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***  6JXR-TYR42-PHE  ***

LOGs for ID: 210717021117125030

output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 210717021117125030.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 210717021117125030.atom to be opened. Openam> File opened: 210717021117125030.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1074 First residue number = 22 Last residue number = 1 Number of atoms found = 8465 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = 165.899808 +/- 21.904681 From: 107.646000 To: 212.636000 = 144.640258 +/- 14.344815 From: 105.556000 To: 184.940000 = 169.568132 +/- 25.359428 From: 107.647000 To: 228.970000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'UNL ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> 1 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.9405 % Filled. Pdbmat> 3032713 non-zero elements. Pdbmat> 331372 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 78.29 +/- 21.35 Maximum number = 127 Minimum number = 15 Pdbmat> Matrix trace = 6.627440E+06 Pdbmat> Larger element = 483.899 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1074 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 210717021117125030.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 210717021117125030.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 210717021117125030.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8465 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1074 residues. Blocpdb> 46 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 50 atoms in block 2 Block first atom: 47 Blocpdb> 44 atoms in block 3 Block first atom: 97 Blocpdb> 49 atoms in block 4 Block first atom: 141 Blocpdb> 47 atoms in block 5 Block first atom: 190 Blocpdb> 49 atoms in block 6 Block first atom: 237 Blocpdb> 46 atoms in block 7 Block first atom: 286 Blocpdb> 51 atoms in block 8 Block first atom: 332 Blocpdb> 47 atoms in block 9 Block first atom: 383 Blocpdb> 46 atoms in block 10 Block first atom: 430 Blocpdb> 50 atoms in block 11 Block first atom: 476 Blocpdb> 20 atoms in block 12 Block first atom: 526 Blocpdb> 52 atoms in block 13 Block first atom: 546 Blocpdb> 52 atoms in block 14 Block first atom: 598 Blocpdb> 47 atoms in block 15 Block first atom: 650 Blocpdb> 51 atoms in block 16 Block first atom: 697 Blocpdb> 37 atoms in block 17 Block first atom: 748 Blocpdb> 48 atoms in block 18 Block first atom: 785 Blocpdb> 48 atoms in block 19 Block first atom: 833 Blocpdb> 46 atoms in block 20 Block first atom: 881 Blocpdb> 49 atoms in block 21 Block first atom: 927 Blocpdb> 52 atoms in block 22 Block first atom: 976 Blocpdb> 47 atoms in block 23 Block first atom: 1028 Blocpdb> 54 atoms in block 24 Block first atom: 1075 Blocpdb> 45 atoms in block 25 Block first atom: 1129 Blocpdb> 39 atoms in block 26 Block first atom: 1174 Blocpdb> 42 atoms in block 27 Block first atom: 1213 Blocpdb> 43 atoms in block 28 Block first atom: 1255 Blocpdb> 43 atoms in block 29 Block first atom: 1298 Blocpdb> 45 atoms in block 30 Block first atom: 1341 Blocpdb> 51 atoms in block 31 Block first atom: 1386 Blocpdb> 38 atoms in block 32 Block first atom: 1437 Blocpdb> 43 atoms in block 33 Block first atom: 1475 Blocpdb> 47 atoms in block 34 Block first atom: 1518 Blocpdb> 57 atoms in block 35 Block first atom: 1565 Blocpdb> 41 atoms in block 36 Block first atom: 1622 Blocpdb> 50 atoms in block 37 Block first atom: 1663 Blocpdb> 43 atoms in block 38 Block first atom: 1713 Blocpdb> 50 atoms in block 39 Block first atom: 1756 Blocpdb> 52 atoms in block 40 Block first atom: 1806 Blocpdb> 47 atoms in block 41 Block first atom: 1858 Blocpdb> 49 atoms in block 42 Block first atom: 1905 Blocpdb> 48 atoms in block 43 Block first atom: 1954 Blocpdb> 56 atoms in block 44 Block first atom: 2002 Blocpdb> 47 atoms in block 45 Block first atom: 2058 Blocpdb> 48 atoms in block 46 Block first atom: 2105 Blocpdb> 40 atoms in block 47 Block first atom: 2153 Blocpdb> 45 atoms in block 48 Block first atom: 2193 Blocpdb> 39 atoms in block 49 Block first atom: 2238 Blocpdb> 59 atoms in block 50 Block first atom: 2277 Blocpdb> 33 atoms in block 51 Block first atom: 2336 Blocpdb> 45 atoms in block 52 Block first atom: 2369 Blocpdb> 51 atoms in block 53 Block first atom: 2414 Blocpdb> 48 atoms in block 54 Block first atom: 2465 Blocpdb> 44 atoms in block 55 Block first atom: 2513 Blocpdb> 44 atoms in block 56 Block first atom: 2557 Blocpdb> 53 atoms in block 57 Block first atom: 2601 Blocpdb> 48 atoms in block 58 Block first atom: 2654 Blocpdb> 51 atoms in block 59 Block first atom: 2702 Blocpdb> 48 atoms in block 60 Block first atom: 2753 Blocpdb> 44 atoms in block 61 Block first atom: 2801 Blocpdb> 48 atoms in block 62 Block first atom: 2845 Blocpdb> 47 atoms in block 63 Block first atom: 2893 Blocpdb> 55 atoms in block 64 Block first atom: 2940 Blocpdb> 48 atoms in block 65 Block first atom: 2995 