 16 atoms in block 98 Block first atom: 1484 Blocpdb> 13 atoms in block 99 Block first atom: 1500 Blocpdb> 19 atoms in block 100 Block first atom: 1513 Blocpdb> 11 atoms in block 101 Block first atom: 1532 Blocpdb> 12 atoms in block 102 Block first atom: 1543 Blocpdb> 10 atoms in block 103 Block first atom: 1555 Blocpdb> 10 atoms in block 104 Block first atom: 1565 Blocpdb> 13 atoms in block 105 Block first atom: 1575 Blocpdb> 13 atoms in block 106 Block first atom: 1588 Blocpdb> 10 atoms in block 107 Block first atom: 1601 Blocpdb> 15 atoms in block 108 Block first atom: 1611 Blocpdb> 19 atoms in block 109 Block first atom: 1626 Blocpdb> 15 atoms in block 110 Block first atom: 1645 Blocpdb> 14 atoms in block 111 Block first atom: 1660 Blocpdb> 12 atoms in block 112 Block first atom: 1674 Blocpdb> 18 atoms in block 113 Block first atom: 1686 Blocpdb> 14 atoms in block 114 Block first atom: 1704 Blocpdb> 20 atoms in block 115 Block first atom: 1718 Blocpdb> 14 atoms in block 116 Block first atom: 1738 Blocpdb> 18 atoms in block 117 Block first atom: 1752 Blocpdb> 19 atoms in block 118 Block first atom: 1770 Blocpdb> 16 atoms in block 119 Block first atom: 1789 Blocpdb> 12 atoms in block 120 Block first atom: 1805 Blocpdb> 13 atoms in block 121 Block first atom: 1817 Blocpdb> 4 atoms in block 122 Block first atom: 1830 Blocpdb> 11 atoms in block 123 Block first atom: 1834 Blocpdb> 15 atoms in block 124 Block first atom: 1845 Blocpdb> 12 atoms in block 125 Block first atom: 1860 Blocpdb> 13 atoms in block 126 Block first atom: 1872 Blocpdb> 12 atoms in block 127 Block first atom: 1885 Blocpdb> 24 atoms in block 128 Block first atom: 1897 Blocpdb> 17 atoms in block 129 Block first atom: 1921 Blocpdb> 13 atoms in block 130 Block first atom: 1938 Blocpdb> 12 atoms in block 131 Block first atom: 1951 Blocpdb> 19 atoms in block 132 Block first atom: 1963 Blocpdb> 14 atoms in block 133 Block first atom: 1982 Blocpdb> 14 atoms in block 134 Block first atom: 1996 Blocpdb> 15 atoms in block 135 Block first atom: 2010 Blocpdb> 10 atoms in block 136 Block first atom: 2025 Blocpdb> 17 atoms in block 137 Block first atom: 2035 Blocpdb> 19 atoms in block 138 Block first atom: 2052 Blocpdb> 17 atoms in block 139 Block first atom: 2071 Blocpdb> 16 atoms in block 140 Block first atom: 2088 Blocpdb> 14 atoms in block 141 Block first atom: 2104 Blocpdb> 52 atoms in block 142 Block first atom: 2117 Blocpdb> 142 blocks. Blocpdb> At most, 52 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 762896 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 6507 Prepmat> Matrix trace = 1666400.0000 Prepmat> Last element read: 6507 6507 212.3841 Prepmat> 10154 lines saved. Prepmat> 8793 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2169 RTB> Total mass = 2169.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2169 RTB> Number of blocks = 142 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 180875.1845 RTB> 46830 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 852 Diagstd> Nb of non-zero elements: 46830 Diagstd> Projected matrix trace = 180875.1845 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 852 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 180875.1845 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4976113 1.1956079 1.2357597 1.4188832 1.6779816 1.8693633 3.0246341 3.2978641 4.0802316 4.1511833 5.2435486 5.5997564 5.7758751 6.2870477 6.6292850 7.2838178 7.6257272 8.8176367 8.9176234 9.9530187 10.2570374 10.7718014 11.1284509 11.8424232 12.5229871 13.2215614 13.5965759 14.6654532 15.1503885 15.5059068 16.1260345 16.5647295 16.9706273 17.7271313 18.0378146 19.0554627 19.5349182 19.9936755 20.2611210 21.0583390 21.7971801 22.4261088 22.6550324 23.4751863 24.3866553 24.7442961 24.8525289 24.9856100 26.0831592 26.8391648 28.0694569 28.2433855 28.4806051 29.0777293 30.3354259 30.9405301 31.3991769 32.2855080 33.2094040 33.7266898 34.5385723 35.0123579 35.7757053 37.0295867 37.4388899 37.9159792 38.2971657 38.6401937 39.4224171 39.7574200 41.0267326 42.3968730 43.1556431 43.4036538 43.5453119 44.0841953 44.4689237 45.6936736 46.0602111 46.9032117 47.3778956 47.8821911 48.0494279 48.9315046 49.7695043 50.5956053 51.0440774 51.9344920 52.3750101 52.8086709 53.6049397 54.6301193 55.7791505 56.2342522 56.9131697 57.5432748 58.0725941 58.2027557 58.3415723 58.9377127 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034325 0.0034332 0.0034333 0.0034337 0.0034342 0.0034348 76.6020525 118.7379812 120.7152935 129.3506460 140.6659153 148.4711728 188.8563988 197.2021552 219.3500240 221.2489578 248.6611450 256.9684743 260.9781663 272.2818282 279.5945011 293.0723307 299.8719985 322.4566828 324.2797602 342.5884282 347.7813188 356.4014400 362.2535386 373.6935212 384.2812962 394.8541011 400.4147398 415.8560505 422.6755869 427.6060737 436.0728747 441.9645692 447.3466898 457.2087266 461.1978136 474.0291284 479.9556175 485.5585429 488.7952938 498.3188745 506.9853810 514.2475632 516.8655951 526.1381630 536.2550561 540.1729496 541.3530326 542.8005248 554.5942672 562.5741584 575.3237272 577.1034318 579.5219454 585.5655592 598.0952161 604.0308989 608.4913546 617.0197884 625.7859688 630.6409088 638.1862912 642.5485674 649.5152946 660.7995105 664.4415180 668.6616539 672.0144279 675.0173373 681.8155542 684.7063837 