Blocpdb> 43 atoms in block 66 Block first atom: 3043 Blocpdb> 44 atoms in block 67 Block first atom: 3086 Blocpdb> 46 atoms in block 68 Block first atom: 3130 Blocpdb> 46 atoms in block 69 Block first atom: 3176 Blocpdb> 47 atoms in block 70 Block first atom: 3222 Blocpdb> 4 atoms in block 71 Block first atom: 3269 Blocpdb> 41 atoms in block 72 Block first atom: 3273 Blocpdb> 44 atoms in block 73 Block first atom: 3314 Blocpdb> 38 atoms in block 74 Block first atom: 3358 Blocpdb> 47 atoms in block 75 Block first atom: 3396 Blocpdb> 54 atoms in block 76 Block first atom: 3443 Blocpdb> 66 atoms in block 77 Block first atom: 3497 Blocpdb> 46 atoms in block 78 Block first atom: 3563 Blocpdb> 55 atoms in block 79 Block first atom: 3609 Blocpdb> 42 atoms in block 80 Block first atom: 3664 Blocpdb> 46 atoms in block 81 Block first atom: 3706 Blocpdb> 45 atoms in block 82 Block first atom: 3752 Blocpdb> 54 atoms in block 83 Block first atom: 3797 Blocpdb> 49 atoms in block 84 Block first atom: 3851 Blocpdb> 44 atoms in block 85 Block first atom: 3900 Blocpdb> 42 atoms in block 86 Block first atom: 3944 Blocpdb> 37 atoms in block 87 Block first atom: 3986 Blocpdb> 43 atoms in block 88 Block first atom: 4023 Blocpdb> 44 atoms in block 89 Block first atom: 4066 Blocpdb> 47 atoms in block 90 Block first atom: 4110 Blocpdb> 52 atoms in block 91 Block first atom: 4157 Blocpdb> 43 atoms in block 92 Block first atom: 4209 Blocpdb> 47 atoms in block 93 Block first atom: 4252 Blocpdb> 49 atoms in block 94 Block first atom: 4299 Blocpdb> 43 atoms in block 95 Block first atom: 4348 Blocpdb> 50 atoms in block 96 Block first atom: 4391 Blocpdb> 46 atoms in block 97 Block first atom: 4441 Blocpdb> 49 atoms in block 98 Block first atom: 4487 Blocpdb> 48 atoms in block 99 Block first atom: 4536 Blocpdb> 45 atoms in block 100 Block first atom: 4584 Blocpdb> 45 atoms in block 101 Block first atom: 4629 Blocpdb> 45 atoms in block 102 Block first atom: 4674 Blocpdb> 46 atoms in block 103 Block first atom: 4719 Blocpdb> 49 atoms in block 104 Block first atom: 4765 Blocpdb> 42 atoms in block 105 Block first atom: 4814 Blocpdb> 48 atoms in block 106 Block first atom: 4856 Blocpdb> 50 atoms in block 107 Block first atom: 4904 Blocpdb> 52 atoms in block 108 Block first atom: 4954 Blocpdb> 47 atoms in block 109 Block first atom: 5006 Blocpdb> 48 atoms in block 110 Block first atom: 5053 Blocpdb> 44 atoms in block 111 Block first atom: 5101 Blocpdb> 56 atoms in block 112 Block first atom: 5145 Blocpdb> 12 atoms in block 113 Block first atom: 5201 Blocpdb> 41 atoms in block 114 Block first atom: 5213 Blocpdb> 53 atoms in block 115 Block first atom: 5254 Blocpdb> 41 atoms in block 116 Block first atom: 5307 Blocpdb> 45 atoms in block 117 Block first atom: 5348 Blocpdb> 55 atoms in block 118 Block first atom: 5393 Blocpdb> 60 atoms in block 119 Block first atom: 5448 Blocpdb> 39 atoms in block 120 Block first atom: 5508 Blocpdb> 51 atoms in block 121 Block first atom: 5547 Blocpdb> 36 atoms in block 122 Block first atom: 5598 Blocpdb> 44 atoms in block 123 Block first atom: 5634 Blocpdb> 48 atoms in block 124 Block first atom: 5678 Blocpdb> 48 atoms in block 125 Block first atom: 5726 Blocpdb> 48 atoms in block 126 Block first atom: 5774 Blocpdb> 39 atoms in block 127 Block first atom: 5822 Blocpdb> 47 atoms in block 128 Block first atom: 5861 Blocpdb> 46 atoms in block 129 Block first atom: 5908 Blocpdb> 45 atoms in block 130 Block first atom: 5954 Blocpdb> 44 atoms in block 131 Block first atom: 5999 Blocpdb> 46 atoms in block 132 Block first atom: 6043 Blocpdb> 50 atoms in block 133 Block first atom: 6089 Blocpdb> 46 atoms in block 134 Block first atom: 6139 Blocpdb> 45 atoms in block 135 Block first atom: 6185 Blocpdb> 49 atoms in block 136 Block first atom: 6230 Blocpdb> 41 atoms in block 137 Block first atom: 6279 Blocpdb> 46 atoms in block 138 Block first atom: 6320 Blocpdb> 48 atoms in block 139 Block first atom: 6366 Blocpdb> 56 atoms in block 140 Block first atom: 6414 Blocpdb> 43 atoms in block 141 Block first atom: 6470 Blocpdb> 44 atoms in block 142 Block first atom: 6513 Blocpdb> 47 atoms in block 143 Block first atom: 6557 Blocpdb> 53 atoms in block 144 Block first atom: 6604 Blocpdb> 45 atoms in block 145 Block first atom: 6657 Blocpdb> 47 atoms in block 146 Block first atom: 6702 Blocpdb> 57 atoms in block 147 Block first atom: 6749 Blocpdb> 54 atoms in block 148 Block first atom: 6806 Blocpdb> 50 atoms in block 149 Block first atom: 6860 Blocpdb> 55 atoms in block 150 Block first atom: 6910 Blocpdb> 49 atoms in block 151 Block first atom: 6965 Blocpdb> 44 atoms in block 152 Block first atom: 7014 Blocpdb> 48 atoms in block 153 Block first atom: 7058 Blocpdb> 41 atoms in block 154 Block first atom: 7106 Blocpdb> 51 atoms in block 155 Block first atom: 7147 Blocpdb> 37 atoms in block 156 Block first atom: 7198 Blocpdb> 53 atoms in block 157 Block first atom: 7235 Blocpdb> 41 atoms in block 158 Block first atom: 7288 Blocpdb> 45 atoms in block 159 Block first atom: 7329 Blocpdb> 41 atoms in block 160 Block first atom: 7374 Blocpdb> 44 atoms in block 161 Block first atom: 7415 Blocpdb> 51 atoms in block 162 Block first atom: 7459 Blocpdb> 38 atoms in block 163 Block first atom: 7510 Blocpdb> 43 atoms in block 164 Block first atom: 7548 Blocpdb> 47 atoms in block 165 Block first atom: 7591 Blocpdb> 57 atoms in block 166 Block first atom: 7638 Blocpdb> 41 atoms in block 167 Block first atom: 7695 Blocpdb> 50 atoms in block 168 Block first atom: 7736 Blocpdb> 43 atoms in block 169 Block first atom: 7786 Blocpdb> 50 atoms in block 170 Block first atom: 7829 Blocpdb> 52 atoms in block 171 Block first atom: 7879 Blocpdb> 47 atoms in block 172 Block first atom: 7931 Blocpdb> 49 atoms in block 173 Block first atom: 7978 Blocpdb> 48 atoms in block 174 Block first atom: 8027 Blocpdb> 56 atoms in block 175 Block first atom: 8075 Blocpdb> 47 atoms in block 176 Block first atom: 8131 Blocpdb> 48 atoms in block 177 Block first atom: 8178 Blocpdb> 40 atoms in block 178 Block first atom: 8226 Blocpdb> 45 atoms in block 179 Block first atom: 8266 Blocpdb> 39 atoms in block 180 Block first atom: 8311 Blocpdb> 59 atoms in block 181 Block first atom: 8350 Blocpdb> 28 atoms in block 182 Block first atom: 8409 Blocpdb> 29 atoms in block 183 Block first atom: 8436 Blocpdb> 183 blocks. Blocpdb> At most, 66 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3032896 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 25395 Prepmat> Matrix trace = 6627440.0000 Prepmat> Last element read: 25395 25395 227.8186 Prepmat> 16837 lines saved. Prepmat> 15323 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8465 RTB> Total mass = 8465.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8465 RTB> Number of blocks = 183 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 188437.3102 RTB> 51723 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1098 Diagstd> Nb of non-zero elements: 51723 Diagstd> Projected matrix trace = 188437.3102 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1098 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 188437.3102 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1915710 0.2744385 0.4198910 0.5495997 0.6913754 1.2285570 1.4575927 1.8524973 1.9816651 2.1655301 2.2753250 2.5520134 3.2669577 3.5105354 3.7754652 3.9637604 4.2038674 4.7184776 4.7964197 5.2646821 5.6076884 5.7056002 6.0547067 6.1986927 6.5451545 6.9363321 7.0919656 7.2496077 7.6381483 7.6891697 8.4144432 9.2036115 9.2565404 9.4139642 10.0758292 10.5204184 10.5917848 11.2936679 11.7975573 11.9428610 12.3108853 12.6436876 12.7576634 13.2933566 13.9317143 14.0978904 14.1416278 14.5766998 14.8101437 15.3108016 15.5372084 16.1288025 16.6608356 16.9729370 17.6937773 18.1372107 18.4357664 18.7678821 19.0052168 19.4508324 19.7508729 20.1741699 20.2231387 20.6082615 21.3409336 21.4516862 21.7663728 22.1626874 22.6082828 22.8624520 23.2381387 23.4847947 23.7149571 23.9798180 24.2581088 25.0076826 25.2850263 25.5978350 25.7517108 26.3131878 26.4686689 26.6784934 26.8687987 27.4640750 28.2296426 28.3503071 28.4508035 28.9552561 29.2654490 29.9373071 30.5404195 30.6803640 31.0127611 31.5466732 31.9680605 32.1156867 32.4567749 33.1465583 33.5588243 33.9742781 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034335 0.0034338 0.0034342 0.0034345 0.0034349 0.0034352 47.5291670 56.8876256 70.3661155 80.5042003 90.2926160 120.3629805 131.1032262 147.7998788 152.8658268 159.8002280 163.8011712 173.4749426 196.2759251 203.4613670 210.9990581 216.1966577 222.6485067 235.8827749 237.8230087 249.1617404 257.1504083 259.3856517 267.2033117 270.3618023 277.8147070 285.9961718 289.1868821 292.3832801 300.1161209 301.1168119 314.9981270 329.4385509 330.3844746 333.1820163 344.6955522 352.2181952 353.4108302 364.9327052 372.9849669 375.2748579 381.0131132 386.1287668 387.8652310 395.9247102 405.3195584 407.7296972 408.3616794 414.5957880 417.9024499 424.9073513 428.0374579 436.1102989 443.2448203 447.3771305 456.7784003 462.4667668 466.2575508 470.4385613 473.4037508 478.9215462 482.6012338 487.7453270 488.3369208 492.9648551 501.6513521 502.9513728 506.6269769 511.2184164 516.3320323 519.2263020 523.4750055 526.2458266 528.8182711 531.7631291 534.8398398 543.0402305 546.0431775 549.4104282 551.0592843 557.0343957 558.6776930 560.8877183 562.8846497 569.0858250 576.9630094 578.1947768 579.2186647 584.3310782 587.4526618 594.1575858 600.1126475 601.4860153 604.7355458 609.9188610 613.9788687 615.3948909 618.6541953 625.1935673 629.0695281 632.9514496 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8465 Rtb_to_modes> Number of blocs = 183 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1916 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2744 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4199 