695.5506258 707.0696451 713.3687434 715.4156327 716.5821453 721.0024476 724.1417537 734.0460698 736.9843105 743.6979274 747.4517513 751.4192004 752.7302873 759.6080618 766.0849630 772.4167414 775.8324838 782.5700522 785.8819972 789.1288092 795.0559393 802.6225456 811.0193724 814.3212020 819.2221142 823.7445750 827.5245626 828.4514342 829.4387957 833.6656721 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2169 Rtb_to_modes> Number of blocs = 142 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9917E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9954E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4976 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.196 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.236 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.419 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.678 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.869 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.025 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.298 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.080 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.151 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.244 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.600 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.776 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.287 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.629 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.284 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.626 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.818 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.918 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> 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Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210720075323115677.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210720075323115677.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210720075323115677.atom Openam> file on opening on unit 11: 210720075323115677.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 282 First residue number = 51 Last residue number = 1 Number of atoms found = 2169 Mean number per residue = 7.7 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9917E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9954E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9959E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9988E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4976 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.196 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.236 Rdmodfacs> Numero du 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lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du 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vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.94 Bfactors> 106 vectors, 6507 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.497600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.454 for 281 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.093 +/- 0.36 Bfactors> = 79.392 +/- 17.38 Bfactors> Shiftng-fct= 79.299 Bfactors> Scaling-fct= 48.373 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210720075323115677.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210720075323115677.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 129.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 219.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 248.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 261.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 293.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 324.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 356.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 394.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 400.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 415.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 485.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 577.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 684.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 747.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 819.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 823.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 833.6 Chkmod> 106 vectors, 6507 coordinates in file. Chkmod> That is: 2169 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 9 is: 0.9998 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 37 is: 1.0001 (instead of 1.0000). 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6 models are in 210720075323115677.10.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 210720075323115677 11 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-50 210720075323115677.eigenfacs 210720075323115677.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 210720075323115677.eigenfacs 210720075323115677.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 210720075323115677.eigenfacs 210720075323115677.atom calculating perturbed structure for DQ=10 210720075323115677.eigenfacs 210720075323115677.atom calculating perturbed structure for DQ=30 210720075323115677.eigenfacs 210720075323115677.atom calculating perturbed structure for DQ=50 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