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5496 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6914 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.229 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.458 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.852 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.982 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.166 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.275 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.552 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.267 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.511 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.775 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.964 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.204 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.718 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.796 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.265 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.608 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.706 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.055 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.199 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.545 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.936 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.092 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.250 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.638 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.689 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.414 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.204 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.257 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.414 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.97 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1098 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00006 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99995 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 0.99995 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00003 1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99996 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 152370 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00006 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 1.00000 1.00003 1.00000 0.99995 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00000 0.99995 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 1.00003 1.00001 0.99996 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99996 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210717021117125030.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210717021117125030.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 210717021117125030.atom Openam> file on opening on unit 11: 210717021117125030.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1074 First residue number = 22 Last residue number = 1 Number of atoms found = 8465 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1916 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2744 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4199 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5496 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6914 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.229 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.458 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.852 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.982 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.166 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.275 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.552 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.267 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.511 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.775 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.964 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.204 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.718 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.796 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.265 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.608 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.706 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.055 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.199 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.545 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.936 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.092 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.250 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.638 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.689 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.414 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.204 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.257 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.414 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.97 Bfactors> 106 vectors, 25395 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.191600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.683 for 1073 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.046 +/- 0.04 Bfactors> = 50.592 +/- 20.72 Bfactors> Shiftng-fct= 50.547 Bfactors> Scaling-fct= 507.042 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 210717021117125030.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 210717021117125030.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 47.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 70.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 80.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 147.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 163.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 173.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 211.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 222.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 237.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 259.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 286.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 301.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 330.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 373.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 414.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 424.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 447.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 462.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 466.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.7 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Chkmod> That is: 8465 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 19 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7311 0.0034 0.9900 0.0034 0.7501 0.0034 0.7267 0.0034 0.9539 0.0034 0.7002 47.5307 0.5274 56.8812 0.6900 70.3638 0.3252 80.5008 0.6294 90.2903 0.4695 120.3795 0.4677 131.1159 0.5534 147.7737 0.1448 152.8722 0.3074 159.8107 0.5628 163.7824 0.3987 173.4670 0.6149 196.2688 0.4482 203.4661 0.4798 210.9770 0.5164 216.1939 0.2896 222.6425 0.6272 235.8607 0.4549 237.8024 0.6259 249.1586 0.5273 257.1465 0.3295 259.3836 0.4358 267.1983 0.2658 270.3569 0.2653 277.7995 0.6119 285.9770 0.3022 289.1752 0.3946 292.3786 0.4093 300.1003 0.5613 301.1006 0.5117 314.9763 0.5601 329.4314 0.2008 330.3785 0.5542 333.1683 0.4383 344.7521 0.2089 352.1961 0.2438 353.3659 0.2787 364.8578 0.4152 373.0076 0.5558 375.2138 0.3862 380.9831 0.4539 386.0559 0.4044 387.8841 0.4015 395.8577 0.3908 405.2772 0.3457 407.7427 0.2155 408.3206 0.5218 414.6249 0.4531 417.8825 0.4221 424.8780 0.2986 428.0575 0.3710 436.1078 0.5010 443.2147 0.3847 447.3192 0.3767 456.7100 0.4662 462.4825 0.2350 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small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 210717021117125030.7.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 210717021117125030 8 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-50 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=10 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=30 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating 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getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 210717021117125030 9 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-50 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=10 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=30 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=50 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom making animated gifs 6 models are in 210717021117125030.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 210717021117125030.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 6 models are in 210717021117125030.9.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 210717021117125030 10 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-50 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom 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6 models are in 210717021117125030.10.pdb, 0 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 2 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 4 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 6 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 210717021117125030 11 -50 50 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-50 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=-30 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=-10 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=10 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=30 210717021117125030.eigenfacs 210717021117125030.atom calculating perturbed structure for DQ=50 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